王 艷 李 園 高 穎 褚福浩 蘇澤琦 丁 霞 (北京中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院,北京 102488)
胃癌(gastric cancer,GC)是全球常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率和病死率分別位居惡性腫瘤的第五和第三[1]。根據(jù)Lauren 分型,可將胃腺癌分為腸型、彌漫型和混合型,其中腸型胃癌是胃癌中最常見的類型,其發(fā)生是一個(gè)復(fù)雜的、多過程的級聯(lián)反應(yīng)模式,從慢性萎縮性胃炎(chronic atrophic gastritis,CAG)到腸上皮化生(intestinal metaplasia,IM),再到異型增生(dysplasia,Dys)是涉及多個(gè)基因及通路的復(fù)雜生物學(xué)過程。IM 作為胃癌前病變的重要階段,該病理階段的形成和進(jìn)展可增加腸型胃癌的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)[2]。因此,尋找IM 的潛在關(guān)鍵靶點(diǎn),明確其發(fā)生發(fā)展機(jī)制,對IM及腸型胃癌的早期診斷及預(yù)防具有重要意義和價(jià)值。
近年來,隨著生物信息學(xué)的發(fā)展和測序技術(shù)的應(yīng)用,從轉(zhuǎn)錄組、蛋白組水平研究疾病的發(fā)生發(fā)展機(jī)制已成為普遍關(guān)注的熱點(diǎn)。本研究利用生物信息學(xué)技術(shù),挖掘公共基因芯片數(shù)據(jù)庫(Gene Expression Omnibus,GEO)中包含IM 的基因芯片,確定IM 組織與正常胃黏膜組織之間的差異表達(dá)基因(differen‐tially expressed genes,DEGs),隨后進(jìn)行GO 分析和KEGG 通路富集分析,構(gòu)建蛋白相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò),尋找關(guān)鍵基因,篩選靶向IM關(guān)鍵基因的中藥,為探究IM 發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制及治療藥物提供科學(xué)依據(jù)。
1.1 基因表達(dá)譜芯片的篩選 本研究從美國國立生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)的GEO 數(shù)據(jù)庫(http://www. ncbi.nlm.nih.gov/)中,以“(gastric OR gastritis)OR stomach”為檢索條件,通過閱讀全文篩選出包含IM的基因芯片數(shù)據(jù)集,獲得GPL18990 和GPL17077 平臺(tái)的GSE78523和GSE60427兩個(gè)數(shù)據(jù)集,從中選取IM 樣本和正常胃黏膜樣本進(jìn)行分析[3-5]。
1.2 數(shù)據(jù)處理及差異基因分析 利用R 語言nor‐malizeBetweenArrays 函數(shù)對數(shù)據(jù)進(jìn)行背景矯正和歸一化處理,使數(shù)據(jù)具有可比性,并對校正后的數(shù)據(jù)進(jìn)行繪圖。采用Limma 包對IM 組織與正常組織進(jìn)行差異基因篩選,篩選標(biāo)準(zhǔn)為P<0.05,|Log2FC|>1;利用pheatmap 包對差異基因進(jìn)行熱圖的繪制,直觀地展現(xiàn)差異基因在每個(gè)樣本中的表達(dá)情況,利用火山圖分別展示2 個(gè)數(shù)據(jù)集中上調(diào)及下調(diào)的差異基因。取2 個(gè)數(shù)據(jù)集所獲得差異基因的交集,并利用在線工具繪制韋恩圖(http://bioinformatics. psb.ugent.be/webtools/Venn/),獲得共同表達(dá)的DEGs。
