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        BRCA1、EML4-ALK基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性

        2021-11-02 03:11:28馬耀先申小燕方曉瑞駱許靜
        實(shí)用癌癥雜志 2021年10期
        關(guān)鍵詞:肺癌差異模型

        孫 楨 馬耀先 劉 鑫 申小燕 方曉瑞 駱許靜

        肺癌是較為常見(jiàn)的呼吸道腫瘤疾病之一[1],據(jù)流行病學(xué)統(tǒng)計(jì)[2],非小細(xì)胞肺癌(non-squamous non-small cell lung cancer,NSCLC)已經(jīng)達(dá)到肺癌發(fā)病率的85.00%,其發(fā)病率居于所有肺癌的首位,隨著工業(yè)化進(jìn)程的加劇,NSCLC呈現(xiàn)逐年上升趨勢(shì)[3]。乳腺癌易感基因(BRCA1)與NSCLC腫瘤細(xì)胞DNA修復(fù)、胚胎生長(zhǎng)以及轉(zhuǎn)錄調(diào)控有關(guān)[4];ALK 基因的重排(EML4-ALK)對(duì)于肺癌具有促進(jìn)作用[5]。本研究通過(guò)探討B(tài)RCA1、EML4-ALK基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性,為臨床診斷和預(yù)防NSCLC提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 基本資料

        選取我院2014年5月至2017年12月期間收治的85例非小細(xì)胞肺癌患者作為疾病組,其中男性患者37例,女性患者48例,年齡在45~65歲之間,平均年齡為(57.51±7.37)歲,體重在45~70 kg之間,平均體重為(61.40±2.37)kg,BMI指數(shù)平均為(25.56±1.29)kg/m2,平均病程為(2.39±0.89)年。另選取本院健康體檢者85例作為對(duì)照組。2組患者的性別、年齡、體重及體重指數(shù)之間的差異不存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        疾病組患者納入標(biāo)準(zhǔn):①符合非小細(xì)胞肺癌診斷標(biāo)準(zhǔn)[6];②預(yù)計(jì)生存時(shí)間在6個(gè)月以上;③KPS評(píng)分[7]均≥70分;④患者知情且同意本研究方案。排除標(biāo)準(zhǔn):①心、肝、腎功能嚴(yán)重不全者;②存在交流障礙的患者;③血常規(guī)異?;颊?;④不配合本研究治療方案患者。

        1.2 研究方法

        入組后,抽取2組患者空腹血液4 ml,使用DNA試劑盒分別對(duì)血液中的DNA進(jìn)行提取,隨后使用taqman探針對(duì)研究對(duì)象的BRCA1、EML4-ALK基因型別進(jìn)行分析,具體操作過(guò)程:將相應(yīng)的引物和探針各取0.5 μL,取DNA提取液2.0 μL,超純水6.0 μL,在熒光PCR檢測(cè)儀中,預(yù)變性(95 ℃,15 s)后,分別再次進(jìn)行變性1(95 ℃,15 s)和變性2(65 ℃,15 s)30個(gè)循環(huán),最終得到BRCA1、EML4-ALK多樣化數(shù)據(jù)。

        1.3 觀察指標(biāo)

        (1)2組人群基因型對(duì)比。分別對(duì)2組人群BRCA1、EML4-ALK基因?qū)Ρ扔^察。(2)2組最小等位基因頻率對(duì)比。使用溫伯格平衡理論,對(duì)2組的最小等位基因頻率進(jìn)行對(duì)比觀察。(3)不同基因遺傳模型下非小細(xì)胞肺癌的風(fēng)險(xiǎn)分析。使用顯性模型、隱性模型、加性模型進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,對(duì)不同基因型別的風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行對(duì)比觀察。(4)不同基因型患者的相關(guān)性分析。分別使用spearman相關(guān)性對(duì)患者的風(fēng)險(xiǎn)進(jìn)行對(duì)比觀察。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        數(shù)據(jù)均采用spss20.0軟件進(jìn)行匯總分析。2組患者的基因型差異采用卡方檢驗(yàn),其中計(jì)數(shù)資料以[n(%)]表示,P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 2組人群基因型對(duì)比

        本研究中,共發(fā)現(xiàn)BRCA1基因類型分別為SER/SER、SER/GLY、GLY /GLY,發(fā)現(xiàn)EML4-ALK基因類型分別為V1、V2、V3,通過(guò)疾病組與健康組的研究發(fā)現(xiàn),2組人群的基因表達(dá)之間的差異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)表1。

        表1 2組人群基因型對(duì)比(例,%)

        2.2 2組最小等位基因頻率對(duì)比

        進(jìn)入本研究的所有基因均符合溫伯格平衡,通過(guò)對(duì)2組人群的最小等位基因進(jìn)行對(duì)比觀察,BRCA1基因類型中的SER/GLY以及EML4-ALK基因類型中的V1具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05),見(jiàn)表2。

        表2 2組最小等位基因頻率對(duì)比

        2.3 不同基因遺傳模型下非小細(xì)胞肺癌的風(fēng)險(xiǎn)分析

        通過(guò)對(duì)非小細(xì)胞肺癌患者的顯性模型、隱性模型、加性模型進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,在3個(gè)模型中,患者的BRCA1基因類型中的SER/GLY以及EML4-ALK基因類型中的V1差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),見(jiàn)表3。

