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        梅干菜和腌制雪菜細(xì)菌菌群多樣性分析

        2021-09-29 14:14:32虞任瑩彭思佳肖慶霞郭斯統(tǒng)羅海波
        食品工業(yè)科技 2021年18期
        關(guān)鍵詞:梅干菜雪菜半成品

        虞任瑩,彭思佳,李 藝,肖慶霞,郭斯統(tǒng),羅海波,

        (1.南京師范大學(xué)食品與制藥工程學(xué)院,江蘇南京 210023;2.寧波市鄞州三豐可味食品有限公司,浙江寧波 315145)

        雪菜(Brassica juncea(L.)Czern. et Coss. var.multicepsTsen et Lee)又名雪里蕻,屬十字花科蕓薹屬,是芥菜的變種,也稱葉用芥菜[1]。雪菜在我國南北各地均有種植,尤其在江浙一帶栽培甚廣。雪菜采收后除少部分直接用于鮮食外,通常采用干法腌制和鹽水泡制的方法加工成梅干菜和泡酸菜產(chǎn)品進(jìn)行保藏[2]。雪菜腌制成的梅干菜色澤油光黃黑、滋味鮮美、香氣濃郁、風(fēng)味獨(dú)特,同時(shí)還具有解暑熱,潔臟腑,消積食,治咳嗽,生津開胃等功效[3],而雪菜經(jīng)鹽水泡制發(fā)酵后富含有機(jī)酸、醇類、酯類及氨基酸等多種風(fēng)味物質(zhì),呈現(xiàn)出特有的鮮香味,深受國內(nèi)外消費(fèi)者喜愛[4]。傳統(tǒng)梅干菜和腌制雪菜多為家庭自制,生產(chǎn)周期過長且鹽分較高,造成市場上銷售的產(chǎn)品品質(zhì)參差不齊,產(chǎn)品檔次不高[5]。

        微生物是影響梅干菜和腌制雪菜等發(fā)酵類蔬菜營養(yǎng)成分、揮發(fā)性物質(zhì)、風(fēng)味及品質(zhì)差異的關(guān)鍵因素,同時(shí)也受蔬菜原料種類及不同地域和腌制環(huán)境條件的制約。近年來,關(guān)于梅干菜和腌制雪菜中發(fā)酵微生物方面的研究主要集中在乳酸菌的分離鑒定[6]、揮發(fā)性風(fēng)味物質(zhì)[7?8]、酚酸及其抗氧化活性[9?10]、低鹽腌制[11]等,對梅干菜和腌制雪菜微生物菌群結(jié)構(gòu)及多樣性的研究報(bào)道較少。尚雪嬌等[12]采用Illumina MiSeq高通量測序技術(shù)對恩施地區(qū)雪里蕻梅干菜菌群多樣性進(jìn)行解析,乳桿菌屬(Lactobacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)等8種相對豐度大于1.0%的菌屬;陳希等[13]采用16S rDNA克隆文庫法對雪菜低鹽腌制過程中微生物群落多樣性進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)腌制初期主要優(yōu)勢菌群為腸桿菌屬(Enterobacter)和歐文菌屬(Erwinia),發(fā)酵中后期主要優(yōu)勢菌群為植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)。謝國芳等[6]對貴州地區(qū)雪里蕻腌菜中的微生物進(jìn)行分離篩選,結(jié)果表明彎曲乳桿菌(Lactobacillus curvatus)、植物乳桿菌(Lactobacillus plantarum)和希臘魏斯氏菌(Weissella hellenica)為主要優(yōu)勢菌。因此,開展梅干菜和腌制雪菜微生物多樣性研究,對推動(dòng)傳統(tǒng)梅干菜和腌制雪菜的工業(yè)化生產(chǎn)具有重要意義。

        本文以寧波地區(qū)雪里蕻梅干菜和腌制雪菜為研究對象,采用Illumina Miseq高通量測序技術(shù)分析梅干菜半成品、成品及腌制雪菜成品中菌群結(jié)構(gòu)及多樣性,比較干法腌制和鹽水泡制發(fā)酵蔬菜產(chǎn)品微生物菌群多樣性差異,為傳統(tǒng)腌制蔬菜微生物資源的挖掘及其工業(yè)化應(yīng)用提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與儀器

