鐘志濤,洪義,黃浩峰,趙敏
(中國醫(yī)科大學(xué)附屬盛京醫(yī)院急診科,沈陽 110004)
有機(jī)磷中毒是臨床常見的急危重癥,具有發(fā)病快、病情變化迅速、死亡率高等特點[1]。主要臨床表現(xiàn)為乙酰膽堿酯酶(acetylcholinesterase,AChE) 活性嚴(yán)重降低,毒蕈堿樣、煙堿樣癥狀及中樞神經(jīng)系統(tǒng)等癥狀,以及各種原因誘導(dǎo)的全身多臟器功能損傷。臨床上有機(jī)磷中毒采用復(fù)能劑、阿托品等對癥治療方案[2]。
血必凈注射液組方為紅花、赤芍、川芎、丹參和當(dāng)歸,具有活血化瘀、扶正固本、清熱解毒等功效,對全身炎癥反應(yīng)綜合征、膿毒血癥有一定的治療作用[3-4]。有研究[5]表明血必凈注射液能抑制有機(jī)磷中毒全身炎癥反應(yīng)、減輕心血管損傷、改善凝血功能等作用。血必凈注射液與血液凈化、復(fù)能劑等聯(lián)合使用能夠改善患者預(yù)后及減少并發(fā)癥的發(fā)生[6]。
目前,有機(jī)磷中毒重癥患者仍缺乏有效及時的藥物檢測方法,難以準(zhǔn)確調(diào)控“阿托品化”劑量。因此多種藥物聯(lián)合安全有效治療有機(jī)磷中毒尤為重要。本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué),對血必凈注射液與有機(jī)磷中毒的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)關(guān)系進(jìn)行分析,探討血必凈注射液治療有機(jī)磷中毒的分子機(jī)制,旨在為闡明血必凈注射液治療機(jī)制提供參考。
以“紅花”“川芎”“赤芍”“丹參”和“當(dāng)歸”五味中藥材名稱在TCMSP數(shù)據(jù)庫(https://tcmspw.com/tcmsp.php) “Herbname” 中進(jìn)行檢索,通過口服生物利用度(oral bioavailability,OB)、類藥性(druglike,DL) 對材料進(jìn)行整理獲得藥物活性成分,通過TCMSP數(shù)據(jù)庫收集的活性成分導(dǎo)入Uniprot數(shù)據(jù)庫(https://www.uniprot.org/) 中得到血必凈注射液藥物靶點的基因名稱。以“organophosphorus pesticide poisoning”在GeneCards數(shù)據(jù)庫(https://www.genecards.org) 和OMIM數(shù)據(jù)庫(https://www.omim.org) 中檢索,收集有機(jī)磷中毒基因靶點并整理。
1.2.1 交集靶點獲?。簩⒀貎糇⑸湟核幬锘钚猿煞职悬c及有機(jī)磷中毒相關(guān)基因靶點導(dǎo)入在線工具Venny2.1(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/),制作活性成分靶點和有機(jī)磷中毒靶點的韋恩圖,獲得其共同靶點基因,探究血必凈注射液對有機(jī)磷中毒治療的作用靶點。
1.2.2 活性成分-交集靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建:將血必凈注射液藥物活性成分、各類藥物名稱、相關(guān)靶點及有機(jī)磷中毒相關(guān)基因等導(dǎo)入Cytoscape3.7軟件,構(gòu)建活性成分-交集靶點網(wǎng)絡(luò),使用Cytoscape3.7軟件中“Network Analyzer”計算連接度值,連接度值越高,表示其在網(wǎng)絡(luò)圖中的重要性越大,可能在疾病治療中發(fā)揮的作用也越大。
1.2.3 蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI) 網(wǎng)絡(luò)制作:在STRING數(shù)據(jù)庫(http://string-db.org)中導(dǎo)入藥物和疾病的交集靶點基因,以“homosapiens”為檢索物種,置信度≥0.4篩選數(shù)據(jù),獲得并導(dǎo)出PPI網(wǎng)絡(luò)圖,將STRING數(shù)據(jù)庫檢索數(shù)據(jù)導(dǎo)出,整理并篩選出重要蛋白。
1.2.4 交集靶點的富集分析:在DAVID數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/) 中將1.2.1獲取的交集靶點基因?qū)氩⑦M(jìn)行檢索,進(jìn)行基因本體(gene ontology,GO) 分析和京都基因與基因組百科全書(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG) 通路富集分析,篩選整理排序前20位關(guān)系密切的相關(guān)富集分析結(jié)果,采用R-studio軟件制作成柱狀圖。
