亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        綿羊OSBPL11、PAEP、ALDH1A2 基因多態(tài)性與胸椎數(shù)關(guān)聯(lián)分析

        2021-11-09 14:18:10郭思武鐘英杰劉秋月劉玉芳儲明星
        中國畜牧雜志 2021年9期
        關(guān)鍵詞:蘇尼特小尾寒羊脊椎

        郭思武,鐘英杰,劉秋月,陶 林,劉玉芳,儲明星*

        (1.中國農(nóng)業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所,農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動物遺傳育種與繁殖重點實驗室,北京 100193;2.河北工程大學生命科學與食品工程學院,河北邯鄲 056001)

        哺乳動物中,亞種或家畜的品種之間經(jīng)常出現(xiàn)脊椎數(shù)的差異,即使在同種內(nèi)個體間也存在差異。胸椎數(shù)的變異在不同的物種中有著千差萬別,如在人類中發(fā)生脊椎數(shù)目的變異會造成嚴重的遺傳性疾病,影響正常生活[1];在家畜中胸椎數(shù)的增加卻是一個非常有利的經(jīng)濟性狀,家畜胸椎和腰椎數(shù)目增加,胴體長度也會隨之增加,這就給養(yǎng)殖企業(yè)帶來更高的經(jīng)濟效益[2-3]。在豬[4-5]、牛[6]、羊[7-8]等物種中均已有多個基因調(diào)控脊椎數(shù)變異的相關(guān)報道。本研究選取的小尾寒羊(STH)是我國肉裘兼用型綿羊品種,具有耐粗飼、發(fā)育快、繁殖性能強、適應性強等特點[9],而蘇尼特羊(SNT)屬蒙古綿羊系統(tǒng)中的一類,經(jīng)過長期的自然選擇和人工選擇而形成了具有耐寒、抗旱、生長發(fā)育快、生命力強的特性,是最能適應荒漠半荒漠草原的肉用地方良種之一[10]。這2 種羊均存在高比例的多脊椎數(shù)變異,含有14 個胸椎(T14,正常綿羊為T13)的個體比例高達20%~30%,同時其肉質(zhì)細嫩呈大理石紋狀,富含人體必需的各種氨基酸、維生素、礦物質(zhì)等營養(yǎng)物質(zhì),具有繁殖選育的潛力[11]。研究綿羊胸椎數(shù)相關(guān)基因已持續(xù)數(shù)年,通過分子生物學技術(shù)選育多脊椎數(shù)性狀的綿羊品種已成為當前階段的重要研究內(nèi)容。因此,本研究基于先前實驗的基因組重測序結(jié)果,對得到的21 個候選基因中的OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因進行胸椎數(shù)關(guān)聯(lián)分析研究,以期獲得新的多胸椎數(shù)相關(guān)分子標記。

        OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因基于綿羊基因組重測序被篩選出來,但目前研究進展表明這3 個基因的功能在胸椎數(shù)變異中并無明顯的關(guān)聯(lián)性。其中,OSBPL11是氧甾醇結(jié)合蛋白(Oxysterol-Binding Protein,OSBP)家族的成員之一,OSBP 在20 世紀80 年代作為幾種氧甾醇的細胞質(zhì)親和力受體被分離出來[12-14]。與OSBP 具有序列同源性的蛋白質(zhì)家族存在于整個真核生物界,在哺乳動物中,OSBP 家族由12 個成員組成[15-17]。孕激素相關(guān)子宮內(nèi)膜蛋白(Progestagen Associated Endo metrial Protein,PAEP)長約5 050 bp,包括7 個外顯子和6 個內(nèi)含子,該基因由180 個氨基酸構(gòu)成,是一種分子大小為28 kDa 的糖蛋白,屬于核脂鈣蛋白家族[18]。PAEP是子宮內(nèi)膜分泌的主要蛋白質(zhì)之一,其中在雄性精囊中表達最高,PAEP還在生殖組織的其他上皮細胞中表達。醛脫氫酶1A2(ALDH1A2)是醛脫氫酶(ALDH1)家族中的一員,ALDH1 由ALDH1A1、ALDH1A2 和ALDH1A3 3 個亞科成員組成[19]。其中ALDH1A1參與視網(wǎng)膜氧化、乙醛代謝和環(huán)磷酰胺解毒,而ALDH1A2和ALDH1A3參與視網(wǎng)膜氧化為維甲酸(RA)[20]。因此,本研究利用分子遺傳學手段檢測了蘇尼特羊和小尾寒羊OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因的多態(tài)位點,并將這些位點與胸椎數(shù)性狀進行關(guān)聯(lián)分析,以揭示這3 個基因的遺傳變異與多脊椎數(shù)性狀之間的關(guān)系,初步推測OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因影響蘇尼特羊和小尾寒羊胸椎數(shù)的具體分子機理,為提高綿羊胸椎數(shù)、改良綿羊生長發(fā)育提供理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 樣品采集 實驗采集了188 只來自內(nèi)蒙古巴彥淖爾烏拉特中旗的蘇尼特羊的組織樣品(樣品組織為背最長肌)和195 只來自內(nèi)蒙古巴彥淖爾及山東鄆城的小尾寒羊的組織樣品,采樣綿羊健康狀態(tài)良好。綿羊屠宰后,快速用2 mL 凍存管采集新鮮肌肉組織,并用液氮冷凍保存帶回實驗室轉(zhuǎn)移到-80℃冰箱保存?zhèn)溆?。記錄綿羊胴體長度部分數(shù)據(jù),其中蘇尼特羊胸椎數(shù)為13 個及14個的個體分別為122 只和66 只,小尾寒羊胸椎數(shù)為13個和14 個的個體分別為137 只和58 只。

        1.2 DNA 提取 使用DNA 提取試劑盒(天根生物科技有限公司,北京)進行組織DNA 提取,對提取后的組織樣品用NanoDrop 2000 和1.5%瓊脂糖凝膠電泳進行濃度和質(zhì)量的評估,合格的DNA 樣品用于后續(xù)實驗。

        1.3 引物設(shè)計 根據(jù)小尾寒羊和蘇尼特羊OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因的SNP 位點序列信息通過Assay design 3.1 軟件進行引物設(shè)計,具體信息見表1。引物設(shè)計及合成由康普森生物技術(shù)有限公司完成。

        表1 小尾寒羊與蘇尼特羊OSBPL11、PAEP 和ALDH1A2 基因的引物序列

        1.4 基因分型 采用Sequenom MassARRAY?SNP[21]分型技術(shù)對OSBPL11基因的g.188064535A>G、PAEP基因的g.3541777A>G 和ALDH1A2基因的g.49249275G>A進行分型檢測,分型樣品為DNA,每個樣品需要量為20 μL,DNA 濃度為40~80 ng/μL。分型的具體過程見Zhang 等[22]所示方法。

        1.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析 利用Microsoft Excel 2019 軟件計算各位點的基因頻率、基因型頻率、有效等位基因數(shù)、多態(tài)信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)和雜合度(Heterozygosity,He),并進行哈代溫伯格平衡檢驗。計算群體遺傳學參數(shù)的方法詳見Zhang 等[22]。利用SPSS 19.0 采取一般線性模型單變量分析與單因素方差分析LSD 對OSBPL11、PAEP、ALDH1A2不同基因型的小尾寒羊和蘇尼特羊進行胸椎數(shù)關(guān)聯(lián)分析。模型為yijn=μ+Pi+Gj+IPG+eijn。式中:yijn代表表型值(胸椎數(shù));μ 代表群體均值;Pi代表品種效應(i=1,2);Gj代表j 種基因型的影響(j=1,2,3);IPG表示品種與基因型的互作效應;eijn代表隨機誤差。胸椎數(shù)用平均值±標準誤表示。

