楊佳慧 孫玉萍 陸雅寧 劉歡 盧存福 陳玉珍
(北京林業(yè)大學生物科學與生物技術學院 教育部林木花卉育種與基因工程重點實驗室,北京 100083)
端粒酶的生物學功能研究在寄生蟲[14]、老鼠[15]、人[16]等領域取得較大進展。植物端粒酶的研究最初是在煙草細胞的提取物中檢測到端粒酶活性[17];并首次從擬南芥懸浮細胞中克隆出擬南芥AtTERT的cDNA,端粒酶分子量131 kD,等電點9.9[18];Heller-Uszynska等[19]采用同源序列比對的方法克隆出單子葉植物水稻中的端粒酶逆轉(zhuǎn)錄酶基因,為植物端粒酶功能研究奠定了基礎。端粒酶的研究在非模式植物中取得較大進展,建立了不同植物材料端粒酶活性檢測方法[20-21]。已有研究表明,在大腸桿菌中可成功表達出有活性的逆轉(zhuǎn)錄酶,Tanese等[22]構(gòu)建了莫洛尼鼠白血病病毒的pol核心區(qū)域的表達載體,在大腸桿菌中成功表達出具有活性逆轉(zhuǎn)錄酶。
目前,人hTERT已在大腸桿菌中實現(xiàn)活性重建[23],但尚未見植物TERT在大腸桿菌中發(fā)揮功能的報道。本研究擬在前期研究基礎上,將擬南芥AtTERT轉(zhuǎn)入大腸桿菌中,誘導表達可溶性AtTERT蛋白,研究其對大腸桿菌生長及非生物脅迫的影響,為深入研究TERT蛋白非端粒功能奠定基礎。
所用植物材料為哥倫比亞(Col-0)擬南芥。菌株為實驗室保存的轉(zhuǎn)pET32a-AtTERT原核表達菌株。
IPTG、考馬斯亮藍、GST親和層析純化試劑、鎳柱親和層析純化試劑、Western blotting相關試劑及試劑盒均購自北京拜爾迪生物科技公司。
1.2.1 原核表達載體構(gòu)建與遺傳轉(zhuǎn)化 引物設計:利用Primer5軟件分析AtTERT的CDS序列,結(jié)合pET32a和pGEX-4T-1原核表達載體上的多克隆位點信息,確定酶切位點BamH I和NotI。使用軟件CE Design(http://www.vazyme.com)設計引物,pGEX-4T-1和pET32a對應的引物分別為GST-F/R和32-F/R(32-F:5′-gccatggctgatatcggatccATGCCGCGTAA ACCTAGACATC-3′、32-R:5′-tggtggtgctcgagtgcggccgc ATAATTCAACTTCCACAGCGAAG-3′;GST-F:5′-gat ctggttccgcgtggatccATGCCGCGTAAACCTAGACATC-3′、GST-R:5′-tcagtcagtcacgatgcggccgcTCAATAATTCAA CTTCCACAGCGA-3′;小寫字母代表載體序列引物部分)。
目的基因的PCR擴增:提取保存測序正確的AtTERT克隆菌株質(zhì)粒,作為PCR擴增模板,以32a-F/GST-F及引物32a-R/GST-R為引物進行PCR擴增,切膠回收目的基因片段。
1.2.1受試者檢查方法 對受試者開展常規(guī)治療。例如胃腸道減壓、及時抗感染等等。分別使用彩色多普勒超聲診斷設備以及多功能直接數(shù)字化X線成像系統(tǒng),對患兒開展檢查。受試者取仰臥位,多切面掃查患兒腹部。開展實時監(jiān)控腸壁回聲,全面判定腸壁厚度和腸管外形形狀情況對受試者的腸腔、門靜脈以及腹腔加以觀察,分析是否存在異?,F(xiàn)象。例如擴張積液等等[3]。在此之后,對患兒腹部開展橫向以及縱向掃描檢查,以免發(fā)生積氣假象現(xiàn)象發(fā)生。對探頭加壓,分析積氣來源。全面明確病變位置位于管壁內(nèi)還是管腔中。使用陽性以及陰性,來表示X線檢查和超聲診斷結(jié)果。陽性代表腸壁內(nèi)存在積氣。陰性代表腸壁積氣、腸壁增厚以及門靜脈積氣等均未出現(xiàn)。
