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        mRNA腫瘤疫苗的免疫學(xué)機(jī)制和臨床研究進(jìn)展

        2022-10-25 04:20:02鄧卓雅田昱瑩楊鵬輝
        關(guān)鍵詞:免疫原性抗原編碼

        鄧卓雅 田昱瑩 楊鵬輝

        (1)解放軍總醫(yī)院第一醫(yī)學(xué)中心肝膽胰外科醫(yī)學(xué)部,全軍肝膽外科研究所,北京 100853;2)解放軍醫(yī)學(xué)院,北京 100853;3)內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué),呼和浩特 010110)

        近年來(lái),盡管腫瘤治療取得了顯著進(jìn)展,但惡性腫瘤仍然是世界第二大致死原因[1]。臨床上常規(guī)的腫瘤治療手段包括手術(shù)、放療、化療、靶向治療、免疫治療和綜合治療等。此外,檢查點(diǎn)抑制劑(checkpoint inhibitor,CPI)對(duì)多種惡性腫瘤的有效治療啟發(fā)了人們對(duì)腫瘤免疫治療的新思路[2]。腫瘤免疫治療的目的是激活宿主的抗腫瘤免疫,改變抑制腫瘤的微環(huán)境,最終達(dá)到縮小腫瘤,提高患者總體生存率的目的。腫瘤疫苗是一種有潛力的抗腫瘤免疫治療手段。針對(duì)腫瘤相關(guān)抗原(tumorassociated antigen,TAA)或 腫 瘤 特 異 性 抗 原(tumor-specific antigens,TSA)的疫苗可以特異性地攻擊和摧毀高表達(dá)腫瘤抗原的惡性腫瘤細(xì)胞,并通過(guò)免疫記憶而實(shí)現(xiàn)對(duì)腫瘤的持續(xù)殺傷作用。因此,與其他免疫療法相比,腫瘤疫苗提供了特異、安全和可耐受的治療方法。盡管研究者在開(kāi)發(fā)腫瘤疫苗方面做出了相當(dāng)大的努力,但由于腫瘤抗原的高度多樣性和相對(duì)較低的免疫反應(yīng),幾十年來(lái)將腫瘤疫苗轉(zhuǎn)化為有效的臨床治療方法仍然具有挑戰(zhàn)性[3]。mRNA疫苗作為腫瘤疫苗的重要類(lèi)型,能夠編碼TAA、TSA及其相關(guān)的細(xì)胞因子,同時(shí)激發(fā)體液和細(xì)胞介導(dǎo)的免疫反應(yīng),增加克服疫苗耐藥性的可能性,從而達(dá)到加強(qiáng)患者抗腫瘤免疫的效果,成為一種具有良好前景的治療方式。mRNA疫苗具有多種優(yōu)勢(shì),如能夠產(chǎn)生強(qiáng)有力的保護(hù)性免疫反應(yīng),mRNA的生產(chǎn)速度更快、更靈活、成本更低,可以用于精準(zhǔn)和個(gè)性化的治療。體外轉(zhuǎn)錄后再加帽加尾是mRNA腫瘤疫苗公認(rèn)的生產(chǎn)方法,它類(lèi)似于真核細(xì)胞胞漿中自然加工和成熟mRNA。當(dāng)接種疫苗部位的細(xì)胞吸收后,mRNA被運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞質(zhì)。接著,通過(guò)核糖體合成mRNA編碼的蛋白質(zhì),然后進(jìn)行翻譯后修飾,產(chǎn)生正確折疊的功能蛋白質(zhì)。mRNA疫苗可以使其編碼的蛋白質(zhì)或肽瞬時(shí)表達(dá),持續(xù)幾天或幾周,使得mRNA更容易控制。更為重要的是從安全性出發(fā),與DNA疫苗相比,mRNA不會(huì)整合到宿主基因組中。

        本文聚焦于mRNA疫苗目前在腫瘤治療方面的應(yīng)用,并總結(jié)了mRNA領(lǐng)域的發(fā)展和面臨的挑戰(zhàn),將有助于更好地認(rèn)識(shí)和了解mRNA疫苗的免疫學(xué)機(jī)制和臨床研究進(jìn)展,為腫瘤治療提供新的研究策略。

        1 mRNA制備策略

        mRNA腫瘤疫苗的制備方法是體外轉(zhuǎn)錄(in vitro transcription,IVT),它模擬真核細(xì)胞胞漿中自然加工和成熟mRNA(圖1)。體外轉(zhuǎn)錄是一個(gè)相對(duì)簡(jiǎn)單的過(guò)程,但制造高質(zhì)量的、高度可翻譯的、不會(huì)引起嚴(yán)重炎癥的“治療性”mRNA一直是該領(lǐng)域的主要限制。最近炎癥和自身免疫得到了很大程度的解決,包括加帽加尾技術(shù)的改善、加入修飾性核苷[4](特別是修飾的尿苷)、優(yōu)化編碼序列[5]、以及通過(guò)高效液相色譜(high performance liquid chromatography,HPLC)[6]嚴(yán) 格 純 化IVT mRNA以去除雙鏈RNA(dsRNA)污染物。這些技術(shù)將有助于減少外源mRNA的信號(hào),從而降低炎癥反應(yīng)并改善mRNA的翻譯水平。

        1.1 序列構(gòu)建

        首先,mRNA疫苗需要設(shè)計(jì)一條DNA模板去進(jìn)行體外轉(zhuǎn)錄。該DNA模板至少需要包含目的蛋白質(zhì)的開(kāi)放閱讀框(open reading frame,ORF)、側(cè)翼的5′非翻譯區(qū)(5′untranslated region,5′UTR)和3′非翻譯區(qū)(3′untranslated region,3′UTR)。其次需要含有可用的RNA聚合酶(例如T7、T3或SP6噬菌體RNA聚合酶)[7]的引物結(jié)合位點(diǎn)啟動(dòng)體外轉(zhuǎn)錄。

        ORF本身編碼的目的蛋白質(zhì)會(huì)影響翻譯效率,有些稀有密碼子也會(huì)降低翻譯效率。而氨基酸可由幾個(gè)密碼子共同編碼,利用密碼子的兼并性可以優(yōu)化氨基酸對(duì)應(yīng)的密碼子進(jìn)而優(yōu)化翻譯過(guò)程[8]。但原始序列的操縱也可能導(dǎo)致不利結(jié)果,有研究表明即使是同義突變也會(huì)導(dǎo)致疾病的發(fā)生[9]。

