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        基于網絡藥理學分析當歸補血湯防治放射性心肌損傷的作用機制

        2021-06-26 08:56:52王潔趙信科李應東劉凱
        世界最新醫(yī)學信息文摘 2021年35期
        關鍵詞:甲苷靶點黃芪

        王潔,趙信科,李應東,劉凱*

        (1.甘肅中醫(yī)藥大學,甘肅 蘭州 730000;2.甘肅中醫(yī)藥大學附屬醫(yī)院,甘肅 蘭州 730020)

        0 引言

        當歸補血湯始載于《內外傷辨惑論》,出自金元四大家之一李東垣之手[1],由黃芪和當歸兩味中藥以5∶1比分組成,為補氣生血之基礎方,應用廣泛。黃芪具有益氣固表,托毒排膿之效,正氣得復,毒邪則出,與藥理學研究認為黃芪具有促進NK細胞活性、增強中性粒細胞及巨噬細胞吞噬功能從而提高機體免疫力,并減輕有毒藥物的毒性作用一致[2]。當歸具有補血活血、調經止痛之功,現代實驗研究證明當歸具有改善血液系統(tǒng)活力等作用[3]。方中重用黃芪一為補氣而固表,即“有形之血不能速生,無形之氣所當急固”之理,二為有形之血生于無形之氣,故用黃芪大補脾肺之氣,以資化源,使氣旺血生,配以當歸養(yǎng)血和營,則浮陽斂收,陽生陰長,用于治勞倦內傷,陰血虧虛,陽浮于外之虛熱證。近年來,隨著對當歸補血湯研究的深入,其應用范圍不斷增大,已有文獻證明從當歸補血湯在血液系統(tǒng)[4]、免疫系統(tǒng)、內分泌系統(tǒng)[5]等的運用,其治療心血管疾病主要是集中在抗心力衰竭、抗動脈硬化、抑制心肌細胞凋亡、減輕心肌纖維化[6]等方面。但由于中藥復方有效成分復雜,可以通過多成分、多途徑、多靶點、協(xié)同來發(fā)揮藥效,因此當歸補血湯治療放射性心肌損傷的作用機制仍有待進一步闡明。

        近年來,隨著胸部惡性腫瘤如食管癌、肺癌、乳腺癌、縱隔腫瘤的發(fā)生率不斷增高,胸部放射治療成為其治療的主要治療措施,而鄰近縱隔的心臟在放療時會不可避免地受到影響,引起不同程度的心臟損傷[7-8]。主要包括放射后心包損傷、心肌損傷(radiationinduced heart disease,RIHD) 、冠狀動脈損傷、心臟傳導系統(tǒng)損傷及心臟瓣膜損傷等,統(tǒng)稱為放射性心臟損傷或放射性心臟病[9-10]。研究表明,經放射治療后的腫瘤患者患冠心病、心臟瓣膜病、心包疾病、猝死等疾病的風險增加[11]。傳統(tǒng)醫(yī)學中的未病防治,增強機體正氣,防御外邪是早期防治癌毒的方法,其在腫瘤的早期防治、減輕患者放化療后副作用及改善生活質量方面具有一定的優(yōu)勢,即中醫(yī)所說的減毒增效。

        網絡藥理學是一種基于系統(tǒng)生物學理論分析藥物作用機制的網絡分析方法,具有整體性優(yōu)勢。它旨在從系統(tǒng)生物學、生物網絡平衡的角度解釋疾病的產生及從整體、從分子層面認識藥物的作用機制[12]。中藥復方治療疾病的作用機制十分復雜,具有多成分、多途徑和多靶點等優(yōu)勢,與中醫(yī)的整體觀念相當契合[13]。當前在中醫(yī)藥領域運用網絡藥理學研究中藥復方的作用機制已成為趨勢,大量研究均已取得了優(yōu)秀的成果[14-16]。故本研究基于網絡藥理學研究方法,從分子角度證實當歸活血湯治療RIHD的可能活性成分,為后續(xù)中藥復方的研究、臨床新藥的開發(fā)提供可借鑒的思路與方法。

        1 資料與方法

        1.1 當歸補血湯的成分及作用靶點篩選

        在中藥系統(tǒng)藥理學數據庫與分析平臺網站[17](TCMSP,Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php)分別輸入當歸補血湯所含中藥(當歸、黃芪),獲得中藥成分、口服生物利用度(oral bioavailability,OB)、藥物相似性(drug-likeness,DL)以及作用靶點信息,以OB≥30%,DL≥0.18 作為篩選標準,獲得有效成分。

        1.2 有效成分作用靶點的獲得

        在TCMSP 網站中獲得藥物有效成分的作用靶點,通過Uniprot (https://www.uniprot.org/)平臺校正其名稱,利用SwissTargetPrediction (http://www.swisstargetprediction.ch/) 數據庫[18]進行有效成分作用靶點的補充完善。

        1.3 RIHD疾病靶點的獲得

        在 Therapeutic Target Database[19](TTD,https://db.idrblab.org/ttd/),Drugbank(https://www.drugbank.ca/)等網站共同檢索RIHD相關靶點信息并進行整合。

