李偉杰,田野,豈曉鑫,蔣桃珍
(中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所,北京 100081)
雞白痢沙門(mén)菌(Salmonellapullorum)具有高度適應(yīng)專(zhuān)一宿主的特點(diǎn),可引起雞白痢,雛雞多呈急性敗血癥經(jīng)過(guò),成年雞多呈慢性或隱性經(jīng)過(guò),可水平傳播,亦可經(jīng)卵垂直傳播,是對(duì)雞群危害最嚴(yán)重的病原細(xì)菌之一[1]。世界動(dòng)物衛(wèi)生組織將雞白痢列為通報(bào)疫病,我國(guó)農(nóng)業(yè)部將其列為二類(lèi)動(dòng)物疫病。目前在我國(guó),養(yǎng)雞業(yè)存在多種養(yǎng)殖模式,其飼養(yǎng)環(huán)境、生物安全管理水平參差不齊,雞白痢依然發(fā)生和流行[2-3]。疫苗接種被認(rèn)為是降低雞群感染和防控疾病的有效措施之一,但目前還沒(méi)有針對(duì)雞白痢的商品化疫苗[4],生產(chǎn)中多用抗生素進(jìn)行預(yù)防和治療,但抗生素的長(zhǎng)期使用甚至是不合理使用,已使細(xì)菌產(chǎn)生耐藥性,導(dǎo)致動(dòng)物成為耐藥菌的重要貯存庫(kù)[5]。
沙門(mén)菌的分型方法包括血清學(xué)分型、藥物敏感試驗(yàn)、多位點(diǎn)序列分型(MLST)等,這些方法在確定與追蹤沙門(mén)菌的感染及溯源方面起著重要的作用[6]。血清分型是監(jiān)測(cè)動(dòng)物中沙門(mén)菌存在與流行的有效工具,細(xì)菌的耐藥特征在流行病學(xué)研究中同樣有重要意義,多位點(diǎn)序列分型是一種基于細(xì)菌看家基因序列的分型方法,在對(duì)病原體流行病學(xué)溯源與監(jiān)控中起重要作用。
本文采用沙門(mén)屬特異性PCR、血清學(xué)試驗(yàn)、雞白痢沙門(mén)菌/雞傷寒沙門(mén)菌鑒別PCR、MLST等方法和藥敏試驗(yàn)分析揚(yáng)州江都區(qū)雞白痢沙門(mén)菌的流行和耐藥情況,為合理用藥提供指導(dǎo),也為雞白痢的綜合防控和凈化提供參考。
樣品為2018至2019年從揚(yáng)州江都區(qū)不同養(yǎng)殖場(chǎng)疑似患雞白痢的病死雞體內(nèi)分離的59株沙門(mén)菌,PCR陽(yáng)性對(duì)照菌株雞白痢沙門(mén)菌CVCC 79201和雞傷寒沙門(mén)菌CVCC 3759,藥敏試驗(yàn)質(zhì)控菌株大腸桿菌ATCC 25922和ATCC 35218,均由中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所收集保存。
胰大豆蛋白胨瓊脂(TSA)購(gòu)自O(shè)XOID公司;沙門(mén)菌O多價(jià)和單價(jià)血清購(gòu)自丹麥國(guó)家血清研究院;10×ExPCR Buffer、dNTP、ExTaq酶、瓊脂糖購(gòu)自寶生物工程(大連)有限公司;染料Goldview購(gòu)自北京賽百盛基因技術(shù)有限公司;革蘭陰性需氧菌藥敏板購(gòu)自天津金章科技發(fā)展有限公司。
參考文獻(xiàn)[7-8],針對(duì)基因invA(編碼吸附和侵襲上皮細(xì)胞表面蛋白)、glgC(編碼葡糖-1-磷酸腺苷?;D(zhuǎn)移酶)和speC(編碼鳥(niǎo)氨酸脫羧酶),由中美泰和生物技術(shù)(北京)有限公司合成引物,具體見(jiàn)表1。沙門(mén)菌的MLST分型中7個(gè)看家基因aroC、dnaN、hemD、hisD、purE、sucA和thrA引物參照http:mlst.warwick.ac.uk/mlst/dbs/Senterica,具體見(jiàn)表1。
表1 引物信息
選擇沙門(mén)菌屬侵襲性抗原保守基因invA序列設(shè)計(jì)的1對(duì)引物進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增目的片段大小為284 bp,DNA的提取采用熱裂解法.
