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        miR-24家族的生成機制及生物學功能研究進展

        2021-12-13 13:43:02沈曼曼侯啟瑞王克華
        關(guān)鍵詞:脂質(zhì)靶向癌癥

        沈曼曼,李 濤,侯啟瑞,曲 亮,王克華,馬 猛,吳 萍*

        (1.江蘇科技大學 生物技術(shù)學院,鎮(zhèn)江 212100) (2.中國農(nóng)業(yè)科學院 江蘇省家禽科學研究所,揚州 225212)

        miR-24是一種重要的miRNA,在多種生命過程中發(fā)揮了關(guān)鍵的功能作用.miR-24的表達受到一些重要轉(zhuǎn)錄因子、非編碼RNA等調(diào)控影響,在癌癥發(fā)生、心血管調(diào)控、炎癥反應(yīng)、脂質(zhì)代謝、繁殖調(diào)控等方面發(fā)揮了重要作用.文中對miR-24的生成機制及miR-24在機體內(nèi)的調(diào)控功能最新研究進展作一綜述.

        1 microRNA的作用機制及生物功能

        microRNA(miRNA)是一類長度為18~25個核苷酸的非編碼單鏈RNA分子,是基因表達的重要調(diào)控因子,在各種生物過程中發(fā)揮重要的作用.其生物合成和表觀遺傳機制形成一個調(diào)控網(wǎng)絡(luò),相互調(diào)節(jié),共同調(diào)控一系列生物過程,廣泛參與細胞的增殖、分化、凋亡以及激素的合成與分泌等過程.miRNA的生物合成受到轉(zhuǎn)錄因子、非編碼RNA等諸多因素的調(diào)控.轉(zhuǎn)錄因子主要通過與miRNA啟動子區(qū)域相互作用調(diào)控miRNA的表達,如SMAD可以和Drosha復合體相互作用,通過提高Drosha加工過程增加一些miRNA的表達.一個miRNA也可以同時受多個轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控影響癌癥的發(fā)生及發(fā)展.非編碼RNA通過miRNA反應(yīng)元件(miRNA response element, MRE)吸附miRNA,以海綿體的角色影響miRNA的功能發(fā)揮.隨著對miRNA的深入研究,發(fā)現(xiàn)其調(diào)控作用呈現(xiàn)出多樣化、復雜化以及精準化等特點.動物miRNA的功能發(fā)揮主要是其種子序列與靶基因的3′非編碼區(qū)(untranslated region, UTR)、5′UTR以及蛋白質(zhì)編碼區(qū)(coding sequence,CDS)結(jié)合發(fā)揮生物學功能.

        2 miR-24的生成機制

        2.1 miR-24的生成

        miR-24首次在2001年被Lagos-Quintana等報道,目前相關(guān)研究報道已達751余篇(PubMed,截止至2020年12月),在各種組織中均有表達但表達水平不同,廣泛參與了細胞增殖、分化、凋亡等生命事件,影響了細胞發(fā)育和代謝、癌癥發(fā)展、炎癥反應(yīng)、病毒互作[1]等多個生命進程.人、小鼠、豬、牛、雞等物種miR-24均由兩條染色體剪切形成,人的miR-24分別來自于9號和19號染色體,小鼠的miR-24來自于8號和13號染色體,豬的miR-24來自于2號和10號染色體,牛的miR-24來自于7號和8號染色體,雞的miR-24來自于30號染色體和Z染色體.由miR-24形成兩種不同序列的剪接體:miR-24-3p和miR-24-5p,miR-24-3p發(fā)揮的生物學效應(yīng)較為廣泛,其序列為5’-UGGCUCAGUUCAGCAGGAA-3’,在人、小鼠、豬、牛、雞等物種中成熟序列高度一致(表1).

