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        攜帶CRISPR/Cas9的重組腺聯(lián)病毒對(duì)偽狂犬病病毒感染小鼠的治療效應(yīng)

        2022-03-30 01:36:30李兆龍張惠芳豐志華
        畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2022年3期
        關(guān)鍵詞:拷貝數(shù)存活質(zhì)粒

        李兆龍,張惠芳,豐志華,方 舟

        (1.福建省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,福州 350013;2.福建師范大學(xué)南方生物醫(yī)學(xué)研究中心,福州 350015)

        豬偽狂犬病病毒(pseudorabies virus, PRV)是皰疹病毒科(Herpesviridae)皰疹病毒屬的一個(gè)重要成員[1],宿主范圍較廣,可感染不同年齡的豬、牛、綿羊、犬、貓、水貂、雪貂、小鼠、大鼠、豚鼠等。豬偽狂犬病在我國(guó)生豬養(yǎng)殖中發(fā)病率較高。此外,不同日齡段豬感染后所表現(xiàn)的臨床癥狀不一樣,幼齡豬感染后死亡率接近70%,成年母豬主要表現(xiàn)為流產(chǎn)、死胎或產(chǎn)木乃伊胎兒等,公豬則主要表現(xiàn)為精子的活力低,或精子數(shù)量少等。該病無(wú)季節(jié)性,各個(gè)季節(jié)均會(huì)發(fā)生。目前,雖然我國(guó)成熟商品化疫苗多,但因病毒變異快,因此疫苗的預(yù)防效果總體不甚理想,生豬的野毒陽(yáng)性率仍然較高,損失較為嚴(yán)重[2-4]。

        PRV病毒粒子呈正二十面體,直徑為150~180 nm[5]。它的基因組較大,約為143 kb,編碼約80個(gè)蛋白。PRV毒性蛋白主要是糖蛋白gE、gD、gI以及胸苷激酶(TK)的基因協(xié)同控制,其中TK基因?qū)RV的增殖、復(fù)制、潛伏感染及激活有重要的作用,因此TK基因是PRV的主要毒性基因,常作為治療及開(kāi)發(fā)疫苗的首選靶基因。而gE基因和gI結(jié)合在一起,促進(jìn)病毒入侵宿主細(xì)胞,因此,控制入侵的源頭也非常關(guān)鍵。由L48基因編碼的被膜蛋白VP16,通過(guò)與宿主的細(xì)胞因子Oct-1和HCF-1結(jié)合從而激活立即早期基因IE180的轉(zhuǎn)錄和表達(dá),進(jìn)而調(diào)控一系列下游基因的表達(dá)和病毒的增殖,它在病毒復(fù)制及裝配中執(zhí)行著非常重要的生物學(xué)功能[6-7]。因而,VP16也是基因靶向治療的關(guān)鍵所在。

        CRISPR/Cas9系統(tǒng)是一個(gè)高效的基因編輯系統(tǒng),能精確靶向編輯目的基因,已被廣泛應(yīng)用于生命科學(xué)領(lǐng)域的研究[8]。它不僅對(duì)動(dòng)物細(xì)胞、細(xì)菌和病毒能進(jìn)行實(shí)時(shí)靶向編輯,而且能夠用于動(dòng)物和部分人的胚胎基因編輯[9-10]。此外,CRISPR/Cas9系統(tǒng)對(duì)于遺傳性疾病的治療也有很好的應(yīng)用前景,之前的研究證實(shí)該系統(tǒng)可用來(lái)治療亨廷頓氏病(huntingtin基因突變引起的疾病)的小鼠,矯正了嚴(yán)重聯(lián)合免疫缺陷病(severe combined immunodeficiency disease, SCID)的致病突變等[11-12]。

        腺聯(lián)病毒(adeno-associated virus,AAV)是單鏈復(fù)制缺陷型DNA病毒,它的宿主范圍廣,能感染分化成熟的細(xì)胞和分化未成熟的細(xì)胞,也能轉(zhuǎn)導(dǎo)不同分裂期的細(xì)胞,被廣泛應(yīng)用于疾病的基因治療和轉(zhuǎn)基因研究等[13]。目前,AAV轉(zhuǎn)導(dǎo)系統(tǒng)對(duì)于多種疾病的臨床試驗(yàn)正在進(jìn)行中,它很有可能成為世界上第一個(gè)上市的基因治療藥物載體。目前的研究表明,AAV的安全性高,通過(guò)加工后可口服,因此它是較為合適的基因治療載體[14-16]。