        UTR具有重要的細(xì)胞功能,可以通過(guò)與RNA結(jié)合蛋白相互作用來(lái)影響mRNA降解速率和翻譯效率,從而調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)的表達(dá)[10]。5′UTR在翻譯的啟動(dòng)和啟動(dòng)前復(fù)合體的形成過(guò)程中起著重要的作用。5′UTR除了有助于啟動(dòng)翻譯和提高翻譯效率外,對(duì)mRNA的穩(wěn)定性也很重要。3′UTR可以通過(guò)包含如來(lái)自α-或β-珠蛋白等序列[11]來(lái)提高翻譯效率;也可以增加miRNA的結(jié)合位點(diǎn)來(lái)調(diào)控靶基因在不同組織的表達(dá),例如增加miRNA-122結(jié)合位點(diǎn)來(lái)減少在正常肝組織表達(dá)從而降低肝毒性[12]。此外,較高的GC含量和較低的U含量有利于降低免疫原性,最大限度地提高IVT mRNA的穩(wěn)定性[13]。

        1.2 體外轉(zhuǎn)錄

        體外轉(zhuǎn)錄(IVT)是將設(shè)計(jì)好的模板DNA鏈根據(jù)堿基互補(bǔ)原則轉(zhuǎn)錄生成RNA鏈的過(guò)程。RNA聚合酶識(shí)別轉(zhuǎn)錄啟動(dòng)子后轉(zhuǎn)錄開(kāi)始。在體外轉(zhuǎn)錄過(guò)程中,修飾的核苷酸可以用來(lái)進(jìn)一步穩(wěn)定RNA并降低免疫原性[14]。常見(jiàn)的替代有N6-甲基腺嘌呤(m6A)、5-甲基胞嘧啶(m5C)、5-甲基尿嘧啶(m5U)、2-硫代尿嘧啶(s2U)或假尿嘧啶(ψ)等。特別是m5C和ψ,不僅被報(bào)道降低體外轉(zhuǎn)錄后RNA的免疫原性,甚至可以提高翻譯效率。

        1.3 加帽

        真核細(xì)胞中典型的5′帽結(jié)構(gòu)是一個(gè)倒置的7-甲基鳥(niǎo)苷(m7G),它通過(guò)5′-5′三磷酸橋與RNA的第一個(gè)核苷酸共轉(zhuǎn)錄。5′帽結(jié)構(gòu)的功能是增加體外轉(zhuǎn)錄后RNA的穩(wěn)定性和翻譯效率,并消除其免疫原性。正常核糖體的結(jié)合與啟動(dòng)轉(zhuǎn)錄需要5′帽子結(jié)構(gòu)的作用,5′UTR和5′帽子結(jié)構(gòu)的作用相關(guān),在翻譯的啟動(dòng)和啟動(dòng)前復(fù)合體的形成過(guò)程中起著重要的作用。體外轉(zhuǎn)錄后RNA有一個(gè)高度免疫原性的5′三磷酸部分。三磷酸化的RNA在細(xì)胞質(zhì)中被模式識(shí)別受體(pattern recognition receptor,PRR)識(shí)別,并引起Ⅰ型干擾素(typeⅠinterferon,IFNⅠ)反應(yīng)[15]。為了防止RNA被識(shí)別為外源物質(zhì),必須去掉其三磷酸,并添加一個(gè)5′帽。有幾種方法來(lái)實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)[16]。加帽可以通過(guò)在體外轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中添加一個(gè)帽子類(lèi)似物來(lái)進(jìn)行共轉(zhuǎn)錄。添加一個(gè)帽子類(lèi)似物有可能會(huì)被錯(cuò)誤地結(jié)合,導(dǎo)致mRNA不具備翻譯能力,而抗反向帽類(lèi)似物(anti-reverse cap analog,ARCA)使聚合酶以正確的方向結(jié)合ARCA[17]。也可以通過(guò)用磷酸酶去除三磷酸腺苷和用2′-O-甲基轉(zhuǎn)移酶添加m7G來(lái)完成轉(zhuǎn)錄后的封頂。無(wú)論是轉(zhuǎn)錄中還是轉(zhuǎn)錄后加帽,都不能保證所有的RNA分子都會(huì)被修飾加帽,由于錯(cuò)誤封頂激活PRRs導(dǎo)致外源mRNA免疫原性的提高[18]。

        1.4 加尾

        Poly(A)尾可以使用Poly(A)聚合酶[19]在轉(zhuǎn)錄后添加,也可以構(gòu)建在模板中直接轉(zhuǎn)錄。Poly(A)尾可以減緩RNA免受RNA核酸外切酶的降解過(guò)程,提高RNA穩(wěn)定性和翻譯效率。Poly(A)尾的長(zhǎng)度一般是100~250個(gè)核苷酸,但最佳長(zhǎng)度取決于靶細(xì)胞類(lèi)型。使用修飾的腺苷可以進(jìn)一步提高多聚(A)尾的穩(wěn)定性,使其不受細(xì)胞核糖核酸酶的降解[20]。在DNA模板中構(gòu)建Oligo(dT)來(lái)添加Poly(A)尾可以更好地控制尾巴的精確長(zhǎng)度,并使隨后的酶促反應(yīng)失效,但作為模板的一部分其長(zhǎng)度往往受到限制。

