何凡應(yīng),徐汪君,黃柳向
1 湖南中醫(yī)藥大學(xué) 湖南長沙 410208
2 湖南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院 湖南長沙 410007
功能性消化不良是指由胃和十二指腸功能紊亂引起的癥狀,而無器質(zhì)性疾病的一組臨床綜合征,臨床主要表現(xiàn)為上腹部脹滿、疼痛不適,食欲不振、惡心嘔吐、胃脘部燒灼感等不適癥狀[1]。在中醫(yī)中并無功能性消化不良病名,而是根據(jù)其臨床表現(xiàn),將其歸屬于胃痞、胃痛范疇。素問其病位在脾胃,與肝密切相關(guān),還可涉及肺和大腸?;静C為肝郁氣滯,脾胃虛弱[2]?!毒霸廊珪てM》言:“怒氣暴傷,肝氣未平而痞皆有嘔證”。若平素憂思惱怒,則易傷肝損脾,脾胃受損,則不思飲食,脾胃為升降樞紐,其受損中焦升降失常,肝郁還可犯胃,甚至嘔吐,進而發(fā)展為本病。
枳術(shù)丸由枳實、白術(shù)兩味藥組成,是由張元素在張仲景中金匱要略的枳術(shù)湯化裁而來,藥物不變,將湯劑改制成丸劑?!督饏T要略·水氣病脈證病治第十四》云:“心下堅大如盤,邊如旋盤,水飲所作,枳術(shù)湯主治”。枳實性苦、辛、微寒,歸脾胃經(jīng),具有破氣消積,化痰散痞之功。白術(shù)性甘苦溫,歸脾胃經(jīng),功效為健脾益氣,燥濕利水,止汗,安胎。二者相配伍,枳實主消,白術(shù)為守,一走一守,一消一補,相互制約互用,共奏疏肝健脾,消食化積散痞之功。若單純健脾補氣而不消滯行氣,則恐補而壅滯, 積痞難去,若一味行氣消滯而不輔以健脾益氣, 則積滯雖可暫去,卻有再積之虞。故二者合用,健脾與行氣并施, 雙管齊下,則可達到消補兼施, 消而不傷正, 補而不礙滯之功[3]。臨床上常用其治療功能性消化不良,并取得了不錯的效果。
為進一步揭示枳術(shù)丸治療功能性消化不良的作用機制,本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法對枳術(shù)丸進行深入挖掘。
借助中醫(yī)藥系統(tǒng)藥理學(xué)平臺TCMSP(https://old.tcmsp-e.com/tcmsp.php)[4],在搜索框中依次輸入白術(shù)、枳實兩味中藥,得到其所有活性成分,根據(jù)人體對藥物吸收、分布、代謝及排泄的藥動學(xué)參數(shù)[5],再篩選出高活性成分,篩選標準為:口服利用度(oral bioavailability,OB)≥ 30% 且類藥性(drug-likeness,DL)≥ 0.18,[6]并利用uniprot數(shù)據(jù)庫借助R語言將得到的活性成分統(tǒng)一轉(zhuǎn)化為規(guī)范的靶點。
利用 genencard(https://www.genecards.org)數(shù)據(jù)庫[7],在其搜索框中輸入功能性消化不良的英文名,即Functional dyspepsia,搜索后得到該疾病的有關(guān)靶標,再選擇參數(shù)relevance score > 10,得到與該疾病密切相關(guān)的常見靶標。
利 用 在 線 畫 圖 網(wǎng) 站,(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny)將枳實、白術(shù),功能性消化不良(Functional dyspepsia)各自的靶標輸入其中,得到共同靶標和韋恩圖。
將得到的共同靶點輸入String數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org)[8],選擇參數(shù) MultipleProtein,選定物種為Homosapiens,設(shè)定最低要求互動分數(shù)為中度信度0.400得到蛋白相互作用(PPI)相關(guān)信息并導(dǎo)出PPI網(wǎng)絡(luò)圖與TSV文件,運用R語言將TSV文件目錄中node1與node2各個靶點的節(jié)點數(shù)目degree導(dǎo)出得到xsl表與柱狀圖。
運 用 DAVID 數(shù) 據(jù) 庫(https://david.ncifcrf.gov)[9],對共同靶點進行GO富集分析,輸入格式選擇“OFFICIAL GENE SYMBOL”,“Background” 選 擇“Homo aspiens”,P<0.05,并將 BP(生物過程)、CC(細胞成分)、MF(分子功能)分別導(dǎo)出,對 P 值取負對數(shù),P 值越小,-lgP大,表明富集程度越大。進行GO分析,將導(dǎo)出后的結(jié)果用微生信(http://www.bioinformatics.com.cn)在線繪制出GO富集氣泡圖。
運 用 DAVID 數(shù) 據(jù) 庫(https://david.ncifcrf.gov),對共同靶點進行KEGG通路富集分析,設(shè)置的參數(shù)同1.5項,將得到的前20條通路進行通路富集分析。并用微生信(http://www.bioinformatics.com.cn)在線繪制出KEGG通路富集氣泡圖。
