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        血清LncRNAs對肺癌骨轉(zhuǎn)移的診斷價值

        2022-07-01 04:49:58張鵬高敏馮斐斐李夢圓劉金燕黃玲玲
        腫瘤防治研究 2022年6期
        關(guān)鍵詞:敏感度預(yù)測值陰性

        張鵬,高敏,馮斐斐,李夢圓,劉金燕,黃玲玲

        0 引言

        長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,LncRNA)是廣泛存在于哺乳動物細胞中的一類轉(zhuǎn)錄本長度超過200 nt的非編碼RNA分子[1]。近年來研究發(fā)現(xiàn)LncRNAs參與調(diào)控細胞的多個階段,影響著癌癥的發(fā)生發(fā)展[2],包括腫瘤轉(zhuǎn)移[3]。此外越來越多研究探討血清LncRNAs作為腫瘤生物標志物的價值[4-5],但其在肺癌骨轉(zhuǎn)移(lung cancer with bone metastasis,LCWBM)診斷中的作用仍未見報道。

        本研究通過文獻查閱,篩選出與腫瘤轉(zhuǎn)移密切相關(guān)的4種LncRNAs。HOTAIR是Homebox C基因位點表達產(chǎn)物,以反式沉默的方式發(fā)揮作用。研究顯示HOTAIR與人類同源盒基因和癌轉(zhuǎn)移相關(guān),參與多種癌癥進展,可作為預(yù)后不良的標志物[6]。HOTTIP是HOXA基因遠端轉(zhuǎn)錄生成的一類LncRNA,已有文獻顯示HOTTIP可促進常見消化系統(tǒng)惡性腫瘤細胞的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移,抑制癌細胞的凋亡,其高表達與患者的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和總體生存時間密切相關(guān)[7]。CRNDE是結(jié)直腸癌差異表達的LncRNA,在許多癌組織和癌細胞中表達出現(xiàn)異常,與疾病分期、遠處轉(zhuǎn)移、病理類型及生存狀態(tài)明顯相關(guān)[8]。AFAP1-AS1是新發(fā)現(xiàn)的一種LncRNA,近年研究發(fā)現(xiàn)AFAP1-AS1與惡性腫瘤的增殖、轉(zhuǎn)移關(guān)系密切[9]。本研究檢測HOTAIR、HOTTIP、CRNDE、AFAP1-AS1這4種血清LncRNAs在LCWBM和未發(fā)生骨轉(zhuǎn)移肺癌(lung cancer without bone metastasis,LCWOBM)患者中的表達水平,并分析其對LCWBM的診斷價值。

        1 資料與方法

        1.1 研究對象

        選取2016年1月—2018年8月河南省腫瘤醫(yī)院LCWBM和LCWOBM患者各38例。肺癌患者發(fā)生骨轉(zhuǎn)移均經(jīng)核素骨掃描或PET掃描確診。LCWOBM肺癌未發(fā)生骨轉(zhuǎn)移患者為原發(fā)肺癌患者,未發(fā)生其他任何轉(zhuǎn)移。所有患者都為未經(jīng)化療、放療或免疫治療的新發(fā)病例。兩組研究對象均排除肝功能(包括谷丙轉(zhuǎn)氨酶和谷草轉(zhuǎn)氨酶)異常和腎功能不全(腎小球濾過率≤60 ml/min)的患者,排除妊娠、腦血管疾病等合并癥的患者。該研究經(jīng)鄭州大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院倫理委員會批準,所有患者均知情同意。

        LCWBM組平均年齡為63.92±8.70歲,LCWOBM組平均年齡為57.06±11.44歲,兩組患者年齡差異無統(tǒng)計學(xué)意義(t=-1.79,P=0.08)。LCWBM患者中男14例、女24例,肺鱗癌15例,肺腺癌23例。LCWOBM患者中男性21例、女性17例,肺鱗癌13例,肺腺癌25例,兩組患者性別差異無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=2.56,P=0.11)。兩組肺癌的病理類型比較,差異亦無統(tǒng)計學(xué)意義(χ2=0.23,P=0.63)。

