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        染色體微陣列分析在產(chǎn)前診斷中的應(yīng)用價值

        2022-05-25 07:05:38張慶娥董晶晶周月云鄭建麗
        中國婦幼健康研究 2022年5期
        關(guān)鍵詞:核型三體致病性

        李 敏,張慶娥,董晶晶,周月云,鄭建麗

        (鹽城市婦幼保健院產(chǎn)前診斷中心,江蘇 鹽城 224001)

        先天性遺傳缺陷是導(dǎo)致死胎、畸形、發(fā)育不良等不良妊娠結(jié)局的重要因素,其不僅降低新生兒出生質(zhì)量,還對社會和家庭造成極大的負擔,因此產(chǎn)前及早發(fā)現(xiàn)并采取干預(yù)措施有利于提高人口素質(zhì)[1]。隨著我國產(chǎn)前超聲診斷技術(shù)、無創(chuàng)DNA產(chǎn)前檢測(non-invasive prenatal testing,NIPT)、唐氏血清學篩查等方法的普及,胎兒疾病高風險的檢出率得到提升,但其準確性較低,易產(chǎn)生假陽性結(jié)果,因此對于高風險孕婦宜采用介入性產(chǎn)前檢查輔助診斷[2]。染色體核型能通過分析染色體形態(tài)特征,判斷胎兒是否存在染色體數(shù)目、結(jié)構(gòu)異常,常作為金標準;然而其分辨率較低,只能分辨較大的染色體缺失、重復(fù),無法獲取微小的變異片段,可能導(dǎo)致致病性變異漏診[3]。而染色體微陣列分析(chromosomal microarray analysis,CMA)則是對全基因組水平檢測,可發(fā)現(xiàn)染色體亞結(jié)構(gòu)異常,已被臨床廣泛應(yīng)用,但CMA是否能代替染色體核型分析尚存爭議[4]。本研究分析了行染色體核型分析及CMA介入性產(chǎn)前檢查孕婦的診斷結(jié)果,探討CMA運用于產(chǎn)前診斷的臨床價值?,F(xiàn)報道如下。

        1 資料與方法

        1.1 一般資料

        選取2018年1月至2021年1月在鹽城市婦幼保健院接受介入性產(chǎn)前檢查染色體核型分析及CMA的孕婦808例為研究對象,其中不良孕產(chǎn)史148例、NIPT篩查異常148例、超聲檢查異常(結(jié)構(gòu)異常、軟指標異常)167例、高齡孕婦132例、血清學篩查異常84例、父母染色體異?;蚱渌?29例。本研究通過倫理審查。納入標準:①病歷資料完整;②所有孕婦均自愿接受介入性產(chǎn)前診斷;③簽署知情同意書。排除標準:①羊水樣本不合格;②母血污染;③多胎妊娠;④輔助生殖受孕。

        1.2 方法

        1.2.1 胎兒羊水標本的采集

        對妊娠16~24周孕婦采用超聲引導(dǎo)下經(jīng)腹羊膜腔穿刺術(shù),抽取胎兒羊水30mL;均在無菌條件下進行所有操作。

        1.2.2 染色體核型分析

        取胎兒羊水標本20mL,行羊水細胞培養(yǎng)、收獲、固定、制片、G顯帶、掃描、拍照,參照人類細胞遺傳學國際命名體制[5]對染色體進行分析和判讀。

        1.2.3 CMA的檢測

        取胎兒羊水樣本10mL,提取羊水基因組DNA,采用全基因組芯片(美國Affymetrix公司CytoScan 750H芯片)對羊水全基因組DNA樣本進行CMA檢測,步驟為:酶切、連接、PCR擴增、純化、片段化、標記、芯片雜交、洗滌及掃描,采用自帶軟件分析芯片數(shù)據(jù),結(jié)果與DGV、DECIPHER、OMIM等公開數(shù)據(jù)庫對比,參照美國醫(yī)學遺傳學與基因組學學會(American College of Medical Genetics and Genomics,ACMG)指南[6]將拷貝數(shù)目變異(copy number variations,CNVs)分為致病性、良性及臨床意義不明的CNV(variants of unknown significance,VUS)。

