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        SETD2在腎癌中的研究進(jìn)展

        2021-08-30 02:54:34徐松林蔡立成張誠(chéng)
        醫(yī)學(xué)綜述 2021年15期
        關(guān)鍵詞:腎癌乳頭狀結(jié)構(gòu)域

        徐松林,蔡立成,張誠(chéng)

        (哈爾濱醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院泌尿外科,哈爾濱 150001)

        腎癌占腎臟腫瘤的90%以上,占成人惡性腫瘤的3%~4%[1]。近年來(lái),腎癌發(fā)病率呈上升趨勢(shì)。我國(guó)人口基數(shù)大,因此腎癌的早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療尤為重要。手術(shù)治療仍是目前腎癌的主要治療手段。隨著免疫治療等的出現(xiàn)和發(fā)展,腎癌的個(gè)體化治療逐漸得到臨床認(rèn)可,但由于多數(shù)腎癌發(fā)現(xiàn)時(shí)已有轉(zhuǎn)移,或存在術(shù)后復(fù)發(fā)以及對(duì)于放療和化療不敏感等生物學(xué)特性,有必要性對(duì)腎癌進(jìn)行深入研究,以尋找更有效的治療手段。在人體內(nèi),含SET結(jié)構(gòu)域蛋白2(SET domain-containing protein 2,SETD2)是組蛋白H3第36位賴氨酸(histone H3 lysine 36,H3K36)的一種特異性三甲基轉(zhuǎn)移酶[2]。SETD2基因突變及其導(dǎo)致的編碼酶的改變與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展有重要聯(lián)系,如腎癌[3]、前列腺癌[4]、胰腺癌[5]、白血病[6]等。SETD2基因是腎癌,特別是腎透明細(xì)胞癌的常見突變基因[7]。此前雖然已有關(guān)于SETD2在腎癌中的研究,但相關(guān)機(jī)制及通路尚未闡明?,F(xiàn)就SETD2基因在腎癌領(lǐng)域的研究進(jìn)展予以綜述,以加深對(duì)SETD2基因在腎癌發(fā)生發(fā)展中的認(rèn)識(shí),從而為腎癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制和相關(guān)通路的研究以及腎癌治療方式的改進(jìn)提供思路。

        1 SETD2的概述

        人類SETD2基因位于第3號(hào)染色體細(xì)胞遺傳帶p21.31位點(diǎn),在各種惡性腫瘤中,該區(qū)域經(jīng)常靶向出現(xiàn)拷貝數(shù)丟失[8]。SETD2基因是包含一個(gè)147 kb的基因組區(qū)域,由21個(gè)外顯子編碼的8 452 nt轉(zhuǎn)錄本,其編碼的SETD2蛋白有AWS-SET-Post SET結(jié)構(gòu)域、WW結(jié)構(gòu)域、SRI(Set2 Rpb1 interacting)結(jié)構(gòu)域三個(gè)保守的功能結(jié)構(gòu)域。AWS-SET-Post SET結(jié)構(gòu)域兩側(cè)分別是AWS域和Post SET域,SET結(jié)構(gòu)域在一些細(xì)菌和病毒、酵母菌甚至哺乳動(dòng)物以及人類中的進(jìn)化均較為保守[9-10];含有WW結(jié)構(gòu)域基因的異常表達(dá)與多種疾病有關(guān),如各種惡性腫瘤及腫瘤的不同亞型[11-12];SRI結(jié)構(gòu)域與RNA聚合酶Ⅱ的最大亞基Rpb1的超磷酸化C端結(jié)構(gòu)域特異性相互作用,并可使SETD2的活性趨向主動(dòng)轉(zhuǎn)錄基因。SRI結(jié)構(gòu)域的缺失將導(dǎo)致SETD2無(wú)法通過與延長(zhǎng)RNA聚合酶Ⅱ的C端結(jié)構(gòu)域結(jié)合而到達(dá)目標(biāo)基因位點(diǎn),可能影響H3K36的甲基化[13],上述結(jié)構(gòu)決定了其功能[14],見圖1。

