李濟(jì)民,朱 輝,徐 可,王 飛,楊 璐,葉澤康,談楚楚,顧 倩,王 靜,李春堅(jiān)*
1南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院心臟科,江蘇 南京 210029;2阜陽市第五人民醫(yī)院心血管內(nèi)科二病區(qū),安徽 阜陽 236000;3南京醫(yī)科大學(xué)附屬常州第二人民醫(yī)院老年病科,江蘇 常州 213000
抗血小板治療是冠心?。╟oronary artery dis?ease,CAD)藥物治療的基石。作為二磷酸腺苷(ade?nosine diphosphate,ADP)受體拮抗劑,氯吡格雷被廣泛應(yīng)用于急性冠脈綜合征(acute coronary syn?drome,ACS)或冠狀動(dòng)脈支架植入后的CAD患者[1-2]。但研究發(fā)現(xiàn),氯吡格雷的抗血小板療效存在顯著的個(gè)體差異,20%以上的患者在服用常規(guī)劑量的氯吡格雷時(shí)血小板聚集功能未被有效抑制[3],稱為氯吡格雷低反應(yīng)性(clopidogrel low response,CLR)或氯吡格雷抵抗(clopidogrel resistance,CR)[4]。研究顯示,CLR 患者的支架內(nèi)血栓、心肌梗死和全因死亡的風(fēng)險(xiǎn)顯著增加[5]。
microRNA(miRNA)是一類長18~22 nt 的非編碼RNA,其可通過與靶信使核糖核酸(messenger RNA,mRNA)特異性結(jié)合,在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控靶基因的表達(dá)。Nagalla等[6]發(fā)現(xiàn)健康志愿者中血小板高反應(yīng)組與正常反應(yīng)組間血小板miRNA 存在表達(dá)差異,miRNA可以通過與mRNA結(jié)合來調(diào)控血小板蛋白的表達(dá),從而影響血小板活性。本研究旨在通過篩查CLR患者血小板miRNA表達(dá)的差異,探尋對血小板聚集關(guān)鍵蛋白(P2Y12受體、Gi2α蛋白、血小板糖蛋白Ⅱb/Ⅲa 受體)可能有調(diào)控作用的miRNA,為個(gè)體化抗血小板治療提供新的靶標(biāo)。
連續(xù)入選2015年4月—8月在南京醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院心血管內(nèi)科經(jīng)常規(guī)氯吡格雷治療(負(fù)荷劑量300 mg,維持劑量75 mg/d)至少5 d 的CAD 患者78 例。入選標(biāo)準(zhǔn):①年齡18~80 歲;②入院診斷為急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)、不穩(wěn)定型心絞痛(unstable angina pectoris,UA)或穩(wěn)定型心絞痛(stable angina pectoris,SA);③簽署知情同意書。排除標(biāo)準(zhǔn):①氯吡格雷過敏或不耐受者;②高出血風(fēng)險(xiǎn)患者(如血小板計(jì)數(shù)<80×109/L、活動(dòng)性消化性潰瘍、近期腦外傷史等);③計(jì)劃服用華法林或可能干擾氯吡格雷[如細(xì)胞色素P450 3A(cyto?chrome P450 3A,CYP3A)抑制劑或CYP3A 誘導(dǎo)劑等]抗血小板療效的藥物。本研究已在clinicaltrials.gov 網(wǎng)站注冊,ID號(hào):NCT02447809。
光學(xué)血小板聚集儀(light transmittance ag?gregometry,LTA;540VS,Chronolog公司,美國),全自動(dòng)血液分析儀(XS?500i,Sysmex公司,日本),高速離心機(jī)(Centrifuge 5810 R)、移液槍(Eppendorf 公司,德國),反應(yīng)杯、攪拌磁棒(Chronolog 公司,美國),漩渦震蕩儀(上海青浦瀘西儀器廠),pH 計(jì)(上海儀電科學(xué)儀器股份有限公司),去離子水制水設(shè)備(Mer?ck Millipore 公司,德國),電泳儀(Bio?Rad 公司,美國),凝膠成像系統(tǒng)(上海天能科技有限公司),Agi?lent 