王傳敏 孟忠吉 陳悅
十堰市太和醫(yī)院(湖北醫(yī)藥學(xué)院附屬醫(yī)院)感染科,湖北十堰442000
慢性乙型肝炎(CHB)是影響我國全民健康的重大傳染性疾病。 目前,HBV DNA 病毒載量檢測是唯一被許可的實驗室指標(biāo),用于監(jiān)測外周血循環(huán)病毒顆粒數(shù)量,從而反映了肝臟內(nèi)病毒產(chǎn)生的活動性。 核苷(酸)類似物(NAs)廣泛用于治療CHB, 通過抑制病毒的逆轉(zhuǎn)錄和DNA 合成發(fā)揮抗病毒作用,但其不能直接靶向作用于HBV 復(fù)制的模板——cccDNA,并且可能需要終生用藥以抑制cccDNA 的回補。
cccDNA 定量檢測雖然是臨床評價治療效果和預(yù)測停藥終點的重要指標(biāo),但因需要肝組織穿刺活檢具有一定的局限性,因此無法在臨床普遍開展。 血清HBV RNA 作為cccDNA的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物[1],是反映其活性的理想血清學(xué)替代指標(biāo),它在血液中的含量可作為反映HBV 轉(zhuǎn)錄活性和判斷藥物療效更直接、更可靠的指標(biāo)[2]。HBV 前基因組RNA (pgRNA) 可存在于成熟病毒顆粒的核衣殼內(nèi),這種病毒顆粒被稱為“HBV RNA病毒樣顆粒”,在血液中可以檢測到全長或剪接的pgRNA。最近的研究表明,HBV pgRNA 作為一種反映肝內(nèi)HBV cccDNA 存在狀態(tài)和轉(zhuǎn)錄水平的新型血清學(xué)標(biāo)志物, 在CHB治療進展方面具有重要的臨床意義[3-4]。 因此,本綜述將總結(jié)血清中HBV pgRNA 的來源、組成、特征及其在乙型肝炎臨床管理中的意義。
pgRNA 是HBV 逆轉(zhuǎn)錄的模板,HBV 基因組的復(fù)制需要pgRNA 與DNA 聚合酶相互作用以進行逆轉(zhuǎn)錄, 逆轉(zhuǎn)錄發(fā)生在細胞質(zhì)的病毒衣殼中。 pgRNA 與DNA 聚合酶結(jié)合后被包裝到由240 個核心蛋白組成的核衣殼中。 pgRNA 中的3 個RGAG 基序與磷酸化的衣殼蛋白的羧基端相互作用來促進核衣殼組裝[5]。 末端蛋白、 間隔區(qū)和逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)中含有與HBV pgRNA5' 端莖環(huán)結(jié)構(gòu)(Hε)相互作用、轉(zhuǎn)錄啟動和包裝相關(guān)的氨基酸[6]。pgRNA 5' 端的“帽子”結(jié)構(gòu)對于pgRNA 包裝也很重要,因為5' 端“帽子”和Hε 之間的距離決定了pgRNA可否被包裝[7]。
在逆轉(zhuǎn)錄過程中,DNA 聚合酶中的RNaseH 會水解RNA模板,但保留5' 端寡核苷酸,隨后殘存的RNA 寡核苷酸置換到直接重復(fù)序列2(DR2),以啟動正鏈合成[8]。 因此,基于pgRNA 的HBV 細胞內(nèi)復(fù)制是一個多步驟過程,包括DNA 聚合酶的結(jié)合、轉(zhuǎn)錄啟動、包裝、DNA 合成和RNA 水解。該過程需要病毒內(nèi)部和病毒-宿主之間相互協(xié)調(diào)配合, 病毒或宿主因子上的任何錯誤均可能影響pgRNA 的穩(wěn)定性和功能。
NAs 終止HBV DNA 延伸可以發(fā)生在核衣殼成熟的不同階段。 當(dāng)恩替卡韋、阿德福韋或替諾福韋等NAs 在轉(zhuǎn)錄啟動或負鏈合成的早期終止DNA 延長時,RNaseH 功能可能不會被激活,核衣殼中的pgRNA 可能會保留完整的poly(A)“尾巴”, 或者僅3' 端被略微縮短但仍保有相對較長的RNA 鏈。雖然據(jù)報道只有包裹了完整的負鏈DNA 的核衣殼才能被表面蛋白包裝,但仍有證據(jù)表明血液中病毒樣顆粒內(nèi)可以檢測到全長的pgRNA[1,3]。
最初,人們認為在HBV 感染的細胞中HBV RNA 剪接并不常見,但研究發(fā)現(xiàn),HBV pgRNA 確實具有多個剪接供體和受體位點, 并且在包括土撥鼠肝炎病毒和鴨HBV 在內(nèi)的嗜肝DNA 病毒感染的組織中很容易檢測到剪接產(chǎn)物[9]。 實際上,目前已經(jīng)從組織培養(yǎng)和CHB 患者中鑒定出18 個以上的sppgRNA[10]。
