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        精液質(zhì)量分析系統(tǒng)的應(yīng)用技巧

        2022-07-06 08:37:02朱寬峰北京田園奧瑞生物科技有限公司
        中國畜牧業(yè) 2022年11期
        關(guān)鍵詞:活率玻片顯微鏡

        文│朱寬峰(北京田園奧瑞生物科技有限公司)

        計(jì)算機(jī)輔助精液質(zhì)量分析系統(tǒng)(computer assisted semen analysis system,CASAS)是使用計(jì)算機(jī)技術(shù)進(jìn)行精液質(zhì)量分析的儀器,正確使用可以有效降低人工檢測(cè)的誤差大、主觀性強(qiáng)的缺點(diǎn)。但很多技術(shù)員甚至科研人員對(duì)CASAS不太了解,存在一些誤解,筆者根據(jù)對(duì)CASAS研發(fā)與使用的經(jīng)驗(yàn)對(duì)CASAS做一個(gè)介紹,期望能讓大家對(duì)此有更多的認(rèn)識(shí)。

        一、CASAS的原理

        1.CASAS系統(tǒng)組成。包括硬件和軟件兩部分,其中硬件主要包括顯微鏡、高清高速攝像頭、計(jì)算機(jī)等部分,軟件包括相機(jī)驅(qū)動(dòng)軟件、精液質(zhì)量分析軟件等。

        2.原理。顯微鏡成的像被高清攝像頭采集,經(jīng)過計(jì)算機(jī)處理后識(shí)別出精子,并構(gòu)建精子軌跡,進(jìn)而計(jì)算出精子各項(xiàng)運(yùn)動(dòng)參數(shù),并輸出各項(xiàng)監(jiān)測(cè)指標(biāo)。

        (1)精子識(shí)別。精液樣品,更為通常雜質(zhì)比較少,最簡(jiǎn)單的識(shí)別方法就是將圖像中一定大小范圍的亮斑或者暗斑識(shí)別出來即可,更為精確的還需要計(jì)算斑塊的長(zhǎng)度寬度等信息。有一些智能算法則是基于訓(xùn)練模型,先通過人工訓(xùn)練,積累數(shù)據(jù),優(yōu)化模型從而對(duì)實(shí)際樣本進(jìn)行檢測(cè)。

        (2)構(gòu)建軌跡。相機(jī)獲取的是一系列有時(shí)間順序的靜態(tài)圖像,通過一定的算法將這些圖像中的精子進(jìn)行一一匹配,從而構(gòu)建出所有精子的運(yùn)動(dòng)軌跡。

        (3)運(yùn)動(dòng)參數(shù)定義。最基礎(chǔ)的運(yùn)動(dòng)參數(shù)定義見表1,對(duì)應(yīng)的示意圖見下圖。根據(jù)這些參數(shù)的定義可以計(jì)算出各種運(yùn)動(dòng)參數(shù),并為活力、活率等指標(biāo)的計(jì)算做基礎(chǔ)。

        表1 精子運(yùn)動(dòng)參數(shù)表

        (4)主要指標(biāo)的定義。主要的指標(biāo)包括密度、活力、活率,以及其他一些輔助的指標(biāo)。

        活力是指前向精子占總精子的百分比,活力=視野中前向精子數(shù)/視野總精子數(shù)×100%。

        活率是指活動(dòng)精子占總精子的百分比,活率=視野中活動(dòng)精子數(shù)/視野總精子數(shù)×100%。

        密度是指單位體積的精子數(shù),密度=視野精子數(shù)/視野體積=視野精子數(shù)/(視野長(zhǎng)度×視野寬度×腔室厚度)。

        一般檢測(cè)時(shí)多個(gè)視野的平均值或者匯總數(shù)據(jù),因此還需要對(duì)上述數(shù)據(jù)求平均值。

        二、引起檢測(cè)誤差的因素

        1.成像質(zhì)量。所有的分析基礎(chǔ)都建立在成像的基礎(chǔ)上,成像不清晰的話會(huì)導(dǎo)致子識(shí)別困難。從樣品到軟件識(shí)別的圖像,需要經(jīng)過顯微鏡物鏡成像、攝像頭采集、圖像處理等多個(gè)步驟,每一個(gè)步驟有問題都會(huì)影響圖像質(zhì)量。

