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        亞硒酸鈉促進(jìn)多形漢遜酵母DL-1合成谷胱甘肽的轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析

        2021-03-31 02:01:18劉嬋嬋荊蓉蓉錢衛(wèi)東
        食品科學(xué) 2021年6期
        關(guān)鍵詞:差異

        王 婷,劉嬋嬋,任 娟,荊蓉蓉,錢衛(wèi)東,*

        (1.陜西科技大學(xué)食品與生物工程學(xué)院,陜西 西安 710021;2.西安醫(yī)學(xué)高等??茖W(xué)校,陜西 西安 710032)

        谷胱甘肽(glutathione,GSH)又稱γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸,是一種由L-谷氨酸、L-半胱氨酸及L-甘氨酸組成的活性三肽。其結(jié)構(gòu)中還原態(tài)的巰基能結(jié)合重金屬離子和氧自由基,具有緩解重金屬中毒、抗氧化功能,可以促進(jìn)糖類、脂肪及蛋白質(zhì)代謝,并具有防止溶血、防止皮膚色素沉積、有效防止食品的酶促或非酶促的褐變、增強食品風(fēng)味和營養(yǎng)等作用。目前,GSH的制備方法主要包括化學(xué)合成法、酶轉(zhuǎn)化法及發(fā)酵法[1]。其中,利用釀酒酵母[2](Saccharomyces cerevisiae)、畢赤酵母[3](Pichia pastoris)、產(chǎn)朊假絲酵母[4](Candida utilis)為工程菌發(fā)酵生產(chǎn)GSH的方法,具有菌種易培養(yǎng)、產(chǎn)量高、純度好、品質(zhì)安全,生產(chǎn)工藝完善等優(yōu)點,被廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥、化妝品和食品等行業(yè)中GSH原料的生產(chǎn)。

        多形漢遜酵母(Hansenula polymorpha)是美國食品藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)的食品級酵母,屬于甲醇型酵母,具有營養(yǎng)要求簡單、耐酸(pH值適應(yīng)范圍為2.5~8.0)、耐高溫(溫度適應(yīng)范圍為25~48 ℃)、繁殖快、發(fā)酵密度高、便于遺傳操作的優(yōu)點,是乙型肝炎病毒表面抗原、人干擾素、胰島素等生物工程產(chǎn)品開發(fā)和拓展的主要細(xì)胞平臺之一[5]。Wang Dahui[6]和Xu Ruoyang[7]等通過紫外線-γ射線復(fù)合誘變、優(yōu)化培養(yǎng)基補料方式、構(gòu)建基因重組菌株、低pH值脅迫[4]促進(jìn)產(chǎn)朊假絲酵母中GSH合成積累。錢衛(wèi)東等[8]以30 μg/mL Na2SeO3誘導(dǎo)多形漢遜酵母使酵母胞內(nèi)GSH產(chǎn)量提高到215.21 mg/L,但對于Na2SeO3誘導(dǎo)下多形漢遜酵母生物合成和積累GSH的分子機(jī)制仍有待進(jìn)一步闡明。

        近年來,轉(zhuǎn)錄組測序(RNA-Seq)技術(shù)因其分辨率高、數(shù)據(jù)重現(xiàn)性好等優(yōu)勢,逐漸成為研究基因表達(dá)水平、新基因的檢測挖掘及其功能注釋的重要手段[9]。因此,本研究以多形漢遜酵母DL-1為出發(fā)菌株,利用Na2SeO3誘導(dǎo)酵母高效合成GSH,通過轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)對比出發(fā)菌株與誘導(dǎo)菌株的轉(zhuǎn)錄本信息,篩選其表達(dá)差異基因(differential expression genes,DEGs),富集與GSH代謝及調(diào)控相關(guān)的基因通路,為進(jìn)一步開展多形漢遜酵母定向分子改良,提高合成GSH效率提供新思路。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        1.1.1 菌株與培養(yǎng)基

        多形漢遜酵母DL-1(ATCC 26012),由陜西科技大學(xué)食品與生物工程學(xué)院功能微生物研究室保存。

        種子培養(yǎng)基:葡萄糖20 g/L,酵母粉10 g/L,蛋白胨20 g/L,pH 6.0;發(fā)酵培養(yǎng)基:葡萄糖40 g/L,(NH4)2SO410 g/L,蛋白胨5 g/L,酵母粉5 g/L,KH2PO42.3 g/L,MgSO40.5 g/L,pH 6.0。培養(yǎng)基滅菌條件:將葡萄糖溶液和不含葡萄糖的培養(yǎng)基分別置于115 ℃,高壓滅菌20 min,滅菌后按比例混勻,并以無菌的1 mol/L HCl或NaOH調(diào)節(jié)培養(yǎng)基pH值。

