謝良志
(1 北京市蛋白和抗體研發(fā)及制備工程技術(shù)研究中心,北京神州細(xì)胞生物技術(shù)集團(tuán)股份公司,北京 100176;2 單克隆抗體上游研發(fā)技術(shù)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京義翹神州科技股份有限公司,北京 100176)
生物技術(shù)自20 世紀(jì)70 年代開(kāi)始萌芽,經(jīng)歷了從采用微生物(如大腸桿菌)表達(dá)生產(chǎn)分子量較小、且無(wú)需翻譯后修飾的蛋白質(zhì)藥物(如生長(zhǎng)因子、白介素2 等),到采用真核細(xì)胞表達(dá)生產(chǎn)分子量大、具有糖基化等翻譯后修飾、結(jié)構(gòu)復(fù)雜的蛋白質(zhì)藥物(如重組八因子蛋白、單克隆抗體藥物等)的發(fā)展和進(jìn)步歷程。工程技術(shù)化一直是推動(dòng)和制約生物藥產(chǎn)業(yè)化發(fā)展的關(guān)鍵。大規(guī)模中國(guó)倉(cāng)鼠卵巢細(xì)胞(CHO 細(xì)胞)培養(yǎng)已經(jīng)成為生物制藥行業(yè)最廣泛使用的生產(chǎn)工藝技術(shù)。然而,在生物藥發(fā)展的早期階段,采用對(duì)剪切力敏感、需要添加動(dòng)物血清而且需要貼壁才能生長(zhǎng)的哺乳動(dòng)物細(xì)胞來(lái)實(shí)現(xiàn)年產(chǎn)量成噸級(jí)抗體藥物規(guī)?;I(yè)生產(chǎn)是不敢想象的。
王義翹教授以其敏銳的前瞻性和戰(zhàn)略性眼光,敢于挑戰(zhàn)科學(xué)和工程領(lǐng)域最尖端的技術(shù),自20 世紀(jì)60 年代率先進(jìn)入微生物發(fā)酵和動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)等工程技術(shù)領(lǐng)域,他的研究除本文重點(diǎn)介紹的研究方向外,還涉及生物反應(yīng)器的自動(dòng)化在線監(jiān)測(cè)和控制、蛋白質(zhì)復(fù)性技術(shù)、分離純化技術(shù)等,系統(tǒng)全面地涵蓋了生物藥產(chǎn)業(yè)化各個(gè)方面的關(guān)鍵技術(shù),為當(dāng)代生物藥大規(guī)模工業(yè)化生產(chǎn)奠定了堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),做出了開(kāi)創(chuàng)性的杰出貢獻(xiàn),被譽(yù)為“生物化工領(lǐng)域奠基人”(the founding fathers of the field of biochemical engineering)[1],“生物化工的驅(qū)動(dòng)力”(the driving force in biochemical engineering)[2];“過(guò)去40 年生物技術(shù)工業(yè)有影響力的領(lǐng)導(dǎo)者”(influential leader of the biotechnology industry over the past four decades)[3],“生物化工領(lǐng)域的締造者和權(quán)威”(an architect of the field of biochemical engineering,a luminary in the field of biochemical engineering)[4],“生物化工之父”(father of biochemical engineer)[5],“生物技術(shù)之父”(father of biotechnology)[6]和“現(xiàn)代生物技術(shù)之父”(the father of modern biotechnology)[7]。
20 世紀(jì)80 年代,哺乳動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)開(kāi)始用于需要糖基化等翻譯后修飾的蛋白質(zhì)藥物的生產(chǎn)。早期的生物藥品種主要為臨床劑量較低的因子類蛋白藥物,如重組八因子(factor Ⅷ),紅細(xì)胞生成素(erythropoietin,EPO),組織型纖溶酶原激活劑(tissue plasminogen activator,tPA)等。受限于當(dāng)時(shí)對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞代謝和培養(yǎng)的了解以及極為有限的工藝開(kāi)發(fā)能力和工藝放大經(jīng)驗(yàn),EPO的生產(chǎn)工藝為添加牛血清的轉(zhuǎn)瓶(roller bottle)貼壁培養(yǎng)[8],GMP 無(wú)菌操作是在一個(gè)封閉的、由自動(dòng)化機(jī)器手操作的無(wú)人車間完成的,無(wú)菌保障和規(guī)模放大都極具挑戰(zhàn)性。由于表達(dá)量低,產(chǎn)品穩(wěn)定性差等因素,八因子蛋白則是采用連續(xù)灌注(perfusion)或重復(fù)批次培養(yǎng)(repeated-batch)實(shí)現(xiàn)商業(yè)化生產(chǎn)[9]。
20 世紀(jì)80 年代末,單克隆抗體藥物研發(fā)開(kāi)始起步。由于抗體的臨床劑量通常達(dá)到幾百毫克,比因子類產(chǎn)品微克級(jí)的劑量高幾個(gè)數(shù)量級(jí),因此,需要開(kāi)發(fā)操作簡(jiǎn)單、容易放大、產(chǎn)量高的細(xì)胞培養(yǎng)生產(chǎn)工藝技術(shù)。優(yōu)化細(xì)胞培養(yǎng)生產(chǎn)工藝需要突破一系列的認(rèn)知和技術(shù)瓶頸,如將CHO 細(xì)胞從貼壁生長(zhǎng)馴化成懸浮生長(zhǎng),從含血清培養(yǎng)馴化成無(wú)血清培養(yǎng),控制葡萄糖和氨基酸代謝的抑制細(xì)胞生長(zhǎng)的副產(chǎn)物(如乳酸和氨),控制細(xì)胞生長(zhǎng)所需數(shù)十種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)在反應(yīng)器中的濃度等。
此后30 年,哺乳動(dòng)物細(xì)胞表達(dá)的生物技術(shù)產(chǎn)品商業(yè)化進(jìn)入快速增長(zhǎng)階段,截至2020 年底,美國(guó)FDA 已批準(zhǔn)101 個(gè)單克隆抗體藥物上市,其中2010 年后批準(zhǔn)上市的品種占72 個(gè),抗體藥物研發(fā)和商業(yè)化呈快速增長(zhǎng)態(tài)勢(shì)。2015~2020 年,全球銷售排名前十的藥品中生物藥品種穩(wěn)住6~8 席。排名第一的阿達(dá)木單抗(TNF-α抗體,治療自身免疫性疾病)自2002 年底獲批上市以來(lái),年銷售額快速增長(zhǎng),2018 年達(dá)到200 億美元(圖1)。截至2020 年,阿達(dá)木單抗累計(jì)銷售額已達(dá)到1720 億美元,成為歷史上最成功的藥品。阿達(dá)木單抗的快速增長(zhǎng)是生物藥產(chǎn)業(yè)發(fā)展的一個(gè)縮影,從一個(gè)側(cè)面體現(xiàn)了生物藥過(guò)去三十年的蓬勃發(fā)展歷程。