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        二代基因測序技術(shù)確診嗜肺軍團(tuán)菌肺炎1例及文獻(xiàn)回顧

        2022-07-14 05:05:20于金鵬高巍
        中外醫(yī)學(xué)研究 2022年16期
        關(guān)鍵詞:軍團(tuán)菌病原體抗原

        于金鵬 高巍

        軍團(tuán)病是一種主要生活在水中的細(xì)胞內(nèi)軍團(tuán)菌引起的疾病,主要危險因素是煙草、免疫缺陷和老年。近年來其發(fā)病率很高,甚至需要重癥監(jiān)護(hù)室住院治療,因此對其早期發(fā)現(xiàn)及診治顯得尤為重要[1]。嗜肺軍團(tuán)菌肺炎所致重癥肺炎,檢測尿抗原多數(shù)陰性,病原學(xué)培養(yǎng)和PCR檢測在診斷方面更重要。嗜肺軍團(tuán)菌肺炎死亡率升高,從普通人群的10%到重癥監(jiān)護(hù)的50%不等[2]。自1976年費(fèi)城暴發(fā)以來,軍團(tuán)菌屬已確認(rèn)的物種和血清群的數(shù)量持續(xù)增加,目前已知有60多個種類和80個血清群。軍團(tuán)菌一直被認(rèn)為是嚴(yán)重社區(qū)獲得性肺炎(CAP)或醫(yī)院獲得性肺炎的一種最常見的病原體。近年來日本軍團(tuán)菌感染病例的報告數(shù)量逐漸增加,雖然大多數(shù)病例是通過尿抗原檢測確診的,但是該檢測僅識別出嗜肺軍團(tuán)菌肺炎血清群1型。因此,如何評估引起肺炎的軍團(tuán)菌種類和血清群類型顯得尤為重要[3]。通常情況下,為診斷嗜肺軍團(tuán)菌肺炎,需進(jìn)行尿抗原檢測、呼吸道標(biāo)本培養(yǎng)、核酸檢測、血清抗體檢測等多種檢查。盡管尿抗原檢測診斷軍團(tuán)菌肺炎一直以來被認(rèn)為是一種有用的工具,但據(jù)報道尿抗原檢測診斷軍團(tuán)菌肺炎的敏感性為55%~80%。雖然從呼吸道標(biāo)本中培養(yǎng)出軍團(tuán)菌是診斷的金標(biāo)準(zhǔn),可以識別所有嗜肺軍團(tuán)菌和非嗜肺軍團(tuán)菌以外的所有軍團(tuán)菌種,但它需要特定的培養(yǎng)基,鑒定需要3~5 d,周期較長[4]。近年來,聚合酶鏈反應(yīng)等核酸檢測廣泛開展應(yīng)用,在靈敏度和速度上有明顯優(yōu)勢相對傳統(tǒng)檢測方法,經(jīng)過專門培訓(xùn)的人員和先進(jìn)的設(shè)備進(jìn)行軍團(tuán)菌臨床分離株的分子序列檢測,可以確定其來源分型,在過去十年中成為嗜肺軍團(tuán)菌DNA分子分型的金標(biāo)準(zhǔn)[5]。嗜肺軍團(tuán)菌是嚴(yán)重軍團(tuán)病肺炎的病原體,感染的結(jié)果多數(shù)取決于細(xì)菌毒力因子和宿主免疫能力。大多數(shù)軍團(tuán)菌感染被認(rèn)為是無癥狀的,或者會導(dǎo)致一種自限性的輕度呼吸道疾病,然而老年人、免疫系統(tǒng)降低和慢性肺部疾病的患者更容易進(jìn)展為重癥肺炎[6]。近年來報道血液系統(tǒng)疾病、HIV、妊娠狀態(tài)中發(fā)現(xiàn)嗜肺軍團(tuán)菌肺炎,癥狀不典型,也易于同其他病原體感染混淆[7-9]。本文回顧既往相關(guān)文獻(xiàn),及收集1例嗜肺軍團(tuán)菌肺炎的臨床資料,進(jìn)行討論分析如下。