        1.5 純化

        體外轉(zhuǎn)錄后需要純化mRNA,并測(cè)定其濃度,排除異常、截?cái)嗪徒导?jí)產(chǎn)品。臨床上通過(guò)層析的技術(shù)純化mRNA,去除了由轉(zhuǎn)錄失敗而引起的較短模板片段或由自身互補(bǔ)3′延伸引起的dsRNA,這兩者都是造成雜質(zhì)的常見(jiàn)原因。為了從轉(zhuǎn)錄的mRNA中去除dsRNA,人們提出了一種基于對(duì)纖維素的吸附來(lái)純化mRNA的替代方法[21]。在IVT過(guò)程中,可以通過(guò)降低Mg2+濃度或在高溫下產(chǎn)生RNA來(lái)減少dsRNA種類(lèi)[22]。HPLC實(shí)現(xiàn)了dsRNA的更完整和更徹底的去除[23]。然而,HPLC純化mRNA的成本高、收率低(<50%)。最近,Baiersdorfer等[21]報(bào)道了一種快速、廉價(jià)的純化方法。該方法利用dsRNA與含有乙醇的緩沖液中的纖維素粉的選擇性結(jié)合,結(jié)合快速蛋白液相色譜(fast protein liquid chromatography,F(xiàn)PLC),可去除高達(dá)90%的dsRNA。現(xiàn)經(jīng)證明,成功的mRNA翻譯和蛋白質(zhì)表達(dá)不需要使用任何修飾的核苷酸,更多地依賴于mRNA的純度和其單個(gè)部分的序列組成[24]。

        2 mRNA遞送系統(tǒng)

        除了構(gòu)建序列、生產(chǎn)mRNA,開(kāi)發(fā)高效、安全的mRNA疫苗遞送系統(tǒng)也是mRNA疫苗技術(shù)的關(guān)鍵。已有的傳統(tǒng)方法,如體外負(fù)載樹(shù)突狀細(xì)胞(dendritic cell,DC)、結(jié)內(nèi)輸送mRNA和機(jī)械方法(基因槍、電穿孔)來(lái)傳遞裸露的mRNA用于疫苗接種[25],但這些方法要么復(fù)雜昂貴(體外負(fù)載DC),要么難以在人體內(nèi)使用(結(jié)內(nèi)輸送、電穿孔),因此,傳遞mRNA的理想方式是使用一種能夠保護(hù)mRNA不被降解,并促進(jìn)細(xì)胞有效攝取的材料。

        2.1 多聚體納米顆粒

        多聚體納米顆粒封裝mRNA可保護(hù)mRNA并使其免于降解,并且其特定的化學(xué)性質(zhì)可以幫助細(xì)胞攝取和內(nèi)體逃逸。聚乙烯亞胺(polyethylenimine,PEI)是一種廣泛用于核酸輸送的陽(yáng)離子聚合物,商品化的線性PEI衍生物jetPEI?已被用于體內(nèi)和體外的mRNA轉(zhuǎn)染。脂肪鏈修飾的低分子PEI可以降低毒性[26-27]。聚酰胺胺(polyamidoamine,PAMAM)或聚丙烯亞胺樹(shù)枝狀大分子是另一類(lèi)用于mRNA傳遞的陽(yáng)離子高分子材料。Khan等[27]開(kāi)發(fā)了脂肪鏈修飾的PAMAM樹(shù)枝狀大分子,用于系統(tǒng)地將siRNA輸送到肺內(nèi)皮細(xì)胞并遞送了抗原編碼的SAM。生物可降解聚合物的開(kāi)發(fā)是為了提高運(yùn)載工具的清除率,同時(shí)降低其荷電毒性。聚β-氨基酯(poly beta-amino esters,PBAEs)是一種用于siRNA/mRNA遞送的生物可降解聚合物。此外,Blakeny等[28]開(kāi)發(fā)的生物可還原聚CBA-co-4-氨基-1-丁醇(Pabol)被用于在小鼠體內(nèi)傳遞編碼血凝素(HA)的SAM。

        2.2 蛋白質(zhì)-mRNA復(fù)合體

        蛋白質(zhì)-mRNA復(fù)合體是指將魚(yú)精蛋白等蛋白質(zhì)直接綴合到RNA,該復(fù)合體通過(guò)胞吞作用進(jìn)入細(xì)胞,通過(guò)涉及Toll樣受體(Toll-like receptor,TLR) 的 髓 系 分 化 標(biāo) 志 物88(myeloid differentiation marker 88,MyD88)依賴性途徑激活免疫系統(tǒng)。魚(yú)精蛋白是一種陽(yáng)離子多肽,通過(guò)靜電相互作用自發(fā)縮合mRNA,保護(hù)包裹的mRNA不被細(xì)胞外核糖核酸酶降解。魚(yú)精蛋白-mRNA復(fù)合物還可以作為佐劑,激活TLR7/8以誘導(dǎo)Th-1型免疫反應(yīng)[29-30]。RNActive?疫苗在Ⅰ/Ⅱ期患者中具有良好的耐受性和免疫原性,其中一些已經(jīng)顯示出中等的抗腫瘤效果。陽(yáng)離子細(xì)胞穿透肽(cellpenetrating peptides,CPPs)能 與RNA形 成 復(fù) 合物。研究人員推測(cè)CPPs可能促進(jìn)帶負(fù)電荷的糖胺聚糖在細(xì)胞表面聚集,并引發(fā)微胞吞噬[30]。

        2.3 脂質(zhì)納米顆粒(lipid nanoparticles,LNPs)

        近幾年,高效核酸輸送材料的開(kāi)發(fā)取得了突飛猛進(jìn)的進(jìn)展。脂質(zhì)納米顆粒(lipid nanoparticles,LNPs)最初是為小干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)遞送而研發(fā),現(xiàn)已成為目前使用最廣泛的體內(nèi)傳遞mRNA材料[31]。Pardi等[32]證實(shí)mRNA-LNPs可以在體內(nèi)表達(dá)后,多項(xiàng)腫瘤疫苗研究已經(jīng)使用了LNPs包裹的mRNA。此外,2021年,中國(guó)國(guó)家納米科學(xué)中心王海、聶廣軍團(tuán)隊(duì)[33]設(shè)計(jì)了一款水凝膠長(zhǎng)效穩(wěn)定RNA疫苗,體內(nèi)動(dòng)物實(shí)驗(yàn)顯示將其皮下注射后,可以至少在30 d內(nèi)持續(xù)釋放RNA納米疫苗,進(jìn)入引流淋巴結(jié)內(nèi)部并且被抗原提呈細(xì)胞攝取,實(shí)現(xiàn)持久的抗腫瘤免疫治療效果。

        3 mRNA激發(fā)的免疫應(yīng)答反應(yīng)

