曾文婷 覃紹敏 吳健敏* 梁小莉 白安斌 劉金鳳 陳鳳蓮 秦樹(shù)英 馬 玲
(1.廣西大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,南寧 530004;2.廣西壯族自治區(qū)獸醫(yī)研究所,廣西獸醫(yī)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南寧 530001;3.廣西農(nóng)業(yè)職業(yè)技術(shù)學(xué)院動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,南寧 530007)
纖維素是植物中主要的多糖化合物[1],廣泛存在于秸稈、稻草、谷物、豆類(lèi)、麥類(lèi)及其加工產(chǎn)品等動(dòng)物飼料中[2]。然而,植物細(xì)胞壁的復(fù)雜結(jié)構(gòu)嚴(yán)重阻礙了富含纖維素的植物在畜牧業(yè)生產(chǎn)中的應(yīng)用[3],為了解決這一問(wèn)題,常使用纖維素酶將植物細(xì)胞壁等植物纖維降解為葡萄糖,以提高其利用率和轉(zhuǎn)化率。微生物是纖維素酶的主要來(lái)源,據(jù)不完全統(tǒng)計(jì),迄今為止,國(guó)內(nèi)外共報(bào)道了約53個(gè)屬的幾千個(gè)菌株可產(chǎn)纖維素酶,包括細(xì)菌、真菌、放線菌等[4]。幾乎所有哺乳動(dòng)物,包括草食性哺乳動(dòng)物,自身不能產(chǎn)生纖維素酶,而是依靠腸道微生物的幫助來(lái)消化纖維素,因此,哺乳動(dòng)物腸道中有豐富的纖維素降解菌資源。此外,動(dòng)物來(lái)源的纖維素降解菌在粗纖維飼料應(yīng)用上有天然的優(yōu)勢(shì),其大多是腸道固有菌,較容易適應(yīng)畜禽體內(nèi)的腸道內(nèi)環(huán)境并發(fā)揮作用。因此,從動(dòng)物腸道中篩選獲得有效的纖維素降解菌,對(duì)粗纖維飼料的開(kāi)發(fā)利用具有重要意義。
動(dòng)物源纖維素降解菌的研究主要集中在植食性動(dòng)物上,其腸道和糞便是纖維素降解菌的重要來(lái)源,研究表明,反芻動(dòng)物瘤胃中存在的白色瘤胃球菌(Ruminococcusalbus)、黃色瘤胃球菌(Ruminococcusflavefaciens)和產(chǎn)琥珀酸絲狀桿菌(Fibrobactersuccinogenes)是公認(rèn)的瘤胃三大優(yōu)勢(shì)纖維素降解菌[5];何靜等[6]在雙峰駝的瘤胃內(nèi)容物中分離獲得1株纖維素降解菌,該菌株能明顯分解纖維素。此外,在大熊貓[7-8]、豬[9]等雜食性動(dòng)物的糞便或腸道中也分離到了產(chǎn)纖維素酶的細(xì)菌,這些細(xì)菌普遍集中在瘤胃球菌屬、梭菌屬、擬桿菌屬、普雷沃氏菌屬、纖維桿菌屬、芽孢桿菌屬和毛螺旋菌屬。
竹鼠(Rhizomys)又稱(chēng)竹鼬、竹根鼠、芒貍等,是一種皮肉兼用且營(yíng)養(yǎng)和藥用價(jià)值較高的珍貴特種動(dòng)物[10]。竹鼠以采食植物性食物為主,對(duì)粗纖維和木質(zhì)素的消化率較高,耐粗飼,是所有飼養(yǎng)動(dòng)物中粗纖維利用率最高的動(dòng)物,并且是唯一和大熊貓類(lèi)似,能在腸道中高效降解纖維素的單胃哺乳動(dòng)物。研究表明,大熊貓?bào)w內(nèi)并不存在編碼纖維素酶的基因,而是依靠腸道內(nèi)微生物進(jìn)行食物中纖維素的降解[11]。雖然未見(jiàn)對(duì)竹鼠進(jìn)行全基因組測(cè)序的報(bào)道,但可以推測(cè),竹鼠腸道內(nèi)微生物對(duì)食物中纖維素的降解應(yīng)該起到了關(guān)鍵的作用。