在轉(zhuǎn)錄HBV pgRNA 活躍的細胞中, sp-pgRNA 占總pgRNA 的10%~30%。pgRNA 的剪接活性受HBV 轉(zhuǎn)錄后調(diào)控元件 (PRE) 的調(diào)控,PRE 的SLα 莖環(huán)區(qū)域被認為對HBV RNA 剪接調(diào)控很重要。 另外,在pgRNA 的第2951 位和3163 位核苷酸之間還存有一個內(nèi)含子剪接沉默子(ISS),刪除ISS 顯著促進了sp-pgRNA 的產(chǎn)生[11]。人們還發(fā)現(xiàn)與宿主剪接相關(guān)的因子如La 蛋白和PSF 能刺激HepG2 和Huh7 細胞中sp-pgRNA 的表達[12]。 據(jù)報道,當(dāng)核心蛋白存在于CHB患者的肝細胞核時,sp-pgRNA 與全長pgRNA 的比例明顯增高[13]。sp-pgRNA 在HBV 生命周期、感染持續(xù)性和發(fā)病機制中起的作用仍有待闡明,尚未排除sp-pgRNA 調(diào)節(jié)HBV 復(fù)制的可能性。
大 多 數(shù)sp-pgRNA 保 持 完 整 的5' 端H ε 結(jié) 構(gòu)、X 蛋 白ORF 和直接重復(fù)序列, 可以被包裝到衣殼中。 剪接的HBV RNA 通常在包膜蛋白(LHBs 的PreS1,MHBs/SHBs 的PreS2/S) 和Pol 聚合酶的合成上有缺陷,但是HBc (衣殼蛋白) 和HBV X 蛋白ORF 可能很大程度上保持不變。因此,sp-pgRNA不可能自動復(fù)制和分泌含剪切的HBV DNA (spHBV) 的顆粒。 spHBV 顆粒的產(chǎn)生需要在同一細胞中pgRNA 和亞基因組RNA 翻譯出的Pol 和包膜蛋白進行反式補償。反式提供的聚合酶能有效地對sp-pgRNA 進行轉(zhuǎn)錄啟動和負鏈合成。有趣的是,在瞬時轉(zhuǎn)染中,spHBV 顆粒中的DNA 結(jié)構(gòu)主要為雙線性形式,而不是疏松環(huán)狀DNA[14]。
在20 多年前就有報道在CHB 患者血液中檢測到HBV RNA,這些HBV RNA 來自吸附在外周血單核細胞上的HBV顆粒[15]。據(jù)估計,在CHB 患者體內(nèi),外周血單核細胞攜帶的病毒顆粒量大約是血清中病毒載量的0.5%,通過蔗糖密度梯度離心和抗體沉淀,發(fā)現(xiàn)血清中的pgRNA 包含在HBV 病毒樣顆粒中[16]。最近發(fā)現(xiàn)CHB 患者血清中病毒樣顆粒只能檢測到微量的pgRNA,pgRNA 主要來自于裸露的核衣殼[1-2]。 因此,血清HBV RNA 的來源值得進一步研究。
當(dāng)NAs 阻斷病毒的逆轉(zhuǎn)錄和rcDNA 的合成時, 會導(dǎo)致血循環(huán)中病毒DNA 相對快速減少, 但不會導(dǎo)致包裝的pgRNA 迅速減少。 作用于病毒DNA 合成之前的藥物如核衣殼抑制劑可降低循環(huán)pgRNA 的水平。 因此, 血清HBVpgRNA 水平的檢測對HBV 感染的輔助診斷和NAs 的抗病毒療效監(jiān)測及停藥預(yù)測有著重要意義[17]。 越來越多的證據(jù)表明,血清pgRNA 的定量有助于確定CHB 患者終止NAs 治療是否安全。 研究發(fā)現(xiàn),NAs 治療12 周時HBV RNA 水平與停藥后24 周內(nèi)HBV DNA 反彈率顯著相關(guān),12 周時血清HBV RNA 水平可作為一獨立影響因素來預(yù)測初始的病毒學(xué)應(yīng)答;NAs 治療結(jié)束時如果pgRNA 仍能檢測到,停藥后24 周則很可能發(fā)生病毒學(xué)復(fù)發(fā)。 HBV pgRNA 的狀態(tài)可以反映CHB 患者接受NAs 抗病毒治療的長期預(yù)后,CHB 患者接受抗病毒治療48 周后HBV pgRNA 仍為陽性的患者HBeAg 轉(zhuǎn)陰失敗的概率更高, 這些患者也需要更長的時間實現(xiàn)HBeAg 轉(zhuǎn)陰及HBV DNA 轉(zhuǎn)陰[18]。 另外,在一項考察559 例HBeAg 陽性的CHB 患者NAs 治療效果的研究中, 130 例患者經(jīng)2年NAs 治療后血清HBV DNA<20 IU/mL,且HBeAg 轉(zhuǎn)陰。停藥后4年內(nèi),46.5%的患者HBV DNA 反彈至>2000 IU/mL。