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        環(huán)狀RNA Circ0000316在大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌誘導(dǎo)的奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型中的表達(dá)研究

        2021-05-12 06:25:16謝曉剛賈燕青薛增迪張振倉(cāng)馬乃祥權(quán)富生
        關(guān)鍵詞:模型

        謝曉剛,李 丹,羅 艷,賈燕青,薛增迪,張振倉(cāng),馬乃祥,權(quán)富生*

        (1.楊凌職業(yè)技術(shù)學(xué)院動(dòng)物工程分院,陜西楊凌 712100;2.西北農(nóng)林科技學(xué)院動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,陜西楊凌 712100)

        奶牛乳腺炎(Cow mastitis)是指奶牛乳腺組織代謝紊亂,或者受到物理或化學(xué)刺激后對(duì)病原微生物入侵易感而造成的炎癥,是奶牛養(yǎng)殖場(chǎng)中的常見(jiàn)病和多發(fā)病,會(huì)影響奶牛產(chǎn)奶量和牛奶品質(zhì),嚴(yán)重時(shí)病牛會(huì)面臨被淘汰的風(fēng)險(xiǎn),給奶牛業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失[1]。在畜牧生產(chǎn)上,造成奶牛乳腺炎的病原微生物主要有大腸埃希氏菌(Escherichiacoli)和金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)。大腸埃希氏菌廣泛存在于糞便、墊料以及飼料中,若工作人員在擠奶過(guò)程中操作不當(dāng),會(huì)造成大腸埃希氏菌入侵乳房引發(fā)急性乳腺炎;而金黃色葡萄球菌具有一定的黏附性,常通過(guò)皮膚傳播,最后定植于乳腺上皮細(xì)胞,產(chǎn)生腸毒素等導(dǎo)致宿主細(xì)胞過(guò)度表達(dá)炎性介質(zhì)造成持續(xù)的炎癥反應(yīng),引起慢性乳腺炎[2-4]。因此,研究奶牛乳腺炎致病機(jī)理對(duì)臨床生產(chǎn)上防控乳腺炎尤為重要。

        circRNA是pre-mRNA的反向剪切或外顯子跳躍產(chǎn)生的首尾相接的單鏈閉合環(huán)狀分子[5],其具有多種生物學(xué)功能,如調(diào)節(jié)自身基因的表達(dá)[6];調(diào)節(jié)mRNA的可變剪切、轉(zhuǎn)錄以及蛋白質(zhì)翻譯過(guò)程[7];作為microRNA的“分子海綿”[8];作為蛋白海綿或蛋白支架[6];還可以翻譯成蛋白或多肽[9]。此外,有一些假基因也來(lái)源于circRNA[10]。但circRNA在牛上的研究主要集中在作為“分子海綿”調(diào)節(jié)成肌細(xì)胞的增殖、分化與凋亡[11-13],參與牛睪丸發(fā)育和精子發(fā)生[14],也可能參與酪蛋白基因表達(dá)的調(diào)節(jié)[15]。之前也有相關(guān)circRNA在奶牛乳腺炎中作用的相關(guān)分析,證明circRNA參與了奶牛乳腺炎的發(fā)生發(fā)展過(guò)程。

        本研究從前期高通量測(cè)序結(jié)果中篩選到一個(gè)名為circRNAcirc0000316的circRNA[16],并通過(guò)大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌誘導(dǎo)建立奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型,采用RT-PCR方法檢測(cè)circ0000316在該模型中的表達(dá)情況,為進(jìn)一步研究環(huán)狀RNA在奶牛乳腺炎進(jìn)程中的作用提供理論支持。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 組織樣品 由病理專(zhuān)業(yè)人員將現(xiàn)代牧業(yè)(寶雞牧場(chǎng))中明顯患有乳腺炎病變和泌乳中后期因意外(如發(fā)生骨折等疾病)而淘汰的健康奶牛的乳腺組織取樣送到實(shí)驗(yàn)室,經(jīng)病理學(xué)鑒別診斷后確定患有乳腺炎,病料經(jīng)40 mL/L福爾馬林及9 g/L生理鹽水處理后,一部分于-80℃保存,一部分用于后期試驗(yàn)。