        1.4 蛋白質相互作用網絡構建

        將篩選后的有效成分所對應的靶點與疾病相關靶點進行匹配,共同靶點在STRING數據庫(https://string-db.org/)中建立蛋白質相互作用PPI網絡。Cytoscape3.2.1[20](http://www.cytoscape.org/)軟件進行當歸活血湯主要有效成分、靶點、通路之間的網絡分析。

        1.5 GO功能富集分析與KEGG通路分析

        采用 Database for Annotation,Visualization and Integrated Discovery v6.8 數 據 庫[21](DAVID,https://david.ncifcrf.gov/)對 PPI 網絡中的蛋白質進行GO生物學功能富集分析和KEGG[22]通路富集分析。

        1.6 成分-靶點-信號通路網絡構建

        將篩選出的當歸補血湯成分與與其相關聯的重要交集蛋白及KEGG 富集出生物通路的相互作用信息,上傳到Cytoscape 3.2.1 軟件中,利用Merge功能構建出成分-靶點-信號通路網絡圖。

        2 結果

        2.1 當歸補血湯有效成分

        在TCMSP數據庫內檢索以OB≥30%,DL≥0.18 的標準進行篩選后共得到 22個有效成分(表 1)。當歸2個,包括β-谷固醇、豆甾醇;黃芪20個,包括黃芪甲苷、異鼠李素和菲-3-酚等。

        2.2 在Cytoscape 3.2.1軟件中導入當歸補血湯的活性成分預測其作用靶標,構建活性成分-心肌損傷靶點網絡圖見圖1。

        如圖1所示,此網絡共包括114個節(jié)點,183個邊。不同的節(jié)點代表當歸補血湯潛在的活性成分與作用靶點。當歸補血湯中共篩選出22個化合物,其中hederagenin、isorhamnetin及isoflavanon等 5個成分在 TCMSP 數據庫中未檢索到相應作用靶點,所以在成分-靶點網絡圖中未顯示。自由度是反映節(jié)點重要性的指標,成分節(jié)點的度越大,表示該成分參與的生物功能越多,生物學重要性越強。對圖1 分析可得出當歸補血湯的重要核心成分包括β-谷固醇(betasitosterol,MOL000358)、豆 甾 醇(Stigmasterol,MOL000449)、黃芪甲苷 (formononetin,MOL000392)等。發(fā)揮作用的重要靶點以3-羥基-3-甲基戊二酰輔酶A還原酶(3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase,HMGCR)、前列腺素 G/H 合成酶 1、2(Prostaglandin G/H synthase 1、2)為主,PTGS1、PTGS2可能是其發(fā)揮藥效的關鍵靶點。

        圖1 當歸補血湯主要活性成分——靶點網絡圖

        2.3 放射后心肌損傷 PPI 網絡

        在CTD、Drugbank數據庫中輸入RIHD名稱,找出相關的蛋白193個,經篩選得出98個與當歸補血湯成分作用靶點相交集蛋白。將相互作用關系數據導入 Cytoscape 3.2.1 軟件,得到蛋白相互作用PPI 網絡,見圖2。圖2中包括98節(jié)點,457條邊,圖中自由度值越大則節(jié)點顏色越深,結果提示當歸補血湯治療RIHD的靶標中自由度值排名前5的靶蛋白為原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src SRC)、前列腺素 G/H 合成酶2(PTGS2)、血清載脂蛋白百度A1(ApoA1)、白介素1β(IL1b)、雌激素受體α蛋白由基因(ESR1)。

        圖2 放射性心肌損傷 PPI網絡圖

        2.4 GO生物過程和KEGG代謝通路富集分析

        2.4.1 GO富集分析

        通過運用 DAVID(https://david.ncifcrf.gov/)平臺,根據P值標準,將104個GO生物過程進行排列,發(fā)現當歸補血湯治療RIHD的作用靶點涉及不同類型的生物學過程。主要涉及蛋白氧化、細胞增殖的正向調節(jié)、水解酶活性的負調控、脂質分解代謝過程的正向調節(jié)、甘油三脂、膽固醇體內平衡、炎癥反應、脂蛋白代謝過程、反向膽固醇運輸、高密度脂蛋白粒子重構、磷脂酰膽堿代謝、信號轉導等。

        2.4.2 KEGG 通路富集分析

        通過運用 DAVID 對當歸補血湯作用靶點及RIHD交集靶點進行富集分析,設定P<0.01,共獲得相關通路37條,主要涉及PI3K-Akt信號通路、Rap1信號通路、花生四烯酸代謝通路、癌癥的中心碳代謝通路、雌激素信號通路、鈣信號通路、神經活性配體-受體相互作用通路、cAMP信號通路、血小板活化通路、cGMP-PKG信號通路等。

        2.5 有效成分-靶點-信號通路構建

        利用 Cytoscape 3.2.1 軟件中的 Merge 功能構建活性成分-作用靶點-代謝通路網絡,如圖3。

        圖3 GO 富集分析結果-log10(P-Value)

