趙云霞 顏秀娟 王學(xué)梅 楊冬艷 蘇慧
摘要:為研究番茄種質(zhì)資源的遺傳多樣性和親緣關(guān)系,科學(xué)評(píng)價(jià)種質(zhì),以246份番茄種質(zhì)資源為試驗(yàn)材料,對(duì)其25個(gè)質(zhì)量性狀和8個(gè)數(shù)量性狀進(jìn)行遺傳多樣性、相關(guān)性及主成分分析。結(jié)果表明:供試材料的表型性狀具有豐富的遺傳多樣性,質(zhì)量性狀中葉片著生狀態(tài)的多樣性指數(shù)最高的是2.46;單果質(zhì)量的變異系數(shù)最大,為57.86%,8個(gè)表型性狀的F值都達(dá)到了極顯著的水平,各性狀間存在復(fù)雜的相互關(guān)系;主成分分析中提取的9 個(gè)主成分累計(jì)貢獻(xiàn)率為66.18%,包含了全部指標(biāo)的大部分信息?;诒硇托誀?,采用系統(tǒng)聚類(lèi)組間聚合的方法在遺傳距離為10 處將供試的246份資源主要以單果質(zhì)量劃分為4個(gè)組群。明確番茄表型變異的豐富程度及不同種質(zhì)間的遺傳關(guān)系,為番茄種質(zhì)資源的進(jìn)一步研究及番茄育種提供理論依據(jù)和工作基礎(chǔ)。
關(guān)鍵詞:番茄;種質(zhì)資源;表型性狀;遺傳多樣性
中圖分類(lèi)號(hào):S641.202.4?? 文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A
文章編號(hào):1002-1302(2021)17-0134-07
收稿日期:2020-12-29
基金項(xiàng)目:寧夏農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新專(zhuān)項(xiàng)(編號(hào):DWX-2018031);寧夏農(nóng)林科學(xué)院科技平臺(tái)提升項(xiàng)目(編號(hào):NKYP-19-12);國(guó)家大宗蔬菜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系建設(shè)專(zhuān)項(xiàng)(編號(hào):CARS-23-G24)。
作者簡(jiǎn)介:趙云霞(1983—),女,山東高唐人,碩士,助理研究員,從事蔬菜栽培及番茄育種研究。E-mail:yunxiazhao2011@163.com。
番茄又名西紅柿、洋柿子,是茄科番茄屬1年生或多年生草本植物,原產(chǎn)于南美洲。在南美西部安第斯山脈的狹長(zhǎng)地帶均有番茄野生種存在[1]。番茄是嚴(yán)格的自花授粉植物,經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的馴化和選育,番茄的遺傳背景逐漸變窄[2],因此廣泛收集資源來(lái)豐富番茄的種質(zhì)資源遺傳背景,這對(duì)其育種極為重要[3]。植物表型的變化反映了基因型對(duì)環(huán)境變化的適應(yīng)程度,植物表型在長(zhǎng)期的壓力選擇中發(fā)生不可逆的變化,經(jīng)穩(wěn)定遺傳后產(chǎn)生新的基因型。因此,表型變異往往在適應(yīng)和進(jìn)化上有重要意義[4]。目前有關(guān)番茄種質(zhì)資源遺傳多樣性的研究報(bào)道較多,孫亞?wèn)|等對(duì)番茄種質(zhì)資源材料進(jìn)行了遺傳多樣性和親緣關(guān)系的分析[5-12]。同時(shí),主成分分析[13-14]、聚類(lèi)分析[15-16]等統(tǒng)計(jì)方法的應(yīng)用為研究種質(zhì)資源奠定了基礎(chǔ)。