        (1)顯微鏡。對(duì)于顯微鏡成像來說,光源的穩(wěn)定性和均勻性、鏡片有無上有無灰塵、鏡頭是否污染、蓋玻片厚度是否與鏡頭匹配都會(huì)影響成像質(zhì)量。不同類型的顯微鏡成像清晰度也不一樣,是否正確使用也是關(guān)鍵。對(duì)于普通生物顯微鏡來說,可變光闌是否調(diào)到合適位置其成像質(zhì)量也會(huì)有很大差異。對(duì)于相差顯微鏡來說,聚光鏡是否調(diào)到位、相差環(huán)是否對(duì)中、相差片與物鏡是否對(duì)應(yīng)都能影響顯微鏡的成像質(zhì)量。

        (2)玻片。對(duì)于玻片來說,玻片潔凈度是嚴(yán)重影響成像質(zhì)量的一個(gè)因素,臟的玻片會(huì)使精子和臟物之間難以區(qū)分。蓋玻片厚度會(huì)影響光程,因而影響成像,一般物鏡上都會(huì)有標(biāo)注,通常是0.7毫米厚的蓋玻片最適宜。

        玻片腔室厚度過大會(huì)導(dǎo)致視野有多層精子,精子運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)為明顯的三維運(yùn)動(dòng),當(dāng)精子不處于焦平面時(shí)成像不清晰,從而影響精子識(shí)別。而當(dāng)精子在不同層之間來回穿梭時(shí)會(huì)導(dǎo)致精子跟蹤失敗。

        (3)攝像頭與相機(jī)驅(qū)動(dòng)。對(duì)于攝像頭來說,分辨率和信噪比是十分重要的參數(shù)。分辨率越高,信噪比越高,則成像越清晰,越有利于精子識(shí)別。但過高分辨率會(huì)導(dǎo)致圖像數(shù)據(jù)量過大,增大計(jì)算機(jī)處理工作量,降低分析速率,一般來說,在物鏡放大基礎(chǔ)上,相機(jī)的分辨率應(yīng)該達(dá)到1微米/像素以內(nèi),否則看不見精子尾部。曝光時(shí)間也會(huì)影響成像質(zhì)量,曝光時(shí)間太短,則獲得的信息不足,圖像模糊;曝光時(shí)間過長(zhǎng),由于精子是運(yùn)動(dòng)的,會(huì)導(dǎo)致精子重影,也會(huì)使圖像模糊。

        一般來說,應(yīng)該使顯微鏡光照盡量強(qiáng)一些,以盡量縮短曝光時(shí)間。

        通過對(duì)相機(jī)參數(shù)進(jìn)行合理調(diào)整和設(shè)置,或者專門對(duì)采集到的數(shù)據(jù)進(jìn)行增強(qiáng)和降噪,都能夠提升圖像質(zhì)量。

        2.震動(dòng)。由于精子本身尺寸只有幾微米,實(shí)驗(yàn)臺(tái)幾微米的震動(dòng)都會(huì)明顯影響精子的運(yùn)動(dòng)軌跡,導(dǎo)致本來靜止的精子表現(xiàn)出活動(dòng)跡象,而活動(dòng)精子VCL也會(huì)略微增大。因此放置顯微鏡的操作臺(tái)應(yīng)該平穩(wěn)防震。

        3.溫度。一定范圍內(nèi),溫度越高精子活躍度越高。但是由于載物臺(tái)中間要留出光通道,中間有空槽,恒溫載物臺(tái)在這個(gè)位置溫度也會(huì)比其他位置低。載玻片越薄,經(jīng)載玻片傳導(dǎo)的熱量越少,中間的溫度也就越低。因此應(yīng)該保證載物臺(tái)中央溫度達(dá)到規(guī)定的37℃~38℃。

        4.精子面密度。面密度是指單位面積的精子數(shù),影響面密度的因素包括精子密度和腔室厚度。密度越大、腔室厚度越大,則精子面密度越大,精子之間的距離也就越小。精子間距越小,則精子碰撞的概率越大,死精子越有可能被當(dāng)成活精子,精子軌跡跟蹤失誤的概率也越大。同時(shí)精子間距越小,當(dāng)精子間距小于精子在兩幀時(shí)間間隔內(nèi)的運(yùn)動(dòng)距離時(shí),精子就很可能匹配錯(cuò)誤。