目前,從竹鼠體內(nèi)分離纖維素降解菌的研究鮮有報(bào)道,僅寧俊平[12]從竹鼠體內(nèi)分離到7株兼性厭氧的纖維素降解菌以及曹曉燕[13]從竹鼠體內(nèi)分離到2株具有纖維素酶活性的嚴(yán)格厭氧的細(xì)菌,證實(shí)竹鼠體內(nèi)也存在能分解纖維素的細(xì)菌。上述研究均集中在對(duì)厭氧菌的分離。本試驗(yàn)改進(jìn)傳統(tǒng)的纖維素降解菌初篩方法,旨在從竹鼠腸道內(nèi)容物中篩選獲得具有較高纖維素酶活性的需氧菌,以期為秸稈、象草等高粗纖維含量飼料的開(kāi)發(fā)利用提供候選菌株。
1.1.1 樣品來(lái)源
廣西桂林市某竹鼠養(yǎng)殖場(chǎng)成年健康竹鼠腸道內(nèi)容物。
1.1.2 主要試劑
革蘭氏染色液、芽孢染色液、莢膜染色液、普通營(yíng)養(yǎng)肉湯培養(yǎng)基、普通營(yíng)養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基、LB液體培養(yǎng)基、LB瓊脂培養(yǎng)基、MRS液體培養(yǎng)基、MRS瓊脂培養(yǎng)基、TSA瓊脂培養(yǎng)基、麥康凱瓊脂培養(yǎng)基、PDA瓊脂培養(yǎng)基為北京陸橋技術(shù)股份有限公司產(chǎn)品,細(xì)菌微量生化管為杭州濱和微生物試劑有限公司產(chǎn)品,細(xì)菌DNA抽提試劑盒為北京康為世紀(jì)公司產(chǎn)品,羧甲基纖維素鈉(CMC-Na)、CMC-Na瓊脂培養(yǎng)基、CMC-Na剛果紅培養(yǎng)基為山東拓普生物科技有限公司產(chǎn)品,DNA Ladder Marker、PCR Mix為T(mén)aKaRa公司產(chǎn)品,微晶纖維素為COOLABER生物科技有限公司產(chǎn)品,D-水楊苷為源葉生物有限公司產(chǎn)品,3,5-二硝基水楊酸(DNS)為國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司產(chǎn)品,其他常規(guī)試劑均為分析純。
1.1.3 培養(yǎng)基及主要溶液
鮮血瓊脂培養(yǎng)基:將無(wú)菌脫纖維羊血按照5%的量加入到冷卻至55~60 ℃的普通瓊脂培養(yǎng)基中,混合后倒入平板中冷卻至室溫。
種子培養(yǎng)基:氯化鈉5 g,牛肉膏5 g,蛋白胨10 g,蒸餾水1 000 mL,自然pH。
發(fā)酵培養(yǎng)基:CMC-Na/微晶纖維素/D-水楊苷10 g,磷酸氫二鉀1 g,硫酸鎂0.5 g,硫酸銨2 g,氯化鈉2.5 g,酵母粉2.5 g,蛋白胨5 g,蒸餾水1 000 mL,自然pH。
濾紙培養(yǎng)基:濾紙條(每條:1.0 cm×3.6 cm,約0.03 g)5 g,酵母粉2 g,磷酸二氫鉀 0.5 g,硫酸鎂0.5 g,蒸餾水1 000 mL,自然pH。
DNS試劑:稱(chēng)取DNS(10±1) g,置于約600 mL水中,逐漸加入氫氧化鈉10 g,在50 ℃水浴中攪拌溶解,再依次加入酒石酸甲鈉200 g、苯酚(重蒸)2 g和無(wú)水亞硫酸鈉5 g,待全部溶解并澄清后,冷卻至室溫,用水定容至1 L,過(guò)濾。濾液貯存于棕色試劑瓶中,于暗處放置7 d后使用。
