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        支氣管抽吸物中矮小同源盒2和Ras 相關(guān)結(jié)構(gòu)域家族蛋白1A DNA 甲基化檢測對早期肺癌診斷價值的Meta分析△

        2022-10-31 09:40:20張文川趙佳寶王哲楊向紅
        癌癥進展 2022年17期
        關(guān)鍵詞:亞組甲基化結(jié)構(gòu)域

        張文川,趙佳寶,王哲,楊向紅

        中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院病理科,沈陽 110004

        世界衛(wèi)生組織(WHO)國際癌癥研究機構(gòu)公布了2020年全球癌癥負擔(dān)的最新數(shù)據(jù),乳腺癌是全球最常見的惡性腫瘤,肺癌位居第二位,但肺癌仍居男性惡性腫瘤首位[1],包括小細胞肺癌(small cell lung cancer,SCLC)和非小細胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC),其中NSCLC占全部肺癌的80%,病理類型主要包括腺癌和鱗狀細胞癌等。由于缺乏靈敏度較高的診斷方法,早期肺癌的診斷準(zhǔn)確度較低,導(dǎo)致患者確診時多已處于中晚期。目前,也仍然沒有特異性的肺癌篩查方法[2],因此,迫切需要尋找更有效的早期肺癌篩查方法。

        細胞學(xué)檢查是早期中心型肺癌的經(jīng)典篩查方法[3],是評估肺部病變良惡性的一種簡單、可靠、經(jīng)濟、無創(chuàng)的方法;但由于痰細胞學(xué)檢查的靈敏度較低,肺癌篩查的成功率受到限制[4-5]。與其他侵入性手術(shù)相比,支氣管鏡檢查雖然也是一種微創(chuàng)技術(shù),術(shù)后并發(fā)癥較少,但支氣管鏡檢查的診斷準(zhǔn)確度也相對較差,靈敏度為30%~69%[6]。因此迫切需要一種創(chuàng)傷小、診斷能力強的方法。生物標(biāo)志物在腫瘤的診斷中迅速發(fā)展,出現(xiàn)了一些有前景的候選分子,如DNA甲基化、補體片段、自身抗體、循環(huán)腫瘤DNA、微小RNA(microRNA,miRNA)及血液蛋白分析等,對肺癌的早期篩查具有重要意義。DNA甲基化是在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化下,將甲基基團轉(zhuǎn)移到胞嘧啶堿基上的一種修飾方式,對基因表達的調(diào)控至關(guān)重要,DNA甲基化導(dǎo)致的表觀遺傳變化在多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要作用[7]。矮小同源盒2(short stature homeobox 2,SHOX2)和Ras相關(guān)結(jié)構(gòu)域家族蛋白1A(Ras association domain family protein 1A,RASSF1A)的甲基化研究現(xiàn)處于第三階段,即用于篩查背景下風(fēng)險管理(risk management in screening context,RMS)的后縱向研究階段,即將進入Ⅳ期臨床驗證水平[8]。有研究表明,SHOX2和RASSF1A的啟動子甲基化已被確定為肺癌診斷和預(yù)后評估的生物標(biāo)志物[9]。因此,支氣管抽吸物比傳統(tǒng)血液檢測診斷肺癌的效能更佳且細胞濃度更高,本研究采用循證醫(yī)學(xué)的方法量化評價支氣管抽吸物中SHOX2和RASSF1A基因甲基化對早期肺癌的診斷價值,現(xiàn)報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 文獻檢索

        計算機檢索 PubMed、Embase、The Cochrane Library、Web of Science、Clinical Trail、CNKI、萬方數(shù)據(jù)庫,檢索時間自建庫至2021年5月11日,檢索語種為英文和中文,檢索詞包括主題詞和自由詞。中文檢索詞為“肺癌”“SHOX2”“RASSF1A”;英文檢索詞為“l(fā)ung neoplasms”“cancer of lung”“pulmonary neoplasms”“ras association(RalGDSAF-6)domain family 1 protein,human”“RASSF1A protein,human”“SHOT protein,human”“short stature homeobox 2 protein,human”。

        1.2 文獻納入與排除標(biāo)準(zhǔn)