        5.幀率。幀率是攝像頭指每秒鐘獲取的圖像數(shù)量。幀率受限于曝光時(shí)間和攝像頭的性能。在攝像頭允許范圍內(nèi),最大幀率=1秒/曝光時(shí)間。幀率越高,則相鄰兩幀中精子移動(dòng)的距離就越小,越不容易將兩個(gè)相鄰的精子錯(cuò)配。

        6.分析時(shí)長(zhǎng)。精子運(yùn)動(dòng)軌跡是彎彎曲曲的,沒有完全呈直線運(yùn)動(dòng)的。分析時(shí)間越長(zhǎng),則精子軌跡呈現(xiàn)的越全面,時(shí)間越短越不容易反映精子的實(shí)際軌跡。對(duì)于圓弧形運(yùn)動(dòng)或者轉(zhuǎn)圈的精子來說尤其明顯。當(dāng)時(shí)間很短時(shí),精子近似呈直線運(yùn)動(dòng),隨著時(shí)間延長(zhǎng),圓弧越來越明顯,直線性越來越低,直到最后呈圓圈狀。不同的軌跡計(jì)算出來的參數(shù)不同,也就影響到活力和活率的判定。

        分析時(shí)長(zhǎng)并不是越長(zhǎng)越好,分析時(shí)間越長(zhǎng),精子軌跡交叉的概率越大,出錯(cuò)的概率也越大。并且分析時(shí)間越長(zhǎng)意味著需要分析的幀數(shù)就越多,數(shù)據(jù)處理量越大,分析速率就越慢。

        7.算法。各種參數(shù)和指標(biāo)的定義,需要明確為計(jì)算公式和判定邏輯才能使計(jì)算機(jī)能夠執(zhí)行,但是具體參數(shù)和指標(biāo)的定義公式、精子識(shí)別算法、跟蹤算法等多個(gè)方面的內(nèi)容細(xì)節(jié)都會(huì)有多種選擇,并影響到結(jié)果。

        (1)參數(shù)定義公式。VCL、VSL和MAD定義比較明確,計(jì)算方法基本一致,LIN=VSL/VCL,定義也因此是明確的,但這些指標(biāo)受幀率和分析時(shí)長(zhǎng)影響。

        但VAP是指平均路徑速率,具體采用哪種平均值或者擬合公式來代表平均路徑各個(gè)廠家都不一樣,并沒有統(tǒng)一的計(jì)算公式。ALH、BCF、STR、WOB等參數(shù)都是在平均路徑的基礎(chǔ)上計(jì)算的,由于平均路徑的計(jì)算方法沒有統(tǒng)一的公式,這些參數(shù)也就沒有統(tǒng)一的計(jì)算公式。并且VAP、ALH、BCF、STR、WOB也受幀率和分析時(shí)長(zhǎng)的影響。

        (2)指標(biāo)定義。對(duì)于目測(cè)方法來說,前向精子是綜合多個(gè)信息來判定的,不僅僅是精子呈前向運(yùn)動(dòng),還有是不是主動(dòng)運(yùn)動(dòng)而不是飄動(dòng)的。但是怎樣的精子算前向的,每個(gè)人都有自己的判定標(biāo)準(zhǔn),并且是個(gè)模糊的標(biāo)準(zhǔn)。對(duì)于計(jì)算機(jī)就必須是明確的。

        對(duì)于活力,可以從運(yùn)動(dòng)軌跡的曲率、線性、前向性、平均移動(dòng)角度等一個(gè)或者多個(gè)方面進(jìn)行判定。但是具體選擇哪一個(gè)作為依據(jù)并沒有標(biāo)準(zhǔn)。理論上這些指標(biāo)都是可行的,并且都是相關(guān)的。

        對(duì)于活率,精子運(yùn)動(dòng)到什么程度算活動(dòng)的,以VCL、VSL還是VAP作為依據(jù)也是沒有標(biāo)準(zhǔn)的,理論上這些指標(biāo)都是可行的,并且也是相關(guān)的。

