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        miR-155-3p對HANK1細(xì)胞EAF1 mRNA降解速率及惡性增殖的影響*

        2021-12-08 07:54:28王祿強(qiáng)徐美麗

        劉 莉, 徐 凱, 王祿強(qiáng), 徐美麗

        (1. 濰坊市第二人民醫(yī)院血液科, 山東 濰坊 261041; 2. 陽光融和醫(yī)院心血管介入科, 山東 濰坊 261000; 3. 陽光融和醫(yī)院心血管介入科, 山東 濰坊 261000; 4. 濰坊市第二人民醫(yī)院血液科, 山東 濰坊 261041)

        NK/T細(xì)胞淋巴瘤(NK/T cell lymphoma)作為一種非霍奇金淋巴瘤,占我國淋巴瘤的11-14%,其惡性程度高,患者預(yù)后不良,5年總體生存率低至32%,中位生存時間8個月[1]。因此,研究影響其惡性表型的分子機(jī)制,對于臨床評估及治療方案的指定具有重大意義。微小RNA (MicroRNA, miRNA)在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控編碼基因的信使RNA(messenger RNA, mRNA)的降解及翻譯過程,是重要的表觀遺傳調(diào)控分子,miR-155-3p作為miRNA中的一員,其基因定位于染色體21q21.3上,近年其被報道參與乳腺癌、肝細(xì)胞癌等多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展[2,3],但其與NK/T細(xì)胞淋巴瘤的關(guān)系仍不明確。本研究通過生物信息技術(shù)發(fā)現(xiàn)血液腫瘤中抑癌蛋白RNA聚合酶II的延伸相關(guān)因子(elongation factor for RNA polymerase II associated factor 1,EAF1)[4,5]可作為miR-155-3p的靶基因,這提示miR-155-3p可能參與影響NK/T細(xì)胞淋巴瘤惡性表型?;谏鲜鼍€索,本研究對相關(guān)問題開展了如下工作。

        1 材料與方法

        1.1 實(shí)驗(yàn)材料

        人NK/T細(xì)胞淋巴瘤HANK1細(xì)胞(上海雅吉生物);IMDM培養(yǎng)基及胎牛血清FBS(美國Gibco);轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine 2000(美國Thermo Fisher Scientific);pENTER-puro空白載體及pENTER-miR-155-3p過表達(dá)載體(湖南豐暉生物);GV248對照載體及GV248-miR-155-3p siRNA干擾載體(上海吉凱基因);放線菌素D(Actinomycin D,ActD,美國MedChemExpress);TRIzol試劑(美國Invitrogen);逆轉(zhuǎn)錄試劑盒及sybr green核酸染料(日本Takara);RIPA裂解液、BCA蛋白濃度檢測試劑盒(上海碧云天生物);聚偏二氟乙烯膜(PVDF膜,美國Merck Millipore);小鼠單克隆anti-EAF1抗體(美國Santa Cruz Biotechnology,sc-373832)、兔單克隆anti-β-catenin抗體(美國Cell Signaling Technology,#9562)、兔單克隆anti-c-Myc抗體(美國Cell Signaling Technology,#18583),小鼠單克隆anti-β-actin抗體(美國Santa Cruz Biotechnology,sc-47778),Cell Counting Kit-8(CCK-8)試劑盒(上海東仁化學(xué))。

        1.2 細(xì)胞培養(yǎng)

        使用80%IMDM+20%FBS培養(yǎng)HANK1細(xì)胞,每48 h進(jìn)行一次細(xì)胞傳代,傳代方法:將細(xì)胞懸液轉(zhuǎn)移至15 ml離心管中,1 000 r/min離心5 min,棄去上清液后加入新鮮80%IMDM+20%FBS,混合均勻后轉(zhuǎn)移至新的培養(yǎng)瓶中,37℃、5%CO2及飽和濕度恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。

        1.3 細(xì)胞轉(zhuǎn)染及處理

        培養(yǎng)對數(shù)生長期的HANK1細(xì)胞,傳代擴(kuò)大培養(yǎng)并分為空白組、過表達(dá)組及對照組、干擾組,將細(xì)胞懸液移至離心管中,1 000 r/min離心5 min,棄去剩余培養(yǎng)液,PBS洗細(xì)胞3次,同時每組制備3 ml無血清RPMI-1640+10 μl Lipofectamine 2000+ 2 μg目的載體,其中空白組中目的載體為pENTER-puro空白載體,過表達(dá)組中目的載體為pENTER-miR-155-3p過表達(dá)載體,對照組中目的載體為GV248對照載體,干擾組中目的載體為GV248-miR-155-3p siRNA干擾載體,放入培養(yǎng)箱中孵育6 h后,將細(xì)胞懸液移至離心管中,1 000 r/min離心5 min,棄上清液,PBS洗細(xì)胞3次,加入90%RPMI-1640+10%FBS培養(yǎng)24 h,完成細(xì)胞轉(zhuǎn)染。為了觀察各組細(xì)胞EAF1 mRNA降解速率,采用5 μg/ml ActD處理各組細(xì)胞1、2、4、8及16 h,檢測EAF1 mRNA降解情況,并通過Graphpad8.0軟件計算EAF1 mRNA的半衰期(%)。

