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        結(jié)直腸癌患者腸道菌群組成及其代謝產(chǎn)物LPS和SCFAs的變化

        2022-04-25 05:13:52李旭照馬立旭趙建寧王寧萍
        寧夏醫(yī)學雜志 2022年4期
        關(guān)鍵詞:差異研究

        李旭照,王 海,白 檳,馬立旭,趙建寧,王寧萍

        根據(jù)世界衛(wèi)生組織統(tǒng)計,全球每年新增結(jié)直腸癌病例約140萬,死亡約有77.4萬人[1]。我國調(diào)查發(fā)現(xiàn)每年新發(fā)結(jié)直腸癌超過60萬,男性結(jié)直腸癌發(fā)病率已經(jīng)上升為第2位,女性則上升為第3位。西北地區(qū)結(jié)直腸癌發(fā)病率亦呈明顯上升趨勢,且發(fā)病年齡有所提前[2]。但是,結(jié)直腸癌的發(fā)病機制復雜且尚不清楚,需要進一步研究闡述,旨在發(fā)現(xiàn)新的干預策略與靶點。越來越多的研究表明,腸道菌群失調(diào)在結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展中扮演著重要角色[3]。腸道菌群是機體腸道內(nèi)定植微生物的總稱,包括細菌、病毒、真菌等,其總量是機體細胞數(shù)量的10倍以上,數(shù)量龐大。經(jīng)過長期的進化,腸道菌群已與機體融為一體,作為一種“特殊器官”,正常情況下,作為腸道共生菌協(xié)助機體各項功能。但在異常情況下,腸道菌群已被證實參與了多種疾病的發(fā)生發(fā)展,尤其在結(jié)直腸癌中,由于腸道菌群主要定植在結(jié)直腸,所以能直接作用于腸道細胞,與該病密切相關(guān)[4],因此,研究結(jié)直腸癌的腸道菌群意義重大。本研究試圖通過分析結(jié)直腸癌患者與健康對照者的腸道菌群組成差異,篩選出顯著差異菌及其代謝產(chǎn)物,明確結(jié)直腸癌相關(guān)的關(guān)鍵菌及產(chǎn)物,為后續(xù)利用腸道菌群干預防治結(jié)直腸癌提供幫助。

        1 資料與方法

        1.1 儀器與試劑:Multiskan GO全自動酶標儀、TRACE 1310-ISQ LT氣-質(zhì)聯(lián)用儀,賽默飛。鱟試劑檢測試劑盒,廈門鱟試劑;短鏈脂肪酸(SCFAs)標準品,Sigma-aldrich;PCR引物,上海生工;PCR反應采用Phusion?High-Fidelity PCR Master Mix試劑盒,New England Biolabs。

        1.2 糞便標本收集:收集寧夏回族自治區(qū)人民醫(yī)院2019至2020年健康對照組人群44例、確診結(jié)直腸癌患者29例臨床資料。健康對照組中男性25例,女性19例;年齡 40~70歲,平均50歲;結(jié)直腸癌患者中男性16例,女性13例;年齡39~75歲,平均52歲,2組間差異無統(tǒng)計學意義。結(jié)直腸癌糞便樣本資料為住院患者,健康對照組糞便樣本來自體檢中心。樣本收集標準:收集樣本前1個月內(nèi)未口服抗生素或益生菌制劑;結(jié)直腸癌患者為初次發(fā)現(xiàn),無放化療史,糞便標本在結(jié)腸鏡下術(shù)前采集。健康對照除未罹患結(jié)直腸癌,其他資料與結(jié)直腸癌組一致。糞便標本凍存于-80 ℃用于后續(xù)腸道菌群測序。本研究經(jīng)寧夏回族自治區(qū)人民醫(yī)院倫理委員會審核批準。

        1.3 16S rRNA腸道菌群測序與分析:待各組收齊后,采用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)方法[5]提取糞便樣本DNA。經(jīng)1%瓊脂糖電泳鑒定后,采用細菌V3~V4區(qū)引物(341F 5’-CCTAYGGGRBGCASCAG-3’和806R 5’-GGACTACNNGGGTATCTAAT-3’)進行PCR擴增,建庫后送北京諾禾致源公司采用Illumina HiSeq 2500測序平臺測序及分析。