        SETD2:含SET結(jié)構(gòu)域蛋白2;SRI:Set2 Rpb1 interacting

        SETD2主要編碼一種甲基轉(zhuǎn)移酶。在組蛋白修飾方面,它可使H3K36發(fā)生三甲基化[15]。這種甲基化轉(zhuǎn)移酶活性的功能主要依賴于AWS SET-Post SET結(jié)構(gòu)域[16],并可通過與C端結(jié)構(gòu)域RNA聚合酶Ⅱ的相互作用被招募到轉(zhuǎn)錄活性位點(diǎn)[17-18]。SETD2表達(dá)水平降低,H3K36的三甲基化水平也明顯下降[19]。

        2 SETD2基因在腎癌中的研究現(xiàn)狀

        2.1SETD2基因與腎癌的代謝 腫瘤細(xì)胞的發(fā)生發(fā)展過程往往伴隨著細(xì)胞代謝的改變。腎癌是一種代謝性疾病,在其發(fā)生發(fā)展過程中,許多參與細(xì)胞呼吸和能量代謝的基因發(fā)生突變,如希佩爾-林道基因缺失導(dǎo)致缺氧誘導(dǎo)因子-1依賴性的能量代謝基因重編程,包括葡萄糖攝取、糖酵解和乳酸生成增加[20]。Liu等[20]通過鋅指核酸酶從786-O細(xì)胞中人工克隆了兩個(gè)獨(dú)立的SETD2基因缺陷型細(xì)胞系,分別使用靶向代謝組學(xué)、RNA序列和分子生物學(xué)方法觀察分析代謝、基因和細(xì)胞表型的變化發(fā)現(xiàn),突變的ATP、糖酵解/線粒體呼吸能力、檸檬酸合成酶活性以及天冬氨酸、蘋果酸、琥珀酸、延胡索酸和α-酮戊二酸等三羧酸循環(huán)代謝物水平升高;并且利用丙酮酸以外的其他來(lái)源為三羧酸循環(huán)生成乙酰輔酶A。此外,SETD2缺失組細(xì)胞與線粒體代謝、脂肪酸和葡萄糖氧化相關(guān)的基因網(wǎng)絡(luò)紊亂,這與過氧化物酶體增殖物激活受體γ共激活因子1α(peroxisome proliferator-activated receptor γ co-activator 1α,PGC-1α)、線粒體質(zhì)量以及細(xì)胞大小或復(fù)雜性的增加有關(guān)。因此,SETD2表達(dá)的缺失誘導(dǎo)腎透明細(xì)胞癌的代謝向氧化磷酸化轉(zhuǎn)變,且這種轉(zhuǎn)變與PGC-1α介導(dǎo)的代謝網(wǎng)絡(luò)有關(guān)。SETD2-PGC-1α代謝途徑的功能障礙可能在腎透明細(xì)胞癌中起刺激因子的作用,并提供了基于靶向治療的代謝組學(xué)潛力,為腎透明細(xì)胞癌的精準(zhǔn)治療和個(gè)體化治療提供了方向。

        自噬是代謝過程中較為保守的分解過程,特別是靶向自噬。應(yīng)激狀態(tài)下,自噬對(duì)細(xì)胞穩(wěn)態(tài)的保護(hù)和維持有重要作用。近年來(lái),自噬在腎癌領(lǐng)域的作用引起了人們的注意[21]。自噬是腎癌治療過程中的潛在治療靶點(diǎn),尤其是腎透明細(xì)胞癌,此外,表觀遺傳學(xué)通路被認(rèn)為是調(diào)控細(xì)胞自噬的關(guān)鍵步驟。González-Rodríguez等[22]的研究發(fā)現(xiàn),腎癌細(xì)胞中,SETD2的缺失與游離的自噬相關(guān)蛋白(autophagy-related protein,ATG)12以及含有ATG12的復(fù)合物的異常累積有關(guān)(ATG5-ATG12復(fù)合物除外)。腎癌細(xì)胞中SETD2功能的恢復(fù)或野生型腎癌細(xì)胞中SETD2表達(dá)水平的降低表明,腎癌中SETD2的缺乏與腎癌細(xì)胞中短ATG12亞型的表達(dá)增加有關(guān),短ATG12亞型的存在導(dǎo)致額外的含ATG12復(fù)合物和游離ATG12存在。ATG12依賴性結(jié)合系統(tǒng)的明顯缺陷與自噬通量降低有關(guān),這與泛素樣蛋白結(jié)合系統(tǒng)在自噬體形成和擴(kuò)張中的作用一致。自噬影響癌細(xì)胞的存活,因此可以將SETD2和ATG12基因表達(dá)水平與腎癌患者預(yù)后情況相關(guān)聯(lián)。對(duì)腎癌患者進(jìn)行治療性干預(yù)時(shí),靶向自噬過程可能對(duì)腎癌的治療具有潛在意義。