        1.1.2 試劑

        Na2SeO3天津市恒興化工;2-硝基苯甲酸(5,5’-dithiobis-(2-nitrobenzoic acid),DTNB)、GSH美國Sigma公司;TRIzol Reagent(15596-026) 美國Invtrogen公司;其余試劑均為國產(chǎn)分析純。

        1.2 儀器與設(shè)備

        J6-MI型冷凍離心機(jī) 美國Beckeman公司;Perkin-Elmer 402紫外-可見分光光度計 上海第三分析儀器廠;多功能酶標(biāo)儀 美國BioTek公司。

        1.3 方法

        1.3.1 種子培養(yǎng)

        將-80 ℃冰箱中保藏的菌種迅速解凍至室溫,取1 mL接種至100 mL的種子培養(yǎng)基中,30 ℃、160 r/min搖床中培養(yǎng)24 h。

        1.3.2 Na2SeO3對多形漢遜酵母生長抑制的EC50

        取1 mL新鮮酵母發(fā)酵液,4 ℃、6 000 r/min離心10 min,沉淀以蒸餾水洗滌2 次,重懸,以細(xì)胞計數(shù)板計數(shù)酵母細(xì)胞個數(shù);2 倍比稀釋懸液,取100 μL置于酶標(biāo)儀,在600 nm波長檢測其OD值,分析OD值與細(xì)胞濃度的相關(guān)性。將酵母種子液接種到96 孔細(xì)胞培養(yǎng)板,0.5~1.0×104個/孔,加Na2SeO3溶液,使Na2SeO3終濃度分別為600、500、400、300、200、100、50 μmol/L,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)24 h;然后測其OD600nm值,計算Na2SeO3對多形漢遜酵母生長抑制的EC50。

        1.3.3 Na2SeO3對多形漢遜酵母生長的影響

        以5%的接種量,將酵母種子液接種添加Na2SeO3的發(fā)酵培養(yǎng)基中,使Na2SeO3終濃度分別為0、30、60、120、240、480 μmol/L,200 r/min、37 ℃培養(yǎng)12 h;隨后,在30 ℃條件下繼續(xù)培養(yǎng)60 h;每間隔6 h 取樣,每次取5 mL發(fā)酵液,4 ℃、6 000 r/min離心10 min,沉淀以蒸餾水洗滌2 次,85 ℃烘干至恒質(zhì)量,測量菌體質(zhì)量濃度,以干質(zhì)量計。

        1.3.4 多形漢遜酵母中GSH的提取和測定

        DTNB可與GSH的巰基反應(yīng),生成黃色的3-羧基-4-硝基苯硫酚,且在412 nm波長處有強烈吸收峰,因此可以通過標(biāo)準(zhǔn)曲線法測定酵母發(fā)酵液中GSH質(zhì)量濃度。取5 mL新鮮的酵母發(fā)酵液,4 ℃、6 000 r/min離心10 min,上清液用于檢測胞外GSH含量;沉淀以5 mL 0.2 mol/L 磷酸鹽緩沖液(pH 7.0)洗滌2 次,置冰浴中超聲波破壁20 min(功率400 W,超聲15 s,間歇10 s);將發(fā)酵液上清液與菌體超聲破碎后獲得的上清液,分別加入1.5 mL 0.06% NaOH和0.5 mL 0.03%甲醛,混勻,室溫下靜置2 min;再加入2.5 mL DTNB分析液(100 μmol/L DTNB,0.25 mol/L Tris-HCl,pH 8.0)混勻,25 ℃ 孵育5 min,在412 nm波長處測定吸光度,根據(jù)GSH標(biāo)準(zhǔn)曲線分別計算酵母胞外、胞內(nèi)GSH產(chǎn)量,按照以下公式分別計算GSH的總產(chǎn)量、胞內(nèi)GSH含量[10-11]:

        1.3.5 多形漢遜酵母轉(zhuǎn)錄組測序

        1.3.5.1 酵母培養(yǎng)及其RNA提取

        將種子液以5%的接種量分別轉(zhuǎn)接到正常和添加Na2SeO3的發(fā)酵培養(yǎng)液中,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)至對數(shù)期;于4 ℃、6 000 r/min離心10 min,棄去上清液;加4 ℃預(yù)冷RNase free的磷酸鹽緩沖液洗滌2 次;利用TRIzol試劑盒提取其總RNA;通過NanoDrop定量RNA濃度和純度,通過瓊脂糖凝膠電泳和Agilent 2100鑒定RNA完整性。

        1.3.5.2 文庫構(gòu)建和轉(zhuǎn)錄組測序

        文庫的制備參照Illumina TruSeq RNA文庫制備試劑盒V2操作說明,包括以下步驟:首先取1 μg檢測合格的總RNA,用磁珠富集mRNA;然后以逆轉(zhuǎn)錄酶催化合成單鏈cDNA,經(jīng)DNA聚合酶合成雙鏈cDNA并連接測序接頭,構(gòu)建特異性cDNA文庫;最后使用Agilent 2100對文庫進(jìn)行質(zhì)量檢測,將檢驗合格的不同文庫置于Illumina HiSeq 2000平臺進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。