        對(duì)于視野邊緣的精子,肯定是有精子游入,也有精子游出,這些精子會(huì)改變視野中的精子數(shù)量,并且都是運(yùn)動(dòng)精子,對(duì)活力和活率有一定影響,因此是否考慮這些邊緣位置的精子就會(huì)導(dǎo)致一定的誤差。

        對(duì)于密度,視野長(zhǎng)度和寬度一般誤差很小,但是腔室厚度誤差比較大。對(duì)于標(biāo)稱10微米厚的玻片來說,如果加工誤差1微米,則檢測(cè)的密度將會(huì)因此產(chǎn)生10%的誤差。對(duì)于標(biāo)稱20微米厚的玻片來說,如果加工誤差1微米,則檢測(cè)的密度也會(huì)因此產(chǎn)生5%的誤差。

        (3)精子識(shí)別。視野邊緣的精子由于顯示不全,會(huì)導(dǎo)致精子識(shí)別失誤。這個(gè)概率為邊緣區(qū)占總視野的面積比例,與精子大小以及視野總面積有關(guān)。精子越小,視野越大,則邊緣精子識(shí)別誤差越小。

        雜質(zhì)越多、圖像質(zhì)量越差,則識(shí)別出錯(cuò)的概率越大,識(shí)別誤差也就越大。

        (4)精子跟蹤。最簡(jiǎn)單的跟蹤方法是最小鄰域算法,也就是將后一幀圖像中與上一幀距離最近的精子認(rèn)為是同一個(gè)精子,這樣就可以將全部圖像中的精子軌跡建立起來。很顯然,這種算法沒有考慮精子運(yùn)動(dòng)方向和路徑交叉的情況。

        由于精子運(yùn)動(dòng)不規(guī)則,構(gòu)建精子實(shí)際路徑,需要預(yù)測(cè)精子的運(yùn)動(dòng)方向,對(duì)精子運(yùn)動(dòng)方向有一定限制。在精子軌跡交叉時(shí),精子圖像重疊,此時(shí)還需要對(duì)重疊圖像進(jìn)行分割,否則會(huì)導(dǎo)致精子數(shù)量偏低以及軌跡斷掉。

        幀率越低,精子在幀與幀之間運(yùn)動(dòng)的距離就長(zhǎng),越容易被當(dāng)成2個(gè)精子。分析時(shí)長(zhǎng)越長(zhǎng),軌跡交叉的概率越大。因此幀率越低,分析時(shí)長(zhǎng)越長(zhǎng),跟蹤的誤差就越大。

        即使沒有跟蹤失誤,要構(gòu)建完整的軌跡最少需要幾十幀的圖像,在這段時(shí)間內(nèi)肯定有精子游出和游入視野,而這兩部分的精子都不會(huì)有完整的軌跡。如果采納不完整軌跡的結(jié)果,則會(huì)有計(jì)算誤差。如果不采納不完整軌跡,則運(yùn)動(dòng)精子尤其是快速運(yùn)動(dòng)精子的比例將會(huì)降低。視野越小,精子運(yùn)動(dòng)越快,分析時(shí)長(zhǎng)越長(zhǎng),這個(gè)影響就會(huì)越大。

        ◎圖 運(yùn)動(dòng)參數(shù)定義示意圖

        三、正確使用CASAS

        不同廠家的CASAS,由于具體參數(shù)各不相同,不具備嚴(yán)格意義上的可比性。同一廠家的CASAS,由于參數(shù)設(shè)置不同得出的結(jié)論也不具備嚴(yán)格意義上的可比性。對(duì)于這些結(jié)果,由于都是對(duì)活力、活率進(jìn)行檢測(cè),但是方法不同,可以認(rèn)為它們是有相關(guān)性的不同指標(biāo),都能反映出精子的運(yùn)動(dòng)狀態(tài)。

        要正確使用CASAS,則應(yīng)該熟悉CASAS的結(jié)構(gòu)和原理,并掌握顯微鏡的調(diào)試使用方法、軟件各項(xiàng)參數(shù)調(diào)好后盡量不動(dòng),起碼不修改對(duì)結(jié)果有重要影響的幀率、分析時(shí)長(zhǎng)、判定參數(shù)及其閾值。即便要修改,也應(yīng)該在一個(gè)實(shí)驗(yàn)全部結(jié)束以后。

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