2200TapeStation(Agilent Technologies 公司,美國),Qubit 2.0(Life Technologies 公司,美國),Hiseq 2500(Illumina 公司,美國),臺(tái)式低溫高速離心機(jī)、分光光度計(jì)、水浴鍋(Thermo Fisher Scientific 公司,美國),磁珠分選磁鐵架(Miltenyi Biotec 公司,德國),電子天平(Mettler Toledo公司,瑞士),凈化工作臺(tái)(蘇州安泰空氣技術(shù)有限公司),制冰機(jī)(SANYO公司,日本),Illumina Hiseq 2500測序儀(Illumina公司,美國)。
TRIzol(Invitrogen 公司,美國),mirVanaTMmiR?NA Isolation Kit(Life Technologies 公司,美國),CD45 MicroBeads,human(Miltenyi Biotec 公司,德國),Small RNA Sample Prep Kit(Illumina 公司,美國),終濃度為5 μmol/L 的ADP(Chronolog 公司,美國),氫氧化鈉、鹽酸、冰醋酸(上海凌峰化學(xué)試劑有限公司),乙二胺四乙酸、瓊脂糖、MOPS、PBS 粉劑(合肥Biosharp公司),枸櫞酸鈉(西隴化工股份有限公司),無水乙醇、甲醛(上海國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司),DEPC 水(Invitrogen 公司,美國),甲酰胺(上海麥克林生化科技有限公司),5 mL枸櫞酸鈉1∶9 抗凝的采血管(BD 公司,美國),CD45 抗體、LD 磁珠分選柱(Miltenyi Biotec 公司,德國),0.22 μm無菌濾器(Merck Millipore公司,德國)。
1.2.1 血小板聚集率測定
在患者服用氯吡格雷后2.5 h,用含3.2%枸櫞酸鈉抗凝管采集肘靜脈血樣8 mL,并于標(biāo)本采集后2 h內(nèi)完成LTA 法血小板聚集功能檢測,具體方法如下:在常溫下將采集的血標(biāo)本以200g離心8 min,用移液槍緩慢抽取離心后血標(biāo)本的上清液以獲取富血小板血漿(platelet rich plasma,PRP);用全自動(dòng)血液分析儀檢測PRP中的血小板計(jì)數(shù);將吸取PRP后剩余的血樣常溫下以2 460g離心10 min,用移液槍緩慢抽取血標(biāo)本的上清液以獲取貧血小板血漿(platelet poor plasma,PPP);用PPP 作為稀釋液將PRP中的血小板濃度稀釋至250×109/L(如PRP中的血小板濃度在250×109/L以下,則無需稀釋);向PRP中加入2.5 μL終濃度為5 μmol/L的ADP,測定8 min最大血小板聚集率。
參照CREST研究,將ADP誘導(dǎo)的血小板聚集率(platelet aggregation induced by adenosine diphos?phate,PLADP)大于上四分位數(shù)定義為氯吡格雷低反應(yīng)性[7],小于下四分位數(shù)者設(shè)為對照組。
1.2.2 血小板純化與RNA提取及變性電泳
在患者進(jìn)行冠狀動(dòng)脈造影時(shí),經(jīng)鞘管采集15 mL動(dòng)脈血于枸櫞酸鈉抗凝管,以200g離心10 min,移取上層PRP,用免疫磁珠法分選白細(xì)胞與血小板比例低于1∶5 000 000 的純化血小板(具體操作參考CD45 MicroBeads LD 磁珠分選柱的說明書)。用TRIzol 裂解上述純化血小板,再用mirVanaTMmiR?NA Isolation Kit 提取裂解后血小板中的總RNA(具體操作參考TRIzol 及mirVanaTMmiRNA Isolation Kit說明書),最終將每份樣本的總RNA 溶解于20 μL無RNase 的的DEPC 水中置-80 ℃冰箱儲(chǔ)存。通過Nanodrop 分光光度計(jì)檢測每個(gè)樣本總RNA 的濃度及260 nm/280 nm 的吸光度(OD)比值,確認(rèn)每個(gè)總RNA 樣本的OD 比值均在1.8~2.0 之間。按上述分組結(jié)果,將氯吡格雷低反應(yīng)組和對照組患者的總RNA 分別混為2 個(gè)RNA 池。分別從2 組RNA 池中取RNA樣本1.5 μg,按照相應(yīng)配比加入10×MOPS、甲醛、甲酰胺并混勻,用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行變性電泳。
