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        Gaussian View軟件在有機(jī)化學(xué)結(jié)構(gòu)教學(xué)中的應(yīng)用

        2021-11-24 12:47:14彭了
        化學(xué)教與學(xué) 2021年7期
        關(guān)鍵詞:有機(jī)化學(xué)

        彭了

        摘要:結(jié)合在中學(xué)有機(jī)化學(xué)結(jié)構(gòu)中的教學(xué)實(shí)踐,討論了Gaussian View軟件的相關(guān)應(yīng)用,具體介紹了如何利用該軟件構(gòu)建不同雜化方式的碳原子,解答有機(jī)分子中的原子共平面問題等。結(jié)合Gaussian View軟件進(jìn)行有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)教學(xué),使構(gòu)象等抽象的概念可視化,有助于學(xué)生的空間理解,能夠激發(fā)學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣,發(fā)展學(xué)生宏觀辨識(shí)與微觀探析的學(xué)科核心素養(yǎng)。

        關(guān)鍵詞:Gaussian View軟件;物質(zhì)結(jié)構(gòu);有機(jī)化學(xué);宏觀辨識(shí)與微觀探析

        文章編號(hào):1008-0546(2021)07-0033-03 中圖分類號(hào):G632.41 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:B

        doi:10.3969/j.issn.1008-0546.2021.07.009

        一、引言

        化學(xué)是在分子、原子水平層次上研究物質(zhì)的組成、結(jié)構(gòu)、性質(zhì)、轉(zhuǎn)化及其應(yīng)用的基礎(chǔ)學(xué)科,樹立正確合理的化學(xué)物質(zhì)結(jié)構(gòu)觀念是加深對(duì)于物質(zhì)性質(zhì)和推測解釋化學(xué)變化規(guī)律的基礎(chǔ)[1]。2017年,教育部對(duì)“普通高中化學(xué)學(xué)科課程標(biāo)準(zhǔn)”進(jìn)行了修訂[2],在必修和選擇性必修模塊中,都對(duì)物質(zhì)結(jié)構(gòu)的相關(guān)內(nèi)容進(jìn)行了調(diào)整。必修內(nèi)容強(qiáng)調(diào)認(rèn)識(shí)物質(zhì)結(jié)構(gòu)的不同尺度,基本角度和基本思路,選擇性必修內(nèi)容注重發(fā)展學(xué)生基于研究物質(zhì)的不同尺度的認(rèn)識(shí),注重結(jié)構(gòu)模型的發(fā)展過程和研究方法,以重點(diǎn)培養(yǎng)學(xué)生的“宏觀辨識(shí)與微觀探析”“證據(jù)推理和模型認(rèn)知”等學(xué)科核心素養(yǎng)[3]。在有機(jī)化合物的相關(guān)模塊中,也更加強(qiáng)調(diào)了碳原子的成鍵特點(diǎn)和基于此的有機(jī)化合物分子的空間結(jié)構(gòu)。

        但是,物質(zhì)結(jié)構(gòu),尤其是有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu),內(nèi)容分散、大量、抽象,思維容量大,對(duì)學(xué)生的空間想象能力提出了較高的要求,是有機(jī)化學(xué)教學(xué)過程中的重點(diǎn)和難點(diǎn)。準(zhǔn)確認(rèn)識(shí)有機(jī)化合物的分子結(jié)構(gòu),對(duì)于進(jìn)一步研究有機(jī)化合物的化學(xué)性質(zhì)、探究結(jié)構(gòu)改變與性質(zhì)變化之間的關(guān)系有著十分重要的作用。

        為了促進(jìn)學(xué)生從多個(gè)角度理解有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu),教師們提出了多種不同的方法,比如球棍模型的拼插等,取得了一定的效果。這說明通過三維視圖的方法將有機(jī)化合物的抽象、微觀的結(jié)構(gòu)可視化,對(duì)于學(xué)生的深入理解有較大幫助。此外,“普通高中化學(xué)學(xué)科課程標(biāo)準(zhǔn)”在必修“主題4:簡單的有機(jī)化合物及其應(yīng)用”中也將“搭建球棍模型認(rèn)識(shí)有機(jī)化合物分子結(jié)構(gòu)的特點(diǎn)”作為該主題的學(xué)生必做實(shí)驗(yàn)。

        為了進(jìn)一步提高3D工具的便攜性,已經(jīng)有不少中學(xué)教師探索使用有機(jī)化合物的繪圖軟件代替球棍模型,比如Material View等。本文將結(jié)合GaussianView(簡稱GView)軟件在有機(jī)化合物結(jié)構(gòu)的教學(xué)方面的實(shí)踐經(jīng)驗(yàn),介紹一些該軟件的使用建議。