        2.2SETD2基因與腎癌的免疫及微環(huán)境 低密度脂蛋白受體相關(guān)蛋白1(low-density lipoprotein receptor-related protein 1,LRP1)是低密度脂蛋白受體家族的成員之一,屬于一種跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,能與細(xì)胞外的30多個(gè)不同配體結(jié)合,并將其傳遞到細(xì)胞質(zhì)中[23];此外,LRP1還可作為受體與細(xì)胞內(nèi)信號(hào)蛋白相互作用。因此,LRP1在人類多種疾病,尤其是腫瘤及其相關(guān)疾病中具有一定作用。LRP1通過調(diào)節(jié)基質(zhì)金屬蛋白酶2和基質(zhì)金屬蛋白酶9的表達(dá)促進(jìn)腫瘤細(xì)胞遷移,調(diào)節(jié)胰島素受體,從而抑制細(xì)胞凋亡[24];LRP1的過表達(dá)與胰腺導(dǎo)管腺癌的不良預(yù)后和侵襲性有關(guān)[25]。Feng等[26]的研究發(fā)現(xiàn),腎透明細(xì)胞癌中的LRP1與一些常見突變基因[如PBRM1(Polybromo 1)基因、SETD2基因、賴氨酸去甲基化酶5C基因]的表達(dá)明顯相關(guān)。LRP1與PBRM1、SETD2等基因以及白細(xì)胞介素-18、腫瘤浸潤(rùn)之間的相關(guān)性均表明LRP1在免疫調(diào)節(jié)方面的意義。進(jìn)一步的免疫組織化學(xué)研究證實(shí),LRP1與SETD2基因表達(dá)呈正相關(guān)[26]。免疫檢查點(diǎn)抑制劑是免疫治療的一線藥物。在LRP1過表達(dá)的病例中,免疫檢查點(diǎn)抑制劑可能通過多個(gè)途徑共同起作用。若LRP1的主要作用是免疫調(diào)節(jié)而非促進(jìn)血管生成,其過表達(dá)的透明細(xì)胞癌模型中也應(yīng)存在免疫排斥的相關(guān)機(jī)制。