稱(chēng)取竹鼠腸道內(nèi)容物1.0 g,轉(zhuǎn)移至盛有100 mL無(wú)菌水的三角瓶中,在80 ℃電熱恒溫振蕩水浴鍋中振蕩30 min,分別取上清液1 mL于LB、MRS和普通營(yíng)養(yǎng)肉湯液體培養(yǎng)基中,37 ℃、220 r/min振蕩培養(yǎng)12 h后,取1 mL發(fā)酵液于裝有9 mL無(wú)菌水的試管中,進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)謩e取10-4、10-5、10-6稀釋液200 μL,分別涂布到LB、MRS、TSA、普通營(yíng)養(yǎng)、麥康凱、CMC-Na、PDA和鮮血瓊脂平板上,每個(gè)稀釋梯度3個(gè)重復(fù),涂布后的平板置于37 ℃恒溫箱培養(yǎng)24 h。
在培養(yǎng)基上,分別挑取單個(gè)不同形態(tài)的菌在平板上劃線純化,直到平板上只有單菌落生長(zhǎng)為止。
將剛果紅平板打孔,孔徑為0.5 cm,對(duì)單個(gè)純化后的菌落進(jìn)行稀釋。用移液槍將其轉(zhuǎn)移到剛果紅平板的孔中,單個(gè)菌落重復(fù)3次,在37 ℃下培養(yǎng)24 h后用游標(biāo)卡尺測(cè)量剛果紅平板上透明圈的直徑,選取透明圈直徑(除去打孔孔徑)(D)與菌落直徑(d)比值(D/d值)較大的菌株進(jìn)行復(fù)篩。
挑取D/d值較大的菌落培養(yǎng),在平板上反復(fù)劃線純化并培養(yǎng)4~5代后,將純化培養(yǎng)后的菌種加甘油于-80 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4.1 發(fā)酵液的制備
取純化培養(yǎng)好的各平板菌種接種于種子培養(yǎng)基,于37 ℃、220 r/min恒溫?fù)u床振蕩培養(yǎng)14~16 h。取液體菌種,按1%的接種量分別接種于以3種底物(CMC-Na、微晶纖維素、D-水楊苷)為碳源的發(fā)酵培養(yǎng)基和濾紙培養(yǎng)基中,于37 ℃、180 r/min恒溫?fù)u床振蕩培養(yǎng)24 h,在8 000 r/min條件下離心5 min,去除菌體,取上清液,得粗酶液[14]。
1.4.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線的繪制
分別吸取不同濃度(0、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5 mg/mL)的葡萄糖標(biāo)準(zhǔn)溶液0.5 mL、緩沖溶液1.5 mL和DNS試劑3 mL于各標(biāo)準(zhǔn)管(每樣做3個(gè)平行)中,混勻。將標(biāo)準(zhǔn)管同時(shí)置于沸水浴中,反應(yīng)10 min。取出,迅速冷卻至室溫,用純水定容至25 mL,蓋塞,混勻。用10 mm比色杯,在分光光度計(jì)波長(zhǎng)540 nm處測(cè)量吸光度(OD)值。以葡萄糖量為橫坐標(biāo),以O(shè)D值為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,獲得線性回歸方程。線性回歸系數(shù)在0.999 0以上時(shí)方可使用。
1.4.3 纖維素酶活性的測(cè)定
內(nèi)切葡聚糖酶(Cen)、外切葡聚糖酶(Cex)、β-葡萄糖苷酶(BG)和濾紙酶(FPA)活性的測(cè)定按李日強(qiáng)等[15]的方法進(jìn)行。分別吸取各菌株粗酶液、緩沖溶液和DNS試劑于各標(biāo)準(zhǔn)管(每樣做3個(gè)平行)中,混勻。將標(biāo)準(zhǔn)管同時(shí)置于沸水浴中,反應(yīng)10 min。取出,迅速冷卻至室溫,用純水定容至25 mL,蓋塞,混勻。用10 mm比色杯,在分光光度計(jì)波長(zhǎng)540 nm處測(cè)量OD值,以滅活后的粗酶液作為空白對(duì)照。以(50.0±0.1) ℃、pH為6.0時(shí)1 min水解纖維素底物產(chǎn)生出相當(dāng)于1 μmol葡萄糖的還原糖量為1個(gè)酶活性單位,以U/mL表示。