        本研究利用重組腺聯(lián)病毒載體攜帶CRISPR/Cas9系統(tǒng),靶向體內(nèi)感染的PRV關(guān)鍵毒力基因TK和gE,以及復(fù)制關(guān)鍵點(diǎn)的VP16基因,從而在源頭削弱PRV的毒力,并通過(guò)破壞它的復(fù)制相關(guān)基因,從而達(dá)到抑制或減弱它復(fù)制能力,進(jìn)而達(dá)到治療的效果。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株、載體和細(xì)胞 大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞來(lái)源于TaKaRa公司。pX601質(zhì)粒為Addgene產(chǎn)品;AAV2/5質(zhì)粒為Biovector公司產(chǎn)品;pHelper質(zhì)粒為廣州華韻生物科技有限公司產(chǎn)品,相關(guān)圖譜見(jiàn)圖1。pXTK、pXgE、pXVP16質(zhì)粒為本實(shí)驗(yàn)室制備。293A細(xì)胞來(lái)源于上海紀(jì)寧生物科技有限公司,ST細(xì)胞為本實(shí)驗(yàn)室保存,兩種細(xì)胞都是貼壁細(xì)胞,使用含10%血清的DMEM培養(yǎng)基;PRV(Fa,閩A株)株來(lái)自福建農(nóng)林大學(xué)。

        A.AAV2/5質(zhì)粒;B.pHelper質(zhì)粒;C.pX601質(zhì)粒

        1.1.2 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物 140只20 g左右的BALB/c小鼠,購(gòu)自吳氏動(dòng)物中心。所有的動(dòng)物試驗(yàn)嚴(yán)格按照福建師范大學(xué)南方生物醫(yī)學(xué)研究中心的動(dòng)物倫理相關(guān)規(guī)定執(zhí)行(動(dòng)物實(shí)驗(yàn)倫理批準(zhǔn)號(hào):FJSU3568423)。

        1.2 方法

        1.2.1 CRISPR/Cas9-sgRNA敲除質(zhì)粒的構(gòu)建

        1.2.1.1 sgRNA的設(shè)計(jì)與合成:從NCBI下載PRV的目標(biāo)基因TK、gE和VP16序列,輸入sgRNA網(wǎng)站http://crispr.mit.edu/進(jìn)行sgRNA的目標(biāo)序列的設(shè)計(jì),挑選合適的sgRNA由福州鉑尚生物公司合成(表1)。

        表1 sgRNA引物

        sgRNA合成后,加入PBS進(jìn)行混勻,置于梯度PCR儀中進(jìn)行退火,退火體系:Primer R 1 μL,Primer F 1 μL,10× PCR Buffer 2 μL,無(wú)菌水16 μL。退火反應(yīng)條件:95 ℃,10 min,然后按2 ℃·s-1的速度讓退火溫度下降至85 ℃,接著又以0.25 ℃·s-1的速度降至25 ℃,最后以25 ℃維持1 min完成退火。將退火完成的sgRNA置于-20 ℃冰箱備用。

        1.2.1.2 pX601質(zhì)粒轉(zhuǎn)化:1 μL的pX601質(zhì)粒(Amp抗性)加入100 μL DH5α感受態(tài)細(xì)胞,42 ℃恒溫?zé)岽碳?0 s,冰浴2~3 min;再加入800 μL LB液體培養(yǎng)基,置37 ℃ 250 r·min-1培養(yǎng)1 h;取出菌,按4 000 r·min-1離心5 min,棄801 μL上清,留100 μL進(jìn)行重懸,均勻涂布在Amp平板上,37 ℃恒溫培養(yǎng)箱中12 h;隔日挑選單一的菌落,進(jìn)行擴(kuò)增,然后再PCR檢測(cè),測(cè)序驗(yàn)證。

        1.2.1.3 pX601質(zhì)粒的提取、酶切、純化及連接:按照康為世紀(jì)生物科技有限公司無(wú)內(nèi)毒素質(zhì)粒小提試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行操作。用BbsⅠ限制性核酸內(nèi)切酶切pX601質(zhì)粒。酶切的反應(yīng)條件:37 ℃ 10 min,65 ℃ 10 min。反應(yīng)中各組分:Plasmid pX601 5 μg,10×Fast Digest buffer 5 μL,BbsⅠ 5 μL,去離子水40 μL。

        用TaKaRa DNA frangment purification kit提取并純化酶切后的pX601質(zhì)粒。接著用T4連接酶連接純化、酶切的pX601質(zhì)粒和退火后的sgRNA,反應(yīng)體系為25 μL,反應(yīng)液中各組分:T4 DNA Ligase 1 μL,10×T4 DNA buffer 2.5 μL,Vector 50 ng,sgRNA 150 ng,去離子水 21.5 μL。連接時(shí)將混合液輕輕混勻,置于PCR儀中16 ℃,3 h最后65 ℃ 10 min。

        1.2.1.4 重組質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化及驗(yàn)證:將重組質(zhì)料轉(zhuǎn)化至DH5α大腸桿菌中增殖,然后挑選單克隆進(jìn)行增殖,然后應(yīng)用PCR及測(cè)序驗(yàn)證(引物見(jiàn)表2)。

        表2 選定基因的驗(yàn)證引物

        1.2.2 重組腺聯(lián)病毒載體的包裝

        1.2.2.1 重組腺聯(lián)病毒載體的驗(yàn)證引物:根據(jù)pX601質(zhì)粒序列設(shè)計(jì)引物RT-pX601,用于鑒定腺聯(lián)病毒的組裝,具體序列見(jiàn)表2驗(yàn)證引物。

