董 坤,陳 玲,盧 俊,張曉玲,鄭立飛,4,楊柱瓊,余學(xué)堂,曾黎瓊
(1.云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院富源魔芋研究所,云南 富源 655500;2.云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)與種質(zhì)資源研究所,云南省農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,農(nóng)業(yè)部西南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南 昆明 650223; 3.威信縣農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心,云南 昭通 657900;4.云南農(nóng)業(yè)大學(xué)園林園藝學(xué)院,云南 昆明 650201)
魔芋是天南星科多年生草本植物,其球莖中含有大量葡甘露聚糖,該物質(zhì)具有高吸水性和高膨脹性,在醫(yī)藥、食品、化工等領(lǐng)域都有廣泛的應(yīng)用。中國(guó)是魔芋的原產(chǎn)地之一,栽培和利用魔芋歷史悠久。云南省特有的地形和氣候條件,是發(fā)展魔芋產(chǎn)業(yè)的適宜 區(qū)域[1-2]。尤其是近年來(lái),隨著國(guó)家鄉(xiāng)村振興戰(zhàn)略的實(shí)施,魔芋產(chǎn)業(yè)成為山區(qū)扶貧的重要項(xiàng)目之一,農(nóng)民種植魔芋的積極性日益高漲。目前,關(guān)于魔芋的研究多集中在栽培技術(shù)[3-5]、病蟲(chóng)害防治[6-7]等方面。也有學(xué)者就魔芋的形態(tài)學(xué)開(kāi)展了一系列研究[8-10],制定了相關(guān)的國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)[11],為魔芋種質(zhì)資源的鑒定奠定了良好的基礎(chǔ)。在分子標(biāo)記方面,RAPD、AFLP、ISSR等技術(shù)都被應(yīng)用于魔芋種質(zhì)資源研究[12-16],為魔芋屬植物分類以及種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析提供了依據(jù)。筆者利用ISSR 分子標(biāo)記技術(shù),對(duì)富源縣金地魔芋種業(yè)有限公司收集和自育的15 份魔芋資源的親緣關(guān)系進(jìn)行分析,旨在為不同魔芋資源的鑒定及其開(kāi)發(fā)利用提供依據(jù)。
15 份魔芋資源編號(hào)為1~15 號(hào),其中,1、5~7、11 號(hào)來(lái)源于云南富源,2 號(hào)來(lái)源于云南普洱,3 號(hào)來(lái)源于云南楚雄,4 號(hào)來(lái)源于云南文山,8 號(hào)(遠(yuǎn)雜1 號(hào))來(lái)源于湖北恩施,9、12 號(hào)來(lái)源于云南臨滄,10、13、14、15 號(hào)分別來(lái)源于云南會(huì)澤、貴州威寧、云南昭通、云南瀘西。收集后于2019 年種植在富源縣金地魔芋種業(yè)有限公司魔芋種植基地。
參考NT-T2500—2013 植物新品種特異性、一致性和穩(wěn)定性測(cè)試指南 魔芋觀測(cè)記錄魔芋植株葉柄、葉片、球莖、花、果的形態(tài)特征。播種時(shí)測(cè)定種芋重量,膨大期測(cè)量其株高、葉柄周長(zhǎng)、葉柄長(zhǎng)度、開(kāi)展度,倒苗后挖出球莖測(cè)定其重量。
采用Magen(美基)生物公司DNA 提取試劑盒提取供試材料單株葉片基因組DNA。DNA 純化后用0.8%瓊脂糖凝膠檢測(cè),以確定其質(zhì)量。利用紫外分光光度計(jì)將DNA 濃度調(diào)整為10 ng/μL,存于-20℃冰箱備用。