載體構(gòu)建:提取pET32a和pGEX-4T-1空載體質(zhì)粒,利用BamH I和NotI進行酶切,然后與目的基因片段重組連接,構(gòu)建原核表達載體pET32a-AtTERT和pGEX-4T-1-AtTERT,并轉(zhuǎn)化Trans5α感受態(tài)細胞進行PCR鑒定。
遺傳轉(zhuǎn)化:選取測序結(jié)果正確的重組質(zhì)粒菌液,轉(zhuǎn)化Transetta(DE3)感受態(tài)細胞中,獲得轉(zhuǎn)化表達菌株。
1.2.2 AtTERT蛋白的誘導表達 融合蛋白誘導表達:將陽性重組菌及空載菌液置于37℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)至對數(shù)期(OD600=0.6-0.8);加入終濃度為1.0 mmol/L IPTG誘導12 h,以不加IPTG作為對照。
樣品制備:收集菌體,使用細胞破碎儀破碎菌體至菌液澄清,并進行SDS-PAGE檢測,融合蛋白純化試驗在4℃條件下操作。
Western blotting檢測:將經(jīng)SDS-PAGE電泳分離蛋白樣品電轉(zhuǎn)至0.45 μm硝酸纖維素膜上,加入一抗(HIS抗體)、二抗(羊抗鼠的辣根過氧化物酶HRP抗體),洗膜、拍照。
1.2.3 轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌的非生物脅迫抗性檢測 轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌的生長特性:將對照菌pET32a及轉(zhuǎn)AtTERT重組菌以1∶100的比例接種至新鮮50 mL LB液體培養(yǎng)基(含有終濃度0.5 mmol/L IPTG),誘導至菌液濃度為OD600=0.6,此時記為初始濃度,繼續(xù)震蕩培養(yǎng),在2、4、6、8、10和12 h時測量OD600值,做好記錄,并做成曲線。
對照菌pET32a及轉(zhuǎn)AtTERT重組菌活化后,加入終濃度為0.5 mmol/L IPTG,20℃、100 r/min過夜誘導培養(yǎng);將2種菌稀釋至相同濃度(OD600=1.2),進行不同非生物脅迫抗性檢測存活率,試驗重復3次。
氯化鈉、甘露醇抗性檢測:經(jīng)實驗室前期預試驗,確定氯化鈉的處理濃度為400和500 mmol/L,甘露醇的處理濃度為400和600 mmol/L。取6 μL兩種菌液分別垂直加到LB固體培養(yǎng)基(含有0.5 mmol/L IPTG和NaCl/甘露醇)上,37℃,倒置培養(yǎng)12 h,按照計數(shù)法統(tǒng)計存活率。
低溫抗性檢測:取1 mL的2種菌液于液氮中反復凍融5-6次,然后取6 μL分別垂直加到LB固體培養(yǎng)基(含有0.5 mmol/L IPTG)上,37℃,倒置培養(yǎng)12 h,統(tǒng)計存活率。
過氧化氫(H2O2)耐受性檢測:采用點板計數(shù)法,取6 μL計數(shù)法準備的2種菌液分別垂直加到LB固體培養(yǎng)基(含有0.4 mmol/L H2O2)上,37℃,倒置培養(yǎng)12 h,統(tǒng)計存活率。
提取測序正確的菌株質(zhì)粒作為模板進行PCR擴增(圖1),以帶有15-20 bp載體序列的引物進行PCR擴增,獲得目的基因片段,片段大小與預期一致,為3 409 bp。
圖1 AtTERT的PCR擴增Fig. 1 PCR amplification of AtTERT gene
將測序正確的菌液提取質(zhì)粒,并用BamH I及NotI酶切鑒定,酶切后片段大小與目的基因片段一致(圖2),說明pET32a/ pGEX-4T-1-AtTERT原核表達載體構(gòu)建成功。