        1.2.2.2 質(zhì)粒轉(zhuǎn)染293A細(xì)胞和病毒的收集:將5×106·mL-1的 293A細(xì)胞均勻平鋪于15 cm的細(xì)胞培養(yǎng)皿中,待細(xì)胞貼壁且匯合度達(dá)70%~90%時(shí),棄除舊培養(yǎng)液,加入無(wú)血清DMEM培養(yǎng)基;取3個(gè)EP管,分別加入135 μL的1 g·mL-1的PEI試劑和15 μg AAV2/5質(zhì)粒、10 μg pHelper質(zhì)粒,再分別加入20 μg pXTK、pXgE和pXVP16質(zhì)粒,PEI和質(zhì)粒量的總量比為3∶1,混勻后室溫靜置15 min;將含有3種混合質(zhì)粒的PEI混合液加入到細(xì)胞培養(yǎng)基中,并輕搖混勻;做好標(biāo)記,放入37 ℃、5%CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)12 h;12 h后更換含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基,放入37 ℃、5% CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng);24 h后收集細(xì)胞上清(含重組腺聯(lián)病毒),做好標(biāo)記存貯于4 ℃冰箱備用,并在細(xì)胞培養(yǎng)皿中加入新鮮的含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)基;24 h后,將培養(yǎng)皿中的細(xì)胞連同培養(yǎng)基收集到45 mL離心管中,反復(fù)凍融,劇烈震蕩后3 000 r·min-1離心5 mim,取上清。

        1.2.2.3 重組腺聯(lián)病毒的滴度測(cè)定:取10 μL濃縮后的AAV病毒液提取全基因組;以AAV病毒基因組和pX601質(zhì)粒作為模板,Q-Cas9為引物,進(jìn)行Real-time PCR;然后計(jì)算病毒拷貝數(shù):首先計(jì)算出作為模板的0.15 ng pX601質(zhì)粒的摩爾數(shù),計(jì)算公式“摩爾數(shù)=總質(zhì)量/分子量”[pX601是堿基數(shù)為7 447 bp的dsDNA平均分子量(MW)=(堿基數(shù))×(660道爾頓/堿基)=7 447×660道爾頓,即7 447×660 g·mol-1,pX601摩爾數(shù)=0.15×10-9/(7 447×660)mol;0.15 ng pX601質(zhì)粒的拷貝數(shù)=6.02×1023×0.15×10-9/(7 447×660)=1.84×107拷貝數(shù)];然后根據(jù)real-time PCR結(jié)果,計(jì)算出3種重組腺聯(lián)病毒載體和pX601質(zhì)粒表達(dá)Cas9的倍數(shù)比,將倍數(shù)乘以0.15 ng pX601質(zhì)粒的拷貝數(shù),得出AAV基因組的拷貝數(shù);再根據(jù)模板AAV基因組占10 μL AAV的基因組的比值,計(jì)算出10 μL AAV的拷貝數(shù)。

        1.2.2.4 重組腺聯(lián)病毒載體及功能驗(yàn)證:重組腺聯(lián)病毒感染5×105·mL-1的ST細(xì)胞,24 h后收集細(xì)胞,按照TRIzol中的操作方法提取細(xì)胞總RNA,再應(yīng)用PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄,接著應(yīng)用RT-PCR檢測(cè)重組腺聯(lián)病毒中的Cas9、TK基因、gE和VP16的mRNA水平。

        1.2.2.5 攜帶Cas9-TK-gE-VP16的編輯質(zhì)粒轉(zhuǎn)染ST細(xì)胞:5×105·mL-1ST細(xì)胞均勻分布于6孔板中,細(xì)胞貼壁并長(zhǎng)至匯合度80%時(shí),棄去培養(yǎng)基,更換新鮮的無(wú)血清DMEM培養(yǎng)基;取1EP管,按PEI和質(zhì)粒3∶1的質(zhì)量比,分別加入2.5 μg質(zhì)粒和1 g·mL-1的PEI 7.5 μL;將含有敲除質(zhì)粒的PEI混合液加入到細(xì)胞培養(yǎng)基中,并輕輕搖晃混勻;做好標(biāo)記,置37 ℃、5% CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)12 h。

        1.3 重組腺聯(lián)病毒系統(tǒng)在細(xì)胞水平對(duì)感染PRV的治療效果評(píng)估

        1.3.1 重組腺聯(lián)病毒載體感染ST細(xì)胞 ST細(xì)胞以5×105·mL-1的濃度均勻鋪于6孔板中,等細(xì)胞貼壁并長(zhǎng)至匯合度達(dá)80%時(shí),棄去舊培養(yǎng)基,更換新鮮的無(wú)血清DMEM培養(yǎng)基;將攜帶3個(gè)不同片段的3種AAV(AAV-TK、AAV-gE、AAV-VP16)的稀釋,取部分AAV稀釋到109拷貝·mL-1;每種AAV濃度設(shè)置4個(gè)時(shí)間梯度,分別為感染ST細(xì)胞8、16、24、32 h(從加入PRV后開(kāi)始計(jì)時(shí)),每種AAV設(shè)置1個(gè)對(duì)照(只加AAV),取108拷貝分別加入6孔板中混勻,并做好標(biāo)記,置37 ℃、5% CO2的細(xì)胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12 h后換液加入PRV。

