謝維熙 張光耀 鄭軒 王賢文

（1.大連理工大學(xué)科學(xué)學(xué)與科技管理研究所暨WISE實(shí)驗(yàn)室，大連，116024；2.大連理工大學(xué)經(jīng)濟(jì)管理學(xué)院，大連，116024）

1 引言

隨著互聯(lián)網(wǎng)的發(fā)展和開放科學(xué)的不斷深入[1]，科學(xué)成果傳播和交流的方式也在不斷推陳出新。預(yù)印本便是一種重要的學(xué)術(shù)成果交流形式，研究人員為進(jìn)行更廣泛的學(xué)術(shù)交流，將科研成果通過網(wǎng)絡(luò)發(fā)布到預(yù)印本平臺。相較于正式出版的論文，預(yù)印本具有傳播和交流速度快、交流更廣泛更開放的特點(diǎn)。研究人員通過預(yù)印本向同行和公眾及時(shí)分享自己的研究成果，極大地促進(jìn)了科學(xué)成果的傳播和交流。

2019年末爆發(fā)的新冠疫情（COVID-19）對科學(xué)界產(chǎn)生了巨大的影響，科學(xué)家們?yōu)樽柚共《镜膫鞑ヒ郧八从械乃俣韧度氲较嚓P(guān)研究中。作為傳統(tǒng)以期刊為核心的學(xué)術(shù)交流模式的替代或補(bǔ)充，更多科學(xué)家選擇將研究成果第一時(shí)間發(fā)布在預(yù)印本平臺，預(yù)印本的優(yōu)勢在這次疫情中得到了充分體現(xiàn)[2]。預(yù)印本可以實(shí)時(shí)分享研究結(jié)果，避免同行評審的延誤，在新冠肺炎病毒未得到完全解決以及開放科學(xué)不斷推進(jìn)的時(shí)代，預(yù)印本在科學(xué)交流體系中的關(guān)鍵作用愈發(fā)明顯[3]。預(yù)印本的擴(kuò)散趨勢是指預(yù)印本在一段時(shí)間內(nèi)，通過特定的渠道在某一團(tuán)體中傳播的過程。探究預(yù)印本的擴(kuò)散趨勢有著重要的意義，然而以往的研究對此鮮有涉及。因此，本文以bioRxiv預(yù)印本為研究對象，探究預(yù)印本發(fā)表模式的擴(kuò)散趨勢，從國家和機(jī)構(gòu)的角度對其擴(kuò)散趨勢進(jìn)行分析。

2 相關(guān)研究

2.1 開放獲取與預(yù)印本的發(fā)展

開放科學(xué)是一種推進(jìn)科學(xué)開放與共享的科學(xué)實(shí)踐，倡導(dǎo)增加科學(xué)的透明度，擴(kuò)大研究成果的訪問范圍，是全球科技發(fā)展的重要趨勢，開放獲取是組成開放科學(xué)的一部分，也是開放科學(xué)的核心要素[4]。為促進(jìn)科學(xué)信息的廣泛交流以及提高科學(xué)研究的效率，開放獲取為作者免費(fèi)提供在互聯(lián)網(wǎng)上獲取和使用科研文獻(xiàn)的機(jī)會，預(yù)印本平臺是開放獲取相關(guān)實(shí)踐的重要部分[5]。預(yù)印本arXiv最初于1991年推出，主要為物理研究人員在論文正式發(fā)表之前提供分享平臺，而后伴隨開放科學(xué)運(yùn)動的興起得到迅速發(fā)展，同時(shí)，預(yù)印本平臺也有助于開放科學(xué)，能夠快速而廣泛地分享研究成果。預(yù)印本是一種為彌合論文提交和出版之間的時(shí)間差而建立的開放獲取在線存儲庫[6]，存儲未經(jīng)正式同行評審的手稿，預(yù)印本的篩選過程是粗略和快速的，平臺對提交到預(yù)印本服務(wù)器上的文章的完整性和是否抄襲以及符合法律和道德規(guī)范進(jìn)行檢查，大多數(shù)預(yù)印本服務(wù)器為每份提交的文章提供DOI[7]。繼arXiv之后，社會科學(xué)、生物學(xué)和醫(yī)學(xué)等領(lǐng)域也推出了各自的預(yù)印本平臺，分別為SSRN、bioRxiv和medRxiv等。