番茄品種改良的關(guān)鍵是種質(zhì)資源的有效利用,進(jìn)行番茄種質(zhì)資源遺傳多樣性和分類(lèi)的研究,對(duì)于鑒別特異種質(zhì)、確定核心親本、提高遺傳育種效率具有重要意義[17]。因此,本試驗(yàn)在前人研究的基礎(chǔ)上,針對(duì)收集到的246份番茄種質(zhì)資源材料的33個(gè)表型性狀進(jìn)行遺傳多樣性分析研究,利用主成分分析和聚類(lèi)分析方法從形態(tài)學(xué)水平上研究其遺傳多樣性,明確番茄表型變異的豐富程度及不同種質(zhì)間的遺傳關(guān)系,以期為番茄種質(zhì)資源的進(jìn)一步研究及番茄育種提供理論依據(jù)和工作基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 試驗(yàn)材料
供試材料為寧夏農(nóng)林科學(xué)院園藝研究所蔬菜課題組于2018—2020年收集的246份材料,如表1所示。
1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)
試驗(yàn)在寧夏農(nóng)林科學(xué)院現(xiàn)代農(nóng)業(yè)綜合試驗(yàn)示范基地蔬菜種質(zhì)資源圃進(jìn)行。采用完全隨機(jī)區(qū)組排列的方式將引進(jìn)的番茄種質(zhì)材料,于每年4月育苗,5月定植,畦寬70 cm,畦溝寬95 cm,畦高 25 cm,株距35 cm,雙行定植,每個(gè)資源定植30株,統(tǒng)一進(jìn)行日常田間管理。
1.3 表型性狀的調(diào)查
番茄生長(zhǎng)發(fā)育時(shí)期主要以第1穗果白熟期、第2穗果成熟期和第3穗果成熟期為主,每個(gè)種質(zhì)資源隨機(jī)調(diào)查10株,共調(diào)查33個(gè)形態(tài)指標(biāo)。其中,縱徑、橫徑、果梗洼大小、果洼處木栓化大小、果肉厚度均采用游標(biāo)卡尺測(cè)量,可溶性固形物含量采用 TD-45 糖度計(jì)測(cè)量,單果質(zhì)量采用稱(chēng)質(zhì)量法測(cè)量。質(zhì)量性狀采用直接觀察法,分別調(diào)查生長(zhǎng)習(xí)性、株型、花序類(lèi)型、花柱長(zhǎng)度、花柱形狀、花柱茸毛、花色、莖葉茸毛、葉片類(lèi)型、葉片形狀、葉片著生狀態(tài)、葉色、葉裂刻、成熟前果色、成熟果色、果面棱溝、果面茸毛、果頂形狀、果肩、果肩形狀、果形、果實(shí)橫切面形狀、果肉色、胎座膠狀物質(zhì)顏色、果皮色25個(gè)指標(biāo)。具體觀測(cè)標(biāo)準(zhǔn)參照文獻(xiàn)[18]。
1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和分析
應(yīng)用 Excel 2007 進(jìn)行數(shù)據(jù)的整理分析與相關(guān)計(jì)算。應(yīng)用SPSS 20.0計(jì)算各質(zhì)量性狀的分布頻率及遺傳多樣性指數(shù)(H′),各數(shù)量性狀的最小值、最大值、平均值、標(biāo)準(zhǔn)差、變異系數(shù)。
分布頻率Pij=nij/n。式中:Pij表示第i個(gè)性狀第j個(gè)變異的分布頻率;nij表示第i個(gè)性狀處于第j個(gè)變異的材料數(shù)量,個(gè);n表示材料的總數(shù),個(gè)。
變異系數(shù)(coefeicient of variation,CV)=σ/μ(σ表示標(biāo)準(zhǔn)差;μ表示平均值),表示某一性狀的離散程度。
遺傳多樣性指數(shù)。利用數(shù)據(jù)的平均值和標(biāo)準(zhǔn)差進(jìn)行 10 個(gè)等級(jí)的劃分,每 0.5σ為1級(jí)。香農(nóng)-威納(Shannon-Wiener) 多樣性指數(shù)(H′)=-∑ni=1[Pi(ln Pi)](i=1,2,3,…)。其中:Pi是某性狀第i個(gè)級(jí)別的材料數(shù)占總材料數(shù)的比例。
用SPSS 20.0進(jìn)行相關(guān)性分析和主成分分析,同時(shí)基于246份番茄種質(zhì)資源的28個(gè)表型性狀,利用組間聚合的方法進(jìn)行系統(tǒng)聚類(lèi),采用歐式距離繪制樹(shù)狀圖。