        1.3 統(tǒng)計學方法

        應(yīng)用SPSS 22.0統(tǒng)計學軟件處理數(shù)據(jù),計數(shù)資料以例數(shù)(百分率)[n(%)]表示,行χ2檢驗,以P<0.05表示差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 不同臨床指征分類染色體異常情況

        在808例胎兒羊水樣本中,CMA共檢出染色體數(shù)目異常79例(9.78%),其中21三體41例(51.90%)、18三體15例(18.99%)、X三體13例(16.46%)、X四體1例(1.27%)、Y三體6例(7.59%)、其他三體3例(3.80%),與染色體核型分析一致;染色體核型分析檢出染色體結(jié)構(gòu)異常9例(1.11%),其中缺失3例(33.33%)、重復(fù)2例(22.22%)、嵌合體4例(44.44%);CMA檢出CNVs異常93例(11.51%),其中微重復(fù)55例(59.14%)、微缺失38例(40.86%),雜合性缺失(LOH)/單親二倍型(UPD)10例,見表1。

        CMA染色體異常檢出率為23.02%(186/808),明顯高于染色體核型分析的10.89%(88/808),二者比較差異有統(tǒng)計學意義(χ2=42.208,P<0.001)。

        2.2 CMA的CNVs類型檢查情況

        在93例CNVs異常中,9例為致病性,包括不良孕產(chǎn)史2例、NIPT篩查異常2例、超聲檢查異常4例、父母表型異常1例,分別與4、8、9、13、16、22號染色體有關(guān),異常片段大小為537.0Kb~70.8Mb,見表2。CNVs異常中,VUS占64.52%(60/93),良性占25.81%(24/93),致病性CNVs占9.68%(9/93);VUS和良性的發(fā)生率均明顯高于致病性CNVs發(fā)生率,差異均有統(tǒng)計學意義(χ2=62.004,P<0.001;χ2=8.392,P=0.004)。

        表1 不同臨床指征分類CMA染色體異常檢測結(jié)果(n)Table 1 Chromosomal abnormalities in different clinical indication categories(n)

        表2 CMA的致病性CNVs檢查結(jié)果Table 2 Pathogenic CNVs examination results of CMA

        2.3 CMA的LOH/UPD檢查情況

        CMA共檢出10例LOH/UPD,包括NIPT篩查異常3例、不良孕產(chǎn)史1例、超聲檢查異常2例、高齡孕婦1例、血清學篩查高風險2例、父母表型異常1例,分別與1、3、5、6、8、11、12、13、19、20號染色體有關(guān),異常片段大小為10.1~18.5Mb,見表3。

        表3 CMA的LOH/UPD檢查結(jié)果Table 3 LOH/UPD inspection results of CMA

        3 討論

        隨著我國生育政策的放開,高危妊娠情況明顯增加,先天缺陷兒出生率有所增加,給其家庭和社會帶來了沉重的精神和經(jīng)濟負擔,產(chǎn)前篩查及產(chǎn)前診斷對降低出生缺陷發(fā)生率、提高人口素質(zhì)具有重要意義。產(chǎn)前篩查是通過了解孕婦的孕產(chǎn)史、年齡、檢測其血液指標,以及超聲檢查等方式篩出染色體異常的高危孕婦,產(chǎn)前診斷則是通過遺傳學手段明確診斷產(chǎn)前高風險[7]。