單克隆抗體等生物藥商業(yè)化取得的巨大成功,催生的大規(guī)模GMP 生產(chǎn)需求的實(shí)現(xiàn),得益于哺乳動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)工藝技術(shù)的不斷優(yōu)化以及生產(chǎn)規(guī)模的不斷擴(kuò)大。王義翹教授領(lǐng)導(dǎo)建立的MIT 生物技術(shù)和工程中心(MIT-BPEC)在90年代開(kāi)展的針對(duì)動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)、代謝、控制、工藝放大以及蛋白質(zhì)質(zhì)量控制等開(kāi)拓性研究奠定了國(guó)際生物藥工業(yè)化生產(chǎn)的基礎(chǔ)。王義翹教授帶領(lǐng)學(xué)生從動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)、生產(chǎn)工藝的各個(gè)方面進(jìn)行了系統(tǒng)性的研究,本文僅對(duì)其部分研究工作和成就進(jìn)行簡(jiǎn)單概述和總結(jié)。王義翹教授在其他生物工程領(lǐng)域的貢獻(xiàn)和成績(jī)已在其他文章中進(jìn)行了總結(jié)[10]。
圖1 阿達(dá)木單抗年銷售額Fig.1 Annual sales of Adamuzumab
早期的動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)研究大多以通過(guò)培養(yǎng)皿(culture dish)和轉(zhuǎn)瓶(roller bottle)貼壁培養(yǎng)的原代細(xì)胞為主,很難實(shí)現(xiàn)工業(yè)化生產(chǎn)。1967 年,van Wezel A L[11]首次提出采用陰離子微載體培養(yǎng)原代細(xì)胞的概念并成功實(shí)現(xiàn)多種原代細(xì)胞的貼壁懸浮培養(yǎng),但由于細(xì)胞接種貼壁效率低,微載體對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)存在抑制性“毒性”等一系列問(wèn)題,此后10 年的反復(fù)研究并沒(méi)有取得實(shí)質(zhì)性的進(jìn)展[12-15]。1977—1979 年,Levine D.W.和Giard D.J.在王義翹教授和Thilly W.G.的指導(dǎo)下,采用帶正電荷的葡聚糖微球(dextran microsphere)作為微載體進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),解決了細(xì)胞貼壁效率低、微載體對(duì)培養(yǎng)基中活性成分吸附造成的細(xì)胞生長(zhǎng)抑制等關(guān)鍵問(wèn)題,才真正推動(dòng)微載體細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)進(jìn)入工業(yè)化應(yīng)用階段[16-21]。此后,王義翹教授和他的學(xué)生Hu W.S.、Croughan M.、Hamel J-F[22-31]又對(duì)微載體培養(yǎng)的細(xì)胞接種密度、微球粒徑、細(xì)胞傳代、微載體密度、剪切力等關(guān)鍵工藝參數(shù)進(jìn)行了系統(tǒng)研究和優(yōu)化。王義翹教授團(tuán)隊(duì)的早期研究奠定了此后數(shù)十年微載體細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)和工業(yè)化應(yīng)用不斷發(fā)展進(jìn)步的重要基礎(chǔ),也為90 年代經(jīng)馴化后CHO 細(xì)胞的懸浮培養(yǎng)工藝開(kāi)發(fā)和優(yōu)化奠定了基礎(chǔ)。
20世紀(jì)80年代末,王義翹教授團(tuán)隊(duì)還設(shè)計(jì)了一種開(kāi)創(chuàng)性的氣升式纖維固定床生物反應(yīng)器(air-lift fiber bed bioreactor)進(jìn)行貼壁細(xì)胞培養(yǎng)。Perry S.D.[32]在王教授指導(dǎo)下首先對(duì)氣升式玻璃纖維固定床生物反應(yīng)器進(jìn)行了概念設(shè)計(jì)和初步可行性驗(yàn)證。此后,王教授團(tuán)隊(duì)的Chiou T.W.(邱紫文)和Murakami S.[33-34]又連續(xù)發(fā)表了兩篇論文分析了規(guī)?;糯蟮目尚行裕翰捎蒙鲜龈拍顚?shí)現(xiàn)了氣升式玻璃纖維固定床生物反應(yīng)器66天的CHO細(xì)胞貼壁培養(yǎng),細(xì)胞密度達(dá)到了6.8×107細(xì)胞/mL,實(shí)現(xiàn)了230倍的細(xì)胞擴(kuò)增;Murakami S.和Chiou T.W.[35]還對(duì)剪切力、營(yíng)養(yǎng)成分和氧氣傳輸和消耗進(jìn)行了模擬計(jì)算和理論放大研究,初步驗(yàn)證此類生物反應(yīng)器具備從10L放大到67 000L的潛力。
王義翹教授團(tuán)隊(duì)在微生物和酵母發(fā)酵生產(chǎn)工藝研究[36-42]、在線自動(dòng)檢測(cè)和控制[43-46]等方面的早期研發(fā)也為動(dòng)物細(xì)胞大規(guī)模培養(yǎng)工藝開(kāi)發(fā)、生物反應(yīng)器設(shè)計(jì)和工藝放大起到了重要的借鑒作用[47]。
氨和乳酸是動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中的兩個(gè)主要代謝副產(chǎn)物。20 世紀(jì)80 年代末至90 年代初,氨和乳酸對(duì)動(dòng)物細(xì)胞的生長(zhǎng)、代謝和蛋白質(zhì)糖基化修飾的影響已進(jìn)行了全面、系統(tǒng)的研究[48-54]。在2~4 mmol/L 的氨濃度下,大多數(shù)細(xì)胞系的生長(zhǎng)速度和產(chǎn)品表達(dá)水平?jīng)]有顯著影響,但是更高濃度的氨可導(dǎo)致嚴(yán)重的細(xì)胞生長(zhǎng)抑制和細(xì)胞死亡。乳酸在細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程的積累同樣對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)和代謝不利,一方面會(huì)導(dǎo)致pH 的下降和滲透壓的升高,同時(shí)還可能抑制葡萄糖的能量代謝。因此,控制氨和乳酸的產(chǎn)生和積累是實(shí)現(xiàn)高密度細(xì)胞培養(yǎng)、提高蛋白質(zhì)生產(chǎn)的關(guān)鍵手段[55-56]。
王義翹教授實(shí)驗(yàn)室研究了多重創(chuàng)新策略進(jìn)行細(xì)胞代謝副產(chǎn)物的調(diào)控,他的博士生Chang D.Y.S.(張幼翔)利用氨和乳酸在培養(yǎng)環(huán)境中分別帶正電和負(fù)電荷的特性,創(chuàng)造性地采用電場(chǎng)移除氨和乳酸的策略,有效控制了氨和乳酸在細(xì)胞培養(yǎng)反應(yīng)器中的濃度,并通過(guò)在培養(yǎng)基中加入過(guò)量氨基酸和葡萄糖進(jìn)行細(xì)胞培養(yǎng),將細(xì)胞密度從3.7×106細(xì)胞/mL 提高到9.1×106細(xì)胞/mL,抗體產(chǎn)量從170 mg/L提高到505 mg/L[57-58]。
