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        基于骨振信號和深度網(wǎng)絡的膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查方法

        2021-07-22 01:50:30鄭田田周海天宋江玲
        西北大學學報(自然科學版) 2021年4期
        關(guān)鍵詞:退行性頻域篩查

        鄭田田,周海天,宋江玲,張 瑞

        (1.西北大學 醫(yī)學大數(shù)據(jù)研究中心, 陜西 西安 710127;2.華南理工大學 電子與信息學院,廣東 廣州 510641)

        膝關(guān)節(jié)退行性病變(knee osteoarthritis,KOA)是一種由于關(guān)節(jié)軟骨變性和破環(huán)[1]、軟骨下骨增生而導致膝關(guān)節(jié)發(fā)生不可逆損傷的一種慢性進展性疾病。導致KOA的因素復雜繁多,如過大的機械載荷、年齡增長、生活中的不良姿勢和習慣[2-3]等。臨床表現(xiàn)主要為膝關(guān)節(jié)紅腫僵硬、活動受限,伴隨嚴重疼痛感,疾病后期會出現(xiàn)關(guān)節(jié)脫位,甚至引發(fā)殘疾[4]。

        據(jù)統(tǒng)計,目前我國KOA患者超過人口總數(shù)的10%[5],其中60歲以上人群的發(fā)病率為50%[6]。KOA已成為影響中老年人生活質(zhì)量和心理健康的主要疾病之一[5],此外,研究表明,KOA的發(fā)生呈年輕化趨勢[7]。因此,若能在病變初期對KOA進行有效診斷,并及時采取相應管理和控制措施,則可在很大程度上避免患者病情進一步加重,陷入半殘疾、甚至殘疾的生活狀態(tài)。

        目前,對KOA的臨床檢測主要是醫(yī)生通過對KOA患者的影像學檢查結(jié)果進行視覺分析完成。如醫(yī)生可通過X射線檢查膝關(guān)節(jié)是否存在骨質(zhì)增生[8],通過核磁共振(MRI)檢測膝關(guān)節(jié)軟骨是否存在不規(guī)則、邊界不清晰等異常[9],或通過多普勒超聲檢查膝關(guān)節(jié)半月板血流及形態(tài),進而給出相應診斷結(jié)果[10]。但這些檢查手段均存在一定的局限性:如X射線、多普勒超聲對人具有一定傷害,無法長期使用;多普勒超聲與MRI的檢查時間長、價格昂貴;上述設備均對環(huán)境要求較高,無法日常使用。且KOA在發(fā)病初期,由于關(guān)節(jié)病變范圍小、程度輕、癥狀不明顯,上述檢查手段幾乎無法得到顯著的病理信息,這使得早期篩查變得十分困難,易出現(xiàn)延誤就診。因此,需要一種更為便捷準確、價格低廉、無創(chuàng)無害的檢測手段。

        關(guān)節(jié)摩擦音[11],又稱為骨振信號(vibroarthrographic signal,VAG),有可能為實現(xiàn)早期篩查提供一種新的途徑。VAG信號是膝關(guān)節(jié)在活動過程中髕骨和股骨的關(guān)節(jié)軟骨摩擦音。由于KOA患者存在軟骨退化損傷和骨質(zhì)增生,其髕股之間的摩擦相較正常人更大,故VAG信號能夠有效反映KOA的發(fā)展情況。鑒于此,從VAG信號出發(fā),基于信號處理和機器學習方法實現(xiàn)對KOA的自動檢測越來越受到廣大學者的關(guān)注。