圖2 pET32a/ pGEX-4T-1-AtTERT重組質(zhì)粒的酶切鑒定Fig.2 Double digestion identification of pET32a/ pGEX-4T-1-AtTERT
2.2.1 誘導表達 GST-AtTERT融合蛋白條件的優(yōu)化 用Transetta(DE3)感受態(tài)細胞對蛋白誘導表達的IPTG濃度(0.3/0.5/1.0 mmol/L)及溫度(20/30℃)進行了優(yōu)化(圖3),在溫度為20℃時特異性蛋白的表達量明顯高于30℃時。在誘導溫度為30℃,IPTG濃度為0.5 和1.0 mmol/L時,特異性蛋白條帶在上清及沉淀中均有表達,但主要存在于沉淀中;而在溫度為20℃,IPTG濃度為0.3、0.5和1.0 mmol/L時,特異性蛋白條帶在上清及沉淀中均有表達,但主要存在于上清中,而且在IPTG濃度為0.5 mmol/L時,上清中蛋白表達量相對較高。因此,優(yōu)化后的蛋白誘導條件為誘導溫度20℃,誘導劑(IPTG)濃度0.5 mmol/L。
圖3 GST-TERT蛋白的SDS-PAGE檢測Fig. 3 Detection of GST-TERT protein by SDS-PAGE
2.2.2 GST-AtTERT融合蛋白的純化及鑒定 為驗證SDS-PAGE中的特異性蛋白條帶是否為帶有GST標簽的目的蛋白,利用融合蛋白中的GST標簽對全菌液、上清、沉淀及純化后組分進行了Western blotting驗證,結(jié)果(圖4)顯示,在誘導全菌、上清及沉淀中均出現(xiàn)與預期蛋白相對分子量大小相符的條帶,為156 kD,與SDS-PADG分析結(jié)果一致。
圖4 Western blotting鑒定GST-AtTERT融合蛋白Fig. 4 Western blotting identification of GST-AtTERT fusion protein
2.3.1AtTERT抑制大腸桿菌的生長 為研究AtTERT對大腸桿菌生長特性的影響,測定空載對照菌(pET32a)和轉(zhuǎn)AtTERT重組菌在同等條件下的生長狀況,結(jié)果(圖5)顯示,兩種菌株均呈現(xiàn)“S”型生長趨勢,在生長4-10 h時,空載對照菌的生長速度總是顯著高于轉(zhuǎn)AtTERT重組菌;在生長10-12 h時,空載對照菌生長速度趨于平緩,而轉(zhuǎn)基因重組菌生長仍然相對較快,兩者菌濃度差距變小但空載對照菌的菌濃度仍然顯著高于轉(zhuǎn)基因重組菌,說明AtTERT抑制了大腸桿菌的生長。
圖5 AtTERT對大腸桿菌生長特性的影響Fig.5 Effect of AtTERT on the growth characteristics of E.coli
2.3.2 轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌的鹽脅迫抗性增強 為研究轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌對鹽脅迫抗性的影響,采用點板法對轉(zhuǎn)AtTERT重組菌和空載體對照菌進行了NaCl抗性檢測,結(jié)果表明,對照菌和重組菌在空白LB基本固體培養(yǎng)基(0 mmol/L NaCl)上生長良好且無顯著差異;但采用400和500 mmol/L NaCl處理時,轉(zhuǎn)AtTERT重組菌存活率顯著高于空載對照菌(圖6),說明轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌的鹽脅迫抗性增強。
圖6 鹽脅迫下AtTERT對大腸桿菌存活率的影響Fig.6 Effect of AtTERT on the survival rate of E. coli under salt stress