        表1 各物種miR-24-3p序列信息及其染色體位置

        2.2 轉(zhuǎn)錄因子對miR-24的調(diào)控作用

        轉(zhuǎn)錄因子通過調(diào)控miR-24上游區(qū)域影響其表達從而調(diào)控相關(guān)靶基因在細胞中的功能作用.miR-24-2上游含有RUX2轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,RUX2能夠降低miR-24的表達,從而解除miR-24對靶基因SATB2的抑制作用,影響骨細胞的分化[2].SMAD5作為BMPR4的下游轉(zhuǎn)錄因子,磷酸化后能夠與miR-24-3p上游啟動子區(qū)的結(jié)合位點作用,阻礙由BMP4誘導的胚胎干細胞凋亡過程[3].在結(jié)腸癌的研究中發(fā)現(xiàn)HIF-1α能夠與miR-24-3p啟動子區(qū)結(jié)合,促使miR-24-3p的靶基因PDHB、PDHA1、DLD等發(fā)揮功能作用,促進細胞存活[4].

        2.3 非編碼RNA對miR-24的表達調(diào)控作用

        基于競爭性內(nèi)源RNA(competing endogenous RNAs, ceRNA)理論,研究發(fā)現(xiàn)生物體內(nèi)miR-24的表達也受非編碼RNA的調(diào)控.非編碼RNA包括了長鏈非編碼RNA(long non-coding RNA, lncRNA)、環(huán)狀RNA(cicular RNA,circRNA)、轉(zhuǎn)運RNA(transfer RNA,tRNA)和核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA)等,其中以lncRNA調(diào)控miR-24的研究最多,廣泛影響癌癥的增殖、凋亡、纖維化等過程,參與癌癥的進展.lncRNA ANRIL通過下調(diào)miR-24表達,解除miR-24對靶基因的抑制從而促進視網(wǎng)膜母細胞瘤細胞的存活、遷移和侵襲[5].lncRNA MIR22HG高表達可抑制miR-24-3p在甲狀腺乳頭狀癌的高表達,從而參與癌癥發(fā)展過程[6].LncRNA IGBP1-AS1通過競爭性吸附miR-24-1影響ZIC3基因的表達,從而抑制乳腺癌的侵襲和增殖[7].

        miR-24不僅介導lncRNA對癌癥的發(fā)生進展過程,也廣泛參與了其他疾病的發(fā)生過程.lncRNA Gm5091可通過海綿吸附miR-27b~23b~24降低小鼠酒精性肝纖維化[8].linc00472啟動子甲基化異常導致linc00472表達水平降低,從而降低linc00472對miR-24的吸附作用,使miR-24表達水平升高,參與調(diào)節(jié)心房顫動[9].文獻[10]對小鼠心肌損傷模型研究發(fā)現(xiàn),非編碼lncRNA CYTOR通過與miR-24種子序列2-8位置結(jié)合調(diào)控其表達影響靶基因XIAP mRNA和蛋白的作用,從而調(diào)控小鼠膿毒病癥狀.

        隨著非編碼RNA研究的深入進行,發(fā)現(xiàn)circRNA也廣泛地參與到了生命過程中,且部分circRNA的發(fā)揮也需要miR-24的參與.文獻[11]對成肌細胞分化過程中進行circRNA和miRNA測序分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)在成肌細胞分化過程中miR-24與circRNA表達呈負相關(guān)關(guān)系,表明了circRNA可能通過調(diào)控miR-24影響成肌細胞分化過程.

        3 miR-24的調(diào)控功能

        miRNA主要通過其成熟體的第2~8個堿基與靶基因的UTR或CDS區(qū)域完全或部分互補配對,誘導靶mRNA的降解或抑制靶基因的蛋白合成,從而在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控基因表達.miR-24主要與靶基因3′UTR、5′UTR和CDS區(qū)域結(jié)合發(fā)揮生物學功能(表2).

        表2 miR-24在癌癥、心血管疾病、脂代謝及卵巢發(fā)育中的功能作用及其靶基因

        以miR-24-3p為搜索關(guān)鍵詞,在miRWalk數(shù)據(jù)中已驗證的hsa-miR-24-3p靶基因有2000多個,包括BCL2L11、CYP11B2、SP1等(http:∥mirwalk.umm.uni-heidelberg.de/interactions/).miR-24對靶基因的調(diào)控也表現(xiàn)了復雜性特點,不同的miR-24成熟體會靶向不同的基因達到共同調(diào)控作用.同一個成熟體對部分基因可以單獨靶向3′UTR、5′UTR或CDS區(qū)域發(fā)揮調(diào)控作用,也會同時靶向基因的3′UTR和5′UTR區(qū)域發(fā)揮復雜的調(diào)控作用.文獻[12]對小鼠的胚胎干細胞(ESC)研究發(fā)現(xiàn)miR-24-3p和miR-24-2-5p能夠共同靶向KLF4和C-MYC的3′UTR區(qū)域,并負反饋調(diào)控PRMT7的表達,從而誘導ESC的全能分化特性.文獻[13]研究發(fā)現(xiàn)miR-24-3p能夠同時靶向JAB1 3′UTR和5′UTR影響鼻咽癌的進展過程.miR-24通過多種復雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)參與了諸多的生物過程.