        雪里蕻梅干菜半成品、梅干菜成品、腌制雪菜成品(圖1) 寧波市鄞州三豐可味食品有限公司提供;MagicPure Size Selection DNA Beads 北京Transgen(全式金)生物技術(shù)有限公司;Qubit3.0 DNA檢測試劑盒 美國Life公司;2×Taq Master Mix 南京Vazyme(諾唯贊)生物科技公司;E.Z.N.A.Soil DNA試劑盒

        圖 1 梅干菜、腌制雪菜產(chǎn)品圖Fig.1 Image of the pickled and dried mustard and the fermented potherb mustard

        美國OMEGA公司。

        AUY220電子分析天平 日本SHIMADZU(島津)公司;Pico-21型臺式離心機(jī) 美國Thermo Fisher公司;32866型Qubit 3.0熒光計(jì)、Q32866型Qubit T100TM Thermal 美國Invitrogen公司;pHS-3C型精密pH計(jì) 上海三信儀表廠;GL-88B型漩渦混合器 海門市其林貝爾儀器制造有限公司;Cyeler型PCR儀 美國BIO-RAD公司;DYY-6 C型電泳儀電源、DYCZ-21型電泳槽 北京市六一儀器廠;凝膠成像系統(tǒng) 美國UVP公司。

        1.2 實(shí)驗(yàn)方法

        1.2.1 樣品制作及取樣 梅干菜半成品:添加雪菜重量6%的食鹽,常溫下腌制2個(gè)月,經(jīng)清洗、挑選、切段后,烘干至水分含量15%~20%,2020年5月下旬取樣;梅干菜成品:梅干菜半成品裝壇密封,常溫發(fā)酵2個(gè)月,2020年7月下旬取樣;腌制雪菜成品:雪菜經(jīng)6%鹽水常溫泡制發(fā)酵2個(gè)月至色澤金黃,2020年5月下旬取樣。三組樣品分別采取隨機(jī)抽樣方法取樣1 kg備用,共采集三個(gè)平行樣品。

        1.2.2 樣品預(yù)處理 在無菌超凈操作臺上,將梅干菜半成品,梅干菜成品和腌制雪菜成品剪成碎渣,備用。

        1.2.3 DNA的提取 采用基因組DNA提取試劑盒提取梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品樣本微生物基因組DNA,并用瓊脂糖凝膠電泳檢測。

        1.2.4 PCR擴(kuò)增及高通量測序 以提取的基因組DNA為模板,擴(kuò)增16S rDNA序列的V3~V4區(qū)域,并在梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品樣本的正向引物上連接含不同堿基的標(biāo)簽條碼序列以達(dá)到區(qū)分目的。采用PCR儀擴(kuò)增后用2%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。隨后進(jìn)行Illumina Miseq高通量測序。

        1.2.5 高通量測序結(jié)果分析 梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品樣本通過Illumina Miseq高通量測序處理后得到雙端序列,本實(shí)驗(yàn)根據(jù)連接不同堿基的標(biāo)簽,找到對應(yīng)引物之間的接口,取出接頭序列。根據(jù)PE reads(讀?。┲g的overlap(覆蓋)關(guān)系進(jìn)行拼接,再依據(jù)barcode(條碼)序列和引物序列進(jìn)行區(qū)分和比較得到有效序列。最后,根據(jù)序列質(zhì)量(reads質(zhì)量和merge效果)進(jìn)行質(zhì)量控制和篩選,過濾復(fù)雜且難處理的短序列,去除末端質(zhì)量值20以下的序列,得到各個(gè)樣本的有效序列。

        在16S rDNA高通量測序過程中,97%的相似性進(jìn)行OTU(操作分類單元)聚類分析和物種分類學(xué)分析。根據(jù)OTU聚類分析的結(jié)果,研究各個(gè)樣品微生物的菌群多樣性。通過Alpha多樣性來分析不同樣品的菌群多樣性和豐富度,并運(yùn)用Ace、Chao1、Shannon、Simpson以及Coverage指數(shù)來進(jìn)行評估。其中ACE、Chao1指數(shù)用于菌群豐度的評估,而Shannon、Simpson指數(shù)則是對菌群多樣性進(jìn)行評估[14]。Coverage指數(shù)是測序深度指標(biāo),表示每個(gè)樣本文庫的覆蓋率。根據(jù)分類學(xué)信息,在各個(gè)水平上統(tǒng)計(jì)群落結(jié)構(gòu)并討論梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品微生物群落特征。

