彭松林 王尚 王振民 龍燦玲 唐菀澤 賀小琴 陳高揚
骨質(zhì)疏松癥是一種以骨量減少和骨微結(jié)構(gòu)破壞為特征,導(dǎo)致骨脆性增加,易發(fā)生骨折的復(fù)雜、多因素全身性慢性骨骼疾病,發(fā)病人群集中在絕經(jīng)后女性[1]。隨著老齡化現(xiàn)象的加劇,骨質(zhì)疏松癥的發(fā)病人數(shù)逐年增加,給病人帶來了全身骨痛、骨折、身高變矮等痛苦和傷害,同時也給社會和家庭帶來了沉重的經(jīng)濟和生活負擔(dān)[2-3]。因為骨質(zhì)疏松發(fā)生和發(fā)展的隱匿性,往往是病人發(fā)生骨質(zhì)疏松骨折后入院治療才得以發(fā)現(xiàn)。因此,骨質(zhì)疏松的早期篩查和診斷是預(yù)防和治療的關(guān)鍵。骨質(zhì)疏松癥的病理過程受諸如局部和全身激素、遺傳調(diào)節(jié)劑和生活條件等復(fù)雜因素的影響[4]。近幾年來,作為疾病分子標(biāo)記物和潛在藥物靶點的長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的相關(guān)研究迅速發(fā)展,已有研究表明lncRNA與人類疾病的發(fā)生、發(fā)展和防治有密切關(guān)聯(lián),在免疫系統(tǒng)疾病、心血管疾病和腫瘤等疾病中發(fā)揮重要作用[5-7]。此外,已有研究報道指出lncRNA參與了成骨細胞的分化[8-10],說明lncRNA在骨質(zhì)疏松癥中扮演著重要角色。本研究擬從lncRNA層面分析骨質(zhì)疏松和骨量正常絕經(jīng)后婦女外周血中l(wèi)ncRNA 的差異表達并檢測其在人骨髓間充質(zhì)干細胞(h-BMSCs)成骨分化過程中的含量變化,探討其作為診斷骨質(zhì)疏松分子標(biāo)志物的可行性。
納入標(biāo)準(zhǔn):①年齡為55~70 歲;②絕經(jīng)后女性;③無影響骨代謝藥物史;④無其他炎性疾病及外傷。
排除標(biāo)準(zhǔn):①腫瘤;②原發(fā)性或繼發(fā)性甲狀旁腺疾?。虎鄹文I功能異常;④嚴(yán)重心臟疾?。虎萏悄虿?;⑥嚴(yán)重胃腸道疾病,如結(jié)直腸癌、炎癥性腸病、腸易激綜合征、長期腹瀉、便秘;⑦嚴(yán)重自免疫型疾病,如類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、紅斑狼瘡;⑧正在服用皮質(zhì)類固醇類激素或近3 個月曾服用此類激素;⑨近一個月服用抗生素。
收集2019年全年在本院體檢女性的臨床資料,根據(jù)雙能X射線骨密度掃描結(jié)果,選取30例骨密度T值≥-1 SD婦女納入骨量正常組(30例),30例T值≤-2.5 SD 的婦女為骨質(zhì)疏松組,建立臨床樣品庫。經(jīng)病人知情同意后抽取部分外周血,分離其外周血單個核細胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)并通過高通量測序檢測PBMC中l(wèi)ncRNA的表達。
BD-10mL EDTA 真空管采血管(沈陽寶康生物工程有限公司,中國);人外周血淋巴細胞分離液(深圳市達科為生物技術(shù)股份有限公司,中國);RNA提取試劑盒(湖南艾科瑞生物工程有限公司,中國);lncRNA 文庫構(gòu)建和測序(深圳市華大基因,中國);逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(湖南艾科瑞生物工程有限公司,中國);成骨誘導(dǎo)液(賽業(yè)生物科技有限公司,中國);h-BMSCs 培養(yǎng)基(Gibco,美國);胎牛血清(Gibco,美國);核酸檢測儀nanodrop2000[賽默飛世爾科技(中國)有限公司,美國];高速離心機[賽默飛世爾科技(中國)有限公司,美國];qPCR 儀[伯樂生命醫(yī)學(xué)產(chǎn)品(上海)有限公司,美國]。
(一)外周血中l(wèi)ncRNA相對表達水平的檢測
取骨質(zhì)疏松組和骨量正常組外周血PBMC,嚴(yán)格按照RNA 提取試劑盒的說明書提取總RNA,nanodrop2000檢測RNA 濃度,瓊脂糖凝膠檢測RNA完整性以及基因組污染情況。利用Qubit2.0 RNA檢測試劑盒對Total RNA精確定量,以確定文庫構(gòu)建所加入Total RNA 的量。根據(jù)VAHTS TM Stranded mRNA-seq Library Prep Kit for Illumina?試劑盒構(gòu)建lncRNA 文庫并擴增,上機高通量測序分析差異lncRNA。
