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        梯型熔解溫度等溫?cái)U(kuò)增檢測(cè)羊肉源基因研究

        2022-10-14 12:53:56王博銳尚建麗許丹丹王德國
        許昌學(xué)院學(xué)報(bào) 2022年5期
        關(guān)鍵詞:雞肉羊肉靈敏度

        王博銳,尚建麗,許丹丹,王德國

        (1.河南科技大學(xué) 食品與生物工程學(xué)院,河南 洛陽 471000;2.許昌學(xué)院 食品與藥學(xué)院;河南省食品安全生物標(biāo)識(shí)快檢技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南 許昌 461000)

        隨著人們消費(fèi)水平的提高,消費(fèi)者逐漸傾向于高蛋白含量、低脂肪含量肉類[1].羊肉營(yíng)養(yǎng)價(jià)值豐富,蛋白質(zhì)含量高且優(yōu)質(zhì),脂肪含量較低[2].目前,肉類摻假是常見的食品安全問題.羊肉及羊肉制品摻假的檢測(cè)技術(shù)有感官鑒別法[3]、同位素質(zhì)譜法[4]、酶聯(lián)免疫吸附法[5]、紅外光譜[6]、核酸檢測(cè)技術(shù)[7]等.其中傳統(tǒng)方法各有優(yōu)缺點(diǎn).核酸檢測(cè)方法因特異性強(qiáng)、靈敏度高和結(jié)果更加準(zhǔn)確而被廣泛應(yīng)用于物種鑒定[8].因此,亟需建立一種方便、快速,能夠廣泛應(yīng)用于基層的羊肉制品檢測(cè)方法.

        梯型熔解溫度等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LMTIA)是2021年WANG[9]等通過借鑒環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)(LAMP)[10]和PCR技術(shù)等開發(fā)的一種新型核酸擴(kuò)增技術(shù),該方法適用范圍廣、反應(yīng)時(shí)間短、操作簡(jiǎn)單,且靈敏度高、特異性強(qiáng).截至目前,還沒有使用LMTIA進(jìn)行羊肉的源基因檢測(cè)研究.因此,通過建立LMTIA檢測(cè)羊肉源性成分的方法,以期為羊肉摻假檢測(cè)提供技術(shù)支持.

        1 材料與方法

        1.1 材料、試劑與儀器

        羊肉、雞肉、鴨肉、豬肉均購于許昌喜盈門超市;狗肉、貓肉購于淘寶.

        試劑:通用型Real-time LMTIA反應(yīng)預(yù)混液,德歌生物技術(shù)(山東)有限公司;DEPC處理水,生工生物工程(上海)股份有限公司;引物,通用生物系統(tǒng)(安徽)有限公司;磁珠法動(dòng)物DNA提取試劑盒,天根生化科技(北京)有限公司.

        儀器:Eppendorf移液槍,德國艾本德股份公司;電熱恒溫水浴鍋,常州普天儀器制造有限公司;高速冷凍離心機(jī),德國Sigma公司;實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,鯤鵬基因(北京)科技有限責(zé)任公司;電子天平,上海佑科儀器儀表有限公司;立式低溫冰箱,青島海爾集團(tuán)有限公司;勻漿機(jī),上海凈信科技;Nano Drop One超微量核酸蛋白測(cè)定儀,美國Thermo Fisher Scientific公司.

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 LMTIA靶序列的選擇及引物設(shè)計(jì)

        根據(jù)LMTIA引物設(shè)計(jì)方法,在GenBank上查找篩選羊肉轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS)(GenBank ID:HM437212.1)上符合梯型結(jié)構(gòu)的序列,并使用BLAST對(duì)比其序列特異性,最后以所選靶序列使用引物設(shè)計(jì)軟件Primer 3 Plus設(shè)計(jì)LMTIA引物.

        1.2.2 DNA制備

        羊肉的DNA提?。焊鶕?jù)磁珠法動(dòng)物DNA提取試劑盒說明書操作提取羊肉的DNA.用電子天平稱取羊肉的肌肉組織30 mg(剔除脂肪和筋腱組織),剪碎,放置于2 mL離心管中,按照試劑盒的操作方法進(jìn)行DNA的提取.最終得到模板DNA,小心吸取溶液,將其轉(zhuǎn)移至新的離心管中,振蕩混勻,并將其置于-20 ℃冰箱中保存,提取的羊肉DNA主要用于建立LMTIA反應(yīng)體系.

        1.2.3 LMTIA反應(yīng)溫度優(yōu)化

        以10 μL體系進(jìn)行LMTIA反應(yīng)體系的優(yōu)化,10 μL反應(yīng)體系中包括3.6 μL通用型Real-time LMTIA預(yù)混液,0.06 μL引物F和引物B,0.02 μL引物L(fēng)F和引物L(fēng)B,2 μL羊肉DNA,然后加入DEPC水補(bǔ)足10 μL.用Step One Plus PCR儀分別在55、56、57、58 ℃進(jìn)行恒溫?cái)U(kuò)增反應(yīng).

        1.2.4 LMTIA的特異性測(cè)試

        用雞肉、鴨肉、豬肉、貓肉、狗肉的DNA測(cè)試LMTIA的特異性,使用TIANGEN公司的磁珠法動(dòng)物組織基因組DNA提取試劑盒提取幾種肉的DNA,提取出來的DNA作為模板進(jìn)行測(cè)試LMTIA的特異性.

        1.2.5 LMTIA靈敏度測(cè)試

        將提取出來的羊肉DNA用DEPC水分別稀釋至10 ng/μL、1 ng/μL、100 pg/μL、10 pg/μL,用移液槍分別移取每個(gè)梯度的DNA溶液作為DNA模板加入LMTIA反應(yīng)體系中,測(cè)試LMTIA的靈敏度.