        1.3 數(shù)據(jù)處理

        利用軟件Usearch 5.2.236進(jìn)行OTU分析,Mothur 1.30.1進(jìn)行Alpha多樣性指數(shù)和稀疏性曲線分析,R 3.2作OTU分布韋恩圖和稀疏性曲線圖,采用Excel 2016作細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分布圖。

        圖 2 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物電泳圖Fig.2 Electrophoretogram of polymerase chain reaction products

        2 結(jié)果與分析

        2.1 PCR擴(kuò)增結(jié)果

        細(xì)菌的16S rDNA具有分子大小適中、突變率低等特點(diǎn),另外因其具有物種特異性,常被用作分子標(biāo)簽來鑒定細(xì)菌種類[15]。將提取的微生物基因組DNA作為模板,16S rDNA V3~V4區(qū)序列擴(kuò)增出電泳圖見圖2,條帶清晰,滿足后續(xù)測序?qū)嶒?yàn)的要求。

        2.2 測序序列與OTU數(shù)量分析

        采用Illumina Miseq高通量測序方法對梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品等不同樣本進(jìn)行測序,獲得總數(shù)為236906條有效序列的樣本原始序列,經(jīng)過質(zhì)控篩選及軟件優(yōu)化后,三組樣本的有效序列為192412條,有效序列數(shù)目可滿足后續(xù)實(shí)驗(yàn)的需求。進(jìn)而對樣本序列進(jìn)行聚類分析,在97%相似水平下的OTU生物信息統(tǒng)計(jì)發(fā)現(xiàn),各處理組得到的OTU數(shù)量范圍為1315~3021(表1)。

        OTU樣本分布韋恩圖可以直觀地看出梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品樣本的OTU數(shù)目組成相似性及重疊(圖3)。梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜含有的OTU分別為2415、3021和1315個(gè),由此可見在同一擴(kuò)增區(qū)域下,梅干菜成品樣本OTU數(shù)量多于梅干菜半成品和腌制雪菜成品樣本,說明梅干菜成品樣本中含有豐富的微生物,而腌制雪菜成品樣本中的微生物多樣性較少。

        2.3 Alpha多樣性分析

        通過Alpha多樣性分析可以反映微生物群落的豐度和多樣性。Coverage指數(shù)代表每個(gè)樣品的文庫覆蓋率,覆蓋率達(dá)到95%以上就表明文庫覆蓋率高,未測出概率低,樣本序列科學(xué)合理,表明測序結(jié)果代表樣本中微生物的真實(shí)情況[16]。由表2可知,梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品的Coverage指數(shù)均在0.97及以上,說明測序?qū)颖局形⑸锏母采w率高,測序結(jié)果合理,可滿足樣本微生物菌群結(jié)構(gòu)和多樣性分析的需要[17]。同時(shí),Shannon-Wiener曲線變化趨勢也逐漸平緩(圖4),說明梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品測序數(shù)據(jù)量合理,能夠反映樣本中絕大多數(shù)的菌群信息。上述現(xiàn)象表明,隨著測序量增加,Shannon指數(shù)變化趨于平緩,三組樣本中菌群多樣性不會(huì)發(fā)生明顯變化,微生物分析結(jié)果充分。總體來看梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品的曲線縱坐標(biāo)寬度,發(fā)現(xiàn)梅干菜成品中微生物物種組成最豐富,其次是梅干菜半成品,三組樣本中腌制雪菜成品微生物物種組成數(shù)量最低。

        圖 3 OTU樣本分布韋恩圖Fig.3 Venn diagram for the operational taxonomic unit distribution of different samples

        圖 4 不同樣本Shannon-Wiener曲線分析Fig.4 Shannon-Wiener curves of different sample

        圖 5 Genus水平所有樣本群落結(jié)構(gòu)分布圖Fig.5 Distribution map of the community structure of all samples at genus level

        表 1 各樣本有效序列與OTU數(shù)量Table 1 Valid sequence and OTU numbers of different samples