1.2.3 測序文庫的構(gòu)建及測序
每例樣本取1.5 μg 總RNA 行15%尿素聚丙烯酰胺凝膠電泳,電泳后對18~32 nt片段進(jìn)行切割、洗脫、純化回收。采用Small RNA Sample Prep Kit(Il?lumina,美國)構(gòu)建小RNA文庫。純化后的小RNA序列采用T4 RNA連接酶將接頭引物分別連接至2個(gè)文庫的序列5′端和3′端,逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA 第一鏈,PCR建立小RNA文庫。利用Illumina HiSeq 2500測序平臺(tái)對該文庫進(jìn)行高通量測序。
1.2.4 小RNA數(shù)據(jù)處理和信息分析
測序所得長度為51 nt 的小RNA 序列通過去接頭、去除低質(zhì)量和污染序列,最終獲得18~32 nt的高質(zhì)量小RNA 序列。統(tǒng)計(jì)小RNA 的種類、數(shù)量及長度分布,初步判斷小RNA質(zhì)量。采用mirdeep2軟件將所得小RNA序列與參考基因組進(jìn)行比對分析,再將匹配序列分別與GenBank 和Rfam 10.0 數(shù)據(jù)庫進(jìn)行對比,篩選出miRNA 序列并分類注釋,分析其表達(dá)情況。
1.2.5 miRNA差異表達(dá)分析
將樣本中的miRNA 表達(dá)量標(biāo)準(zhǔn)化為TPM(tags per million),應(yīng)用EdgeR 軟件對2 對樣本已知miR?NA表達(dá)差異分析統(tǒng)計(jì)。將“差異倍數(shù)”絕對值≥2且P<0.05的miRNA定義為差異表達(dá)的miRNA。差異倍數(shù)=Log2(氯吡格雷低反應(yīng)組miRNA 標(biāo)準(zhǔn)化的表達(dá)量/對照組miRNA標(biāo)準(zhǔn)化的表達(dá)量)。
計(jì)量資料經(jīng)正態(tài)檢驗(yàn)符合正態(tài)分布者采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,兩組計(jì)量資料的比較采用獨(dú)立樣本的t檢驗(yàn);不符合正態(tài)性分布者用中位數(shù)與四分位數(shù)[M(P25,P75)]表示,組間比較采用非參數(shù)檢驗(yàn)中的秩和檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以百分率表示,計(jì)數(shù)資料比較采用χ2檢驗(yàn)或Fisher’s精確檢驗(yàn)。所有數(shù)據(jù)采用SPSS 20.0 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
根據(jù)入選患者的PLADP結(jié)果計(jì)算出四分位數(shù)P25=19.5%,P75=48.5%。選取PLADP>48.5%的氯吡格雷低反應(yīng)性患者19例為低反應(yīng)組,為了更明顯地篩選出血小板miRNA 表達(dá)譜的差異,將PLADP<19.5%的19 例患者設(shè)為對照組。兩組患者的臨床基線特征包括年齡、性別、體重指數(shù)、臨床診斷、既往史及合并用藥等均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(表1)。兩組患者住院期間的生化指標(biāo)包括紅細(xì)胞計(jì)數(shù)、白細(xì)胞計(jì)數(shù)、尿素氮、丙氨酸氨基轉(zhuǎn)移酶、射血分?jǐn)?shù)等亦無顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(表2)。
表1 患者臨床基線特征Table 1 Baseline clinical characteristics of the patients
表2 患者住院期間的生化指標(biāo)Table 2 Biochemical indexes of the patients during hospitalization
