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        基于激光誘導(dǎo)擊穿光譜的柑橘葉片黃龍病檢測

        2022-02-17 12:20:36歐陽愛國劉曉龍李斌林同征劉燕德黃敏宋燁
        關(guān)鍵詞:黃龍柑橘預(yù)處理

        歐陽愛國,劉曉龍,李斌,林同征,劉燕德,黃敏,宋燁

        1.華東交通大學(xué)智能機電裝備創(chuàng)新研究院, 南昌 330013; 2. 江南大學(xué)輕工過程先進控制教育部重點實驗室, 無錫 214122; 3.濟南果品研究院, 濟南 250000

        柑橘是世界上重要的經(jīng)濟作物[1]。目前,柑橘產(chǎn)業(yè)的發(fā)展受到各種病害的侵襲和威脅,其中,柑橘黃龍病是柑橘生產(chǎn)中威脅最大的毀滅性病害[2]。柑橘黃龍病的發(fā)病癥狀主要表現(xiàn)為患病植株長勢衰退,抽梢短而小,樹葉出現(xiàn)斑駁性黃化和整體黃化枯萎,柑橘植株果實變小且果柄端橘紅色,其余部分青色,俗稱紅鼻子果[3-4]。對發(fā)病輕的柑橘果樹,挖除病株后可采用無病苗補植,然后加強對黃龍病的監(jiān)測和防治;當(dāng)柑橘黃龍病發(fā)生的范圍很廣時,應(yīng)將全園的苗木都挖掉,重新栽種未受該病影響的苗木。找到一種快速、有效、無損的柑橘葉片黃龍病檢測方法,對柑橘產(chǎn)業(yè)健康持續(xù)發(fā)展具有重要意義。

        柑橘黃龍病的傳統(tǒng)診斷方法主要有田間癥狀診斷法、電鏡觀察法以及PCR檢測法等[4-6]。由于黃龍病癥狀非常復(fù)雜,上述檢測方法在對柑橘黃龍病檢測中都存在不足之處。其中,田間癥狀診斷法的缺點是主觀性較強,準(zhǔn)確率不高[6-7];病菌分布大小不均勻和采集方法不正確會導(dǎo)致電鏡觀察法準(zhǔn)確率不高[7];血清學(xué)檢測法抗體的制備技術(shù)復(fù)雜以及檢測范圍較窄[8];PCR檢測則成本較高,不適合用于大田果園批量檢測[9]。為此,研究人員嘗試采用無損檢測方法來檢測或及時發(fā)現(xiàn)病樹,如王凡等[10]利用高光譜技術(shù)對黃龍病進行檢測并對病害進行了分類;劉燕德等[11]采用近紅外光譜對感染黃龍病的柑橘葉片、缺素葉片及健康葉片等樣品進行了分析。但高光譜和近紅外存在圖譜結(jié)合比較復(fù)雜、測定精度不高等缺點。激光誘導(dǎo)擊穿光譜技術(shù)(laser-induced breakdown spectroscopy,LIBS)[12]能夠檢測試驗樣品中元素的光譜強度,可以用于農(nóng)業(yè)研究。如章琳穎等[13]運用九點平滑(SM)結(jié)合多元散射校正(MSC)對臍橙果汁進行LIBS數(shù)據(jù)預(yù)處理,然后采用主成分分析(PCA)結(jié)合多層感知器神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(MLP)和徑向基函數(shù)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(RBF)模型對健康和感染黃龍病的臍橙進行快速判別。劉燕德等[14]采用MSC光譜預(yù)處理方法和PCA分類法,并建立三維模型分析,可以很好地將感染炭疽病的油茶葉片和健康油茶葉片區(qū)分開來,建立的PLS-DA模型的識別率為90%。

        LIBS在植物病害檢測中具有比較簡單、方便、新穎和突出等特點,目前有關(guān)LIBS應(yīng)用于柑橘葉片病害檢測的研究報道不多。柑橘葉片的生長情況可直接反映柑橘果樹及整個種植區(qū)柑橘果實的健康程度。本研究基于健康柑橘葉片和感染黃龍病柑橘葉片的LIBS及其光譜響應(yīng),建立基于LIBS的柑橘葉片黃龍病檢測方法,旨在進一步擴展LIBS的應(yīng)用范圍,并為柑橘葉片營養(yǎng)元素的檢測提供新的參考。