        乳頭狀腎細(xì)胞癌占腎癌的15%~20%,由于患者數(shù)量相對(duì)有限,一般不作為腎癌分子機(jī)制和隨機(jī)臨床試驗(yàn)研究的范圍[27]。因此,仍缺乏可靠的乳頭狀腎細(xì)胞癌分子生物學(xué)研究證據(jù),目前,免疫抑制劑或疫苗正逐漸成為腎癌的一種新的治療手段,如程序性細(xì)胞死亡受體1(programmed cell death receptor 1,PD-1)/程序性細(xì)胞死亡配體1(programmed cell death-ligand 1,PD-L1)阻斷乳頭狀腎細(xì)胞癌的有效應(yīng)答率可達(dá)30%,遠(yuǎn)高于腎透明細(xì)胞癌[28]。對(duì)161例原發(fā)性乳頭狀腎細(xì)胞癌進(jìn)行研究分析發(fā)現(xiàn),SETD2基因突變是2型乳頭狀腎細(xì)胞癌的特點(diǎn)之一[29]。Wang等[30]的實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),乳頭狀腎細(xì)胞癌的免疫風(fēng)險(xiǎn)相關(guān)特征與15個(gè)基因相關(guān);高風(fēng)險(xiǎn)組患者腫瘤的炎癥微環(huán)境增加,促進(jìn)了乳頭狀腎細(xì)胞癌的進(jìn)展,患者往往預(yù)后不良,并伴隨SETD2基因的突變,其風(fēng)險(xiǎn)特征與染色體缺失呈正相關(guān),但染色體缺失或突變可能影響調(diào)控免疫的基因,有待進(jìn)一步驗(yàn)證;此外,高風(fēng)險(xiǎn)組CD8+和CD4+T細(xì)胞浸潤(rùn)程度明顯增加,腫瘤微環(huán)境中PD-L2、PD-L1、PD-1和細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞相關(guān)蛋白-4(cytotoxic T-lymphocyte-associated protein 4,CTL-4)的表達(dá)明顯升高。因此,雖然T細(xì)胞在乳頭狀腎細(xì)胞癌微環(huán)境中呈高水平浸潤(rùn),但PD-1或 CTL-4介導(dǎo)的抑制途徑可能抑制了T細(xì)胞的功能。由此可見,高風(fēng)險(xiǎn)組患者更有可能受益于針對(duì)PD-1和CTLA4的免疫檢查點(diǎn)阻斷治療,故可將其應(yīng)用于乳頭狀腎細(xì)胞癌的診斷、免疫治療及預(yù)后。

        目前對(duì)SETD2基因的結(jié)構(gòu)已有一定的認(rèn)識(shí),但其下游細(xì)胞通路的調(diào)控仍不明確。由于化療不敏感以及耐藥性等問題,有必要加深對(duì)腎癌微環(huán)境的研究。細(xì)胞周期蛋白依賴性激酶1(cyclin-dependent kinase 1,CDK1)-細(xì)胞周期蛋白B1(cyclin B1,CCNB1)復(fù)合物是細(xì)胞周期調(diào)控的關(guān)鍵分子。Li等[7]的分析發(fā)現(xiàn),SETD2缺失腎癌細(xì)胞系中的Polo樣激酶1-CDK1/CCNB1調(diào)控通路被異常激活,且Polo樣激酶1作為潛在的腫瘤靶點(diǎn),其上調(diào)可刺激下游靶點(diǎn)CKD1的染色質(zhì)定位,從而使SETD2缺失的細(xì)胞增殖減少,而這種減少可通過CDK1的消耗進(jìn)行拮抗。

        2.3SETD2基因與腎癌的DNA損傷修復(fù) DNA損傷修復(fù)在腫瘤進(jìn)程中起重要作用。Na等[31]通過分析腫瘤基因組圖譜數(shù)據(jù)庫(kù)中的腎癌樣本發(fā)現(xiàn),腎癌患者的DNA損傷修復(fù)通路存在變化,特別是局限性晚期腎透明細(xì)胞癌,此類患者的無(wú)病生存期縮短,復(fù)發(fā)率升高。Kanu等[32]對(duì)SETD2缺失型腎癌的研究表明,雙等位基因SETD2突變與腎透明細(xì)胞癌中的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性無(wú)關(guān)。腎透明細(xì)胞癌中,SETD2的缺失揭示了異常、減少的核小體壓縮以及染色質(zhì)相關(guān)的關(guān)鍵復(fù)制蛋白染色體維持復(fù)合物7(minichromosome maintenance complex component 7,MCM7)和DNA聚合酶δ阻礙復(fù)制叉的進(jìn)展,在DNA斷裂時(shí)不能加載晶狀體上皮來(lái)源的生長(zhǎng)因子和Rad51同源重組修復(fù)因子。此外,SETD2野生型腎透明細(xì)胞癌染色體斷點(diǎn)位置偏離H3K36me3位點(diǎn),H3K36me3陰性腎透明細(xì)胞癌患者體內(nèi)表現(xiàn)出更明顯的DNA損傷修復(fù),表明SETD2通過穩(wěn)定核小體、抑制復(fù)制應(yīng)激和協(xié)調(diào)DNA修復(fù)來(lái)維持基因組完整性,有助于理解基因組不穩(wěn)定性中染色質(zhì)調(diào)節(jié)的意義。