        1.2.6 羊肉檢測(cè)限的確定

        以雞肉為基底,制備羊肉不同質(zhì)量比例的混合模擬肉樣(0.1%、0.5%、1%、5%、10%),用血液/細(xì)胞/組織基因組DNA提取試劑盒(離心柱法)分別提取模擬肉樣的DNA,羊肉質(zhì)量占兩者總質(zhì)量的百分比分別為0.1%、0.5%、1%、5%、10%.首先分別稱取一定量(>5 g)的羊肉和雞肉的肌肉組織,置于5 mL的離心管中,用勻漿機(jī)將其研磨徹底,為后續(xù)稱量做準(zhǔn)備.然后分別按比例稱取0.1%(1.998 g雞肉+0.002 g羊肉)、0.5%(1.99 g雞肉+0.01 g羊肉)、1%(0.198 g雞肉+0.002 g羊肉)、5%(0.047 5 g雞肉+0.002 5 g羊肉)、10%(0.045 g雞肉+0.005 g羊肉)的混合肉.使用TIANGEN公司的血液/細(xì)胞/組織基因組DNA提取試劑盒(離心柱法)提取DNA,即可得到不同羊肉質(zhì)量百分比的混合肉的模板DNA.將提取出來模板DNA加入LMTIA反應(yīng)體系中,進(jìn)行LMTIA反應(yīng),測(cè)試摻假肉中羊肉的檢測(cè)限.

        2 結(jié)果與討論

        2.1 LMTIA引物的確定

        經(jīng)過在GenBank上查找,并使用Oligo 7引物設(shè)計(jì)軟件分析篩選,確定的羊肉特有序列如圖1所示,序列的熔解溫度曲線形狀呈梯型.

        圖1 靶序列的梯型熔解曲線

        圖1所示的序列為靶標(biāo),使用Primer 3 Plus引物設(shè)計(jì)軟件進(jìn)行LMTIA引物的設(shè)計(jì),所設(shè)計(jì)的引物序列如表1所示.

        表1 羊肉引物序列

        2.2 LMTIA溫度的確定

        用Step One Plus PCR儀分別在55、56、57、58 ℃進(jìn)行LMTIA等溫?cái)U(kuò)增反應(yīng).如圖2所示,陰性對(duì)照均未出現(xiàn)擴(kuò)增,羊肉DNA均擴(kuò)增,結(jié)合擴(kuò)增效率選擇55 ℃為最適溫度.

        圖2 LMTIA溫度優(yōu)化結(jié)果圖

        2.3 LMTIA的特異性

        用Step One Plus PCR儀,在55 ℃下進(jìn)行LMTIA擴(kuò)增反應(yīng),陰性對(duì)照(DEPC水)、鴨肉、雞肉、豬肉貓肉和狗肉的DNA均未出現(xiàn)擴(kuò)增現(xiàn)象,只有陽性對(duì)照(羊肉DNA)出現(xiàn)了擴(kuò)增反應(yīng),如圖3所示.結(jié)果表明,羊肉DNA模板的CT值與其他肉類差異明顯,說明該引物特異性較好,可用于羊肉中特異性基因的檢測(cè).

        圖3 LMTIA特異性結(jié)果圖

        2.4 LMTIA的靈敏度

        將梯度稀釋后的DNA稀釋液作為模板加入LMTIA反應(yīng)體系中,于55 ℃下測(cè)試LMTIA的靈敏度,結(jié)果如圖4所示:DNA濃度為100 pg/μL時(shí),未出現(xiàn)擴(kuò)增現(xiàn)象;濃度為1和10 ng/μL時(shí),均出現(xiàn)擴(kuò)增反應(yīng),因此,該LMTIA體系的靈敏度為1 ng/μL.

        圖4 LMTIA靈敏度結(jié)果圖

        2.5 肉制品中羊肉源基因的檢測(cè)限

        將1.2.6中所提取的不同質(zhì)量分?jǐn)?shù)的羊肉DNA加入LMTIA反應(yīng)體系中,在所優(yōu)化的最適溫度下進(jìn)行LMTIA擴(kuò)增反應(yīng),結(jié)果如圖5所示.質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%的混合肉樣在28循環(huán)處出現(xiàn)擴(kuò)增,陰性對(duì)照無擴(kuò)增.因此,該方法可檢測(cè)出混合肉樣中摻入質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.1%的羊肉源成分.

        圖5 LMTIA檢測(cè)限結(jié)果圖

        3 結(jié)論

        研究建立了肉制品中羊肉源成分LMTIA檢測(cè)方法.該方法根據(jù)羊肉的特異性基因序列設(shè)計(jì)特異性引物,通過特異性與靈敏度測(cè)試,最終確定LMTIA方法反應(yīng)體系.在55 ℃反應(yīng)溫度下,該方法的特異性良好,最低檢測(cè)細(xì)胞核DNA濃度可達(dá)到1 ng/μL.該方法反應(yīng)時(shí)間短,不到30 min,相較于LAMP檢測(cè)技術(shù),LMTIA可節(jié)約至少一倍的反應(yīng)時(shí)間.此外,該方法通過對(duì)模擬混合肉樣進(jìn)行檢測(cè)限測(cè)定,可檢測(cè)出羊肉質(zhì)量比在0.1%的混合肉及肉制品,在一定程度上為羊肉的摻假造假檢測(cè)提供技術(shù)支持,為其他肉類摻假檢測(cè)研究提供了借鑒,對(duì)于市場(chǎng)上的羊肉摻假檢測(cè)具有參考價(jià)值.

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