氯吡格雷低反應(yīng)組和對照組的PLADP分別為54.8%±5.3%vs.13.3%±4.4%,組間存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P<0.000 1,圖1)。
圖1 兩組患者血小板聚集率Figure 1 Platelet aggregation in the two groups
經(jīng)Nanodrop分光光度計(jì)檢測,氯吡格雷低反應(yīng)組的血小板總RNA 池OD值為2.0,濃度為30.3 ng/μL。對照組的血小板總RNA 池OD 比值為1.9,濃度為41.8 ng/μL。從RNA 變性電泳圖可以看出血小板總RNA 中miRNA 分布區(qū)的條帶清晰,無明顯降解(圖2)。
圖2 血小板總RNA的變性電泳圖Figure 2 Denaturation electrophoresis of platelet total RNA
通過高通量測序發(fā)現(xiàn)兩組患者有95 種血小板miRNA 表達(dá)上存在顯著差異,其中顯著性下調(diào)的、差異倍數(shù)>2、拷貝數(shù)前20 位的miRNA 依次是hsa?miR?300、hsa?miR?151b、hsa?miR?1299、hsa?miR?16?1?3p、hsa?miR?3150b?3p、hsa?miR?548am?3p、hsa?miR?1260a、hsa?let?7f?2?3p、hsa?miR?4755?3p、hsa?miR?3144?3p、hsa?miR?5004?3p、hsa?miR?6862?5p、hsa?miR?1288?3p、hsa?miR?4661?5p、hsa?miR?4479、hsa?miR?4421、hsa?miR?6788?3p、hsa?miR?188?5p、hsa?miR?6874?3p、hsa?miR?218?5p(表3)。
表3 大于2倍拷貝數(shù)下調(diào)的miRNA(前20 位)Table 3 2?fold down?regulated miRNAs(top 20)
通過靶基因預(yù)測軟件TargetScan、miRanda、PI?TA 和miRWalk 對上述顯著性下調(diào)的、差異倍數(shù)>2、拷貝數(shù)前20 位miRNA 的靶基因進(jìn)行預(yù)測,并從中篩選出至少被2個(gè)靶基因預(yù)測軟件預(yù)測對血小板聚集關(guān)鍵蛋白(P2Y12 受體、Gi2α蛋白、血小板糖蛋白Ⅱb/Ⅲa 受體)可能有調(diào)控作用的miRNA;結(jié)果發(fā)現(xiàn)血小板miRNAs中的hsa?miR?188?5p、hsa?miR?6874?3p對P2Y12受體基因的表達(dá)可能具有調(diào)控作用;hsa?miR?218?5p、hsa?miR?3150b?3p、hsa?miR?1288?3p、hsa?miR?1299、hsa?miR?6862?5p 對Gi2α蛋白基因的表達(dá)可能具有調(diào)控作用;hsa?miR?6862?5p、hsa?miR?188?5p、hsa?miR?4421對血小板糖蛋白Ⅲa受體基因的表達(dá)可能具有調(diào)控作用;對于血小板糖蛋白Ⅱb受體,結(jié)果未發(fā)現(xiàn)同時(shí)被至少被2 個(gè)靶基因預(yù)測軟件預(yù)測到的交集miRNA(表4)。
表4 血小板miRNA靶基因預(yù)測Table 4 Target gene prediction of platelet miRNA
目前,阿司匹林與氯吡格雷雙聯(lián)抗血小板治療被廣泛應(yīng)用于ACS患者[1,8-10],較之新一代ADP受體拮抗劑替格瑞洛,氯吡格雷在年齡≥75 歲的老年患者、腎功能不全、血小板計(jì)數(shù)偏低等特殊ACS 患者中使用更為安全[11]。但研究發(fā)現(xiàn)在服用氯吡格雷常規(guī)劑量的患者中CLR發(fā)生率>20%[12],且CLR患者血栓事件發(fā)生率顯著增高[5]。研究發(fā)現(xiàn)CLR與細(xì)胞色素P450 2C19(cytochrome P450 2C19,CYP2C19)基因多態(tài)性、糖尿病、吸煙、肥胖、腎功能不全、血清堿性磷酸酶、血尿酸等多種因素相關(guān)[13-18],但基因變異等已知因素僅可解釋約12%的個(gè)體反應(yīng)差異,探討CLR的未知相關(guān)因素一直是近年來的研究熱點(diǎn)。