        1.3.2 ST細(xì)胞形態(tài)變化觀察和收集 每到一個(gè)時(shí)間梯度時(shí),在顯微鏡下觀察細(xì)胞狀態(tài)并拍照,做好標(biāo)記,再進(jìn)行細(xì)胞樣品收集和細(xì)胞總RNA的純化。

        1.3.3 ST細(xì)胞中的PRV核酸拷貝數(shù)的變化情況 按PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。應(yīng)用Real-time PCR測(cè)定ST細(xì)胞中的PRV核酸拷貝數(shù)的變化情況,在MicroAmp?Fast 8-Tube Strip 0.1 mL 快速反應(yīng)8聯(lián)管中配制反應(yīng)混合液,反應(yīng)條件為95 ℃ 20 s、95 ℃ 15 s、60 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s、95 ℃ 15 s、60 ℃ 60 s、95 ℃ 15 s 結(jié)束。其中,95 ℃反應(yīng)20 s為第一階段(稱為Hold Stage),第二階段為PCR Stage(即95 ℃ 15 s、60 ℃ 30 s、72 ℃ 30 s);最后一步為熔解曲線擴(kuò)增階段(即95 ℃ 15 s、60 ℃ 60 s、95 ℃ 15 s)。第二階段進(jìn)行40個(gè)循環(huán),退火溫度因不同基因而不同。每組做3個(gè)重復(fù)。根據(jù)Ct值進(jìn)行數(shù)據(jù)處理。

        反應(yīng)體系設(shè)置為10 μL,各組分組成:前后引物各0.25 μL,模板 120 ng,SYBR? Premix Ex Taq II(Tli RNaseH Plus)ROX Plus 5 μL,DEPC水0.5 μL。

        1.4 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)對(duì)感染PRV小鼠的治療效果評(píng)估

        1.4.1 小鼠感染PRV半數(shù)致死量(LD50)的測(cè)定

        1.4.1.1 Karber法計(jì)算PRV滴度:取10 μL病毒液進(jìn)行梯度稀釋,每個(gè)梯度相差10倍體積,每個(gè)稀釋梯度為8個(gè)復(fù)孔。每隔24 h觀察細(xì)胞病變情況,連續(xù)觀察直至沒(méi)有新病變孔出現(xiàn)。然后統(tǒng)計(jì)陽(yáng)性孔比例,根據(jù)公式lgTCID50=L-d(S-0.5)計(jì)算出PRV的滴度,L為最高稀釋度的對(duì)數(shù),d為稀釋度對(duì)數(shù)之間的差,S為陽(yáng)性孔比例總和。lgLD50=Xk-d(∑p-0.5),Xk為最大劑量對(duì)數(shù),∑p為各劑量組死亡率之和,d為稀釋度對(duì)數(shù)之間的差。

        1.4.1.2 試驗(yàn)分組設(shè)計(jì):取30只BALB/c小鼠,分為6組,分別為1×106.5TCID50組、1×105.5TCID50組、1×104.5TCID50組、1×103.5TCID50組、1×102.5TCID50組及空白對(duì)照組??瞻捉M注射DMEM,肌內(nèi)注射,注射部位均為左后腿肌肉,注射體積為100 μL。每天記錄小鼠的存活情況。

        1.4.2 治療試驗(yàn)分組 取110只20 g左右的BALB/c小鼠,隨機(jī)平均分成兩大組:觀察組和試驗(yàn)組,觀察組用于觀察小鼠的生理狀況和死亡統(tǒng)計(jì),試驗(yàn)組用于小鼠組織的采取。具體分組:100 μL DMEM+10 μL生理鹽水注射1次組,PRV注射1次組,AAV-TK注射治療1次組,AAV-gE注射治療1次組,AAV-VP16注射治療1次組,AAV-TK注射治療2次組,AAV-gE注射治療2次組,AAV-VP16注射治療2次組,AAV-TK注射治療3次組,AAV-gE注射治療3次組,AAV-VP16注射治療3次組,每組5只小鼠,共11組。其中PRV用肌內(nèi)注射法(注射小鼠后腿內(nèi)側(cè)),注射量為5×104TCID50,只注射1次;AAV用尾靜脈注射法,每次注射109拷貝數(shù),分注射1次、2次和3次組,多次注射組為隔天注射,表中PRV+AAV的注射次數(shù)指的是AAV的注射次數(shù);DMEM和生理鹽水分別用肌內(nèi)注射、尾靜脈注射。