1.4.4 培養(yǎng)條件對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響
1.4.4.1 培養(yǎng)時(shí)間對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響
將篩選出的菌株按1%接種量接種于種子培養(yǎng)基,于37 ℃、220 r/min恒溫?fù)u床振蕩培養(yǎng)14~16 h后,得菌株種子液。取100 μL菌株種子液接入20 mL發(fā)酵培養(yǎng)基(pH為7.0)中,于37 ℃、185 r/min恒溫?fù)u床振蕩發(fā)酵培養(yǎng)6、12、24、36、48、60、72 h,測(cè)定其OD600 nm值和FPA活性。
1.4.4.2 pH對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響
將發(fā)酵培養(yǎng)基pH分別調(diào)至3、4、5、6、7、8、9和10,取菌株種子液100 μL接入20 mL發(fā)酵培養(yǎng)基中,于37 ℃、185 r/min恒溫?fù)u床振蕩發(fā)酵培養(yǎng)24 h,測(cè)定其OD600 nm值和FPA活性。
1.4.4.3 溫度對(duì)菌株產(chǎn)酶能力的影響
取菌株種子液100 μL接入20 mL發(fā)酵培養(yǎng)基(pH為7.0)中,分別于30、37、43、50、57、65 ℃,185 r/min恒溫?fù)u床振蕩發(fā)酵培養(yǎng)24 h,測(cè)定其OD600 nm值和FPA活性。
1.5.1 生理生化鑒定
取菌液于普通瓊脂培養(yǎng)基上劃線培養(yǎng),37 ℃下培養(yǎng)24 h觀察菌落形態(tài);采用革蘭氏染色、芽孢染色和莢膜染色法,顯微鏡下觀察菌株形態(tài);參考《常見(jiàn)細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊(cè)》[16]和《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》[17]進(jìn)行生化試驗(yàn),挑取純化培養(yǎng)的單菌落分別接種于生化管中,根據(jù)顏色的變化,判定試驗(yàn)結(jié)果。
1.5.2 分子生物學(xué)鑒定
使用細(xì)菌DNA抽提試劑盒提取細(xì)菌DNA,采用16S rDNA通用引物16sRp1(5′-AGAGTTTGATCATGGCTCAG-3′)和16sRp2(5′-GTGTGACGGGCGGTGTGTAC-3′),預(yù)計(jì)擴(kuò)增長(zhǎng)度1 380 bp,PCR反應(yīng)體系(25 μL)為:上、下游引物(10 μmol/L)各0.5 μL,細(xì)菌基因組(208 ng/μL)3 μL,2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL,ddH2O 8.5 μL。反應(yīng)條件為:94 ℃ 5 min,94 ℃ 30 s,57 ℃ 30 s,72 ℃ 2 min,35個(gè)循環(huán),72 ℃ 10 min。PCR產(chǎn)物送至生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序,在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST比對(duì)。