預(yù)印本的出現(xiàn)不僅推動了開放科學(xué)運(yùn)動[8]，讓讀者快速免費(fèi)地獲取科學(xué)內(nèi)容，同時(shí)研究者在將論文提交至期刊之前也可以得到及時(shí)的反饋并確立其研究的優(yōu)先權(quán)[9]，研究人員通過發(fā)布預(yù)印本可以即時(shí)傳達(dá)他們的研究結(jié)果，從而得到及時(shí)的反饋以及促進(jìn)早期合作。研究表明最終發(fā)表的出版物中發(fā)布過預(yù)印本的文章有更多的關(guān)注和引用[10,11]，預(yù)印本的推出還降低了論文發(fā)表的偏見，尤其是對于職業(yè)生涯早期的科研人員[12]。預(yù)印本作為期刊出版物的替代或補(bǔ)充，加速了科學(xué)信息的傳播，在一定程度上還加速了研究的進(jìn)程，同時(shí)還為出版生態(tài)系統(tǒng)的演變提供了可能性[13]。

從學(xué)術(shù)界的態(tài)度來看，隨著研究進(jìn)程的加快，研究人員對同行評審的速度以及已發(fā)表論文的可獲得性愈發(fā)不滿，盡管預(yù)印本的可信度因缺乏嚴(yán)格的評審被詬病[14-15]，然而其及時(shí)性對于科學(xué)交流至關(guān)重要，預(yù)印本也得到了學(xué)術(shù)團(tuán)體、基金組織甚至傳統(tǒng)出版商的認(rèn)可和支持，生物學(xué)出版商鼓勵(lì)提交預(yù)印本[16]，Elife等知名期刊直接接受bioRxiv網(wǎng)站的提交，節(jié)省了作者向期刊提交論文的時(shí)間[17]。美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）和歐洲研究理事會等主要研究資助者也表達(dá)了對預(yù)印本的支持[16]。

2.2 疫情形勢下的預(yù)印本

2019年末爆發(fā)的新冠疫情引發(fā)了科學(xué)文獻(xiàn)的激增，尤其是與新冠肺炎相關(guān)的文獻(xiàn)數(shù)量大幅增加[18]。隨著新型冠狀病毒的傳播，與冠狀病毒有關(guān)的論文出版規(guī)范迅速發(fā)生變化，傳統(tǒng)的論文發(fā)表已經(jīng)無法滿足人們對信息的迫切需求，信息的即時(shí)性對于決策者和普通民眾都至關(guān)重要。預(yù)印本因其傳播速度快而受到廣泛使用，其中醫(yī)學(xué)相關(guān)預(yù)印本論文增長速度尤其快，最受歡迎的兩個(gè)生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的預(yù)印本服務(wù)器是bioRxiv和medRxiv[19]。

疫情前期，預(yù)印本占據(jù)冠狀病毒相關(guān)研究的大部分，相比較于學(xué)術(shù)出版物，預(yù)印本獲得了更多的關(guān)注和引用[20]，預(yù)印本的廣泛使用促進(jìn)了學(xué)者之間的快速交流，加速了研究進(jìn)程，為疫情防控和疫苗研發(fā)提供即時(shí)信息，也對政策制定起到了至關(guān)重要的作用[21]。然而，預(yù)印本的質(zhì)量控制問題仍令人擔(dān)憂[22]，預(yù)印本服務(wù)器上發(fā)布的手稿因未經(jīng)嚴(yán)格的同行評審而飽受爭議，研究結(jié)果可能會影響臨床實(shí)踐，甚至影響患者的安全[23]。雖然嚴(yán)格的同行評審過程能夠保證科學(xué)研究質(zhì)量和完整性，但是即使在學(xué)術(shù)期刊已經(jīng)大幅縮短論文出版時(shí)間的情況下，幾個(gè)月甚至更久的評審過程與疫情下對信息的迫切需求仍然存在巨大的張力[24]。也有研究表示預(yù)印本論文與期刊論文的可靠性相差不大，Brainard對比疫情期間經(jīng)過同行評審發(fā)表在期刊上的文章與發(fā)布在預(yù)印本平臺上的文章后發(fā)現(xiàn)，兩者在可靠性等方面的差距在變小[19]。