        1.4 實(shí)時熒光定量PCR實(shí)驗(yàn)(RT-qPCR)

        TRIzol法提取各組細(xì)胞總RNA,取1 μg RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄,1 ml無核酶水稀釋逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物,配制合成引物(上海生工),引物序列:miR-155-3p F:5'-GCAGCTAGCCCAGGGTTGGAACTGAGTTTGA-3'、R:5'- GCAAAGCTTCAGTTAACCCG-3';EAF1 F:5'-GACTACCCAGCCAGTGAAGT-3'、R:5'-ACTAAGCGCCTCTGACACTT-3';β-catenin F:5'- AATCCGAGGACTCAATACC -3'、R:5'- AGAGTAAAGTATTCACCCACA -3';c-Myc F:5'-TGGTCTTCCCCTACCCTCTCAAC-3'、R:5'-GATCCAGACTCTGACCTTTTGCC-3';β-Actin F:5'-GCATGGAGTCCTGTGGCAT-3'、R:5'-CTAGAAGCATTTGCGGTGG-3'。10 μl sybr green核酸染料+5 μl逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物+5 μl合成引物,在7500型實(shí)時熒光定量PCR儀(美國Applied Biosystems)中進(jìn)行qPCR反應(yīng),得到各組樣本達(dá)到熒光信號閾值的循環(huán)數(shù)(cycle threshold,CT),以β-actin為內(nèi)參基因,2(-△△CT)法計算miR-155-3p、EAF1、β-catenin及c-Myc的表達(dá),每組樣本保證5個獨(dú)立的重復(fù)孔。

        1.5 蛋白質(zhì)免疫印跡實(shí)驗(yàn)(Western blot)

        RIPA裂解液于冰上裂解各組細(xì)胞20 min以抽提總蛋白,各組細(xì)胞取50 μg與Loading buffer煮沸5 min,進(jìn)行10%聚丙烯酰胺凝膠電泳,轉(zhuǎn)PVDF膜后,10%脫脂牛奶室溫封閉2 h,PBS洗膜3次,1∶ 1 000一抗及1∶3 000內(nèi)參蛋白β-actin一抗4℃孵膜過夜,PBS洗膜3次,1∶2 000二抗室溫孵膜2 h,PBS洗膜3次,ECL發(fā)光液孵膜1 min,在暗室中ChemiDoc化學(xué)發(fā)光成像系統(tǒng)(美國BioRad)對膜曝光顯影,灰度掃描重復(fù)取3次結(jié)果。

        1.6 CKK-8實(shí)驗(yàn)

        將各組細(xì)胞以每孔2000個細(xì)胞密度接種至96孔板中,設(shè)置時間點(diǎn)0、24、48、72 h,90%RPMI-1640+10%FBS培養(yǎng)過夜后,檢測0 h細(xì)胞增殖活力,每孔加入10 μl CCK-8試劑,培養(yǎng)箱中避光孵育2 h,多孔酶標(biāo)儀(美國Bio-Rad)檢測450 nm處吸光度(optical density,OD)值。同樣在24、48、72 h重復(fù)上述檢測,將各時間點(diǎn)與0 h相對OD值的比值(OD各時間點(diǎn)/OD0h)表示細(xì)胞的相對增殖能力,每組樣本保證5個獨(dú)立的重復(fù)孔。

        1.7 統(tǒng)計學(xué)處理

        2 結(jié)果

        2.1 各組細(xì)胞miR-155-3p、EAF1、β-catenin及c-Myc mRNA水平的比較

        空白組、過表達(dá)組、對照組及干擾組miR-155-3p表達(dá)分別為1.00±0.06、8.52±0.47、1.00±0.08及0.22±0.01; EAF1 mRNA表達(dá)分別為1.00±0.07、0.30±0.02、1.00±0.08及3.51±0.35;β-catenin mRNA表達(dá)分別為1.00±0.07、3.38±0.26、1.00± 0.08及0.50±0.04;c-Myc mRNA表達(dá)分別為1.00± 0.05、2.62±0.29、1.00±0.03、0.38±0.02。相比空白組,過表達(dá)組細(xì)胞miR-155-3p、β-catenin及c-Myc mRNA表達(dá)水平顯著增高,EAF1表達(dá)則顯著降低,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,圖1A);相比對照組,干擾組細(xì)胞miR-155-3p、β-catenin及c-Myc mRNA表達(dá)水平顯著降低,EAF1表達(dá)則顯著增高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,圖1B)。表明miR-155-3p可抑制HANK1細(xì)胞EAF1 mRNA的表達(dá),并促進(jìn)β-catenin及c-Myc mRNA的表達(dá)水平。

