何潤銘,黎振興,郭漢權(quán),黃智文,田永紅,沈 穎,劉洪標(biāo)
(1.廣東科農(nóng)蔬菜種業(yè)有限公司,廣州 510000;2.廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜研究所,廣州 510000)
番茄,又名西紅柿,為茄科番茄屬,是一年或多年生草本植物。番茄是世界上重要的蔬菜作物,全球年總產(chǎn)量達(dá)1.7億t,在蔬菜作物中位居首位[1]。中國是番茄生產(chǎn)和消費(fèi)大國,種植面積常年保持在110萬hm2左右,總產(chǎn)量5 500萬t以上,占全國蔬菜總產(chǎn)量的7%左右[2]。番茄經(jīng)過長期的自然馴化和人工選擇,種類豐富,而番茄又是嚴(yán)格的自花授粉植物,導(dǎo)致了遺傳背景越來越窄[3],因此,不同番茄種質(zhì)資源的收集和利用對于番茄育種有重要意義[4]。
育種的基礎(chǔ)是種質(zhì)資源,而種質(zhì)資源的評價(jià)對于提高番茄育種效率有重要的指導(dǎo)意義[5]。近年來,中國農(nóng)作物種質(zhì)資源累計(jì)更新430 925份[6],目前關(guān)于種質(zhì)資源評價(jià)的報(bào)道較多。孫亞東等[7]對50份來自不同國家和地區(qū)番茄育種材料的22個(gè)性狀進(jìn)行了鑒定分析,發(fā)現(xiàn)4個(gè)材料性狀表現(xiàn)突出,具有一定遺傳改良價(jià)值;袁東升等[8]對100份番茄種質(zhì)資源材料進(jìn)行遺傳多樣性分析、主成分分析和聚類分析,發(fā)現(xiàn)不同性狀在不同材料之間表現(xiàn)出不同程度的多樣性;芮文婧等[9]對353份番茄種質(zhì)資源的13個(gè)質(zhì)量性狀和16個(gè)數(shù)量性狀進(jìn)行變異水平評價(jià)、相關(guān)性分析及主成分分析,發(fā)現(xiàn)番茄品種材料的表型性狀具有豐富的遺傳多樣性;鄭福順等[10]通過對480份番茄種質(zhì)資源的20個(gè)表型性狀進(jìn)行分析,成功構(gòu)建出3組核心種質(zhì)R1、P1和D1。主成分分析和聚類分析是遺傳多樣性分析的重要方法之一,在很多植物中都有應(yīng)用,如甘藍(lán)型油菜[11]、生菜[12]、鐘花櫻[13]、云南紅米[14]、毛花獼猴桃[15]等。
本研究對95份番茄品種資源的表型性狀進(jìn)行主成分分析和聚類分析,從而了解品種資源的遺傳多樣性、變異程度和品種資源之間的遺傳關(guān)系,為番茄品種資源利用和現(xiàn)代育種提供一定的參考。
95份番茄品種材料分別來自廣東省、山東省、陜西省、臺灣省、廣西省、北京市、湖北省及甘肅省。品種編號、名稱及來源見表1。于2020年8月12播種,10月6日定植于廣東省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣總站示范田。
表1 番茄品種材料編號、名稱及來源
參照中華人民共和國農(nóng)業(yè)行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)NY/T 2236—2012《植物新品種特異性、一致性和穩(wěn)定性測試指南 番茄》,調(diào)查植株高度、生長類型、生長習(xí)性、葉姿態(tài)、葉綠色程度、復(fù)葉類型、復(fù)葉長、復(fù)葉寬、花序類型、花簇生、花顏色、果實(shí)綠肩、綠肩覆蓋范圍、綠肩綠色程度、果實(shí)成熟前顏色、果梗離層、果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果實(shí)縱/橫比率、果柄長、果梗端的棱、果實(shí)橫切面形狀、果實(shí)成熟時(shí)顏色、單果重及硬度,共25個(gè)性狀。
對數(shù)量性狀的數(shù)據(jù)進(jìn)行平均值、標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù)和遺傳多樣性指數(shù)分析,對質(zhì)量性狀數(shù)據(jù)進(jìn)行分布頻率及遺傳多樣性指數(shù)的分析,其中遺傳多樣性指數(shù)的分析是利用Shannon-Wiener多樣性指數(shù)(H′)計(jì)算公式計(jì)算,利用SPSS 21.0軟件進(jìn)行相關(guān)性分析和主成分分析。通過番茄的25個(gè)表型性狀,采用系統(tǒng)聚類組間聚合的方法對95份番茄品種資源進(jìn)行聚類,采用平方歐式距離得到近似矩陣。
番茄品種資源的質(zhì)量性狀分析結(jié)果(表2)表明,15個(gè)質(zhì)量性狀在95份番茄品種材料中共有35個(gè)變異類型,平均每個(gè)性狀的變異類型為2.33個(gè),大部分性狀的變異類型與分布頻率不同,其中果梗離層性狀、花簇生性狀和花顏色性狀由于不存在性狀分離,分布頻率都是100%。