為了解疫情期間關(guān)于冠狀病毒預(yù)印本累積數(shù)量的演化模式，Vasconcelos建立模型發(fā)現(xiàn)在疫情爆發(fā)后很短的時(shí)間內(nèi)產(chǎn)生了前所未有數(shù)量的學(xué)術(shù)論文，然而這種增速在幾個(gè)月后降低，甚至文獻(xiàn)數(shù)量有下降趨勢[25]。Abdill基于bioRxiv預(yù)印本在國家層面展示了全球參與bioRxiv的大致情況，國家在bioRxiv上的投稿數(shù)量以及主導(dǎo)地位分布極不均衡[26]。相關(guān)研究還分析了bioRxiv預(yù)印本使用量的變化趨勢，發(fā)現(xiàn)自2013年推出以來預(yù)印本的提交量和下載量激增，其中首次發(fā)布預(yù)印本的作者數(shù)量也持續(xù)上升，此外大部分論文最終經(jīng)過同行評審發(fā)表到期刊上[24]。

預(yù)印本作為一種新興的學(xué)術(shù)交流載體已經(jīng)在許多學(xué)科領(lǐng)域得到廣泛關(guān)注和應(yīng)用，因此探索預(yù)印本的擴(kuò)散趨勢有著重要的意義。目前國內(nèi)外關(guān)于bioRxiv以及預(yù)印本的研究，問題主要集中于預(yù)印本平臺的優(yōu)勢、影響與局限性[27]，預(yù)印本的提交量和下載量，最終有多少預(yù)印本在期刊上發(fā)表以及預(yù)印本到最終發(fā)表的版本發(fā)生的變化，預(yù)印本研究領(lǐng)域的變化趨勢[17,28]，預(yù)印本的關(guān)注和引用優(yōu)勢[11,29]等方面，國內(nèi)也有學(xué)者從政策角度對預(yù)印本的發(fā)展態(tài)勢進(jìn)行分析[30]，然而幾乎沒有研究涉及預(yù)印本在時(shí)間演化和空間擴(kuò)散上的趨勢。

本文以生物學(xué)領(lǐng)域最大的預(yù)印本平臺bioRxiv為研究對象，選取2013-2021年Dimensions平臺上的bioRxiv數(shù)據(jù)集，使用文獻(xiàn)計(jì)量法從多維度探究bioRxiv在國家和機(jī)構(gòu)層面的演化規(guī)律，以及疫情對擴(kuò)散趨勢的影響，有助于了解bioRxiv的整體格局和發(fā)展趨勢，從預(yù)印本角度總結(jié)學(xué)術(shù)交流演變規(guī)律，為預(yù)印本平臺建設(shè)和學(xué)術(shù)交流體系發(fā)展提供參考。本研究主要關(guān)注以下幾個(gè)研究問題：

（1）國家層面上，bioRxiv預(yù)印本發(fā)表在國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平下呈現(xiàn)什么樣的擴(kuò)散趨勢？