利用 Excel 2010對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行初步整理,采用SPSS 23.0和GraphPad Prism 7軟件對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析和圖表繪制。
采用LB、MRS、TSA、普通營(yíng)養(yǎng)、麥康凱、CMC-Na、PDA和鮮血瓊脂平板分離獲得10株菌,依此命名為GL1~10。通過(guò)剛果紅培養(yǎng)基上產(chǎn)生透明圈的大小,篩選能降解纖維素的菌株,如圖1所示,GL-4、GL-5、GL-6和GL-8具有一定的產(chǎn)纖維素酶活性,其中GL-4的透明圈最大,直徑為23.54 mm;GL-6的透明圈最小,直徑為12.49 mm。
圖1 剛果紅培養(yǎng)基上形成的透明圈
通過(guò)測(cè)量透明圈直徑和菌落直徑,計(jì)算得出D/d值,詳見(jiàn)表1。由表中數(shù)據(jù)可知GL-4的D/d值最大,為3.45±0.05;GL-6的D/d值最小,為1.85±0.06。
表1 D/d值結(jié)果
在篩選出的4株纖維素降解菌GL-4、GL-5、GL-6和GL-8中,GL-4的Cen和FPA活性最高,分別為49.32和25.13 U/mL;GL-8的Cex活性最高,為30.59 U/mL;GL-5的BG活性最高,為35.08 U/mL(圖2)。
圖2 纖維素酶活性測(cè)定結(jié)果
選擇產(chǎn)CMC和FPA活性最高的菌株GL-4進(jìn)行最佳培養(yǎng)條件篩選。
溫度對(duì)產(chǎn)酶能力的影響見(jiàn)圖3-a。GL-4的生長(zhǎng)性能(OD600 nm)和產(chǎn)酶能力(FPA活性)在30~37 ℃時(shí)隨溫度升高而升高,在37~57 ℃時(shí)隨溫度升高而急劇降低,在57 ℃時(shí)菌株不再生長(zhǎng)和產(chǎn)酶。上述結(jié)果說(shuō)明菌株GL-4產(chǎn)纖維素酶的最適溫度為37 ℃。
培養(yǎng)時(shí)間對(duì)產(chǎn)酶能力的影響見(jiàn)圖3-b。對(duì)于GL-4,0~6 h是生長(zhǎng)調(diào)整期,6~36 h是對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,36~48 h是穩(wěn)定期,48 h后進(jìn)入衰亡期。發(fā)酵時(shí)間在0~24 h時(shí),GL-4的產(chǎn)酶能力隨發(fā)酵時(shí)間的延長(zhǎng)而升高,并在24 h時(shí)達(dá)到頂峰,之后產(chǎn)酶能力隨發(fā)酵時(shí)間的延長(zhǎng)逐步降低,所以菌株GL-4的最佳培養(yǎng)時(shí)間為24 h。培養(yǎng)時(shí)間在0~24 h時(shí),生長(zhǎng)曲線與FPA活性活性曲線的變化呈正相關(guān),培養(yǎng)24 h之后,2個(gè)曲線的變化沒(méi)有明顯的相關(guān)性。
圖3 不同培養(yǎng)條件對(duì)菌株生長(zhǎng)和產(chǎn)酶能力的影響
pH對(duì)產(chǎn)酶能力的影響見(jiàn)圖3-c。當(dāng)發(fā)酵培養(yǎng)基的pH為3~4時(shí),GL-4的生長(zhǎng)性能和產(chǎn)酶能力隨著pH的升高而升高;在pH為4~6時(shí),隨pH的升高稍微有所降低;之后又隨著pH的升高而升高,在pH為8時(shí)達(dá)到峰值;當(dāng)pH達(dá)到9時(shí),菌株失活而無(wú)法產(chǎn)生纖維素酶。結(jié)果顯示,菌株GL-4在弱堿性的環(huán)境下能很好的生長(zhǎng)和產(chǎn)酶,其產(chǎn)纖維素酶的最適pH為8。