        1.4.3 小鼠生理狀態(tài)觀察 注射病毒后,每天記錄觀察組中各組小鼠的生理變化,包括小鼠的進(jìn)食、精神狀態(tài)、瘙癢癥傷口面積、死亡數(shù)量和時(shí)間、觀察是否有特殊病理行為,并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。

        1.4.4 小鼠組織采取 在小鼠的腹腔注射250 μL的5%水合氯醛,麻醉小鼠,用200 mL的注射器裝滿DEPC水,連接4號(hào)半的輸液器針頭,在注射泵上固定;麻醉后解剖小鼠,剪開(kāi)小鼠胸腔露出心,剪破右心耳,將針頭刺入心尖3~4 mm開(kāi)始灌注,灌注約20 mL DEPC水時(shí),灌注完成(直到小鼠耳部、趾部沒(méi)有血色);取小鼠腦部及脾組織,并將其從小鼠身上剝離,將脾組織放入預(yù)備的做有相應(yīng)標(biāo)記EP管中,放入-80 ℃冰箱內(nèi)冰凍(用于總RNA的純化)。

        1.4.5 小鼠腦部組織總RNA純化 取小鼠腦組織5 g,放入1.5 mL EP管中,加入200 μL的TRIzol,研磨成組織漿液,再加入800 μL TRIzol,進(jìn)行細(xì)胞總RNA的純化。

        1.4.6 cDNA的合成 按照PrimeScript RT reagent Kit with gDNA Eraser說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。

        1.4.7 Real-time PCR 具體試驗(yàn)步驟參見(jiàn)cDNA的實(shí)時(shí)熒光定量PCR反應(yīng)。

        1.5 圖像分析和數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)

        試驗(yàn)中測(cè)序結(jié)果用Mega 5.0和Bioedit軟件分析;RT-PCR結(jié)果用CorelDRAW軟件處理分析。

        2 結(jié) 果

        2.1 編輯質(zhì)粒的驗(yàn)證

        將sgRNA連接到pX601質(zhì)粒,經(jīng)測(cè)序和生物學(xué)軟件Bioedit的比對(duì)證實(shí), 目標(biāo)序列的sgRNA成功構(gòu)建針對(duì)PRV 3個(gè)關(guān)鍵基因的pX601編輯質(zhì)粒(圖2)。

        2.2 編輯質(zhì)粒的功能驗(yàn)證

        為進(jìn)一步驗(yàn)證編輯質(zhì)粒的靶基因序列,分別將pXTK、pXgE和pXVP16 3種編輯質(zhì)粒轉(zhuǎn)染ST細(xì)胞12 h,后加入1×105TCID50的PRV,24 h后收集含PRV的細(xì)胞和上清,反復(fù)凍融3次,提PRV基因組DNA,進(jìn)行PCR擴(kuò)增并測(cè)序驗(yàn)證。測(cè)序結(jié)果證實(shí),PRV的病毒基因在靶基因位置出現(xiàn)了套疊峰,證實(shí)編輯質(zhì)粒在PRV的TK、gE和VP16位置發(fā)生了剪切編輯(詳細(xì)的編輯效率之前文章已經(jīng)驗(yàn)證)[17],具備剪切PRV的功能(圖3)。

        圖3 3種剪切質(zhì)粒對(duì)PRV剪切的測(cè)序驗(yàn)證

        2.3 評(píng)估重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)在ST細(xì)胞模型中清除PRV

        2.3.1 pT-IE180載體的構(gòu)建 pT-IE180載體是本研究構(gòu)建的含PRVIE180基因部分片段的TA克隆載體。用ExTaq酶擴(kuò)增出PRVIE180基因目的片段,連接到pMD19-T上,目的片段大小為101 bp,測(cè)序結(jié)果如圖4,可以看出質(zhì)粒載體上有約100 bp的序列與PRVIE180基因片段相同,圖中兩個(gè)不同的堿基是所用的PRV基因組參照系列的點(diǎn)突變。

        圖4 PRV IE180基因組和T-IE180序列比對(duì)

        2.3.2 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)對(duì)ST細(xì)胞中PRV拷貝數(shù)影響 ST細(xì)胞以5×105·mL-1的細(xì)胞濃度均勻鋪于6孔板中,在鋪板的同時(shí)分別加入1×108拷貝數(shù)的AAV-gE、AAV-TK和AAV-VP16,12 h后給細(xì)胞換液,并加入105TCID50的PRV處理細(xì)胞,在12、18、24 h 3個(gè)時(shí)間段收集細(xì)胞,并提取細(xì)胞RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA作為模板,用IE180和豬源管家基因GAPDH基因引物進(jìn)行Real-time PCR,檢測(cè)不同時(shí)段細(xì)胞中病毒量的變化情況。如圖5所示,在12 h不同AAV處理過(guò)的細(xì)胞中PRV量相比于沒(méi)有處理過(guò)的細(xì)胞并沒(méi)明顯的減少,而18 h時(shí),AAV-gE和AAV-VP16處理組,PRV的IE180的拷貝數(shù)明顯下降(P≤0.01),但AAV-TK、AAV-gE和AAV-VP16 3組間的變化卻不明顯。24 h時(shí),AAV-TK、AAV-gE和AAV-VP16處理組的PRVIE180的拷貝數(shù)出現(xiàn)更為顯著的下降(P≤0.001)。