（2）機(jī)構(gòu)層面上，bioRxiv預(yù)印本發(fā)表從機(jī)構(gòu)科研水平視角下存在什么樣的擴(kuò)散趨勢？

（3）新冠疫情形勢下，bioRxiv預(yù)印本發(fā)表的擴(kuò)散趨勢有何特征？

3 研究數(shù)據(jù)與方法

Digital Science公司于2018年初發(fā)布了一個(gè)新型的綜合科研信息數(shù)據(jù)平臺——Dimensions（https://app.dimensions.ai/），收錄了大量科研信息資源，包括文獻(xiàn)（期刊和會議論文、圖書、預(yù)印本等）、研究數(shù)據(jù)集、基金和專利數(shù)據(jù)、臨床試驗(yàn)和跨數(shù)據(jù)源關(guān)聯(lián)關(guān)系等，為科研人員、出版商以及科研經(jīng)費(fèi)資助機(jī)構(gòu)所需的科技情報(bào)和決策提供數(shù)據(jù)支撐[31]。對本研究而言，雖然數(shù)據(jù)來源于bioRxiv，但是需從Dimensions采集。這是因?yàn)閎ioRxiv網(wǎng)站不提供論文元數(shù)據(jù)采集的API，對于論文作者所屬的機(jī)構(gòu)和國家信息，從bioRxiv下載的原始字段沒有經(jīng)過結(jié)構(gòu)化處理，無法進(jìn)行本文研究所需的分析；而Dimensions平臺提供了bioRxiv論文作者的所屬機(jī)構(gòu)和國家的結(jié)構(gòu)化字段，從Dimensions下載的數(shù)據(jù)可以方便地進(jìn)行分析。

預(yù)印本服務(wù)器bioRxiv于2013年11月由冷泉港實(shí)驗(yàn)室（CSHL）及其出版社（CSHLP）推出，每年提交的論文數(shù)量穩(wěn)步增加[17]，現(xiàn)已成為生物科學(xué)領(lǐng)域最大的預(yù)印本平臺，因此在研究疫情相關(guān)問題上其數(shù)據(jù)更具有代表性。從研究領(lǐng)域來看，bioRxiv最初主要包括進(jìn)化生物學(xué)、遺傳學(xué)和計(jì)算生物學(xué)等，現(xiàn)在更多的是神經(jīng)科學(xué)、細(xì)胞和發(fā)育生物學(xué)的內(nèi)容，其他領(lǐng)域的研究者也在bioRxiv上發(fā)布了大量文章[13]。

考慮到bioRxiv的學(xué)科領(lǐng)域和預(yù)印本的及時(shí)性特點(diǎn)，以及Dimensions平臺上數(shù)據(jù)的完整性和可用性，本研究于2022年1月15日在Dimensions平臺收集了2013-2021年bioRxiv的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)，去除字段內(nèi)容不完整的數(shù)據(jù)，得到了141,731份預(yù)印本作為研究數(shù)據(jù)，對元數(shù)據(jù)進(jìn)行處理后，提取數(shù)據(jù)中的有用信息，包括預(yù)印本的數(shù)字對象標(biāo)識符（DOI）、發(fā)布到bioRxiv的日期、作者、所屬機(jī)構(gòu)和國家等。

4 結(jié)果與分析

4.1 bioRxiv 平臺上發(fā)布文章的國家和機(jī)構(gòu)數(shù)量變化趨勢

從整體角度分析2013-2021年在bioRxiv平臺上發(fā)布文章的國家和機(jī)構(gòu)數(shù)量變化情況。國家和機(jī)構(gòu)數(shù)量及其論文量變化在一定程度上反映了bioRxiv擴(kuò)散程度以及未來發(fā)展趨勢，也從整體上反映了科學(xué)界對bioRxiv的認(rèn)可程度。

對論文量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，如圖1所示，bioRxiv從2013年推出以來論文量穩(wěn)步增長，其中，2016年開始，論文量增長速度明顯加快。在作者的國家和機(jī)構(gòu)歸屬方面，由于已有大量研究證實(shí)末位作者在研究中有著重要的貢獻(xiàn)，尤其是在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域[26,32]。因此，進(jìn)一步對每年以末位作者身份在bioRxiv上發(fā)文的國家和機(jī)構(gòu)數(shù)量及其論文量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，bioRxiv上國家和機(jī)構(gòu)數(shù)量及其論文量在2013-2020年呈現(xiàn)明顯上升的趨勢，但論文量、國家和機(jī)構(gòu)數(shù)量都在2021年有小幅下降。2019年以后雖然論文量和機(jī)構(gòu)數(shù)量持續(xù)增長，但是到2020年論文量和國家數(shù)量均有所下降，機(jī)構(gòu)數(shù)量增長速度減緩。由此可見，疫情之前，bioRxiv預(yù)印本的發(fā)文量呈現(xiàn)良好的增長趨勢，在疫情爆發(fā)后，發(fā)文國家數(shù)量的增長趨勢減緩并在2021年出現(xiàn)回落，發(fā)文機(jī)構(gòu)數(shù)量的增長趨勢也在2021年有所放緩。

