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        MALDI-TOF-MS方法快速鑒定食品中空腸彎曲菌的技術(shù)研究

        2022-03-04 11:23:26吳福平吳瑜凡崔思宇邵景東
        工業(yè)微生物 2022年1期
        關(guān)鍵詞:近緣傳代甲酸

        吳福平, 吳瑜凡, 崔思宇, 邵景東

        1.張家港檢驗認(rèn)證有限公司,張家港 215600; 2.張家港海關(guān)綜合技術(shù)中心,張家港 215600; 3.華東理工大學(xué)分析測試中心,上海 200237; 4.常州經(jīng)濟開發(fā)區(qū)環(huán)境衛(wèi)生管理處,常州 213000

        空腸彎曲菌(Campylobacterjejuni,C.jejuni)是革蘭氏陰性菌,菌體彎曲小逗點狀,微需氧,是目前主要食源性病原菌之一,可引起人及動物多種疾病,主要癥狀為腹瀉性腸炎,被認(rèn)為是細(xì)菌性腹瀉的主要原因[1-3]。

        目前,空腸彎曲菌鑒定方面主要依據(jù)GB/T 4789.9—2014《食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗 空腸彎曲菌檢驗》的傳統(tǒng)生化來進行,檢測時間較長,且對于深加工食品中由于細(xì)菌受到損傷從而導(dǎo)致檢測難度加大。隨著分子生物學(xué)技術(shù)的發(fā)展,熒光定量PCR、16S rRNA基因測序技術(shù)、多重PCR法及變形高效液相色譜等方法也越來越多的應(yīng)用于空腸彎曲菌的檢測,這些方法對于空腸彎曲菌的快速鑒定發(fā)揮著重要作用[4-6]。

        基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laser desorption/ionization time of-flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)是近幾年來發(fā)展起來的新型快速微生物鑒定技術(shù)。其基本原理是,樣品與基質(zhì)在靶表面形成共晶體薄膜,激光照射,基質(zhì)吸收能量,將能量轉(zhuǎn)移樣品解吸,基質(zhì)和樣品之間發(fā)生電荷轉(zhuǎn)移,樣品電離,經(jīng)過飛行時間檢測器將質(zhì)荷比(m/z)不同的離子分開,形成特異性肽蛋白質(zhì)指紋圖譜。采集圖譜與數(shù)據(jù)庫比對,從而獲得鑒定結(jié)果。目前MALDI-TOF-MS已應(yīng)用于沙門氏菌、金黃色葡萄球菌、阪崎腸桿菌、蠟樣芽孢桿菌等食源性致病菌的快速鑒定,與傳統(tǒng)生化鑒定相比,該技術(shù)具備準(zhǔn)確、快速、高通量、低成本的檢測優(yōu)勢,操作簡便,可部分替代傳統(tǒng)生化鑒定和分子生物鑒別方法,適用于對病原微生物的快速篩檢。但因設(shè)備成本高,難以在基層實驗室普及,部分微生物數(shù)據(jù)庫還不夠完整,隨著MALDI-TOF-MS方法的進一步普及和數(shù)據(jù)庫的不斷完善,上述不足有望得到有效完善[7-13]。本文通過MALDI-TOF-MS方法對樣品前處理的選擇、穩(wěn)定性、特異性等方面進行研究,確定鑒定空腸彎曲菌的可行性。

        1 材料與方法

        1.1 試劑與設(shè)備

        1.1.1供試菌株 標(biāo)準(zhǔn)菌株:空腸彎曲菌CampylobacterjejuniNCTC11168,結(jié)腸彎曲菌CampylobactercoliATCC33559,結(jié)腸彎曲菌CampylobactercoliATCC43478,胎兒彎曲菌CampylobacterfetusDSM 5361,烏普薩拉彎曲菌CampylobacterupsaliensisDSM 5365,紅嘴鷗彎曲菌CampylobacterlariATCC 35221,豬腸彎曲菌CampylobacterhyointestinalisATCC 35217。從樣品中檢測出經(jīng)其他生化鑒定方法確認(rèn)為空腸彎曲菌、結(jié)腸彎曲菌的野生分離株共28株,其中空腸彎曲菌25株、結(jié)腸彎曲菌3株。

        1.1.2培養(yǎng)基與試劑血瓊脂平板,購自北京陸橋技術(shù)股份有限公司;α-氰基-4-羥基肉桂酸(CHCA)、BTS標(biāo)準(zhǔn)品,購自德國Bruker公司;VITEK2鑒定卡(NH),購自法國生物梅里埃公司;乙腈,無水乙醇,甲酸,三氟乙酸(TFA)。