2 結(jié)果與分析
2.1 番茄種質(zhì)資源表型性狀的遺傳多樣性分析
2.1.1 質(zhì)量性狀的遺傳多樣性 對(duì)供試的246份番茄種質(zhì)資源材料的25個(gè)主要質(zhì)量性狀進(jìn)行描述性統(tǒng)計(jì)分析(表2),共檢測(cè)到92個(gè)變異類(lèi)型,各個(gè)性狀變異類(lèi)型頻率分布各不相同。
注:生長(zhǎng)習(xí)性:1代表無(wú)限生長(zhǎng)、2代表有限生長(zhǎng);株型:1代表蔓生、2代表半蔓生;花序類(lèi)型:1代表單花、2代表單式花序、3代表雙歧花序、4代表多歧花序;花柱長(zhǎng)度:1代表短于雄蕊、2代表與雄蕊近等長(zhǎng)、3代表長(zhǎng)于雄蕊;花柱形狀:1代表單圓花柱、2代表扁生花柱;花柱茸毛:1代表有、2代表無(wú);花色:1代表淺黃、2代表黃;莖葉茸毛:1代表短稀、2代表短密、3代表長(zhǎng)稀、4代表長(zhǎng)密;葉片類(lèi)型:1代表普通葉型、2代表薯葉型、3代表復(fù)寬葉型、4代表復(fù)細(xì)葉型;葉片形狀:1代表羽狀復(fù)葉、2代表二回羽狀復(fù)葉;葉片著生狀態(tài):1代表直立、2代表水平、3代表下垂;葉色:2代表淺綠、3代表綠、4代表深綠;葉裂刻:1代表淺、2代表中、3代表深、4代表無(wú);成熟前果色:1代表綠白、2代表淺綠、3代表綠、4代表深綠;成熟果色:1代表黃白、2代表淺黃、3代表黃、4代表橘黃、5代表綠、6代表粉紅、7代表紅、8代表深紅、9代表花色、10代表咖啡色;果面棱溝:1代表輕、2代表無(wú);果面茸毛:1代表稀、2代表中,3代表無(wú);果頂形狀:1代表深凹、2代表微凹、3代表圓平、4代表微凸、5代表凸尖;果肩:1代表無(wú)、2代表有;果肩形狀:1代表平、2代表微凹、3代表深凹;果形:1代表扁平、2代表扁圓、3代表圓形、4代表高圓、5代表長(zhǎng)圓、6代表卵圓、7代表桃形、8代表長(zhǎng)梨形;果實(shí)橫切面形狀:1代表圓形、2代表等邊多規(guī)則;果肉色:1代表黃白、2代表淺黃、3代表黃、4代表粉紅、5代表紅、6代表綠、7代表咖啡色、8代表花色;胎座膠狀物質(zhì)顏色:1代表黃白、2代表黃、3代表黃綠、4代表綠、5代表粉紅;果皮色:1代表無(wú)色、2代表黃色、3代表紅色。
H′為0.03~2.46,其中H′超過(guò)1.0的番茄質(zhì)量性狀為葉片著生狀態(tài)、葉裂刻、成熟前果色、成熟果色、果形、果肉色、胎座膠狀物質(zhì)顏色。葉片著生狀態(tài)的H′最高,達(dá)到2.46,其中以下垂為主,分布頻率達(dá)到57.32%;其次是胎座膠狀物質(zhì)顏色,其H′為1.19,以黃白和黃綠為主,分布頻率分別為45.53%和37.81%;成熟果色的H′為1.16,以粉紅色和紅色為主,分布頻率分別為48.78%和39.43%;果肉色的H′為1.12,其中粉紅色和紅色的分布頻率達(dá)到了48.78%和39.84%;成熟前果色的H′為1.12,以綠色為主,分布頻率55.69%;葉裂刻為中的分布頻率達(dá)到 45.12%,果形為圓形的分布頻率達(dá)到67.89%,生長(zhǎng)習(xí)性以無(wú)限生長(zhǎng)為主,分布頻率94.72%;株型以半蔓生為主,分布頻率91.87%;花序類(lèi)型以單式花序?yàn)橹?,分布頻率84.55%;花柱長(zhǎng)度以短于雄蕊為主,分布頻率85.37%;花柱形狀以單花柱為主,分布頻率80.89%;以有花柱茸毛為主,分布頻率97.56%;花色以黃色為主,分布頻率97.56%;莖葉茸毛以長(zhǎng)密為主,分布頻率65.04%;葉片類(lèi)型以復(fù)寬葉型為主,分布頻率50.41%;葉片形狀以二回羽狀復(fù)葉為主,分布頻率97.96%;葉色以深綠為主,分布頻率60.16%;果面棱溝以輕為主,分布頻率78.05%;果面茸毛以無(wú)為主,分布頻率62.60%;果頂形狀以圓平為主,分布頻率77.24%;果肩以無(wú)為主,分布頻率90.24%;果肩形狀以平為主,分布頻率95.10%;果實(shí)橫切面形狀以圓形為主,分布頻率99.59%;果皮色以無(wú)色為主,分布頻率53.66%。