(二)PCR 檢測外周血PBMC 中差異表達lncRNA的相對表達水平
取PBMC 細胞,使用Trizol 提取細胞總RNA,檢測其濃度與純度,將總RNA 反轉(zhuǎn)錄為cDNA。反轉(zhuǎn)錄條件:37 ℃15 min,85 ℃5 s,4 ℃30 min。然后根據(jù)實時熒光定量PCR 進行檢測,結(jié)果以GAPDH 為內(nèi)參,采用2-ΔΔCt相對定量法計算目的基因相對表達量。引物序列見表1。
(三)h-BMSCs的培養(yǎng)及成骨誘導(dǎo)
h-BMSCs 購自于ATCC 細胞庫,使用的培養(yǎng)基為α-MEM,內(nèi)含10%胎牛血清與抗生素(青霉素100 U/mL 和鏈霉素100 μg/mL),于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。h-BMSCs細胞以5×104個/皿接種于六孔板,待細胞鋪滿板底約60%時(記為成骨誘導(dǎo)第0天),換成骨誘導(dǎo)液培養(yǎng)。成骨誘導(dǎo)開始后每2 d換液,分批次共誘導(dǎo)培養(yǎng)3、7、14 d。換液時棄原成骨誘導(dǎo)液,然后配置新鮮的成骨誘導(dǎo)液,以每孔2.5 mL加入六孔板中,于37 ℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。
(四)茜素紅染色檢測成骨效果
將h-BMSCs接種在24孔板中,分為對照組和成骨誘導(dǎo)組。對照組常規(guī)培養(yǎng)基培養(yǎng),成骨誘導(dǎo)組換成骨誘導(dǎo)液培養(yǎng)14 d 后,4%多聚甲醛固定,按照茜素紅染液說明書進行染色操作,檢測細胞成骨效果。
(五)qPCR 檢測誘導(dǎo)過程中成骨相關(guān)基因的表達
將成骨誘導(dǎo)分化過程中的h-BMSCs 細胞(0、3、7、14 d)加入RNA 提取試劑-Trizol。RNA 提取和逆轉(zhuǎn)錄方法同研究方法(二),檢測成骨相關(guān)基因堿性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)、Runt 相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子2(Runx2)、骨鈣素(osteocalcin,OCN)及骨橋蛋白(osteopontin,OPN)mRNA 的表達。引物序列見表1。
表1 引物序列信息
(六)qPCR檢測差異表達的lncRNA在成骨分化過程中的表達量
提取0、3、7、14 d 的h-BMSCs 細胞的RNA 并按照反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書將RNA 反轉(zhuǎn)錄為cDNA,最后把其作為模板通過qPCR 檢測差異lncRNA 的表達水平,內(nèi)參基因為GAPDH,上海生工生物工程股份有限公司協(xié)助完成引物設(shè)計和合成,序列見表1。
采用SPSS 20.0(IBM 公司,美國)對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析,正態(tài)分布的計量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,組間比較采用獨立樣本t檢驗。P<0.05 表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
熱圖顯示,與骨量正常組相比,骨質(zhì)疏松組外周血PBMC 細胞中存在15 個差異表達的lncRNA(P<0.05)(圖1),其中NONHSAT005760.2表達量明顯上調(diào)(P<0.01)。
圖1 外周血中l(wèi)ncRNA的差異表達情況
qPCR檢測結(jié)果顯示,骨質(zhì)疏松組病人外周血中NONHSAT005760.2 的表達量明顯上升(P<0.05)(圖2)。
圖2 NONHSAT005760.2在臨床病人外周血中的表達
