鄒玥,劉穎,郭雪華
作者單位:吉林省婦幼保健院中心實驗室,吉林 長春 130000
胎兒心臟發(fā)育畸形是臨床常見的先天畸形類型,據(jù)報道[1],心臟發(fā)育畸形在胎兒期的發(fā)生率約為0.3%~1.4%,因心臟發(fā)育畸形導(dǎo)致的妊娠終止率可高達(dá)75%,其存活率僅有10%~38%,存活患兒經(jīng)治療后也有部分預(yù)后不良,影響身體健康。胎兒心臟發(fā)育畸形受遺傳、環(huán)境等多因素影響,近年來研究發(fā)現(xiàn)[2],染色體22q11.2微缺失與胎兒心臟發(fā)育畸形關(guān)系密切,染色體22q11.2微缺失病例中有60%~80%病例合并心臟發(fā)育畸形。臨床對22q11.2微缺失所致的胎兒心臟發(fā)育畸形尚無有效治療方法,因此進(jìn)行產(chǎn)前早期篩查診斷對降低死胎率和活產(chǎn)兒心臟畸形率非常重要。目前微陣列比較基因組雜交技術(shù)(array comparative genomic hybridization,arrayCGH)是替代傳統(tǒng)分析細(xì)胞核型的有效工具,無需細(xì)胞培養(yǎng)即可高分辨準(zhǔn)確檢測出染色體微缺失,但價格高、難度大,而近幾年臨床應(yīng)用較多的多重連接探針擴(kuò)增技術(shù)(multiplex ligation probe amplification,MLPA)雖花費較少,操作簡單,但該方法與arrayCGH均需行羊水穿刺采集樣本,會增加早產(chǎn)、宮內(nèi)感染、宮內(nèi)死亡的風(fēng)險,孕婦及家屬接受度不高,不適用于產(chǎn)前篩查[3-4]。近年來新一代測序技術(shù)打破了傳統(tǒng)產(chǎn)前診斷的局限性,該技術(shù)包括大規(guī)模平行測序、焦磷酸測序、Illumina測序等多種方法,具有低成本、高通量、無創(chuàng)傷的特點,在胎兒遺傳病基因檢測和生殖篩查中優(yōu)勢顯著[5],但目前該技術(shù)在22q11.2微缺失所致的胎兒心臟發(fā)育畸形中的應(yīng)用及診斷效能尚未有研究報道。鑒于此,筆者選取78例可疑胎兒心臟發(fā)育畸形者的孕婦采用新一代測序技術(shù)進(jìn)行產(chǎn)前檢測,分析其篩查價值。
1.1 一般資料按下述入排標(biāo)準(zhǔn)選取吉林省婦幼保健院2018年7月至2020年3月可疑胎兒心臟發(fā)育畸形的孕婦78例作為受試對象,年齡范圍為23~41歲,年齡(28.43±4.27)歲;孕齡范圍為12~24周,孕齡(18.94±2.86)周;其中自然受孕者65例;既往有唇裂、無腦兒、心臟缺陷、智力缺陷、死胎等異常生育史者18例;有家族遺傳史者2例。本研究已經(jīng)吉林省婦幼保健院倫理委員會批準(zhǔn)(201806-002)。
納入標(biāo)準(zhǔn):(1)經(jīng)超聲檢查疑似胎兒心臟發(fā)育畸形者;(2)均為單胎妊娠;(3)均接受跟蹤隨訪;(4)均對本研究知情并簽署同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)妊娠期有糖尿病、高血壓等合并癥者;(2)既往有高血壓、糖尿病者;(3)接受過輸血、細(xì)胞治療、移植手術(shù)者;(4)過度肥胖者;(5)心、肝、腎等功能異常者。
1.2 方法
1.2.1 樣本采集及處理(1)羊水穿刺及DNA提取:告知孕婦及家屬羊水穿刺風(fēng)險,孕婦需簽署同意書。進(jìn)行穿刺前需行血常規(guī)、凝血常規(guī)、傳染病檢查、超聲檢查,在無感染、無發(fā)熱、凝血功能正常、羊水量充足的情況下進(jìn)行羊水穿刺。穿刺后取羊水樣本,離心后棄去上清液,采用游離DNA提取試劑盒(上海希言科學(xué)儀器有限公司)按照操作流程提取胎兒脫落細(xì)胞中的DNA。(2)外周血DNA提?。翰杉袐D及其配偶的外周血于抗凝管中保存,在4℃、10 000 r/min(離心半徑12 cm)條件下離心10 min,后取上層血漿,采用游離DNA提取試劑盒(上海希言科學(xué)儀器有限公司)按照操作流程提取游離DNA。
1.2.2 新一代測序技術(shù)檢測用Nanodrop2000核酸定量儀(美國Nanodrop)測定提取的孕婦外周血游離DNA的純度和濃度,檢測合格后于-20℃冰箱保存。游離DNA經(jīng)文庫制備后在Illumina Next-Sep500測序平臺完成100 kb、測序深度1×的高通量測序,將測序結(jié)果經(jīng)信息分析通過Z值進(jìn)行染色體22q11.2缺失基因判定。