        1.3.6 轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)處理及分析

        1.3.6.1 轉(zhuǎn)錄組測序質(zhì)量評估

        將測序獲得Raw Data經(jīng)過去除接頭和過濾得到Clean序列[12];使用Trinity軟件[13-14]將短的Clean序列組裝為Unigene序列;并將Clean序列與Unigene序列進(jìn)行比對[15],得到Mapped Data;通過插入片段長度檢驗、隨機(jī)性檢驗等進(jìn)行原始序列質(zhì)量評估[16]。

        1.3.6.2 差異表達(dá)基因分析

        將測序得到的Clean reads與Unigene庫進(jìn)行比對,結(jié)合RSEM[15-16]進(jìn)行基因表達(dá)量水平估計;應(yīng)用HTSeq方法對基因表達(dá)量進(jìn)行FPKM定量[17-18];利用DESeq[19]進(jìn)行Na2SeO3誘導(dǎo)組和對照組間的基因表達(dá)量對比分析,以差異倍數(shù)≥2或≤1/2且錯誤發(fā)現(xiàn)率(false discovery rate,F(xiàn)DR)≤0.01作為篩選標(biāo)準(zhǔn),獲得DEGs。

        1.3.6.3 差異表達(dá)基因功能注釋及富集分析

        對篩選獲得的Na2SeO3誘導(dǎo)組和對照組間的DEGs:1)通過BLAST2 GO比對到基因本體(Gene Ontology,GO)數(shù)據(jù)庫(http://www.geneontology.org/),再通過topGO進(jìn)行DEGs功能的GO富集[20];2)通過KAAS(KEGG automatic annotation server)比對到KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)數(shù)據(jù)庫,再采取超幾何分布樣本抽取方法進(jìn)行DEGs功能的KEGG代謝通路富集[21-22],進(jìn)一步注解與GSH代謝調(diào)控相關(guān)基因、關(guān)鍵合成酶及其代謝途徑。

        1.4 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析

        轉(zhuǎn)錄組樣品設(shè)置2 個平行重復(fù),其他樣本設(shè)置3 個平行重復(fù),使用SPSS 20.0對所檢測的多形漢遜酵母生長及其GSH產(chǎn)量進(jìn)行t檢驗分析,以P<0.05計為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 Na2SeO3對多形漢遜酵母生長影響

        以細(xì)胞計數(shù)和發(fā)酵液吸光度分別考察多形漢遜酵母DL-1菌體增長情況,結(jié)果在1×104~1×1010個/mL范圍,酵母細(xì)胞數(shù)目和發(fā)酵液OD600nm值呈良好的線性關(guān)系,擬合方程為y=0.095 8x+0.729 8,R2=0.986 3,P<0.001(圖1A),因此,可用OD600nm間接表示酵母菌體濃度。在24 h發(fā)酵期內(nèi),≤100 μmol/L的Na2SeO3可以促進(jìn)HP-DL-1生長,而>100 μmol/L的Na2SeO3抑制HPDL-1生長,其生長抑制EC50為234.72 μmol/L(圖1B)。將HP-DL-1以5%的接種量接種于含不同濃度Na2SeO3的發(fā)酵培養(yǎng)基中,200 r/min,37 ℃發(fā)酵12 h,然后置于30 ℃繼續(xù)發(fā)酵60 h;如圖1C所示,0~120 μmol/L的Na2SeO3可促進(jìn)HP-DL-1生長,60 μmol/L發(fā)酵48 h菌體質(zhì)量濃度最高,達(dá)(40.29±0.64)g/L;而240 μmol/L和480 μmol/L的Na2SeO3延遲酵母進(jìn)入對數(shù)生長期的時間,抑制HP-DL-1生長。不同濃度Na2SeO3誘導(dǎo)培養(yǎng)多形漢遜酵母DL-1發(fā)酵液中GSH的總產(chǎn)量如圖1D所示,隨著發(fā)酵時間延伸,酵母發(fā)酵液中GSH的積累逐漸增高,在48~54 h達(dá)到高峰。

        圖 1 Na2SeO3對多形漢遜酵母DL-1生長及GSH總產(chǎn)量的影響Fig. 1 Effects of Na2SeO3 on the growth and GSH yield of HP-DL-1

        2.2 Na2SeO3對多形漢遜酵母GSH總產(chǎn)量的影響

        表 1 不同濃度Na2SeO3對多形漢遜酵母DL-1 GSH產(chǎn)量的影響Table 1 Effect of different concentrations of Na2SeO3 on GSH production of HP-DL-1