PCR 反應(yīng)體系總體積為15 μL:天根2×Taq PCR MasterMPCR 7.5 μL,引物(10 μmol/L)1 μL(所用引物由上海生工合成,詳見(jiàn)表1),模板DNA(10 ng/μL)2 μL,ddH2O 4.5 μL,最后加1 滴石蠟油防止蒸發(fā)。反應(yīng)條件為:94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,50~55℃復(fù)性30 s(溫度因引物不同而異,具體溫度如表1 所示),72℃延伸1 min,共35 個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物在3%瓊脂糖凝膠上以5 V/cm 恒壓電泳,選用DL 1 000 marker (寶生物工程大連有限公司)作為對(duì)比,通過(guò)凝膠成像系統(tǒng)拍照記錄。
采用Excel 和SPSS19.0 統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行試驗(yàn)數(shù)據(jù)的分析比較;運(yùn)用Popgeng-32 軟件計(jì)算各材料間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離,并進(jìn)行聚類分析。
表1 ISSR 引物名稱,序列及其退火溫度
15 份魔芋資源的形態(tài)特征詳見(jiàn)圖1 和表2。1、3、15、5、13、9 號(hào)樣品具有花魔芋形態(tài)特征,它們的主要區(qū)別在于葉柄主色、葉柄斑紋顏色和形狀的不同。1、3、15、5、13、9 號(hào)樣品球莖肉色都為白色,其中15號(hào)樣品白色球莖肉色中有紅絲,與其他樣品明顯不同。1、3、15、13、9 號(hào)魔芋的肉穗狀花序長(zhǎng)度高于佛焰苞位置;5 號(hào)魔芋的肉穗狀花序長(zhǎng)度約等于佛焰苞位置。6、7、14、8 號(hào)樣品具有白魔芋形態(tài)特征,植株較矮小,主要區(qū)別是葉柄主色、葉柄斑紋形狀和顏色不同。6 號(hào)魔芋葉柄綠色,細(xì)小點(diǎn)狀灰白色斑紋;7號(hào)魔芋葉柄綠色,塊狀斑紋;14 號(hào)魔芋葉柄綠色,點(diǎn)狀斑紋;8 號(hào)魔芋葉柄淺粉紅色,塊狀墨綠色斑紋。2號(hào)魔芋植株相對(duì)較大,球莖肉色為黃色,附屬器淺紫色且有皺褶,果序?yàn)樗{(lán)色,鑒定為勐海魔芋。4 號(hào)魔芋植株分叉處有株芽,植株較大,球莖肉色為粉紅色,佛焰苞內(nèi)側(cè)紅色,外側(cè)粉紅色,果序?yàn)槌燃t色,是一種珠芽魔芋。10 號(hào)魔芋和11 號(hào)魔芋鑒定為滇魔芋,主要區(qū)別是葉柄和葉柄斑顏色不同,11 號(hào)魔芋的葉柄主色更深,斑點(diǎn)更多,果序?yàn)樗{(lán)色。12 號(hào)魔芋植株較大,叢生性強(qiáng),球莖上芽點(diǎn)較多,根系發(fā)達(dá),球莖肉色為橙色,鑒定為甜魔芋,開(kāi)花后干枯死亡,未見(jiàn)結(jié)子。
圖1 15 份魔芋相關(guān)器官的形態(tài)特征
表2 樣品來(lái)源及形態(tài)比較
如表3 所示,2、4 號(hào)魔芋的平均株高、葉柄長(zhǎng)、開(kāi)展度、葉柄周長(zhǎng)數(shù)值較大,6、7、8、14 號(hào)魔芋的平均株高、葉柄長(zhǎng)、開(kāi)展度、葉柄周長(zhǎng)數(shù)值較??;生長(zhǎng)系數(shù)最大的是5 號(hào)魔芋,為5.78。
提取15 份魔芋葉片基因組DNA 進(jìn)行了ISSR分析。從41 條引物中篩選出31 條引物可擴(kuò)增出清晰穩(wěn)定、重復(fù)性好、多態(tài)性高的條帶,圖2 為引物UBC822 的電泳圖譜。結(jié)果顯示,以15 份魔芋葉片基因組DNA 作為模板,31 條引物共擴(kuò)增出490 條DNA帶,其中多態(tài)性條帶共489 條,占99.80%。