        3.1 miR-24對癌癥發(fā)生的作用

        miR-24廣泛參與多種癌癥的進展過程,在生命體內(nèi)通過不同的調(diào)控途徑參與癌細胞的增殖、凋亡、遷移和侵襲等過程,然miR-24受多種因素的影響以及調(diào)控多個靶基因?qū)Π┌Y的發(fā)生過程發(fā)揮雙重作用.諸多研究通過構(gòu)建小鼠疾病模型或體外培養(yǎng)人癌細胞,在細胞和個體水平上驗證miR-24對腫瘤發(fā)展的作用影響,利用增殖、凋亡、靶點互作等研究技術(shù)驗證其相關(guān)功能.研究發(fā)現(xiàn)miR-24在乳腺癌、膠質(zhì)瘤、霍奇金淋巴瘤細胞、腎癌細胞中高表達,通過促進癌細胞增殖、遷移、侵襲的能力促進癌癥發(fā)展.其作用的發(fā)揮也主要通過與靶基因的UTR區(qū)域結(jié)合,如miRNA-23b~27b~24 主要通過靶向轉(zhuǎn)錄因子FOXP2基因的啟動子區(qū)域,從而降低FOXP2基因的mRNA和蛋白的表達水平,促進結(jié)腸癌細胞的遷移[14].miR-24通過靶向MAPK7、ZNF376[15]促進肺癌細胞增殖、遷移和侵襲.miR-23a~27a~24-2基因家族通過靶向SOCS6基因抑制其表達,從而促進胃癌細胞的增殖和遷移作用[16].

        此外,miR-24在一些癌癥進展過程中起到抑制的作用,如胰腺癌、骨肉瘤細胞、大腸癌、鼻咽癌等.β-catenin基因突變廣泛參與各種癌癥的發(fā)生過程,miR-24通過抑制β-catenin表達從而抑制癌癥發(fā)生,是β-catenin基因有效調(diào)節(jié)因子.在膠質(zhì)瘤中研究發(fā)現(xiàn)miR-24能夠調(diào)節(jié)β-catenin基因從而影響膠質(zhì)瘤細胞的存活和自噬功能[17].在結(jié)腸癌中,miR-24-1-5p可以靶向β-catenin基因從而抑制β-catenin的表達,達到抑制癌細胞增殖、遷移和存活的能力[18].在其他各類癌癥中,miR-24通過靶向DND1抑制胃癌細胞的增殖、遷移和侵襲的作用,靶向LAMB3抑制胰腺導管腺癌的增殖,調(diào)控SW48細胞的凋亡抑制大腸癌[19-20]等多種癌癥進展過程,在上述抑癌作用中可將miR-24作為治療癌癥的靶點,從而提高化療的敏感性.

        在癌癥發(fā)生過程中miR-24在血清中的表達水平可以作為癌癥的臨床診斷標記.文獻[21]研究發(fā)現(xiàn)miR-24-3p在口腔鱗狀細胞癌腫瘤組織表達水平較高,且外源性的miR-24-3p增加了惡性腫瘤細胞的增殖作用,揭示唾液中的miR-24-3p可以作為口腔鱗狀細胞癌篩查的潛在檢測標志物.文獻[22]研究發(fā)現(xiàn)口腔鱗狀細胞癌患者血清中miR-24的表達水平較正常人要高,進一步說明miR-24可以作為一種口腔癌診斷工具.除了在口腔癌中,在對胃癌的研究發(fā)現(xiàn)miR-24在早期胃癌的表達水平顯著低于晚期胃癌血清中,上述研究提示miR-24可以作為癌癥進展的生物標記物.