        納入標(biāo)準(zhǔn):①SHOX2或RASSF1A甲基化診斷肺癌的原始文獻;②以肺癌病理檢查為診斷金標(biāo)準(zhǔn);③真陽性例數(shù)、假陽性例數(shù)、假陰性例數(shù)和真陰性例數(shù)可直接或間接根據(jù)文獻計算;④隊列或病例對照研究。排除標(biāo)準(zhǔn):①動物實驗;②病例報道;③部分或全部文獻數(shù)據(jù)出現(xiàn)在另一篇文章中;④非中文和英文文獻;⑤會議摘要、綜述、薈萃分析。

        1.3 文獻篩選和數(shù)據(jù)提取

        由兩名研究員分別獨立篩選標(biāo)題和摘要,并閱讀全文以確定合格的研究,如果存在爭議,則與第三名研究員協(xié)商一致解決分歧。研究資料包括:①作者、研究類型、國籍和年份;②甲基化陽性患者和陰性對照者;③SHOX2和RASSF1A甲基化的測定方法;④肺癌病理類型。對于數(shù)據(jù)不足的研究,向原作者發(fā)送郵件以獲取相關(guān)信息。

        1.4 納入文獻偏倚風(fēng)險評價

        由兩名研究員獨立進行文獻偏倚風(fēng)險評價,方法學(xué)質(zhì)量評價采用診斷準(zhǔn)確性研究質(zhì)量評價工具2(quality assessment of diagnostic accuracy studies-2,QUADAS-2)[10]評估,通過RevMan 5.4軟件對每項研究進行質(zhì)量評價。

        1.5 統(tǒng)計學(xué)方法

        采用Stata 16.0軟件進行Meta分析;繪制受試者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲線,計算曲線下面積(area under the curve,AUC),評估各指標(biāo)診斷肺癌的靈敏度、特異度。通過Cochrane’s Q檢驗和Higgin I2評估各研究間的異質(zhì)性,當(dāng)I2≤50%或P>0.10時,表明各研究間異質(zhì)性較小,采用固定效應(yīng)模型進行分析;當(dāng)I2>50%或P<0.10時,表明各研究間的異質(zhì)性較大,采用隨機效應(yīng)模型進行分析。采用單一敏感性分析,通過移除一項研究(每次一項)來確定其是否對總體結(jié)果有重大影響。此外,還對樣本量、NSCLC占肺癌的比例和種族人群進行亞組分析以進一步探討異質(zhì)性的來源。使用Deeks’漏斗圖驗證發(fā)表偏倚[11]。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 檢索結(jié)果

        本研究初步篩選出6067篇文獻,通過查閱標(biāo)題和摘要后篩選出27篇文獻,經(jīng)過全文復(fù)篩,最終納入20篇文獻(中文文獻8篇[12-19],英文文獻12篇[20-31]),共4238例患者,其中病例組2328例,對照組1910例。

        2.2 納入文獻基本特征及質(zhì)量評價

        所有研究中,11項[12-22]在亞洲,8項[23-30]在歐洲,1項[31]在非洲,其中11項研究[12,14,16-17,19,22,25,28-31]中的2471例患者接受了SHOX2甲基化檢測,15項研究[12-20,22-27]中的3046例患者接受了RASSF1A甲基化檢測,5項研究[12,14,19,21-22]中的1469例患者同時接受了SHOX2和RASSF1A甲基化檢測。納入20篇文獻的基本情況見表1,采用QUADAS-2進行了質(zhì)量評估,結(jié)果見圖1。

        圖1 QUADAS-2評價文獻質(zhì)量

        表1 納入20篇文獻的基本情況

        2.3 SHOX2甲基化、RASSF1A 甲基化單獨及聯(lián)合檢測對肺癌的診斷價值

        SHOX2甲基化診斷肺癌的AUC為0.86,合并靈敏度為 0.73(95%CI:0.69~0.77),合并特異度為0.90(95%CI:0.86~0.93),陽性似然比和陰性似然比分別為7.50和0.30。RASSF1A甲基化診斷肺癌的AUC為0.82,合并靈敏度為0.51(95%CI:0.44~0.58),合并特異度為0.96(95%CI:0.93~0.98),陽性似然比、陰性似然比分別為14.10、0.50。SHOX2甲基化聯(lián)合RASSF1A甲基化診斷肺癌的AUC為0.90,合并靈敏度為 0.78(95%CI:0.73~0.82),合并特異度為0.87(95%CI:0.83~0.90),陽性似然比、陰性似然比分別為5.80、0.26。(圖2、圖3、圖4)