        表 2 不同樣本Alpha多樣性指數(shù)Table 2 Alpha diversity index of different sample

        ACE和Chao1指數(shù)是樣本菌群豐度的表征,數(shù)值越高表明菌群豐富度越高[14]。由表2可知,梅干菜成品樣本的ACE和Chao1指數(shù)最高,其次是梅干菜半成品樣本,腌制雪菜成品樣本的ACE和Chao1指數(shù)最低,表明三組樣本中梅干菜成品的菌群豐度最高,其次是梅干菜半成品,而腌制雪菜成品的菌群豐度最低。

        Shannon和Simpson指數(shù)與樣本中菌群多樣性相關(guān),其中Shannon指數(shù)與菌群多樣性呈正相關(guān),而Simpson指數(shù)與菌群多樣性呈負(fù)相關(guān)[14]。由表2可知,梅干菜成品與梅干菜半成品樣本的Shannon指數(shù)高于腌制雪菜成品,而Simpson指數(shù)則是相反的結(jié)果,表明梅干菜成品和半成品樣本中物種多樣性較豐富,其中梅干菜成品菌群多樣性稍大于梅干菜半成品,而腌制雪菜成品樣本中物種多樣性較低。

        表 3 各樣品菌群在屬水平上的相對豐度(%)Table 3 Relative abundance of bacterial flora at the genus level in different sample (%)

        2.4 菌群多樣性分析

        對OTU序列進(jìn)行分類學(xué)分析,獲得梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品樣本在genus分類水平上的菌群組成統(tǒng)計(jì)(表3和圖5)。由表3可知,梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品菌群中相對豐度大于1%的菌屬分別有8、13、5屬。梅干菜半成品的主要優(yōu)勢菌屬是乳桿菌屬(Lactobacillus)、嗜鹽單胞菌屬(Halomonas)、梭狀芽孢桿菌屬(ClostridiumIV)、假交替單胞菌(Pseudoalteromonas)、弓形桿菌屬(Arcobacter)、產(chǎn)堿桿菌屬(Alkaliflexus)、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)和嗜冷桿菌屬(Psychrobacter);梅干菜成品的主要優(yōu)勢菌屬是慢生芽孢桿菌屬(Lentibacillus)、交替芽胞桿菌屬(Alteribacillus)、嗜鹽球菌屬(Halococcus)、乳桿菌屬(Lactobacillus)、海單胞菌屬(Oceanimonas)、枝芽孢菌屬(Virgibacillus)、叢毛單胞菌屬(Comamonas)、鈉白菌屬(Natrialba)、代爾夫特菌屬(Delftia)、薄壁芽孢桿菌屬(Gracilibacillus)、硫酸鹽還原菌(Garciella)、明串珠菌屬(Leuconostoc)和節(jié)桿菌屬(Arthrobacter);腌制雪菜成品的主要優(yōu)勢菌屬是乳桿菌屬(Lactobacillus)、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、假交替單胞菌(Pseudoalteromonas)、伯克霍爾德菌(Burkholderia)和甲基桿菌屬(Methylobacterium)。

        梅干菜半成品中未鑒定菌屬相對豐度較高,這可能歸因于梅干菜原料較高的菌群多樣性。與梅干菜半成品相比,梅干菜成品中表現(xiàn)出部分菌群增長的趨勢,菌群的豐度和多樣性均提高,表明成品中的各菌屬可能是梅干菜風(fēng)味形成的主要原因。腌制雪菜樣本菌群多樣性較低,主要優(yōu)勢菌屬為乳桿菌屬(Lactobacillus),占菌群總數(shù)的78.08%,表明乳桿菌屬(Lactobacillus)對腌制雪菜的風(fēng)味和品質(zhì)有重要影響。腌制雪菜的制作工藝為泡制,乳酸菌發(fā)酵產(chǎn)生乳酸,可能抑制不耐酸微生物的生長繁殖;且發(fā)酵環(huán)境適合兼性厭氧菌生長,而抑制了好氧菌的生長。