        **.P≤0.05; ***.P≤0.001

        2.3.3 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)降低了PRV對(duì)ST細(xì)胞致病性 ST細(xì)胞以5×105·mL-1的細(xì)胞濃度均勻鋪于6孔板中,在鋪板的同時(shí)分別加入1×108拷貝數(shù)的AAV-gE、AAV-TK和AAV-VP16,12 h后給細(xì)胞換液,并加入105TCID50的PRV處理細(xì)胞,每到一個(gè)時(shí)間梯度時(shí),在顯微鏡下觀察細(xì)胞狀態(tài)并拍照,做好標(biāo)記,記錄細(xì)胞的形態(tài)變化,結(jié)果發(fā)現(xiàn),與沒(méi)有處理過(guò)的細(xì)胞相比,12 h時(shí)不同AAV相關(guān)治療系統(tǒng)處理過(guò)的細(xì)胞的拉網(wǎng)、聚集及死亡現(xiàn)象明顯較少,細(xì)胞的病變整體較為輕微。

        如圖6所示,在24 h時(shí)可以觀察到大部分對(duì)照細(xì)胞已經(jīng)開(kāi)始病變(變圓),且可以觀察到漂在培養(yǎng)液中的死細(xì)胞,在40 h時(shí),細(xì)胞培養(yǎng)液變渾濁,細(xì)胞全部死亡,AAV-gE、AAV-TK和AAV-VP16接種組相對(duì)較好。

        圖6 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)降低了PRV對(duì)ST細(xì)胞致病性

        2.4 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)降低了PRV在小鼠體內(nèi)的增殖

        2.4.1 小鼠感染PRV半數(shù)致死量的測(cè)定 觀察并記錄小鼠每天的存活情況,并進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)分析,如圖7,從圖中可以看出PRV對(duì)小鼠的半數(shù)致死量為103.5TCID50。

        圖7 PRV對(duì)小鼠的半數(shù)致死量分析

        2.4.2 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)對(duì)感染PRV后小鼠“偽狂犬瘙癢癥”影響 豬的PRV宿主范圍較廣,可感染不同年齡的豬、牛、綿羊、犬、貓、水貂、雪貂、小鼠、大鼠和豚鼠等。在不同種屬間表現(xiàn)的臨床癥狀往往不一樣,哺乳小豬或斷奶小豬感染該病毒后常表現(xiàn)為腹瀉或部分有神經(jīng)癥狀。但小鼠感染該病毒則表現(xiàn)為明顯的瘙癢癥,尤其通過(guò)肌內(nèi)注射進(jìn)行感染試驗(yàn)時(shí),小鼠的瘙癢癥明顯。為了評(píng)估AAV攜帶的CRISPR系統(tǒng)對(duì)PRV的治療效果,本研究中記錄AAV攜帶的CRISPR系統(tǒng)對(duì)PRV的治療中各組小鼠的瘙癢癥狀,結(jié)果發(fā)現(xiàn)攻毒后注射1次的AAV-gE治療組小鼠有2只出現(xiàn)輕微的瘙癢癥狀(撓后腿)(表3,圖8b),而注射2次的則出現(xiàn)1只,注射3次的小鼠并沒(méi)有出現(xiàn)明顯的搔癢癥(表3)。另外一組,AAV-VP16組,注射1、2、3次則分別出現(xiàn)3、2和1只(表3,圖8 d)。而AAV-TK治療組,出現(xiàn)搔癢癥小鼠較少,只在注射治療1次組出現(xiàn)1只搔癢癥小鼠(表3),其他的小鼠則沒(méi)有明顯的搔癢癥表現(xiàn)。而對(duì)照組(未進(jìn)行治療)的小鼠全部出現(xiàn)搔癢癥(圖8a)。