        2 結(jié)果與分析

        2.1OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因多態(tài)性分析 測序結(jié)果顯示,383 只綿羊群體基因型及分型分別是:OSBPL11基因g.188064535A>G 位 點AA 型350 只、AG型30 只、GG(不計入統(tǒng)計分析)型1 只;PAEP基因g.3541777A>G 位點AA 型216 只、AG 型143 只、GG 型21 只;ALDH1A2基因g.49249275G>A 位點GG 型362 只、AG 型18 只(圖1~3)。

        圖1 OSBPL11 基因g.188064535A>G 位點分型結(jié)果

        圖2 PAEP 基因g.3541777A>G 位點分型結(jié)果

        圖3 ALDH1A2 基因g.49249275G>A 位點分型結(jié)果

        PIC:OSBPL11基因g.188064535A>G位點中小尾寒羊和蘇尼特羊PIC 分別是0.06 和0.09,均屬于低度 多 態(tài)(PIC<0.25);PAEP基 因g.3541777A>G 位點中小尾寒羊和蘇尼特羊PIC 分別是0.32 和0.27,均屬于中度多態(tài)(0.25<PIC<0.50);ALDH1A2基因g.49249275G>A 位點中小尾寒羊和蘇尼特羊PIC 分別是0.05 和0.04,均屬于低度多態(tài)(PIC<0.25)(表2)。在卡方檢驗值方面,OSBPL11基因g.188064535A>G位點小尾寒羊與蘇尼特羊的卡方檢驗值分別為0.631 和0.439;PAEP基因g.3541777A>G 位點小尾寒羊與蘇尼特羊的卡方檢驗值分別為0.427 和0.930;ALDH1A2基因g.49249275G>A 位點小尾寒羊與蘇尼特羊的卡方檢驗值分別為0.685 和0.793。結(jié)果表明,小尾寒羊和蘇尼特羊中3 個SNPs 位點均處于哈代溫伯格平衡狀態(tài)(P>0.05)。

        表2 3 個位點在小尾寒羊和蘇尼特羊中的群體遺傳學分析

        2.2OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因3個位點與胸椎數(shù)的關(guān)聯(lián)分析 由表3 可知,OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因的3 個突變位點均與胸椎數(shù)不顯著相關(guān)。對188 只蘇尼特羊和195 只小尾寒羊2 個種群單獨進行胸椎數(shù)關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),ALDH1A2基因g.49249275G>A 位點在蘇尼特羊中野生型個體(GG)的胸椎數(shù)顯著低于突變雜合個體(AG),其他位點與胸椎數(shù)均不顯著相關(guān);而在小尾寒羊中OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因的3 個突變位點與胸椎數(shù)均不顯著相關(guān),表明ALDH1A2基因g.49249275G>A 位點與蘇尼特羊的胸椎數(shù)變化有關(guān)(表4)。

        表3 OSBPL11、PAEP 及ALDH1A2 基因位點與綿羊胸椎數(shù)關(guān)聯(lián)分析結(jié)果

        表4 3 個位點各基因型與小尾寒羊和蘇尼特羊胸椎數(shù)最小二乘均值及標準誤

        2.3OSBPL11、PAEP、ALDH1A2基因3 個位點與小尾寒羊胴體長的關(guān)聯(lián)分析 由表5 可知,這3 個突變位點各基因型與小尾寒羊胴體長均不顯著相關(guān)。

        表5 各位點基因型與小尾寒羊胴體長的關(guān)聯(lián)分析(平均值±標準誤)