選擇D/d值較大,且產(chǎn)纖維素酶活性較高的菌株GL-4、GL-5和GL-8進(jìn)行鑒定。
2.4.1 形態(tài)學(xué)鑒定
3株菌在普通瓊脂培養(yǎng)基平板上的形態(tài)學(xué)鑒定結(jié)果(表2)顯示,GL-4和GL-8菌落形態(tài)相似,呈邊緣整齊、表面光滑凸起的圓形菌落;鏡檢結(jié)果(表2、圖4)顯示,3株菌均為革蘭氏陽(yáng)性短桿菌。
表2 菌株的形態(tài)結(jié)構(gòu)
圖4 GL-4的顯微形態(tài)
2.4.2 生化鑒定
生化鑒定結(jié)果見(jiàn)表3。3株菌的生化試驗(yàn)結(jié)果大致相似,均能利用明膠、葡萄糖、蔗糖、淀粉和過(guò)氧化氫,分解糖類(lèi)產(chǎn)生乙酰基甲醇,不能利用木糖、阿拉伯糖、吲哚、硝酸鹽和枸櫞酸鹽,不能分解糖類(lèi)產(chǎn)酸。另外,3株菌中僅GL-8可利用甘露醇。生化試驗(yàn)結(jié)果符合芽孢桿菌的生化特性,初步確定3株菌均為枯草芽孢桿菌。
表3 生化鑒定結(jié)果
續(xù)表3項(xiàng)目 Items菌株 StrainsGL-4GL-5GL-8甘露醇 Mannitol--+枸櫞酸鹽 Citrate---乙酰甲基甲醇 V.P. +++甲基紅 MR-VP---淀粉 Starch+++過(guò)氧化氫 H2O2+++
2.4.3 16S rDNA鑒定
采用PCR方法擴(kuò)增菌株GL-4、GL-5和GL-8的16S rDNA序列,將克隆測(cè)序后序列進(jìn)行BLAST比對(duì),并用MEGA 7.0軟件構(gòu)建16S rDNA的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)。BLAST比對(duì)結(jié)果顯示,GL-4、GL-5和GL-8的16S rDNA基因與枯草芽孢桿菌的基因序列一致性均大于98%。使用MEGA 7.0軟件進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析,結(jié)果顯示,GL-4、GL-5和GL-8分別位于3個(gè)不同的枯草芽孢桿菌分支(圖5),表明這3株菌均為枯草芽孢桿菌,與生理生化鑒定結(jié)果一致。
Bacillus sp.:芽孢桿菌屬;Bacteria:細(xì)菌;Uncultured Bacillus sp. clone RB-77:不可培養(yǎng)芽孢桿菌克隆 RB-77;Bacillus subtilis:枯草芽孢桿菌;Bacillus subtilis subsp.:枯草芽孢桿菌亞種;Bacillus cereus:蠟樣芽孢桿菌;Bacillus tequilensis:特基拉芽孢桿菌;Bacillus licheniformis:地衣芽孢桿菌;Bacillus pumilus:短小芽孢桿菌;Bacillus anthracis:炭疽芽孢桿菌;strain:菌株。
剛果紅染色法是用于纖維素降解菌初篩的經(jīng)典方法,Ghezelbash等[18]采用的傳統(tǒng)剛果紅染色法是先在平板上培養(yǎng)細(xì)菌,再用剛果紅進(jìn)行染色,這個(gè)方法在用氯化鈉進(jìn)行清洗的過(guò)程中容易產(chǎn)生菌落脫落現(xiàn)象,造成菌落之間發(fā)生混雜,導(dǎo)致無(wú)法獲得準(zhǔn)確結(jié)果,且該方法操作繁瑣,不利于細(xì)菌的大量篩選。本研究對(duì)該方法進(jìn)行了部分改進(jìn),在制備平板時(shí)即加入剛果紅,并在平板上進(jìn)行打孔,然后將菌落稀釋后加入孔內(nèi),繼續(xù)培養(yǎng)24 h即可測(cè)量透明圈直徑。