        1.1.3設(shè)備 基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時間質(zhì)譜(Microflex),德國Bruker公司生產(chǎn)。微生物實驗室常規(guī)滅菌及培養(yǎng)設(shè)備,微需氧培養(yǎng)裝置:提供微需氧條件(5% 氧氣、10% 二氧化碳和85% 氮氣)。

        1.2 方法

        1.2.1細(xì)菌分離與純化 參照GB 4789.9—2014《食品安全國家標(biāo)準(zhǔn) 食品微生物學(xué)檢驗 空腸彎曲菌檢驗》[14]操作。

        1.2.2MALDI-TOF-MS測定

        1.2.2.1溶液配制

        溶劑I:按照水∶乙腈∶三氟乙酸為50∶47.5∶2.5(v/v)的比例配制,現(xiàn)配現(xiàn)用;BTS標(biāo)準(zhǔn)溶液的配制:用50 μL溶劑I溶解BTS標(biāo)準(zhǔn)品。用移液器反復(fù)吹吸溶解BTS粉末,室溫放置5 min,再次溶解,待BTS全部溶解后,瞬時離心,用200 μL PCR管進行分裝,每管5 μL,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        CHCA基質(zhì)溶液的配制:在CHCA粉末中加入溶劑I,使CHCA終濃度為10 mg/mL。振蕩混勻,直至溶液澄清。用1.5 mL離心管進行分裝,每管50 μL,用封口膜密封管口,室溫放置備用。放置后,如出現(xiàn)大量沉淀應(yīng)棄用。

        1.2.2.2樣品前處理和點樣

        采用直接轉(zhuǎn)移法、擴展的直接轉(zhuǎn)移法、甲酸提取法對NCTC 11168空腸彎曲菌標(biāo)準(zhǔn)菌株進行樣品前處理,以考察不同處理方法對鑒定結(jié)果的影響。直接轉(zhuǎn)移法:單菌落在靶點上涂布成薄層,覆蓋1 μL CHCA溶液,自然晾干;擴展的直接轉(zhuǎn)移法:在直接轉(zhuǎn)移法的基礎(chǔ)上,中間部分增加覆蓋1 μL 70%甲酸溶液并自然晾干;甲酸提取法:取單個菌落加入300 μL去離子水,振蕩混勻;加入900 μL無水乙醇,混勻,13 000 r/min離心2 min,棄上清液;再次離心除去上清液,室溫干燥3 min;加入30 μL 70%甲酸溶液,吹吸混勻;加入30 μL純乙腈,吹吸混勻,13 000 r/min離心2 min;取1 μL的上清點樣至靶點,自然晾干,覆蓋1 μL CHCA溶液并自然晾干。

        1.2.2.3數(shù)據(jù)采集和結(jié)果判定 用標(biāo)準(zhǔn)溶液對儀器校準(zhǔn)后進行樣品數(shù)據(jù)采集和分析。運用FlexControl軟件采集數(shù)據(jù),獲得樣品的質(zhì)譜圖譜;用BioTyper軟件將采集的樣品圖譜與數(shù)據(jù)庫中的標(biāo)準(zhǔn)圖譜進行比對,根據(jù)匹配度判定結(jié)果,分值在2.300~3.000,表示菌種鑒定的可信度較高,可完全確認(rèn)菌株鑒定結(jié)果;2.000~2.299表示保守的菌屬鑒定或可能的菌種鑒定,可基本確認(rèn)鑒定結(jié)果;1.700~1.999表示可能的菌屬鑒定,菌株鑒定為不確定結(jié)果;0.000~1.699表示鑒定結(jié)果不可信。

        1.2.2.4特異性試驗 選取在生化和形態(tài)學(xué)與空腸彎曲菌較為相近的近緣株結(jié)腸彎曲菌CampylobactercoliATCC33559,結(jié)腸彎曲菌CampylobactercoliATCC43478,胎兒彎曲菌CampylobacterfetusDSM 5361,烏普薩拉彎曲菌CampylobacterupsaliensisDSM 5365,紅嘴鷗彎曲菌CampylobacterlariATCC 35221,豬腸彎曲菌CampylobacterhyointestinalisATCC 35217,以及分離到的3株結(jié)腸彎曲菌疑似菌株進行MALDI-TOF數(shù)據(jù)采集,并在VITEK結(jié)果比對,評價MALDI-TOF-MS鑒定的準(zhǔn)確性。