        1.2 血液采集與血清制備

        采用EDTA抗凝真空采血管采集LCWBM和LCWOBM患者晨起空腹靜脈血5 ml,全血離體6 h內(nèi)進行血清分離。將采血管3000 r/min離心10 min,收集上清液;之后將上清液12000 r/min再次離心10 min,收集血清,放于-80℃凍存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3 試劑和設(shè)備

        TRIzol試劑盒購自美國Invitrogen公司,反轉(zhuǎn)錄試劑盒PrimeScript? RT reagent Kit with gDNA Eraser(Perfect Real Time)和熒光定量試劑盒TB Green?Premix Ex Taq?(Tli RNaseH Plus)均來自日本Takara公司。PCR儀器使用Illumina公司的PCRmax Eco 48實時熒光定量PCR儀。由尚亞公司合成的GAPDH為內(nèi)參,LncRNA HOTAIR、HOTTIP、CRNDE和AFAP1-AS1的引物由銳博生物公司設(shè)計合成,見表1。

        表1 qRT-PCR引物序列Table 1 Primers sequences for qRT-PCR

        1.4 RNA提取、反轉(zhuǎn)錄和qRT-PCR實驗

        采用TRIzol試劑從血清樣本中提取總RNA,Thermo Scientific NanoDrop 2000超微量分光光度計檢測RNA濃度和純度。將RNA濃度調(diào)整至200~300 ng/μl。采用反轉(zhuǎn)錄試劑盒PrimeScript?RT reagent Kit with gDNA Eraser將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA,采用熒光定量PCR試劑盒TB Green?Premix Ex Taq?檢測LncRNA HOTAIR、HOTTIP、CRNDE、AFAP1-AS1的表達水平。在冰上配制25 μl反應(yīng)體系:cDNA 2 μl,上、下游引物各1.0 μl,SYBR Premix Ex TaqⅡ 12.5 μl,dH2O 8.5 μl。實時定量PCR反應(yīng)條件:首先95℃ 30 s預(yù)變性,其次95℃ 5 s,60℃ 30 s,共40個循環(huán),最后繪制熔化曲線。采用2-??Ct法計算LncRNA在肺癌骨轉(zhuǎn)移患者血清中表達量相對于未發(fā)生骨轉(zhuǎn)移肺癌患者血清中表達量的倍數(shù)。

        1.5 統(tǒng)計學(xué)方法

        采用SPSS21.0統(tǒng)計軟件進行數(shù)據(jù)分析,計數(shù)資料比較采用卡方檢驗,不符合正態(tài)分布的計量資料采用中位數(shù)(M)和四分位數(shù)間距(P25,P75)表示,非正態(tài)分布的計量資料兩組間比較采用Mann-Whitney U秩和檢驗。采用MedCalc醫(yī)學(xué)統(tǒng)計軟件15.2繪制受試者工作特征曲線(receiver operating characteristics curve,ROC),計算曲線下面積(area under curve,AUC),得出敏感度、特異性、陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值。敏感度(試驗正確檢出陽性患者的率)=真陽性人數(shù)/(真陽性人數(shù)+假陰性人數(shù))×100%。特異性(試驗正確檢出陰性患者的率)=真陰性人數(shù)/(真陰性人數(shù)+假陽性人數(shù))×100%。陽性預(yù)測值(試驗檢出真陽性數(shù)在試驗方法檢出總陽性數(shù)中的比例)=真陽性例數(shù)/(真陽性例數(shù)+假陽性例數(shù))×100%;陰性預(yù)測值(試驗檢出真陰性數(shù)在試驗方法檢出總陰性數(shù)中的比例)=真陰性例數(shù)/(真陰性例數(shù)+假陰性例數(shù))×100%。采用二分類Logistic回歸分析兩個血清LncRNA診斷肺癌骨轉(zhuǎn)移的效果。檢驗水準為雙側(cè)α=0.05。

        2 結(jié)果

        2.1 LCWBM和LCWOBM患者血清中4種LncRNA的表達水平比較

        LCWBM患者血清中HOTAIR的表達水平明顯低于LCWOBM患者(P<0.05),LCWBM患者血清中HOTTIP的表達水平明顯高于LCWOBM患者(P<0.05),血清CRNDE、AFAP1-AS1表達水平在LCWBM組和LCWOBM組之間差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表2。

        表2 LCWBM和LCWOBM患者血清中四種LncRNA的表達水平比較Table 2 Comparison of four serum LncRNA levels between LCWBM group and LCWOBM group