        3.2 miR-24對心血管疾病的影響

        miR-24在心血管系統(tǒng)中廣泛存在,能夠抑制發(fā)育期和心肌梗死的血管生成,從而影響心血管的功能作用.miR-24是一種對缺氧敏感的miRNA,能夠通過調(diào)節(jié)血管功能參與心血管疾病的發(fā)展.miR-24通過與Notch基因3′UTR結(jié)合靶向調(diào)節(jié)Notch以及其他一些血管形態(tài)因子參與調(diào)節(jié)肢體肌肉缺血后的微血管反應(yīng)過程[23].miR-24-3p通過靶向BCL2L11,使冠心病患者外周血BCL2L11表達下調(diào),抑制血管平滑肌細胞的凋亡,可作為治療冠心病的潛在靶點[24].miR-24的上調(diào)表達通過PI3K/Akt/mTOR軸的PIK3R1,抑制血管平滑肌細胞增殖、遷移,顯著減輕糖尿病大鼠血管重構(gòu)[25].miR-24-3p可通過激活NRF2-Keap1信號通路,降低Keap1蛋白表達水平,達到保護心肌細胞免受缺血/再灌注損傷過程[26].miR-24參與糖尿病的血管重構(gòu)過程,miR-24通過參與NLRP3相關(guān)炎癥信號通路,抑制損傷動脈膜增生過程,從而減輕糖尿病大鼠的血管重塑過程[19].miR-24在血清中的不同表達水平也與心血管疾病進展不同時期相關(guān),如miR-24、miR-23a和miR-145a在急性心肌梗死后的急性腎損傷患者的血清中表達水平顯著下調(diào),提示這3種miRNA可以作為早期發(fā)現(xiàn)急性心肌梗死的標記基因.

        3.3 miR-24在脂質(zhì)代謝中的功能作用

        miRNA影響脂質(zhì)代謝過程, 主要通過參與調(diào)控前脂肪細胞分化、肝臟脂質(zhì)和血漿中脂類的合成等過程.在影響脂肪分化形成上通過不同的調(diào)節(jié)作用起到促進或抑制的作用,文獻[27]研究發(fā)現(xiàn)過表達miR-24可以抑制MAPK7,增加PPAR-γ、SREBP1基因的表達,使脂滴形成和甘油三酯的積累增加,從而顯著促進3T3-L1的脂肪生成.而miR-23a~27a~24基因家族通過同時靶向促脂肪(GPAM、DGAT2)和抑脂肪(DCN、G6PD、LPL)相關(guān)基因調(diào)控牛脂肪細胞生成過程,最終基因家族的平衡調(diào)節(jié)作用抑制脂肪的生成.miR-24的過表達下調(diào)與脂肪生成有關(guān)的某些基因(FASN、ACLY和SCD1)表達,但增加膽固醇合成、脂質(zhì)合成相關(guān)基因(HMGCR、DHCR24和SREBP2)的表達,其功能的發(fā)揮主要是通過靶向基因SR-B1實現(xiàn)[28].miR-24同時影響脂質(zhì)代謝相關(guān)產(chǎn)物的生成,在腦梗死大鼠中miR-24能夠降低血清中總膽固醇、高密度脂蛋白以及甘油三酯水平,進而抑制腦組織的凋亡[29].miR-24在高脂小鼠的肝臟和離體的人肝細胞中表達水平顯著增加,其作用機制主要是通過抑制Insig1促進肝臟脂質(zhì)沉積和高脂血癥,miR-24被敲除后將導致肝臟脂質(zhì)積聚受損,血漿甘油三酯降低,提示miR-24可作為動脈粥樣硬化的潛在治療劑[30].在動物生產(chǎn)上的研究發(fā)現(xiàn)miR-24參與了兔肝細胞中多不飽和脂肪酸的生物合成過程[31].在山羊乳腺組織泌乳期和干乳期的表達水平顯著不同,體外實驗表明miR-24通過靶向FAS影響甘油三酯含量、調(diào)控SREBP1等基因的表達從而影響乳汁中脂肪酸含量[32].