        1 材料與方法

        1.1 樣品制備

        1)樣品采集。2020年10月在江西省贛州市的果園采集柑橘的健康葉片、中度感染黃龍病的葉片和重度感染黃龍病的葉片各100片。將摘取到的鮮葉放入保鮮袋中保存,并將冰袋放入其中保證柑橘葉片的新鮮度。

        2)樣品制備。采用去離子水反復(fù)沖洗葉片表面,去除柑橘葉片表面上灰塵和泥垢;再用吸水紙擦拭,在通風(fēng)處放置2 h,讓其自然晾干,以減少水珠對試驗結(jié)果的影響。最后裝袋并分類標(biāo)號。

        1.2 試驗設(shè)備

        本研究采用的LIBS試驗設(shè)備為MX2500+(海洋光學(xué)),其系統(tǒng)原理圖如圖1所示。Nd:YAG激光器在納秒量級的范圍內(nèi)激發(fā)出能量較高、脈寬較大的激光,經(jīng)反射后由透鏡聚焦到柑橘葉片表面,然后擊打葉片表面產(chǎn)生等離子體。由光纖收集后傳輸?shù)?通道多譜儀。通過MX2500+所配套的MaxLIBS軟件對元素的波長和光譜強度進行采集。

        圖1 LIBS系統(tǒng)原理圖Fig.1 A schematic diagram of LIBS system

        激光能量設(shè)置為50 mJ,光譜儀的波長范圍為198.71~727.69 nm,光學(xué)分辨率0.1 nm,延遲時間設(shè)定為2 μs。在采集過程中,每個葉片樣品重復(fù)采集6個LIBS光譜數(shù)據(jù),這樣可以涉及葉片的不同部位。再將采集到的6個LIBS光譜數(shù)據(jù)的平均值作為試驗分析數(shù)據(jù),目的是為了減小誤差和樣品的不平整性對試驗結(jié)果的影響。

        1.3 數(shù)據(jù)處理

        數(shù)據(jù)預(yù)處理的目的在于除去數(shù)據(jù)中含有的噪音和無用的信息,如激光器激光能量的波動、光譜儀分辨率的差異、外部環(huán)境的差異以及樣品不均勻等因素,提高建立模型的預(yù)測精度,增強建立模型的穩(wěn)健性[14]。本研究采用歸一化(normalization)、多元散射校正(multiplicative scatter correction,MSC)、標(biāo)準(zhǔn)正態(tài)變換(standard normal variate,SNV)和正交信號校正(orthogonal signal correction,OSC)4種光譜預(yù)處理方法[15]。

        偏最小二乘是最常用的多元線性校正技術(shù),可以同時分解光譜矩陣X和濃度矩陣Y,消除無用的噪聲信息,使其在實際應(yīng)用中具有更強的魯棒性[16]。模型公式如下:

        Y=bX+e

        (1)

        式(1)中,b表示回歸系數(shù)的向量,e表示模型殘差。

        根據(jù)NIST的標(biāo)準(zhǔn)原子光譜數(shù)據(jù)庫,預(yù)選光譜P(Ⅱ)645.999 nm,Mn(Ⅰ)279.483 nm,Mn(Ⅰ)280.379 nm,Si(Ⅰ)251.432 nm和Fe(Ⅰ)252.285 nm這5條LIBS光譜作為分析感染黃龍病柑橘葉片的譜線。這些微量元素與柑橘葉片組織密切相關(guān),即能區(qū)分柑橘葉片是否健康。采用Unscrambler10.1軟件中的Normalization、MSC、SNV和OSC 4種預(yù)處理方法和偏最小二乘判別分析(partial least square discriminant analysis,PLS-DA)對LIBS光譜數(shù)據(jù)進行分類處理。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 葉片LIBS光譜特征分析

        P(Ⅱ)的LIBS特征光譜如圖2所示。由圖2可知,P(Ⅱ)的特征光譜在波長645.999 nm處,健康柑橘葉片的P(Ⅱ)特征光譜強度明顯高于感染黃龍病的柑橘葉片,并且健康柑橘葉片、中度感染黃龍病的柑橘葉片和重度感染黃龍病的葉片的P(Ⅱ)特征光譜強度呈線性下降。P有利于植物的新陳代謝,能使葉片變得更加耐旱和耐寒。如果柑橘葉片中的P含量較低,就會影響植物的新陳代謝。

        圖2 柑橘葉片在644~650 nm 波長范圍內(nèi)P(Ⅱ)的LIBS光譜Fig.2 P(Ⅱ) LIBS spectra of citrus leaves in the wavelength range of 644-650 nm