1.3 GO 富集分析和KEGG 通路富集分析 利用DAVID6.8 在線工具(https://david. ncifcrf. gov/)對上述共同表達(dá)差異基因進(jìn)行GO 富集分析及KEGG通路分析,以P<0.05為篩選標(biāo)準(zhǔn)。
1.4 PPI 的構(gòu)建 通過STRING 在線數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/)對2個(gè)數(shù)據(jù)集共有的DEGs構(gòu)建PPI網(wǎng)絡(luò),置信度評分≥0.4為顯著;將原始數(shù)據(jù)輸出并導(dǎo)入Cytoscape3.6.1(https://cytoscape. org/)軟件中進(jìn)行PPI 網(wǎng)絡(luò)的可視化[6],在網(wǎng)絡(luò)中,節(jié)點(diǎn)表示差異基因所編碼的蛋白質(zhì),與該節(jié)點(diǎn)的連線代表蛋白間的相互作用,連接數(shù)為該節(jié)點(diǎn)的degree,利用Cytohubba 插件篩選PPI 網(wǎng)絡(luò)中degree 得分前9 的關(guān)鍵基因,MCODE插件篩選出重要的模塊。
1.5 靶點(diǎn)對接及中藥預(yù)測 將關(guān)鍵基因與Coremine Medical 數(shù)據(jù)庫(http://www. coremine. com/)相互映射,篩選出靶向IM 關(guān)鍵基因的中藥,以P<0.05表示差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 差異基因的篩選 本研究納入2組基因芯片,其中GSE78523 數(shù)據(jù)集包括15 例正常胃黏膜樣本,14例IM 胃黏膜樣本(6例不完全腸化生,8例完全腸化生);GSE60427 數(shù)據(jù)集包括8 例正常胃黏膜樣本,8 例IM 胃黏膜樣本。所有數(shù)據(jù)均經(jīng)affy 包標(biāo)準(zhǔn)化處理[7],根據(jù)處理后的箱線圖(圖1)顯示,樣本的基因表達(dá)譜數(shù)據(jù)一致性較好,可以進(jìn)行差異分析。GSE78523 數(shù)據(jù)集共篩選出458 個(gè)差異基因,其中上調(diào)基因384個(gè),下調(diào)基因74個(gè);GSE60427數(shù)據(jù)集共篩選出1 766個(gè)差異基因,其中上調(diào)基因1 215個(gè),下調(diào)基因551個(gè);通過火山圖(圖2)可以直觀地顯示兩個(gè)數(shù)據(jù)集中總體基因表達(dá)情況,橫坐標(biāo)log2(fold change)為差異表達(dá)倍數(shù)的log2轉(zhuǎn)換,值≥1 表示上調(diào)的基因,≤?1為下調(diào)的基因,差異較大的基因分布在X 軸的兩端,縱坐標(biāo)?log10(p-value)代表對p-value 進(jìn)行?log10的轉(zhuǎn)化,值越大說明差異越顯著,圖上的每個(gè)點(diǎn)代表1 個(gè)基因,將|logFC|>3 的基因在圖上進(jìn)行標(biāo)注。通過熱圖(圖3A、B)反映差異基因在IM 組織和正常組織中的表達(dá)情況,橫坐標(biāo)表示樣本聚類,縱坐標(biāo)表示基因聚類;通過韋恩圖(圖3C)發(fā)現(xiàn)兩個(gè)數(shù)據(jù)集包含135個(gè)共同的DEGs。