表2 番茄品種資源質(zhì)量性狀的分類及分布頻率
番茄品種資源質(zhì)量性狀的Shannon-Wiener多樣性指數(shù)(H′)變化范圍為0.108 8~1.234 8。H′最大的是成熟時(shí)果皮顏色,果皮為橙色的分布頻率達(dá)到36.84%。復(fù)葉類型的H′最小,大多數(shù)表現(xiàn)為二回羽狀復(fù)葉,分布頻率為88.42%。葉片綠色程度以中間型為主,分布頻率為62.11%,葉片顏色淺的只有一個(gè)品種。葉片著生狀態(tài)以半下垂為主,分布頻率為63.16%。生長類型以無限生長性為主,分布頻率為95.79%。生長習(xí)性以直立生長為主,占總數(shù)量的94.74%。多岐花序在花序類型中占71.58%。果實(shí)綠肩占50.53%,與無綠肩的相當(dāng)。綠肩覆蓋中覆蓋范圍大的占大部分,分布頻率為87.50%。綠肩的顏色以中肩型為主,分布頻率為85.42%。果實(shí)硬度以硬為主,分布頻率占總數(shù)的62.11%。
95份番茄品種數(shù)量性狀的分析結(jié)果見表3,其中變異系數(shù)在15.7%~128.6%,遺傳多樣性指數(shù)在1.005~2.087,多樣性豐富。果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑和果形指數(shù)都是番茄果實(shí)外觀的主要參照指標(biāo),其中果實(shí)橫徑的變異系數(shù)最大,為49.6%。在果實(shí)產(chǎn)量的參照指標(biāo)中,單果重的變異系數(shù)是所有數(shù)量性狀指標(biāo)中最大的,為128.6%。復(fù)葉長度的遺傳多樣性指數(shù)最大,為2.087,其次是植株高度的遺傳多樣性指數(shù),為2.079,再次是果形指數(shù)和復(fù)葉寬度的遺傳多樣性指數(shù),分別為2.047和2.015。
表3 番茄品種資源數(shù)量性狀的遺傳多樣性分析
性狀的相關(guān)性可以通過對一種性狀的選擇間接達(dá)到選擇另一種性狀的效果,從而可以提高選擇效率,加速育種進(jìn)程[16]。95份番茄品種性狀的相關(guān)性分析結(jié)果見表4。由表4可知,株高與復(fù)葉長表現(xiàn)為極顯著正相關(guān);復(fù)葉長與復(fù)葉寬、果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、單果重呈極顯著正相關(guān),與果柄長、果形指數(shù)呈極顯著負(fù)相關(guān);復(fù)葉寬與復(fù)葉長、果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、單果重呈極顯著正相關(guān),與果柄長、果形指數(shù)呈極顯著負(fù)相關(guān);果柄長與復(fù)葉長、復(fù)葉寬、果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、單果重呈極顯著負(fù)相關(guān),與果形指數(shù)呈極顯著正相關(guān);果實(shí)縱徑與果實(shí)橫徑、單果重呈極顯著正相關(guān),與果型指數(shù)呈極顯著負(fù)相關(guān);果實(shí)橫徑與果形指數(shù)呈極顯著負(fù)相關(guān),與單果重呈極顯著正相關(guān);果形指數(shù)與單果重呈極顯著負(fù)相關(guān)。
表4 95份番茄品種性狀的相關(guān)性分析
對95份番茄品種材料的表型性狀進(jìn)行主成分分析,結(jié)果見表5。主成分的選擇是依據(jù)特征值和貢獻(xiàn)率,以特征值大于1為標(biāo)準(zhǔn)提取成分[17]。前7個(gè)主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)76.71%,說明這7個(gè)主成分能代表這25個(gè)性狀所代表的遺傳信息。
表5 95份番茄品種性狀的主成分分析
第一個(gè)主成分的特征值和貢獻(xiàn)率分別為5.124和24.40%,主要是果柄長、果梗端的棱、單果重等,其特征向量都在0.600~0.805,這類性狀主要和番茄果實(shí)相關(guān)。第二個(gè)主成分的特征值為2.480,貢獻(xiàn)率為11.81%,主要是株高、生長習(xí)性和復(fù)葉類型,這類性狀主要和番茄的植株和葉片有關(guān)。第三個(gè)主成分特征值和貢獻(xiàn)率分別為2.275和10.83%,主要是橫切面性狀、果形指數(shù)、果實(shí)橫徑等,這類性狀主要和番茄的果實(shí)有關(guān)。第四個(gè)主成分主要是綠肩覆蓋范圍和果實(shí)硬度。第五個(gè)主成分主要是葉姿態(tài)。第六個(gè)和第七個(gè)主成分主要和果實(shí)成熟前和成熟時(shí)顏色有關(guān)。從特征值和貢獻(xiàn)率的大小,可以篩選出果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果形指數(shù)、單果重、果柄長、果梗端的棱、果實(shí)成熟前顏色、果實(shí)成熟時(shí)顏色、果實(shí)硬度、復(fù)葉長、復(fù)葉寬等性狀是造成番茄品種表型差異的主要因素。