        3 討論

        哺乳動物脊椎是由胚胎發(fā)育到原腸胚時中胚層分化而來,而控制胸椎生長的初級神經(jīng)胚的發(fā)育變化主要受到骨形成蛋白(BMP)的濃度控制。其中發(fā)育的每個階段都是極為復雜的工程,任何地方出錯都有可能導致胸椎的異常分化[23-24]。家畜多脊椎性狀是指家畜胸椎數(shù)和腰椎數(shù)比正常個體增多的現(xiàn)象。早在20 世紀中期,人們就發(fā)現(xiàn)家畜的胸腰椎數(shù)目存在變異。脊椎數(shù)的增多可以間接地提高家畜的體長、體重、產(chǎn)肉量和肋骨數(shù)等性狀,從而提高其經(jīng)濟效益。所以家畜脊椎數(shù)變異的遺傳改良也在近年來得到了深入的研究。

        豬多脊椎性狀候選基因的挖掘始于QTL 定位。由于豬的繁殖速度較其他家畜快,使得在利用家系進行多脊椎性狀相關(guān)QTL 定位研究中較其他單胎家畜具有明顯的優(yōu)勢,這也是豬繁殖研究中獲得成果較其他家畜多的原因之一。早在2000 年,Wada 等[25]首次將脊椎數(shù)相關(guān)QTL 位點定位在豬1 號染色體和2 號染色體上。其中1 號染色體上脊椎數(shù)相關(guān)的QTL 與Rohrer 等定位在1 號染色體與胴體長度相關(guān)的QTL 在位置上很接近[26],提示脊椎數(shù)與胴體長可能存在相關(guān)性。在此基礎(chǔ)上,該研究團隊后期研究又發(fā)現(xiàn)在豬1 號染色體和7 號染色體各存在1 個與脊椎數(shù)相關(guān)的QTL 位點[27],該結(jié)果后來也被在其他不同豬品種上的研究所證實[28-29]。與豬相比,羊脊椎數(shù)變化范圍要小很多。張立嶺等[3]研究發(fā)現(xiàn),蒙古羊每增加1 枚胸椎或腰椎,脊柱就加長約2.40 cm或3.50 cm。無論多1 枚胸椎還是腰椎,綿羊的活重、胴體重、凈肉重和眼肌面積均明顯增加,其中凈肉平均增加4 kg 以上。該研究結(jié)果與豬的研究結(jié)果基本一致。最早在大白豬群體中發(fā)現(xiàn)控制脊椎數(shù)性狀的VRTN基因首次被證實為影響脊椎數(shù)性狀的主效基因[30],隨后又發(fā)現(xiàn)了更多影響胸椎數(shù)性狀的基因,如NR6A1[7]、Hoxc[31]和TGFβ3[32]等,而在蘇尼特羊中已被證實VRTN對胸椎數(shù)的影響仍然存在[33]。

        查閱OSBPL11基因相關(guān)文獻發(fā)現(xiàn),該基因的表達在各物種間可能存在差異,人OSBPL11基因的功能與脂肪形成有關(guān),綿羊中卻在肺臟和淋巴組織中高度表達。目前OSBPL11所在家族中的其他成員OSBP 相關(guān)(ORP)蛋白或OSBP 樣(OSBPL)蛋白更多的研究主要聚焦在哺乳動物和酵母系統(tǒng)中,主要參與控制細胞脂質(zhì)代謝、囊泡運輸和細胞信號傳導[34-35],在脊椎數(shù)變異等骨相關(guān)的研究鮮少。查閱PAEP基因相關(guān)文章發(fā)現(xiàn),還沒有發(fā)現(xiàn)PAEP在綿羊胸椎數(shù)變異研究的報道,已知的PAEP 蛋白亞型有4 種,分別為glycodelin A(來自羊水、內(nèi)膜和母體血清)、glycodelin S(來自雄性精漿和精液囊泡)、glycodelin F(來自卵泡液和輸卵管)和glycodelin C(來自卵丘),這些亞型的蛋白骨架完全相同,區(qū)別僅在糖基結(jié)構(gòu)部分,表現(xiàn)出不同甚至相反的功能,提示糖基化對蛋白功能具有重要的調(diào)節(jié)作用[36]。且在NCBI 中發(fā)現(xiàn)PAEP主要在綿羊乳腺中高度表達,其原因是由于PAEP的表達受孕酮/孕激素、松弛素和組蛋白去乙酰化酶抑制劑的調(diào)控[37]。