        1 病例資料

        患者男性,65歲,因“確診急性髓系白血病7個月,5周期化療后”于2020年12月2日入院。既往有“腦梗死、高血壓、室上性早搏”病史。個人史無特殊。查體:心率78次/min,體溫36.5 ℃,呼吸頻率 20 次 /min,血壓 122/78 mmHg(1 mmHg=0.133 kPa),咽部稍充血,扁桃體無紅腫,雙肺呼吸音粗,未聞及干濕性啰音,雙下肢輕度凹陷性水腫。實驗室檢查:血常規(guī):白細(xì)胞總數(shù)4.70×109/L,C反應(yīng)蛋白正常;生化示肝腎功能未見異常;骨髓細(xì)胞學(xué)示AML-CR。入院后診斷:(1)急性髓系白血病(AML1/ETO陽性);(2)高血壓1級(高危);(3)肺動脈高壓;(4)室上性早搏;(5)陳舊性腦梗死;(6)肺結(jié)節(jié)。患者于2020年12月17日出現(xiàn)發(fā)熱,體溫最高為39.4 ℃,復(fù)查血常規(guī)示白細(xì)胞總數(shù)4.70×109/L,紅細(xì)胞總數(shù)3.06×109/L,血紅蛋白100 g/L,血小板計數(shù)23.00×109/L。C反應(yīng)蛋白 176.50 mg/L,降鈣素原 11.94 ng/L,呼吸道病原體譜抗體陰性。2020年12月18日胸部CT檢查如圖1所示。考慮患者粒缺合并重度感染,予以伏立康唑抗真菌,比阿培南聯(lián)合替考拉寧抗細(xì)菌感染,積極升白細(xì)胞、血小板支持治療。經(jīng)治療后,病程進(jìn)展很快出現(xiàn)呼吸衰竭,急性呼吸窘迫綜合征,不除外肺孢子菌肺炎,加用復(fù)方新諾明,改用替加環(huán)素聯(lián)合比阿培南,并同時繼續(xù)伏立康唑治療,積極應(yīng)用人免疫球蛋白、托珠單抗支持治療。調(diào)整治療方案后,患者癥狀仍無緩解,2020年12月22日復(fù)查胸部CT檢查如圖2所示。經(jīng)纖支鏡行支氣管肺泡灌洗,留取灌洗液進(jìn)行mNGS基因測序,檢測出嗜肺軍團(tuán)菌(Legionellamophila pneumophila)序列數(shù)為52060,結(jié)合具有粒缺病史高危因素,高級抗生素治療效果差,肺泡灌洗液微生物基因測序結(jié)果,故可診斷為軍團(tuán)菌肺炎。改用莫西沙星抗感染,不除外合并真菌,改用卡泊芬凈抗真菌支持,治療后患者體溫早期出現(xiàn)下降,隨后又再次發(fā)熱,出現(xiàn)休克,多臟器功能衰竭,病情進(jìn)展難以控制而死亡。

        圖1 2020年12月18日胸部CT

        圖2 2020年12月22日胸部CT

        2 討論

        嗜肺軍團(tuán)菌肺炎的臨床表現(xiàn)以咳嗽、發(fā)熱、胃腸道癥狀、低鈉血癥和肝功能異常為主,可伴有多系統(tǒng)損害、龐蒂亞克熱,與其他病原體引起的肺炎癥狀類似,往往難以區(qū)分[10]。嗜肺軍團(tuán)菌肺炎的確診主要依據(jù)尿抗原、痰聚合酶鏈反應(yīng)、痰液或支氣管肺泡灌洗培養(yǎng)檢[11]。該患者合并粒細(xì)胞缺乏癥,且長期應(yīng)用免疫抑制,本身的免疫防御功能低下,出現(xiàn)發(fā)熱、肺部感染為主要表現(xiàn),通過前后兩次胸部CT檢查對比,可見病情進(jìn)展非常迅速,急劇發(fā)展為呼吸衰竭,并進(jìn)行氣管插管后呼吸輔助通氣高級生命支持。然而患者自發(fā)病以來病因始終未明,早期進(jìn)行經(jīng)驗性治療效果不佳,病情加重仍難以控制,再次進(jìn)行肺泡灌洗二代基因測序技術(shù)(metagenomics next generation sequencing,mNGS)檢查發(fā)現(xiàn)嗜肺軍團(tuán)菌為致病菌,調(diào)整抗生素方案,盡管隨后患者體溫出現(xiàn)平穩(wěn)期,但因啟動針對性治療的時間延遲,最終病情難以控制而死亡。由此可見,對嗜肺軍團(tuán)菌肺炎的早期識別及治療顯得尤為重要。