        Mn(Ⅰ)的LIBS特征光譜如圖3所示。由圖3可知,Mn(Ⅰ)的特征光譜譜線在279.483 nm和280.379 nm處??梢园l(fā)現(xiàn)感染黃龍病柑橘葉片中Mn(Ⅰ)的特征光譜強度明顯低于健康柑橘葉片中的Mn(Ⅰ)的特征光譜強度。原因是Mn是維持葉綠體結(jié)構(gòu)必不可少的微量元素。當(dāng)葉片非常缺乏Mn時,葉脈間會逐漸出現(xiàn)黃化。

        Si(Ⅰ)和Fe(Ⅰ)的LIBS特征光譜如圖4所示。由圖4可知,Si(Ⅰ)和Fe(Ⅰ)在波長251.432 nm和252.285 nm處有明顯的特征峰,通過對比圖4中的強度值,健康柑橘葉片中Si(Ⅰ)的特征光譜強度明顯高于感染黃龍病柑橘葉片中Si(Ⅰ)的特征峰。Si在植物生長中扮演著重要的角色,并且能抵抗攻擊植物的病原體。健康柑橘葉片中高含量的Si對抗病原體有著很重要的作用;但感染黃龍病的柑橘葉片中Si含量較低,是因為受到了黃龍病的危害。此外,健康柑橘葉片中Fe(Ⅰ)的特征光譜強度要比感染黃龍病柑橘葉片中Fe(Ⅰ)的特征光譜強度高,原因是Fe是形成葉綠素不可或缺的微量元素之一,健康柑橘葉片中含有的大量Fe參與氧化還原反應(yīng),促進氮素代謝,并且能增強植株的抗原體,而感染黃龍病的柑橘葉片的表面上出現(xiàn)病斑且病斑周圍呈淡黃色,出現(xiàn)缺鐵變黃的癥狀。

        圖3 柑橘葉片在278~281 nm 波長范圍內(nèi)Mn(Ⅰ)的LIBS光譜Fig.3 LIBS spectra of Mn(Ⅰ)in citrus leaves in the wavelength range of 278-281 nm

        圖4 柑橘葉片在250~254 nm波長范圍內(nèi) Si(Ⅰ)和Fe(Ⅰ)的LIBS光譜Fig.4 LIBS spectra of Si(Ⅰ)and Fe(Ⅰ)in the wavelength range of 250-254 nm in citrus leaves

        綜上,感染黃龍病的柑橘葉片中P(Ⅱ)、Mn(Ⅰ)、Si(Ⅰ)和Fe(Ⅰ)的特征光譜強度顯著低于健康柑橘葉片中P(Ⅱ)、Mn(Ⅰ)、Si(Ⅰ)和Fe(Ⅰ)的特征光譜強度。而且柑橘葉片中的P、Mn、Si和Fe的LIBS信號強度與葉片的健康狀態(tài)有著很強的相關(guān)性,LIBS信號強度隨著葉片的病害加重而逐漸減弱。因此,選用P(Ⅱ)645.999 nm、Mn(Ⅰ)279.483 nm、Mn(Ⅰ)280.379 nm、Si(Ⅰ)251.432 nm和Fe(Ⅰ)252.285 nm等5條LIBS特征光譜對健康、中度感染和重度感染黃龍病的柑橘葉片等3種情形進行分析。

        2.2 單個特征光譜和特征光譜融合的PLS-DA

        使用300個樣本用于建立偏最小二乘判別模型,其中健康柑橘葉片、中度感染黃龍病和重度感染黃龍病的柑橘葉片分別為100片。首先人為設(shè)定健康柑橘葉片樣品為1,感染中度黃龍病的柑橘葉片為2,感染重度黃龍病的柑橘葉片為3。若預(yù)測值介于0.5和1.5之間則判定為健康柑橘葉片,若預(yù)測值介于1.5和2.5之間則判定為中度感染黃龍病的柑橘葉片,若預(yù)測值介于2.5和3.5之間則判定為是重度感染黃龍病的柑橘葉片。然后將300個柑橘葉片樣本按照3∶1的比例隨機分為建模集(225個樣本)和預(yù)測集(75個樣本)。

