王煜

研究人員在上海市重大傳染病和生物安全研究院的加強型生物安全二級（BSL-2+）實驗室。

響應(yīng)疫情帶來的現(xiàn)實需求、落實上?！肮l(wèi)20條”的部署，上海市重大傳染病和生物安全研究院（簡稱“傳研院”）自2020年11月在復(fù)旦大學(xué)揭牌成立以來的一年間，勤懇探索，邊建邊研，始終不忘肩負的特殊使命。

研究院為每一次上?？茖W(xué)精準(zhǔn)防控提供關(guān)鍵建議;為疫苗接種策略、陸路口岸管理等國家疫情防控重大決策的制定，提供了重要的科學(xué)建議。

傳研院院長、復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院副院長吳凡表示：研究院正加速攻關(guān)傳染病防控關(guān)鍵技術(shù)，為保障人民健康和城市公共衛(wèi)生安全貢獻上海力量。

助力決策，精準(zhǔn)抗疫

傳研院是由上海市人民政府和復(fù)旦大學(xué)共同建設(shè)的獨立法人事業(yè)單位，整合上海市在傳染病和生物安全領(lǐng)域的優(yōu)勢單位，旨在為上海和國家公共衛(wèi)生安全體系提供人才、技術(shù)支持以及政策建議。

在新冠疫情這一特殊的時期建立，傳研院的一大重要使命就是為國家的疫情防控策略提供基于科學(xué)依據(jù)的建議。例如，傳研院雙聘PI（Principle Investigator，學(xué)術(shù)帶頭人）、復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院羅力教授帶領(lǐng)團隊承接上海市政協(xié)《公共衛(wèi)生應(yīng)急管理體系建設(shè)》重大調(diào)研課題，自2021年3月以來，走訪了上海市衛(wèi)健委、徐匯區(qū)政府、浦東新區(qū)政府、復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院等單位，邀請政協(xié)委員、相關(guān)政府部門負責(zé)人、資深專家等召開專題座談會16次，300多人次參與座談。此外，課題組認真研究了美國、日本、新加坡等國家的應(yīng)急管理體系建設(shè)經(jīng)驗，以及北京市、湖北省、武漢市等省市應(yīng)急管理體制機制的改革實例。

運用公共衛(wèi)生與應(yīng)急管理科學(xué)的交叉學(xué)科研究方法，課題組得出的調(diào)查結(jié)果顯示：上海市開展疫情防控基本實現(xiàn)了“統(tǒng)一指揮、專常兼?zhèn)?、上下?lián)動、反應(yīng)靈敏”。在實施常態(tài)化防控后，上海應(yīng)對歷次疫情，做到了快速響應(yīng)、精準(zhǔn)防控，體現(xiàn)了“上海速度”和“上海精度”。同時，課題組提出了強化上海市公共衛(wèi)生應(yīng)急管理體系建設(shè)需要關(guān)注的主要問題，并給出了相應(yīng)解決建議。

實際上，在2020年新冠疫情暴發(fā)初期，羅力團隊就為上海和全國疫情防控的決策貢獻了智慧。例如，2020年2月，團隊向中央提交專報，提出“疫情防控應(yīng)該逐步進入常態(tài)化”;2020年4月，上海出臺的“公衛(wèi)20條”政策中，也體現(xiàn)了團隊的關(guān)鍵貢獻。

2020年4月，上海出臺的“公衛(wèi)20 條”政策中，也體現(xiàn)了羅力團隊的關(guān)鍵貢獻。

“當(dāng)前我們防止境外疫情輸入獲得了較好成果，限制入境人數(shù)、降低防控成本是很關(guān)鍵的一點?！绷_力向《新民周刊》表示。數(shù)據(jù)顯示：2019年從上海入境人次超過2000萬，而2021年截至當(dāng)前只有100萬人次左右。他認為，當(dāng)下防控策略的成效是明顯的，效果大于成本;但這并非長久之計。他帶領(lǐng)的團隊正在抓緊研究，希望為國家提出“疫情防控新常態(tài)”的策略，來解決當(dāng)前面臨的新情況、新問題，使得將來我們的國門可以安全地打開。

左圖：加強型生物安全二級（BSL-2+）實驗室動物實驗區(qū)域。右上圖：病原樣本庫平臺。右下圖：病原樣本庫平臺監(jiān)控室。

疫苗的接種是抗擊新冠肺炎的關(guān)鍵策略，在此領(lǐng)域，傳研院雙聘PI、復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院余宏杰教授帶領(lǐng)團隊開展了“新冠肺炎的流行病學(xué)、干預(yù)措施效果及疫苗接種策略研究”。團隊積極將科研成果轉(zhuǎn)化為公共衛(wèi)生政策，向上海市政府、國家衛(wèi)健委、中國疾控中心等部門遞交了13份政策報告，助力制定新冠肺炎的防控方案及疫苗接種策略。

2021年3月，團隊提交了新冠病毒變異毒株研究報告;7月，團隊提出“通過疫苗接種建立群體免疫以控制新冠病毒原型株和變異株在中國的流行”;8月，團隊先后提交了“新冠病毒Delta變異株引入中國導(dǎo)致流行的疾病負擔(dān)估計”和“新冠病毒Lambda變異株的流行趨勢和主要特點”研究報告。