細(xì)胞培養(yǎng)用商業(yè)化基礎(chǔ)培養(yǎng)基(如IMEM、DMEM)中氨基酸和葡萄糖濃度過(guò)高,細(xì)胞的新陳代謝效率較低并導(dǎo)致大量有毒副產(chǎn)物的產(chǎn)生和積累。研究表明,氨的產(chǎn)生主要來(lái)源于谷氨酰胺,其他氨基酸也能進(jìn)入TCA 循環(huán)代謝并產(chǎn)生氨[59-66]。氨的產(chǎn)生速率與谷氨酰胺濃度相關(guān)性較高,當(dāng)谷氨酰胺濃度從商業(yè)化基礎(chǔ)培養(yǎng)基中4~6 mmol/L 的濃度下調(diào)到0.5 mmol/L 時(shí),大多數(shù)細(xì)胞的生長(zhǎng)速率并不會(huì)受到影響,但非必需的谷氨酰胺代謝和降解會(huì)大幅下降,氨的產(chǎn)生速率也因此會(huì)大幅下降[67-70]。同理,葡萄糖代謝是乳酸的主要來(lái)源,控制葡萄糖到一個(gè)不影響細(xì)胞生長(zhǎng)速率的較低濃度(如2~5 mmol/L)可有效降低乳酸的產(chǎn)生[71-77]。一些早期研究采用經(jīng)典的補(bǔ)料技術(shù)或連續(xù)培養(yǎng)技術(shù)控制谷氨酰胺或葡萄糖濃度和代謝,獲得了一些積極結(jié)果,為20 世紀(jì)90 年代的流加工藝研發(fā)奠定了概念驗(yàn)證的基礎(chǔ),但單變量控制的效果往往有限[52,55-56,67,73,75-77],主要是因?yàn)榘被幔ú粌H僅是谷氨酰胺)和葡萄糖的代謝網(wǎng)絡(luò)是交織在一起的,具有一定的互補(bǔ)性和替代性。因此,控制細(xì)胞生長(zhǎng)所需的整個(gè)營(yíng)養(yǎng)環(huán)境(包含數(shù)十種必需的關(guān)鍵成分),同時(shí)解決氨和乳酸積累導(dǎo)致的細(xì)胞生長(zhǎng)抑制問(wèn)題和營(yíng)養(yǎng)成分消耗補(bǔ)充問(wèn)題,才可能大幅度提高細(xì)胞密度和產(chǎn)品產(chǎn)量。
本文作者在王教授的指導(dǎo)下,通過(guò)系統(tǒng)研究細(xì)胞新陳代謝網(wǎng)絡(luò),解析出合成一個(gè)細(xì)胞所需各類營(yíng)養(yǎng)成分的最低值,采用化學(xué)計(jì)量平衡的基礎(chǔ)培養(yǎng)基和加料液控制生物反應(yīng)器中各營(yíng)養(yǎng)成分(主要是氨基酸和葡萄糖)的濃度和細(xì)胞代謝,以達(dá)到調(diào)控和優(yōu)化細(xì)胞新陳代謝、降低氨和乳酸產(chǎn)生速率和積累、提高細(xì)胞密度、延長(zhǎng)細(xì)胞生長(zhǎng)時(shí)間、優(yōu)化目標(biāo)蛋白和抗體產(chǎn)量的目的。實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,與標(biāo)準(zhǔn)批次培養(yǎng)對(duì)比,通過(guò)化學(xué)計(jì)量平衡的加料,使細(xì)胞生長(zhǎng)所需的氨基酸和葡萄糖濃度在流加培養(yǎng)全過(guò)程中均控制在較低但相對(duì)穩(wěn)定的水平,在保證細(xì)胞生長(zhǎng)速率的前提下,乳酸的產(chǎn)生速率從批次培養(yǎng)0.3 pmole/(cell·h)降低到0.0036 pmole/(cell·h),氨的產(chǎn)生速率從0.016 pmole/(cell·h)降低到0.0028 pmole/(cell·h)[78-80]。
由于乳酸的產(chǎn)生是一個(gè)涉及LDH 酶的催化反應(yīng),王教授實(shí)驗(yàn)室團(tuán)隊(duì)人員(陳克勤博士,劉謙研究員和筆者)在20 世紀(jì)90 年代初期開(kāi)創(chuàng)性地嘗試通過(guò)基因工程改造的技術(shù)建立一個(gè)LDH-A 基因敲除的細(xì)胞系,以達(dá)到降低或消除乳酸副產(chǎn)物的目的,但受限于當(dāng)時(shí)的技術(shù),僅獲得了一個(gè)單拷貝LDH-A 基因敲除的細(xì)胞克隆。批次細(xì)胞培養(yǎng)試驗(yàn)結(jié)果顯示,單拷貝LDH-A 基因敲除細(xì)胞的乳酸產(chǎn)生速率比未改造的母細(xì)胞降低了50%,最高細(xì)胞密度提高了30%,抗體產(chǎn)量提高了3 倍[81]。該技術(shù)驗(yàn)證了通過(guò)基因工程改造的方式控制細(xì)胞新陳代謝、提高營(yíng)養(yǎng)成分的代謝效率,降低有毒副產(chǎn)物的新方法。由于劉謙研究員回國(guó)后忙于政務(wù),研究結(jié)果直到2001年才最終發(fā)表[81]。
由于細(xì)胞生長(zhǎng)需要消耗大量營(yíng)養(yǎng)物質(zhì),盡管較低的氨基酸和葡萄糖濃度可以降低氨和乳酸的產(chǎn)生,但不足以支撐細(xì)胞的持續(xù)生長(zhǎng)。因此,需要在培養(yǎng)過(guò)程中持續(xù)添加細(xì)胞生長(zhǎng)所消耗的多種氨基酸、葡萄糖和維生素等營(yíng)養(yǎng)成分。數(shù)十種營(yíng)養(yǎng)成分的配比以及加料速率控制是開(kāi)發(fā)高密度培養(yǎng)和高產(chǎn)量生產(chǎn)工藝的關(guān)鍵,因?yàn)橹灰幸环N關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)成分添加量不足,就可能導(dǎo)致該營(yíng)養(yǎng)成分成為細(xì)胞生長(zhǎng)的限制因素,并引起其他營(yíng)養(yǎng)成分和有毒副產(chǎn)物在反應(yīng)器中積累。
在20 世紀(jì)90 年代初期,大規(guī)模動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)剛剛被嘗試應(yīng)用于生物藥的商業(yè)化生產(chǎn)。由于細(xì)胞新陳代謝涉及成千上萬(wàn)的生物化學(xué)反應(yīng),涉及數(shù)十種營(yíng)養(yǎng)成分和成千上萬(wàn)的生物學(xué)物質(zhì),如構(gòu)成細(xì)胞的各種蛋白質(zhì)(膜蛋白、酶、結(jié)構(gòu)蛋白等)、脂肪、碳水化合物、DNA、RNA等,以及各種各樣的中間產(chǎn)物和副產(chǎn)物。因此,細(xì)胞新陳代謝網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜性和多樣性導(dǎo)致理論上存在無(wú)數(shù)種可能的代謝方式和結(jié)果,即細(xì)胞的生長(zhǎng)方式不是唯一的,而是多變的。舉例來(lái)說(shuō),細(xì)胞既可以將葡萄糖代謝成乳酸,產(chǎn)生2個(gè)ATP,也可以在TCA循環(huán)中氧化成CO2和水,產(chǎn)生30~38 個(gè)ATP。在每次細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程中,轉(zhuǎn)化成乳酸和進(jìn)入TCA 循環(huán)的葡萄糖比例并不是固定的。很顯然,細(xì)胞的新陳代謝效率也是動(dòng)態(tài)變化的。