        1.4 鱟試劑法檢測血漿脂多糖( LPS)水平:采用鱟試劑盒按說明書檢測各組血漿LPS水平。

        1.5 氣質(zhì)聯(lián)用(GC-MS)檢測短鏈脂肪酸(SCFAs):采用美國Thermo公司的TRACE 1310-ISQ LT氣-質(zhì)聯(lián)用儀,色譜柱為Agilent HP-INNOWAX毛細管柱(30 m×0.25 mm ID×0.25 μm)。分流進樣,進樣量1 μl,分流比為10∶1。進樣口溫度250 ℃,離子源溫度230 ℃,傳輸線溫度250 ℃,四極桿溫度150 ℃。程序升溫起始溫度90 ℃,然后以10 ℃/min升溫至120 ℃,再以5 ℃/min升溫至150 ℃,最后以25 ℃/min 升溫至250 ℃維持2 min。載氣為氦氣,載氣流速1.0 mL/min。質(zhì)譜(MS)條件:電子轟擊電離(EI)源,SIM掃描方式,電子能量70 eV。標準品曲線制作:稱取適量的乙酸、丙酸、丁酸、異丁酸、戊酸、異戊酸、己酸標準品,用乙醚配分別配制成0.01、0.1、0.5、1、5、10、25、50、100、250、500 μg/mL 11個標準濃度梯度。對標準液的濃度系列分別進行GC-MS檢測,以標準品的濃度(X)為橫坐標,標準品與內(nèi)標的峰面積比值(Y)為縱坐標進行線性回歸分析,繪制標準曲線,同時進行精密度、重復性、回收率、定量限的考察。

        2 結(jié)果

        2.1 結(jié)直腸癌患者腸道菌群的alpha(α)多樣性發(fā)生顯著變化:對2組患者腸道菌群測序分析,發(fā)現(xiàn)2組樣本測序OTU超過10 000時趨于平緩,說明測序穩(wěn)定、可靠。進一步分析發(fā)現(xiàn),OTU數(shù)量和菌種數(shù)量,見圖1(封二)均顯著變化,提示結(jié)直腸癌患者腸道菌群α多樣性顯著改變。

        2.2 結(jié)直腸癌患者腸道的整體組成發(fā)生顯著變化:對2組患者的β多樣性主坐標分析(PCoA),結(jié)果表明結(jié)直腸癌患者的腸道菌群與健康對照組相比發(fā)生了顯著改變,2組各個樣本之間各自相對聚集,2組之間完全分開,說明結(jié)直腸癌患者的腸道菌群在整體組成上有顯著差異。類似地,通過非度量多維尺度分析(NMDS)發(fā)現(xiàn),2組樣本距離較遠,亦證實結(jié)直腸癌患者腸道菌群在組成上差異明顯,見圖2(封二)。韋恩圖分析發(fā)現(xiàn)健康對照組特有菌為513個,結(jié)直腸癌患者特有菌減少至368個。鑒于總體組成發(fā)生了顯著變化,為明確具體差異菌,本研究進一步分析了2組門和屬水平差異有統(tǒng)計學意義。

        2.3 結(jié)直腸癌患者腸道菌群在門水平上顯著失調(diào):菌群門水平主要組成菌為厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)。與健康對照組比較,結(jié)直腸癌組厚壁菌門(Firmicutes)顯著增加(P<0.05),而變形菌門(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)顯著降低(P<0.05),提示結(jié)直腸癌患者腸道菌群在門水平上發(fā)生了顯著改變,其中主要表現(xiàn)為菌厚壁菌門、擬桿菌門和變形菌門的顯著變化。

        2.4 結(jié)直腸癌患者腸道菌群在屬水平上顯著改變:深入分析屬水平上組成變化,與健康對照組相比,結(jié)直腸癌組顯著增加的有確腸桿菌 (Enterobacteriaceae)、變形菌門(Prevotellaceae)、理研菌(Rikenellaceae)、鏈球菌(Streptococcaceae)、丹參科(Tannerellaceae)、脫硫弧菌科(Desulfovibrionaceae)、球菌科(Coriobacteriaceae)、巴內(nèi)塞科(Barnesiellaceae);顯著減少的菌有紅球菌科(Ruminococcaceae)、拉氏菌科(Lachnospiraceae),提示結(jié)直腸癌患者腸道菌群在屬水平上發(fā)生了顯著改變(P<0.05)。

        2.5 結(jié)直腸癌患者腸道菌群之間關(guān)聯(lián)性分析:進一步對2組患者的菌群組成進行關(guān)聯(lián)性分析,發(fā)現(xiàn)2組間菌群關(guān)聯(lián)性差異有統(tǒng)計學意義,見圖3(封二)。

        2.6 結(jié)直腸癌患者血漿LPS水平顯著升高:血漿LPS來源于腸道菌群紊亂中的革蘭陰性菌,其介導的慢性低度炎癥與結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。檢測結(jié)果表明,與健康對照組相比,結(jié)直腸癌組血漿LPS水平亦顯著升高,提示患者存在內(nèi)毒素血癥(P<0.05),見圖4(封二)。

        2.7 結(jié)直腸癌患者腸道菌群代謝產(chǎn)物SCFAs顯著改變:腸道菌群重要代謝產(chǎn)物SCFAs參與了結(jié)直腸癌的發(fā)生發(fā)展。進一步采用GC-MS檢測了SCFAs含量,結(jié)果表明與健康對照組相比,結(jié)直腸癌組乙酸、丙酸和丁酸顯著減少(P<0.05)。