在上海和全國防控新冠疫情的策略中，凝聚著大量傳研院研究者團隊的真知灼見，他們是默默守衛(wèi)人民群眾生命健康安全的幕后英雄。

抗擊新冠需要全球合作，傳研院研究者同樣為世界貢獻了抗疫智慧。傳研院雙聘PI、復(fù)旦大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院王偉炳教授帶領(lǐng)團隊在輸入性風(fēng)險預(yù)測、全球性疫情防控干預(yù)措施效果等研究領(lǐng)域取得系列成果。

新冠疫情暴發(fā)初期，人們關(guān)心的一個問題是：新冠病毒是否會像SARS病毒一樣在夏天消失？2020年春季，王偉炳團隊從全球水平層面探究了8個國家202個地區(qū)的平均氣溫、平均最高氣溫、平均最低氣溫、相對濕度和紫外線與累計報告病例數(shù)和新冠病毒基本再生數(shù)的關(guān)系。研究成果最終報送上海市政府并建議：不能依靠天氣回暖來抑制病毒的傳播，建議繼續(xù)執(zhí)行適度嚴(yán)格的疫情防控措施。這項成果發(fā)表在《歐洲呼吸學(xué)雜志》上，成為向全球貢獻的抗疫“中國智慧”。

針對嚴(yán)重威脅全球公共衛(wèi)生安全的新發(fā)、重大傳染病，包括新冠肺炎、季節(jié)性流感和禽流感、艾滋病、結(jié)核、手足口病、肺炎鏈球菌病等，傳研院正在進行高質(zhì)量、智能化的生物安全樣本庫建設(shè)。

搭建平臺，服務(wù)一線

在為抗疫提供決策建議之外，傳研院也直接為應(yīng)對疫情的一線研制出了可運用的工具。

新冠疫情以來，人們對核酸檢測變得熟悉。實際上，除了新冠病毒以外，很多呼吸道疾病的病原體都可以通過熒光PCR方法來檢測。在同時檢測多種呼吸道疾病的臨床需求面前，當(dāng)前市場上常見的檢測試劑盒有不少缺陷：要么檢測時間長，要么價格高，或者多重PCR只能檢測少數(shù)臨床常見病原微生物。

針對這樣的問題，傳研院雙聘PI、復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院呼吸科與危重醫(yī)學(xué)科主任宋元林與中山醫(yī)院檢驗科郭瑋主任團隊聯(lián)合，并與生產(chǎn)企業(yè)合作，研發(fā)出38聯(lián)檢測PCR試劑盒。該試劑盒可以在4小時內(nèi)完成對既定38種呼吸道病原體的檢測，涵蓋臨床常見的99.9%的真菌、結(jié)核、細菌、病毒等病原微生物，靈敏度和特異性符合臨床呼吸道感染科的應(yīng)用需求。它不僅適用于臨床檢測，也可進行大規(guī)模流行病學(xué)調(diào)查。

上海市重大傳染病和生物安全研究院院長、復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院副院長吳凡。

“這個研究項目之前已經(jīng)開展了幾年時間，納入傳研院的框架后，獲得了快速的進展?！彼卧指嬖V《新民周刊》，以前各個學(xué)科的研究者在自己的領(lǐng)域深耕，平時可能連見面都不容易;共同進入傳研院這個平臺后，不同領(lǐng)域的專家有了近距離溝通交流的機會，“1+1>2”的合作更容易實現(xiàn)。

在傳研院，基礎(chǔ)研究與臨床研究也有了緊密聯(lián)結(jié)。他舉例說：當(dāng)前他的多個在研課題如建設(shè)重癥肺炎標(biāo)本庫、耐藥菌感染免疫分型研究等，就是和公衛(wèi)學(xué)院、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院等學(xué)院的教授團隊合作開展。

羅力團隊在新冠疫情初期的另一項成果也能很好地闡釋傳研院的平臺功能：2020年初，突如其來的疫情使得口罩供應(yīng)不足，生活在上海的很多人都有到居委會報備口罩需求，幾天后再到指定藥店按配額統(tǒng)一購買的經(jīng)歷。支撐這套體系運作的，就是羅力團隊開發(fā)的“口罩應(yīng)急調(diào)配信息系統(tǒng)”。該系統(tǒng)連接起居民、居委會、民政部門、商委、口罩生產(chǎn)企業(yè)、配送企業(yè)、藥店，運行到2020年3月底，保證了總計1.38億只口罩的有序流轉(zhuǎn)。

在這個團隊里，不僅有公共衛(wèi)生與計算機信息團隊的合作，還有臨床醫(yī)學(xué)、經(jīng)濟、新聞傳播、國際關(guān)系等多個專業(yè)的人員。