        3 SETD2基因與腎癌患者的預(yù)后和鑒別診斷

        用于腎癌治療的靶向藥物——酪氨酸激酶抑制劑(舒尼替尼,索拉非尼等)已在北美、歐洲、亞洲國(guó)家上市,但其治療轉(zhuǎn)移性腎癌的效果有限。Wang等[33]對(duì)腎癌樣本的分析發(fā)現(xiàn),SETD2低表達(dá)腎癌樣本更易出現(xiàn)更高級(jí)別的腫瘤核分級(jí),出現(xiàn)除肺臟以外的其他器官轉(zhuǎn)移以及多器官轉(zhuǎn)移。與SETD2低表達(dá)相比,酪氨酸激酶抑制劑治療SETD2高表達(dá)樣本的效果更好。因此,經(jīng)酪氨酸激酶抑制劑治療的SETD2低表達(dá)轉(zhuǎn)移性腎癌患者的預(yù)后較差。

        2012年國(guó)際泌尿病理學(xué)會(huì)腎腫瘤共識(shí)會(huì)議提出了低度惡性潛能多房囊性腎腫瘤(mutilocular cystic renal cell neoplasm of low malignant potential,MCRCNLMP)的概念,其遺傳和組織病理學(xué)特征與腎透明細(xì)胞癌相似,但具有良性特征,無(wú)復(fù)發(fā)或進(jìn)展,故兩者預(yù)后完全不同[34-35]。目前主要依靠病理學(xué)手段對(duì)MCRCNLMP和腎透明細(xì)胞癌進(jìn)行鑒別,但對(duì)于明確區(qū)分MCRCNLMP和腎透明細(xì)胞癌伴囊性變(clear cell renal cell carcinoma with cystic change,ccRCCCC)的形態(tài)學(xué)和組織學(xué)特征尚不清楚。Kim等[36]用基因測(cè)序等方法對(duì)臨床標(biāo)本進(jìn)行研究分析,最終篩選出包括SETD2在內(nèi)的6個(gè)靶基因,發(fā)現(xiàn)只有ccRCCCC中的SETD2基因變化較MCRCNLMP中更常見,說(shuō)明SETD2基因可能是良性MCRCNLMP轉(zhuǎn)化為惡性ccRCCCC的關(guān)鍵基因之一。在所有入組ccRCCCC患者中,賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶2C均存在改變,且該基因在大多數(shù)MCRCNLMP患者中陽(yáng)性表達(dá)。SETD2和賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶2C基因在腎癌發(fā)生發(fā)展以及表觀遺傳學(xué)調(diào)控方面的作用及其相關(guān)聯(lián)系有待于進(jìn)一步驗(yàn)證,該研究樣本量有限,研究結(jié)果存在一定局限性,但可為兩種腫瘤的表觀遺傳學(xué)方面的鑒別診斷、腎癌的良惡性及其相互轉(zhuǎn)變的研究提供新思路。

        4 小 結(jié)

        SETD2基因突變存在于各種實(shí)體腫瘤及非實(shí)體腫瘤中。近年來(lái),表觀遺傳學(xué)研究的進(jìn)展使腎癌的診斷、治療水平不斷提高,患者預(yù)后明顯改善?,F(xiàn)代臨床科研及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)的水平可為患者提供更廣泛和更為有效的治療手段,從而避免以往治療過程中患者的一些不良反應(yīng)和毒性,提供更多治療選擇。Li等[7]的研究表明,SETD2至少通過4種途徑促進(jìn)惡性腫瘤的發(fā)生和發(fā)展:①抑制DNA修復(fù)以及干擾基因組的穩(wěn)定性;②改變細(xì)胞代謝;③癌癥相關(guān)基因的異常激活;④細(xì)胞周期過程的失調(diào)。SETD2可能有一定抑癌作用,可能作為一種降低靶向治療耐藥的生物標(biāo)志物及腎癌治療的潛在靶點(diǎn),以促進(jìn)個(gè)體化治療,提高患者生存率。

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