2.2 GO富集分析和KEGG通路分析 運(yùn)用DAVID數(shù)據(jù)庫對135 個(gè)DEGs 進(jìn)行GO 和KEGG 通路富集,GO 分析包括生物學(xué)過程(biological processes,BP)、細(xì)胞成分(cell component,CC)、分子功能(molecular function,MF)三個(gè)部分。BP 相關(guān)變化主要涉及“O-聚糖合成(O-glycan processing)”“消化(digestion)”“細(xì)胞增殖的正向調(diào)控(positive regulation of cell pro‐liferation)”“蛋白水解(proteolysis)”等13 個(gè)功能簇;CC 相關(guān)變化主要涉及“細(xì)胞外空間(xtracellular space)”“質(zhì)膜的組成部分(integral component of plasma membrane)”“細(xì)胞外泌體(extracellular exo‐some)”“質(zhì)膜(plasma membrane)”“膜的組成部分(integral component of membrane)”等功能簇;MF 相關(guān)變化主要涉及“病毒受體活性(virus receptor activity)”“轉(zhuǎn)錄阻遏活性,RNA 聚合酶Ⅱ核心啟動(dòng)子近端區(qū)域序列特異性結(jié)合(transcriptional repressor activity,RNA polymerase Ⅱcore promoter proximal region sequence-specific binding)”“Ras 鳥嘌呤核苷酸交換因子活性(Ras guanyl-nucleotide exchange factor activity)”等功能簇。KEGG 通路分析顯示基因富集于“胃酸分泌(gastric acid secretion)”“氮代謝(nitro‐gen metabolism)”“腎素-血管緊張素系統(tǒng)(reninangiotensin system)”“蛋白質(zhì)的消化吸收(protein digestion and absorption)”“胰腺分泌(pancreatic secretion)”共5 條信號通路(表1)。對以上GO 及KEGG 結(jié)果采用R 語言ggplot2 包進(jìn)行可視化呈現(xiàn)(圖4)。
表1 KEGG分析Tab.1 KEGG analysis
圖4 DEGs的GO功能及KEGG富集結(jié)果Fig.4 GO function of DEGs and KEGG enrichment results
2.3 PPI網(wǎng)絡(luò)分析和關(guān)鍵基因篩選 利用Cytoscape中的Cytohubba插件找出關(guān)鍵基因,將degree≥5的基因定義為關(guān)鍵基因,分別為MUC5AC、DEFA5、MUC17、ALPI、SST、FOXA2、MUC13、GCNT3、OLFM4,節(jié)點(diǎn)顏色越深代表分值越高。根據(jù)MODE 插件對模塊進(jìn)行重要程度分析,篩選代表性的模塊,其中核心模塊打分值為3,包含GCNT3、MUC5AC、MUC17、MUC13共4個(gè)基因。見圖5。
圖5 DEGs的PPI網(wǎng)絡(luò)、關(guān)鍵基因及核心模塊Fig.5 PPI network,key genes and core modules of DEGs