PCR反應(yīng)體系(50 μL):10×ExPCR Buffer 5 μL,dNTP(2.5 mmol/L)4 μL,模板DNA 2 μL,引物(10 μmol/L)各1 μL,ExTaq酶(5 U/μL)0.5 μL,補(bǔ)水至50 μL。
PCR反應(yīng)條件: 94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。同時(shí)設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照和空白對(duì)照。PCR產(chǎn)物用1.0%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳。
采用玻片凝集法,將復(fù)蘇的沙門(mén)菌在TSA平板中進(jìn)行傳代,用一次性接種環(huán)蘸取適量菌苔與O多價(jià)血清充分混勻,來(lái)回傾斜晃動(dòng)載玻片10 s,觀察凝集現(xiàn)象,若凝集則說(shuō)明具有對(duì)應(yīng)的O多價(jià)抗原;挑取單菌落在SWARM瓊脂中央點(diǎn)一點(diǎn),37 ℃正向培養(yǎng)過(guò)夜,測(cè)定H抗原的操作同O抗原,出現(xiàn)凝集反應(yīng)即為陽(yáng)性;以生理鹽水作為陰性對(duì)照,檢查菌株自身有無(wú)自凝現(xiàn)象。最后查閱White-Kauffmann抗原表[9]確定沙門(mén)菌的血清型。
采用glgC和speC雙重PCR鑒別雞白痢沙門(mén)菌。DNA的提取采用熱裂解法。PCR反應(yīng)體系(50 μL):10×ExPCR Buffer 5 μL,dNTP(2.5 mmol/L)4 μL,模板DNA 2 μL,引物(10 μmol/L)各1 μL,ExTaq酶(5 U/μL)0.5 μL,補(bǔ)水至50 μL。
PCR反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,65 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,30個(gè)循環(huán);72 ℃延伸7 min。同時(shí)設(shè)置陽(yáng)性對(duì)照和空白對(duì)照。PCR產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳。
DNA的提取采用熱裂解法。對(duì)沙門(mén)菌的7個(gè)看家基因aroC、dnaN、hemD、hisD、purE、sucA和thrA分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
PCR反應(yīng)體系(50 μL):10×ExPCR Buffer 5 μL,dNTP(2.5 mmol/L)4 μL,上游和下游引物(10 μmol/L)各1 μL,ExTaq酶(5 U/μL)0.5 μL,補(bǔ)水至50 μL。
PCR反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5min;94 ℃變性45 s,56 ℃退火45 s,72 ℃延伸60 s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸7 min??醇一驍U(kuò)增產(chǎn)物由中美泰和生物技術(shù)(北京)有限公司完成測(cè)序,序列測(cè)序結(jié)果上傳http://mlst.warwick.ac.uk/mlst/dbs/Senterica進(jìn)行分析,基于等位基因位點(diǎn)的組合而獲得目標(biāo)菌株的序列型(sequence type,ST)。利用https://pubmlst.org/bigsdb?db=pubmlst_salmonella_seqdef中的BURST程序進(jìn)行ST型克隆群(clonal complexes,CC)歸類(lèi)。