2.1.2 不同數(shù)量性狀的表型變異分析 對(duì)供試的246份番茄種質(zhì)資源材料的8個(gè)主要數(shù)量性狀進(jìn)行描述性統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果見(jiàn)表3。單果質(zhì)量的變異系數(shù)最高,為57.86%,其次是心室數(shù)、果洼處木栓化大小和果梗洼大小,分別為46.30%、41.89%和41.84%,可溶性固形物含量的變異系數(shù)較小,為 18.68%,說(shuō)明這個(gè)性狀的變異程度較小。8個(gè)表型性狀的F值都達(dá)到了極顯著水平,說(shuō)明這246份番茄種質(zhì)資源材料各表型性狀間都存在著非常大的遺傳差異。
2.2 不同數(shù)量性狀表型性狀間的相關(guān)性分析
性狀的相關(guān)性可以通過(guò)對(duì)一種性狀的選擇間接達(dá)到選擇另一種性狀的效果,從而提高選擇效率,加快育種的進(jìn)程[19]。由表4可知,不同表型性狀間均存在極顯著的相關(guān)關(guān)系。單果質(zhì)量與縱經(jīng)、橫徑、果梗洼大小、心室數(shù)、果肉厚度、果洼處木栓化大小極顯著正相關(guān),與可溶性固形物含量呈極顯著負(fù)相關(guān);縱徑與橫徑、果梗洼大小、果肉厚度、心室數(shù)、果洼處木栓化大小呈極顯著正相關(guān),與可溶性固形物含量呈極顯著負(fù)相關(guān);橫徑與果梗洼大小、果肉厚度、心室數(shù)、果洼處木栓化大小呈極顯著正相關(guān),與可溶性固形物含量呈極顯著負(fù)相關(guān);果梗洼大小與心室數(shù)、果肉厚度、果洼處木栓化大小呈極顯著正相關(guān),與可溶性固形物含量呈極顯著負(fù)相關(guān);果洼處木栓化大小與果肉厚度、心室數(shù)呈極顯著正相關(guān),與可溶性固形物含量呈極顯著負(fù)相關(guān);果肉厚度與心室數(shù)呈極顯著正相關(guān),與可溶性固形物含量呈極顯著負(fù)相關(guān); 心室數(shù)與可溶性固形物含量呈極顯著負(fù)相關(guān)。在極顯著正相關(guān)關(guān)系中,單果質(zhì)量與橫徑的遺傳相關(guān)系數(shù)最大,為0.948;果肉厚度與心室數(shù)的相關(guān)系數(shù)最小,為0.328。在極顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系中,橫徑與可溶性固形物含量的相關(guān)系數(shù)最大,為 0.601;心室數(shù)與可溶性固形物含量的遺傳相關(guān)性最小,相關(guān)系數(shù)為0.268。
2.3 番茄種質(zhì)資源表型性狀的主成分分析
為了能夠更加充分地反映番茄種質(zhì)資源各性狀間起主導(dǎo)作用的綜合指標(biāo),對(duì)番茄種質(zhì)資源調(diào)查的33個(gè)表型性狀進(jìn)行主成分分析,其結(jié)果(表5)顯示,9個(gè)主成分的特征值都在1.0以上,提取的前9個(gè)主成分累積貢獻(xiàn)率達(dá)到66.18%,基本能夠反映全部指標(biāo)的大部分信息。
主成分1特征值最大,為7.85,貢獻(xiàn)率為23.80%。載荷值絕對(duì)值較高的農(nóng)藝性狀有橫徑、單果質(zhì)量、果洼處木栓化大小、果梗洼大小、果肉厚度、縱徑和果面棱溝,其載荷值分別為0.97、0.93、0.90、0.89、0.85、0.81和0.78,這些性狀主要反映果實(shí)外觀性狀。