        3 討論

        已有研究表明,乳桿菌屬(Lactobacillus)在大多數(shù)傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜產(chǎn)品中為絕對優(yōu)勢菌屬[18?19]。康建依等[20]研究發(fā)現(xiàn)乳桿菌屬(Lactobacillus)為發(fā)酵蔬菜中后期的主要優(yōu)勢菌屬,發(fā)酵7 d時(shí)所占比例達(dá)93.5%。尚雪嬌等[12]研究表明,乳桿菌屬(Lactobacillus)在梅干菜中占據(jù)主要作用,相對豐度為60.5%。陳希等[13]對雪菜低鹽腌制過程中微生物群落多樣性進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)乳桿菌屬(Lactobacillus)相對豐度隨腌制時(shí)間延長逐漸上升,腌制18 d時(shí)達(dá)到最大值77.5%。鮑偉等[21]研究發(fā)現(xiàn)乳桿菌屬(Lactobacillus)在臭冬瓜、臭莧菜梗和酸筍等3種浙江傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜中相對豐度分別為17.88%、8.17%、6.58%,但在酸茭白中相對豐度較低。此外,郭倩倩等[22]分析了晴隆酸菜不同發(fā)酵時(shí)期的微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性,結(jié)果表明魏斯氏菌屬(Weissella)、乳桿菌屬(Lactobacillus)和明串珠菌屬(Leuconostoc)等為主要優(yōu)勢菌屬。本實(shí)驗(yàn)中,乳桿菌屬(Lactobacillus)在梅干菜半成品、梅干菜成品及腌制雪菜成品中相對豐度均較高,分別為31.70%、9.51%、78.08%,同時(shí)梅干菜半成品中檢出片球菌屬(Pediococcus),梅干菜成品中檢出明串珠菌屬(Leuconostoc)和魏斯氏菌屬(Weissella),與前人研究結(jié)果相似。

        梅干菜半成品鑒定到的其他菌屬中,嗜鹽單胞菌屬(Halomonas)可發(fā)酵葡萄糖產(chǎn)酸,并具備還原硝酸鹽為亞硝酸鹽的能力[23],這可能與梅干菜腌制早期亞硝酸鹽含量快速上升有關(guān);梭狀芽孢桿菌屬(ClostridiumIV)、弓形桿菌屬(Arcobacter)、棒狀桿菌屬(Corynebacterium)、伯克霍爾德菌屬(Burkholderia)和弧菌屬(Vibrio)的部分種具有致病性[24],產(chǎn)堿桿菌屬(Alkaliflexus)和不動(dòng)桿菌屬(Acinetobacter)為條件致病菌[25],嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)等為常見的腐敗菌[26],這些微生物很可能來源于原料種植基地和腌制環(huán)境,但在梅干菜成品中相對豐度極低甚至未檢出,表明后發(fā)酵對梅干菜的菌群結(jié)構(gòu)有顯著影響,有利于提高梅干菜的食用安全性。梅干菜成品鑒定到的其他菌屬中,慢生芽孢桿菌屬(Lentibacillus)、交替芽胞桿菌屬(Alteribacillus)、嗜鹽球菌屬(Halococcus)、海單胞菌屬(Oceanimonas)、枝芽孢菌屬(Virgibacillus)、薄壁芽孢桿菌屬(Gracilibacillus)、鹽芽孢桿菌屬(Halobacillus)和色鹽桿菌屬(Chromohalobacter)為嗜鹽菌[27],總相對豐度達(dá)54.98%,表明嗜鹽菌為梅干菜后發(fā)酵階段的絕對優(yōu)勢微生物,其共生和協(xié)同作用可能對梅干菜風(fēng)味的形成有重要貢獻(xiàn)。硫酸鹽還原菌屬(Garciella)能通過異化作用進(jìn)行硫酸鹽還原,在二價(jià)鐵鹽的存在下可生成黑色物質(zhì)[28],色鹽桿菌屬(Chromohalobacter)在固體培養(yǎng)基上可形成奶酪狀的紫色菌落[29],鹽芽孢桿菌屬(Halobacillus)能產(chǎn)橙色非水溶性色素[30],這可能是梅干菜在發(fā)酵后期呈現(xiàn)黃黑色的重要原因。此外,叢毛單胞菌屬(Comamonas)、鈉白菌屬(Natrialba)、代爾夫特菌屬(Delftia)和節(jié)桿菌屬(Arthrobacter)相對豐度均在1%以上,但目前關(guān)于上述微生物的生理生化特性研究報(bào)道較少,有待進(jìn)一步研究。腌制雪菜成品鑒定到的其他菌屬中,鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、產(chǎn)吲哚金黃桿菌屬(Chryseobacterium)、黃單胞菌屬(Xanthomonas)和黃桿菌屬(Flavobacterium)均可產(chǎn)生黃色色素物質(zhì)[31],甲基桿菌屬(Methylobacterium)可在液體培養(yǎng)基中形成粉色表面菌環(huán)或菌膜[31],這可能與腌制雪菜呈現(xiàn)金黃色感官品質(zhì)有關(guān)。