        表3 不同基因遺傳模型下非小細(xì)胞肺癌的風(fēng)險(xiǎn)分析

        2.4 不同基因型患者的相關(guān)性分析

        通過(guò)對(duì)不同基因型患者的相關(guān)性分析,患者的BRCA1基因類型中的SER/GLY以及EML4-ALK基因類型中的V1與非小細(xì)胞肺癌患者風(fēng)險(xiǎn)呈現(xiàn)正相關(guān),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),詳見(jiàn)表4。

        表4 不同基因型患者的相關(guān)性分析

        3 討論

        BRCA1主要位于患者的17q12.21染色體位置[8],以常染色體顯性遺傳方式進(jìn)行遺傳,在疾病的進(jìn)展過(guò)程中,屬于重要的抑癌基因,該基因具有24個(gè)外顯子,其中22個(gè)外顯子具有編碼功能,而其他2個(gè)均無(wú)編碼功能[9]。通過(guò)基因的編碼功能,共計(jì)可產(chǎn)生1863種蛋白質(zhì),其相對(duì)分子量在220000左右[10],在早期,該基因主要在乳腺癌患者中顯性表達(dá),對(duì)于乳腺癌的發(fā)生發(fā)展具有積極的意義[11],隨著研究的進(jìn)展,該基因?qū)τ诨颊叩膿p傷修復(fù)、胚胎繁殖以及調(diào)控轉(zhuǎn)錄作用具有重要意義,而在眾多功能中,該基因的損傷修復(fù)功能最為重要。在眾多研究中,BRCA1基因類型中的SER/GLY基因突變對(duì)于患者的基因具有顯著的守護(hù)作用,是公認(rèn)的基因組看護(hù)組。EML4-ALK基因的卷曲螺旋區(qū)域是患者的重要突變基因區(qū)域,該基因與ALK形成二聚體后,進(jìn)而激活患者的EML4-ALK基因的卷曲螺旋區(qū)域,造成患者的基因突變。目前的研究發(fā)現(xiàn)[12],患者的EML4-ALK基因的突變主要發(fā)生在外顯子2、6、13~15、18、20,而患者的ALK基因的外顯子主要發(fā)生在20,所以該區(qū)域的突變對(duì)于非小細(xì)胞肺癌的發(fā)生發(fā)展具有積極的意義。

        本研究中,通過(guò)對(duì)疾病組和健康組患者的不同基因型進(jìn)行對(duì)比觀察,2組人群的基因型之間的差異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,而在對(duì)2組人群不同的最小等位基因的頻率進(jìn)行對(duì)比觀察,BRCA1基因類型中的SER/GLY以及EML4-ALK基因類型中的V1,相比其他基因型別,其差異顯著。同時(shí),通過(guò)對(duì)不同基因型別的顯性模型、隱性模型、加性模型進(jìn)行風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估,患者的BRCA1基因類型中的SER/GLY以及EML4-ALK基因類型中的V1中差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.05),分析認(rèn)為,BRCA1基因類型中的SER/GLY在基因修復(fù)中扮演重要角色,對(duì)于核苷酸的剪切修復(fù)具有重要意義,同時(shí)對(duì)于同源性重組修復(fù)具有重要意義。在非小細(xì)胞癌肺癌患者的治療中已經(jīng)發(fā)現(xiàn),隨著核苷酸修復(fù)能力的升高[13],患者對(duì)于化療藥物的耐藥作用相對(duì)較強(qiáng),患者的耐藥程度升高。而在本研究中,BRCA1基因類型中的SER/GLY是在患者眾多肺癌基因中使患者的癌基因發(fā)生變化的重要原因,本研究結(jié)果與上述理論研究相互印證。

        EML4-ALK基因也是核酸檢測(cè)中最為常見(jiàn)的突變基因,而在早期研究中,非小細(xì)胞肺癌表皮生長(zhǎng)因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因?yàn)橹匾脑┗颍?0%的癌癥患者的核酸檢測(cè)發(fā)現(xiàn)其均可呈現(xiàn)顯著的EGFR過(guò)度表達(dá)[14],而EGFR基因的過(guò)度表達(dá)中,選擇性使患者的EML4-ALK基因中的堿基發(fā)生替換,使患者的EML4-ALK基因出現(xiàn)顯著的抑癌基因,而在本研究中,EML4-ALK基因類型中的V1呈現(xiàn)高度表達(dá),提示,EML4-ALK基因類型中的V1在肺小細(xì)胞癌的疾病進(jìn)展中具有積極的意義。潘麗霞等[15]對(duì)浙江省非小細(xì)胞肺癌患者的基因型進(jìn)行分析,患者的EGFR與EML4-ALK基因?qū)τ诨颊叩募膊∵M(jìn)展中具有協(xié)同作用,共同促進(jìn)患者的疾病進(jìn)展,與本研究相互印證。

        綜上所述,患者的BRCA1基因類型中的SER/GLY以及EML4-ALK基因類型中的V1與非小細(xì)胞肺癌患者風(fēng)險(xiǎn)呈現(xiàn)正相關(guān),在疾病的進(jìn)展以及早期發(fā)現(xiàn)中具有積極意義。

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