        1.2.2.5穩(wěn)定性試驗 通過對比空腸彎曲菌NCTC11168同一傳代次數(shù)的不同菌落及不同傳代次數(shù)的鑒定結(jié)果,評價MALDI-TOF-MS鑒定的穩(wěn)定性。

        1.2.3VITEK2鑒定 VITEK2 compact全自動微生物鑒定系統(tǒng)進行生化鑒定。

        1.2.4分離菌株鑒定 25株樣品分離菌株MALDI-TOF-MS技術(shù)鑒定,與VITEK結(jié)果相比較。

        2 結(jié)果

        2.1 樣品處理方法選擇結(jié)果三種樣品處理方法下空腸彎曲菌NCTC11168的可信度得分均在2.300以上,說明鑒定結(jié)果可靠。與其他兩種樣品處理方法相比,甲酸提取法蛋白指紋圖譜的基線平滑、峰強度高(圖1),信噪比高,更適用于后續(xù)數(shù)據(jù)分析。不同的樣品處理對MALDI-TOF-MS的鑒定結(jié)果有一定影響,選擇合適的樣品處理方法是保證MALDI-TOF-MS準(zhǔn)確鑒定的前提。

        圖1 三種前處理方法對空腸彎曲菌NCTC11168處理后的MALDI-TOF-MS峰圖

        2.2 特異性MALDI-TOF-MS檢測空腸彎曲菌及其近緣株的結(jié)果表明,該方法可以準(zhǔn)確區(qū)分空腸彎曲菌和其近緣菌株,無假陽性或假陰性結(jié)果發(fā)生(見表1)。

        表1 MALDI-TOF-MS檢測空腸彎曲菌及其近緣株的結(jié)果

        2.3 穩(wěn)定性由穩(wěn)定性試驗結(jié)果(表2)顯示,空腸彎曲菌NCTC11168同一傳代次數(shù)的3個菌落平行樣的可信度得分非常接近,且不同傳代次數(shù)的可信度得分無顯著性差異。

        表2 MALDI-TOF-MS檢測空腸彎曲菌穩(wěn)定性試驗結(jié)果

        2.4 25株分離菌株鑒定結(jié)果結(jié)果表明:MALDI-TOF-MS鑒定結(jié)果與生化鑒定結(jié)果一致,均鑒定為空腸彎曲菌,且MALDI-TOF-MS菌種鑒定的可信度較高(表3)。

        表3 25株分離菌株的MALDI-TOF-MS與VITEK鑒定結(jié)果

        3 討論

        通過比較不同樣品處理方法對空腸彎曲菌MALDI-TOF-MS鑒定結(jié)果的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn)甲酸提取法得到的結(jié)果蛋白峰數(shù)量和高度較另外兩種方法更穩(wěn)定。

        本文選取6株與空腸彎曲菌相近且較難區(qū)分的近緣彎曲菌屬標(biāo)準(zhǔn)菌株進行研究。MALDI-TOF-MS鑒定結(jié)果表明,MALDI-TOF-MS能夠準(zhǔn)確快速的區(qū)分彎曲菌近緣菌株,相較于傳統(tǒng)生化方法在時效性上均有較大提高。通過與VITEK生化結(jié)果比對,兩者結(jié)果高度一致。

        空腸彎曲菌NCTC11168同一傳代次數(shù)的3個菌落平行樣的可信度得分非常接近,且不同傳代次數(shù)的可信度得分無顯著性差異,說明空腸彎曲菌MALDI-TOF-MS鑒定方法的穩(wěn)定性較好,同一代次及不同代次的鑒定結(jié)果具有很好的一致性。

        25株樣品分離菌株MALDI-TOF-MS鑒定結(jié)果與VITEK生化結(jié)果一致,均鑒定為空腸彎曲菌,且MALDI-TOF-MS菌種鑒定的可信度較高。說明本研究建立的空腸彎曲菌MALDI-TOF-MS鑒定方法準(zhǔn)確度高,可用于空腸彎曲菌快速、準(zhǔn)確的鑒定。

        綜上所述,MALDI-TOF-MS方法具有操作簡單、快速、高通量、準(zhǔn)確度高等優(yōu)點,方法可用于食品中空腸彎曲菌的快速篩檢,也為其它食源性致病菌快速鑒定方法的建立提供參考,有望發(fā)展成為新的檢測標(biāo)準(zhǔn)化方法。

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