        圖4中包括當歸補血湯核心成分 7 種,用三角形表示,RIHD重要靶點42個,用圓形表示;信號通路10條,用菱形表示。成分-靶點-信號通路網絡顯示,所預測出當歸補血湯治療RIHD 7 種潛在的活性成分與ESR1、SRC、ApoA1、IL1β及 PTGS2 等 42 個 靶蛋密切相關,通過PI3K-Akt信號通路、Rap1信號通路、花生四烯酸代謝通路、雌激素信號通路、鈣信號通路、神經活性配體-受體相互作用通路、cAMP信號通路、血小板活化通路、cGMP-PKG信號通路等多條信號通路參與調控RIHD發(fā)病過程的不同環(huán)節(jié)。

        圖4 當歸補血湯主要活性成分-靶點-信號通路網絡圖

        3 討論

        本研究基于網絡藥理學理論初步篩選出當歸補血湯治療RIHD的有效成分包括β-谷固醇、豆甾醇、黃芪甲苷(formononetin,MOL000392)等 17種化合物,提示黃芪甲苷、豆甾醇是當歸補血湯發(fā)揮作用的主要成分。研究表明,黃芪甲苷通過影響心肌細胞肥大,抑制心肌細胞纖維化和細胞凋亡來改善心肌重塑,保護心肌[23]。實驗證實黃芪甲苷能降低高脂大鼠心肌缺血再灌注的損傷,其作用機制可能與黃芪甲苷及人參皂苷 Rg1降低炎癥反應、抑制PINK1-Parkin介導的線粒體過度自噬相關[24]。豆甾醇是心血管疾病的獨立有效危險因素,其蓄積會導致左心室功能障礙,心臟間質纖維化和巨噬細胞浸潤而不引起動脈粥樣硬化,并增加死亡率[25]。

        基于PPI相互作用網絡分析藥物-疾病交集靶蛋白得到5個重要關鍵靶點為原癌基因酪氨酸蛋白激酶Src(SRC)、前列腺素 G/H 合成酶2(PTGS2)、血清載脂蛋白A1(ApoA1)、白介素1β(IL1β)、雌激素受體α蛋白由基因(ESR1),由此說明本方的核心成分可通過以上5個核心靶點發(fā)揮抗RIHD的作用。所預測出當歸補血湯治療RIHD中17種潛在的活性成分與IL1β、ApoA1、ESR1 及前列腺素內源性過氧化物合酶(PTGS1,PTGS2)等5種蛋白存在較強的相互作用。

        通過對藥物-疾病-靶點富集分析發(fā)現,當歸補血湯的作用涉及多個生物學過程,主要有蛋白氧化、細胞增殖的正向調節(jié)、水解酶活性的負調控、脂質分解代謝過程的正向調節(jié)、甘油三脂、膽固醇體內平衡、炎癥反應、脂蛋白代謝過程、反向膽固醇運輸、高密度脂蛋白粒子重構、磷脂酰膽堿代謝、信號轉導等生物過程。通過分析富集的 KEGG 通路可以發(fā)現,靶點基因主要集中在PI3K-Akt信號通路、Rap1信號通路、花生四烯酸代謝通路、雌激素信號通路、神經活性配體-受體相互作用通路、cAMP信號通路、血小板活化通路、cGMP-PKG信號通路等多條信號通路。研究表明,PI3K/AKT信號通路與細胞生長、炎性反應以及細胞凋亡有著重要聯系。PI3K是一種胞內磷脂酰肌醇激酶,參與細胞的能量代謝、增殖、分化以及凋亡[26];有文獻指出,缺血后處理保護心肌其機制可能是通過再灌注損傷補救酶(RISK)途徑中細胞內生存途徑磷酸肌醇3激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)途徑的激活(磷酸化)抑制凋亡的線粒體途徑[27]。由此可見,當歸補血湯中有效成分通過作用于多個靶點、調控多條信號通路,從而達到治療RIHD的作用。祖國醫(yī)學認為正氣不足是疾病發(fā)生的重要原因之一,正所謂“正氣存內,邪不可干”,正氣不足可導致機體免疫功能低下,從而使“外邪”易于侵襲機體,病情遷延,難以痊愈,增強正氣、提高機體免疫功能是祖國醫(yī)學治療疾病的優(yōu)勢之一。而當歸補血湯具有扶正驅邪,補益氣血,減毒增效之功,能有效延長能患者生存時間、減少放化療不良反應并且提高機體免疫力,從而達到治療RIHD的目的。

        綜上所述,本研究通過網絡藥理學方法從分子層面預測當歸補血湯的豆甾醇、黃芪甲苷等2個成分主要通過調控PI3K-Akt信號通路、Rap1信號通路共同參與機體氧化、細胞增殖的正向調節(jié)、炎癥反應、脂蛋白代謝過程、磷脂酰膽堿代謝、信號轉導等過程,協(xié)同治療RIHD,證實了中藥復方是通過多靶點、多層面聯合調控疾病的發(fā)生過程。本研究雖然為當歸補血湯治療RIHD提供了科學的理論支持,為復雜的中藥體系提供了研究思路,但仍存在明顯不足之處,缺乏需要臨床觀察研究和藥理實驗的后期驗證。

        表2 37條KEGG相關通路

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