2.3.3 轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌甘露醇脅迫抗性增強 采用點板法對轉(zhuǎn)AtTERT重組菌和空載體對照菌進行了甘露醇脅迫處理,發(fā)現(xiàn)對照菌和重組菌在空白LB基本固體培養(yǎng)基上生長良好且無顯著差異;但經(jīng)400和600 mmol/L甘露醇處理時,轉(zhuǎn)AtTERT重組菌存活率明顯高于空載對照菌(圖7),故轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌甘露醇脅迫抗性增強。
圖7 甘露醇脅迫下AtTERT對大腸桿菌存活率的影響Fig.7 Effect of AtTERT on the survival rate of E. coli under mannitol stress
2.3.4 轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌低溫抗性減弱 為研究轉(zhuǎn)AtTERT對大腸桿菌低溫脅迫抗性的影響,采用點板法對轉(zhuǎn)AtTERT重組菌和空載體對照菌進行了液氮反復凍融處理,結(jié)果(圖8)表明,對照菌和重組菌在LB基本固體培養(yǎng)基上生長良好且無顯著差異;經(jīng)過液氮反復凍融5次時,兩者的存活率沒有顯著差異,但是液氮反復凍融6次時,轉(zhuǎn)AtTERT重組菌存活率顯著低于空載對照菌,說明轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌低溫抗性減弱。
圖8 低溫脅迫下AtTERT對大腸桿菌存活率的影響Fig.8 Effect of AtTERT on the survival rate of E. coli under cold stress
2.3.5 轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌H2O2耐受性增強 為研究轉(zhuǎn)AtTERT對大腸桿菌H2O2耐受性影響,采用點板技術法及在菌液中直接添加H2O2測定菌液OD600值2種方法(圖9)。點板法結(jié)果顯示,對照菌和重組菌在空白LB固體培養(yǎng)基上生長良好且無顯著差異;但是在含有H2O2的LB固體培養(yǎng)基上生長狀況顯著高于空載對照菌(圖9-B)。
圖9 H2O2脅迫下AtTERT對大腸桿菌存活率的影響Fig. 9 Effect of AtTERT on the survival rate of E. coli under hydrogen peroxide stress
端粒酶是基本的核蛋白逆轉(zhuǎn)錄酶,在真核細胞中負責端粒延長,把DNA復制損失的端粒填補起來,使端粒不會因細胞分裂而有所損耗,端粒酶在保持端粒穩(wěn)定、基因組完整、細胞長期的活性和潛在的繼續(xù)增殖能力等方面具有重要作用[3-5]。已有研究表明,端粒酶除具有端粒DNA的合成作用外,還具有非端粒功能[7],生命活動的多種應激反應與TERT介導相關,如調(diào)節(jié)與細胞增殖和分化有關的基因表達[24],改善DNA損傷修復[25-26],增加細胞凋亡抗性[27]或減少凋亡信號傳導[28]等。在研究模式植物擬南芥AtTERT功能時發(fā)現(xiàn),由AtTERT生物學功能網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)可推測,AtTERT和多種蛋白相互作用,這些蛋白中部分參與維持端粒長度,具有保護端粒末端結(jié)構(gòu)的作用,值得關注的是SMG7可能在植物防御中發(fā)揮作用,這表明擬南芥AtTERT如同動物等TERT,除具有合成端粒末端結(jié)構(gòu)生物學功能外,還可行使其非端粒的生物學功能[29-32]。