        2.2 各組細(xì)胞EAF1、β-catenin及c-Myc蛋白水平的比較

        空白組、過表達(dá)組、對照組及干擾組EAF1 蛋白表達(dá)分別為1.00±0.09、0.52±0.07、1.00±0.12及5.85±0.71;β-catenin 蛋白表達(dá)分別為1.00±0.10、6.20±0.43、1.00±0.15及0.38±0.06;c-Myc蛋白表達(dá)分別為1.00±0.07、4.43±0.36、1.00±0.08、0.35±0.06。相比空白組,過表達(dá)組細(xì)胞β-catenin及c-Myc蛋白表達(dá)顯著增高,EAF1蛋白表達(dá)則顯著降低(P<0.05,圖2A);相比對照組,干擾組細(xì)胞β-catenin及c-Myc蛋白表達(dá)顯著降低,EAF1蛋白表達(dá)則顯著增高(P<0.05,圖2B)。 表明miR-155-3p同樣可抑制HANK1細(xì)胞EAF1蛋白表達(dá),并促進(jìn)β-catenin及c-Myc 蛋白表達(dá)水平。

        Fig. 1 Expressions and comparisons of miR-155-3p, EAF1, β-Catenin and c-Myc mRNA in each group n=5)

        Fig. 2 Protein blotting of EAF1, β-Catenin and c-Myc in each group n=3)

        2.3 各組細(xì)胞EAF1 mRNA降解速率的比較

        空白組、過表達(dá)組、對照組及干擾組EAF1 mRNA半衰期分別為(9.81±0.72)、(13.07±1.12)、(13.28±0.71)及(15.74±0.98)h。相比空白組,過表達(dá)組細(xì)胞EAF mRNA降解速率顯著加快,半衰期明顯縮短,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,圖3A);相比對照組,干擾組細(xì)胞EAF mRNA降解速率顯著減緩,半衰期明顯延長,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P< 0.05,圖3B)。而各組細(xì)胞β-Actin降解速率沒有差異(P>0.05,圖3C及3D)。表明miR-155-3p可加速EAF1 mRNA的降解。

        2.4 各組細(xì)胞惡性增殖能力的比較

        以0 h時間點(diǎn)為相對值1,空白組、過表達(dá)組、對照組及干擾組48 h相對增殖能力分別為(3.95±0.44)、(5.38±0.55)、(3.67±0.26)及(2.71± 0.28),72 h相對增殖能力分別為(8.21±0.56)、 (12.03±0.40)、(7.74±0.54)及(5.60±0.61)。相比空白組,過表達(dá)組細(xì)胞增殖能力在48、72 h時顯著增高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,圖4A);相比對照組,干擾組細(xì)胞增殖能力在48、72 h時顯著降低,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01,圖4B)。提示miR-155-3p可促進(jìn)HANK1細(xì)胞的增殖能力。

        Fig. 3 EAF1 mRNA degradation in each group n=5)

        Fig. 4 Comparison of malignant proliferation ability of cells in each group n=5)

        3 討論

        miRNA可通過切斷靶基因mRNA分子或抑制靶基因mRNA的翻譯過程影響靶基因的表達(dá)水平[6]。miR-155-3p作為miRNA的成員,被發(fā)現(xiàn)可與多種靶基因結(jié)合,進(jìn)而在不同生命過程中發(fā)揮作用,包括影響惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展[7,8]。Tang B[2]等研究指出,miR-155-3p在肝癌組織中表達(dá)顯著上調(diào),過表達(dá)miR-155-3p可促進(jìn)肝癌細(xì)胞體內(nèi)外增殖能力,該效應(yīng)與抑制FBXW7(F-box and WD repeat domain-containing 7)mRNA 的表達(dá)有關(guān);Zhang G[3]等發(fā)現(xiàn)miR-155-3p在乳腺癌組織及細(xì)胞中表達(dá)顯著升高,同時miR-155-3p可通過下調(diào)細(xì)胞粘附分子1(cell adhesion molecule 1,CADM1)mRNA 水平,促進(jìn)細(xì)胞惡性增殖并抑制細(xì)胞凋亡;Tao M[8]等在腎透明細(xì)胞癌中發(fā)現(xiàn)MIR155HG/miR-155-5p/3p的高表達(dá),干擾miR-155-3p可顯著降低細(xì)胞增殖、侵襲及遷移等惡性表型;Fonte E等[9]在氟達(dá)拉濱耐藥的慢性淋巴細(xì)胞白血病中發(fā)現(xiàn)miR-155-3p的顯著高表達(dá),這提示miR-155-3p可能參與影響血液腫瘤細(xì)胞的惡性行為。上述證據(jù)均提示miR-155-3p可能是血液腫瘤的潛在促癌基因,故本研究通過生物信息學(xué)預(yù)測分析尋找可能的線索,發(fā)現(xiàn)EAF1可作為miR-155-3p的靶基因。