但如果停藥時患者血清HBV RNA 是陰性, 只有21.2%患者有病毒學(xué)指標(biāo)的反彈[19]。 因此,檢測血清中HBV RNA 水平可作為預(yù)測NAs 安全停藥的指標(biāo)[5,20-21]。 pgRNA 的定量也可以用于監(jiān)測NAs 耐藥突變的出現(xiàn)[22]。當(dāng)NAs 與IFN-α 一起使用時,HBV RNA 在治療早期的明顯下降預(yù)示NAs 和IFN-α 聯(lián)合治療的反應(yīng)較好, 而血清中病毒DNA 的水平無法揭示患者 是 否 會 對 治 療 產(chǎn) 生 應(yīng) 答[16]。 van B?mmel 等[23]應(yīng) 用NAs 和IFN-α 抗病毒治療3 個月后HBV RNA 降低則HBeAg 血清學(xué)轉(zhuǎn)化率更高, 而高水平HBV RNA 患者停止抗病毒治療易發(fā)生病毒反彈。
通過隨訪接受恩替卡韋治療的患者,Wang 等[4]觀察到循環(huán)中的HBV RNA 在表達水平和序列變異方面反映了肝臟中病毒RNA 的狀態(tài):他們對血清中的HBV RNA,以及配對的肝臟中病毒RNA 進行了深度測序,發(fā)現(xiàn)血清HBV RNA 在遺傳學(xué)上與肝內(nèi)HBV RNA 同源, 血清HBV RNA 水平反映了肝內(nèi)HBV RNA 的量以及亞型的組成。 此外, 還發(fā)現(xiàn)血清HBV RNA 與肝組織學(xué)改變有關(guān), 血清HBV RNA 水平以2.45 lg 拷貝/mL 為臨界值將肝組織輕度炎癥纖維化(Metavir評分<2)與重度肝組織病理學(xué)區(qū)分開。 然而,接受恩替卡韋治療的CHB 患者和HBV 感染的人源化小鼠, 血清病毒RNA和cccDNA 之間的定量相關(guān)性無法建立, 這表明血清HBV RNA 的水平只反映肝臟中cccDNA 的轉(zhuǎn)錄概況。
血清中spHBV 顆粒的剪接模式根據(jù)HBV 基因型和疾病分期而有所不同[10,24]。 在由急性感染發(fā)展為慢性感染的6例乙型肝炎患者均檢測到spHBV,但在完全康復(fù)的患者中只有9%被檢測到[25]。 在體外和體內(nèi)實驗中,通過剪接供體和受體位點突變阻遏spHBV 產(chǎn)生, 可重新建立HBV 對IFN-ɑ 的敏感性,在乙型肝炎患者血液中spHBV 含量與對IFN-ɑ 治療的反應(yīng)性成反比[10]。 此外,對無癥狀攜帶者、慢性肝炎和肝硬化患者血清中病毒DNA 的測序分析表明,Pre-S1 第57~119位氨基酸之間的缺失在肝硬化患者更常見[26]。Redelsperger 等[27]評估了56 例CHB 患者和273 例急性乙型肝炎患者的spHBV DNA 水平與疾病狀況之間的關(guān)系, 結(jié)果顯示在肝壞死和纖維化的患者中,spHBV 相對于全長HBV 的比例變得更高。 這些結(jié)果表明,肝細胞在病毒復(fù)制和免疫反應(yīng)所致的異常生理環(huán)境中可能傾向產(chǎn)生剪接的RNA。 此外,從多個原發(fā)性肝癌組織中分離到的剪接pgRNA 也顯示spHBV DNA可能是病毒基因組整合的來源[28]。 與CHB 患者相比,原發(fā)性肝癌患者spHBV 顆粒的含量更高[29],它可能作為肝癌發(fā)生的標(biāo)志物[30]。
目前研究顯示, 血清中的HBV pgRNA 既可以來自病毒顆粒又可以來自裸露的核衣殼;在未接受過NAs 治療的患者中,HBV RNA 水平低于HBV DNA;但在NAs 治療期間,病毒DNA 與RNA 的比例可以顛倒。 血清中HBV pgRNA 的表達水平和序列特征可以反映肝臟中cccDNA 的轉(zhuǎn)錄活性、表明耐藥突變體的出現(xiàn)并預(yù)測治療結(jié)果。 接受NAs 治療的患者,血清剪接pgRNA 相對于spHBV DNA 的比例會增加,而pgRNA 與病毒DNA 的比例也會增加。 另外, 從血清HBV RNA 深度測序獲得的數(shù)據(jù)可能比HBcrAg 定量檢測更敏感,更能反映cccDNA 轉(zhuǎn)錄活性的動態(tài)變化。 因此, 在乙型肝炎的臨床管理中, 對血清HBV RNA 進行測定可用于預(yù)測抗病毒療效及預(yù)后判斷。
利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突