        ALDH1A2是醛脫氫酶1(ALDH1)家族的一員,而ALDH1 是通過氧化全跨視網(wǎng)膜(all-trans-retinal)和9-順視網(wǎng)膜(9-cis-retinal)產(chǎn)生維甲酸(RA)的主要酶,主要參與細胞分化、細胞周期阻滯最終凋亡等生物學功能[38-40]。ALDH1A2的功能與胸椎數(shù)性狀沒有直接關(guān)系,但是本研究結(jié)果表明,ALDH1A2基因在存在品種效應的條件下雖與胸椎數(shù)呈不顯著關(guān)系,但在單獨群體中ALDH1A2基因的突變位點可以顯著提高蘇尼特羊的胸椎數(shù),其機理有待進一步研究。

        4 結(jié)論

        在小尾寒羊中OSBPL11基因g.188064535A>G、PAEP基因g.3541777A>G 和ALDH1A2基 因g.49249275G>A位點與胸椎數(shù)和胴體長無顯著關(guān)聯(lián)。OSBPL11基因g.188064535A>G 和PAEP基 因g.3541777A>G 位 點與蘇尼特羊胸椎數(shù)性狀無顯著關(guān)聯(lián);ALDH1A2基因g.49249275G>A 位點突變與蘇尼特羊胸椎數(shù)呈顯著相關(guān)。ALDH1A2基因可作為潛在的多胸椎數(shù)的分子標記。

        猜你喜歡
        蘇尼特小尾寒羊脊椎
        巨盜龍珊珊的荒漠探險
        基于機器學習和幾何變換的實時2D/3D脊椎配準
        自動化學報(2018年7期)2018-08-20 02:58:46
        你想不到的“椎”魁禍首:皮膚病可能與脊椎有關(guān)
        華人時刊(2017年15期)2017-10-16 01:22:27
        小尾寒羊產(chǎn)前癱瘓的診療
        引進小尾寒羊暴發(fā)羊痘病
        蘇尼特午后的那一刻
        鹿鳴(2015年7期)2015-05-30 23:48:50
        蘇尼特羊肉
        小尾寒羊養(yǎng)殖技術(shù)
        飼養(yǎng)小尾寒羊的幾項措施
        脊椎結(jié)核病灶清除內(nèi)固定術(shù)后不愈原因分析與處理
        久久婷婷人人澡人人爽人人爱| 最新国产成人自拍视频| 国产女主播强伦视频网站| 丝袜美腿久久亚洲一区| 国产精品麻豆一区二区三区| 蜜桃av人妻精品一区二区三区| 手机在线看片| 亚洲熟妇少妇任你躁在线观看无码| 情侣黄网站免费看| 99久久精品国产一区二区蜜芽| 久久久久久无码AV成人影院| 麻豆成人久久精品一区| 精品人妻一区二区三区久久| 国产精品成人免费视频一区| 男女啪啪无遮挡免费网站| 亚洲最新版无码AV| 北岛玲精品一区二区三区| 国产三级精品和三级男人| 亚洲男女内射在线播放| 国产精品久久久久9999赢消| 国产专区国产av| 911香蕉视频| av熟女一区二区久久| 亚洲天堂一区二区三区| 精品日韩亚洲av无码| 2019最新国产不卡a| 亚洲AV秘 无套一区二区三区| 蜜桃传媒免费在线观看| 亚洲线精品一区二区三区| 国产影片中文字幕| 日本污视频| 放荡人妻一区二区三区| 偷拍美女上厕所一区二区三区| 国产成人a人亚洲精品无码| 熟妇无码AV| 97人妻中文字幕总站| 精品欧美一区二区三区久久久| 中文字幕久久久人妻无码| 妇女性内射冈站hdwwwooo| 蜜桃av夺取一区二区三区| 美女视频黄a视频全免费网站色 |