        3.4 miRNA-24對卵巢及卵泡生長的調(diào)控

        miRNA參與卵巢發(fā)育的整個生物學功能,包括卵泡生長、閉鎖以及排卵等一系列過程中的因子調(diào)控功能,卵泡生長各個階段受特異性表達的miRNA調(diào)控.miR-24也參與繁殖過程中的各個途徑,人卵泡液中的miR-24-3p能夠調(diào)控雌二醇和孕酮的水平,降低睪酮水平[33].miR-24-3p能夠靶向SMAD5通過FasL-Fas信號通路調(diào)控人卵泡顆粒細胞凋亡水平[34].miR-24的表達水平與牛卵泡顆粒細胞發(fā)育相關(guān),影響受精率,與山羊的妊娠狀態(tài)相關(guān)等.miR-24-3p還能夠降低HepG2細胞脂質(zhì)沉積能力,而脂質(zhì)沉積影響了雞卵泡生長過程.miR-24-3p在30周齡的雞的肝臟中表達水平下降[35],表明其有可能參與了卵黃脂質(zhì)合成及代謝,影響卵黃沉積等過程,從而影響卵泡生長.

        3.5 miR-24在其他生物過程中的作用

        miR-24除了影響細胞增殖、凋亡等過程,也影響如少突膠質(zhì)前體細胞、神經(jīng)元、胚胎干細胞等分化過程.文獻[36]研究發(fā)現(xiàn)miR-24在損傷的脊髓細胞中表達水平增加,并通過靶向調(diào)節(jié)ADM抑制少突膠質(zhì)細胞前體細胞的分化.文獻[37]研究發(fā)現(xiàn)miR-24-3p通過控制海馬鈣蛋白的表達來調(diào)節(jié)神經(jīng)元的分化進展.文獻[3]研究發(fā)現(xiàn)BMP4通過募集SMAD5調(diào)控miR-23a/b~27a/b~24啟動子序列,使miR-23a/b~27a/b~24影響胚胎干細胞的分化功能.

        miR-24也參與機體內(nèi)炎癥反應(yīng)和氧化應(yīng)激等生物過程,并通過靶向基因的功能作用作為疾病治療靶點.文獻[38]將外源性miR-24-3p轉(zhuǎn)染進缺血再灌注小鼠的肝臟中,發(fā)現(xiàn)miR-24-3p可顯著抑制肝臟內(nèi)STING和p-IRF3蛋白的表達,從而達到減輕炎性細胞因子的釋放,并降低肝細胞功能障礙和凋亡過程.文獻[39]研究發(fā)現(xiàn)抑制類風濕關(guān)節(jié)炎的GSK-3β抑制劑TDZD-8能夠通過下調(diào)miR-24表達,降低類風濕關(guān)節(jié)炎的炎癥反應(yīng)過程,說明miR-24促進類風濕關(guān)節(jié)炎的發(fā)生.miR-24在潰瘍性結(jié)腸炎患者的結(jié)腸活檢和血液樣本中比健康對照組的表達水平要高,進一步研究提示miR-24是腸道免疫屏障的重要調(diào)節(jié)因子[40].在氧化應(yīng)激上研究顯示miR-24在人體外胸主動脈平滑肌細胞的上調(diào),可以通過NRF2/HO-1信號通路抑制細胞內(nèi)ROS、MDA等的活性水平,從而抑制細胞的氧化應(yīng)激反應(yīng)[41].

        4 展望

        綜上所述,miR-24的調(diào)控是一個復雜的系統(tǒng),其表達水平受到轉(zhuǎn)錄因子和非編碼RNA等多方面調(diào)控,其功能發(fā)揮主要通過與不同靶基因結(jié)合廣泛地參與細胞增殖、分化、凋亡等過程.研究表明miRNA的生成機制和作用靶基因在各物種或各組織中表現(xiàn)差異性,因此進一步研究miR-24在不同物種或組織中的生物合成的分子機制及其調(diào)控作用,將為miR-24家族成員的生物學功能提供新的見解.然目前的研究多集中于在人、小鼠物種,相關(guān)組織也多與腫瘤相關(guān),大部分的miR-24的靶基因及其相關(guān)功能仍未被解析驗證,仍存在許多科學問題有待于深入研究,全面剖析miR-24的功能作用仍有很長的路要走.

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