        從表1中可知,在沒有預(yù)處理的情況下,當(dāng)5個特征光譜單獨用PLS-DA建模分析時, Fe(Ⅰ)的建模集均方根誤差(root mean square error of calibration,RMSEC)為0.394,建模集相關(guān)系數(shù)(correlation coefficient of calibration,Rc)為0.871,總誤判率為23.1%;預(yù)測集均方根誤差(root mean square error of prediction,RMSEP)為0.454,預(yù)測集相關(guān)系數(shù)(correlation coefficient of prediction,Rp)為0.841,總誤判率為26.6%。將5條特征光譜進行光譜融合,可以看到建模效果有所提高,模型的RMSEC為0.341,Rc為0.905,總誤判率為15.5%,RMSEP為0.395,Rp為0.867,總誤判率為22.7%。圖5為元素Fe(Ⅰ)特征光譜的建模模型結(jié)果,圖6 為5種特征光譜融合的建模模型結(jié)果。

        表1 單個特征光譜和5個特征光譜融合的PLS-DA模型結(jié)果 Table 1 The results of PLS-DA model combining single feature spectra and five feature spectra

        A:建模集 Modeling set; B:預(yù)測集 Prediction set; H:健康的柑橘葉片 Citrus leaf of healthy; MI:中度感染黃龍病的柑橘葉片 Citrus leaf moderately infected with Huanglongbing; SI:重度感染黃龍病的柑橘葉片Citrus leaf severely infected with Huanglongbing。下同 The same as below.

        A:建模集 Modeling set; B:預(yù)測集模型 Prediction set.圖6 5個特征光譜融合的PLS-DAFig.6 PLS-DA model for the fusion of five feature spectra

        2.3 基于不同預(yù)處理方法的PLS-DA

        5個特征光譜融合之后,根據(jù)3∶1比例劃分好的建模集和預(yù)測集建立柑橘葉片的PLS模型,并使用4種預(yù)處理方法(Normalization、MSC、SNV、OSC)對光譜進行處理,結(jié)果見表2。由于OSC是通過正交投影除去光譜陣中無關(guān)的信息,再進行多元校正運算,以達到簡化模型以及提高模型預(yù)測能力的目的。因此,選取OSC預(yù)處理后,所建立的模型最佳,其中RMSEC為0.027,Rc為0.994,總誤判率為0;RMSEP為0.023,Rp為0.995,總誤判率為0。圖7為結(jié)合預(yù)處理后最優(yōu)的PLS-DA模型。

        表2 不同預(yù)處理方法的PLS-DA模型結(jié)果 Table 2 PLS-DA model results of different pretreatment method

        A:建模集 Modeling set; B:預(yù)測集 Prediction set.圖7 OSC預(yù)處理后的PLS-DAFig.7 PLS-DA model after OSC pretreatment

        3 討 論

        營養(yǎng)元素的變化作為判別植物是否染病的重要指標(biāo)之一,對早期柑橘黃龍病的檢測具有重要的意義。本研究分析了柑橘葉片中P(Ⅱ)、Mn(Ⅰ)、Si(Ⅰ)和Fe(Ⅰ)元素的LIBS光譜特征,發(fā)現(xiàn)這4種元素的LIBS信號特征光譜的強度與柑橘葉片是否感染黃龍病有關(guān),隨著柑橘葉片感染黃龍病的程度加重,LIBS信號特征光譜的強度逐漸降低。另外,F(xiàn)e(Ⅰ)的特征光譜用PLS-DA建模判別,建模集的誤判率為23.1%,預(yù)測集的誤判率為26.6%;將5條特征光譜融合在一起用PLS-DA建模判別,建模集的誤判率為15.5%,預(yù)測集的誤判率為22.7%。進一步利用OSC預(yù)處理方法并用PLS-DA建模方法進行建模判別,模型的識別率能達到100%,可以較好地區(qū)分健康柑橘葉片、中度感染黃龍病的柑橘葉片和重度感染黃龍病的柑橘葉片這3種狀態(tài),并且RMSEC、RMSEP均有所降低,Rc和Rp均有所提高,說明模型經(jīng)過預(yù)處理優(yōu)化后剔除了大量噪聲信息,從而提高了模型的準(zhǔn)確性和穩(wěn)定性。研究顯示,采用激光誘導(dǎo)擊穿光譜技術(shù)結(jié)合OSC光譜預(yù)處理、PLS-DA建模方法識別柑橘葉片黃龍病具有一定可行性。后續(xù)研究可以將葉片中的其他營養(yǎng)元素、其他病害用于實驗分析,并與黃龍病病害進行對比分析,并改進預(yù)處理方法、波段篩選的方法以及建模方法來進一步提高模型的準(zhǔn)確性、穩(wěn)定性和適用性。

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