因此,在90 年代初期以前,細(xì)胞培養(yǎng)過(guò)程被認(rèn)為是一個(gè)不可解的“黑箱”。細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化主要憑經(jīng)驗(yàn),根據(jù)檢測(cè)主要營(yíng)養(yǎng)成分消耗情況、細(xì)胞生長(zhǎng)情況和蛋白質(zhì)產(chǎn)品表達(dá)量,得出一些經(jīng)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行試錯(cuò)式的迭代優(yōu)化。加料液的配比也通常是在基礎(chǔ)培養(yǎng)基(如DMEM、IMEM 等)的基礎(chǔ)上進(jìn)行濃縮。采用濃縮加料液的流加工藝可以有效解決關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)成分在批次培養(yǎng)后期被耗盡所導(dǎo)致的細(xì)胞生長(zhǎng)停滯和死亡的問(wèn)題,取得了比批次培養(yǎng)更好的結(jié)果,但單克隆抗體產(chǎn)量仍一直處于幾十毫克/升至幾百毫克/升的水平[58,82-88]。
本文作者試圖通過(guò)系統(tǒng)分析復(fù)雜的細(xì)胞新陳代謝反應(yīng)網(wǎng)絡(luò),梳理出營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)成分與細(xì)胞構(gòu)成成分以及能量代謝的對(duì)應(yīng)關(guān)系,進(jìn)而建立主導(dǎo)細(xì)胞合成的化學(xué)計(jì)量反應(yīng)方程式[89]。這是一項(xiàng)前所未有的高挑戰(zhàn)性任務(wù)。并結(jié)合自身的生物化學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、化學(xué)工程,系統(tǒng)工程和計(jì)算機(jī)編程等方面的知識(shí)和經(jīng)驗(yàn),對(duì)新陳代謝反應(yīng)網(wǎng)絡(luò)涉及的生化反應(yīng)按細(xì)胞內(nèi)的物質(zhì)類別進(jìn)行歸類和簡(jiǎn)化。例如,無(wú)論涉及的生化反應(yīng)如何復(fù)雜和多樣,細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)總量及其氨基酸成分是基本穩(wěn)定的,而且可以準(zhǔn)確測(cè)定,因此,根據(jù)物質(zhì)守恒的原理,合成細(xì)胞內(nèi)所有蛋白質(zhì)所需的各類氨基酸是可以確定的。相對(duì)而言,細(xì)胞的能量代謝則更為復(fù)雜,一方面是細(xì)胞生長(zhǎng)所需的能量既包括合成細(xì)胞所需的能量,還包括細(xì)胞生長(zhǎng)停滯狀況下的基本消耗,即維持需求;另一方面,涉及細(xì)胞能量代謝的化學(xué)成分既包括葡萄糖,還包括多種氨基酸,而且這些營(yíng)養(yǎng)成分在一定程度上具有相互替代功能[61,66,90-92]。舉例來(lái)說(shuō),當(dāng)葡萄糖濃度太低時(shí),谷氨酰胺和其他氨基酸的消耗速率會(huì)大幅提升,成為葡萄糖能量代謝的主要代償。
盡管細(xì)胞生長(zhǎng)的化學(xué)計(jì)量模型沒(méi)有唯一解,但理論上只有一個(gè)最優(yōu)解,即當(dāng)所有的細(xì)胞新陳代謝反應(yīng)均以最高效率和最佳方案進(jìn)行時(shí),細(xì)胞生長(zhǎng)所消耗的各種營(yíng)養(yǎng)成分達(dá)到最低、產(chǎn)生的氨和乳酸副產(chǎn)物達(dá)到最低。根據(jù)物質(zhì)守恒和能量守恒的原理,即可以解析出一個(gè)最佳的理想化的細(xì)胞生長(zhǎng)化學(xué)計(jì)量模型。在實(shí)際應(yīng)用中,理想化的化學(xué)計(jì)量關(guān)系是無(wú)法實(shí)現(xiàn)的,因?yàn)榧?xì)胞的能量代謝無(wú)法達(dá)到最優(yōu),因此,需要對(duì)限制條件進(jìn)行適度放寬,即允許細(xì)胞在代謝過(guò)程中采用一些非最佳的替代方式,如產(chǎn)生一定量的乳酸和氨,從而使化學(xué)計(jì)量模型變得可行和具有實(shí)際應(yīng)用價(jià)值[78-80]。
根據(jù)已建立的動(dòng)物細(xì)胞生長(zhǎng)化學(xué)計(jì)量模型中解析出的各營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的化學(xué)計(jì)量系數(shù)比,就可以參照一個(gè)普通化學(xué)反應(yīng)的控制原理設(shè)計(jì)并配制出化學(xué)計(jì)量平衡的細(xì)胞培養(yǎng)基和加料液。理論上,如果化學(xué)計(jì)量模型準(zhǔn)確預(yù)測(cè)了細(xì)胞在培養(yǎng)過(guò)程中的新陳代謝,則各營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的消耗速率是均衡的,即不會(huì)出現(xiàn)某些營(yíng)養(yǎng)成分被消耗盡而另一些成分大量積累的問(wèn)題,也就是說(shuō)可以通過(guò)一個(gè)包含幾十種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的加料液來(lái)控制細(xì)胞培養(yǎng)反應(yīng)器中所有關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)成分的濃度使其維持在一個(gè)最優(yōu)水平。這是以前不敢想象的目標(biāo)。
1992 年,本文作者對(duì)前文描述的化學(xué)計(jì)量模型進(jìn)行了解析,采用可收集的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)對(duì)細(xì)胞的主要成分進(jìn)行了估算:細(xì)胞干重為0.36 ng/細(xì)胞,其中各主要成分占比分別為:蛋白質(zhì)37.5%,DNA 2.5%,RNA 6.9%,脂類20%,碳水化合物25%。此外,利用文獻(xiàn)報(bào)道的207 個(gè)蛋白質(zhì)氨基酸組成,計(jì)算出一個(gè)平均的氨基酸摩爾分?jǐn)?shù)用于化學(xué)計(jì)量模型的解析。具體為:Ala 9.0%;Arg 4.7%;Asn 4.4%;Asp 5.5%;Cys 2.8%;Glu 6.2%;Gln 3.9%;Gly 7.5%;His 2.1%;Ile 4.6%;Leu 7.5%;Lys 7.0%;Met 1.7%;Phe 3.5%;Pro 4.6%;Ser 7.1%;Thr 6.0%;Trp 1.1%;Tyr 3.5%;Val 6.9%。根據(jù)解析出的各營(yíng)養(yǎng)成分的化學(xué)計(jì)量系數(shù),設(shè)計(jì)了第一代的基礎(chǔ)培養(yǎng)基和加料液配方,并在T 形培養(yǎng)瓶?jī)?nèi)進(jìn)行了兩輪流加培養(yǎng)試驗(yàn)驗(yàn)證。