        1.1.2 細(xì)胞和菌種 奶牛乳腺上皮細(xì)胞系(MAC-T細(xì)胞)以及本研究中所用大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌均由西北農(nóng)林科技大學(xué)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部動(dòng)物生物技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室保存。

        1.1.3 主要試劑 Trizol up試劑盒、TransScript?First-Strand cDNA Synthesis SuperMix試劑盒、TransStart?Top Green qPCR SuperMix試劑,均為北京全式金生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品;牛腫瘤壞死因子(TNF-α)檢測(cè)試劑盒,上??道蕦?shí)業(yè)有限公司產(chǎn)品;DMEM/DF12培養(yǎng)基,美國(guó)Gibco公司產(chǎn)品;胎牛血清,以色列BI公司產(chǎn)品;試驗(yàn)過(guò)程中所用到的引物,均由北京擎科公司合成(表1)。

        表1 引物序列

        1.1.4 主要儀器 CO2恒溫培養(yǎng)箱,日本SANYO公司產(chǎn)品;多功能酶標(biāo)檢測(cè)儀,美國(guó)Bio-Rad公司產(chǎn)品;Real-time quantitative PCR儀,美國(guó)Bio-Rad公司產(chǎn)品。

        1.2 方法

        1.2.1 組織和細(xì)胞RNA提取 本試驗(yàn)采用Trizol法提取組織總RNA。對(duì)于組織樣品,將黃豆大小的組織樣品剪碎后放入液氮預(yù)冷的研缽中,將組織塊研細(xì),加入1 mL Trizol up試劑反復(fù)吹吸,使組織樣品充分裂解,依照說(shuō)明書(shū)提取組織或細(xì)胞總RNA,酶標(biāo)儀檢測(cè)所得RNA質(zhì)量和濃度,置-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        細(xì)胞樣品經(jīng)處理后,棄去上清,經(jīng)PBS沖洗后加入適量Trizol up試劑,使細(xì)胞充分裂解后依據(jù)說(shuō)明書(shū)提取細(xì)胞總RNA,酶標(biāo)儀檢測(cè)所得RNA質(zhì)量和濃度,置-80℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 RT-PCR檢測(cè) 按照北京全式金公司TransScript?First-Strand cDNA Synthesis SuperMix試劑盒說(shuō)明書(shū)進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄得到cDNA,反應(yīng)步驟如下:在無(wú)RNase的EP管中,分別加入總RNA 1 μg、Random Primer(N9)和TransScript?RT/RI Enzyme Mix各1 μL,2×TS Reation Mix 10 μL,加Nuclease-Free Water補(bǔ)至20 μL,輕輕混勻后,25℃孵育10 min,42℃孵育15 min,85℃加熱5 s失活TransScript?RT/RI,反應(yīng)結(jié)束后將cDNA置于-20℃?zhèn)溆?。采用SYBR方法檢測(cè)mRNA表達(dá)情況,反應(yīng)體系與步驟如下:在無(wú)RNase的EP管中,分別加入2×TransStart?Top Green qPCR SuperMix 10 μL,上、下游引物各0.4 μL,cDNA 1 μL,Nuclease-Free Water補(bǔ)至20 μL,輕輕混勻后,進(jìn)行離心,避免管壁和管蓋沾有液體而影響試驗(yàn)結(jié)果,每孔3個(gè)重復(fù)。PCR程序?yàn)椋?5℃ 5 min;95℃ 5 s,60℃ 30 s,40個(gè)循環(huán)進(jìn)行擴(kuò)增;95℃ 15 min,60℃ 1 min,±5℃進(jìn)行梯度升溫至95℃,持續(xù)15 s,程序結(jié)束后對(duì)目的基因的表達(dá)量進(jìn)行分析。