        3.1 CMA與染色體核型分析

        染色體核型分析是通過獲取羊水中的細胞進行培養(yǎng),借助G顯帶技術(shù),對比人染色體正常數(shù)目、長度、著絲點位置、臂比等核型不同特征,對染色體進行分析、配對、編號和排序,并進行染色體結(jié)構(gòu)和數(shù)目形態(tài)分析,可有效地確定染色體的數(shù)量結(jié)構(gòu)異常,但結(jié)果具有一定的主觀性,與操作者技術(shù)水平相關(guān),檢查時間長[8]。CMA技術(shù)可在全基因組水平檢測染色體異??截?,尤其是染色體核型分析無法檢測到的微缺失、微重復(fù)等情況。CMA技術(shù)可分為基于微陣列的比較基因組雜交技術(shù)和單核苷酸多態(tài)性微陣列(single nucleotide polymorphism array,SNP array)技術(shù)[9]。本研究使用的SNP assay技術(shù)只需將待測樣本DNA與已報道的正常基因組數(shù)據(jù)進行對比,即可發(fā)現(xiàn)染色體亞結(jié)構(gòu)的異常;不僅能夠檢出CNVs,還能夠檢測出大多數(shù)的LOH和UPD。目前CMA成為一線臨床遺傳學檢測技術(shù),并應(yīng)用于產(chǎn)前診斷。本研究CMA染色體異常檢出率明顯高于染色體核型分析,染色體數(shù)目異常與染色體核型分析結(jié)果一致,但還檢出了較多的CNVs及LOH,因此CMA能提高染色體異常的檢出率。

        不良孕產(chǎn)史與子宮發(fā)育、內(nèi)分泌及父母染色體異常等多種因素有關(guān)。不良孕產(chǎn)史父母不平衡易位攜帶可使生殖細胞減數(shù)分裂過程中遺傳物質(zhì)分配不平衡,導(dǎo)致流產(chǎn)、早產(chǎn)、死胎、生育智力低下兒等不良妊娠結(jié)局[10]。本研究中,CMA共檢出2例不良孕產(chǎn)史的致病性CNVs,22號染色體與CLTCL1、HIRA、TBX1等29個OMIM基因相關(guān),涉及22q11.21微缺失綜合征關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括先天性心臟病、腭裂、面容異常、認知障礙、免疫缺陷等;16號染色體與NDE1、MYH11、ABCC6等9個OMIM基因相關(guān),涉及16p13.11微重復(fù)綜合征關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括智力障礙、發(fā)育遲緩、自閉癥譜系障礙等;提示CMA可進一步篩查染色體異常的因素,指導(dǎo)產(chǎn)前診斷,預(yù)防不良妊娠結(jié)局的發(fā)生。

        3.2 CMA與NIPT篩查

        NIPT篩查是對母體外周血的游離DNA片段高通量測序,主要用于篩查胎兒21三體綜合征、18三體綜合征、13三體綜合征等染色體情況,同時還可提示其他常染色體及性染色體數(shù)目或結(jié)構(gòu)異常問題,具有較高的靈敏度和特異度。母體外周血游離DNA包含母體及胎兒的所有游離DNA,母體存在限制性胎盤嵌合、CNVs,致使游離DNA異常、而胎兒正常導(dǎo)致假陽性,同時若孕周過小,染色體異常的胎兒游離DNA水平過低,會被母體的游離DNA掩蓋導(dǎo)致假陰性結(jié)果,增加了穿刺的風險[11]。本研究中,CMA共檢出2例NIPT篩查異常的致病性CNVs,其中1例位于13號染色體,包含RB1、ZIC2、EDNRB等164個OMIM基因,涉及13q14.11q3微重復(fù)綜合征關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括不同程度的精神障礙、發(fā)育遲緩、面部特征等;另1例位于22號染色體,包含CLTCL1、HIRA、TBX1等44個OMIM基因,涉及22q11.21微缺失綜合征關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括先天性心臟病、腭裂、面容異常、認知障礙、免疫缺陷等;提示CMA檢測可進一步確認假陽性,發(fā)現(xiàn)一些染色體核型分析無法發(fā)現(xiàn)的染色體微缺失微重復(fù)問題。

