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        多組學(xué)技術(shù)在葛根品質(zhì)提升研究中的應(yīng)用進展

        2022-08-24 08:08:46胡心怡吳田澤鄭雅芹
        世界中醫(yī)藥 2022年13期
        關(guān)鍵詞:粉葛葛根素藥用

        胡心怡 吳田澤 侯 聰 鄭雅芹 鄧 港 劉 霞

        (武漢理工大學(xué)化學(xué)化工與生命科學(xué)學(xué)院,武漢,430070)

        葛根為豆科葛屬植物葛Puerarialobata(Willd.)Ohwi的干燥根,習(xí)稱野葛。葛根性味甘、辛、涼,歸脾、胃、肺經(jīng),具有解肌退熱、生津止渴、解酒毒等諸多功效[1],是一味常用的傳統(tǒng)中藥材,藥用歷史可以追溯到東漢時期的《神農(nóng)本草經(jīng)》。此外葛根中富含異黃酮,可用于降低血脂、血壓、血糖,具有保健功能,是原衛(wèi)生部首批發(fā)布的藥食兩用植物[2]。

        近年來對于葛根的化學(xué)成分、藥理藥效等的研究已經(jīng)具體深入,對于育種栽培以及分子生物學(xué)研究也逐年增多。本文將對葛根資源分布、質(zhì)量控制、多組學(xué)研究、栽培育種和品質(zhì)提升等方面的研究進展進行綜述,對多組學(xué)研究在葛根品質(zhì)提升方面的應(yīng)用進行總結(jié)展望,以期推動對葛根的進一步開發(fā)利用。

        1 葛根的資源與分布

        全世界葛屬植物35種,主要分布在溫帶和亞熱帶地區(qū),中國有8種,在貴州有分布[3]。野葛和粉葛2種葛屬植物常作藥用,在《中華人民共和國藥典》(2005版)之前并無區(qū)分,顧志平[4]在全國各地進行了實地調(diào)查,發(fā)現(xiàn)野葛在全國絕大多數(shù)地區(qū)均有分布,而粉葛則主要分布于廣西和廣東,人工栽培粉葛較為常見[4-5]。其調(diào)查到的我國葛屬植物分布見表1。

        表1 我國葛屬植物分布

        2 葛根的質(zhì)量控制

        2.1 化學(xué)成分 葛根的主要成分包括異黃酮類化合物和三萜類化合物,除此之外還富含生物堿類、皂苷類、香豆素類和多糖類化合物等多種化學(xué)成分[6],還富含人體必需氨基酸、礦物質(zhì)和微量元素等[7]。葛根的這些主要成分使其同時兼具藥用和使用價值,因此對葛根的質(zhì)量控制尤其重要。

        2.2 藥理學(xué)作用 葛根作為重要的藥食同源中藥材,其諸多有效成分能夠發(fā)揮多種藥理活性,如降低血壓、抗腦梗死、抗動脈粥樣硬化、抗心律失常、抗糖尿病、抗腫瘤、解熱鎮(zhèn)痛、抗氧化、抗阿爾茨海默病、抗帕金森癥、抗抑郁、預(yù)防骨質(zhì)疏松、保護肝臟、解酒等作用。見表2。

        3 葛根的多組學(xué)研究

        近年來,分子生物學(xué)技術(shù)發(fā)展迅速,隨著高通量測序技術(shù)的出現(xiàn),藥用植物的基因組學(xué)、轉(zhuǎn)錄組學(xué)、代謝組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)隨之發(fā)展迅速,研究者們對于葛根的多組學(xué)研究也逐漸被報道。接下來將對近年來葛根的多組學(xué)研究進行總結(jié)。

        3.1 葛根的基因組學(xué)研究 Zhang等[27]利用Illumina HiSeq X Ten測序獲得了葛根葉綠體基因組,得到了全長153 411 bp的基因組,由一個84 131個堿基的大單拷貝區(qū)和一個17 990個堿基的短單拷貝區(qū)組成,中間隔著一對25 645個堿基的反向重復(fù)序列;葉綠體全基因組包含111個基因,其中77個為蛋白質(zhì)編碼基因、30個為tRNA基因,4個為rRNA基因;總GC含量為35.4%;系統(tǒng)發(fā)育分析表明,野葛與豆薯比較接近。

        Cao等[28]對葛根的完整葉綠體基因組進行了組裝,得到了全長153 442 bp的基因組,包含84 162個大的單拷貝區(qū)和17 998個小的單拷貝區(qū),25 641個堿基的反向重復(fù)序列,GC含量為35.41%;葉綠體全基因組共編碼129個基因,其中84個為蛋白質(zhì)編碼基因,37個為RNA基因,8個為rRNA基因。注釋后的基因組序列提交GenBank,登錄號為MT818508;此外還通過對豆科鳳蝶亞科48種植物的系統(tǒng)發(fā)育樹分析證明,葛根屬于豆科蝶形花亞科,與豆薯(P.erosus)、赤豆(V.angularis)和菜豆(P.vulgaris)親緣關(guān)系較近。