        不同腌制方式、腌制階段和不同地區(qū)的發(fā)酵蔬菜產(chǎn)品優(yōu)勢微生物菌屬也有較大差異。尚雪嬌等[12]對恩施地區(qū)梅干菜細(xì)菌多樣性進(jìn)行了研究,發(fā)現(xiàn)其主要優(yōu)勢菌屬為乳桿菌屬(Lactobacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)、葡萄球菌屬(Staphylococcus)、魏斯氏菌屬(Weissella)、鞘脂單胞菌屬(Sphingomonas)、嗜冷桿菌屬(Psychrobacter)、四聯(lián)球菌屬(Tetragenococcus)和棒狀桿菌屬(Corynebacterium)。陳希等[13]研究了寧波地區(qū)雪菜低鹽腌制過程中微生物群落多樣性,結(jié)果表明腌制初期主要優(yōu)勢菌群為腸桿菌屬(Enterobacter)和歐文氏菌屬(Erwinia),發(fā)酵中后期為乳桿菌屬(Lactobacillus plantarum)。谷懿寰等[19]分析了海南7個(gè)地區(qū)的30份不同種類傳統(tǒng)發(fā)酵竹筍、小西瓜、白菜和豆角樣品中微生物多樣性,發(fā)現(xiàn)乳桿菌屬(Lactobacillus)、腸球菌屬(Enterococcus)和片球菌屬(Pediococcus claussen)為主要優(yōu)勢菌屬。本實(shí)驗(yàn)中,梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品中相對豐度大于1%的菌屬分別為8、13、5屬,其中梅干菜成品中菌群結(jié)構(gòu)較復(fù)雜,菌群多樣性和相對豐度均較高,這與前人在傳統(tǒng)腌制發(fā)酵蔬菜中鑒定到的微生物菌屬差異較大。以上結(jié)果表明,不同地區(qū)和環(huán)境條件可能對傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜產(chǎn)品的微生物多樣性有較大影響。干法腌制比鹽水泡制發(fā)酵蔬菜產(chǎn)品的微生物多樣性要高,這可能與鹽水泡制不利于好氧菌的生長,同時(shí)乳桿菌屬發(fā)酵產(chǎn)酸后對其他菌屬有抑制作用有關(guān)。

        4 結(jié)論

        Illumina Miseq高通量測序分析結(jié)果顯示,梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品特有的OTU分別為2415、3021和1315個(gè),表明干法腌制比鹽水泡制蔬菜產(chǎn)品的菌群結(jié)構(gòu)和多樣性更復(fù)雜。

        梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品菌群中相對豐度大于1%的菌屬分別有8、13、5屬,各種菌屬可能對傳統(tǒng)腌制蔬菜風(fēng)味的形成發(fā)揮協(xié)同作用。

        乳桿菌屬(Lactobacillus)在梅干菜半成品、梅干菜成品和腌制雪菜成品3種產(chǎn)品中相對豐度均較高,分別為31.70%、9.51%、78.08%,是傳統(tǒng)發(fā)酵蔬菜的主要優(yōu)勢菌屬。嗜鹽菌在梅干菜成品中相對豐度達(dá)54.98%,為梅干菜后發(fā)酵階段的絕對優(yōu)勢微生物。硫酸鹽還原菌屬(Garciella)、色鹽桿菌屬(Chromohalobacter)和鹽芽孢桿菌屬(Halobacillus)可能與梅干菜色澤形成有關(guān)。鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、甲基桿菌屬(Methylobacterium)、產(chǎn)吲哚金黃桿菌屬(Chryseobacterium)、黃單胞菌屬(Xanthomonas)和黃桿菌屬(Flavobacterium)可能在腌制雪菜色澤形成過程中發(fā)揮重要作用。

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