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        披針葉黃華內(nèi)生真菌的分離與鑒定

        2021-11-04 00:47:26趙文星吳可欣郭梓豫張?jiān)脐?/span>唐麗輝劉奕伶莫重輝趙寶玉
        畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào) 2021年10期
        關(guān)鍵詞:黃華針葉內(nèi)生

        趙文星,吳可欣,郭梓豫,張?jiān)脐唬汽愝x,劉奕伶,莫重輝,趙寶玉,路 浩*

        (1.西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,楊凌 712100; 2.青海大學(xué)農(nóng)牧學(xué)院,西寧 810016)

        披針葉黃華(Thermopsislanceolata),又名“黃花苦豆”“野決明”“牧馬豆”,蒙古語(yǔ) “他日巴干-希日”,為豆科(leguminoseae)野決明屬(Thermopsis)植物[1]。披針葉黃華為多年生草本植物,資源相當(dāng)豐富[2-4],廣泛分布于我國(guó)東北、華北和西北各省區(qū)[5]。披針葉黃華多生長(zhǎng)于草原沙丘、河岸礫灘、林下灌叢,在河谷、溝渠等地也可零星生長(zhǎng),偶見(jiàn)農(nóng)田及路旁,一般散生,條件合適時(shí)也能形成小群落[6,7]。該植物憑借其發(fā)達(dá)的根系、超強(qiáng)的抗逆性等特性,分布范圍和分布強(qiáng)度逐步擴(kuò)大[8],能耐-37 ℃的低溫,在東北、青藏高原等高寒地域亦可良好越冬,同時(shí)也能在退化鹽堿化的土壤中較好生長(zhǎng)[9]。披針葉黃華可做藥用[10],具有興奮呼吸、祛痰、止咳、止痛、抗炎等功效[11-12]。新鮮狀態(tài)下具有特殊的苦味,牲畜一般不采食,若誤食其種子或全草后則會(huì)發(fā)生慢性中毒,干枯后毒性減弱[13]。林源等[14]研究發(fā)現(xiàn),引起披針葉黃華中毒的主要成分是喹諾里西啶生物堿(Quinolizidine)類[15],其中廣泛存在的有黃花堿(Thermopsine)、金雀花堿(Cytisine)[16]等。

        植物內(nèi)生真菌(endophytic fungi)是指生活史部分或者全部寄存在植物體內(nèi)的各個(gè)組織或者器官內(nèi),生存狀況良好,并且沒(méi)有引起任何感染的真菌[17]。這些內(nèi)生真菌具有促進(jìn)植物生長(zhǎng)發(fā)育,提高植物抗逆性的作用[18],其次生代謝產(chǎn)物擁有多種結(jié)構(gòu)類型(如生物堿、聚酮、萜類等)[19],有抗腫瘤、抗氧化性、抗菌等功能[20],在醫(yī)藥、農(nóng)業(yè)、環(huán)境保護(hù)等方面廣泛應(yīng)用[21]。因而,植物內(nèi)生真菌中的活性代謝產(chǎn)物為抗生素、抗癌藥物及農(nóng)藥的研究與開(kāi)發(fā)提供了重要研究方向,同時(shí)也具有重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值[22]。劉建利等[23]從苦豆子植物中分離出多種內(nèi)生真菌,其葉最多,莖次之,根最少,優(yōu)勢(shì)菌屬為鏈格孢屬(Alternariasp.)、枝梗莖點(diǎn)霉屬(Dendrophomasp.)。孫璐等[24]從毛序棘豆中分離的內(nèi)生真菌中莖最高,根次之,葉最少,鏈格孢屬(Alternariasp.)、鐮孢霉屬(Fusariumsp.)為優(yōu)勢(shì)菌屬。但目前有關(guān)披針葉黃華內(nèi)生真菌的種類及種群分布情況尚不清楚。