        1.2.3 大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌滅活 參照Ma等[17]的試驗(yàn)方法,首先對(duì)細(xì)菌進(jìn)行培養(yǎng),將保存于-80℃的大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌分別劃線接種于不含抗生素的LB固體培養(yǎng)基中,37℃倒置培養(yǎng)14~16 h,待培養(yǎng)基中長(zhǎng)出單菌落,并將1 mm~2 mm的單菌落用接種針接種于15 mL LB液體培養(yǎng)基中,37℃、180 r/min過(guò)夜培養(yǎng),待細(xì)菌生長(zhǎng)至對(duì)數(shù)期,收集菌液備用。將收集后的菌液分別進(jìn)行10倍稀釋至102、104、106后,分別吸取不同稀釋度的菌液10 μL接種至LB固體培養(yǎng)基中,每個(gè)稀釋度做3個(gè)重復(fù),37℃倒置培養(yǎng)12 h~14 h,待培養(yǎng)基長(zhǎng)出清晰可見(jiàn)的單菌落時(shí),對(duì)單菌落數(shù)在50~200之間的稀釋度進(jìn)行計(jì)數(shù),依據(jù)文獻(xiàn)中的計(jì)算公式對(duì)細(xì)菌數(shù)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)。將收集后的菌液在超凈臺(tái)中分裝至2 mL無(wú)菌離心管中,做好標(biāo)記并封口。采用低溫滅活的方式對(duì)細(xì)菌進(jìn)行滅活,依據(jù)文獻(xiàn)中的描述,大腸埃希氏菌的滅活條件為:65℃水浴1 h,金黃色葡萄球菌為60℃水浴2 h。滅活后對(duì)菌液進(jìn)行滅活檢驗(yàn),檢驗(yàn)方法為:吸取10 μL滅活后的菌液,接種至LB固體培養(yǎng)基中倒置于37℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng),24 h后觀察培養(yǎng)基中是否長(zhǎng)出單菌落,若未長(zhǎng)出則滅活成功,將滅活成功的單菌落于-80℃中保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.4 炎性細(xì)胞模型的建立 將生長(zhǎng)良好的MAC-T細(xì)胞消化收集后,用DF12培養(yǎng)液重懸進(jìn)行細(xì)胞計(jì)數(shù),計(jì)數(shù)后將細(xì)胞接種于60皿中,每皿細(xì)胞數(shù)約為4×105個(gè),培養(yǎng)細(xì)胞至貼壁;將預(yù)先滅活并計(jì)數(shù)的菌液收集離心,PBS清洗2次后細(xì)胞培養(yǎng)液重懸,大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌分別以1 000∶1和100∶1的比例對(duì)細(xì)胞進(jìn)行攻菌,處理24 h后分別收集上清和細(xì)胞,總RNA進(jìn)行下一步試驗(yàn)。

        1.2.5 酶聯(lián)免疫吸附試驗(yàn) ①試驗(yàn)前準(zhǔn)備:將試劑盒平衡至室溫后,20倍濃縮洗滌液于37℃水浴助溶;②收集處理后細(xì)胞上清至無(wú)菌離心管,2 500 r/min離心20 min,將上清轉(zhuǎn)移至新的無(wú)菌離心管;③加樣:設(shè)置空白孔,標(biāo)準(zhǔn)孔和待測(cè)樣品孔,空白孔不加樣品及酶標(biāo)試劑,每個(gè)標(biāo)準(zhǔn)孔加不同濃度的標(biāo)準(zhǔn)品50 μL,樣品孔中,樣品稀釋液40 μL+待測(cè)樣品10 μL(樣品稀釋5倍);④加酶孵育:除空白孔外,每孔加入酶標(biāo)試劑100 μL,封板膜封板,37℃孵育60 min;⑤洗板:20倍濃縮洗滌液蒸餾水稀釋20倍,揭掉封板膜棄去試劑,甩干,每孔加滿洗滌液(約350 μL),靜置30 s棄去,重復(fù)5次,拍干;⑥顯色:每孔先加顯色劑A 50 μL,再加50 μL顯色劑B 50 μL,輕輕振蕩混勻,封板37℃避光顯色15 min;⑦終止:每孔加入終止液50 μL終止反應(yīng);⑧測(cè)定:終止液加入15 min后,450 nm波長(zhǎng)測(cè)定各孔吸光度。