利用Popgen 32 軟件計(jì)算不同魔芋材料間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離,結(jié)果見(jiàn)表4??梢?jiàn),15 份魔芋材料之間的遺傳相似系數(shù)在0.555 1~0.942 9,遺傳距離在0.058 8~0.588 6,其中1 號(hào)花魔芋與3 號(hào)花魔芋之間的遺傳相似系數(shù)最大,為0.942 9,遺傳距離最小,為0.058 8;3 號(hào)花魔芋與11 號(hào)滇魔芋芋之間的遺傳相似系數(shù)最小,為0.555 1,遺傳距離最大,為0.588 6。聚類分析結(jié)果見(jiàn)圖3,15 份魔芋材料在遺傳相似系數(shù)為0.69 的位置處分成6 大類:第一類包括1、3、15、5、13、9 號(hào)樣品,具有花魔芋形態(tài)特征;第二類包括6、7、14、8 號(hào)樣品,具有白魔芋形態(tài)特征;第三類包括2 號(hào)樣品(勐海魔芋);第四類包括4 號(hào)樣品(珠芽魔芋);第五類包括10、11 號(hào)樣品,具有滇魔芋的形態(tài)特征;第六類包括12 號(hào)樣品,具有甜魔芋的形態(tài)特征。可見(jiàn),15 份魔芋的遺傳聚類與形態(tài)外觀調(diào)查分析結(jié)果基本一致。
表3 15 份魔芋材料的生長(zhǎng)情況
圖2 ISSR 分析電泳圖(引物UBC822)
表4 15 份魔芋材料的的遺傳相似系數(shù)(—以上)和遺傳距離(—以下)
在同樣的種植條件下觀察不同魔芋種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀,可以看出曲靖市富源縣竹園鎮(zhèn)的氣候環(huán)境不是白魔芋、勐海魔芋、珠芽魔芋、滇磨芋和甜魔芋的最佳生長(zhǎng)條件,導(dǎo)致這些魔芋植株長(zhǎng)勢(shì)稍差。從生長(zhǎng)系數(shù)看,5 號(hào)魔芋更適合在當(dāng)?shù)胤N植。
圖3 15 份魔芋材料的聚類結(jié)果
對(duì)15 份魔芋材料的葉、球莖、花、果等進(jìn)行了觀察記載和農(nóng)藝性狀分析調(diào)查,并利用ISSR 分子標(biāo)記技術(shù)分析了它們的遺傳多樣性,聚類分析結(jié)果顯示,花魔芋、白魔芋、勐海魔芋、珠芽魔芋、滇魔芋、甜魔芋各自聚為一類,遠(yuǎn)雜1 號(hào)在遺傳上更接近于白魔芋,為今后魔芋種質(zhì)資源鑒定和保護(hù)利用提供了依據(jù)。
ISSR 分子標(biāo)記技術(shù)能夠揭示植物的遺傳多態(tài)性,有效反映出品種間的親緣關(guān)系。任盤(pán)宇等[14]對(duì)云南南部5 種魔芋屬植物居群遺傳結(jié)構(gòu)的分析中,通過(guò)PCR 擴(kuò)增9 個(gè)ISSR 引物共獲得95 條條帶,其中多態(tài)性條帶占總條帶數(shù)的100%。在該研究中,15 份魔芋材料通過(guò)31 個(gè)引物進(jìn)行PCR 擴(kuò)增共獲得490 條條帶,其中多態(tài)性條帶489 條,占總條帶數(shù)的99.80%。遺傳相似系數(shù)是比較不同品種或群體間遺傳多樣性的重要指標(biāo)。任盤(pán)宇等[14]利用ISSR 技術(shù)對(duì)云南南部5 種魔芋屬植物居群遺傳結(jié)構(gòu)分析的樣品間遺傳相似系數(shù)為0.857 1~0.473 7,宣慢[16]利用ISSR 技術(shù)對(duì)49 份魔芋屬資源的多樣性分析,其遺傳相似系數(shù)為1.00~0.68,該研究中15 份魔芋樣品間的遺傳相似系數(shù)為0.555 1~ 0.942 9,居于前二者的研究結(jié)果之間。聚類分析結(jié)果顯示,花魔芋和白魔芋的雜交品種遠(yuǎn)雜1 號(hào)的親緣關(guān)系更靠近白魔芋。滕彩珠等[17]進(jìn)行的云南魔芋種質(zhì)資源親緣關(guān)系ISSR 分析發(fā)現(xiàn)甜魔芋與花魔芋聚到一起,與該研究結(jié)果中甜魔芋(12 號(hào)樣品)與滇魔芋(10、11 號(hào)樣品)聚到一起,有所不同,可能是因?yàn)樵撗芯克x擇的ISSR 引物較少未能全面地反映二者在DNA水平上的差異所致。