        鑒于此,本試驗(yàn)采用表面消毒法分離披針葉黃華內(nèi)生真菌,運(yùn)用形態(tài)學(xué)和5.8S rDNA-ITS序列分析進(jìn)行內(nèi)生真菌種屬鑒定,探討披針葉黃華內(nèi)生真菌的種類及種群分布特點(diǎn),可為披針葉黃華內(nèi)生真菌次生代謝產(chǎn)物的開(kāi)發(fā)與利用提供重要參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 植物材料 試驗(yàn)所用的披針葉黃華新鮮植物樣本(包含根、莖、葉和種子),于2020年7月在青海省湟中縣(東經(jīng)101°17′18″,北緯37°16′26″,海拔3216.6 m)采集,干燥處理后,實(shí)驗(yàn)室保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.1.2 主要試劑 2%NaClO、葡萄糖(廣東光華);無(wú)水乙醇(成都克隆);瓊脂粉、苯酚(北京索萊寶);氯仿(西隴科學(xué));中性樹膠(國(guó)藥集團(tuán));植物基因組DNA提取試劑盒(北京天根);真菌通用引物ITS 1和ITS 4(西安熱默爾);75%乙醇(山東安捷);巰基乙醇;Hieff Canace?Gold高保真DNA聚合酶;馬鈴薯葡萄糖瓊脂培養(yǎng)基(PDA):瓊脂(20 g·L-1),馬鈴薯(200 g·L-1),葡萄糖(20 g·L-1)和無(wú)菌去離子水等。

        1.1.3 主要儀器 恒溫培養(yǎng)箱(中儀國(guó)科);冷凍離心機(jī)(德國(guó)Sigma);TG16A臺(tái)式高速離心機(jī)(上海盧湘);BGP Power 600通用電泳儀(北京天誠(chéng));超凈臺(tái)(蘇州凈化);高壓蒸汽滅菌鍋(上海博訊);PCR基因擴(kuò)增儀(美國(guó)Biorad);冰箱(TCL);光學(xué)顯微鏡(廈門麥克奧迪);水浴鍋(天津泰斯特)。

        1.2 方法

        1.2.1 植物樣品的表面消毒 首先將洗凈的披針葉黃華植物組織剪成3 cm左右的小段,用無(wú)菌去離子水浸泡2~3 h,在超凈臺(tái)中按照以下步驟進(jìn)行表面消毒處理:75%乙醇消毒30 s,無(wú)菌水漂洗1 min,2%NaClO消毒2 min(NaClO為消毒作用較強(qiáng)的試劑,其消毒時(shí)間需要根據(jù)不同組織性質(zhì)作適度調(diào)整,并通過(guò)試驗(yàn)篩選出最適的消毒時(shí)間),無(wú)菌水漂洗1 min, 重復(fù)操作4次。

        1.2.2 披針葉黃華內(nèi)生真菌的分離與純化 用菌絲尖端切割法[25]對(duì)披針葉黃華植物內(nèi)生真菌進(jìn)行分離純化,并將純化菌株培養(yǎng)、編號(hào)并計(jì)算分離率(isolation rate,IR),用于判斷披針葉黃華各組織部位(根、莖、葉和種子)內(nèi)生真菌浸染的程度。

        1.2.3 披針葉黃華內(nèi)生真菌的形態(tài)學(xué)鑒定 參考孫璐等[24]對(duì)植物內(nèi)生真菌的形態(tài)學(xué)鑒定的方法,對(duì)該植物進(jìn)行鑒定。

        1.2.4 披針葉黃華內(nèi)生真菌的基因組DNA提取與5.8S rDNA-ITS序列分析 按照植物基因組DNA提取試劑盒說(shuō)明,提取分離純化的披針葉黃華菌絲DNA。然后利用PCR擴(kuò)增技術(shù)對(duì)提取到的披針葉黃華內(nèi)生真菌的5.8S rDNA-ITS片段進(jìn)行擴(kuò)增。采用20 μL反應(yīng)體系:真菌通用引物ITS 1和ITS 4各1 μL,DNA模板1 μL, Hieff Canace?Gold高保真DNA聚合酶10 μL,ddH2O 7 μL。反應(yīng)條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性20 s,55 ℃ 退火20 s,72 ℃延伸1 min,重復(fù)上述操作33次;72 ℃終延伸10 min;最后4 ℃保溫。反應(yīng)結(jié)束后,將純化的產(chǎn)物送至楊凌奧科公司進(jìn)行測(cè)序。

        1.2.5 內(nèi)生真菌的系統(tǒng)進(jìn)化分析 將內(nèi)生真菌對(duì)應(yīng)的序列輸入NCBI的DNA數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST比對(duì),挑選出吻合度最高的序列,在MEGA 7.0軟件中構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(所用方法為鄰接法,自展次數(shù)為1 000次),根據(jù)系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹中組群親緣關(guān)系對(duì)菌株進(jìn)行分類。