        二、Gaussian View軟件簡介

        GView是計(jì)算軟件Gaussian配套使用的圖形可視化軟件,其主要用途是將Gaussian的計(jì)算結(jié)果通過圖形進(jìn)行輸出。此外,GView也可以用于直接繪制無機(jī)或有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu),作為Gaussian計(jì)算的基礎(chǔ),或者讀人Chem3D,晶體結(jié)構(gòu)等文件。Gaussian及GView可用于計(jì)算和顯示中間態(tài)的穩(wěn)定性,勢能曲面,活化能等,在預(yù)測有機(jī)反應(yīng)機(jī)理,解釋光譜等方面有重要應(yīng)用。

        在GView的軟件界面中,除了可以直接繪制多種有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu),還可以通過鼠標(biāo)拖拽改變視角、調(diào)整大小、選定某一個(gè)原子調(diào)整鍵角、以及固定一根化學(xué)鍵調(diào)整二面角,從而能夠改變有機(jī)化合物的構(gòu)象并實(shí)現(xiàn)多角度觀察。因此,GView可以在中學(xué)有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)教學(xué)中有所應(yīng)用。

        三、Gaussian View在有機(jī)化學(xué)結(jié)構(gòu)教學(xué)中的應(yīng)用

        學(xué)生剛接觸有機(jī)化學(xué)時(shí),對(duì)有機(jī)化學(xué)的立體結(jié)構(gòu)的理解缺乏空間想象能力,而利用可視化的軟件,可以幫助學(xué)生培養(yǎng)空間想象能力,從而更好地培養(yǎng)“結(jié)構(gòu)決定性質(zhì),性質(zhì)決定功能”的模型認(rèn)知,發(fā)展化學(xué)學(xué)科“宏觀辨識(shí)與微觀探析”的學(xué)科核心素養(yǎng)[4]。下面結(jié)合實(shí)例介紹GView在中學(xué)有機(jī)化學(xué)結(jié)構(gòu)教學(xué)中的一些應(yīng)用。

        1.碳原子的雜化方式

        利用GView可以自定義地繪制多種有機(jī)化合物的空間結(jié)構(gòu)。在軟件中,提供了多種可供選擇的不同原子的不同雜化方式。以碳原子為例,提供的雜化方式及它們的空間結(jié)構(gòu)如圖1所示,包括由sp雜化形成的單三鍵結(jié)構(gòu)(圖1a),由sp2雜化形成的單雙鍵結(jié)構(gòu)(圖1b),和由sp3雜化形成的四單鍵結(jié)構(gòu)(圖1c),利用這些不同的碳原子的雜化方式,可以構(gòu)建不同的有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)。此外,GView還提供了一些可以直接使用的模型分子,可以在此基礎(chǔ)上進(jìn)行修改繪制衍生物,如苯(圖1d)和環(huán)己烷(椅型構(gòu)象,圖1e)等。

        2.直鏈烷烴和環(huán)烷烴的構(gòu)象

        在有機(jī)化合物中,單鍵可以自由地旋轉(zhuǎn),由此產(chǎn)生的分子中原子或者原子團(tuán)在空間具有的不同的排列方式稱之為構(gòu)象[5]。以GView中的四單鍵結(jié)構(gòu)作為基礎(chǔ),可以非常容易地繪制丁烷的交叉型構(gòu)象,如圖2所示。學(xué)生在繪制得到結(jié)構(gòu)之后,能夠通過視角旋轉(zhuǎn)或原子刪減,從不同角度觀察正丁烷的空間結(jié)構(gòu),進(jìn)而發(fā)現(xiàn)其中的每一個(gè)C的四根鍵都滿足四面體的位置關(guān)系。通過這種方式,能夠使得學(xué)生對(duì)“烷烴呈現(xiàn)出鋸齒型而不是直線型的結(jié)構(gòu),是基于碳原子的3sp雜化”這一結(jié)論有更加深刻的理解。

        此外,Gveiw也直接提供了多種環(huán)烷烴的結(jié)構(gòu)模型,如環(huán)戊烷,環(huán)己烷(圖1e)等。與鏈狀烷烴類型,因?yàn)樘荚拥?sp雜化,環(huán)烷烴也不是平面結(jié)構(gòu),此外環(huán)己烷還有椅型構(gòu)象和船型構(gòu)象之分,這通過GView可以得到直觀的結(jié)論。如果有進(jìn)階學(xué)習(xí)需求,GView也提供了可以自由旋轉(zhuǎn)的視角,對(duì)學(xué)生書寫和理解烴類物質(zhì)的傘形式、鋸架式和紐曼投影式有很大幫助。

        3.判斷原子共平面問題

        有機(jī)化合物中的原子共平面問題是考察對(duì)于有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)理解和空間想象能力的重要方法,也是學(xué)生在學(xué)習(xí)時(shí)難以突破之處。學(xué)生需要在思維中對(duì)有機(jī)化合物結(jié)構(gòu)中的部分單鍵進(jìn)行旋轉(zhuǎn)操作,才能判斷一個(gè)有機(jī)分子中最多或者至少有多少個(gè)原子在同一個(gè)平面上。使用GView可以對(duì)上述問題進(jìn)行更直觀的闡述,輔助學(xué)生增強(qiáng)空間理解。