        2.2 年齡、性別、病理類型和血清4種LncRNA表達量的關(guān)系

        根據(jù)LCWBM患者年齡中位數(shù)(58歲)將兩組患者分為兩個部分。年齡分層后,LCWBM組<58歲的低年齡層患者血清HOTTIP表達水平顯著高于LCWOBM組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),其余3種血清LncRNAs在兩組患者不同年齡層的表達量比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表3。

        表3 LCWBM和LCWOBM組年齡與血清中4種lncRNA表達量的關(guān)系Table 3 Association between age and four serum lncRNA levels in LCWBM and LCWOBM groups

        性別和病理類型分層結(jié)果顯示:性別分層后,LCWBM組女性患者血清HOTAIR表達量明顯低于LCWOBM組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);LCWBM組肺腺癌患者血清HOTTIP表達水平明顯高于LCWOBM組肺腺癌患者,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。其余3種血清LncRNAs在兩組患者不同性別、不同病理類型分層的表達量比較,差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表4~5。

        表4 LCWBM和LCWOBM組性別與血清中4種LncRNA表達量的關(guān)系Table 4 Association between gender and four serum LncRNA levels in LCWBM and LCWOBM groups

        表5 LCWBM和LCWOBM組病理類型與血清中4種LncRNA表達量的關(guān)系Table 5 Association between pathological types and four serum LncRNA levels in LCWBM and LCWOBM groups

        2.3 ROC曲線分析

        采用ROC曲線評估四種血清LncRNAs對LCWBM的診斷價值,結(jié)果顯示:血清HOTAIR診斷LCWBM的ROC曲線下面積(AUC)為0.722(95%CI:0.562~0.849);敏感度和特異性分別為70.0%和81.3%,陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值為53.8%和89.7%。血清HOTTIP診斷LCWBM的ROC曲線下面積為0.784(95%CI:0.538~0.936);敏感度和特異性分別為100.0%和45.5%,陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值為57.1%和100.0%。血清CRNDE和AFAP1-AS1的ROC曲線下面積分別為0.630和0.558。血清HOTAIR和HOTTIP對LCWBM的診斷效力較好(P=0.027,P=0.008),血清CRNDE和AFAP1-AS1對LCWBM診斷效力較差(P=0.345,P=0.658)。

        由于血清HOTAIR和HOTTIP表達水平在兩組間差異有統(tǒng)計學(xué)意義,將血清HOTAIR和HOTTIP聯(lián)合,分析其聯(lián)合診斷LCWBM的效果,結(jié)果顯示ROC曲線下面積為0.818(95%CI:0.577~0.955)(P=0.002);敏感度和特異性為87.5%和72.7%,陽性預(yù)測值和陰性預(yù)測值為70.0%和88.9%,見圖1。

        3 討論

        HOTAIR能夠調(diào)控其靶基因參與多種腫瘤的發(fā)生和轉(zhuǎn)移。研究報道非小細胞肺癌患者血清中HOTAIR水平明顯高于健康對照者[10];食管鱗癌患者血清中HOTAIR的表達水平亦明顯高于健康對照者,采用血清HOTAIR診斷食管鱗癌的ROC曲線下面積為0.793,提示其可能可以作為診斷食管鱗癌的潛在生物標志物[11]。本研究結(jié)果顯示LCWBM患者血清HOTAIR表達水平明顯低于LCWOBM患者,性別分層后發(fā)現(xiàn),女性LCWBM組患者血清HOTAIR表達量明顯低于LCWOBM組女性患者,分析其原因,可能是兩組研究對象均為肺癌患者,只是發(fā)生骨轉(zhuǎn)移的情況不同,而之前報道的研究對象是癌癥患者和健康人群;此外LCWBM患者血液中免疫細胞可能因腫瘤細胞的攻擊而受到抑制,導(dǎo)致其分泌入血的HOTAIR減少,且在女性患者中更為明顯。本研究血清HOTAIR診斷LCWBM的ROC曲線下面積(AUC)為0.722,敏感度和特異性分別為70.0%和81.3%,曲線下面積大于0.7,敏感度和特異性均較高,提示其診斷效力較好。