        1.2.6 統(tǒng)計(jì)分析 本研究中的試驗(yàn)數(shù)據(jù)均以“平均值±標(biāo)準(zhǔn)差(SD)”形式呈現(xiàn),每個(gè)試驗(yàn)結(jié)果均重復(fù)3次,統(tǒng)計(jì)學(xué)差異由雙尾t檢驗(yàn)所得,*P<0.05認(rèn)為統(tǒng)計(jì)學(xué)差異顯著,**P<0.01認(rèn)為統(tǒng)計(jì)學(xué)差異極顯著。

        2 結(jié)果

        2.1 circ0000316在健康乳腺組織及炎性乳腺組織中的表達(dá)

        本研究前期從現(xiàn)代牧業(yè)(寶雞牧場(chǎng))獲得了3頭健康奶牛和3頭患乳腺炎奶牛的乳腺組織,分別提取總RNA反轉(zhuǎn)錄后采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)circ0000316的表達(dá)量,結(jié)果顯示circ000316在炎性組織中的表達(dá)量顯著降低(圖1A和圖1B)。

        A.炎性組織和正常組織中circ0000316的表達(dá)(n=3);B.炎性組織和正常組織中circ0000316表達(dá)的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。**P<0.01

        2.2 奶牛乳腺炎細(xì)胞模型的建立

        參考文獻(xiàn)中建立奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型的方法,以大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌刺激MAC-T細(xì)胞后,TNF-α顯著升高為作為模型建立成功的標(biāo)志,因此本研究從mRNA和蛋白分泌水平檢測(cè)了TNF-α的變化,結(jié)果顯示TNF-α表達(dá)量顯著升高(圖2A和2B),表明炎癥模型建立成功。

        A.大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌刺激前后TNF-α基因表達(dá)情況;B.大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌刺激后TNF-α分泌水平

        2.3 circ0000316在奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型中的表達(dá)

        在成功建立奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型后,本研究繼而檢測(cè)了circ0000316在該模型中的表達(dá)量,結(jié)果顯示,circ0000316在奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型中呈現(xiàn)顯著低表達(dá)(圖3),與前面提到的組織中的表達(dá)情況一致。

        圖3 circ0000316在奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型中的表達(dá)量

        3 討論

        本研究參考Ma等[16]的方法以炎性標(biāo)志性因子TNF-α升高為標(biāo)志,建立了大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌刺激的奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型,模擬奶牛發(fā)生乳腺炎時(shí)的細(xì)胞環(huán)境,驗(yàn)證circ0000316在奶牛乳腺上皮細(xì)胞炎癥模型中的表達(dá)情況。結(jié)果顯示,與奶牛乳腺組織中的表達(dá)趨勢(shì)一致,也與文獻(xiàn)中報(bào)道的高通量測(cè)序結(jié)果中circ0000316的表達(dá)趨勢(shì)相一致[17]。此外,有研究表明,circKIKA通過(guò)miR-326的“分子海綿”作用參與調(diào)控MAC-T細(xì)胞的凋亡和增殖[18];而circLPP通過(guò)“分子海綿”作用降低游離miR-615的表達(dá),導(dǎo)致miR-615對(duì)其靶基因SPRED3的穩(wěn)定性降低,從而參與調(diào)控奶牛乳腺組織的炎癥進(jìn)程[19]。

        本研究在大腸埃希氏菌和金黃色葡萄球菌誘導(dǎo)的乳腺炎模型中驗(yàn)證了circ0000316的表達(dá)情況,為深入研究circ0000316在奶牛乳腺炎發(fā)生過(guò)程的調(diào)控作用奠定了基礎(chǔ),為進(jìn)一步研究奶牛乳腺炎的防控提供了新思路。

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