        11-19賴氨酸富集白血病(eleven-nineteen lysine-rich leukemia,ELL)是混合系白血病(mixed lineage leukemia,MLL)基因的融合蛋白,其與MLL基因倒位可誘發(fā)人類急性髓系白血病(acute myeloid leukemia,AML),而EAF1作為ELL蛋白的相互作用分子,其可與ELL蛋白的N端1-117AA及C端401-621AA相互結(jié)合[10,11],兩者在細(xì)胞核中形成Cajal bodies,進(jìn)而參與RNA轉(zhuǎn)錄及加工復(fù)合體[12]。Shilatifard A及Luo RT等[13,14]研究顯示ELL-MLL融合蛋白中ELL與EAF1結(jié)合的N端結(jié)構(gòu)域缺失,而C端在融合蛋白中保留,人工合成的MLL-EAF1能誘導(dǎo)小鼠白血病的發(fā)生,進(jìn)一步研究表明,MLL-ELL及MLL-EAF1的白血病細(xì)胞中,野生型EAF1表達(dá)量顯著降低[12],這些證據(jù)表明EAF1的功能與白血病的發(fā)生密切相關(guān)。Liu JX[5]等利用斑馬魚模型發(fā)現(xiàn)EAF1可抑制Wnt/β-catenin信號通路轉(zhuǎn)導(dǎo),而Wnt/β-catenin作為經(jīng)典的原癌信號通路,是腫瘤細(xì)胞侵襲轉(zhuǎn)移過程中的關(guān)鍵調(diào)控因素[15,16],該證據(jù)暗示EAF1在腫瘤發(fā)生發(fā)展中存在潛在調(diào)控作用。

        本研究結(jié)果顯示,在人NK/T細(xì)胞淋巴瘤HANK1細(xì)胞模型中,過表達(dá)miR-155-3p可顯著抑制EAF1 mRNA及蛋白水平的表達(dá),同時促進(jìn)EAF1靶基因β-catenin及c-Myc的轉(zhuǎn)錄活性,而干擾miR-155-3p則可促進(jìn)EAF1表達(dá),并抑制下游原癌基因β-catenin及c-Myc的轉(zhuǎn)錄。結(jié)合生物信息學(xué)預(yù)測分析的結(jié)果以及miRNA經(jīng)典的調(diào)控模式[6-8],推測miR-155-3p可能通過影響靶基因EAF1 mRNA的表達(dá)在HANK1細(xì)胞中發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)。因此本研究首先明確miR-155-3p對EAF1的調(diào)控模式,通過ActD處理來觀察miR-155-3p對EAF1 mRNA降解速率的影響,結(jié)果發(fā)現(xiàn),過表達(dá)miR-155-3p可促進(jìn)EAF1 mRNA的降解速率,反之抑制其降解,表明miR-155-3p可通過促進(jìn)EAF1 mRNA的降解,影響EAF1的表達(dá)水平,進(jìn)而導(dǎo)致下游基因β-catenin及c-Myc表達(dá)的變化,這與miR-155-3p已知的調(diào)控方式類似[2,3],但本研究在HANK1細(xì)胞中找到miR-155-3p新的靶基因EAF1,這為腫瘤發(fā)生發(fā)展機(jī)制提供了新的方向。進(jìn)一步的生物學(xué)效應(yīng)實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:miR-155-3p可增強(qiáng)HANK1細(xì)胞的惡性增殖能力,且干擾miR-155-3p則抑制細(xì)胞增殖能力。結(jié)合miR-155-3p加速EAF1 mRNA的降解及EAF1在不同腫瘤中發(fā)揮顯著的抑癌效應(yīng)[12, 15-17],本研究表明:miR-155-3p可介導(dǎo)HANK1細(xì)胞EAF1 mRNA的降解,并促進(jìn)細(xì)胞惡性增殖能力。

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