2.4 根據(jù)關(guān)鍵基因預(yù)測治療中藥 利用Coremine Medical 數(shù)據(jù)庫對關(guān)鍵基因進(jìn)行IM 治療潛在中藥的篩選,結(jié)果顯示南沙參(P=0.002 28)、桔梗(P=0.002 29)、半夏(P=0.003 29)、藿香(P=0.006 67)、浙貝母(P=0.090 1)、甘草(P=0.012 7)、大黃(P=0.014)、車前草(P=0.015 4)、車前子(P=0.016 2)、款冬花(P=0.016 3)、瓜蔞(P=0.020 7)、瓜蔞皮(P=0.020 7)、瓜蔞子(P=0.020 8)、野菊花(P=0.021 2)、薏苡仁(P=0.022 2)、天花粉(P=0.023)、黨參(P=0.025)、甘草(P=0.027 1)、桑葉(P=0.029 5)、山茱萸(P=0.029 7)、青蒿(P=0.033 7)與MUC5AC 相對應(yīng);蘄蛇(P=0.035 9)與ALPI相對應(yīng);木鱉子(P=0.027 8)、枳實(shí)(P=0.046 3)、蒼術(shù)(P=0.047 2)與SST相對應(yīng);鹿角(P=0.007 4)與FOXA2 相對應(yīng);蠶豆(P=0.011 3)與MUC13相對應(yīng);蓖麻子(P=0.019 9)與OLFM4相對應(yīng)。這些中藥可能作為IM的潛在治療藥物。
IM 是指胃黏膜的正常上皮細(xì)胞被腸型上皮細(xì)胞取代,出現(xiàn)杯狀細(xì)胞、潘氏細(xì)胞及吸收上皮細(xì)胞的一種病理性形態(tài)學(xué)改變,被認(rèn)為是胃癌癌前病變。本研究利用GEO 數(shù)據(jù)庫檢索得到IM 基因芯片數(shù)據(jù)集(GSE78523、GSE60427),篩選出135 個(gè)共同DEGs 進(jìn)行生物信息學(xué)分析,發(fā)現(xiàn)IM 的發(fā)生可能與單核細(xì)胞趨化性、白細(xì)胞遷移、細(xì)胞外泌體等炎癥相關(guān)生物過程及胃酸分泌通路有關(guān),其結(jié)果有助于揭示IM 發(fā)生發(fā)展的分子機(jī)制,從基因?qū)用嫱诰虺鯥M 發(fā)生的關(guān)鍵基因,可能作為IM 的潛在生物標(biāo)志物,篩選出可干預(yù)IM 靶點(diǎn)的中藥,為臨床用藥提供依據(jù)。
3.1 炎癥反應(yīng)是IM 發(fā)生發(fā)展的關(guān)鍵因素 由于Hp感染或其他環(huán)境因素影響,白細(xì)胞介導(dǎo)慢性胃黏膜炎癥,導(dǎo)致多灶性腺體萎縮、壁細(xì)胞減少及酸分泌功能的降低,隨之出現(xiàn)以杯狀細(xì)胞為主的IM。單核細(xì)胞趨化性、白細(xì)胞遷移等生物功能及細(xì)胞外泌體等細(xì)胞組分參與了細(xì)胞的炎癥反應(yīng)過程。免疫細(xì)胞被認(rèn)為是腫瘤微環(huán)境的重要組成部分,嗜中性粒細(xì)胞和巨噬細(xì)胞是腫瘤微環(huán)境最豐富的免疫細(xì)胞[8]。胃部炎癥性疾病及胃癌前病變過程中可見嗜中性粒細(xì)胞、淋巴細(xì)胞等白細(xì)胞聚集,其分泌的淋巴因子可募集巨噬細(xì)胞于炎癥和腫瘤部位,發(fā)揮抗炎及殺傷癌變細(xì)胞的作用,但嗜中性粒細(xì)胞會(huì)產(chǎn)生活性氧(ROS)及活性氮物質(zhì)(RNS),并在細(xì)胞中積累導(dǎo)致細(xì)胞惡性轉(zhuǎn)化[6,9]。血液中的單核細(xì)胞游走進(jìn)入組織器官發(fā)育成熟為巨噬細(xì)胞,巨噬細(xì)胞常出現(xiàn)于急性炎癥的后期、慢性炎癥和非化膿性炎癥等,具有較強(qiáng)的吞噬能力,參與特異性免疫反應(yīng),攝取并呈遞抗原,巨噬細(xì)胞的表型和功能受周圍微環(huán)境的調(diào)節(jié),當(dāng)機(jī)體出現(xiàn)感染與炎癥時(shí),巨噬細(xì)胞首先表現(xiàn)出M1 表型,表達(dá)和分泌經(jīng)典促炎細(xì)胞因子和趨化因子,通過免疫識(shí)別發(fā)揮抗腫瘤作用,但長期的炎癥反應(yīng)會(huì)導(dǎo)致組織損傷,此時(shí),M2 型巨噬細(xì)胞可產(chǎn)生VEGF 和抗炎分子,起到減輕炎癥反應(yīng),促進(jìn)組織修復(fù)的作用,在腫瘤微環(huán)境中,M2 型巨噬細(xì)胞可通過促進(jìn)腫瘤生長、遷移侵襲、免疫抑制等作用發(fā)揮促癌效應(yīng)[8,10-12]。M1、M2 型巨噬細(xì)胞的動(dòng)態(tài)平衡可維持人體內(nèi)環(huán)境穩(wěn)態(tài),研究發(fā)現(xiàn),M2 型巨噬細(xì)胞是壁細(xì)胞丟失后誘導(dǎo)化生的關(guān)鍵免疫細(xì)胞,在IM中表達(dá)增多[13]。