1.2.3 MLPA技術(shù)檢測采用微缺失檢測試劑盒(荷蘭MBC-Holland)按照操作流程進(jìn)行檢測,共含22q11.2區(qū)域的29個探針,稀釋提取的羊水DNA濃度后進(jìn)行變性、雜交、連接反應(yīng),取連接產(chǎn)物進(jìn)行PCR反應(yīng),過程:95℃、60℃下各30 s,72℃下1 min,35個循環(huán)后在72℃下延伸10 min。然后取反應(yīng)產(chǎn)物在ABI3130基因分析儀中進(jìn)行電泳,采用Coffalyser軟件進(jìn)行分析得出基因相對拷貝數(shù)比值:比值<0.7表示檢測區(qū)基因有缺失;比值為0.7~1.3,表示檢測區(qū)基因無缺失;比值>1.3表示檢測區(qū)基因有重復(fù)片段。采集檢測結(jié)果有22q11.2缺失的孕婦及配偶外周血,提取外周血DNA采用MLPA技術(shù)檢測胎兒父母有無22q11.2微缺失,以進(jìn)行父母溯源。
1.2.4 arrayCGH技術(shù)檢測采用Oligo Human CGH Microarray芯片(美國Agilent公司),經(jīng)過洗滌、離心甩干后對采集提取的孕婦羊水DNA進(jìn)行全基因組掃描分析22q11.2精確缺失位置和大小。
1.2.5 跟蹤隨訪跟蹤隨訪至孕婦妊娠結(jié)束,引產(chǎn)或死產(chǎn)者進(jìn)行尸檢觀察胎兒心臟發(fā)育畸形情況,活產(chǎn)者進(jìn)行心臟檢查觀察發(fā)育情況,統(tǒng)計胎兒心臟發(fā)育畸形結(jié)果。將arrayCGH驗證結(jié)果記作診斷22q11.2微缺失所致的胎兒心臟發(fā)育畸形的“金標(biāo)準(zhǔn)”。
1.3 觀察指標(biāo)(1)隨訪結(jié)果;(2)新一代測序技術(shù)檢測胎兒22q11.2微缺失情況;(3)MLPA技術(shù)檢測胎兒及其父母22q11.2微缺失情況;(4)arrayCGH技術(shù)驗證情況。
1.4統(tǒng)計學(xué)方法采用SPSS 25.0軟件作為統(tǒng)計學(xué)工具。采用配對χ2檢驗方法比較各診斷方法與金標(biāo)準(zhǔn)方法的診斷價值,采用Kappa一致性檢驗分析不同方法與“金標(biāo)準(zhǔn)”結(jié)果的一致性,P<0.05為檢測水平差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 隨訪情況共35例胎兒心臟發(fā)育畸形,發(fā)生率為其中永存動脈干、右心室雙出口2例,共同動脈干、雙上腔靜脈、共同房室瓣反流3例,大動脈轉(zhuǎn)位、單心室、三尖瓣閉鎖3例,肺動脈閉鎖、室間隔缺損3例,單心房、單心室、完全性心內(nèi)膜墊缺損2例,肺動脈狹窄、室間隔缺損、主動脈騎跨5例,室間隔缺損、肺動脈狹窄、右位主動脈弓5例,室間隔缺損、動脈導(dǎo)管缺如、右位主動脈弓4例,室間隔缺損、動脈導(dǎo)管缺如4例,室間隔缺損、右位主動脈弓2例,法洛四聯(lián)癥、肺動脈閉鎖2例。
2.2 新一代測序技術(shù)結(jié)果35例胎兒心臟發(fā)育畸形中有12例經(jīng)新一代測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為34.29%(12/35);43例胎兒心臟發(fā)育正常中有1例經(jīng)新一代測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為2.33%(1/43)。(即新一代測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)了13例陽性樣本-22q11.2微缺失)。
2.3 MLPA檢測結(jié)果35例胎兒心臟發(fā)育畸形中有14例經(jīng)MLPA發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為40.00%(14/35);43例胎兒心臟發(fā)育正常中有1例經(jīng)MLPA發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為2.33%(1/43)。(即MLPA方法發(fā)現(xiàn)了15例陽性樣本22q11.2微缺失)。
