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        醫(yī)藥化工廢水降解菌的分離及菌群分析

        2022-09-20 13:51:28周旭華
        低碳世界 2022年6期
        關(guān)鍵詞:鞘氨醇甾體桿菌屬

        周旭華,蘇 悅

        (1.長(zhǎng)治職業(yè)技術(shù)學(xué)院,山西 長(zhǎng)治 046000;2.杭州秀川科技有限公司,浙江 杭州 311121)

        0 引言

        天然和人工合成品的甾體激素,均具有環(huán)戊烷駢多氫菲母核。廢水中主要污染物為稠環(huán)的雜環(huán)有機(jī)物,吡啶及吡啶鹽含量較多。甾體激素制藥廢水具有濃度高、生化性差、生物抑制性高等特點(diǎn),處理難度較大。生物法具有處理成本低、降解具有特異性和無(wú)二次污染等優(yōu)勢(shì),目前報(bào)道的甾體制藥廢水高效降解菌株主要有假單胞菌屬(psudomonas sp.)、醋酸桿菌屬(Acetobacter sp.)、不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter sp.)、鐮刀菌屬(Fusarium sp.)、紅球菌屬(Rhodococcus sp.)和鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium sp.)等[1-5]。

        本實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)進(jìn)行了大量醫(yī)藥化工廢水生物處理的相關(guān)研究。本研究擬從甾體激素制藥廢水的生物處理系統(tǒng)物種分布情況,探究有效降解甾體制藥廢水的可能物種組成,為同類(lèi)廢水工程應(yīng)用奠定理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 樣品來(lái)源

        樣品來(lái)源于湖南某生物制藥公司甾體激素醫(yī)藥原料生產(chǎn)廢水的生化處理系統(tǒng)。菌株分離自曝氣池混合液,高通量測(cè)序樣品來(lái)源于曝氣池的活性污泥。該處理系統(tǒng)已經(jīng)穩(wěn)定運(yùn)行約9個(gè)月,曝氣池運(yùn)行溫度約為45℃。曝氣池的進(jìn)水水質(zhì)基本情況如下:COD 26 876 mg/L,NH3-N 297 mg/L,TP 5.8 mg/L,鹽度2.56%,pH 7.0。采樣時(shí)間為2019年10月14日,4℃冷藏。分離出的菌株由杭州秀川科技有限公司實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.2 培養(yǎng)基

        LB液體培養(yǎng)基:酵母提取物5.0 g/L、胰蛋白胨10.0 g/L、NaCl 10.0 g/L,pH 7.0。121℃滅菌20 min。

        LB固體培養(yǎng)基:1 L的LB液體培養(yǎng)基加入20.0 g瓊脂。121℃滅菌20 min。

        1.3 菌株分離純化

        菌株分離:采用梯度稀釋涂布法,將富集液梯度進(jìn)行稀釋,隨后取各梯度的樣品0.1 mL,用無(wú)菌的玻璃涂布棒均勻涂布到LB固體培養(yǎng)基上,分別在30℃和50℃培養(yǎng)箱內(nèi)倒置培養(yǎng),定期觀察,直至出現(xiàn)明顯的單菌落[6]。

        菌株純化:挑取形態(tài)不同的單菌落至無(wú)菌的LB固體培養(yǎng)基上,多次畫(huà)線,得單菌落。

        1.4 形態(tài)學(xué)特征

        菌落形態(tài):觀察平板上菌落培養(yǎng)1~3 d后的形狀、大小、顏色、邊緣、透明程度和突起等。

        1.5 DNA提取

        取菌液1 mL,12 000 r/min離心5 min,棄上清液,加100 μL無(wú)菌的MilliQ級(jí)水重懸菌體;煮沸30~40 min;放-20℃環(huán)境2 h以上;12 000 r/min離心5 min,上清液備用。

        1.6 PCR擴(kuò)增

        引物1:27F(5′-GAGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3′)。

        引物2:1492R(5′-TACGGYTACCTTGTTACGAC-3′)擴(kuò)增16S rDNA。擴(kuò)增體系為PCR mix:12.5 μL,引物1:0.5 μL,引物2:0.5 μL,無(wú)菌的MilliQ級(jí)水:10.5 μL,DNA模板:1 μL。擴(kuò)增程序:25 μL反應(yīng)體系35個(gè)循環(huán);變性:98℃,5 s;退火:55℃,10 s;延伸:72℃,25 s。

        1.7 序列分析

        將分離純化得到的菌株P(guān)CR擴(kuò)增產(chǎn)物直接送交杭州擎科生物技術(shù)有限公司進(jìn)行序列測(cè)定,16S rDNA序列提交至EzBioCloud數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行序列比對(duì)。污泥樣品直接送交生工生物工程(上海)股份有限公司進(jìn)行高通量宏基因組微生物測(cè)序。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菌株的分離