        圖2 SHOX2甲基化診斷肺癌的森林圖

        圖3 RASSF1A 甲基化診斷肺癌的森林圖

        圖4 SHOX2和RASSF1A 甲基化聯(lián)合診斷肺癌的森林圖

        分別依據(jù)樣本量、NSCLC占比、種族將SHOX2和RASSF1A甲基化對肺癌的診斷價值進行亞組分析。亞組1:樣本量<200的亞組中,SHOX2和RASSF1A甲基化診斷肺癌的靈敏度分別為0.74和0.49,特異度分別為0.88和0.98;樣本量≥200的亞組中,SHOX2和RASSF1A甲基化診斷肺癌的靈敏度分別為0.72和0.53,特異度分別為0.91和0.96。亞組2:NSCLC占比<80%的亞組中,SHOX2和RASSF1A甲基化診斷肺癌的靈敏度分別為0.75和0.49,特異度分別為0.88和0.97;NSCLC占比≥80%的亞組中,SHOX2和RASSF1A甲基化診斷肺癌的靈敏度分別為0.71和0.54,特異度分別為0.92和0.96。亞組3:亞洲人群的亞組中,SHOX2和RASSF1A甲基化診斷肺癌的靈敏度分別為0.73和0.57,特異度分別為0.89和0.93;在非亞洲人群亞組中,靈敏度分別為0.73和0.42,特異度分別為0.92和1.00。(表2)

        表2 SHOX2和RASSF1A甲基化診斷肺癌的亞組分析結(jié)果

        2.4 敏感性分析

        每次對參與Meta分析的單個研究進行評估,以反映單個數(shù)據(jù)集對靈敏度和特異度的影響,結(jié)果顯示,該Meta分析不受單個研究的影響,I2統(tǒng)計量也表明沒有一項研究影響了該Meta分析的異質(zhì)性。(表 3)

        表3 SHOX2和RASSF1A甲基化診斷肺癌的敏感性分析

        2.5 發(fā)表偏倚

        本研究評估了這20項研究中SHOX2和RASSF1A甲基化的發(fā)表偏倚,結(jié)果顯示本研究無明顯發(fā)表偏倚。

        3 討論

        3號染色體短臂等位基因缺失是肺癌發(fā)病機制中最常見、最早的事件之一,超過90%的SCLC和50%~80%的NSCLC中均有發(fā)現(xiàn)[32-33]。RASSF1A基因位于3號染色體p21.3(3p21.3)帶,是肺癌最小純合缺失的120 kb區(qū)域[34]。此外,RASSF1A是一個常見的異常甲基化基因,在肺癌中,RASSF1A啟動子在NSCLC和SCLC中的高甲基化率分別超過50%和79%[35-36]。這與本研究結(jié)果接近,即RASSF1A在NSCLC占多數(shù)的肺癌樣本中的靈敏度為0.51。RASSF1A亦是RAS的負效應(yīng)子,通常以其基因上4種主要的結(jié)構(gòu)域包括C1結(jié)構(gòu)域、RA結(jié)構(gòu)域、共濟失調(diào)毛細血管擴張癥突變磷酸化位點和Salvador/RASSF/Hippo(SARAH)結(jié)構(gòu)域,通過幾種不同的通路包括蛋白激酶C(protein kinase C,PKC)/促分裂原活化的蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)/細胞外信號調(diào)節(jié)激酶(extracellular signal-regulated kinase,ERK)等,在腫瘤中發(fā)揮腫瘤抑制因子的作用,包括細胞凋亡、基因組和微管穩(wěn)定性及細胞周期調(diào)節(jié)。但RASSF1A高甲基化情況會發(fā)生反轉(zhuǎn),肺癌中RASSF1A的缺失參與了肺癌分化程度的降低和干細胞特性的增強,是肺癌中表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)-酪氨酸激酶抑制劑(tyrosine kinase inhibitor,TKI)耐藥、復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移的必要條件。