Chen等[19]發(fā)現(xiàn)與健康對照相比,支架植入術(shù)后接受抗血小板治療(阿司匹林聯(lián)合氯吡格雷或替格瑞洛或西洛他唑)的患者中miR?365?3p表達(dá)水平與抗血小板治療的反應(yīng)性相關(guān);Chen S 等通過檢測血管舒張刺激磷蛋白計(jì)算血小板反應(yīng)指數(shù)來評價(jià)健康對照與介入治療術(shù)后冠心病患者對氯吡格雷的反應(yīng)性,發(fā)現(xiàn)miRNA?26a 與氯吡格雷低反應(yīng)性相關(guān)[20];Nagalla 等[6]發(fā)現(xiàn)在血小板高反應(yīng)與正常反應(yīng)的健康人中有74種血小板miRNA 存在表達(dá)水平的差異,并發(fā)現(xiàn)miR?200b、miR?495和miR?107可通過特異性識(shí)別各自的靶mRNA 來調(diào)控血小板相應(yīng)蛋白的表達(dá)。因入選對象、血小板miRNA 提取方法、血小板功能檢測方法、miRNA 測序方法等存在差異,上述不同研究篩選出的與血小板反應(yīng)性相關(guān)的血小板miRNA不盡相同。
本研究通過如下方面在一定程度上避免了相關(guān)偏倚對實(shí)驗(yàn)結(jié)果造成的影響:①參考相關(guān)研究共入選38例CAD患者[6],氯吡格雷低反應(yīng)組與對照組患者的臨床基線特征與生化指標(biāo)均無顯著的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。②采取了免疫磁珠法高效地純化血小板后,提取的血小板miRNA又經(jīng)Nanodrop分光光度計(jì)及變性電泳質(zhì)控。③采用的光比濁法血小板功能檢測可特異性地反映ADP通道被抑制的水平[21],是目前血小板聚集功能檢測的“金標(biāo)準(zhǔn)”[22],也是國際相關(guān)共識(shí)推薦的檢測方法之一[23]。POPULAR 研究比較了光比濁法、VerifyNow P2Y12、Plateletworks、IMPACT?R、PFA?100、改良PFA P2Y 共6 種血小板功能檢測方法,結(jié)果提示,光比濁法是對臨床終點(diǎn)有預(yù)測價(jià)值的3種血小板功能檢測方法之一[24]。④選取的Illumina HiSeq 2500 測序平臺(tái)是一個(gè)功能強(qiáng)大的高通量測序系統(tǒng),可獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù),是目前高通量測序領(lǐng)域主導(dǎo)的檢測方法之一[25]。
與對照組相比,CLR患者中有95種血小板miR?NA 表達(dá)上存在顯著差異;通過查詢靶基因預(yù)測軟件TargetScan、miRanda、PITA 和miRWalk,篩選出了至少被2個(gè)靶基因預(yù)測軟件預(yù)測對血小板聚集關(guān)鍵蛋白(P2Y12 受體、Gi2α蛋白、血小板糖蛋白IIb/IIIa受體)可能有調(diào)控作用的miRNA。在這些miRNA中,已有研究證實(shí)miR?218?5p 與凝血功能相關(guān),但具體機(jī)制還有待進(jìn)一步研究[26]。這些差異表達(dá)的miRNAs 有望成為血小板反應(yīng)性特異性生物學(xué)標(biāo)志物,也可能用于預(yù)測作用于相同位點(diǎn)的新型抗血小板藥物的反應(yīng)性。
綜上所述,本研究通過高通量測序探討了CLR的CAD患者血小板miRNA的表達(dá)差異,并篩選出了8個(gè)對血小板聚集關(guān)鍵蛋白可能有調(diào)控作用的miR?NA。隨著血小板miRNA 對血小板和其他細(xì)胞(包括血管內(nèi)皮細(xì)胞、心肌細(xì)胞等)以及l(fā)ncRNA(long non?coding RNA)、circRNA、miRNA、mRNA 之間的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的進(jìn)一步完善,miRNA在抗栓治療中的調(diào)控作用可能會(huì)為個(gè)體化抗血小板治療提供新的干預(yù)手段,值得進(jìn)一步深入研究。