        2 結(jié) 果

        2.1 內(nèi)生真菌分離

        以2%NaClO的消毒時(shí)間為時(shí)間梯度,對(duì)披針葉黃華植物組織進(jìn)行表面消毒,得出以下結(jié)果:披針葉黃華不同組織適宜的消毒時(shí)間有所不同,根的消毒時(shí)間主要集中在2和2.25 min;莖的消毒時(shí)間在1.50、1.75和2.00 min;葉的消毒時(shí)間在1.50、1.75和2.00 min; 種子的消毒時(shí)間在2.00和2.25 min。而印記對(duì)照平板中,消毒時(shí)間為1.00和1.25 min的均被污染;消毒時(shí)間為1.75和2.00 min的分離到的內(nèi)生真菌菌落總數(shù)最多。

        2.2 披針葉黃華內(nèi)生真菌形態(tài)學(xué)鑒定

        將純化菌珠的菌落特征與菌絲特性的觀察結(jié)果與《真菌鑒定手冊(cè)》[26]進(jìn)行比較,初步鑒定試驗(yàn)中從披針葉黃華各組織樣品分離出的內(nèi)生真菌。

        青霉屬(Penicilliumsp.)是披針葉黃華的優(yōu)勢(shì)菌屬,其菌落特征為菌落形狀規(guī)則,背面黃色,表面顏色由外向里依次為白色、淡黃色、墨綠色,該菌生長(zhǎng)速度為2.4 mm·d-1。菌絲特征為菌絲淡黃色,頂端尖細(xì),有隔膜,分支(圖1A1、A2);彎孢霉屬(Curvulariasp.)是生長(zhǎng)速度最快的菌屬,其菌落特征為菌落灰綠色,邊緣呈白色毛絮狀整齊,背面墨綠色,疏松菌絲氣生生長(zhǎng),生長(zhǎng)速度為17.5 mm·d-1。菌絲特征為菌絲灰綠色,分支,有隔膜(圖1B1、B2)。

        A.青霉屬;B.彎孢霉屬A. Penicillium sp.; B. Curvularia sp.圖1 披針葉黃華典型內(nèi)生真菌菌落及菌絲形態(tài)Fig.1 Typical colonies and mycelium morphology of endophytic fungi in Thermopsis lanceolata

        2.3 內(nèi)生真菌種屬鑒定

        將分離到的菌株序列在NCBI的DNA數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST比對(duì),得出的結(jié)果在《真菌鑒定手冊(cè)》中查詢從而確定種屬,具體結(jié)果如表1所示。從披針葉黃華各組織中共分離獲得29種內(nèi)生真菌,分屬于7綱、9目、11科、12屬,其中6種未定屬。

        表1 披針葉黃華內(nèi)生真菌鑒定結(jié)果

        2.4 內(nèi)生真菌在不同組織分布特點(diǎn)

        將鑒定的結(jié)果整理并計(jì)算出不同菌屬在不同組織的相對(duì)分離頻率(表2)。結(jié)果顯示,披針葉黃華內(nèi)生真菌總相對(duì)分離頻率為79.31%,葉的內(nèi)生真菌分離率最高(41.38%),莖次之(37.93%),然后為種子(13.79%),根的最少(6.90%)。不同植物優(yōu)勢(shì)菌屬亦有不同,葉內(nèi)青霉屬(Penicilliumsp.)較常見(jiàn);莖內(nèi)鏈格孢屬(Alternariasp.)和節(jié)孢霉屬(Arthriniumsp.)較多;種子中曲霉屬(Aspergillussp.)為主;根內(nèi)則僅有鐮孢霉屬(Fusariumsp.)。

        2.5 披針葉黃華內(nèi)生真菌的5.8S rDNA-ITS序列分析

        使用MEGA7.0軟件,將披針葉黃華內(nèi)生真菌的5.8S rDNA-ITS序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,具體見(jiàn)圖2所示。由圖2可以看出,分離得到的29種菌株(含有 6種未命名菌株),根據(jù)組群親緣關(guān)系可以將除去裂褶菌屬(Schizophyllumsp.)剩余的菌株,分成種群Ⅰ(自檢支持率76%)和種群Ⅱ(自檢支持率98%)。細(xì)化又可將種群Ⅰ分為種群A(自檢支持率58%)、種群B(自檢支持率100%),將種群Ⅱ分為種群C(自檢支持率83%)和種群D(自檢支持率98%)。

        圖2 基于5.8S rDNA-ITS序列由鄰近法構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.2 Phylogenetic tree constructed with the program Neighbor-joining (NJ) based on 5.8S rDNA-ITS sequences