細(xì)胞外泌體是一種具有雙層磷脂膜結(jié)構(gòu)的細(xì)胞外囊泡,攜帶分泌細(xì)胞中的生物活性物質(zhì),如蛋白質(zhì)、核酸、脂質(zhì)等,將其傳遞到靶器官,參與細(xì)胞免疫、抗原呈遞等多種生物反應(yīng)過程。腫瘤來源的循環(huán)外泌體可調(diào)節(jié)巨噬細(xì)胞的極化,誘導(dǎo)向M2 型促腫瘤巨噬細(xì)胞的極化,還可增強(qiáng)嗜中性粒細(xì)胞向癌細(xì)胞的募集來促進(jìn)腫瘤發(fā)生[14-16]。外泌體包含腫瘤細(xì)胞的遺傳特征,可作為胃癌早期診斷、預(yù)后預(yù)測及治療效果評估的生物標(biāo)志[17],但其在IM 發(fā)生、發(fā)展中的作用機(jī)制尚未見報(bào)道,值得進(jìn)一步深入研究。
3.2 胃酸分泌異常誘發(fā)胃黏膜IM病理改變 正常胃黏膜處于不斷地更新修復(fù)中,表面上皮不斷地脫落,并由胃腺頸部干細(xì)胞增生分化,向上移行分化為表面黏液細(xì)胞,向下遷移分化為其他胃底腺細(xì)胞。位于胃體的壁細(xì)胞通過乙酰膽堿、組胺和胃泌素的刺激導(dǎo)致胃酸分泌,由于壁細(xì)胞數(shù)量下降,腺體萎縮,胃酸分泌量減少,加速CAG 惡性轉(zhuǎn)化,導(dǎo)致IM 和Dys 發(fā)生,進(jìn)而誘發(fā)癌變[18-19]。除了分泌胃酸和內(nèi)因子外,壁細(xì)胞還具有誘導(dǎo)自身和胃上皮細(xì)胞分化的功能。壁細(xì)胞功能正常時(shí),胃腺頸部的干細(xì)胞分化為成熟細(xì)胞,腺體完整地再生。當(dāng)壁細(xì)胞功能缺陷時(shí),胃干細(xì)胞可能分化為成熟的腸細(xì)胞,胃腺以腸化生的形式再生。當(dāng)壁細(xì)胞功能喪失時(shí),干細(xì)胞不能成功分化為成熟細(xì)胞,未成熟細(xì)胞在胃黏膜組織中的積累,形成不同嚴(yán)重程度的異性增生和不同分化程度的癌癥[20]。胃壁細(xì)胞數(shù)量改變及泌酸功能的喪失是IM發(fā)展為胃腺癌的先決條件。
通過GO 富集和KEGG 功能分析發(fā)現(xiàn),IM 的發(fā)生涉及鈉離子跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)、鉀離子轉(zhuǎn)運(yùn)、碳酸氫鹽運(yùn)輸、膽囊收縮素信號通路,且與胃酸分泌功能密切相關(guān)。胃酸不僅可以消化食物,同時(shí)高酸性環(huán)境也可殺死攝入的微生物,抑制細(xì)菌的過度生長,構(gòu)成抵御食源性微生物的第一道防線[18,21]。胃酸由胃壁細(xì)胞分泌,由于胃液中H+的濃度為150~170 mmol/L,比血漿中的H+高出3 000 000~4 000 000倍,因此,壁細(xì)胞逆濃度梯度分泌H+依靠其頂膜上的H+-K+-ATP酶來完成。黏液-HCO3?屏障是胃黏膜保護(hù)的第一道防線,可有效保護(hù)胃黏膜免受胃腔內(nèi)胃酸和胃蛋白酶的損傷。除黏液-碳酸氫鹽,胃黏膜上皮細(xì)胞的頂膜和相鄰細(xì)胞側(cè)膜間存在緊密連接,可防止細(xì)胞內(nèi)鈉離子、鉀離子外流及氫離子內(nèi)流,成為保護(hù)胃黏膜的第二道防線。IM 過程中鈉離子、鉀離子、碳酸氫鹽運(yùn)輸?shù)壬锕δ馨l(fā)生改變,導(dǎo)致胃酸分泌減少,胃上皮細(xì)胞破壞,繼而被腸化生細(xì)胞取代。