        HOTTIP可以通過廣泛的結(jié)構(gòu)域激活組蛋白H3賴氨酸27三甲基化(H3K4me3)轉(zhuǎn)錄,提示HOTTIP在協(xié)調(diào)和激活HOXA簇基因中發(fā)揮著重要作用。HOTTIP通過結(jié)合WD-repeat-containing protein 5(WDR5),增加β-catenin基因表達水平,增強成骨分化,最終激活下游Wnt/catenin信號通路,因此HOTTIP可以促進骨肉瘤細胞的生長和上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化[12]。HOTTIP在大多數(shù)癌癥中過表達[13],HOTTIP可能通過靶向調(diào)控miR-516b-5p/SPIN1參與食管癌凋亡、轉(zhuǎn)移和免疫逃逸[14]。胃癌患者血清外泌體HOTTIP表達明顯升高,且與順鉑化療耐藥有關(guān)[15]。本研究中,LCWBM組患者血清HOTTIP表達顯著上調(diào),特別是在LCWBM組<58歲的低年齡層和肺腺癌患者中,血清HOTTIP表達量均明顯高于LCWOBM組相應(yīng)亞型組,說明在<58歲且肺癌病理類型為肺腺癌的患者中判斷其是否可能發(fā)生骨轉(zhuǎn)移,應(yīng)重點考慮該指標。血清HOTTIP診斷LCWBM的ROC曲線下面積(AUC)為0.784,敏感度和特異性分別為100.0%和45.5%。結(jié)果表明血清HOTTIP對肺癌骨轉(zhuǎn)移有較好的診斷潛力,但特異性較低,即血清HOTTIP把實際沒有發(fā)生骨轉(zhuǎn)移的肺癌患者正確判斷為未發(fā)生骨轉(zhuǎn)移的能力較低,最終可能導(dǎo)致假陽性增多。然而將血清HOTAIR與HOTTIP兩指標聯(lián)合,其聯(lián)合診斷肺癌骨轉(zhuǎn)移的ROC曲線下面積為0.818,敏感度和特異性分別為87.5%和72.7%,顯示兩指標聯(lián)合診斷效果要明顯優(yōu)于單一指標的診斷效果,即聯(lián)合血清HOTAIR與HOTTIP有助于提高診斷LCWBM的效力。

        血清外泌體CRNDE水平在胰腺導(dǎo)管內(nèi)黏液腺瘤(IPMN)患者和惡性程度較高的胰腺導(dǎo)管腺癌(PDAC)患者中顯著高于健康對照,且其在PDAC患者血清中表達水平高于IPMN患者,提示血清CRNDE表達水平與胰腺癌惡性程度有關(guān)[15]。AFAP1-AS1可通過介導(dǎo)miR-423-5p調(diào)節(jié)Rho/Rac信號通路,促進鼻咽癌細胞的遷移和侵襲;裸鼠轉(zhuǎn)染AFAP1-AS1后鼻咽癌細胞的肺轉(zhuǎn)移率明顯高于對照組[16]。本研究中,血清CRNDE和AFAP1-AS1表達水平在兩組中差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),且對LCWBM診斷效力較低(0.50.05),尚不能作為診斷LCWBM的生物標志物。

        本研究探討了血清LncRNA HOTAIR、HOTTIP、CRNDE、AFAP1-AS1對LCWBM的診斷價值。血清檢測因其無創(chuàng)、方便、可重復(fù)性等特點,更適合作為生物標志物[17]。本研究也存在一些局限:首先,樣本數(shù)量較少;其次,除了年齡、性別和病理類型,未收集患者的其他基本信息,無法深層次探討肺癌骨轉(zhuǎn)移患者臨床特征與血清LncRNAs表達的關(guān)系。今后,將擴大樣本量,進一步驗證血清LncRNA HOTAIR、HOTTIP在肺癌骨轉(zhuǎn)移診斷中的價值,并探索其生物學(xué)效應(yīng),揭示其內(nèi)在的分子機制。

        綜上所述,血清HOTAIR和HOTTIP對肺癌骨轉(zhuǎn)移有一定的診斷價值,兩者聯(lián)合診斷效果優(yōu)于單一指標,可能成為診斷肺癌骨轉(zhuǎn)移的新的生物標志物,為肺癌骨轉(zhuǎn)移臨床診斷提供新的思路。

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