        表3 重組腺聯(lián)病毒治療對(duì)小鼠“偽狂犬瘙癢癥”發(fā)生的影響

        a.未注射AAV;b.注射AAV 1次;c.注射AAV 2次;d.注射AAV 3次

        2.4.3 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)降低了PRV對(duì)小鼠致病性 經(jīng)AAV-TK治療1次的PRV感染小鼠(圖9a),100 h內(nèi),死亡5只,死亡時(shí)間推后約2 d(平均死亡時(shí)間46 h),且存活2只小鼠;經(jīng)AAV-TK治療2次的PRV感染小鼠則死亡4只,存活3只,且小鼠的死亡時(shí)間也是明顯推后(平均死亡時(shí)間82.5 h);而治療3次的小鼠,則全部存活,在100 h的觀察時(shí)間內(nèi)存活率最高,而且存活時(shí)間最長(zhǎng)。AAV-VP16治療組中注射1次AAV-VP16的僅有1只存活,注射2次AAV-VP16有2只存活,注射3次AAV-VP16則有5只存活(圖9b)。通過(guò)AAV-gE治療發(fā)現(xiàn),小鼠生存曲線如圖9c,從圖9c中可以看出AAV-gE注射2次的治療小鼠有2只小鼠存活,3次的則有6只存活,從圖9c中可以看出AAV-gE治療的小鼠存活狀況比不治療的小鼠情況略好些,在一定時(shí)間內(nèi)存活率略大些,存活時(shí)間也更久。從圖9中可以看出AAV-TK、AAV-VP16和AAV-gE組注射3次的小鼠存活率均超過(guò)70%,其中AAV-TK組達(dá)到100%的存活(100 h),這個(gè)結(jié)果說(shuō)明3次注射效果比1次和2次都好,且以AAV-TK組小鼠療效最好。只進(jìn)行AAV尾靜脈注射和注射DMEM與生理鹽水的小鼠全部存活,且很有活力,生理體征都正常。

        a.AAV-TK; b.AAV-VP16; c.AAV-gE

        2.4.4 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)對(duì)PRV感染小鼠的免疫器官的影響 AAV本身是DNA病毒,作為外源核酸病原體常引起小鼠的免疫應(yīng)答作用,從而導(dǎo)致小鼠免疫器官的變化。為了評(píng)估重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)是否對(duì)機(jī)體的免疫有上調(diào)作用,對(duì)注射不同次數(shù)腺病毒攜帶編輯質(zhì)粒的小鼠進(jìn)行麻醉,再用DEPC水對(duì)小鼠進(jìn)行灌注,然后再取脾,拍照并測(cè)量比對(duì),結(jié)果發(fā)現(xiàn)注射PRV的小鼠脾組織比只注射DMEM和生理鹽水的正常小鼠小,而只注射AAV的小鼠脾組織有些腫大。圖10a~c為相同注射次數(shù)的3種AAV治療小鼠脾組織的對(duì)比,可以看出用AAV-TK治療3次小鼠的脾大小和形狀最接近正常小鼠,而用AAV-gE和AAV-VP16治療的小鼠脾都有一定程度的萎縮,但是比單純注射PRV的小鼠好些,可見(jiàn)3種AAV對(duì)治療感染PRV的小鼠都有一定的療效,其中AAV-TK的治療效果最佳。圖10a~c分別為相同AAV不同注射次數(shù)的小鼠脾進(jìn)行對(duì)比,從圖中可以看出,AAV-TK和AAV-gE注射2次時(shí)小鼠的脾大小和形狀最接近正常小鼠,而AAV-VP16注射3次時(shí)小鼠脾最接近正常小鼠(圖10c)。

        a.注射AAV 1次;b.注射AAV 2次;c.注射AAV 3次

        2.4.5 重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)部分抑制PRV在小鼠腦組織中的復(fù)制 PRV是一種嗜神經(jīng)病毒,感染后在腦部組織的分布較高,可作為發(fā)病的指征。此外,小鼠感染PRV后,常表現(xiàn)為典型搔癢癥,因而本研究通過(guò)檢測(cè)小鼠的腦部組織病毒的載量,來(lái)初步評(píng)估重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)對(duì)PRV感染小鼠治療效果。用IE180引物和小鼠腦組織cDNA進(jìn)行Real-time PCR。結(jié)果如圖11,經(jīng)過(guò)重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)治療的小鼠,腦組織中病毒的拷貝數(shù)都比對(duì)照組低(P≤0.01)。經(jīng)過(guò)重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)治療的小鼠2次和3次的小鼠腦組織的病毒的拷貝數(shù)顯著比對(duì)照組低(P≤0.001)。此外,AAV-TK注射3次的治療組腦部組PRV量比AAV-gE組還低(P≤0.05)。這個(gè)結(jié)果表明重組腺聯(lián)病毒編輯系統(tǒng)對(duì)小鼠腦部PRV的載量有下調(diào)作用,而AAV-TK組的降低效果最為明顯。