整個(gè)過(guò)程不需要對(duì)平板進(jìn)行清洗,克服了傳統(tǒng)方法的不足,試驗(yàn)結(jié)果更加準(zhǔn)確,且操作簡(jiǎn)便。本研究通過(guò)改進(jìn)的剛果紅染色法從竹鼠腸道內(nèi)容物中初步篩選獲得4株纖維素降解菌,通過(guò)測(cè)定纖維素酶活性,最終獲得3株產(chǎn)纖維素酶活性較強(qiáng)的菌株GL-4、GL-5和GL-8,經(jīng)鑒定均為枯草芽孢桿菌。GL-4的纖維素酶總活性高于寧俊平[12]和曹曉燕[13]在竹鼠腸道內(nèi)分離出的酪酸梭狀芽孢桿菌、沙雷氏菌、肺炎克伯雷氏菌等厭氧菌,其中最高的Cen活性為0.502 9 U/mL;也高于沈琦等[19]和樊程等[8]分別在豬和大熊貓的糞便中分離的解淀粉芽胞桿菌,前者Cen活性為7.64 U/mL,后者FPA活性為0.228 3 U/mL。
纖維素酶降解纖維素的過(guò)程被認(rèn)為是3種酶協(xié)同作用的結(jié)果,有觀點(diǎn)認(rèn)為,纖維素酶發(fā)揮作用首先由Cen在纖維素分子內(nèi)部的無(wú)定形區(qū)進(jìn)行酶切產(chǎn)生新的末端,然后由Cex以纖維二糖為單位從末端進(jìn)行水解,每次切下1個(gè)纖維二糖分子,最后由BG將纖維二糖以及短鏈的纖維寡糖水解為葡萄糖。纖維素酶的3種組分作用的底物不同,Cen的水解底物包括羧甲基纖維素和磷酸溶脹纖維素等無(wú)定形纖維素;Cex的水解底物包括棉纖維和微晶纖維素等結(jié)晶度較高的纖維素;BG的水解底物是纖維寡糖和纖維二糖[20]。本試驗(yàn)對(duì)初篩菌株的3種纖維素酶和總酶(FPA)的活性均進(jìn)行了測(cè)定,能全面評(píng)估菌株的纖維素降解能力,結(jié)果顯示GL-4的FPA和Cen活性最高,說(shuō)明該菌株對(duì)于多種成分的纖維素底物和無(wú)定形纖維素底物有較強(qiáng)的降解解能力;GL-8的Cex活性最高,說(shuō)明該菌株對(duì)葡聚糖和纖維二糖有較強(qiáng)的降解解能力;GL-5的BG活性最高,說(shuō)明該菌株對(duì)纖維寡糖和纖維二糖的降解能力較強(qiáng)。因此,在后續(xù)的應(yīng)用研究中,可根據(jù)不同的發(fā)酵原料,選擇其中的1個(gè)或多個(gè)菌株混合使用,達(dá)到最佳的纖維素降解效果。
根據(jù)本試驗(yàn)中纖維素酶活性測(cè)定結(jié)果可知,不同菌株所產(chǎn)纖維素酶活性存在差異,同一株菌所產(chǎn)纖維素酶活性在不同碳源存在時(shí)也存在差異,本研究獲得的菌株GL-4是目前竹鼠源分離菌中產(chǎn)纖維素酶活性最強(qiáng)的細(xì)菌,對(duì)常見(jiàn)的4種纖維素底物均有較好的降解能力。
纖維素降解菌的產(chǎn)酶能力受到培養(yǎng)條件的影響,培養(yǎng)基的pH和培養(yǎng)溫度的改變均影響菌株的生長(zhǎng),從而間接影響產(chǎn)酶能力,在強(qiáng)酸強(qiáng)堿和高溫條件下,菌株無(wú)法生長(zhǎng)及產(chǎn)酶。根據(jù)本研究結(jié)果,培養(yǎng)時(shí)間在0~24 h時(shí),菌株GL-4的生長(zhǎng)與產(chǎn)酶能力呈正相關(guān),即隨著菌量的增加,產(chǎn)酶量也隨之增加,并且在培養(yǎng)24 h時(shí)達(dá)到最高,24 h后,菌株依然處于對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期,但產(chǎn)酶能力卻不再升高,直到48 h后,兩者又重新呈正相關(guān)。