        3 討論

        越來越多的研究表明,腸道菌群在結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展中具有重要作用[6-8]。隨著2008年人類微生物組學計劃(HMP)的順利實施,腸道菌群在健康與疾病中的重要作用得到不斷揭示[9]。研究表明,不同類型腫瘤具有顯著差異的腸道菌群組成,可能與不同腫瘤提供的具體特定菌群定植微環(huán)境有關(guān)[10]。在結(jié)直腸癌發(fā)生過程中,失調(diào)的腸道菌群通過與腫瘤細胞和免疫細胞相互作用而促進腫瘤的生長[10]。盡管目前還未發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌特征菌,但已發(fā)現(xiàn)其腸道菌群組成顯著區(qū)別于健康人群?;诓煌貐^(qū)飲食、氣候等因素均會影響腸道菌群組成,本研究通過高通量測序分析了結(jié)直腸癌患者腸道菌群組成變化、其代謝產(chǎn)物SCFAs組成及血漿LPS水平,旨在確定結(jié)直腸癌患者差異的腸道菌及其代謝產(chǎn)物。

        本研究發(fā)現(xiàn),結(jié)直腸癌患者腸道菌群總體組成發(fā)生了顯著變化,體現(xiàn)為豐度增加,發(fā)現(xiàn)368種特異菌,提示結(jié)直腸癌患者腸道菌群存在顯著失調(diào)。進一步具體分析發(fā)現(xiàn),在門水平上以厚壁菌門、擬桿菌門為主,這與以往結(jié)直腸癌腸道菌群研究結(jié)果一致[11]。本研究發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌患者厚壁菌門顯著增加,而變形菌門和擬桿菌門顯著降低,提示可能存在腸道菌群紊亂。研究表明厚壁菌門在結(jié)直腸癌中是顯著富集的[12]。變形菌門與多種慢性代謝性疾病密切相關(guān)[13]。一項臨床研究發(fā)現(xiàn)擬桿菌門在健康志愿者與腺瘤之間具有顯著差異,提示擬桿菌門水平上的改變可能參與了結(jié)直腸癌及腺瘤的發(fā)生[14]。本研究進一步分析了腸道菌群屬水平上的變化,發(fā)現(xiàn)結(jié)直腸癌患者腸桿菌、變形菌門、理研菌、鏈球菌、丹參科、脫硫弧菌科、球菌科、巴內(nèi)塞科、紅球菌科、拉氏菌科,均發(fā)生了顯著變化,提示在屬水平上結(jié)直腸癌亦存在顯著失衡。研究表明,Lachnospiraceae細菌基因m3具有潛在的結(jié)直腸癌診斷價值[15]。Streptococcaceae的改變與腸道菌群失調(diào)密切相關(guān)[13]。黑色素瘤患者采用PD-1治療過程中,敏感患者Enterobacteriaceae菌減少[16]。然而,更多菌的確切功能仍需要深入研究證實。

        本結(jié)果表明,結(jié)直腸癌患者體內(nèi)差異腸道菌群組成,提示腸道菌群失調(diào),腸道菌群失調(diào)會使腸道產(chǎn)生過量LPS,后者損傷腸道屏障作用,導致腸道完整性破壞和通透性增加,經(jīng)腸道滲漏LPS異位進入血液循環(huán),引起持續(xù)內(nèi)毒素血癥,引發(fā)炎癥參與的持續(xù)疾病進展。以往研究發(fā)現(xiàn)包括CRC在內(nèi)的多種腫瘤中存在顯著升高的血漿LPS水平[17],這支持本研究結(jié)果,提示結(jié)直腸癌患者存在腸道菌群失調(diào)引發(fā)的內(nèi)毒素血癥。

        SCFAs,作為腸道菌群重要代謝產(chǎn)物,在正常生理與疾病狀態(tài)下均發(fā)揮重要作用[18]。越來越多的研究表明,SCFAs廣泛參與腸道能量吸收、炎癥反應、氧化應激、乙?;碛^遺傳修飾等多種生物學作用[19]。本研究顯示,結(jié)直腸癌患者SCFAs中的乙酸、丙酸和丁酸顯著減少,這與以往多種慢性病減少的SCFAs結(jié)果一致[19]。SCFAs能夠通過結(jié)合G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)發(fā)揮抑制慢性疾病炎癥的作用。此外,研究發(fā)現(xiàn)SCFAs通過上調(diào)調(diào)節(jié)性T細胞(Tregs)改善慢性低度炎癥反應[20]。重要的是,SCFAs主要由擬桿菌等腸道菌發(fā)酵碳水化合物產(chǎn)生[21],而本研究也發(fā)現(xiàn)CRC擬桿菌顯著下降,提示可能減少擬桿菌下調(diào)SCFAs參與結(jié)直腸癌腸道菌群失調(diào)。

        本研究的不足之處:首先,由于臨床研究中腸道菌群在不同個體之間差異較大,這就需要在寧夏區(qū)域多中心進行大樣本量分析證實本研究發(fā)現(xiàn)的差異菌及其代謝產(chǎn)物;其次,需要開展腸道菌群宏基因組分析,以便進一步明確差異菌關(guān)鍵基因的生物學功能及機制。

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