批次培養(yǎng)中,各種營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)隨著細(xì)胞生長(zhǎng)而快速被消耗,其濃度不斷下降;而在化學(xué)計(jì)量控制的流加培養(yǎng)中,葡萄糖和氨基酸的起始濃度就處于一個(gè)較低但足以維持細(xì)胞生長(zhǎng)的濃度,培養(yǎng)過(guò)程加入的加料液對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)過(guò)程中所消耗的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)進(jìn)行了有效的補(bǔ)充,因此大多數(shù)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的濃度維持在一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的水平,部分成分的濃度還有一定的升高[93]。與批次培養(yǎng)對(duì)比,氨和乳酸的產(chǎn)生速率得到了大幅度(26倍和50倍)的降低。由于氨和乳酸的積累得到非常有效的控制,階段性的加料確保了關(guān)鍵必需營(yíng)養(yǎng)成分的補(bǔ)充和維持在細(xì)胞生長(zhǎng)所必需的最低濃度以上,細(xì)胞密度得到了大幅度的提升,而且培養(yǎng)時(shí)間從批次培養(yǎng)的150 h 延長(zhǎng)到了流加培養(yǎng)的300 h 以上。因此,抗體的產(chǎn)量從50 mg/L 首次提高到了550 mg/L。該研究結(jié)果于1994 年初在生物工程權(quán)威刊物Biotechnology &Bioengineering上發(fā)表[93]。細(xì)胞生長(zhǎng)的化學(xué)計(jì)量模型在流加培養(yǎng)中實(shí)現(xiàn)跨越式突破的應(yīng)用價(jià)值首次得到了初步認(rèn)可。
此后,根據(jù)首次試驗(yàn)獲得的數(shù)據(jù)和經(jīng)驗(yàn)對(duì)化學(xué)計(jì)量模型進(jìn)行了校正和優(yōu)化,并對(duì)細(xì)胞的主要成分進(jìn)行了實(shí)測(cè)。結(jié)果顯示,細(xì)胞干重為0.25 ng/細(xì)胞,其中各主要成分占比分別為,蛋白質(zhì)72.9%,DNA 1.4%,RNA 3.8%,脂類13.5%,碳水化合物3.5%,與首次計(jì)算采用的文獻(xiàn)數(shù)據(jù)偏差較大。細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的氨基酸摩爾分?jǐn)?shù)實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)為:Ala 8.25%;Arg 5.93%;Asn 4.4%;Asp 4.69%;Cys 2.8%;Gln 6.2%;Glu 4.96%;Gly 8.54%;His 2.16%;Ile 4.22%;Leu 8.11%;Lys 6.79%;Met 2.17%;Phe 3.19%;Pro 5.26%;Ser 6.89%;Thr 5.73%;Trp 1.1%;Tyr 2.59%;Val 6.02%。實(shí)測(cè)的氨基酸比例與首次采用的平均值也有一些偏差,但整體符合性較好,對(duì)模型計(jì)算結(jié)果的影響不大。
根據(jù)優(yōu)化的模型和細(xì)胞株的實(shí)測(cè)組成數(shù)據(jù)解析出的化學(xué)計(jì)量系數(shù)進(jìn)行了第二輪的培養(yǎng)基設(shè)計(jì),并在自動(dòng)控制的2L 生物反應(yīng)器中進(jìn)行了第二輪驗(yàn)證和優(yōu)化實(shí)驗(yàn)。在本輪實(shí)驗(yàn)中,加料液的添加是由計(jì)算機(jī)控制自動(dòng)連續(xù)進(jìn)行的,因此避免了間歇式手動(dòng)加料造成的瞬時(shí)濃度刺突式的增加。溶氧和pH 值也得到了控制并維持穩(wěn)定,從而避免了首輪試驗(yàn)中T 形培養(yǎng)瓶中溶氧限制和pH 下降產(chǎn)生的局限性。
結(jié)果顯示,乳酸的產(chǎn)生速率比批次培養(yǎng)降低了62 倍,比首輪采用化學(xué)計(jì)量模型控制的T 形培養(yǎng)瓶流加培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步降低了8倍;抗體產(chǎn)量比批次培養(yǎng)提高了17 倍,達(dá)到900 mg/L,此為當(dāng)時(shí)文獻(xiàn)報(bào)道最高水平。在350 h 以上的培養(yǎng)中,總細(xì)胞密度達(dá)到了2.2×107細(xì)胞/mL,最高活細(xì)胞密度達(dá)到了6.3×106細(xì)胞/mL,而乳酸的峰值濃度僅為11 mmol/L,氨的峰值濃度僅為6 mmol/L 左右。葡萄糖和谷氨酰胺的濃度在培養(yǎng)全過(guò)程中均得到了良好控制[94],再次驗(yàn)證了化學(xué)計(jì)量模型對(duì)動(dòng)物細(xì)胞流加培養(yǎng)工藝優(yōu)化和控制的巨大價(jià)值。
通過(guò)化學(xué)計(jì)量模型解決了關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)成分在培養(yǎng)過(guò)程中被耗盡或大量積累的問(wèn)題,同時(shí)還大幅度降低了有毒副產(chǎn)物乳酸和氨的產(chǎn)生速率,避免了氨和乳酸積累到抑制細(xì)胞生長(zhǎng)或?qū)е录?xì)胞死亡的濃度。然而,在嚴(yán)格控制的細(xì)胞培養(yǎng)反應(yīng)器中,當(dāng)活細(xì)胞密度達(dá)到(5~10)×106細(xì)胞/mL 水平時(shí),盡管總細(xì)胞密度繼續(xù)增加,但活細(xì)胞密度不再增加,導(dǎo)致培養(yǎng)后期的細(xì)胞活率下降,很可能是還有一些細(xì)胞生長(zhǎng)所必需的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)未能通過(guò)化學(xué)計(jì)量模型得到有效控制。
因此,又對(duì)流加培養(yǎng)工藝過(guò)程和控制進(jìn)行了進(jìn)一步的優(yōu)化:①通過(guò)離線細(xì)胞計(jì)數(shù),每12 h 對(duì)細(xì)胞生長(zhǎng)速率和加料速率進(jìn)行校正;②通過(guò)分析認(rèn)為,基礎(chǔ)培養(yǎng)基中的磷將可能在培養(yǎng)后期被耗盡,進(jìn)而影響細(xì)胞的能量代謝和磷脂合成,因此,對(duì)磷的化學(xué)計(jì)量系數(shù)進(jìn)行了測(cè)算并應(yīng)用到加料液配方設(shè)計(jì)中;③在培養(yǎng)中期添加了血清和金屬離子(Li+,Zn2+,Cu2+等)。由于上述優(yōu)化改進(jìn),流加培養(yǎng)時(shí)間進(jìn)一步延長(zhǎng)到550 h,最高活細(xì)胞密度達(dá)到1.7×107細(xì)胞/mL(圖2),總細(xì)胞密度達(dá)到5×107細(xì)胞/mL。細(xì)胞培養(yǎng)反應(yīng)器從外觀上觀察已成肉色。在未采取細(xì)胞截留措施的流加培養(yǎng)中能達(dá)到如此高的細(xì)胞密度是前所未有的,因此,抗體產(chǎn)量也達(dá)到了前所未有的2400 mg/L(圖3),比批次培養(yǎng)提高了45 倍[79]。