膽囊收縮素(CCK)信號通路也參與調(diào)控胃酸分泌的過程,膽囊收縮素受體(CCKR)主要包括兩大類:CCK-A和CCK-B 受體。分泌生長抑素(SST)的D 細(xì)胞上存在CCK-A 受體,CCK 通過與CCK-A 受體結(jié)合,導(dǎo)致D 細(xì)胞釋放生長抑素抑制胃的運(yùn)動(dòng)和分泌,延緩胃排空,胃竇的G 細(xì)胞分泌胃泌素作用于壁細(xì)胞上的CCK-B 受體,刺激胃酸分泌,也可通過影響腸嗜鉻樣(ECL)細(xì)胞分泌組胺間接刺激壁細(xì)胞分泌胃酸[22-24]。整體情況下,CCK 對胃酸的分泌主要表現(xiàn)為抑制作用,與IM 階段胃酸分泌減少相吻合,提示結(jié)果的可靠性。
3.3 關(guān)鍵基因可能成為IM潛在治療靶點(diǎn) 本研究分析出的關(guān)鍵基因包括MUC5AC、DEFA5、MUC17、ALPI、SST、FOXA2、MUC13、GCNT3、OLFM4,其中DEFA5、MUC17、MUC13、ALPI、GCNT3、OLFM4表達(dá)上調(diào),MUC5AC、SST、FOXA2 表達(dá)下調(diào)。黏蛋白(MUC)是胃黏膜屏障的關(guān)鍵成分,為上皮表面提供保護(hù)和潤滑作用,在正常組織中以細(xì)胞和組織特異性模式表達(dá),其改變可被視為胃黏膜惡性轉(zhuǎn)化的分子標(biāo)志,有望成為早期篩查/診斷標(biāo)志物[25]。其中,胃黏液蛋白MUCA5AC 表達(dá)于正常胃黏膜小凹上皮表面,是胃黏膜表面黏液層的主要成分[26]。研究發(fā)現(xiàn)MUC5AC 在正常胃黏膜、IM、Dys 及GC 組織中表達(dá)逐漸降低,其低表達(dá)可能是胃癌預(yù)后不良的指標(biāo)[27-28]。黏蛋白17(MUC17)主要在腸道中表達(dá),可維持腸上皮完整性,在胃癌組織和細(xì)胞中表達(dá)上調(diào),其敲低可降低胃癌細(xì)胞的遷移和侵襲能力[29-31]。MUC13 是一種跨膜黏蛋白,在正常胃黏膜中不表達(dá),而在IM 與胃癌中經(jīng)常過表達(dá),其高表達(dá)可增強(qiáng)腫瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力,與腸型胃癌相關(guān)聯(lián)[32-33]。此外,SST是由胃腸道黏膜D 細(xì)胞分泌的一種肽類激素,可抑制胃酸分泌,發(fā)揮保護(hù)胃黏膜的作用,在胃癌組織中呈低表達(dá),其高表達(dá)可抑制胃癌細(xì)胞的增殖、侵襲和遷移能力[34-35]。GCNT3 已被建議作為結(jié)直腸癌預(yù)后的生物標(biāo)志物,其過表達(dá)可降低結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖和侵襲能力[36]。防御素是上皮細(xì)胞表面產(chǎn)生的抗微生物肽,是先天宿主防御的組成部分,α-防御素(DEFA5)由小腸隱窩基部的Paneth細(xì)胞表達(dá),參與Paneth細(xì)胞的分化,是腸道固有免疫的關(guān)鍵效應(yīng)分子,對巨噬細(xì)胞和T 淋巴細(xì)胞均有趨化作用[37]。腸堿性磷酸酶(ALPI)在成熟的小腸上皮細(xì)胞中高表達(dá),IM 發(fā)生過程中胃部出現(xiàn)Paneth 細(xì)胞等腸上皮細(xì)胞,因此DEFA5、ALPI 表達(dá)上調(diào)。OLFM4 與GC 細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲有關(guān),可促進(jìn)惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展,在胃癌組織中過度表達(dá)[38]。FOXA2 在胃癌組織中下調(diào),與胃癌預(yù)后不良有關(guān),其過表達(dá)可抑制胃癌細(xì)胞增殖[39]。以上基因均在胃腸中表達(dá),與消化道癌癥相關(guān),其在IM 階段已能檢測出表達(dá)量差異,可作為早期干預(yù)治療、預(yù)防IM向胃癌進(jìn)展的靶點(diǎn)。