        注射mRNA疫苗后,編碼的蛋白質(zhì)將被翻譯并呈遞給免疫系統(tǒng)。該過(guò)程類(lèi)似于RNA病毒感染的自然過(guò)程及其連續(xù)誘導(dǎo)的保護(hù)性免疫應(yīng)答。外源mRNA進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)后會(huì)發(fā)生與內(nèi)源性mRNA相似的反應(yīng)——mRNA在細(xì)胞質(zhì)中被翻譯成蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)經(jīng)過(guò)翻譯后修飾通過(guò)靶向序列或跨膜結(jié)構(gòu)域進(jìn)入亞細(xì)胞間隔,比如分泌途徑、細(xì)胞膜、細(xì)胞核、線粒體或過(guò)氧化物酶體[34]。因此,遞送外源mRNA進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)對(duì)于抗原的表達(dá)至關(guān)重要,但這個(gè)過(guò)程是通過(guò)胞內(nèi)體途徑還是通過(guò)質(zhì)膜直接進(jìn)入尚未研究透徹[35]。

        3.1 mRNA腫瘤疫苗誘導(dǎo)固有免疫反應(yīng)

        3.1.1 免疫細(xì)胞識(shí)別

        外源性mRNA通常被認(rèn)為是具有免疫原性的,表現(xiàn)為類(lèi)似RNA病毒特性,通過(guò)TLR激活先天免疫細(xì)胞[7,36]。TLR屬于固有免疫反應(yīng)PRR的一組,作為病原體相關(guān)分子模式(pathogen-associated molecular patterns,PAMP)的“感受 器”檢測(cè)PAMP。mRNA可被抗原呈遞細(xì)胞(antigen presenting cell,APC)識(shí)別,激活TLR,如TLR3、TLR7和TLR8[37],一旦TLR感應(yīng)到PAMP,就會(huì)通過(guò)連續(xù)激活適應(yīng)性免疫應(yīng)答來(lái)啟動(dòng)先天免疫應(yīng)答[38],產(chǎn)生促炎細(xì)胞因子如腫瘤壞死因子α(tumor necrosis factor-α,TNF-α),干 擾 素α(interferon-α,IFN-α),白介素-6(interleukin-6,IL-6),干擾素γ(interferon-γ,IFN-γ)誘導(dǎo)蛋白10和APC(如DC)上的共刺激分子[39]。最終導(dǎo)致適應(yīng)性B細(xì)胞和T細(xì)胞應(yīng)答的產(chǎn)生[38]。TLR7由B細(xì)胞[40]、巨噬細(xì)胞和DC[41]表達(dá),并且可以檢測(cè)單鏈RNA(single stranded RNA,ssRNA)。因此,B細(xì)胞通過(guò)MYD88/TLR7依賴性信號(hào)通路快速激活,為調(diào)節(jié)mRNA疫苗誘導(dǎo)的適應(yīng)性免疫應(yīng)答提供刺激。此外,TLR7信號(hào)傳導(dǎo)增加促炎細(xì)胞因子的產(chǎn)生,增加抗原呈遞并改善記憶B細(xì)胞存活[35]。

        3.1.2 非免疫細(xì)胞識(shí)別

        在非免疫細(xì)胞中,細(xì)胞質(zhì)維甲酸誘導(dǎo)基因Ⅰ(retinoic acid-inducible gene I,RIG-I)樣 受 體(RIG-I like receptor,RLR)和黑色素瘤分化相關(guān)基因(melanoma differentiation-associated gene 5,MDA5)感知外源mRNA并介導(dǎo)細(xì)胞因子和趨化因子的產(chǎn)生[19,40,42-43],進(jìn)而招募先天免疫細(xì)胞,如DC和巨噬細(xì)胞到mRNA注射部位[42]。雖然早期誘導(dǎo)強(qiáng)大細(xì)胞因子的產(chǎn)生對(duì)提高疫苗效力來(lái)說(shuō)是有利的,但由于細(xì)胞因子會(huì)導(dǎo)致自身免疫等嚴(yán)重的全身副作用,或削弱mRNA疫苗的免疫應(yīng)答使得腫瘤疫苗不能完全發(fā)揮抗腫瘤免疫作用(圖2)。有研究表明,在慢性感染發(fā)生時(shí),IFN-Ⅰ應(yīng)答保持不變,產(chǎn)生的多種下游效應(yīng)與持續(xù)的T細(xì)胞受體(T cell receptor,TCR)信號(hào)和其他免疫調(diào)節(jié)機(jī)制(如共抑制受體、免疫抑制細(xì)胞因子的表達(dá)和調(diào)節(jié)性T細(xì)胞數(shù)量的增加)相結(jié)合,這會(huì)導(dǎo)致CD8+T細(xì)胞反應(yīng)功能障礙,也稱為T(mén)細(xì)胞耗竭。因此人們?cè)趍RNA疫苗技術(shù)中尋求用不同的方法來(lái)將IFNⅠ等細(xì)胞因子的誘導(dǎo)降至最低。例如,Miao等[15]提出,加入不飽和脂質(zhì)尾部、二氫咪唑接頭和環(huán)胺頭部基團(tuán)的mRNA,可以通過(guò)細(xì)胞內(nèi)干擾素基因(stimulator of interferon genes,STING)途徑而不是TLR途徑激活A(yù)PC,從而減少細(xì)胞因子的表達(dá),降低由于細(xì)胞因子引起的自身免疫反應(yīng)導(dǎo)致的副作用,提高抗腫瘤效果。

        綜上所述,對(duì)于外源mRNA的先天感應(yīng)可能導(dǎo)致mRNA翻譯停滯、mRNA降解以及連續(xù)的次要抗原特異性免疫反應(yīng)[43],這些表明在mRNA接種后先天免疫和獲得性免疫之間存在密切聯(lián)系。