上述結(jié)果是基于化學(xué)計(jì)量平衡的培養(yǎng)基設(shè)計(jì)和加料速率控制,關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)成分維持在一個(gè)較優(yōu)且基本恒定的水平而實(shí)現(xiàn)的。如圖4 和圖5 所示,與批次培養(yǎng)中葡萄糖和谷氨酰胺濃度由于細(xì)胞代謝的消耗而隨培養(yǎng)時(shí)間延長(zhǎng)而快速下降不同,在化學(xué)計(jì)量平衡和控制的流加培養(yǎng)中,葡萄糖和谷氨酰胺濃度在全培養(yǎng)過(guò)程中均被控制在一個(gè)較低且相對(duì)穩(wěn)定的濃度范圍,既避免了濃度過(guò)高而導(dǎo)致的低效率代謝和有毒副產(chǎn)物的過(guò)度積累,又避免了因必要營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的耗盡而導(dǎo)致的細(xì)胞生長(zhǎng)停滯和死亡。因此,由于細(xì)胞生長(zhǎng)營(yíng)養(yǎng)環(huán)境得到了有效的控制,細(xì)胞的新陳代謝效率得到大幅度提升,副產(chǎn)物的產(chǎn)生速率大幅度下降(圖6)。僅有3.4%的葡萄糖被轉(zhuǎn)化為乳酸,其余均被用于細(xì)胞成分的合成和更高效的TCA 循環(huán)能量代謝,而在批次培養(yǎng)對(duì)照中,有67%的葡萄糖被轉(zhuǎn)化成乳酸,既導(dǎo)致葡萄糖的低效利用,又導(dǎo)致乳酸副產(chǎn)物的積累。
圖2 化學(xué)計(jì)量平衡和加料控制的流加培養(yǎng)工藝中活細(xì)胞密度與批次培養(yǎng)對(duì)比Fig.2 Comparison of the viable cell density in the perfusion culture developed on stoichiometric balance and feed control to that observed in the batch process
圖3 化學(xué)計(jì)量平衡和加料控制的流加培養(yǎng)工藝中抗體產(chǎn)量與批次培養(yǎng)對(duì)比Fig.3 Comparison of the antibody yield in the perfusion culture developed on stoichiometric balance and feed control with that of the batch process
圖4 化學(xué)計(jì)量平衡和加料控制的流加培養(yǎng)工藝中葡萄糖控制情況與批次培養(yǎng)對(duì)比Fig.4 Comparison of the glucose control index of the perfusion culture developed on stoichiometric balance and feed control with that of the batch process
圖5 化學(xué)計(jì)量平衡和加料控制的流加培養(yǎng)工藝中谷氨酰胺控制情況與批次培養(yǎng)對(duì)比Fig.5 Comparison of the glutamine control for the perfusion culture developed on stoichiometric balance and feed control with that of the batch process
圖6 化學(xué)計(jì)量平衡和加料控制的流加培養(yǎng)工藝中副產(chǎn)物乳酸和氨產(chǎn)生速率與批次培養(yǎng)對(duì)比Fig.6 Comparison of the byproduct lactic acid and ammonia production for the perfusion developed on stoichiometric balance and feed control with those of the batch process
為驗(yàn)證化學(xué)計(jì)量模型的通用性,還針對(duì)表達(dá)γ-干擾素蛋白的CHO 細(xì)胞無(wú)血清培養(yǎng)流加工藝進(jìn)行了初步優(yōu)化。采用間歇式的手動(dòng)加料方式,在T 形培養(yǎng)瓶培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中,化學(xué)計(jì)量平衡的培養(yǎng)基設(shè)計(jì)和加料同樣可以將葡萄糖和氨基酸濃度控制在一個(gè)相對(duì)穩(wěn)定的水平。與批次對(duì)照培養(yǎng)比較,活細(xì)胞密度提高2 倍以上,γ-干擾素蛋白產(chǎn)量從7.6 mg/L 提高到30 mg/L 的水平[95]。
2000 年,王義翹教授的學(xué)生邱紫文博士畢業(yè)后回臺(tái)灣任教,將動(dòng)物細(xì)胞的化學(xué)計(jì)量模型完整地應(yīng)用到昆蟲(chóng)細(xì)胞流加培養(yǎng)中并得到了良好的結(jié)果[96]。與經(jīng)典的流加培養(yǎng)工藝對(duì)比,采用化學(xué)計(jì)量模型平衡和控制的昆蟲(chóng)細(xì)胞流加培養(yǎng)工藝,SF21 細(xì)胞密度提高了3 倍,達(dá)到1.7×107細(xì)胞/mL,白介素5 蛋白表達(dá)量也得到了大幅度提高。盡管昆蟲(chóng)細(xì)胞培養(yǎng)與哺乳動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)有較大的不同,然而物質(zhì)守恒和能量守恒的定律不變,細(xì)胞的新陳代謝化學(xué)反應(yīng)原理不變,因此動(dòng)物細(xì)胞的化學(xué)計(jì)量模型和昆蟲(chóng)細(xì)胞基本一致,只是細(xì)胞的成分有差別,細(xì)胞的副產(chǎn)物產(chǎn)生速率有差別,維持細(xì)胞生長(zhǎng)速率所需的各種關(guān)鍵營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)最佳濃度有差別。該研究進(jìn)一步驗(yàn)證了化學(xué)計(jì)量模型在優(yōu)化流加細(xì)胞培養(yǎng)工藝中的廣泛應(yīng)用價(jià)值。
根據(jù)多輪化學(xué)計(jì)量平衡和控制的流加細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)所測(cè)定的細(xì)胞生長(zhǎng),各營(yíng)養(yǎng)成分的加入量、消耗量、副產(chǎn)物的產(chǎn)生以及目標(biāo)抗體的合成等實(shí)驗(yàn)結(jié)果,采用化學(xué)劑量模型中涉及的化學(xué)反應(yīng)網(wǎng)絡(luò),本文作者對(duì)各種營(yíng)養(yǎng)成分的實(shí)際代謝路徑和效率進(jìn)行了系統(tǒng)分析[97],還對(duì)細(xì)胞的整個(gè)能量代謝網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了解析[98]。上述分析對(duì)動(dòng)物細(xì)胞探索在不同的營(yíng)養(yǎng)環(huán)境下的新陳代謝規(guī)律提供了重要的數(shù)據(jù),為后續(xù)進(jìn)一步修正和優(yōu)化化學(xué)計(jì)量模型以及流加工藝提供了很多重要的線索和實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