通過TCMSP共收集到枳術(shù)丸活性成分共120種,其中枳實65種,白術(shù)55種,通過篩選共得到活性成分29種,其中枳實22種,白術(shù)7種,通過Uniprot數(shù)據(jù)庫借助R語言將其活性成分轉(zhuǎn)化為靶點,刪除重復(fù)靶點后共得到62個靶點,其中枳實52個,白術(shù)10個,見表1。
表1 枳術(shù)丸藥物活性成分
在genencard數(shù)據(jù)庫搜索框中輸入功能性消化不良的英文名,即Functional dyspepsia,搜索共得到2452個靶標,選擇relevance score > 10,得到與功能性消化不良密切相關(guān)的靶標共553個。
將枳術(shù)丸的活性成分得到的靶標與功能性消化不良得到的靶標在(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny)中的list 1,list 2,list 3中分別輸入后,得到藥物疾病共同的靶點共23個,該靶點即是枳術(shù)丸對功能性消化不良起治療作用密切相關(guān)的靶點,同時導(dǎo)出韋恩圖,見圖1。
圖1 藥物-疾病韋恩圖
在String數(shù)據(jù)庫中將得到的藥物疾病23個共同靶點輸入后,設(shè)置參數(shù)完畢后,得到PPI蛋白互作關(guān)系圖并導(dǎo)出,見圖2;同時導(dǎo)出TSV數(shù)據(jù)文件,運用R語言對文件進行處理,得到各個靶點的連接節(jié)點數(shù)的degree的 xls表,見表 2, 其中 EGFR(degree=18)、IL6(degree=18)、VEGFA(degree=18)、CASP3(degree=16)連接節(jié)點均大于15,表明枳術(shù)丸可通過多個靶點對功能性消化不良起到治療作用。
表2 藥物疾病共同靶點的degree值
23個共同靶點在DAVID數(shù)據(jù)庫中GO富集共得到92對BP,25對CC,28對MF,利用微生信對排在前10的BP、CC、MF在線繪制出GO富集氣泡圖,見圖3,結(jié)果顯示,共同靶點主要分布于細胞外間隙、細胞表面、高爾基體、細胞質(zhì)、細胞內(nèi)體膜等細胞成分中,主要通過酶結(jié)合、同蛋白結(jié)合、類固醇結(jié)合、染色質(zhì)結(jié)合、蛋白磷酸酶結(jié)合等方式參與凋亡負調(diào)控、上皮細胞增殖、氨基酸反應(yīng)、雌二醇反應(yīng)、一氧化氮合成等生物進程。
圖3 GO分析富集氣泡
23個共同靶點在DAVID數(shù)據(jù)庫中KEGG富集共得到39條信號通路,富集程度前20位的通路見表3,KEGG富集分析氣泡圖見圖4,共同靶點參與的關(guān)鍵通路為癌癥途徑、HIF-1信號通路、TNF信號通路、麻疹信號通路等。
圖4 KEGG富集分析氣泡
表3 共同靶點富集的前20條通路
功能性消化不良是一種功能性疾病,臨床表現(xiàn)為消化功能改變而無器質(zhì)性病變,其病因尚未明確,可能與胃動力及感覺異常、精神狀態(tài)、應(yīng)激因素、和環(huán)境影響有關(guān),與HP感染的關(guān)系不密切,酸分泌亦無增加,女性患者較常見,目前西醫(yī)對其的治療主要以促胃動力、抑制胃酸分泌、保護胃黏膜及心理疏導(dǎo)為主,治療效果一般,而中醫(yī)藥對功能性病變的疾病治療有著極大的優(yōu)勢,尤其是在改善患者的癥狀這一方面,功能性消化不良對應(yīng)中醫(yī)“胃痞”“胃痛”范疇,《素問·六云正紀大論》云:“木郁發(fā)之……民病胃脘當心而痛”肝郁氣滯,脾胃虛弱乃其基本病機。臨床研究發(fā)現(xiàn)枳術(shù)丸及其衍變方對功能性消化不良的治療效果良好,李曉玲等人研究發(fā)現(xiàn)枳術(shù)丸對碘酰胺誘導(dǎo)的功能性消化不良大鼠具有加快胃排空、降低胃腸感覺過敏的作用,其機制可能與外周血Ghrelin、5-HT含量提高,CGRP含量降低有關(guān)[10],沈一山等人將64名功能性消化不良的患者分為橘皮枳術(shù)丸組、嗎丁啉組,治療后發(fā)現(xiàn)橘皮枳術(shù)丸對功效性消化不良的治療效果優(yōu)于嗎丁啉組,P<0.05[11]。