以O(shè)B≥30%和DL≥0.18篩選TCMSP數(shù)據(jù)庫中血必凈注射液藥物活性成分,最后得到125個活性成分。OB值排序前15位(從高到低) 的活性成分見表1。
表1 血必凈注射液部分活性成分Tab.1 Some active ingredients in Xuebijing injection
將血必凈注射液活性成分導(dǎo)入Uniprot數(shù)據(jù)庫獲得靶點217個,從GeneCards、OMIM數(shù)據(jù)庫檢索有機(jī)磷中毒獲得相關(guān)靶點279個,用Venny2.1繪制血必凈注射液與有機(jī)磷中毒交集靶點,最終得到69個共同靶點,這些共同靶點可能為血必凈注射液治療有機(jī)磷中毒的潛在靶點。
在Cytoscape3.7軟件中導(dǎo)入血必凈注射液與有機(jī)磷中毒交集靶點關(guān)系,繪制活性成分-交集靶點的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系,見圖1。以連接度值大小排序,槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇位于前三位,分別為52、51、28,表明這3個活性成分可能是血必凈注射液治療有機(jī)磷中毒的重要核心藥物活性成分。PTGS1、AR、ACHE為排名前三位的交集靶點基因,連接度值分別為42、27、27,表明這3個靶點基因可能是重要的治療靶點基因,CHRM2、ESR1、OPRD1、PPARG、CASP3、SLC6A3等基因也有較大的連接度值。
圖1 血必凈注射液活性成分-交集靶點網(wǎng)絡(luò)圖Fig.1 The active ingredient-intersection target network of Xuebijing injection
將血必凈注射液與有機(jī)磷中毒交集靶點導(dǎo)入STRING數(shù)據(jù)庫中,獲得交集蛋白相互作用關(guān)系,見圖2。通過導(dǎo)出String數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù),根據(jù)Betweenness Centrality、Closeness Centrality的均值篩選,結(jié)果顯示AKT1、ALB、CAT、CASP3、JUN、VEGFA等靶點連接度值較大,這些靶點可能在治療有機(jī)磷中毒中發(fā)揮重要作用。
圖2 PPI網(wǎng)絡(luò)分析圖Fig.2 Protein-protein interaction diagram
在DAVID數(shù)據(jù)庫中導(dǎo)入交集靶點進(jìn)行分析,如圖3所示,得到GO富集分析 1 217個,KEGG代謝通路144條。生物過程(biological process,BP) 1 122個,其中化學(xué)物質(zhì)反應(yīng),氧化應(yīng)激反應(yīng)、活性氧反應(yīng)、抗生素反應(yīng)等富集程度較大;細(xì)胞組成(cellular component,CC) 28個,其中脂筏、膜微結(jié)構(gòu)域、囊腔、分泌顆粒內(nèi)腔等富集程度較大;分子功能(molecular function,MF) 67個,其中血紅素結(jié)合、四吡咯結(jié)合、磷酸酶結(jié)合、氧化還原酶活性、DNA結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合等富集程度較大。KEGG排名前20條通路見圖4,包括流體剪切應(yīng)力和動脈粥樣硬化、乙型肝炎、結(jié)腸直腸癌、膀胱癌、IL-17信號通路、前列腺癌、內(nèi)分泌抵抗、糖尿病并發(fā)癥年齡-年齡信號通路、卡波濟(jì)肉瘤相關(guān)皰疹病毒感染、細(xì)胞凋亡、胰腺癌、鉑耐藥、美洲錐蟲病、丙型肝炎、人類巨細(xì)胞病毒感染、T細(xì)胞受體信號通路、麻疹、腫瘤壞死因子信號通路、弓形蟲病、沙門氏菌感染等,血必凈注射液可能通過這些通路起到治療有機(jī)磷中毒的作用。
圖3 GO富集分析Fig.3 GO enrichment analysis
圖4 KEGG富集分析Fig.4 KEGG enrichment analysis