        基于VAG信號的KOA自動檢測方法本質(zhì)是一個模式識別問題,即從VAG信號中提取恰當特征,訓練分類器完成正常VAG信號與膝關(guān)節(jié)退行性病變VAG信號(KOA-VAG)的分類。早在1997年,Rangayyan提出以極值點個數(shù)和倒譜系數(shù)為特征,結(jié)合Logistic回歸分析實現(xiàn)KOA的檢測[12]。其后,從時域角度提取信號及其導數(shù)的方差、偏度、峰度和熵等統(tǒng)計指標,并采用徑向基神經(jīng)網(wǎng)絡完成KOA的檢測[13]。另有基于概率密度函數(shù)的Kullback-Leibler距離[14]、變異參數(shù)[15]等特征被相繼提出。從時頻角度,如基于短時傅里葉變換的頻譜局部極大值的平均值、個數(shù)[16],基于小波包變換的相關(guān)指數(shù)、節(jié)點能量和方差[17],基于MP稀疏分解的能量和能量擴散指標[18]等特征提取方法也可用于KOA檢測。此外,B?czkowicz于2015年提出了與患者年齡相關(guān)的生理特征對于有效檢測KOA具有重要意義[19]。一方面這些方法均需要人為設計特征,而構(gòu)造泛化能力較強的特征需要經(jīng)過大量實驗,過程耗時;另一方面,現(xiàn)有工作大部分針對是否患病進行檢測,而很少聚焦于KOA的早期篩查。

        深度學習是一種具有層級結(jié)構(gòu)的學習算法[20],近年來,這一技術(shù)因強大的特征自主學習能力與完整的端到端學習策略,在各個領(lǐng)域得到了廣泛應用[21-22]?;诖?本文從深度學習角度出發(fā),結(jié)合VAG信號與卷積神經(jīng)網(wǎng)絡提出了一種新的膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查方法。首先,結(jié)合自動裁剪、補零處理、白化處理等方法對VAG信號進行信號對齊與去相關(guān)等預處理;其次,采用Fourier變換對VAG信號進行頻域轉(zhuǎn)換,從VAG信號頻域角度出發(fā),基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡框架設計了一種KOA早期篩查方法;最后,結(jié)合772條臨床采集的VAG信號驗證所提方法的可行性與有效性。

        1 基于CNN模型的膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查方法

        1.1 卷積神經(jīng)網(wǎng)絡

        卷積神經(jīng)網(wǎng)絡是Hubel和Wiesel于20世紀60年代提出的一種以卷積運算為基礎的前饋神經(jīng)網(wǎng)絡,主要受到大腦視覺皮層神經(jīng)元機制的啟發(fā),即只對特定區(qū)域的刺激做出響應。卷積神經(jīng)網(wǎng)絡在傳統(tǒng)網(wǎng)絡的基礎上引入局部連接、權(quán)值共享的運算模式,大大降低了網(wǎng)絡運算復雜度。卷積神經(jīng)網(wǎng)絡框架包含卷積層、池化層和全連接層三種層級結(jié)構(gòu)。

        1)卷積層

        卷積層(convolutional layer,conv)主要通過引入卷積核(卷積算子)對信號的局部特征進行提取[20],其計算公式如下

        y=f(W*x+b)。

        (1)

        其中:x為卷積層的輸入向量;W為卷積核的權(quán)重矩陣;b為偏置向量,*表示卷積運算,y為卷積層的輸出向量;f為激活函數(shù),常用的激活函數(shù)包括sigmoid、tanh、relu等。由式(1)知,輸入x通過與不同維度的卷積核權(quán)重矩陣W進行卷積,實現(xiàn)信號在不同尺度上的反褶、平移、內(nèi)積、積分等運算,從而提取信號在各尺度上的特征。

        2)池化層

        池化層(pooling layer,pooling)主要通過max函數(shù)或者average函數(shù)舍棄信號中的部分信息。其中,max函數(shù)對應最大池化,average函數(shù)對應平均池化。由于max函數(shù)效率更高,故本文選擇最大池化。最大池化的計算公式為

        (2)

        其中:x為池化層的輸入向量;r為感受野,y為池化層的輸出向量。由式(2)知,感受野值的大小決定了輸入x響應區(qū)域的大小,通過在不同大小的響應區(qū)域上由max函數(shù)舍棄部分信息,增加所提特征的泛化能力。

        3)全連接層

        全連接層(fully connected layer,FC)的主要作用為完成分類任務,其計算公式如下

        y=f(WT·x+b)。

        (3)