        3 討 論

        本試驗(yàn)采用植物表面消毒法和PDA培養(yǎng)基對(duì)披針葉黃華組織樣品進(jìn)行消毒,能夠確保分離到的真菌是內(nèi)生真菌,但同時(shí)也可能對(duì)組織中的真菌造成一定的影響[27]。消毒過(guò)程中,時(shí)間過(guò)短會(huì)因達(dá)不到消毒目的而導(dǎo)致污染,消毒時(shí)間過(guò)長(zhǎng)則影響內(nèi)生真菌分離的種類和數(shù)量,由此可見(jiàn)篩選最佳消毒時(shí)間尤為重要[28]。本試驗(yàn)將2%NaClO的消毒設(shè)定幾個(gè)時(shí)間梯度進(jìn)行篩選,結(jié)果顯示,披針葉黃華根的最佳消毒時(shí)間為2 min,葉的最佳消毒時(shí)間為1.75 min,種子的最佳消毒時(shí)間為2.25 min,莖的最佳消毒時(shí)間為2 min。由此可見(jiàn),同一植物不同部位的最佳消毒時(shí)間有所不同。

        本試驗(yàn)表明,披針葉黃華中葉的內(nèi)生真菌分離率最高,莖次之,種子和根較少。這可能是因?yàn)槿~較薄且相對(duì)表面積較大而最易受到浸染,而種子硬度較高、試驗(yàn)中創(chuàng)造出的新鮮創(chuàng)面不足等因素造成分離率較低。關(guān)于披針葉黃華種子特性,王進(jìn)等[29]研究表明,苦豆子與披針葉黃華種子的健壯度和硬實(shí)率都很高,含水量都很低且差異不顯著;同時(shí),兩種豆類在寬度、厚度和相對(duì)密度上沒(méi)有顯著差異,故可推測(cè)兩種植物的種子特性可能差異不大。余永濤[30]等從苦豆子中共分離到27株真菌,主要分布于葉、莖部位,花中較少,而種子和根部組織中始終未分離到真菌,這與本試驗(yàn)結(jié)果基本相似。另外,黃恩霞等[31]對(duì)藏沙蒿內(nèi)生真菌分離過(guò)程中發(fā)現(xiàn),花內(nèi)分離到的真菌種類最多,其次是根,然后是莖,葉內(nèi)分離率最低;而陳青青等[32]發(fā)現(xiàn),在白芨各組織內(nèi)生真菌的分離中根的分離率最高,莖次之,葉最低。以上結(jié)果與本試驗(yàn)中披針葉黃華內(nèi)生真菌分離情況有差異,由此說(shuō)明不同植物受內(nèi)生真菌侵染的程度也不同。

        本試驗(yàn)共分離出29種菌株,屬于7綱、9目、11科、12屬,其中,6株未定屬。青霉屬(Penicilliumsp.)在莖和葉中均分離出,而曲霉屬(Aspergillussp.)在莖和種子中均分離出,由此可見(jiàn)這兩種菌在披針葉黃華中定植比較廣泛。披針葉黃華優(yōu)勢(shì)菌屬—青霉屬(Penicilliumsp.)屬于腐生類真菌,是自然界中一類重要的分解者,可以產(chǎn)生結(jié)構(gòu)類型豐富的活性次級(jí)代謝產(chǎn)物,這些次級(jí)代謝產(chǎn)物在抗菌、抗氧化、抗腫瘤等藥物開(kāi)發(fā)中發(fā)揮重要作用[33-34],而莖中發(fā)現(xiàn)的鏈格孢菌屬(Alternariasp.)其發(fā)酵產(chǎn)物具有一定抗氧化和細(xì)胞毒的潛力,表明披針葉黃華內(nèi)生真菌能產(chǎn)多種具有藥理活性的化合物[35-36]。除此之外,在披針葉黃華中分離出的諸如小雙胞腔菌屬(Didymellasp.)、蛇孢腔菌屬(Ophiobolussp.)、彎孢霉屬(Curvulariasp.)、多尾孢菌屬(Podosporasp.)等內(nèi)生真菌的次生代謝產(chǎn)物成分及是否有藥理活性化合物還需進(jìn)一步深入研究。

        4 結(jié) 論

        經(jīng)過(guò)對(duì)披針葉黃華各組織內(nèi)生真菌的分離與鑒定,共發(fā)現(xiàn)12屬29種內(nèi)生真菌;在披針葉黃華各組織中,葉中分離到的內(nèi)生菌種類最多,莖次之,之后為種子和根;披針葉黃華植株葉中的優(yōu)勢(shì)菌屬為青霉屬(Penicilliumsp.),其在葉和莖中均有分布。

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