操作方法參照文獻(xiàn)[10],利用微量肉湯稀釋法對(duì)12種抗菌藥物進(jìn)行耐藥性分析。將臨床分離的59株雞白痢沙門(mén)菌進(jìn)行復(fù)蘇培養(yǎng),挑取2~3個(gè)單菌落置5 mL滅菌生理鹽水中,用麥?zhǔn)媳葷醿x調(diào)整濁度至0.5個(gè)麥?zhǔn)蠞岫?,使含菌量約為1.5×108CFU/mL;取上述菌液60 μL,加入12 mL的藥敏接種培養(yǎng)液中,進(jìn)行混勻稀釋?zhuān)冒说酪埔浩骷尤?6孔革蘭陰性需氧菌藥敏板中。每孔100 μL,將板條放入恒溫培養(yǎng)箱,37 ℃培養(yǎng)18~20 h。在質(zhì)控菌株的最低抑菌濃度符合規(guī)定范圍的前提下,按判斷標(biāo)準(zhǔn)判斷被檢菌株的敏感性并進(jìn)行耐藥性結(jié)果分析。
對(duì)59株臨床分離的沙門(mén)菌進(jìn)行屬特異性PCR擴(kuò)增,均擴(kuò)增出大小284 bp左右的單一目的條帶,與預(yù)期的片段大小一致,陽(yáng)性對(duì)照成立,空白對(duì)照沒(méi)有擴(kuò)增條帶,部分臨床分離株的電泳結(jié)果見(jiàn)圖1,表明分離菌株均為沙門(mén)菌。
M. DL 2000 DNA Marker; 1~9. 臨床分離株;10.空白對(duì)照;11~12.陽(yáng)性對(duì)照?qǐng)D1 部分沙門(mén)菌菌株invA基因擴(kuò)增產(chǎn)物
用玻板凝集試驗(yàn)進(jìn)行血清型鑒定,59株臨床分離菌株與O9和O12因子血清均呈陽(yáng)性反應(yīng),而與H-a、H-d、H-g.m、H-g. p因子血清均呈陰性反應(yīng),血清抗原式為(9, 12:-:-)。
59株確定為沙門(mén)菌菌株經(jīng)雙重PCR后電泳檢測(cè),僅擴(kuò)增出252 bp的片段(speC基因),根據(jù)雞白痢沙門(mén)菌PCR鑒定判定標(biāo)準(zhǔn),59株為雞白痢沙門(mén)菌。臨床分離株部分電泳結(jié)果見(jiàn)圖2。
M. DL 2000 DNA Marker;1~9. 雞白痢沙門(mén)菌臨床分離株;10.雞白痢沙門(mén)菌CVCC 79201;11.雞傷寒沙門(mén)菌CVCC 3759;12.空白對(duì)照?qǐng)D2 雞白痢沙門(mén)菌鑒別PCR
利用特異性引物對(duì)雞白痢沙門(mén)菌臨床分離株的基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增和測(cè)序,得到7個(gè)看家基因的序列后上傳沙門(mén)菌MLST數(shù)據(jù)庫(kù),共得到10個(gè)等位基因,不同的等位基因組合后,共獲得4種ST型,即ST 92、ST 2151、ST 3721和ST 3722,其中ST 92為優(yōu)勢(shì)基因型,具體見(jiàn)表2。利用BURST程序分析,4個(gè)ST型同屬于CC 2151。
表2 雞白痢沙門(mén)菌MLST鑒定
將59株雞白痢沙門(mén)菌進(jìn)行了12種抗菌藥物的敏感試驗(yàn),結(jié)果顯示:雞白痢沙門(mén)菌對(duì)磺胺異惡唑(SF)的耐藥率最高,對(duì)氨芐西林(AMP)、頭孢噻呋(CEF)、黏菌(CL)素的耐藥性次之,對(duì)其他8種抗菌藥物無(wú)耐藥性,具體見(jiàn)表3。6株菌存在多重耐藥,其中5株為ST 92,1株為ST 3721。59株菌對(duì)12種藥物的耐藥結(jié)果形成4種耐藥譜型,分別為SF、AMP-CL、AMP-CEF、AMP-CEF-SF。
表3 雞白痢沙門(mén)菌藥敏試驗(yàn)