        其中:W為連接權(quán)重矩陣;b為偏置向量;(·)表示矩陣乘法運算。

        1.2 基于CNN模型的膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查方法

        VAG信號的頻域特征對于檢測膝關(guān)節(jié)退行性病變具有重要意義。本文首先將VAG信號轉(zhuǎn)換為頻域信號(功率譜與相位譜),進而搭建一個CNN網(wǎng)絡對VAG信號頻域信息進行挖掘(稱之為頻域CNN(frequency domain-CNN,F-CNN)),以完成對KOA的早期篩查。

        1)VAG信號的頻域轉(zhuǎn)換

        (4)

        (5)

        (6)

        為信號Xj的功率譜,

        (7)

        為信號Xj的相位譜。

        2)網(wǎng)絡搭建

        由于VAG信號的功率譜與相位譜存在較多噪聲,因此,在F-CNN的第1層中采用伯努利分布構(gòu)建dropout層,伯努利分布的參數(shù)p即為失活概率,設置為20%。第2層、第4層、第6層、第8層是卷積核大小為9*1的卷積層,用以提取不同尺度與層級的VAG信號頻域特征,并隨著網(wǎng)絡加深,網(wǎng)絡提取到的特征逐漸抽象,其中,卷積核個數(shù)分別為48,96,129,384,卷積步長均為1。為增加網(wǎng)絡泛化能力,分別設第3層、第5層、第7層、第9層是池化核大小為4*1的池化層,其步長均設為4。第10層與第12層為含384個神經(jīng)元的全連接層,用以完成分類任務。為防止過擬合,在全連接層后(即第11層與第13層)增加失活概率為50%的dropout層。最后,增加包含2個神經(jīng)元的輸出層,輸出信號屬于每一類的概率值。F-CNN參數(shù)設置列于表1,圖1描述了F-CNN的網(wǎng)絡結(jié)構(gòu)。

        3)基于CNN模型的膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查方法

        在上述所搭建網(wǎng)絡的基礎上,首先,對數(shù)據(jù)進行自動裁剪與補零、Fourier變換、白化等預處理,然后,采用Fourier變換后的VAG信號基于Adam算法訓練F-CNN網(wǎng)絡,完成KOA的早期篩查;最后,結(jié)合臨床采集的VAG信號驗證所提方法的可行性與有效性。本文所提的基于VAG信號和卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查方法流程圖如圖2所示。

        圖1 本文所提CNN結(jié)構(gòu)Fig.1 The architecture of proposed CNN model

        表1 本文所提F-CNN參數(shù)設置Tab.1 Detailed parameters used for all the layers of proposed F-CNN model

        圖2 基于骨振信號和卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查方法過程示意圖Fig.2 Procedure of early screening of KOA based on VAG and CNN

        2 實驗

        2.1 數(shù)據(jù)來源

        本文實驗數(shù)據(jù)來源于西安市某醫(yī)院骨科的VAG信號數(shù)據(jù)庫,數(shù)據(jù)記錄了受試者在完成3組“蹲下—起立”動作時的關(guān)節(jié)摩擦聲。數(shù)據(jù)庫共包含從2017年10月到2019年09月采集的1 440條VAG信號,其中,正常信號為395條,KOA信號為1 045條,采樣率為10 240 Hz。膝關(guān)節(jié)退行性病變VAG信號根據(jù)Kellgren-Lawrence評級系統(tǒng)[23]進一步分為1~4級。1級代表發(fā)病初期,2~4級代表病變程度逐漸加深。由于發(fā)病初期病變程度較輕,與正常信號極為相似,若能有效區(qū)分這兩類信號,則能在病變早期對患者采取防控措施,有效緩解KOA的進一步加重。因此,本文主要關(guān)注這兩類信號的自動檢測。

        2.2 數(shù)據(jù)預處理

        由于數(shù)據(jù)采集過程中不同受試者在完成“蹲下—起立”動作時所需時間長短不一,此外對于一些特殊患者,其完成3組動作有較大困難,最終只完成了一組,這些均導致每條信號的持續(xù)時長差異較大。圖3展示了實驗數(shù)據(jù)持續(xù)時長的分布,可以看到,信號持續(xù)時長由4s到30s不等。圖4A和4B分別展示了一個正常(0級)的VAG信號與一個1級膝關(guān)節(jié)退行性病變VAG信號的7s片段。