圖1 2013-2021年bioRxiv 論文量和國家/機(jī)構(gòu)量及其論文量變化趨勢Fig.1 Changes in the Number of Countries/ Institutions and Their Papers on bioRxiv from 2013 to 2021

4.2 國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平視角下的bioRxiv擴(kuò)散趨勢

進(jìn)一步從國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平角度分析bioRxiv在國家層面的擴(kuò)散趨勢。在國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平劃分上，綜合世界銀行、國際貨幣基金組織、聯(lián)合國開發(fā)計(jì)劃署和美國中央情報(bào)局發(fā)布的資料，將國家分為發(fā)達(dá)國家和發(fā)展中國家，以分析其數(shù)量變化。發(fā)達(dá)國家和發(fā)展中國家數(shù)量及其占比變化趨勢如圖2所示。從國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平來看，2013-2018年發(fā)展中國家數(shù)量呈上升趨勢，而發(fā)達(dá)國家相反。兩類國家數(shù)量在2018-2020年基本穩(wěn)定，然而發(fā)展中國家數(shù)量在2021年小幅下降。

圖2 發(fā)達(dá)國家和發(fā)展中國家數(shù)量及其占比變化趨勢Fig.2 Changes in the Number and Proportion of Developed and Developing Countries

為進(jìn)一步探究國家層面的演化規(guī)律，取各國家機(jī)構(gòu)數(shù)量排名、國家機(jī)構(gòu)數(shù)量的對數(shù)分別為橫縱坐標(biāo)繪制散點(diǎn)圖，如圖3所示，2013-2021年結(jié)果均呈冪律分布，且冪律分布的長尾分布特征逐漸減弱，2013-2019年發(fā)展中國家數(shù)量逐漸增多，但2019年之后，發(fā)展中國家數(shù)量有所減少?？偟膩碚f，bioRxiv預(yù)印本的發(fā)表模式呈現(xiàn)由發(fā)達(dá)國家向發(fā)展中國家擴(kuò)散的趨勢，而疫情使得這一擴(kuò)散趨勢有所逆轉(zhuǎn)。

圖3 發(fā)文機(jī)構(gòu)的冪律分布圖Fig.3 Power Law Distribution of the Institutions Publishing on bioRxiv

4.3 機(jī)構(gòu)科研水平視角下的bioRxiv擴(kuò)散趨勢

bioRxiv發(fā)文機(jī)構(gòu)主要為大學(xué)，也包括研究所和醫(yī)院等其他機(jī)構(gòu)，為探究機(jī)構(gòu)層面是否存在由頂尖機(jī)構(gòu)向普通機(jī)構(gòu)擴(kuò)散的趨勢，本研究只考慮大學(xué)的排名，使用2021軟科世界大學(xué)學(xué)術(shù)排名（Shanghai Ranking's Academic Ranking of World Universities,ARWU）和U.S.News在生物學(xué)和生物化學(xué)領(lǐng)域的排名作為大學(xué)科研水平的評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)，兩個(gè)排名均是世界范圍內(nèi)公認(rèn)的較為權(quán)威的世界大學(xué)排名。對每年發(fā)文量排名前50的機(jī)構(gòu)的發(fā)文量及其大學(xué)的最新軟科排名進(jìn)行統(tǒng)計(jì)，結(jié)果如表1所示。為了解發(fā)文量Top50機(jī)構(gòu)中高?？蒲兴脚琶植迹紤]到論文發(fā)布量還計(jì)算了加權(quán)平均排名，結(jié)果如圖4所示，加權(quán)平均值計(jì)算公式見公式1。