出現(xiàn)這種現(xiàn)象的可能原因如下:1)GL-4的生長(zhǎng)曲線與殷曉敏等[21]的研究大致相同,但其對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期持續(xù)時(shí)間較長(zhǎng),達(dá)30 h,在24 h后隨著菌株生長(zhǎng)代謝的增強(qiáng),培養(yǎng)基中的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)不斷被消耗,菌株死亡率上升,產(chǎn)酶量下降;2)GL-4對(duì)溫度的變化較敏感,除37 ℃培養(yǎng)外,在其他溫度培養(yǎng)24 h后,其產(chǎn)酶能力均不高,在細(xì)菌發(fā)酵培養(yǎng)過(guò)程中的溫度升高可能也會(huì)導(dǎo)致纖維素酶活性的降低,這與菌株的熱穩(wěn)定性有關(guān)[22];3)GL-4在pH為4~8時(shí),其所產(chǎn)纖維素酶活性一直保持較高狀態(tài),但當(dāng)培養(yǎng)基pH離開(kāi)這個(gè)區(qū)間后,纖維素酶活性急劇下降,根據(jù)劉陽(yáng)等[23]的研究,枯草芽孢桿菌在發(fā)酵時(shí)會(huì)產(chǎn)生乳酸,從發(fā)酵開(kāi)始分泌直至48 h到達(dá)峰值,乳酸的生成導(dǎo)致培養(yǎng)基的pH發(fā)生改變,從而使纖維素酶活性發(fā)生改變。本研究中,GL-4在培養(yǎng)基pH為4~8時(shí),纖維素酶活性均較高,這與Irfan等[24]的研究結(jié)果一致,說(shuō)明芽孢桿菌的產(chǎn)酶能力在一定pH范圍內(nèi)保持穩(wěn)定。本試驗(yàn)中GL-4的最適pH為8,與崔海洋等[25]的研究結(jié)果一致。
本研究?jī)H改變單一條件來(lái)分析培養(yǎng)條件對(duì)GL-4產(chǎn)酶能力的影響,未考慮各培養(yǎng)條件間相互影響的情況,有一定的局限性。柴秀娟等[26]采用響應(yīng)曲面回歸分析法對(duì)菌株進(jìn)行產(chǎn)酶條件優(yōu)化,優(yōu)化效果明顯。響應(yīng)曲面回歸分析法是一種通過(guò)對(duì)影響過(guò)程的因子及其交互作用進(jìn)行評(píng)價(jià)來(lái)優(yōu)化過(guò)程的有效方法[27],可以彌補(bǔ)傳統(tǒng)單因素變量?jī)?yōu)化試驗(yàn)的不足。下一步,我們將使用響應(yīng)曲面法進(jìn)一步優(yōu)化產(chǎn)酶條件,使分離菌株更好的在飼料發(fā)酵中發(fā)揮作用。
① 本試驗(yàn)從竹鼠腸道內(nèi)容物中獲得了3株纖維素降解菌——GL-4、GL-5和GL-8,經(jīng)形態(tài)特征、生化特性和分子生物學(xué)鑒定,確定均為枯草芽孢桿菌。
② 3株纖維素降解菌所產(chǎn)纖維素酶的活性有一定差異,GL-4的D/d值最大,為3.45±0.05,其Cen和FPA活性最高,分別為49.32和25.13 U/mL;GL-8的Cex活性最高,為30.59 U/mL;GL-5的BG活性最高,為35.08 U/mL。
③ 對(duì)GL-4進(jìn)行培養(yǎng)條件優(yōu)化,該菌株具有培養(yǎng)pH范圍廣和耐高溫的特點(diǎn),在培養(yǎng)基pH為3~8、溫度為50 ℃時(shí)仍具有產(chǎn)酶能力。該菌株產(chǎn)酶的最適條件為發(fā)酵時(shí)間24 h、發(fā)酵培養(yǎng)基pH 8和發(fā)酵溫度37 ℃,是一株可用作粗纖維飼料添加劑的優(yōu)良候選菌株。
動(dòng)物營(yíng)養(yǎng)學(xué)報(bào)2021年7期