        3.2 mRNA腫瘤疫苗誘導(dǎo)獲得性免疫

        3.2.1 抗原呈遞

        在注射mRNA疫苗后,其編碼的蛋白質(zhì)將被翻譯并呈遞給免疫系統(tǒng),并激發(fā)獲得性免疫。mRNA編碼的蛋白質(zhì)被翻譯后通過(guò)微吞飲、內(nèi)吞或吞噬作用被APC(如DC)攝?。?4],可能形成含有抗原蛋白的吞噬小體或內(nèi)小體[45],通過(guò)DC上的主要組織相容性復(fù)合體Ⅰ(MHC-Ⅰ)和主要組織相容性復(fù)合體Ⅱ(MHC-Ⅱ)提呈。APC可以將外源抗原通過(guò)MHC-II呈遞給CD4+T細(xì)胞,并在MHCI上交叉呈遞給CD8+T細(xì)胞。由此產(chǎn)生的細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞誘導(dǎo)稱為交叉激發(fā)。CD4+T細(xì)胞為B細(xì)胞和CD8+T細(xì)胞提供幫助。最后,抗原特異性B細(xì)胞和T細(xì)胞的克隆擴(kuò)增導(dǎo)致靶細(xì)胞消除。此外,所有有核細(xì)胞都有能力去處理mRNA并在MHC-Ⅰ上呈遞翻譯的蛋白質(zhì)或多肽,但只有APC能夠在MHC-Ⅰ和MHC-Ⅱ上呈遞,進(jìn)而誘導(dǎo)CD4+T細(xì)胞和B細(xì)胞產(chǎn)生免疫反應(yīng)(圖3)。此外,DC可以內(nèi)化活細(xì)胞的胞漿和細(xì)胞膜物質(zhì)來(lái)啟動(dòng)T細(xì)胞反應(yīng)[46]。

        3.2.2抗原分類(lèi)

        為了誘導(dǎo)獲得性免疫,需要將特定的抗原提呈給免疫細(xì)胞。mRNA腫瘤疫苗通常編碼TAA,這些抗原在癌細(xì)胞上優(yōu)先表達(dá)。對(duì)這些腫瘤來(lái)源的抗原進(jìn)行分類(lèi),可以細(xì)分為:a.組織分化抗原如人類(lèi)癌胚抗原(human carcinoembryonic antigen,CEA)或MART-1,也可在健康組織上表達(dá);b.腫瘤種系(睪丸癌)抗原(例如NY-ESO-1或MAGE-3);c.腫瘤細(xì)胞過(guò)表達(dá)的正常蛋白(如EGFR、MUC1、Her2/neu);d.病毒蛋白(如EBV、HPV);e.腫瘤特 異 性 突 變 抗 原(如MUM-1、β-catenin或CDK4)[47-48]?;虍惓J悄[瘤發(fā)展的重要驅(qū)動(dòng)因素[49]。體細(xì)胞突變可能產(chǎn)生新抗原表位,這些表位是腫瘤衍生的肽并且可以與MHC結(jié)合[50]并被T細(xì)胞識(shí)別,因此編碼新抗原的mRNA疫苗被認(rèn)為是最佳的腫瘤疫苗候選[49]。同樣,識(shí)別這些抗原的T細(xì)胞在過(guò)繼轉(zhuǎn)移或免疫檢查點(diǎn)抑制后介導(dǎo)臨床反應(yīng)[51]。且有研究表明含有較高新抗原表位負(fù)荷的腫瘤,如黑色素瘤、非小細(xì)胞肺癌和錯(cuò)配修復(fù)缺陷的結(jié)直腸癌,都對(duì)免疫檢查點(diǎn)抑制劑有較好的反應(yīng)[52]。

        3.2.3 免疫效應(yīng)

        基于多肽的疫苗受到MHC限制,而mRNA疫苗允許組合編碼不同抗原的mRNA。mRNA電穿孔的樹(shù)突狀細(xì)胞具有多種MHC-I和MHC-II限制性多肽,并能誘導(dǎo)多克隆的CD4+和CD8+T細(xì)胞應(yīng)答。CD4+輔助T細(xì)胞對(duì)于有效誘導(dǎo)細(xì)胞毒T淋巴細(xì)胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)和B細(xì)胞應(yīng)答非常重要[53],并且mRNA疫苗在存在輔助表位時(shí)可以進(jìn)一步提高免疫應(yīng)答。將mRNA導(dǎo)入樹(shù)突狀細(xì)胞后,誘導(dǎo)CD4+T細(xì)胞反應(yīng)是由自噬介導(dǎo)的[54]。最后,疫苗組合物中可以包括編碼免疫調(diào)節(jié)蛋白的mRNA,可以進(jìn)一步提高其效力。綜上所述,編碼兩個(gè)或更多蛋白質(zhì)或長(zhǎng)肽的mRNA疫苗可以實(shí)現(xiàn)廣泛的多克隆免疫反應(yīng),避免了對(duì)某些MHC分子的限制和由于抗原丟失而導(dǎo)致的免疫逃逸風(fēng)險(xiǎn)。

        應(yīng)用編碼突變抗原表位的mRNA可產(chǎn)生強(qiáng)烈的抗原特異性CD8+T細(xì)胞反應(yīng)和有效持久的CD4+T細(xì)胞介導(dǎo)的腫瘤消退。Kreiter等[55-56]證明,大多數(shù)腫瘤特異性突變是由CD4+T細(xì)胞識(shí)別的,這種細(xì)胞具有很強(qiáng)的抗腫瘤活性。CD4+T細(xì)胞應(yīng)答主要由一種以Th1為主的免疫應(yīng)答以及由CD4+和CD8+T細(xì)胞產(chǎn)生的IFN-γ組成。對(duì)于這種強(qiáng)烈的Th1反應(yīng),不同的研究試圖利用mRNA疫苗作為工具來(lái)調(diào)節(jié)Th分化。例如,對(duì)于Ⅱ型免疫反應(yīng)(其特征是分泌細(xì)胞因子IL-4、IL-5、IL-13和過(guò)敏原特異性IgE),應(yīng)用了mRNA疫苗從而減少了過(guò)敏性輔助T細(xì)胞(T helper 2,Th2)反應(yīng)。