公式1中，為加權(quán)平均排名，xn為第n個(gè)高校軟科排名，wn為第n個(gè)高校在bioRxiv上發(fā)表論文量。

由表1中可以看到，哈佛大學(xué)、斯坦福大學(xué)、牛津大學(xué)等一些頂尖大學(xué)發(fā)文量始終位居前列，2015-2019年有許多軟科排名靠后的大學(xué)進(jìn)入發(fā)文量前五十，而2019年之后，發(fā)文量前五十的機(jī)構(gòu)大部分軟科排名靠前。除中國科學(xué)院大學(xué)在2020和2021年分列26和31位之外，中國機(jī)構(gòu)很少進(jìn)入發(fā)文量前50。

表1 Top50機(jī)構(gòu)的發(fā)文量Table 1 Number of Documents Published by the Top50 Institutions

如圖4所示，無論從軟科排名還是U.S.News生物學(xué)排名來看，高?？蒲兴脚琶图訖?quán)平均排名的變化趨勢基本一致，即2013年和2014年平均排名較高，2015-2019年平均排名呈上升趨勢，2019年之后，平均排名有所下降?？偟膩碚f，bioRxiv預(yù)印本發(fā)表模式存在向普通機(jī)構(gòu)擴(kuò)散的趨勢，但疫情的爆發(fā)對該擴(kuò)散趨勢有負(fù)向影響。

圖4 發(fā)文量Top50機(jī)構(gòu)中高校科研水平排名分布圖Fig.4 Ranking Distribution of Research Level of Colleges and Universities Among the Top 50 Institutions

4.4 新冠疫情對bioRxiv擴(kuò)散趨勢的影響

從整體上對bioRxiv平臺上發(fā)布文章的國家和機(jī)構(gòu)數(shù)量變化趨勢，以及從國家和機(jī)構(gòu)層面對bioRxiv擴(kuò)散趨勢的分析，可知疫情給bioRxiv的擴(kuò)散趨勢造成了負(fù)面影響。為進(jìn)一步驗(yàn)證結(jié)論，對每一年消失的國家和機(jī)構(gòu)（即前一年在bioRxiv上有論文發(fā)布，但該年沒有）進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析，結(jié)果如表2和表3所示。

表2 疫情前后退出bioRxiv 的國家對比Table 2 Comparison of Countries Withdrawing from bioRxiv Before and After the Epidemic

表3 疫情前后退出bioRxiv 的機(jī)構(gòu)對比Table 3 Comparison of Institutions Withdrawing from bioRxiv Before and After the Epidemic

2013-2019年即疫情前消失的國家有24個(gè)，主要是亞洲、非洲的發(fā)展中國家，另外還有歐洲的三個(gè)發(fā)達(dá)國家，分別是盧森堡、斯洛伐克和馬耳他；2019-2021年即疫情期間，消失的國家有29個(gè)且全部是發(fā)展中國家，主要分布在北美洲、亞洲和非洲。

對比疫情前后退出的機(jī)構(gòu)發(fā)現(xiàn)，疫情后消失的機(jī)構(gòu)數(shù)量較多，但相比于疫情前，疫情后消失的機(jī)構(gòu)大多數(shù)是科研水平排名靠后的機(jī)構(gòu)。新冠疫情嚴(yán)重影響了國家和機(jī)構(gòu)的科研活動，其中對發(fā)展中國家和普通機(jī)構(gòu)的影響更大。

5 結(jié)論

預(yù)印本的出現(xiàn)加速了科學(xué)傳播，促進(jìn)了學(xué)術(shù)交流體系的發(fā)展。本文以2013-2021年bioRxiv的預(yù)印本為樣本，采用文獻(xiàn)計(jì)量方法，從時(shí)間演化、國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平以及機(jī)構(gòu)科研水平多角度對bioRxiv在國家和機(jī)構(gòu)層面的擴(kuò)散趨勢進(jìn)行探索，并探究新冠疫情對bioRxiv擴(kuò)散趨勢的影響。