在詳細(xì)發(fā)表上述模型、培養(yǎng)基配方、流加策略以及多輪實(shí)驗(yàn)結(jié)果后,該研究在學(xué)術(shù)界和工業(yè)界產(chǎn)生了強(qiáng)烈反響。應(yīng)工業(yè)界的要求,筆者在王教授實(shí)驗(yàn)室從事博士論文研究的最后一年,指導(dǎo)碩士研究生共同完成了動(dòng)物細(xì)胞化學(xué)計(jì)量模型通用軟件的開(kāi)發(fā)。此后,該軟件系統(tǒng)被廣泛免費(fèi)提供給加入MIT 生物技術(shù)工程中心生物制藥工業(yè)聯(lián)盟的制藥企業(yè)會(huì)員并被應(yīng)用于支持其商業(yè)化產(chǎn)品的生產(chǎn)工藝開(kāi)發(fā)和優(yōu)化。
王義翹教授實(shí)驗(yàn)室自20 世紀(jì)70 年代開(kāi)始開(kāi)展的細(xì)菌發(fā)酵和動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)相關(guān)研究工作,奠定了90 年代動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)應(yīng)用于單克隆抗體和重組蛋白藥物商業(yè)化生產(chǎn)工藝的基礎(chǔ)。在抗體藥物產(chǎn)業(yè)化初始階段,王教授實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展的動(dòng)物細(xì)胞高密度培養(yǎng)系列研究對(duì)后續(xù)30 年抗體藥物大規(guī)模高效率流加生產(chǎn)工藝的廣泛商業(yè)化應(yīng)用和不斷發(fā)展起到了重要的支撐和推動(dòng)作用。
王義翹教授實(shí)驗(yàn)室不僅在動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)生產(chǎn)工藝開(kāi)發(fā)和優(yōu)化上做出奠基性貢獻(xiàn),還在20 世紀(jì)90 年代初期就開(kāi)始對(duì)重組蛋白藥物的糖基化修飾多樣性進(jìn)行了比較系統(tǒng)的研究。單克隆抗體和γ-干擾素等蛋白質(zhì)藥物的糖基化存在2 個(gè)維度的多樣化:一是糖基化位點(diǎn)的糖基化修飾多樣化,即宏觀多樣性(macroheterogeneity),如有些位點(diǎn)的糖基化修飾比例很高,而有些位點(diǎn)的糖基化修飾比例可能較低,且隨培養(yǎng)條件、培養(yǎng)時(shí)間動(dòng)態(tài)變化;二是蛋白上的糖鏈結(jié)構(gòu)存在多樣性,即微觀多樣性(microheterogeneity)。糖鏈結(jié)構(gòu)對(duì)蛋白質(zhì)的性質(zhì)、穩(wěn)定性、代謝、生物學(xué)功能都可能有重要意義。舉例來(lái)說(shuō),抗體藥物的糖基化位點(diǎn)位于抗體的重鏈恒定區(qū),糖鏈參與和影響抗體與免疫細(xì)胞上的Fc 受體(CD16a,CD16b,CD32a,CD32b,CD64)和FcRn分子的結(jié)合,對(duì)抗體的藥代動(dòng)力學(xué)、Fc功能(如ADCC、CDC、ADCP生物活性)均可能有重要影響[99-104]。
王教授的學(xué)生Harmon B.博士在20世紀(jì)90年代初期開(kāi)始探索基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜(MALDI/TOF mass spectrometry)技術(shù)應(yīng)用于蛋白質(zhì)糖基化多樣性的快速分析和監(jiān)測(cè)[105],建立了高靈敏度2 h 快速分析蛋白質(zhì)各糖基化位點(diǎn)糖鏈結(jié)構(gòu)多樣性的技術(shù),為實(shí)時(shí)動(dòng)態(tài)研究和檢測(cè)細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境、過(guò)程參數(shù)對(duì)蛋白質(zhì)和抗體藥物糖基化多樣性變化,控制大分子生物藥糖基化關(guān)鍵質(zhì)量參數(shù)提供了重要的手段。在此基礎(chǔ)上,王教授的博士生顧學(xué)軍對(duì)CHO 細(xì)胞表達(dá)γ-干擾素蛋白糖基化及唾液酸修飾情況進(jìn)行了分析,研究了無(wú)血清培養(yǎng)過(guò)程中添加蛋白水解物對(duì)CHO 細(xì)胞代謝及γ-干擾素蛋白唾液酸修飾程度的影響,并成功通過(guò)添加N-乙酰基甘露糖胺(N-acetylmannosamine)對(duì)唾液酸修飾進(jìn)行優(yōu)化,以達(dá)到提高唾液酸修飾比例的目的[106-110]。利用CHO 細(xì)胞連續(xù)培養(yǎng)可以實(shí)現(xiàn)細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境穩(wěn)態(tài)控制的特點(diǎn),王教授的博士生Nyberg G.和Balcarcel R.與Harmon B.合作,系統(tǒng)研究了細(xì)胞培養(yǎng)環(huán)境和代謝中間產(chǎn)物對(duì)γ-干擾素蛋白糖基化修飾程度的影響[110-111],為控制蛋白質(zhì)藥物糖基化特性提供了重要的線索。
動(dòng)物細(xì)胞在攪拌式生物反應(yīng)器中高密度懸浮大規(guī)模培養(yǎng)已經(jīng)成為重組蛋白藥物、單克隆抗體藥物和基因工程疫苗類產(chǎn)品的主流生產(chǎn)技術(shù)。由于需要連續(xù)不斷地將空氣中的氧氣傳遞到液體培養(yǎng)基中的細(xì)胞,并將細(xì)胞新陳代謝產(chǎn)生的二氧化碳移除出生物反應(yīng)器,機(jī)械攪拌和空氣鼓泡是大規(guī)模動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)的必要手段,也是工藝放大的關(guān)鍵和難點(diǎn)。這是因?yàn)閯?dòng)物細(xì)胞沒(méi)有細(xì)胞壁的保護(hù),細(xì)胞膜對(duì)剪切力很敏感,在細(xì)胞培養(yǎng)生物反應(yīng)器中無(wú)法耐受高速攪拌和鼓泡所產(chǎn)生的剪切力。