在h-BMSCs 成骨誘導(dǎo)14 d 過程中,成骨相關(guān)基因ALP、Runx2、OCN、OPN 的表達均明顯上調(diào)(圖3),同時誘導(dǎo)14 d后茜素紅染色結(jié)果顯示鈣沉積明顯,基因和形態(tài)學(xué)結(jié)果均表明成骨誘導(dǎo)成功(圖4)。
圖3 成骨相關(guān)基因的表達(與0 d比較,*P<0.05)
圖4 成骨誘導(dǎo)14 d后茜素紅染色結(jié)果 a:對照組,×40;b:成骨誘導(dǎo)組,×40;c:對照組,×100;d:成骨誘導(dǎo)組,×100
qPCR檢測結(jié)果顯示NONHSAT005760.2的表達在h-BMSCs 成骨分化過程中隨著時間延長而降低(圖5),表明NONHSAT005760.2 的表達與成骨呈負相關(guān)。
圖5 成骨分化過程中l(wèi)ncRNA NONHSAT005760.2的相對表達情況(與0 d比較,*P<0.05)
隨著高通量測序技術(shù)的飛速發(fā)展,原本被認為是“轉(zhuǎn)錄噪音”的lncRNA 逐漸被證實在多種不同的生物學(xué)過程中發(fā)揮著重要作用。lncRNA 是一類長度超過200 個核苷酸,但不能翻譯成蛋白質(zhì)的RNA分子,其主要作用為信號分子,具有作為生物標(biāo)記物的潛能,且能調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄。lncRNAs 作為復(fù)雜有機體分子生物學(xué)的前沿研究領(lǐng)域,有其獨特的生物學(xué)特性及待開發(fā)潛力。lncRNAs 通常比mRNAs 的表達水平低,其表達具有細胞和組織特異性,可用于特定疾病的預(yù)測和診斷。越來越多研究發(fā)現(xiàn),lncRNAs幾乎參與調(diào)控基因表達的每一個階段[11-13]。
目前研究表明骨質(zhì)疏松癥與遺傳、雌激素、營養(yǎng)和生活方式密切相關(guān),主要發(fā)病機制是雌激素缺乏導(dǎo)致破骨細胞增殖分化,破骨細胞功能活躍,同時抑制破骨細胞凋亡,從而使骨吸收速度超過骨形成速度,造成骨質(zhì)有機物和無機物成比例地減少[14]。另外,雌激素受體、維生素D 受體、Ⅰ型膠原和轉(zhuǎn)化因子-β等基因多態(tài)性也與骨質(zhì)疏松關(guān)系密切[15]。
目前臨床上骨質(zhì)疏松癥病人以絕經(jīng)后女性居多,其發(fā)病隱匿,經(jīng)常是病人在骨折發(fā)生后做手術(shù)時才知道患有骨質(zhì)疏松,因此本研究旨在通過收集絕經(jīng)后女性外周血樣本進行高通量測序,從而尋找骨質(zhì)疏松相關(guān)的早期標(biāo)志物,以期為臨床骨質(zhì)疏松的早期診斷提供參考。關(guān)于非編碼RNA 近些年來才展開對其功能的研究[16],其中l(wèi)ncRNA作為其主要成員之一[7],在多種疾病中均被發(fā)現(xiàn)異常表達,但是其具體是通過何種機制如何發(fā)揮功能的,目前還處于一個相對空白的階段。lncRNA的異常表達,增多或者減少,均提示癌癥進展的一些階段,甚至可以預(yù)測早期癌癥治療的療效[17]。然而,當(dāng)前骨質(zhì)疏松癥lncRNA的研究主要采用了芯片技術(shù)以及qPCR方法,低通量和小樣本量進行局部研究。隨著二代高通量測序技術(shù)的發(fā)展,lncRNA測序技術(shù)在該領(lǐng)域研究中將有很大的應(yīng)用前景和技術(shù)優(yōu)勢。在骨質(zhì)疏松領(lǐng)域,目前有報道發(fā)現(xiàn)lncRNA 在骨質(zhì)疏松的發(fā)生、發(fā)展中也發(fā)揮著重要作用[18]。本研究發(fā)現(xiàn)NONHSAT005760.2 在骨質(zhì)疏松絕經(jīng)后婦女外周血中明顯高表達,同時在h-BMSCs成骨分化過程中低表達,表明其與骨質(zhì)疏松密切相關(guān)。可作為預(yù)測骨質(zhì)疏松的指標(biāo)。提示lncRNA NONHSAT005760.2有希望成為絕經(jīng)后婦女骨質(zhì)疏松診斷的分子標(biāo)志物,為骨質(zhì)疏松的防治提供了新的思路。但lncRNA NONHSAT005760.2 與骨質(zhì)疏松癥的具體作用通路和下游具體分子機制尚不明確,NONHSAT005760.2 的下游通路和對成骨的具體作用機制是我們下一步研究的重要方向,亟待我們進一步探究。