整體上，越來越多的國家和機(jī)構(gòu)的科研人員將研究成果發(fā)布到bioRxiv上，說明該平臺作為生物學(xué)界最大的預(yù)印本平臺在全球范圍內(nèi)逐漸得到認(rèn)可和關(guān)注。從國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平來看，越來越多的發(fā)展中國家在bioRxiv上發(fā)布文章，從參與國家數(shù)量角度進(jìn)行分析可知，bioRxiv由發(fā)達(dá)國家向發(fā)展中國家流行，觀察疫情前后國家數(shù)量變化，發(fā)現(xiàn)疫情使得少數(shù)發(fā)展中國家在bioRxiv上的科學(xué)活動受到影響，冪律分布圖也證實(shí)了該擴(kuò)散趨勢的存在。從機(jī)構(gòu)層面來看，考慮到2013年數(shù)據(jù)僅包括11月和12月的預(yù)印本，論文量較少，且2013-2014年bioRxiv處于發(fā)展初期，尚未在全球范圍內(nèi)得到廣泛使用，因此2013-2014年大學(xué)平均排名較高。2015-2019年bioRxiv發(fā)展迅速，越來越多的普通大學(xué)發(fā)文量進(jìn)入發(fā)文量前五十，然而，2019年后頂尖大學(xué)更多占據(jù)前列。因此，可以得出結(jié)論：bioRxiv有從頂尖機(jī)構(gòu)向普通機(jī)構(gòu)擴(kuò)散的趨勢，但疫情對普通機(jī)構(gòu)的影響更大，對該擴(kuò)散有負(fù)面影響。

新冠疫情對bioRxiv的擴(kuò)散趨勢有負(fù)面影響，整體上雖然bioRxiv論文量在疫情前期持續(xù)增長，但在后疫情時(shí)代有所下降。分析國家和機(jī)構(gòu)的擴(kuò)散趨勢后發(fā)現(xiàn)，疫情對bioRxiv在國家和機(jī)構(gòu)視角的擴(kuò)散均存在不同程度的負(fù)向影響。從每年消失的國家和機(jī)構(gòu)的分析中可以發(fā)現(xiàn)，相較于發(fā)達(dá)國家和頂尖機(jī)構(gòu)，疫情對發(fā)展中國家和普通機(jī)構(gòu)的科學(xué)工作影響更大，發(fā)展中國家和普通機(jī)構(gòu)的科學(xué)活動較大程度上受到疫情影響。從中國在bioRxiv的發(fā)文情況來看，中國的科研產(chǎn)出能力逐漸增強(qiáng)并僅次于美國，但在機(jī)構(gòu)層面上，單個(gè)機(jī)構(gòu)競爭力并不強(qiáng)。

值得注意的是，本文中各種指標(biāo)的增長趨勢在2020年后有所減緩，甚至發(fā)生逆轉(zhuǎn)，對于這一現(xiàn)象有必要作出解釋。疫情對科學(xué)界產(chǎn)生了巨大的影響。雖然疫情的挑戰(zhàn)刺激了科學(xué)研究數(shù)量和速度的大幅提高，但與此同時(shí)社會隔離和封鎖導(dǎo)致了大量科學(xué)研究的中斷。首先，在預(yù)印本數(shù)量急劇增長幾個(gè)月后，研究人員很難以疫情初期同樣的速度持續(xù)進(jìn)行科學(xué)研究；其次，研究人員有可能把研究重心從新型冠狀病毒轉(zhuǎn)移到新的或者以前的研究方向，尤其是與公共衛(wèi)生和生物學(xué)無關(guān)的一些研究人員。此外，對預(yù)印本科學(xué)可信度的質(zhì)疑導(dǎo)致預(yù)印本篩查審核過程更加嚴(yán)格，這也會影響預(yù)印本的提交數(shù)量[25]。