Fojtová等[33]研究重金屬鎘脅迫與DNA修復時發(fā)現(xiàn),大部分DNA鏈斷裂在脫鎘48 h內(nèi)得到修復,端粒酶活性在恢復期增加了2.5倍,表明端粒酶可能與DNA修復有關,認為植物可能已經(jīng)建立了一套高效的DNA修復系統(tǒng)來應對短暫的環(huán)境脅迫。吳曉飛等[34]以胡楊(Populus euphratica)和合作楊(P.simonii×P. pyramibalis)懸浮細胞為材料,0和20 mmol/L H2O2處理提高胡楊細胞端粒酶活性,而合作楊端粒酶對H2O2不敏感,研究認為抗鹽性強胡楊細胞的端粒酶對抵御其細胞內(nèi)氧化損傷具有一定作用。張徐俞等[32]發(fā)現(xiàn),采用500 mmol/L高濃度鹽脅迫時,初期端粒酶活性迅速增加,但隨后端粒酶活性下降;當高鹽處理后移除 NaCl 脅迫,端粒酶活性可增加1.4倍,且DNA穩(wěn)定性提高;同時孫麗春等[35]采用熒光定量PCR檢測到,高鹽、干旱、高熱及低溫脅迫均能導致沙冬青幼苗根和葉中AmTERT的表達量升高,表明植物細胞端粒酶可能和動物細胞一樣具有應激保護功能。王楊等[36]發(fā)現(xiàn),采用濃度100 mmol/L NaCl處理模式植物擬南芥幼苗3 d時,其端粒酶活性升高,鹽處理時間延長端粒酶活性下降;同時AtTERT表達量也呈現(xiàn)先升高后降低的規(guī)律性變化,這些抗性結(jié)果說明,雖然不同物種對不同脅迫處理抗性程度表現(xiàn)不同,但在一定脅迫范圍內(nèi),植物抗性應激反應與其端粒酶活性及TERT的表達量密切相關。
端粒酶的生物發(fā)生是一個高度調(diào)控的過程,解決了DNA的末端復制問題,但這些研究均是在真核生物背景下完成。Hansen等[23]為了揭示TERT的結(jié)構(gòu)和功能,進行了人類端粒酶在原核生物中的表達研究,在表達序列優(yōu)化的hTERT基因大腸桿菌細胞提取物中,檢測到端粒酶重復擴增(TRAP)陽性活性,尤其是終點TRAP顯示的表達水平是HeLa癌細胞的3倍,這些結(jié)果首次報道了來自細菌的TRAP活性,并為獨立于真核環(huán)境的組裝因子和抗癌治療的研究提供了一個簡便的系統(tǒng)。而植物TERT在大腸桿菌中的表達還未見報道,本研究將擬南芥AtTERT成功轉(zhuǎn)入大腸桿菌中,構(gòu)建了pET32a-AtTERT原核表達載體,并優(yōu)化了AtTERT蛋白誘導條件,獲得了純化GST-AtTERT融合蛋白(156 kD);同時檢測了轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌的非生物脅迫抗性:轉(zhuǎn)AtTERT重組菌在NaCl(400 和500 mmol/L)、甘露醇(400和600 mmol/L)和H2O2(0.4 mmol/L)的LB固體培養(yǎng)基上的存活率顯著高于空載對照菌LB固體培養(yǎng)基上的存活率,結(jié)果表明,轉(zhuǎn)AtTERT大腸桿菌NaCl鹽脅迫、甘露醇滲透脅迫、H2O2氧化脅迫抗性增強,表明擬南芥AtTERT具有提高大腸桿菌的鹽滲透脅迫抗性及氧化應激能力。Ahmed等[29]在細胞中過表達hTERT時發(fā)現(xiàn),線粒體膜電位增加,線粒體超氧化物產(chǎn)生和細胞過氧化物水平降低及mtDNA受到保護,但TERT在大腸桿菌中如何參與非生物脅迫過程減少ROS的形成、保護DNA完整性、增強細胞凋亡抗性以及調(diào)控相關基因表達等還有待于進一步深入研究。
優(yōu)化AtTERT蛋白誘導條件,獲得156 kD純化GST-AtTERT融合蛋白,轉(zhuǎn)AtTERT重組大腸桿菌獲得多種非生物脅迫抗性,表明擬南芥AtTERT具有抗非生物脅迫的非端粒功能。