        圖3 信號長度的分布Fig.3 Distribution of the length of signals

        CNN要求輸入數(shù)據(jù)維度必須相等,因此,首先對信號進行自動裁剪與補零預處理,即對較長信號隨機裁剪至13s,對較短信號進行末尾補零,使其為等長信號。

        進一步采用1.2節(jié)所述方法將VAG信號轉(zhuǎn)化為對應的頻域信號,即采用Fourier變換[24]將VAG信號轉(zhuǎn)化為其對應的功率譜與相位譜,最終,將功率譜序列與相位譜序列作為F-CNN的輸入信號。圖4C和4D分別展示了圖4A和4B經(jīng)Fourier變換后的功率譜。

        圖4 0級與1級VAG信號對比Fig.4 Comparison of VAG between level 0 and level 1

        此外,為降低網(wǎng)絡運算復雜度,減小信號相關(guān)性,進一步采用Z-score方法對信號進行白化處理。

        2.3 實驗結(jié)果與分析

        將預處理后所得的772條信號按7∶1.5∶1.5的比例隨機分為訓練集、驗證集和測試集,即訓練集包含540條信號,驗證集包含116條信號,測試集中包含116條信號。網(wǎng)絡的損失函數(shù)設置為交叉熵損失。為了防止過擬合、降低時間成本,采用早停法控制訓練過程,即在網(wǎng)絡進入穩(wěn)定狀態(tài)時立即終止訓練。所提模型在Python3的Keras框架下實現(xiàn),圖5為對應F-CNN訓練損失函數(shù)與準確率的變化曲線,可以看到,網(wǎng)絡在前14個epoch中迅速收斂,損失函數(shù)迅速下降,準確率快速上升,到第14個epoch時損失函數(shù)趨于0,準確率趨于100%,但是在第14個epoch后網(wǎng)絡準確率出現(xiàn)略微下降,即網(wǎng)絡進入震蕩階段,故網(wǎng)絡在第15個epoch停止訓練。數(shù)值實驗中主要采用準確率(accuracy)、靈敏度(sensitivity)、特異性(specificity)以及F1分數(shù)作為性能評價指標,其計算公式如下:

        (8)

        (9)

        (10)

        (11)

        本文所提方法性的準確率、靈敏度、特異性及F1分數(shù)分別為86.20%、88.20%、83.30%與0.88,可以看出,本文方法能較好地實現(xiàn)KOA的早期篩查。最后,將本文所提方法與其他已有關(guān)于KOA自動檢測的方法[25-27]進行比較,結(jié)果如表2所示。從表2中可以看出,相比其他已有方法,本文所提方法的準確率與靈敏度都得到了顯著提高。盡管文獻[25]中所提方法的特異性比本文方法高出了12.4%,這主要是由于文獻[25]聚焦于對正常與KOA患者的檢測,這兩者的差異性明顯大于正常與KOA早期狀態(tài)之間的差異性,因此,更不容易誤檢。值得注意的是,本文研究目標及所用數(shù)據(jù)與文獻[26]均一致,可以看出,即使與最近的早期篩查方法相比,本文所提方法的檢測性能都得到了提升。

        圖5 F-CNN訓練損失函數(shù)和準確率曲線Fig.5 Training loss and accuracy of F-CNN

        表2 本文方法與已有關(guān)于KOA自動檢測方法對比Tab.2 Comparison between the methods of this paper and existing automatic detection methods of KOA

        3 總結(jié)與展望

        本文提出了一種新的用于進行膝關(guān)節(jié)退行性病變早期篩查的方法:基于頻譜分析的CNN模型。首先,對臨床采集的VAG信號進行數(shù)據(jù)預處理;然后,設計基于卷積神經(jīng)網(wǎng)絡的KOA早期篩查方法:F-CNN模型;最后,結(jié)合所采集數(shù)據(jù)驗證本文方法的有效性。實驗結(jié)果表明,本文所提出的F-CNN模型在整體上性能更好,能夠更準確地完成早期篩查任務。但是,如年齡等生理特征對于KOA早期篩查也具有重要意義,因此,下一步研究將考慮聯(lián)合生理特征與VAG信號完成膝關(guān)節(jié)退行性病變的輔助診斷。

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