主成分2特征值為2.70,貢獻(xiàn)率為8.19%,載荷較高且為正的農(nóng)藝性狀有花色、成熟果色、果肉色、葉色、果皮色,載荷值分別為0.73、0.55、0.53、0.44、0.42,這些性狀主要與果實(shí)顏色有關(guān)。
主成分3載荷值正向較高的性狀有果肉色、成熟果色,特征向量分別為0.72、0.65,這些性狀主要與果實(shí)顏色有關(guān)。
主成分4中載荷值正向較高的性狀為果肩性狀和果肩,載荷值分別為0.59、0.58,說(shuō)明這一主成分主要與果實(shí)外觀有關(guān)。
主成分5累計(jì)貢獻(xiàn)率為50.16%,載荷值較高為正的性狀是葉片形態(tài)和葉片類(lèi)型,主要與葉片性狀有關(guān)。
主成分6中載荷值正向最大的性狀為株型,主要反映植株的性狀。
主成分7累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到 58.76%,葉片著生狀態(tài)的載荷值最大,主要反映葉片的性狀。
2.5 番茄種質(zhì)資源表型性狀的聚類(lèi)分析
以246份番茄種質(zhì)資源對(duì)的8個(gè)數(shù)量性狀和25個(gè)質(zhì)量性狀的均值為基礎(chǔ)數(shù)據(jù),利用組間聚合的方法對(duì)246份番茄種質(zhì)資源進(jìn)行聚類(lèi),采用歐式距離繪制樹(shù)狀圖,結(jié)果見(jiàn)圖1。按歐式距離10為閾值,可以將246份番茄種質(zhì)材料分為4類(lèi),第1類(lèi)175份,主要以中等番茄為主,單果質(zhì)量200 g左右;第2類(lèi)49份,以小果番茄為主,單果質(zhì)量小于40 g;第3類(lèi)8份,以中果番茄為主,單果質(zhì)量大于40且小于100 g;第4類(lèi)4份,分別是14、101、237、21號(hào),以特大果番茄為主,單果質(zhì)量大于350 g。
3 結(jié)論與討論
本研究通過(guò)對(duì)246份番茄種質(zhì)資源的表型性狀進(jìn)行遺傳多樣性分析,在質(zhì)量性狀上,各個(gè)性狀變異類(lèi)型頻率分布各不相同。Shannon-Wiener 多樣性指數(shù)(H′)變化范圍0.03~2.46,H′超過(guò)1.0的番茄質(zhì)量性狀為葉片著生狀態(tài)、葉裂刻、成熟前果色、成熟果色、果形、果肉色、胎座膠狀物質(zhì)顏色,葉片著生狀態(tài)的H′最高,達(dá)到2.46;通過(guò)對(duì)不同數(shù)量性狀的表型變異分析,單果質(zhì)量的變異系數(shù)最高,為57.86%,8個(gè)數(shù)量性狀的F值都達(dá)到了極顯著的水平,說(shuō)明這246份番茄種質(zhì)資源材料各表型性狀間都存在著非常大的遺傳差異。對(duì)246份番茄種質(zhì)資源的8個(gè)數(shù)量性狀進(jìn)行遺傳相關(guān)分析可知,所有表型性狀間存在極顯著相關(guān)關(guān)系。在極顯著正相關(guān)中,單果質(zhì)量與橫徑相關(guān)系數(shù)最大,為0.948;在極顯著負(fù)相關(guān)中,單果質(zhì)量與可溶性固形物含量的相關(guān)系數(shù)最大,表明各性狀間存在復(fù)雜的相互關(guān)系;主成分分析中9 個(gè)主成分的累計(jì)貢獻(xiàn)率為66.18%,包含了全部指標(biāo)的大部分信息。聚類(lèi)結(jié)果顯示,以歐式距離10為閾值,可將246份番茄資源分成四大類(lèi),主要以單果質(zhì)量劃分。聚在同一類(lèi)的材料表明其親緣關(guān)系較近,有可能來(lái)自同一個(gè)祖先,不同類(lèi)別間種質(zhì)資源的親緣關(guān)系較遠(yuǎn),遺傳差異較大,多樣性豐富,可豐富和拓寬番茄種質(zhì)資源的遺傳多樣性,為番茄育種提供良好的資源材料。
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