        表2 葛根的藥理作用

        Sun等[29]也對葛根的葉綠體基因組測序,并利用這些數(shù)據(jù)對基因組資源進行了評估,得到葉綠體基因組全長共153 411個堿基,包含84 142個大的單拷貝區(qū)和17 998個小的單拷貝區(qū);重新組裝和注釋表明,共編碼112個基因,其中78個為蛋白質(zhì)編碼基因,30個為tRNA基因,4個為rRNA基因;總GC含量為35.4%。

        3.2 葛根的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究 對葛根的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究始于2015年,近年來越來越多的研究者將目光投向葛根的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究。研究內(nèi)容及結(jié)果總結(jié)見表3。

        表3 葛根的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

        續(xù)表3 葛根的轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

        3.3 葛根的代謝組學(xué)研究 Shang等[39]使用長閱讀的單分子測序和Hi-C技術(shù)組裝了高質(zhì)量的葛根基因組?;蚪M大小為1.37 GB,由5 145個重疊群組成,重疊群N50為593.70 kb;基因組結(jié)構(gòu)注釋產(chǎn)生了869.33 Mb的重復(fù)區(qū)域,占基因組62.70%,編碼蛋白質(zhì)的基因45 270個;進化分析表明,葛根與大豆的親緣關(guān)系最近,經(jīng)歷了2次古老的全基因組復(fù)制事件——一次是在豆科物種的共同祖先中,另一次是在大約720萬年前物種形成后獨立發(fā)生的;與其他5種豆科植物相比,葛根共有2 373個基因家族是獨一無二的;還對與葛根素含量相關(guān)的基因和代謝產(chǎn)物進行了鑒定,共鑒定了572個在葛根素生物合成途徑中上調(diào)的基因,235個候選基因通過組學(xué)數(shù)據(jù)進一步豐富;此外,還鑒定了6個與葛根素代謝密切相關(guān)的8-C-葡萄糖轉(zhuǎn)移酶(8-C-GT)候選基因,填補了豆科植物基因組的一個重要空白,為葛根的遺傳改良提供了有價值的多基因組資源。

        Shang等[40]還進行了基于超高效液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜儀的廣靶代謝組學(xué)分析,共鑒定了614種代謝物,其中包括初生代謝物和次生代謝物,不同品種積累特異代謝物;進行了主成分分析、聚類分析、KEGG富集分析來進行代謝組學(xué)分析,用Log2FC≥3和VIP≥1來進行營養(yǎng)成分分析,結(jié)果表明,葛根與其變種之間的營養(yǎng)差異可以用氨基酸、核苷酸、糖類和脂類豐度的差異來解釋,而葛根與其變種之間藥用品質(zhì)差異則是由異黃酮類、異黃酮類、酚酸、有機酸和香豆素含量的差異造成的;此外,還確定了對3個葛根品種進行分類的關(guān)鍵代謝物。

        3.4 葛根的蛋白組學(xué)研究 暫時未發(fā)現(xiàn)相關(guān)研究。

        4 葛根的育種栽培

        4.1 葛根的種植技術(shù) 葛根在中國的栽培歷史悠久,最常見的葛屬植物有常作藥用的野葛和常做食用的粉葛。野葛在中國分布廣,除新疆、西藏外其余各省皆有分布,而粉葛更是以栽培為主,因此出現(xiàn)了多個有“粉葛之鄉(xiāng)”之稱的粉葛種植地,葛根的栽培技術(shù)在實踐中積累經(jīng)驗不斷完善提升,從土地選擇、精細整地、堆捂營養(yǎng)土、種藤選取、芽節(jié)扦插、防治病蟲害等各個方面進行了具體而科學(xué)的規(guī)范,以達到高產(chǎn)高抗的種植目標[41]。

        葛根喜溫喜濕,大多生長在海拔1 600~2 100 m的背陰坡地,適宜生長溫度為12~16 ℃。葛根于2月上旬開始萌芽,4~9月生長旺季,11月中旬生長減緩直至不再生長,在12月到次年2月之間為采收期,越冬率可達100%[42]。葛根耐寒耐干旱,對土壤的要求不高,因此在國內(nèi)種植范圍十分廣闊。

        4.2 葛根的新品種選育 近年來,人們對藥食藥膳、綠色食品等健康飲食的需求越來越高,對葛根的食品開發(fā)和育種栽培等的研究也逐漸增多;另一方面,國家對葛根的加工工藝和流程等制定了相關(guān)的標準,使食用葛根的質(zhì)量和食品安全大大提高[43]。各研究所和藥企也開始開展葛根新品種選育相關(guān)工作,雖然目前我國葛根新品種報道較少,選育進程緩慢,但也有了一定成效,選育出一系列優(yōu)良葛根新品種,如湘葛系列、贛葛系列、宋葛系列、橫峰系列、“恩葛-08”“桂葛1號”“桂粉葛1號”以及木生葛根、糯粉葛、菜粉葛和綠健葛根等[44-48]。