        軍團(tuán)菌肺炎臨床表現(xiàn)缺乏特異性,其實驗室檢測尿抗原、血清抗體、培養(yǎng)及分子診斷更有鑒別意義[1]。美國傳染病學(xué)會(IDSA)和美國胸科學(xué)會(ATS)的成人社區(qū)獲得性肺炎(CAP)指南提出軍團(tuán)菌尿抗原檢測的敏感性和特異性較差[12]。軍團(tuán)菌血清學(xué)抗體多檢測應(yīng)用于流行病學(xué),不作為診斷試驗。軍團(tuán)菌培養(yǎng)的敏感性較低,耗時長。歐洲軍團(tuán)菌感染進(jìn)行流行病學(xué)研究期間,采用STB基因擴(kuò)增和測序,其陽性率顯著提高,逐漸推廣應(yīng)用至臨床的診斷檢測,使得mNGS迅速發(fā)展[13]。軍團(tuán)菌是引起社區(qū)和醫(yī)院獲得性肺炎的重要原因,世界各地都有散在或爆發(fā)的病例報道,發(fā)病率正在逐年上升,死亡率仍然很高,特別是合并免疫功能低下的患者[14]。軍團(tuán)菌感染的臨床分子診斷也逐漸成為首選,從而早期檢測出陽性患者進(jìn)行干預(yù)治療[15]。

        軍團(tuán)菌是一種細(xì)胞內(nèi)細(xì)菌,可在肺泡巨噬細(xì)胞和血單核細(xì)胞的吞噬體中滲透和增殖。因此,不能穿透宿主細(xì)胞膜的抗生素,如β-內(nèi)酰胺,是無效的。大環(huán)內(nèi)酯類、喹諾酮類或四環(huán)素類藥物是軍團(tuán)菌CAP有效治療所必需的。目前對軍團(tuán)菌感染的檢測方法靈敏度有限,而且耗費(fèi)很長的時間。因此,經(jīng)驗性應(yīng)用廣譜抗生素或聯(lián)合治療,導(dǎo)致抗生素的過度使用,從而導(dǎo)致抗生素耐藥性的增加[16]。因此住院時早期診斷發(fā)現(xiàn),減少廣譜抗生素的不必要使用,而依據(jù)目前國內(nèi)外指南的推薦可選用喹諾酮類和/或大環(huán)內(nèi)酯類藥物[17-18]。軍團(tuán)菌肺炎導(dǎo)致嚴(yán)重急性呼吸衰竭,可進(jìn)行體外膜氧合(ECMO)治療維持生命體征。據(jù)報道軍團(tuán)菌肺炎的發(fā)生率明顯升高,體外膜肺氧合治療也成為一種更常用、更容易獲得的治療方法??傊駷橹沟呐R床經(jīng)驗回顧表明,軍團(tuán)菌肺炎引起的嚴(yán)重急性呼吸衰竭患者接受體外膜肺氧合治療的生存率超過70%。對于符合適應(yīng)證的患者,應(yīng)考慮使用體外生命支持[19]。

        總結(jié)本文,嗜肺軍團(tuán)菌肺炎,多有吸煙病史,早期可出現(xiàn)低鈉血癥、腹瀉等癥狀,有些癥狀不典型,容易漏診。同時,嗜肺軍團(tuán)菌肺炎的治療也面臨挑戰(zhàn)。大多數(shù)針對多重耐藥菌(特別是MRSA和假單胞菌)的患者的經(jīng)驗性治療通常不包括嗜肺軍團(tuán)菌(左氧氟沙星除外),從而在一定程度上降低了患者早期接受診斷指導(dǎo)治療的機(jī)會。延遲治療的軍團(tuán)菌肺炎導(dǎo)致更嚴(yán)重的結(jié)果,其相關(guān)研究數(shù)據(jù)顯示死亡率增加1倍以上[20]。嚴(yán)重急性呼吸衰竭患者需要接受體外膜肺氧合治療。結(jié)合該病例早期癥狀不典型,住院期間多重耐藥菌針對性藥物治療未能覆蓋,隨著灌洗液二代基因測序確診嗜肺軍團(tuán)菌,針對性干預(yù)治療后癥狀有所好轉(zhuǎn),然而病情未能控制。因此,對肺部感染疾病的診治中,善于發(fā)現(xiàn)可疑臨床癥狀,盡早進(jìn)行肺部灌洗液二代基因測序檢查,更有利于發(fā)現(xiàn)病原體,及時針對性治療,縮短住院時間,降低病死率。

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