《粵港澳大灣區(qū)發(fā)展規(guī)劃綱要》明確提出，大灣區(qū)建設國際科技創(chuàng)新中心，深化粵港澳創(chuàng)新合作，構建開放型融合發(fā)展的區(qū)域協(xié)同創(chuàng)新共同體，建設全球科技創(chuàng)新高地和新興產業(yè)重要策源地。據了解，2019年粵港澳大灣區(qū)內國家級高新技術企業(yè)總數超過1.89萬家，PCT國際專利申請量占全國56%，科研創(chuàng)新速度不斷提升。但隨著粵港澳大灣區(qū)的發(fā)展，大灣區(qū)科技創(chuàng)新協(xié)同發(fā)展也暴露出不少問題，例如，科研協(xié)同發(fā)展體制還未完全構建，科研與產業(yè)創(chuàng)新合力以及城市間多樣化科技成果轉化產業(yè)鏈還未形成等。

為此，2020年全國兩會期間，民建中央提交了《關于加快粵港澳科技創(chuàng)新協(xié)同發(fā)展的提案》。提案建議，加強體制機制改革創(chuàng)新，設立“粵港澳高層聯席會議”制度和專責工作辦公室，構建半官方及民間的協(xié)調交流機制；整合產學研創(chuàng)新合力，建立粵港澳三地科研機構人員流動及薪酬體系雙邊協(xié)議制度，打通人員互聘及雙職雙薪的障礙；加快推進廣深港澳科技創(chuàng)新走廊建設，依托廣深港高鐵、港珠澳大橋、深中通道等重要交通連接線，吸納惠州、東莞、佛山、珠海、澳門等珠江沿線城市一體聯動，支持港澳科技成果孵化、轉化向內地轉移，完善科技轉化鏈條區(qū)域協(xié)同；加大《關于鼓勵香港、澳門高等院校和科研機構參與中央財政科技計劃組織實施的若干規(guī)定》落地力度，與香港、澳門共同研究落實細則和資金管理辦法，簡化項目申請受理流程，完善項目投標、實施和評估機制等，并在深港科技合作區(qū)先行試點。

為加快推進粵港澳大灣區(qū)科技創(chuàng)新協(xié)同發(fā)展，廣東、香港、澳門三地共同發(fā)力，在科技創(chuàng)新、人才互聘、交通、教育等方面密切合作，不斷消除粵港澳科技創(chuàng)新協(xié)同發(fā)展的障礙。

2020年7月9日，廣東省人民政府港澳事務辦公室網站公布實施《粵澳合作框架協(xié)議》2020年重點工作，部署2020年粵澳合作的8大方面共73項具體措施。按照計劃，粵澳雙方將推動設立粵澳深度合作區(qū)，加快建設南沙粵澳合作葡語國家產業(yè)園等一批重要平臺；實施科技聯合資助計劃，推動大科學裝置進一步向澳門創(chuàng)新主體開放共享，聯合打造國際中藥材信息中心、交易中心、定價中心和國際中藥質量標準中心、檢測中心；推動全面放開澳門機動車經港珠澳大橋珠海公路口岸入出內地。

粵澳正合力加快推進廣深港澳科技創(chuàng)新走廊建設，進一步推動在科技人才交流、科研攻關協(xié)同、科研資金流通等方面先行先試。

在創(chuàng)新合作機制方面，粵澳雙方將組織實施粵澳科技聯合資助計劃。廣東將落實好財政科研資金跨境使用政策，進一步便利資金跨境撥付。在創(chuàng)新合作載體方面，粵港澳聯合實驗室建設有望提速。發(fā)揮澳門4個國家重點實驗室作用，加強在中醫(yī)藥、芯片、智慧城市和物聯網、太空科學與深空探測等領域合作。同時，支持建設中國與葡語國家之間的技術轉移合作平臺，利用好橫琴預留土地深化跨境科技創(chuàng)新合作。共同支持廣州中醫(yī)藥大學、香港浸會大學與澳門大學合作的粵港澳大灣區(qū)中醫(yī)藥創(chuàng)新中心項目。

2020年11月25日，香港特別行政區(qū)行政長官林鄭月娥在立法會發(fā)表了題為《砥礪前行 重新出發(fā)》的2020年施政報告。施政報告指出，將出臺容許在大灣區(qū)內地城市指定港資醫(yī)療機構使用已在香港注冊的藥物和常用的醫(yī)療儀器、放寬內地人類遺傳資源過境香港作研究用途、在港珠澳大橋實施“港車北上”、加快落實“跨境理財通”等政策。

2月20日，廣州市科學技術局在《粵港澳大灣區(qū)發(fā)展規(guī)劃綱要》公開發(fā)布兩周年廣州推進建設國際科技創(chuàng)新中心工作情況新聞發(fā)布會上表示，目前在廣州的粵港澳聯合實驗室已達10家，廣州正著力推進穗港澳協(xié)同創(chuàng)新。這10家實驗室主要分布在新材料、先進制造、生物醫(yī)藥、環(huán)境科技等重點領域。

其中，牽頭單位為高校的有6家，包括華南理工大學、暨南大學、華南師范大學、中山大學各1家，廣東工業(yè)大學2家；牽頭單位為科研機構的有4家，包括中國科學院廣州地球化學研究所、廣東省人民醫(yī)院、廣州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院、廣州中醫(yī)藥大學第二附屬醫(yī)院各1家。港澳參與方包括香港大學、香港科技大學、香港理工大學、香港中文大學、香港城市大學、香港浸會大學、澳門大學、澳門科技大學8所高校。聯合實驗室建設周期均為三年，每家首期建設經費均為500萬元人民幣。

廣州市科學技術局相關負責人表示，聯合實驗室自2019年9月成立以來，在為廣東經濟社會發(fā)展提供關鍵性支撐上取得了良好成效，特別是在新冠肺炎防控科技攻關中，粵港澳呼吸系統(tǒng)傳染病聯合實驗室、粵港澳中醫(yī)藥與免疫疾病研究聯合實驗室等在病毒溯源、治療藥物、快速檢測及公共支撐服務上做出了積極貢獻。

2月24日，在《粵港澳大灣區(qū)發(fā)展規(guī)劃綱要》發(fā)布兩周年系列發(fā)布之廣州市推進全球重要交通樞紐建設情況發(fā)布會上，有關負責人透露，目前正在緊張建設中的廣州地鐵22號線，一頭連接廣州中心城區(qū)，另一頭將聯通東莞，并延伸到深圳，將分布在珠江東岸的這三座城市串聯起來。不僅如此，廣州地鐵22號線將把南沙科學城、東莞濱海灣新區(qū)和深圳市光明區(qū)科教城串聯起來，這與廣深港澳科技創(chuàng)新走廊的走向一致，有利于推動實現大灣區(qū)人才流通和產業(yè)協(xié)作互補。

在此之前，2月19日，澳門特區(qū)政府表示，為完善澳門與內地城市的便捷對接，加快交通基礎互聯互通，創(chuàng)造便捷舒適的跨境出行環(huán)境，實現澳門輕軌融入粵港澳大灣區(qū)“一小時生活圈”的目標，特區(qū)政府將積極推動輕軌橫琴線的建設。由于工程屬珠澳兩地跨境建設項目，將通過區(qū)域合作方式建設，土建工程總投資約35億澳門元，項目爭取4年內建成并試營運。