        5 組學(xué)研究在品質(zhì)提升方面的應(yīng)用

        葛根的有效成分絕大多數(shù)是它的次生代謝產(chǎn)物,代謝途徑需要多種酶催化,找到合成有效成分的關(guān)鍵酶,就能了解在藥材有效成分合成的分子機制和調(diào)控機制,進而利用基因工程技術(shù)對有效成分進行調(diào)控和生產(chǎn)。

        5.1 藥用有效成分葛根素 葛根素是葛根中最主要的藥用活性成分,近年來對葛根素合成相關(guān)的研究逐漸增多,找到了一些與葛根素合成相關(guān)的基因、轉(zhuǎn)錄因子和酶等,在3.2中進行了詳細論述。Wang等[31]對PlUGT43(一種葛根葡糖基轉(zhuǎn)移酶)進行了分子克隆和功能鑒定,生化分析表明,PlUGT43具有大豆苷元C-糖基化為葛根素的活性,對異黃酮類大豆苷元和染料木素具有活性,但對包括黃酮類在內(nèi)的其他潛在受體沒有活性,證實了PlUGT43在葛根素生物合成中的作用。

        5.2 膨大機制和淀粉合成 葛根作為重要的藥食同源植物,富含淀粉、黃酮和葛根素等成分,除可作藥用治療多種疾病,其食用價值也很高。葛根除了可以作為蔬菜鮮食、炒菜、煲湯之外,最常見的是加工成為葛根粉,還可做成葛根面條、饅頭、果糕、酒、茶、飲料等特色食品[2]。粉葛生長快、塊莖大且富含淀粉,是人工種植最多的葛根品種,因此對葛根的膨大機制和淀粉合成相關(guān)基因的研究也不在少數(shù)。劉冬梅等[49]選取了普通葛根和塊根膨大的野生型突變型葛根,運用cDNA-AFLP技術(shù)進行差異分析,分析結(jié)果篩選出5個特異表達片段,發(fā)現(xiàn)它們參與了信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、抗脅迫應(yīng)答、電子傳遞和光合代謝等反應(yīng)。郭麗君[50]為了提高葛根產(chǎn)量,克隆了淀粉合成關(guān)鍵酶腺苷二磷酸-葡萄糖焦磷酸化酶(ADP-glucose Pyrophosphorylase,AGPase)小亞基基因(sAGP)和大亞基基因(LAGP),探究其對葛根塊根長度、粗細、重量和產(chǎn)量的影響機制,發(fā)現(xiàn)AGPase基因表達變化是植物通過自身信號網(wǎng)絡(luò)相互作用調(diào)控,進而調(diào)控淀粉合成關(guān)鍵酶活性變化,從而影響淀粉成分及含量變化。

        5.3 抗逆 葛根喜愛濕潤溫暖的環(huán)境,干旱、低溫等環(huán)境因素會對葛根的生長帶來影響,因此可以利用溫度、光照、水分等非生物脅迫或者病蟲害等生物脅迫來篩選葛根相關(guān)的抗逆基因,為抗逆性強的葛根品種選育打下基礎(chǔ),以提高葛根的品質(zhì)性狀和產(chǎn)量性狀。

        6 展望

        近年來,對葛根的分子研究逐漸增多,多組學(xué)研究特別是轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究十分火熱。研究者主要專注于葛根異黃酮類化合物合成相關(guān)的基因和代謝通路進行研究,獲得了長足進展。然而,葛根的基因組學(xué)研究進展緩慢,蛋白質(zhì)組學(xué)的研究更是尚未起步。因此,可以利用多組學(xué)聯(lián)合技術(shù),挖掘葛根素等有效成分生物合成相關(guān)的基因、調(diào)控蛋白、酶、轉(zhuǎn)錄因子以及次生代謝途徑等,從而從分子層面對葛根分子研究的短板進行填補。

        多組學(xué)研究可以從基因水平對葛根的品質(zhì)提升進行指導(dǎo),目前大部分研究針對的是葛根素合成相關(guān)的基因和酶,還有一部分研究專注于葛根膨大機制和淀粉合成,對于葛根抗逆方面的研究還有待提升。因此,可以利用溫度、光照、水分等非生物脅迫或者病蟲害等生物脅迫來篩選葛根相關(guān)的抗逆基因,從而提升葛根的抗逆性。

        在葛根的種植和新品種選育方面,相對于常見的蔬菜水果等,葛根的品種選育進展較為緩慢,全國報道的葛根新品種不多,且推廣種植面積較小。另外,最主要的藥用成分葛根素在野葛中含量較高,在粉葛中含量較低,但是主要選育和種植的葛根絕大部分為淀粉含量高、食用價值高的粉葛,其葛根素含量很難達到藥典規(guī)定的標準。因此,對于富含藥用有效成分葛根素的野葛的新品種選育有待加強。

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