        3.3 CMA與超聲檢查

        超聲檢查是產(chǎn)檢中最常用的影像學檢查方法,可以觀察胎兒的生長發(fā)育狀況,安全快捷,主要觀測包含心臟、神經(jīng)系統(tǒng)、骨骼、泌尿系統(tǒng)等結(jié)構(gòu)異常,以及NT增厚、NB缺失、側(cè)腦室增寬、腸管回聲增強、脈絡(luò)叢囊腫、心室強光點、單臍動脈、腎盂擴張等軟指標異常情況,但超聲軟指標指導(dǎo)產(chǎn)前診斷尚存爭議,雖然染色體異常的胎兒超聲軟指標異常發(fā)生率較高,但超聲軟指標不具有特異性,不能完全提示胎兒的結(jié)構(gòu)異常,其可能隨著孕周增大而消失,屬一過性特征,染色體正常胎兒也可能發(fā)生超聲異常,造成一定的假陽性[12-13]。本研究中,CMA檢出1例超聲結(jié)構(gòu)異常的致病性CNVs,16號染色體與PRRT2、TBX6、KCTD13等20個OMIM基因相關(guān),涉及16p13.11復(fù)發(fā)微重復(fù)綜合征關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括發(fā)育遲緩、自閉癥譜系障礙、體重過輕、神經(jīng)行為異常等。本研究中,CMA共檢出3例超聲軟指標異常致病性CNVs,9號染色體與DOCK8、SMARCA2、KANK1等32個OMIM基因相關(guān),臨床表型包括面部畸形、腸梗阻、發(fā)育遲緩、智力障礙等,4號染色體與FGFR3、LETM1、WHSC1、NELFA等177個OMIM基因相關(guān),包含Wolf-Hirschhorn綜合征疾病關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括巨頭畸形、語言發(fā)育遲緩、面容異常等;16號染色體與PRRT2、TBX6、KCTD13等23個OMIM基因相關(guān),涉及16p11.2微重復(fù)綜合征關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括發(fā)育遲緩,智力障礙,自閉癥譜系障礙,肥胖等;22號染色體與CLTCL1、HIRA、TBX1等44個OMIM基因相關(guān),涉及22q11.2微缺失綜合征關(guān)鍵區(qū)域,臨床表型包括先天性心臟病,腭裂,面容異常,認知障礙,免疫缺陷等。上述均提示CMA能進一步診斷超聲異常的孕婦,提高染色體異常檢出率。

        3.4 CMA與唐氏血清學篩查

        唐氏血清學篩查通過檢測孕中期血清妊娠相關(guān)血漿蛋白A、絨毛膜促性腺激素、甲型胎兒蛋白、游離雌三醇、抑制素等指標水平,結(jié)合孕婦體征綜合評估胎兒發(fā)育狀態(tài),主要用于評估我國發(fā)病率高、危害性大的21三體綜合征(檢出率為60%~70%)和18三體綜合征(檢出率為60%~70%)及先天性神經(jīng)管缺陷(檢出率為85%~90%),因其成本低、快捷,臨床多用于大規(guī)模篩查,但只能評估染色體異常的風險,準確診斷需進一步的檢查[14]。本研究中,CMA檢查未發(fā)現(xiàn)致病性CNVs,但有2例患者檢出LOH,LOH可能與抑癌基因相關(guān),患癌癥的風險較高。

        3.5 小結(jié)

        本研究除了檢出上述致病性CNVs,還檢出了大量的VUS,這些不明確的染色體變異可能與機體某些代謝疾病相關(guān),但無法得到明確的解釋,增加了孕婦及其家屬的心理負擔,其與DGV、DECIPHER、OMIM數(shù)據(jù)庫不完整有關(guān)。

        總之,產(chǎn)前篩查后采用CMA技術(shù)與染色體核型分析對比,可明顯提高染色體異常的檢出率,但也檢出了較多的無意義拷貝數(shù)異常,因此需要廣大臨床工作者共同參與完善相關(guān)數(shù)據(jù)庫,提高CNVs的準確性,使CMA技術(shù)得到更廣泛的臨床運用。本研究后期將對60例孕婦進行隨訪,并記錄孕婦的妊娠結(jié)局,以補充有關(guān)數(shù)據(jù)庫。

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