        除了誘導(dǎo)T細(xì)胞免疫外,mRNA疫苗還誘導(dǎo)中和抗體。T濾泡輔助細(xì)胞(T follicular helper,Tfh)不僅對(duì)生發(fā)中心(germinal center,GC)的發(fā)生至關(guān)重要,還驅(qū)動(dòng)免疫球蛋白類(lèi)的轉(zhuǎn)換、親和力成熟和持久的B細(xì)胞記憶反應(yīng)。盡管Tfh的確切機(jī)制尚未清楚,但這種細(xì)胞會(huì)被mRNA疫苗激活,然后產(chǎn)生足夠數(shù)量、有效和持久的中和抗體[57]。Pardi等[58]將脂質(zhì)納米顆粒包裹的mRNA疫苗用于皮下注射,發(fā)現(xiàn)可以誘導(dǎo)小鼠和非人靈長(zhǎng)類(lèi)動(dòng)物產(chǎn)生抗原特異性CD4+T細(xì)胞、B細(xì)胞和漿細(xì)胞反應(yīng)以及高效的中和抗體。疫苗的接種方式?jīng)Q定了抗原表達(dá)的持續(xù)時(shí)間(肌肉注射較皮內(nèi)注射表達(dá)的時(shí)間長(zhǎng)),持續(xù)的抗原表達(dá)導(dǎo)致高抗體滴度以及生發(fā)中心B細(xì)胞和Tfh反應(yīng)[59]。

        4 mRNA疫苗的抗腫瘤免疫應(yīng)答策略

        多種技術(shù)可以改善mRNA的傳遞、組成、免疫原性或可譯性。然而,大多數(shù)腫瘤疫苗試驗(yàn)很難在晚期或難治性腫瘤患者中發(fā)揮作用,其中,主要原因是無(wú)法高效誘導(dǎo)T細(xì)胞免疫反應(yīng)。TAA是一種非突變自身抗原,通常能誘導(dǎo)中樞T細(xì)胞耐受[60]。所以針對(duì)腫瘤的免疫反應(yīng)需要考慮幾個(gè)具體的因素:疫苗應(yīng)用的最佳時(shí)機(jī)、靶抗原的選擇、與免疫佐劑的聯(lián)用、對(duì)腫瘤微環(huán)境的改變以及與其他腫瘤治療結(jié)合(圖4)。這些策略可能會(huì)產(chǎn)生協(xié)同甚至相加的抗腫瘤效果。

        4.1 疫苗應(yīng)用時(shí)機(jī)

        腫瘤疫苗通常在腫瘤達(dá)到一定大小或已經(jīng)轉(zhuǎn)移時(shí)使用。這時(shí)癌細(xì)胞與免疫系統(tǒng)進(jìn)行了長(zhǎng)時(shí)間的“互動(dòng)”,可能已經(jīng)形成了逃離免疫系統(tǒng)的機(jī)制,并削弱了疫苗誘導(dǎo)的抗癌免疫的治療效果[61]。因此,為提高mRNA疫苗治療效果,應(yīng)在疾病的早期階段(如輔助治療期間)應(yīng)用。如在一項(xiàng)隨機(jī)的II期臨床試驗(yàn)中,招募黑色素瘤術(shù)后且無(wú)復(fù)發(fā)的患者,進(jìn)行自體DC遞送編碼TriMix的mRNA和編碼4種TAA(MAGE-A3、MAGE-C2、酪 氨 酸 酶 或gp100)之一的mRNA共電穿孔治療并與HLA II類(lèi)靶向信號(hào)相關(guān)的療效[62-63]。這種治療耐受性良好,提高了患者1年無(wú)病存活率。研究者提出,與CPI聯(lián)合治療或靶向治療可能會(huì)進(jìn)一步提高高復(fù)發(fā)風(fēng)險(xiǎn)患者的存活率[63]。

        4.2 靶抗原選擇

        腫瘤患者個(gè)體間的異質(zhì)性會(huì)阻礙有效的免疫誘導(dǎo),使產(chǎn)生的腫瘤免疫反應(yīng)明顯不同。腫瘤累積了數(shù)以千計(jì)的基因組突變,其中一小部分會(huì)產(chǎn)生新的抗原表位,這些表位可以被免疫系統(tǒng)識(shí)別,并抑制腫瘤生長(zhǎng)。下一代測(cè)序(next generation sequencing,NGS)技術(shù)的進(jìn)步可破譯腫瘤患者的基因組、外顯子組和轉(zhuǎn)錄組,從而針對(duì)腫瘤患者的個(gè)體免疫原性突變構(gòu)建個(gè)性化mRNA疫苗,并實(shí)現(xiàn)快速大量生產(chǎn),極大地推動(dòng)了個(gè)性化腫瘤治療的進(jìn)展[64-65]。

        4.3 免疫佐劑聯(lián)用

        在mRNA疫苗系統(tǒng)中添加免疫佐劑可以增強(qiáng)mRNA疫苗的免疫原性。如用諾華公司生產(chǎn)的佐劑MF59和陽(yáng)離子納米乳劑(cationic nanoemulsion,CNE)配制的自擴(kuò)增RNA疫苗,在各種動(dòng)物模型中被證明可以增強(qiáng)mRNA疫苗的免疫原性和有效性[7,66]。某些免疫調(diào)節(jié)分子也具有佐劑活性。TriMix是布魯塞爾大學(xué)開(kāi)發(fā)的一種新的佐劑策略,由編碼三種免疫激活蛋白的mRNA組成CD70、CD40配 體(CD40L)和TLR4[30,62,67]。TriMix mRNA可以增加裸露的、未修飾的、未純化的mRNA的免疫原性,它還與增強(qiáng)DCs的成熟度和細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞反應(yīng)有關(guān)[67]。2018年,Leal等[68]采用TriMix裸體mRNA策略治療獲得性免疫缺陷綜合征 (acquired immune deficiency syndrome,AIDS)患者。使用大劑量TriMix mRNA的治療表明,可以刺激和檢測(cè)到高的人類(lèi)免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)特異性T細(xì)胞反應(yīng)。這項(xiàng)研究已經(jīng)證明了這種策略的高度安全性和耐受性。CureVac公司還開(kāi)發(fā)了具有所謂自佐劑活性的RNActive?疫苗。它們只包含有體外轉(zhuǎn)錄的mRNA和魚(yú)精蛋白復(fù)合的絡(luò)合物[69-70]。這種遞送的mRNA尤其增強(qiáng)了B和T細(xì)胞反應(yīng),包括T細(xì)胞效應(yīng)和記憶反應(yīng),以及Th1和Th2細(xì)胞和GC B細(xì)胞等亞群的擴(kuò)張[42,69]。在臨床前模型中,RNActive?疫苗可有效預(yù)防不同的流感病毒株,并顯示出抗腫瘤效果[42,70-72]。疫苗可有效預(yù)防不同的流感病毒株,并顯示出抗腫瘤效果[72-73]。