對95份番茄品種表型性狀進(jìn)行聚類分析,在遺傳距離為5處分為5個(gè)群組,結(jié)果見圖1。
圖1 95份番茄品種聚類分析結(jié)果
第1群組共包含有35個(gè)品種材料,絕大部分來源是廣東且全部都是大果形番茄品種。其主要特征是株高較高,生長類型都是無限生長型,復(fù)葉類型都是二回羽狀復(fù)葉且都相對較大,葉片顏色都較深,大部分品種果實(shí)無綠肩,成熟時(shí)果皮顏色以橙色為主,果實(shí)縱徑、橫徑也相對較大,單果重也都在100 g以上,果實(shí)硬度都較硬。
第2群組共包含10個(gè)品種材料,來源較廣。其主要特征是果實(shí)成熟前顏色較淺,果梗端的棱強(qiáng)或極強(qiáng),成熟時(shí)果皮顏色橙色和粉紅色各占50%,果形指數(shù)較小,果實(shí)硬度以中、硬為主,單果重有9個(gè)品種在200 g以上。
第3群組包含2個(gè)品種材料,都來源于廣東。其主要特征是果實(shí)橫徑較縱徑小,果形指數(shù)較大,復(fù)葉長,都是無限生長型,果柄較長。
第4群組包含44個(gè)品種材料,來源較廣。其主要特征是全部都是小果形番茄品種,葉片顏色中、深為主,大部分番茄品種都有綠肩,且綠肩覆蓋范圍較大,綠肩顏色中、深為主,果實(shí)成熟前顏色淺,果形指數(shù)較大,果梗端的棱中、弱為主,單果重較輕,果實(shí)硬度中、硬為主。
第5群組只有1個(gè)品種材料,來源于廣東。其主要特征是株高較矮,葉片顏色深,復(fù)葉小,果柄短,單果重最輕。
對番茄品種質(zhì)量性狀的多樣性分析結(jié)果表明,成熟時(shí)果皮顏色的多樣性指數(shù)最大,說明供試品種的果皮顏色比較豐富,但是還是以橙色、紅色、粉色為主,再結(jié)合其他質(zhì)量性狀分析結(jié)果,在一定程度上說明了當(dāng)前番茄育種方向:果皮顏色以常規(guī)顏色為主;葉片顏色以中間型為主;葉片著生以半下垂為主;生長類型以無限生長型為主;果實(shí)硬度以偏硬為主等。
對番茄品種的數(shù)量性狀的多樣性分析結(jié)果表明,單果質(zhì)量的變異系數(shù)最大,果形指數(shù)的多樣性指數(shù)最大,在一定程度上說明當(dāng)前的育種向多種果形、多種重量方向發(fā)展。
數(shù)量性狀的相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn),株高只與復(fù)葉長呈極顯著相關(guān),與其他性狀無相關(guān)性;果形指數(shù)與果柄長呈極顯著正相關(guān),與果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、單果重、復(fù)葉長、復(fù)葉寬互呈極顯著負(fù)相關(guān);單果重與果型指數(shù)和果柄長呈極顯著負(fù)相關(guān),與果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、復(fù)葉長、復(fù)葉寬互呈極顯著正相關(guān),這個(gè)結(jié)果與前人的研究結(jié)論[18]相似。這些分析結(jié)果從一定程度上說明株高在番茄育種方向上不再是重點(diǎn)指標(biāo),單果重、果型指數(shù)、果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、復(fù)葉長、復(fù)葉寬和果柄長是相對重要的性狀指標(biāo)。
從主成分分析的結(jié)果可以篩選出果實(shí)縱徑、果實(shí)橫徑、果形指數(shù)、單果重、果柄長、果梗端棱、果實(shí)成熟前顏色、成熟時(shí)顏色、果實(shí)硬度、復(fù)葉長、復(fù)葉寬等性狀是造成番茄品種表型差異的主要因素,這與前人的研究結(jié)果[19]相似,也與相關(guān)性分析的結(jié)果相對應(yīng)。
采用系統(tǒng)聚類組間聚合的方法在遺傳距離為5處將供試的95份資源劃分為5個(gè)群組。第1群組包含35份資源,第4群組包含44份資源,這兩大群組資源數(shù)量占總數(shù)的83.2%,這也從一定程度上說明當(dāng)前番茄育種趨于同質(zhì)化。
遺傳的多樣性在于遺傳背景的多樣性,而如今的番茄品種趨于同質(zhì)化,應(yīng)當(dāng)重視不同遺傳背景材料的保護(hù),發(fā)掘不同背景番茄材料的利用價(jià)值?,F(xiàn)代生物技術(shù)在育種中可大大縮短育種周期,加速育種進(jìn)程,簡化育種流程[20],應(yīng)結(jié)合現(xiàn)代育種技術(shù)系統(tǒng)、快速和深入地挖掘不同背景的遺傳資源。