王義翹教授早在20 世紀(jì)60 年代末就開(kāi)始研究流體力學(xué)對(duì)動(dòng)物細(xì)胞死亡的影響。為了模擬細(xì)胞在攪拌式生物反應(yīng)器中所經(jīng)受的剪切力并能準(zhǔn)確計(jì)算剪切力,Augenstein D.C.設(shè)計(jì)了一個(gè)毛細(xì)管裝置讓動(dòng)物細(xì)胞在含10%牛血清的培養(yǎng)基懸浮液中多次通過(guò)毛細(xì)管并測(cè)定細(xì)胞死亡率,建立了細(xì)胞死亡速率與剪切力的關(guān)聯(lián)關(guān)系,為細(xì)胞培養(yǎng)生物反應(yīng)器的設(shè)計(jì)、培養(yǎng)工藝放大以及生物反應(yīng)器的控制提供了基礎(chǔ)性的依據(jù)[112]。原代細(xì)胞的微載體貼壁培養(yǎng)所用的微載體直徑遠(yuǎn)大于單個(gè)動(dòng)物細(xì)胞的直徑,因此,貼附在微載體上的動(dòng)物細(xì)胞對(duì)攪拌所產(chǎn)生的剪切力更敏感,容易導(dǎo)致細(xì)胞脫落后死亡。王教授的博士生Croughan 在80 年代對(duì)FS-4 細(xì)胞微載體培養(yǎng)攪拌式生物反應(yīng)器中的流體力學(xué)和湍流所產(chǎn)生的剪切力進(jìn)行了系統(tǒng)模擬分析和計(jì)算,系統(tǒng)研究了攪拌速度對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)和死亡速率的影響[27,113],以及培養(yǎng)液黏度對(duì)減輕湍流所產(chǎn)生的剪切力和細(xì)胞損傷的影響[31]。90 年代,王教授的博士生Orton 和Meier 先后對(duì)細(xì)胞培養(yǎng)生物反應(yīng)器中空氣鼓泡導(dǎo)致的損傷和死亡進(jìn)行了全面系統(tǒng)的研究[114-116]。Orton采用熒光示蹤法全程記錄了氣泡從液體中上升并浮出水面破裂過(guò)程中細(xì)胞死亡的情況,發(fā)現(xiàn)細(xì)胞死亡主要發(fā)生在氣泡破裂的瞬間。模擬計(jì)算顯示,氣泡破裂時(shí)可產(chǎn)生巨大的剪切力并足以撕裂細(xì)胞。她還比較了不同濃度的多種表面活性劑,如PF68,對(duì)降低空氣鼓泡導(dǎo)致的細(xì)胞死亡作用的影響。Meier 在此基礎(chǔ)上,進(jìn)一步研究了PF68 等高分子表面活性劑分別對(duì)氣泡在上升階段和破裂時(shí)細(xì)胞死亡的影響[115-116]。
本文作者在默克公司工作期間帶領(lǐng)學(xué)生對(duì)不同表面活性劑PF68 濃度對(duì)細(xì)胞吸附、死亡的影響首次進(jìn)行了準(zhǔn)確測(cè)定[117]。結(jié)果顯示,在PF68低濃度情況下,細(xì)胞被大量富集到氣泡表面,氣泡層的細(xì)胞密度可以達(dá)到反應(yīng)器中細(xì)胞密度的10 倍。當(dāng)PF68濃度提高到1 g/L 時(shí),氣泡層的細(xì)胞密度僅為反應(yīng)器中細(xì)胞密度的一半左右。因此,在無(wú)血清培養(yǎng)基中添加PF68 等高分子表面活性劑對(duì)細(xì)胞的保護(hù)作用主要是降低氣泡對(duì)細(xì)胞吸附并在氣泡層的富集作用。
王義翹教授團(tuán)隊(duì)在20 世紀(jì)90 年代及以前針對(duì)動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)開(kāi)展的奠基性研發(fā),推動(dòng)了90 年代至今全球生物技術(shù)產(chǎn)業(yè)的快速發(fā)展,高密度動(dòng)物細(xì)胞流加培養(yǎng)技術(shù)已經(jīng)成為單克隆抗體規(guī)?;a(chǎn)的主流技術(shù)。在此基礎(chǔ)上,過(guò)去30 年,生物藥產(chǎn)業(yè)化技術(shù)在三個(gè)方面取得了重要進(jìn)展:①分子生物學(xué)技術(shù)的進(jìn)步持續(xù)推動(dòng)目標(biāo)蛋白表達(dá)載體的不斷優(yōu)化,穩(wěn)定高產(chǎn)細(xì)胞株獲取成為可能;②高通量細(xì)胞克隆篩選技術(shù)(如流式細(xì)胞分選儀和ClonePix 細(xì)胞克隆系統(tǒng))的推廣應(yīng)用,使細(xì)胞株的表達(dá)水平不斷提高;③通過(guò)對(duì)特定單克隆細(xì)胞株的培養(yǎng)基及培養(yǎng)條件優(yōu)化,以流加培養(yǎng)方式,活細(xì)胞密度達(dá)到107細(xì)胞/mL 已成為常態(tài),因此,單克隆抗體產(chǎn)量已普遍超過(guò)3 g/L。
由于單克隆抗體藥物的臨床應(yīng)用價(jià)值得到廣泛驗(yàn)證,臨床需求大的品種往往需要采用10 000 L 以上規(guī)模的生物反應(yīng)器進(jìn)行商業(yè)化生產(chǎn)。國(guó)際主流生物制藥企業(yè)大多建成了12 000 L、15 000 L 細(xì)胞培養(yǎng)規(guī)模的商業(yè)化生產(chǎn)線。盡管理論上反應(yīng)器規(guī)??梢赃M(jìn)一步提高,但隨著培養(yǎng)規(guī)模的擴(kuò)大,下游純化成本成為主要瓶頸,因此進(jìn)一步放大細(xì)胞培養(yǎng)生物反應(yīng)器的風(fēng)險(xiǎn)收益比不再具有吸引力。近年來(lái),采用設(shè)備投資小、建設(shè)周期短、車間GMP 認(rèn)證快、不要對(duì)固定式生物反應(yīng)器進(jìn)行清洗和消毒的一次性生物反應(yīng)器(如2000 L)開(kāi)展產(chǎn)業(yè)化,得到了中小型生物技術(shù)企業(yè)的青睞,尤其是在我國(guó)得到了快速推廣和應(yīng)用,對(duì)我國(guó)生物制藥領(lǐng)域的高速發(fā)展起到了重要的推動(dòng)作用。
可以預(yù)見(jiàn),隨著重組蛋白藥物、單克隆抗體藥物、雙特異性抗體藥物、抗體藥物偶聯(lián)物(ADC)、CAR-T 細(xì)胞治療、重組蛋白疫苗、病毒樣顆粒疫苗等生物藥的開(kāi)發(fā)和商業(yè)化,細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)(動(dòng)物細(xì)胞、T 細(xì)胞、昆蟲(chóng)細(xì)胞培養(yǎng))將得到越來(lái)越多的應(yīng)用,推動(dòng)生物產(chǎn)品的不斷發(fā)展和進(jìn)步。王義翹教授團(tuán)隊(duì)數(shù)十年前奠定的基礎(chǔ)仍將不斷發(fā)揮重要作用。
王義翹教授自20 世紀(jì)60 年代開(kāi)始,以其前瞻性的洞察力和深厚的工程學(xué)背景,對(duì)哺乳動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)技術(shù)進(jìn)行了數(shù)十年全面系統(tǒng)的研究和優(yōu)化,尤其是在80 年代中期,領(lǐng)導(dǎo)組建了美國(guó)唯一的生物工程技術(shù)中心(BPEC),匯集了MIT 化工系、生物系以及世界各地不同領(lǐng)域的教授專家進(jìn)行交叉學(xué)科的研究和探索,為90 年代開(kāi)始的全球重組蛋白、單克隆抗體和基因工程疫苗等生物技術(shù)產(chǎn)品的蓬勃發(fā)展奠定了堅(jiān)實(shí)的理論和工程基礎(chǔ),做出了不可磨滅的偉大貢獻(xiàn)。本文限于作者自身的專業(yè)知識(shí)和在王義翹教授實(shí)驗(yàn)室的短暫經(jīng)歷,僅對(duì)王教授在動(dòng)物細(xì)胞培養(yǎng)及相關(guān)領(lǐng)域的奠基性工作進(jìn)行了粗淺的概述。王教授培養(yǎng)的學(xué)生遍布世界各國(guó)主流的生物制藥企業(yè)并成為推動(dòng)生物工程技術(shù)不斷發(fā)展的核心力量,將王義翹教授的思想和品德不斷傳承下去,推動(dòng)人類健康事業(yè)的不斷發(fā)展。王義翹教授永垂不朽!