3.4 相關(guān)中藥可能是IM治療的潛在藥物 現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對IM尚無特效療法,而中醫(yī)藥可改善患者臨床癥狀,具有潛在的療效優(yōu)勢。中醫(yī)學(xué)中并沒有腸上皮化生的病名,現(xiàn)代醫(yī)家結(jié)合患者臨床癥狀將IM歸屬于“胃痛”“嘈雜”“痞滿”等范疇,其核心病機(jī)以胃陰不足、氣陰兩虛為主,兼見陽虛、氣虛、氣滯、陰虛、熱、濕、痰等,治以益氣健脾,養(yǎng)陰解毒為主[40-42]。本研究通過Coremine Medical 數(shù)據(jù)庫篩選治療IM 的潛在中藥,大致可分為5類:理氣藥(枳實(shí)、桔梗)、補(bǔ)益藥(黨參、甘草、沙參)、祛濕藥(藿香、蒼術(shù))、化痰藥(半夏、瓜蔞)、清熱解毒藥(野菊花、車前草)。枳實(shí)破氣消積,化痰除痞;桔梗宣肺、祛痰,宣肺氣以降胃氣;黨參補(bǔ)脾生津;沙參益胃生津,補(bǔ)氣,化痰;藿香、蒼術(shù)燥濕健脾,化濕和胃;半夏燥濕化痰、降逆止嘔、消痞散結(jié);野菊花、車前草清熱解毒,共奏理氣健脾,養(yǎng)陰解毒之效。這些中藥配伍是溫膽湯、四君子湯、半夏瀉心湯、甘草瀉心湯的組成部分,體現(xiàn)了中醫(yī)治療的組方配伍原則?,F(xiàn)代研究顯示廣藿香中的廣藿香醇、桔梗中的桔梗皂苷-D 具有抗炎、免疫調(diào)節(jié)及抗腫瘤作用,體外研究表明其可抑制胃癌細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移[43-44]。甘草中的甘草次酸可抑制胃癌細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)其凋亡[45]。黨參具有抑制胃酸分泌,促進(jìn)胃黏液分泌,增強(qiáng)黏液-碳酸氫鹽屏障,促進(jìn)胃腸上皮細(xì)胞增殖,保護(hù)和修復(fù)胃腸黏膜及免疫調(diào)節(jié)作用[46-47]。沙參具有保護(hù)胃黏膜,誘導(dǎo)胃癌細(xì)胞凋亡的作用[48-49]。蒼術(shù)可抑制胃酸分泌,促進(jìn)胃黏膜修復(fù),抗炎抗腫瘤及免疫調(diào)節(jié)[48]。半夏具有活化白細(xì)胞及抗腫瘤作用[50];車前草的醇提物及水提物均有體外抗炎作用[51];菊花中的黃酮類化合物可抑制胃癌細(xì)胞的生長并誘導(dǎo)其凋亡,發(fā)揮抗腫瘤作用[52]。上述中藥可能通過干預(yù)關(guān)鍵基因發(fā)揮治療IM的作用。
綜上所述,本研究通過功能富集分析及通路分析說明IM 的發(fā)生是一個(gè)多基因異常表達(dá)的復(fù)雜過程,主要與白細(xì)胞、單核細(xì)胞、細(xì)胞外泌體等引起的細(xì)胞炎癥反應(yīng)及胃酸分泌過程相關(guān),該結(jié)果有助于對IM發(fā)生過程中涉及機(jī)制的理解,同時(shí)從基因?qū)用嫱诰虺鯥M 中的關(guān)鍵基因,可作為IM 的潛在生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo),枳實(shí)、桔梗、黨參、甘草、沙參、藿香、蒼術(shù)、半夏、野菊花、車前草可作為IM 治療的靶向中藥,為后續(xù)的藥物研究提供思路。由于本研究只是基于已有數(shù)據(jù)集進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘,其結(jié)果及機(jī)制仍需在基礎(chǔ)與臨床研究中進(jìn)一步驗(yàn)證。