        從樣品中分離純化的14株菌株,大部分可以在中等鹽濃度的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)。其中KR1和KR4在50℃培養(yǎng)分離,其余在30℃培養(yǎng)分離。

        2.2 形態(tài)學(xué)特征

        菌落呈白色或乳白色,其中白色菌落居多。菌落呈圓形,培養(yǎng)1~3 d后,直徑為1~4 mm;表面光滑或粗糙;大多數(shù)不透明,少數(shù)半透明或透明(表1)。

        表1 部分分離菌株的形態(tài)學(xué)特征

        2.3 測(cè)序結(jié)果

        通過(guò)高通量宏基因組微生物測(cè)序共得到去除嵌合體與靶區(qū)域外后的序列數(shù)68 286條,根據(jù)結(jié)果表明,污泥樣品中微生物主要分布在5個(gè)屬,分別為貪銅菌屬(Cupriavidus sp.)53.68%,無(wú)色桿菌屬(Achromobacter sp.)30.67%,橄欖形菌屬(Olivibacter sp.)7.23%,伊 麗 莎 白 菌 屬(Elizabethkingia sp.)2.78%,嗜染料菌屬(Pigmentiphaga sp.)1.79%(圖1)。

        圖1 屬水平豐度

        圖1為樣品內(nèi)物種豐度,豐度前13的物種按不同的顏色標(biāo)出。

        對(duì)從樣品中分離純化的菌株中挑選有代表性的14個(gè)菌株進(jìn)行16S rDNA序列測(cè)定,并提交至EzBioCloud數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),14個(gè)菌株分布在5個(gè)屬,其中芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)6株,伊麗莎白菌屬(Elizabethkingia sp.)2株,無(wú)色桿菌屬(Achromobacter sp.)2株,假單胞菌屬(Pseudomonas sp.)3株,鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium sp.)1株(表2)。

        表2 菌株16S rDNA序列的BLAST比較結(jié)果

        2.4 基于COG的功能分析

        通過(guò)對(duì)已有測(cè)序微生物基因組的基因功能的構(gòu)成進(jìn)行分析后,獲得的物種構(gòu)成推測(cè)樣本中的功能基因的構(gòu)成(圖2)。

        圖2 功能預(yù)測(cè)豐度

        3 結(jié)語(yǔ)

        16S rDNA常用于生物物種的分子進(jìn)化分析,序列分析結(jié)果表明,在生物降解甾體激素制藥廢水中起作用的可能菌群包括貪銅菌屬(Cupriavidus sp.)、無(wú)色桿菌屬(Achromobacter sp.)、橄欖形菌屬(Olivibacter sp.)、伊麗莎白菌屬(Elizabethkingia sp.)、嗜染料菌屬(Pigmentiphaga sp.)、芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)、假單胞菌屬(Pseudomonas sp.)、鞘氨醇桿菌屬(Sphingobˉacterium sp.)等。假單胞菌屬(psudomonas sp.)和鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium sp.)與已有報(bào)道處理同類(lèi)廢水菌群相同[1,3]。鞘氨醇桿菌屬(Sphingobium)是一類(lèi)具有很強(qiáng)的烷烴、雜環(huán)芳香烴降解能力的革蘭氏陰性細(xì)菌。陸源源[7]也從城市污水處理廠獲得高效降解甾體雌激素的鞘氨醇桿菌屬(Sphingobacterium sp.)菌株。

        曝氣池混合液梯度稀釋涂布平板在50℃下培養(yǎng)2 d主要生長(zhǎng)芽孢桿菌屬(Bacillus sp.)。在30℃下培養(yǎng)分離純化得到菌株較為豐富,包括伊麗莎白菌(Elizabethkingia anophelis)、無(wú)色桿菌(Achromobacter anxifer)、綠膿桿菌(Pseudomonas aeruginosa)、高地芽孢桿菌(Bacillus altitudinis)、嗜熱鞘氨醇桿菌(Sphingobacterium thermophilum)。高地芽孢桿菌(Bacillus altitudinis)KR1和特基拉芽孢桿菌(Bacillus tequilensis)KR4可以在50℃下較好生長(zhǎng)。周旭華等[8]從高鹽環(huán)境中篩選的一株嗜耐鹽菌株高地芽孢桿菌(Bacillus altitudinis),能高效降解吡啶。孫智毅[9]從焦化廢水中分離出一株具有高效異養(yǎng)硝化-好氧反硝化的貪銅菌屬(Cupriavidus sp.)菌株。孫福艷等[10]從煙草工業(yè)廢水處理廠的污泥中篩選出一株不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter sp.)甾體雌激素降解菌株,能以雌酮為底物。高通量測(cè)序和可培分析之間不能完全對(duì)應(yīng),可能與采用的培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件有關(guān),也可能與人工挑選菌落遺漏有關(guān),也可能與高通量測(cè)序樣品污染有關(guān),需進(jìn)一步確認(rèn)。

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