此外,15例發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失的胎兒父母基因溯源發(fā)現(xiàn)有2例父源22q11.2微缺失,占比為13.33%(2/15);余13例父母檢測結(jié)果均正常。
2.4 arrayCGH技術(shù)驗證結(jié)果
2.4.1 14例胎兒心臟發(fā)育畸形22q11.2微缺失的檢測結(jié)果35例胎兒心臟發(fā)育畸形中有14例經(jīng)arrayCGH檢測發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為40.00%(14/35),具體信息見表1。
表1 14例胎兒心臟發(fā)育畸形22q11.2微缺失的檢測結(jié)果
2.4.2 1例胎兒心臟發(fā)育正常22q11.2微缺失的檢測結(jié)果43例胎兒心臟發(fā)育正常中有1例經(jīng)arrayCGH檢測發(fā)現(xiàn)父源22q11.2微缺失,MLPA檢測缺失范圍為LCR A-D,arrayCGH檢測22q11.2微缺失范圍為19187939-21464479,2.27Mb,檢出率為2.33%(1/43)。
2.4.3 新一代測序技術(shù)診斷22q11.2微缺失情況的診斷分析結(jié)果(1)胎兒心臟發(fā)育畸形者經(jīng)新一代測序技術(shù)檢測22q11.2微缺失檢出率,均高于胎兒心臟發(fā)育正常者。診斷價值分析(配對χ2檢驗)發(fā)現(xiàn):新一代測序技術(shù)檢測與金標(biāo)準(zhǔn)arrayCGH驗證法的關(guān)聯(lián)性χ2=59.43,P=0.000(提示兩法關(guān)聯(lián)),差異性χ2=0.50,P=0.480(提示兩法相近),靈敏度0.87,特異度1.00。其符合率(準(zhǔn)確度)為97.4%(76/78)、Kappa=0.910(提示一致性好),見表2。
表2 新一代測序技術(shù)診斷22q11.2微缺失情況/例
(2)胎兒心臟發(fā)育畸形者經(jīng)MLPA檢測22q11.2微缺失檢出率,均高于胎兒心臟發(fā)育正常者。診斷價值分析(配對χ2檢驗)發(fā)現(xiàn):MLPA檢測22q11.2微缺失情況與金標(biāo)準(zhǔn)arrayCGH驗證法的關(guān)聯(lián)性χ2=71.70,P=0.000(提示兩法關(guān)聯(lián)),差異性χ2=0.00,P=1.000(提示兩法相同)。其符合率(準(zhǔn)確度)為100.0%(76/78)、Kappa=1.000(提示兩法完全一致),見表3。
表3 MLPA診斷22q11.2微缺失情況/例
染色體22q11.2微缺失是最常見的引起胎兒心臟發(fā)育畸形的遺傳因素之一,因其為顯性遺傳,攜帶者下一代發(fā)生22q11.2微缺失的概率較大[6],因此產(chǎn)前篩查22q11.2微缺失意義重大。近年來隨著基因組學(xué)的技術(shù)進(jìn)步,臨床上采用MLPA、arrayCGH等技術(shù)進(jìn)行22q11.2微缺失的檢測,但檢測過程均具有創(chuàng)性,對宮內(nèi)胎兒發(fā)育有潛在危險,不適用于產(chǎn)前篩查。因此,亟須尋求一種安全、有效、簡便的方法來進(jìn)行22q11.2微缺失產(chǎn)前篩查,預(yù)防新生兒出生缺陷。
本研究發(fā)現(xiàn),在78例可疑胎兒心臟發(fā)育畸形的孕婦中有35例確診胎兒心臟發(fā)育畸形,胎兒心臟發(fā)育畸形易造成孕期流產(chǎn)、死胎、新生兒早期死亡等,因此需高度重視胎兒心臟發(fā)育畸形產(chǎn)前篩查。本研究35例胎兒心臟發(fā)育畸形者經(jīng)新一代測序技術(shù)檢測發(fā)現(xiàn)有12例22q11.2微缺失,檢出率為34.29%,43例胎兒心臟發(fā)育正常者經(jīng)新一代測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)有1例22q11.2微缺失,檢出率為2.33%,說明新一代測序技術(shù)對22q11.2微缺失有一定的篩查作用。研究發(fā)現(xiàn)[7-8],妊娠5周后就可在母體外周血中檢測出胎兒DNA,并且其濃度隨孕期增加而升高,且妊娠后血漿胎源性DNA分子長度顯著短于母體,因此從母體外周血血漿中提取胎兒DNA比較簡便。