利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)對藥物與疾病潛在的關(guān)系網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析,能夠促進(jìn)藥物的研發(fā)和疾病的治療[7]。本研究結(jié)果顯示,有機(jī)磷中毒機(jī)制不限于對AChE的抑制,另一個重要機(jī)制是有機(jī)磷能誘導(dǎo)機(jī)體氧化損傷[8-9]。機(jī)體產(chǎn)生活性氧簇(reactive oxygen species,ROS) 造成臟器直接損傷,還可介導(dǎo)信號通路生成炎癥介質(zhì),加重各器官損傷[10-11]。經(jīng)現(xiàn)代藥理證實,血必凈注射液具有改善微循環(huán)、抗炎、抗氧化、抑制炎癥介質(zhì)聚集與炎癥反應(yīng)等功效,有助于抑制血小板聚集、調(diào)節(jié)機(jī)體免疫反應(yīng)和改善血管內(nèi)皮功能[1,12]。
本研究發(fā)現(xiàn)血必凈注射液治療有機(jī)磷中毒的主要核心活性成分為槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇等。槲皮素可能通過多種途徑減少氧化應(yīng)激對細(xì)胞的損傷。盧春鳳等[13]發(fā)現(xiàn)槲皮素能減少氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的肝細(xì)胞損傷,可能與提高下游抗氧化基因的表達(dá)有關(guān),從而抑制肝細(xì)胞凋亡。李冬梅等[14]發(fā)現(xiàn)槲皮素通過下調(diào)心肌髓過氧化物酶(myeloperoxidase,MPO) 活性和心肌NF-κB的表達(dá),對心肌產(chǎn)生保護(hù)效果。BAO 等[15]用槲皮素處理H2O2誘導(dǎo)的大鼠嗜鉻細(xì)胞瘤PC-12細(xì)胞,能提高細(xì)胞的生存能力,減少細(xì)胞和海馬神經(jīng)元的凋亡,說明槲皮素能減少PC-12細(xì)胞對氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的凋亡。
木犀草素是一種天然類黃酮化合物,結(jié)構(gòu)中含有的酚羥基基團(tuán)有較強(qiáng)的還原性,從而使木犀草素具有抗氧化特性[16]。SEELINGER等[17]發(fā)現(xiàn)木犀草素可減少誘導(dǎo)型一氧化氮合酶(inducible nitric oxide synthase,iNOS) 的作用,降低iNOS的表達(dá)和一氧化氮(nitric oxide,NO) 產(chǎn)生。研究[18]發(fā)現(xiàn)木犀草素能夠抑制多種白細(xì)胞介素(interleukin,IL) 因子(IL-6等)、粒細(xì)胞-巨噬細(xì)胞集落刺激因子(granulocyte-macrophage colony stimulating factor,GM-CSF) 等多種因子,增強(qiáng)IL-10的表達(dá)而發(fā)揮抗炎作用。
已有研究發(fā)現(xiàn)β-谷甾醇在抗氧化、抗炎、免疫調(diào)節(jié)等多個方面表現(xiàn)出良好的藥理作用。VALERIO等[19]認(rèn)為β-谷甾醇可以提高脂多糖誘導(dǎo)的J774A1巨噬細(xì)胞抗炎因子IL-10的活性,下調(diào)趨化因子、促炎性細(xì)胞因子的表達(dá),發(fā)揮抗炎作用。CHOI等[20]認(rèn)為β-谷甾醇減少NO合成,IL-1、腫瘤壞死因子等炎性細(xì)胞因子的分泌,抑制IL-6活性來發(fā)揮抗炎作用。
活性成分-交集靶點圖與PPI網(wǎng)絡(luò)圖顯示AKT1、ALB、CAT、CASP3、JUN、VEGFA等可能是血必凈注射液治療有機(jī)磷中毒的重要靶點蛋白,目前相關(guān)蛋白與血必凈注射液、有機(jī)磷中毒的研究較少。KEGG通路分析提示血必凈注射液治療有機(jī)磷中毒相關(guān)通路涉及流體剪切應(yīng)力和動脈粥樣硬化、IL-17信號通路、內(nèi)分泌抵抗、細(xì)胞凋亡、T細(xì)胞受體信號通路、腫瘤壞死因子信號通路等,這與現(xiàn)代藥理證實的部分作用相符合[1],表明血必凈注射液可能通過多通路、多信號對有機(jī)磷中毒產(chǎn)生積極影響。
綜上所述,本研究基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析了血必凈注射液與有機(jī)磷中毒的作用關(guān)系,從“多成分、多靶點”角度揭示了其可能的分子機(jī)制,認(rèn)為血必凈注射液可能通過作用于AKT1、ALB、CAT、CASP3、JUN、VEGFA等關(guān)鍵靶點基因,調(diào)控流體剪切應(yīng)力和動脈粥樣硬化、IL-17信號通路、腫瘤壞死因子信號通路等來發(fā)揮治療效果。本研究結(jié)論是基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)原理,通過提取數(shù)據(jù)庫信息整理、分析而獲得,與實際作用機(jī)制可能存在差異,因此需要進(jìn)一步實驗來驗證。