        4.4 改變腫瘤微環(huán)境

        腫瘤微環(huán)境(tumor microenvironment,TME)中存在的幾個(gè)免疫細(xì)胞是免疫抑制環(huán)境中的關(guān)鍵調(diào)節(jié)細(xì)胞,促進(jìn)了腫瘤的發(fā)生以及血管生成和轉(zhuǎn)移[74]。其中,癌相關(guān)成纖維細(xì)胞(cancerassociated fibroblasts,CAF)和腫瘤相關(guān)巨噬細(xì)胞(tumor-associated macrophages,TAMs)可被認(rèn)為是在TME中發(fā)現(xiàn)的最豐富的非腫瘤細(xì)胞且TAMs對(duì)環(huán)境刺激有顯著的反應(yīng)潛力,許多研究表明,TAMs的調(diào)節(jié)可以誘導(dǎo)抗腫瘤T細(xì)胞反應(yīng)[75-78]。已有研究表明,使用IVT mRNA編碼TAMs[79],通過(guò)CAR-T納米顆粒技術(shù)將其送入腫瘤內(nèi),可以誘導(dǎo)腫瘤相關(guān)DCs(tumor-associated DCs,TADC)的局部調(diào)節(jié)[80]。TME中腫瘤細(xì)胞與各種免疫組分的相互作用可以顯著影響腫瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)。大多數(shù)腫瘤細(xì)胞通過(guò)表達(dá)免疫抑制蛋白如程序性死亡配體1(PD-L1)、產(chǎn)生免疫抑制因子如IL-10和趨化因子、招募免疫抑制細(xì)胞如調(diào)節(jié)性T細(xì)胞、M2巨噬細(xì)胞和髓系來(lái)源的抑制細(xì)胞來(lái)進(jìn)行免疫逃逸,這種促進(jìn)腫瘤生長(zhǎng)的微環(huán)境導(dǎo)致T細(xì)胞的無(wú)能和耗盡,從而延長(zhǎng)了腫瘤細(xì)胞的存活期[61,81]。因此,理想的腫瘤疫苗可以改善局部免疫細(xì)胞組成,恢復(fù)腫瘤免疫監(jiān)視。免疫檢查點(diǎn)已被證明能影響腫瘤微環(huán)境的結(jié)構(gòu),并且有重新激活和擴(kuò)大原有T細(xì)胞或誘導(dǎo)新的抗癌免疫反應(yīng)的潛力[82]。免疫檢查點(diǎn)抑制劑能夠維持一次誘導(dǎo)的免疫反應(yīng),并防止T細(xì)胞耗竭標(biāo)志物的上調(diào),這使它們成為mRNA疫苗的有效伴侶[83]。例如,免疫檢查點(diǎn)抑制劑與編碼Trp2的mRNA疫苗相結(jié)合,在C57BL/6小鼠B16F10黑色素瘤模型中誘導(dǎo)了強(qiáng)大的TAA特異性免疫反應(yīng),從而抑制了腫瘤的生長(zhǎng)[83]。在這個(gè)模型中,PD-L1 siRNA和mRNA疫苗的聯(lián)合傳遞下調(diào)了抗原呈遞DC中PD-L1的表達(dá),從而增加了T細(xì)胞的激活和增殖[83]。

        5 mRNA腫瘤疫苗臨床研究進(jìn)展

        mRNA經(jīng)DC遞送的疫苗是第一個(gè)進(jìn)入臨床試驗(yàn)的mRNA治療性腫瘤疫苗[30]。目前基于IVT mRNA的疫苗主要分為3部分,mRNA編碼免疫刺激劑、TAA和TSA。在大多數(shù)臨床試驗(yàn)中,mRNA腫瘤疫苗已被應(yīng)用于治療侵襲性、難治性和轉(zhuǎn)移性實(shí)體腫瘤,并進(jìn)一步與檢查點(diǎn)調(diào)節(jié)劑或細(xì)胞因子結(jié)合以增強(qiáng)抗腫瘤效果。這一部分綜述了mRNA編碼的免疫刺激劑、腫瘤相關(guān)抗原和腫瘤特異性抗原腫瘤疫苗在臨床的應(yīng)用,以及討論個(gè)性化疫苗和帶有檢查點(diǎn)阻斷調(diào)節(jié)劑的聯(lián)合免疫療法的優(yōu)勢(shì)。

        mRNA編碼的免疫刺激劑通常是細(xì)胞因子或趨化因子,它們誘導(dǎo)APC成熟和并激活A(yù)PC,激活T細(xì)胞介導(dǎo)的免疫,并調(diào)節(jié)功能失調(diào)的免疫腫瘤微環(huán)境。已經(jīng)被用來(lái)編碼免疫刺激劑的mRNA,目前大多數(shù)評(píng)估處于I/II階段,并評(píng)估單一治療或與其他藥物(包括PD-1/PD-L1抗體或腫瘤疫苗)聯(lián)合治療的耐受性(表1)。

        抗原選擇是開(kāi)發(fā)有效的腫瘤疫苗的基礎(chǔ)。腫瘤疫苗可以被設(shè)計(jì)成針對(duì)在惡性腫瘤細(xì)胞中優(yōu)先表達(dá)的TAA。例如,酪氨酸酶、gp100、MAGE-A3、MAGE-C2已被確定為黑色素瘤的TAA。在多項(xiàng)臨床研究中,編碼所有TAA的mRNA疫苗已經(jīng)用于治療轉(zhuǎn)移性黑色素瘤(表2)。