        *.P≤0.05; P≤0.01; ***.P≤0.001

        3 討 論

        PRV感染在我國(guó)生豬養(yǎng)殖中較為普遍,且對(duì)生產(chǎn)影響較大。若要凈化PRV陽(yáng)性豬群,只能通過(guò)嚴(yán)格篩查并及時(shí)淘汰[18-21]。但該方法操作繁瑣,代價(jià)高,并不適合當(dāng)前生豬養(yǎng)殖。因而對(duì)于感染PRV的陽(yáng)性豬及陽(yáng)性豬場(chǎng),采取有效的治療手段是當(dāng)前降低生豬養(yǎng)殖虧損,促進(jìn)生豬產(chǎn)業(yè)發(fā)展的迫切需求。本試驗(yàn)中作者通過(guò)重組腺聯(lián)病毒載體轉(zhuǎn)運(yùn)CRISPR/Cas9系統(tǒng),進(jìn)入PRV感染小鼠體內(nèi),剪切PRV的毒力基因TK和gE,以及復(fù)制相關(guān)基因VP16,以期減弱PRV的毒力和復(fù)制能力,乃至清除小鼠體內(nèi)的病毒。據(jù)報(bào)道,CRISPR/Cas9系統(tǒng)不僅對(duì)動(dòng)物細(xì)胞、細(xì)菌和病毒能進(jìn)行實(shí)時(shí)靶向編輯,而且能夠用于動(dòng)物和部分人的胚胎基因編輯。此外,CRISPR/Cas9系統(tǒng)還成功地治療亨廷頓氏病(huntingtin基因突變引起的疾病)的小鼠,矯正了嚴(yán)重聯(lián)合免疫缺陷病[11-12]。本試驗(yàn)中作者利用重組腺聯(lián)病毒載體來(lái)轉(zhuǎn)運(yùn)CRISPR/Cas9系統(tǒng),明顯地減少了細(xì)胞和小鼠組織中PRVIE180的mRNA,抑制了PRV的復(fù)制和進(jìn)一步的繁殖。隨著冶療次數(shù)增加,細(xì)胞病變減少。小鼠典型“偽狂犬搔癢癥”明顯減輕,一定時(shí)間小鼠的存活時(shí)間和存活率都獲得提高,這個(gè)結(jié)果與預(yù)期一致。

        本研究應(yīng)用偽狂犬病病毒IE180基因作為評(píng)估重組腺聯(lián)病毒載體編輯系統(tǒng)的治療效果,主要是因?yàn)橹坝醒芯繄?bào)道,偽狂犬病病毒只含一個(gè)立即早期基因,即IE180基因,該基因?qū)Σ《驹趧?dòng)物體內(nèi)的復(fù)制至關(guān)重要[22],只有IE180基因開(kāi)放轉(zhuǎn)錄,并翻譯成IE180蛋白,其下游的基因才能在IE180蛋白的激活作用下得以完全開(kāi)放轉(zhuǎn)錄,否則病毒復(fù)制將不能完成。IE180基因的表達(dá)產(chǎn)物IE180蛋白是一個(gè)多功能蛋白,不僅能激活同源蛋白基因啟動(dòng)子,而且能激活某些異源蛋白基因啟動(dòng)子[23-26]。細(xì)胞試驗(yàn)表明,IE180拷貝數(shù)低的處理組,其細(xì)胞的病變也較輕;通過(guò)評(píng)價(jià)感染PRV小鼠和治療組小鼠的存活率、存活時(shí)間以及體征,作者發(fā)現(xiàn)PRV的IE180較低組,其小鼠成活率較高,死亡率較低,小鼠出現(xiàn)搔癢癥的現(xiàn)象也明顯減少;防治效果和治療的次數(shù)成正比。這進(jìn)一步證實(shí),該小鼠模型的結(jié)果對(duì)當(dāng)前陽(yáng)性PRV豬的治療有一定的借鑒作用。

        研究中還發(fā)現(xiàn),雖然運(yùn)載有三種重組CRISPR/Cas-sgRNA表達(dá)系統(tǒng)的AAV由于自身具有免疫原性,在一定程度上引起了小鼠機(jī)體內(nèi)的免疫反應(yīng),但對(duì)小鼠并沒(méi)有致病性傷害,且對(duì)PRV感染小鼠有一定的治療效果。其中,AAV-TK和AAV-VP16治療組小鼠注射2次時(shí)的治療效果最好,AAV-gE治療組小鼠的治療效果較差。作者還對(duì)比了不同AAV注射不同次數(shù)治療小鼠的脾組織,發(fā)現(xiàn)PRV感染小鼠的脾出現(xiàn)嚴(yán)重萎縮,而經(jīng)過(guò)AAV治療后的小鼠脾組織萎縮有明顯改善。

        應(yīng)用重組腺聯(lián)病毒載體運(yùn)載CRISPR/Cas9系統(tǒng)治療PRV感染是可行的。AAV-TK和AAV-gE減弱PRV毒性,而AAV-VP16抑制PRV的復(fù)制,3種AAV治療PRV感染都有一定的效果。在3種AAV的治療結(jié)果中,注射3次AAV的治療比注射1和2次的效果好。由于小鼠試驗(yàn)重復(fù)次數(shù)有限,體內(nèi)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)尚且不明確,有可能和豬體內(nèi)的效果不完全一致,因此該方法在豬的治療效果尚有待進(jìn)一步研究。

        4 結(jié) 論

        重組腺聯(lián)病毒載體編輯系統(tǒng)用于感染PRV的ST細(xì)胞,能明顯減緩和減輕ST細(xì)胞病變;用于PRV感染小鼠,可降低感染小鼠的死亡率、延長(zhǎng)存活時(shí)間,提高成活率,減輕搔癢癥,治療效果和治療次數(shù)成正比。

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