本研究采用Illumina新一代測序技術(shù)對母體外周血提取的胎兒DNA進(jìn)行大規(guī)模深度測序,在DNA復(fù)制時加入標(biāo)記核苷酸進(jìn)行追蹤捕獲目的基因組,利用Illumina平臺邊合成邊測序,覆蓋基因范圍廣泛,具有較高的敏感度和準(zhǔn)確性,且操作方法簡單,對宮內(nèi)胎兒發(fā)育無影響[9]。Gatticchi等[10]在對由2ALMS1基因變異引起的Alstr?m綜合征病人進(jìn)行基因篩查診斷研究中,發(fā)現(xiàn)新一代測序技術(shù)能夠快速、準(zhǔn)確進(jìn)行篩查診斷,進(jìn)一步證實了新一代測序技術(shù)在基因篩查診斷中的價值。既往研究報道[11-12],MLPA技術(shù)在基因變異導(dǎo)致的各種疾病中有較高的檢測價值。本研究中35例胎兒心臟發(fā)育畸形中有14例經(jīng)MLPA發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為40.00%,43例胎兒心臟發(fā)育正常中有1例經(jīng)MLPA發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為2.33%;其中15例22q11.2微缺失的胎兒父母基因溯源發(fā)現(xiàn)有2例父源22q11.2微缺失,占比為13.33%,余13例父母檢測結(jié)果均正常,說明了MLPA技術(shù)對22q11.2微缺失具有檢測診斷價值。MLPA技術(shù)將DNA探針技術(shù)與PCR技術(shù)結(jié)合,能夠高通量快速檢測基因組拷貝數(shù)變異,準(zhǔn)確識別缺失區(qū)域,且能對父母溯源,有助于遺傳咨詢,評估再次孕育風(fēng)險,常用于檢測臨床基因遺傳疾?。?3]。另外本研究結(jié)果顯示,經(jīng)arrayCGH技術(shù)檢測驗證,35例胎兒心臟發(fā)育畸形中有14例發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為40.00%,43例胎兒心臟發(fā)育正常中有1例發(fā)現(xiàn)22q11.2微缺失,檢出率為2.33%。arrayCGH技術(shù)能夠進(jìn)行基因組拷貝數(shù)變異分析,對檢測微小缺失具有獨特優(yōu)勢,檢測結(jié)果準(zhǔn)確、可靠,臨床常采該技術(shù)驗證其他基因測序技術(shù)檢測結(jié)果[14]。
本研究結(jié)果顯示胎兒心臟發(fā)育畸形者經(jīng)一代測序技術(shù)、MLPA技術(shù)檢測22q11.2微缺失檢出率均高于心臟發(fā)育正常者,提示22q11.2微缺失與胎兒心臟發(fā)育畸形有密切關(guān)系。大量研究發(fā)現(xiàn),染色體22q11.2區(qū)域有較多低拷貝重復(fù)序列,易發(fā)生非等位基因同源重組,影響胚胎早期心臟形態(tài)發(fā)生及心血管的發(fā)育,主要導(dǎo)致圓錐動脈畸形,如法洛四聯(lián)癥、主動脈離斷、房/室間隔缺損、永存動脈干、右室雙出口和大動脈轉(zhuǎn)位等[15-17],故進(jìn)行產(chǎn)前篩查胎兒22q11.2微缺失情況對降低新生兒心臟畸形率意義重大。本研究采用新一代測序技術(shù)檢測胎兒22q11.2微缺失情況結(jié)果與金標(biāo)準(zhǔn)arrayCGH驗證法具有高度一致性,采用MLPA檢測結(jié)果與金標(biāo)準(zhǔn)arrayCGH驗證法完全一致,且以上兩種檢測方法與金標(biāo)準(zhǔn)arrayCGH驗證法有顯著關(guān)聯(lián)性,無明顯差異性,檢測符合率高,說明新一代測序技術(shù)和MLPA技術(shù)對22q11.2微缺失的檢測準(zhǔn)確度高,證實了新一代測序技術(shù)及MLPA技術(shù)的篩查價值。新一代測序技術(shù)相比傳統(tǒng)Sanger測序技術(shù)所需樣本量少、通量高、分辨率高,能檢測出低至0.1 Mb的缺失或重復(fù)[18];與arrayCGH技術(shù)相比無需對全基因組測序,可利用序列捕獲技術(shù)針對性檢測目的基因組,節(jié)省成本,檢測速度快;與MLPA技術(shù)相比樣本要求簡單,可降低樣本污染風(fēng)險,且無創(chuàng)傷性。因此,臨床可應(yīng)用新一代測序技術(shù)作為22q11.2微缺失所致的胎兒心臟發(fā)育畸形的產(chǎn)前篩查方法。
綜上,22q11.2微缺失是胎兒心臟發(fā)育畸形的常見原因,新一代測序技術(shù)和MLPA對其篩查價值相當(dāng),可在臨床產(chǎn)前篩查中推廣應(yīng)用。