共同研究不僅跨學(xué)科，還涵蓋不同地域。王偉炳透露，依托傳研院的平臺，他帶領(lǐng)的團隊正與江蘇、浙江、安徽三省聯(lián)動，打造基于長三角區(qū)域的呼吸道綜合征監(jiān)測系統(tǒng);與全國各大醫(yī)院共同探索傳染病癥候群隊列研究，以盡早發(fā)現(xiàn)“苗子事件”，守護公眾健康。

2021年10月，上海市重大傳染病和生物安全研究院主辦“2021上海傳染病論壇暨申江健康論壇”，探討“新冠肺炎的研究進展”。

成立之初，傳研院就定下五大核心任務(wù)：構(gòu)建“全鏈?zhǔn)健笨蒲衅脚_;建立一支國際一流、長期從事傳染病和生物安全的研究隊伍;形成科研聯(lián)合攻關(guān)新模式;建設(shè)重大傳染病和生物安全創(chuàng)新型人才培養(yǎng)基地;構(gòu)建直通國內(nèi)外開放的合作體系。如今，這五大任務(wù)，都在逐步推進落實。

配備“神器”，科學(xué)共享

工欲善其事，必先利其器。傳研院擁有先進的硬件基礎(chǔ)設(shè)施，為前沿的科研提供保障。

傳研院的加強型生物安全二級（BSL-2+）實驗室平臺位于復(fù)旦大學(xué)上海醫(yī)學(xué)院，用于新發(fā)傳染病傳播與防控以及突發(fā)公共衛(wèi)生應(yīng)急領(lǐng)域的相關(guān)研究。BSL-2+實驗室中，有不少設(shè)備的能力位于國際領(lǐng)先水平。實驗室負責(zé)人蔡啟良介紹：動物活體成像設(shè)備就是實驗室擁有的“神器”之一。以往，進行病原體的動物感染實驗時，只能在感染了病原體的動物死亡后從其身體提取病理組織進行觀測，觀測的時間和空間維度都受到明顯限制。有了動物活體成像設(shè)備后，觀測可以變得三維立體化，而且可以涵蓋感染的前、中、后全部時間段;如此一來，研究的可行性、研究的精準(zhǔn)性和研發(fā)對應(yīng)藥物的有效性都能得到顯著提升。

第二代和第三代高通量測序平臺的結(jié)合，為疑難疾病病原體發(fā)現(xiàn)和鑒定、精準(zhǔn)多維度的疫苗全過程評價與免疫學(xué)分析等功能提供了技術(shù)支撐。這使得傳研院在面對重大新發(fā)傳染病疫情時，具備快速響應(yīng)能力和應(yīng)急保障能力。

這樣的能力得到了實戰(zhàn)的檢驗。2020年下半年上海黃浦區(qū)的一次疫情中，有一個密接者是出租車司機。傳研院生物安全實驗室在此之前對新冠病毒在木頭、塑料、鋼材等十幾種固體材質(zhì)表面的存活期開展過檢測，得出的結(jié)論是：病毒在當(dāng)時的氣候條件下，在這些地方的存活期為2-3天。根據(jù)這樣的結(jié)論，上海對進入過該出租車的人員的排查時間范圍就定在3天。為精準(zhǔn)抗疫做出貢獻，是傳研院生物實驗室眾多“優(yōu)秀戰(zhàn)績”的代表?！拔覀兊腜3實驗室是全國利用率最高、最有成效的P3實驗室之一。”蔡啟良說。

針對嚴(yán)重威脅全球公共衛(wèi)生安全的新發(fā)、重大傳染病，包括新冠肺炎、季節(jié)性流感和禽流感、艾滋病、結(jié)核、手足口病、肺炎鏈球菌病等，傳研院正在進行高質(zhì)量、智能化的生物安全樣本庫建設(shè)。

樣本庫由傳研院統(tǒng)一布局和管理，將來自各個渠道的生物標(biāo)本，統(tǒng)一在生物樣本庫中保藏和管理。樣本庫具備自動化與智能化特征，從而實現(xiàn)系統(tǒng)化、標(biāo)準(zhǔn)化、規(guī)范化、智能化的樣本管理與共享機制。

目前傳研院在建設(shè)中的“基于傳染病病例的隊列生物樣本庫”與“基于生命全周期的自然人群隊列生物樣本庫”，均布局配備了-80℃全自動樣本存取系統(tǒng)，可存儲百萬級的樣本量;-196℃氣相液氮深低溫自動化存儲系統(tǒng)以及備份系統(tǒng)可存儲約十萬級的樣本量。

“樣本庫不僅保存樣本本身，還同步保存和管理與樣本有關(guān)的臨床診療、倫理審批、知情同意等健康相關(guān)信息?！辈虇⒘颊f。未來新的傳染病出現(xiàn)時，樣本庫中的樣本與信息，將為制定傳染病精準(zhǔn)防控措施提供科學(xué)依據(jù)。

傳研院運行一年以來，對上述硬件設(shè)施與配套人才隊伍的建設(shè)大力投入，希望整合基礎(chǔ)、臨床及公共衛(wèi)生的科研資源，建立有效合作共享機制，為重大傳染病和生物安全研究打造具備先進性、科學(xué)性和共享性的公共服務(wù)平臺。