        多種因素限制了TAA疫苗的廣泛應(yīng)用,如:a.僅在某些實(shí)體腫瘤中發(fā)現(xiàn)有限的TAA,從而限制了其應(yīng)用;b.TAA具有廣泛的變異性,導(dǎo)致免疫效應(yīng)逃逸和產(chǎn)生耐藥性;c.正常組織中也存在TAA。針對(duì)TAA的疫苗可能會(huì)引發(fā)中樞和外周免疫耐受反應(yīng),從而降低疫苗接種效率。腫瘤特異性抗原,又稱為新抗原,是目前mRNA疫苗的核心靶點(diǎn)。新抗原來(lái)源于腫瘤細(xì)胞中的隨機(jī)體細(xì)胞突變,而正常細(xì)胞中不存在。新抗原可以被宿主免疫系統(tǒng)識(shí)別為一個(gè)“非我”組分,因此是腫瘤疫苗的一個(gè)顯著靶點(diǎn)[84]。開(kāi)發(fā)個(gè)性化新抗原疫苗最關(guān)鍵的的一步是鑒定和確認(rèn)患者腫瘤中表達(dá)的特異性免疫原性非同義體細(xì)胞突變。首先進(jìn)行腫瘤組織活檢。腫瘤組織的活檢是為了進(jìn)行完整的外顯子組、RNA或轉(zhuǎn)錄組測(cè)序??梢酝ㄟ^(guò)比較腫瘤和匹配的健康組織的序列來(lái)識(shí)別腫瘤中的非同義體細(xì)胞突變,如點(diǎn)突變和插入缺失。接著使用MHC-Ⅰ類(lèi)表位預(yù)測(cè)算法篩選、分析和鑒定具有最高免疫原性的突變。進(jìn)一步確認(rèn)候選抗原的排序列表?;谛驴乖膫€(gè)性化疫苗可以針對(duì)各種類(lèi)型的變異突變[84](表3)。

        Table 1 Clinical trials of mRNA encoding an immunostimulant表1編碼免疫刺激劑的mRNA的臨床試驗(yàn)

        Table 2 Clinical trials of mRNA encoding TAAs表2編碼TAAs的mRNA的臨床試驗(yàn)

        Table 3 Clinical trials of mRNA encoding neo-antigen(Neo-Ag)表3編碼新抗原(Neo-Ag)mRNA的臨床試驗(yàn)

        續(xù)表3

        6 安全與挑戰(zhàn)

        直到2020年,世界上還沒(méi)有批準(zhǔn)單一的mRNA疫苗治療方案。自新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)疫情爆發(fā)以來(lái),美國(guó)食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準(zhǔn)了針對(duì)嚴(yán)重急性呼吸綜合征冠狀病毒2(SARS-CoV-2)的不同mRNA疫苗,證明mRNA疫苗針對(duì)新出現(xiàn)的傳染病大流行具有快速有效的生產(chǎn)優(yōu)勢(shì)。然而,與傳染病類(lèi)疫苗針對(duì)明確抗原的預(yù)防性接種不同,大多數(shù)腫瘤靶標(biāo)抗原表現(xiàn)出高度的個(gè)體間異質(zhì)性,且數(shù)量有限、特征不明顯,mRNA腫瘤疫苗安全性、有效性問(wèn)題顯得尤為突出。開(kāi)發(fā)腫瘤疫苗的另一挑戰(zhàn)在于抗癌治療性疫苗需要激活MHC-Ⅰ介導(dǎo)的CD8+T細(xì)胞反應(yīng),這進(jìn)一步增加了有效抗腫瘤免疫的難度。作為一種治療性腫瘤疫苗,需要較大用藥劑量、且多次重復(fù)給藥。治療性腫瘤疫苗需要對(duì)mRNA的生產(chǎn)有更高的安全性標(biāo)準(zhǔn)[85]。

        mRNA疫苗的安全性體現(xiàn)在以下幾個(gè)方面。a.mRNA腫瘤疫苗可以同時(shí)編碼多種抗原,具有非整合性、高度可降解性、無(wú)插入誘變潛力等特點(diǎn)。b.IVT產(chǎn)生的mRNA不含細(xì)胞和致病病毒成分,沒(méi)有感染的可能性,在正在進(jìn)行的臨床試驗(yàn)中測(cè)試的大多數(shù)mRNA疫苗通常耐受性良好,很少出現(xiàn)注射部位免疫反應(yīng)[86]。全身性炎癥也可以通過(guò)去除dsRNA等污染物或改變給藥途徑等方式將先天免疫反應(yīng)限制在局部注射部位。由于I型干擾素反應(yīng)的激活可能與自身免疫有關(guān),所以在mRNA疫苗接種之前必須評(píng)估個(gè)體自身免疫反應(yīng)增加的風(fēng)險(xiǎn)[25]。c.mRNA腫瘤疫苗的另一個(gè)優(yōu)點(diǎn)是生產(chǎn)速度快。成熟的mRNA制造技術(shù)可以在短時(shí)間內(nèi)生產(chǎn)出新型疫苗。最近新抗原的發(fā)現(xiàn)和鑒定促進(jìn)了個(gè)性化疫苗治療的發(fā)展。mRNA疫苗先驅(qū)BioNTech和Moderna領(lǐng)導(dǎo)的治療實(shí)體腫瘤的臨床試驗(yàn)展示了個(gè)性化疫苗強(qiáng)大的抗腫瘤免疫功能[87],開(kāi)啟了治療性腫瘤疫苗的新紀(jì)元。為了進(jìn)一步提高mRNA疫苗的抗癌效力,應(yīng)當(dāng)聯(lián)合使用特定佐劑、CPIs、T細(xì)胞激活單克隆抗體、調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境(如細(xì)胞因子)或聯(lián)合放射治療或化療,以克服免疫逃逸機(jī)制以提高疫苗效力。目前有多項(xiàng)以評(píng)估m(xù)RNA疫苗與其他腫瘤療法的聯(lián)合應(yīng)用療效的臨床試驗(yàn)正在進(jìn)行。這些臨床試驗(yàn)有助于發(fā)現(xiàn)更安全、更高效的抗腫瘤療法,以提高腫瘤患者的生存質(zhì)量。

        綜上所述,mRNA是一種功能強(qiáng)大、用途廣泛的腫瘤疫苗治療方式,有望顯著提高腫瘤臨床治療效果。未來(lái)的研究應(yīng)集中(但不限于)解決mRNA矛盾的免疫原性、設(shè)計(jì)先進(jìn)和可耐受的遞送系統(tǒng),來(lái)提高抗原表達(dá)和提呈的效率,以及優(yōu)化mRNA的結(jié)構(gòu)以達(dá)到延長(zhǎng)和控制表達(dá)持續(xù)時(shí)間的目的。此外,應(yīng)繼續(xù)發(fā)展腫瘤個(gè)性化疫苗,提高患者的生存率和生活質(zhì)量。

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