雞白痢沙門(mén)菌和雞傷寒沙門(mén)菌同屬于沙門(mén)菌血清D1群,血清抗原式均為(1, 9, 12:-:-),為同一血清型的不同生物型,因此血清學(xué)方法不能區(qū)分兩者[11]。傳統(tǒng)的區(qū)別方法是基于生化試驗(yàn),主要包括葡萄糖(產(chǎn)氣)、衛(wèi)矛醇、麥芽糖、鳥(niǎo)氨酸脫羧酶等[12],但一些臨床分離株具有非典型的生化特性[13]?;贒NA的分子技術(shù)有限制性?xún)?nèi)切酶片段長(zhǎng)度多態(tài)性(RFLP)、單鏈構(gòu)象多態(tài)性(SSCP)和等位基因特異性PCR方法等[14-17],這些方法都針對(duì)單核苷酸多態(tài)性,只有單個(gè)核苷酸的變異,常規(guī)PCR后需進(jìn)行后續(xù)操作或需要二次PCR。因?yàn)檫@些固有的局限性,在臨床診斷方面較為費(fèi)時(shí)費(fèi)力。隨著全基因組測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,越來(lái)越多的沙門(mén)菌全基因組序列完成測(cè)序,通過(guò)序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)在糖原合成基因位點(diǎn)和鳥(niǎo)氨酸脫羧酶合成基因位點(diǎn),雞傷寒沙門(mén)菌、雞白痢沙門(mén)菌與其他D群腸道沙門(mén)菌之間存在差異,據(jù)此設(shè)計(jì)合成引物可以用來(lái)區(qū)分兩者[8, 18],本研究利用glgC和speC基因特異性引物能夠有效的區(qū)分59株臨床分離的沙門(mén)菌。
沙門(mén)菌抗原結(jié)構(gòu)復(fù)雜,根據(jù)菌體抗原(O抗原)、鞭毛抗原(H抗原)以及Vi抗原的不同,按照Kauffman-White抗原表,截止到2014年共報(bào)道了2 659種血清型[19]。依據(jù)7個(gè)看家基因aroC、dnaN、hemD、hisD、purE、sucA和thrA的多位點(diǎn)序列分型,截止到2021年1月22日,將沙門(mén)菌分為8 354個(gè)ST型。多位點(diǎn)序列分型作為一種常用的適合流行病學(xué)調(diào)查研究的方法,比血清分型具有更強(qiáng)的分型能力,可以更確切地進(jìn)行種群的結(jié)構(gòu)以及生物進(jìn)化方面的研究。本研究中的59株雞白痢沙門(mén)菌分為4種ST型,經(jīng)BURST程序分析,構(gòu)成以ST 2151為中心的克隆群,說(shuō)明從揚(yáng)州江都區(qū)分離的臨床分離株具有很高的親緣關(guān)系。
近年來(lái),隨著養(yǎng)禽業(yè)向規(guī)模化和集約化方向發(fā)展,細(xì)菌性疾病的混合感染導(dǎo)致細(xì)菌的耐藥性呈上升趨勢(shì);雞白痢的發(fā)病季節(jié)越來(lái)越不明顯,特別是一些飼料添加劑中盲目使用某些抗菌藥物,導(dǎo)致沙門(mén)菌的耐藥譜有很大的差異[20]。細(xì)菌的耐藥程度也與養(yǎng)殖場(chǎng)的用藥習(xí)慣密切相關(guān),用藥不當(dāng),不僅達(dá)不到治療效果,反而容易引起體內(nèi)正常菌群失調(diào)。在臨床用藥預(yù)防和治療時(shí),應(yīng)選擇平時(shí)少用或沒(méi)有用過(guò)的藥物,有條件的應(yīng)結(jié)合藥敏試驗(yàn)結(jié)果選用敏感藥物。在做好藥物選擇的同時(shí)加強(qiáng)飼養(yǎng)管理,采取聯(lián)合用藥,輪換使用不同的抗生素進(jìn)行定期預(yù)防,亦可采用微生態(tài)制劑來(lái)預(yù)防雞白痢[21]。建議養(yǎng)殖場(chǎng)結(jié)合本場(chǎng)的條件采用多種方法進(jìn)行定期監(jiān)測(cè),淘汰疑似陽(yáng)性病雞,從而做到逐步凈化雞群,達(dá)到經(jīng)濟(jì)效益的最大化。