        以判斷乙烷分子中最多和至少有多少個(gè)原子在同一個(gè)平面上為例。通過GView直接繪制出的乙烷結(jié)構(gòu)為圖3a的結(jié)構(gòu)(交叉型構(gòu)象),其側(cè)視圖(即紐曼投影式)如圖3b所示,此時(shí)乙烷分子中最多有4個(gè)原子在同一個(gè)平面上。選中H2,Cl,C5和H6四個(gè)原子,轉(zhuǎn)動(dòng)二面角旋轉(zhuǎn)60°,即可得到重疊型構(gòu)象(圖3c,d),此時(shí)乙烷分子中也有4個(gè)原子在同一個(gè)平面上。在旋轉(zhuǎn)的過程中(扭曲型構(gòu)象),乙烷分子中都只有3個(gè)原子在同一個(gè)平面上。因此可以得出結(jié)論,乙烷分子中最多有4個(gè)原子在同一個(gè)平面上,至少有3個(gè)原子在同一個(gè)平面上。上述旋轉(zhuǎn)過程還可以用于定性地解釋不同構(gòu)象的穩(wěn)定性問題。

        利用同樣的方法可以判斷出,在甲苯分子中,至少有12個(gè)原子在同一個(gè)平面上,最多有13個(gè)原子在同一個(gè)平面上(圖4)?;趩捂I的旋轉(zhuǎn)操作,可以輔助學(xué)生對(duì)于有機(jī)化合物中的等價(jià)氫原子的判斷,更好地理解甲苯是一個(gè)軸對(duì)稱分子。

        四、結(jié)語

        GView是一款功能強(qiáng)大的圖形可視化軟件,它能夠?qū)Χ喾N有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)進(jìn)行多視角的觀察和調(diào)整。在中學(xué)有機(jī)化學(xué)的教學(xué)中,使用GView輔助教學(xué),能夠使得抽象的有機(jī)化合物的結(jié)構(gòu)更加直觀形象,使得有機(jī)化合物中不同原子或基團(tuán)的位置關(guān)系更容易讓學(xué)生理解,從而能夠提高教學(xué)的效率,同時(shí)也能夠吸引學(xué)生的學(xué)習(xí)興趣,讓學(xué)生在自己動(dòng)手繪制和旋轉(zhuǎn)的過程中進(jìn)一步發(fā)展宏觀辨識(shí)與微觀探析的化學(xué)學(xué)科核心素養(yǎng)。在2019年出版的魯科版選擇性必修3《有機(jī)化學(xué)基礎(chǔ)》[6]中,加入了“模擬和表征有機(jī)化合物分子結(jié)構(gòu)——基于模型和圖譜的探索”的微項(xiàng)目,通過模型塔尖和圖譜表征等活動(dòng),加深學(xué)生對(duì)于有機(jī)化合物的分子結(jié)構(gòu)的認(rèn)識(shí)。因此,在之后的教學(xué)中,可以對(duì)相關(guān)類似的軟件多加開發(fā)利用,使其在物質(zhì)結(jié)構(gòu)、有機(jī)化學(xué)的教學(xué)中發(fā)揮更大的作用。

        參考文獻(xiàn)

        [1]吳俊明,錢秋萍.化學(xué)的物質(zhì)結(jié)構(gòu)思維與教學(xué)[J].化學(xué)教學(xué),2018,380(11):9-18

        [2]中華人民共和國教育部.普通高中化學(xué)課程標(biāo)準(zhǔn)(2017年版)[S].北京:人民教育出版社,2018

        [3]王磊,魏銳.學(xué)科核心素養(yǎng)發(fā)展導(dǎo)向的高中化學(xué)課程內(nèi)容和學(xué)業(yè)要求——《普通高中化學(xué)課程標(biāo)準(zhǔn)(2017年版)》解讀[J].化學(xué)教育,2018,39(9):48-53

        [4]鄒國華,童文昭,韓閩江.促進(jìn)空間能力進(jìn)階發(fā)展的物質(zhì)結(jié)構(gòu)空間模型教學(xué)分析[J]北學(xué)教學(xué),2018,378(9):54-58

        [5]邢其毅.基礎(chǔ)有機(jī)化學(xué).第4版[M].北京:北京大學(xué)出版社,2016

        [6]王磊,陳光巨,曹居?xùn)|,尹冬冬.普通高中教科書(化學(xué))選擇性必修3有機(jī)化學(xué)基礎(chǔ)[M].濟(jì)南:山東科學(xué)技術(shù)出版社,2019

        *本文系中國化學(xué)會(huì)“十三五”規(guī)劃2018年度教育學(xué)規(guī)劃課題“基于學(xué)生化學(xué)學(xué)科核心素養(yǎng)發(fā)展的UbD分層教學(xué)設(shè)計(jì)研究”(HJ2018-0034);國家社會(huì)科學(xué)基金“十三五”規(guī)劃2016年度教育學(xué)重點(diǎn)課題“基于學(xué)生不同發(fā)展需求的中學(xué)化學(xué)分層課程建設(shè)研究”(1601060855A)階段性研究成果。

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