以預(yù)印本為媒介的學(xué)術(shù)交流模式迅速發(fā)展，正在改變傳統(tǒng)以期刊為主的學(xué)術(shù)交流模式，很大程度上推動了開放科學(xué)的發(fā)展，因此對預(yù)印本的擴(kuò)散趨勢進(jìn)行探索是十分有必要的。相比以往的研究，本研究探究了bioRxiv在國家和機(jī)構(gòu)層面的擴(kuò)散趨勢，多層次分析了預(yù)印本的擴(kuò)散趨勢，同時(shí)從時(shí)間、國家經(jīng)濟(jì)和機(jī)構(gòu)科研發(fā)展水平多角度反映了bioRxiv的演化趨勢，為預(yù)印本的研究提供了新視角。本研究有助于了解bioRxiv的整體格局及發(fā)展趨勢，了解各國家和機(jī)構(gòu)在以bioRxiv為載體的學(xué)術(shù)交流體系中的地位和競爭力，為預(yù)印本平臺建設(shè)和學(xué)術(shù)交流體系研究提供基礎(chǔ)。

結(jié)合以上分析和結(jié)論，本文提出以下建議。首先，對于預(yù)印本平臺來說，加強(qiáng)預(yù)印本在發(fā)展中國家和普通科研機(jī)構(gòu)的宣傳推廣，擴(kuò)大預(yù)印本的使用受眾范圍。其次，對于所有國家和機(jī)構(gòu)來說，在后疫情時(shí)代，應(yīng)積極采取措施促進(jìn)科研工作者的科學(xué)活動的恢復(fù)，盡量減輕或者消除疫情對科學(xué)活動的影響。再次，對于發(fā)展中國家和普通科研機(jī)構(gòu)的科研工作者來說，應(yīng)積極利用預(yù)印本平臺，如關(guān)注預(yù)印本論文、利用預(yù)印本平臺發(fā)布論文等，以預(yù)印本為途徑提升在學(xué)術(shù)交流體系中的地位。最后，對于中國來說，目前我國已經(jīng)開始建設(shè)自己的預(yù)印本平臺ChinaXiv，建設(shè)過程中如何吸取國際上成熟的預(yù)印本平臺如arXiv、bioRxiv、SSRN等的經(jīng)驗(yàn)，尤其是現(xiàn)階段完善ChinaXiv平臺的基礎(chǔ)架構(gòu)、加大平臺的宣傳、提升平臺在國內(nèi)和國際上的影響力等是當(dāng)務(wù)之急。

本研究也存在一定局限。首先，研究數(shù)據(jù)集僅限于bioRxiv預(yù)印本；其次，本文從時(shí)間演化、國家經(jīng)濟(jì)發(fā)展水平和機(jī)構(gòu)科研水平這幾個(gè)角度分析bioRxiv在國家和機(jī)構(gòu)層面的演化趨勢，地理空間等方面的演化規(guī)律沒有涉及。在之后的研究中，將從更加多源的數(shù)據(jù)集和更多角度對預(yù)印本的擴(kuò)散趨勢進(jìn)行探究。

作者貢獻(xiàn)說明

謝維熙：設(shè)計(jì)研究方案，數(shù)據(jù)收集、處理和分析，論文寫作；

張光耀：論文寫作與修改；

鄭軒：數(shù)據(jù)收集，論文修改；

王賢文：提出研究思路，設(shè)計(jì)研究方案，數(shù)據(jù)收集，論文修改。

支撐數(shù)據(jù)

支撐數(shù)據(jù)可開放獲取，獲取地址為：https://doi.org/10.6084/m9.figshare.20224638.v1。

1、王賢文，謝維熙.bioRxiv 歷年發(fā)文國家數(shù)量統(tǒng)計(jì).xlsx.國家統(tǒng)計(jì).

2、王賢文，謝維熙.bioRxiv 歷年發(fā)文機(jī)構(gòu)數(shù)量統(tǒng)計(jì).xlsx.機(jī)構(gòu)統(tǒng)計(jì).