        SHOX2位于3號染色體(3q25.32)的長臂上,是同源盒家族成員。SHOX2編碼的DNA結(jié)構(gòu)域由60個氨基酸組成。SHOX2是一種致癌基因,是細胞增殖和凋亡的調(diào)節(jié)因子和上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelialmesenchymal transition,EMT)的誘導(dǎo)因子。SHOX2基因中有3個CpG島,而這些CpG島的甲基化可以深刻影響SHOX2基因本身及其他相關(guān)基因的表達。同時,SHOX2基因的CpG島經(jīng)常被高甲基化,在腫瘤組織和細胞中高表達,如肺癌、乳腺癌、食管鱗狀細胞癌和肝細胞癌。在一些腫瘤中,SHOX2基因可通過參與調(diào)節(jié)成纖維細胞生長因子(fibroblast growth factor,F(xiàn)GF)通路[包括RAS/ERK和磷脂酰肌醇-3-激酶(phosphoinositide 3-kinases,PI3K)/蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,又稱AKT)通路、干細胞多能性相關(guān)信號通路等]、EGFR-酪氨酸激酶抑制劑抗性及細胞增殖、遷移、分化和細胞表型,抑制細胞抗凋亡作用,還可通過增加RUNX2激活核因子κB(nuclear factor-κB,NF-κB)通路并抑制p53活性,導(dǎo)致致癌生物學(xué)過程的發(fā)生。有趣的是,SHOX2能夠與轉(zhuǎn)化生長因子(transforming growth factor,TGF)受體結(jié)合,并與NF-κB信號通路相互作用,與RASSF1A相互調(diào)控。因此,RASSF1A和SHOX2與Hippo、NF-κB和 TGF-β通路密切相關(guān)。有證據(jù)表明,RASSF1A和SHOX2的甲基化在肺癌的發(fā)生發(fā)展中是一個關(guān)鍵事件,是診斷肺癌的重要生物標(biāo)志物,且對疑似肺癌患者的早期篩查非常有用[9,37]。目前研究顯示,表現(xiàn)出RASSF1A和SHOX2高甲基化的肺癌患者,組織學(xué)分化更差、臨床分期更晚、易局部復(fù)發(fā),并明顯縮短了患者的總生存期和無病生存期,因此,甲基化檢測能為患者個性化治療選擇提供參考,對預(yù)測患者預(yù)后和監(jiān)測疾病發(fā)生發(fā)展有重要的臨床意義。

        血漿中SHOX2甲基化診斷肺癌的靈敏度為60.0%,血清或痰樣本中RASSF1A甲基化診斷肺癌的靈敏度和特異度僅為45%,診斷效能并不高,而本研究在支氣管抽吸物中發(fā)現(xiàn),SHOX2和RASSF1A診斷肺癌的靈敏度和特異度均高于痰液或血液,這可能與樣本來源密切相關(guān)。支氣管抽吸物中肺泡腺上皮含量較多,檢測干擾少,標(biāo)本質(zhì)量較高。但在其他文獻中,結(jié)果還存在相當(dāng)大的爭議。本研究對支氣管抽吸物中SHOX2和RASSF1A甲基化對早期肺癌的診斷價值進行Meta分析,結(jié)果顯示,SHOX2甲基化診斷肺癌的合并靈敏度和特異度分別為0.73和0.90,RASSF1A甲基化診斷肺癌的合并靈敏度和特異度分別為0.51和0.96,SHOX2和RASSF1A甲基化聯(lián)合診斷肺癌的合并靈敏度和特異度分別為0.78和0.87。雖然聯(lián)合診斷的特異度有所降低,但降低幅度很小并提高了整體靈敏度。本研究也有其不足和局限性,首先,由于本研究納入的文獻數(shù)量較少,可能無法全面評估SHOX2基因甲基化與肺癌間的真實關(guān)聯(lián),并可能對本研究結(jié)果產(chǎn)生影響,有必要進一步擴大樣本量,以提供更具代表性的統(tǒng)計數(shù)據(jù);作為回顧性研究,Meta分析可能存在選擇偏倚,可能影響研究結(jié)果。鑒于此,本研究結(jié)論尚需加大樣本量證實。

        綜上所述,支氣管抽吸物中SHOX2和RASSF1A甲基化對肺癌的診斷價值較高,對CT檢查可疑肺癌的患者,是肺癌早期篩查的重要手段。對于疑似肺癌且支氣管鏡檢查未發(fā)現(xiàn)腫瘤的患者,進行支氣管抽吸物SHOX2和RASSF1A甲基化檢測對肺癌的早期診斷和預(yù)防具有重要意義。

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