網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)涉及了多門學(xué)科技術(shù),可以從整體上揭示藥物、疾病、靶點之間的關(guān)系,為中醫(yī)藥治療疾病對疾病的治療提供了數(shù)據(jù)支撐,已廣泛應(yīng)用于單位中藥、中藥復(fù)方作用機制研究[12]。本研究通過對枳實、白術(shù)的有效成分檢索再篩選,共得到29種活性成分,枳實的主要活性成分有黃銅類、揮發(fā)油類、生物堿類、豆香素類。侯雪楠等人發(fā)現(xiàn)枳實的主要成分橙皮苷可以增加CUMS大鼠GR表達,抑制下丘腦促腎上腺皮質(zhì)激素釋放,改善過度亢進的HPA軸狀態(tài)[13]。有研究證實枳實水提物可通過上調(diào)5-羥色胺受體4(5-HTR4)和神經(jīng)絲蛋白H (NF-H)的表達促進神經(jīng)絲生長, 從而顯著改善瀉劑結(jié)腸大鼠的腸道動[14]。枳實黃酮類化合物具有良好的抗氧化作用,其中黃銅A環(huán)中5,7-二羥基為主要活性基團,枳實黃銅能夠緩解氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的肺功能損傷,從而改善肺部組織的病理變化[15]。白術(shù)的主要活性成分有揮發(fā)性成分、內(nèi)酯類成分、苷類、多糖類成分與氨基酸類成分[16]。曹艷霞等研究發(fā)現(xiàn)白術(shù)多糖可通過調(diào)節(jié)Bcl-2蛋白、Bax蛋白的表達對應(yīng)激性胃潰瘍起到明顯的改善作用[17]。宋厚盼等觀察白術(shù)甲醇提取物可通過促進多胺介導(dǎo)的上皮細胞遷移修復(fù)胃腸黏膜的損傷[18]。
本研究發(fā)現(xiàn)功能性消化不良與枳術(shù)丸的共同靶點共有23個,其中連接節(jié)點大于15的靶點有EGFR、IL6、VEGFA、CASP3;研究表明在特定的配體、組織和病理條件下,EGFR的配體直接激活可以產(chǎn)生不同的細胞反應(yīng),促進細胞生長和纖維化[19]。IL-6一個典型的促炎性細胞因子,有研究表明,它通過gp130的同源二聚體化激活Janus激酶(JAK)/STAT信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路參與炎癥疾病有關(guān)進程,,與胃炎的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[20]。董宏超等發(fā)現(xiàn)VEGFA可通過ERK、PI3K/Akt通路調(diào)控血管的再生與增值,與多種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[21]。有研究表明caspase-3是一種常見被激活的死亡蛋白酶,是細胞凋亡的關(guān)鍵介質(zhì),可催化許多關(guān)鍵細胞蛋白的特異性切割[22]。
本研究GO富集分析結(jié)果表明,共同靶點分布于細胞的多種成分中,能夠多靶點、多結(jié)構(gòu)、多形式、通過多種生物進程,包括凋亡負調(diào)控、上皮細胞增殖、氨基酸反應(yīng)等。細胞凋亡等。KEGG富集結(jié)果共得到39條信號通路,其中癌癥途徑、HIF-1信號通路、TNF信號通路為關(guān)鍵信號通路,癌癥途徑與多種癌癥的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),如前列腺癌、膀胱癌、胰腺癌、子宮內(nèi)膜癌、非小細胞癌等。有研究發(fā)現(xiàn),C-X-C基序配體8(CXCL8)是癌癥途徑中的一種關(guān)鍵因子,發(fā)揮著多功能細胞因子的作用,能以自分泌或旁分泌的方式調(diào)節(jié)腫瘤的增殖,侵襲和遷移,能參與多種細胞內(nèi)信號傳導(dǎo)及整合,以產(chǎn)生協(xié)同效應(yīng),從而介導(dǎo)各種癌癥的發(fā)生和發(fā)展[23]。缺氧誘導(dǎo)因子-1(HIF-1)是一種重要的轉(zhuǎn)錄因子,可在人類癌癥中低氧條件下誘導(dǎo)發(fā)生適應(yīng)性反應(yīng),有關(guān)研究發(fā)現(xiàn)在缺氧條件下,BRU抑制了HIF-1的反式激活活性,并抑制了VEGF,GLUT1,HK2和LDHA等HIF-1靶基因的表達。此外,BRU還可以通過抑制HIF-1信號通路來降低缺氧條件下的葡萄糖消耗[24]。TNF(腫瘤壞死因子)是促炎和抗炎細胞因子,對自身免疫性疾病,癌癥的發(fā)展以及對傳染性病原體的保護至關(guān)重要。除無數(shù)其他活動外,TNF可以是T細胞的產(chǎn)物,并可以作用于T細胞。TNF可以促進中樞和效應(yīng)T細胞的活化和增殖,但也可以誘導(dǎo)高度活化的效應(yīng)T細胞凋亡,從而進一步確定病原性或保護性T細胞池的大小。而且,TNF可以對調(diào)節(jié)性T細胞產(chǎn)生不同的作用。它既可以下調(diào)其抑制能力,又可以在其他情況下促進其發(fā)展或積累[25]。
綜上所述,本研究運用了網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)技術(shù),揭示了枳術(shù)丸對功能性消化不良的可能的治療作用機制,但受限于數(shù)據(jù)庫、軟件的不足之處,其還可待進一步實驗論證其科學(xué)性,從而為新藥的開發(fā)提供有力依據(jù)。