        如表1所示,當(dāng)Na2SeO3終濃度為60 μmol/L時,HP-DL-1發(fā)酵液GSH總產(chǎn)量最高,為(530.22±9.6)mg/L。隨著發(fā)酵液中Na2SeO3濃度增加,Na2SeO3對HPDL-1由營養(yǎng)轉(zhuǎn)為毒性作用,抑制菌體生長。當(dāng)Na2SeO3濃度為240 μmol/L時,HP-DL-1胞內(nèi)GSH含量最高,達(dá)(15.03±0.34)mg/g,但發(fā)酵液總GSH產(chǎn)量降低,為(286.34±9.6)mg/L。

        2.3 RNA-seq數(shù)據(jù)質(zhì)量評估

        60 μmol/L Na2SeO3能有效促進(jìn)多形漢遜酵母DL-1生長,發(fā)酵48~54 h后胞內(nèi)GSH產(chǎn)量較高,因此,本研究將HP-DL-1種子液以5%的接種量分別轉(zhuǎn)接到Na2SeO3終濃度為0 μmol/L(對照組)和60 μmol/L(誘導(dǎo)組)的發(fā)酵培養(yǎng)液中,37~30 ℃、200 r/min培養(yǎng)至對數(shù)期;提取RNA、構(gòu)建文庫并進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測序。利用Fast QC(v 0.10.1)法分析測序質(zhì)量,測序的堿基質(zhì)量值用Qphred表示,樣品測序數(shù)據(jù)如表2所示,對照組獲得45 778 342 Clean reads,誘導(dǎo)組得到45 492 098 Clean reads,4 個轉(zhuǎn)錄組樣本中Q30(0.1%堿基識別錯誤率)最小的樣本值為95.28%,序列GC含量47.96%,表明轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)質(zhì)量較高。

        使用Trinity軟件將短的reads拼接組裝為較長的Unigene序列集;將Clean reads與Unigene序列進(jìn)行比對,得到Mapped Data;結(jié)果顯示,測序4 個樣本定位到Unigene序列上的序列數(shù)均大于80%,最低匹配率為84.65%,表明本測序樣本沒有受到污染。

        表 2 Na2SeO3誘導(dǎo)多形漢遜酵母DL-1的轉(zhuǎn)錄組測序質(zhì)量分析Table 2 Quality statistics of transcriptome sequencing of HP-DL-1 induced by Na2SeO3

        2.4 差異表達(dá)基因

        采用Bowtie結(jié)合RSEM進(jìn)行基因表達(dá)量水平估計;以FPKM計算各個基因相對表達(dá)量,以基因FC≥2或FC≤1/2且FDR≤0.01作為篩選條件,進(jìn)行Na2SeO3誘導(dǎo)組與對照組多形漢遜酵母的差異表達(dá)分析。如圖2所示,橫坐標(biāo)表示基因在不同樣本中表達(dá)倍數(shù)變化,縱坐標(biāo)表示基因表達(dá)量變化差異的統(tǒng)計學(xué)顯著性,Na2SeO3誘導(dǎo)組與對照組多形漢遜酵母之間有1 254 個顯著性DEGs,其中630 個DEGs表達(dá)顯著上調(diào),624 個DEGs表達(dá)顯著下調(diào),說明Na2SeO3對多形漢遜酵母DL-1的基因轉(zhuǎn)錄水平產(chǎn)生了廣泛的影響。

        圖 2 Na2SeO3誘導(dǎo)組和對照組比較的差異表達(dá)基因Fig. 2 DEGs between Na2SeO3 induced and control groups

        2.5 差異表達(dá)基因GO富集分析

        對獲得的Na2SeO3誘導(dǎo)組和對照組間1 254 個顯著DEGs進(jìn)行GO數(shù)據(jù)庫比對,其中639 個DEGs獲得GO功能注釋,再通過topGO進(jìn)行DEGs的GO富集分析,639 個DEGs在GO功能二級分類下共涉及12 個生物過程(biological process,BP),10 個細(xì)胞組分(cellular component,CC),12 個分子功能(molecular function,MF)(圖3)。生物學(xué)過程功能分組中包括106 個DEGs,主要涉及代謝過程、細(xì)胞過程和單有機(jī)體過程;在細(xì)胞組分的功能分組中包括63 個DEGs,主要涉及細(xì)胞、細(xì)胞組分、細(xì)胞膜組分和細(xì)胞器組分;在分子功能分組中包括470 個DEGs,主要涉及催化活性、結(jié)合、轉(zhuǎn)運活性等功能。

        圖 3 差異表達(dá)基因的GO富集Fig. 3 GO enrichment of DEGs between Na2SeO3 induced and control groups

        圖 4 差異表達(dá)基因的GO富集柱狀圖Fig. 4 Go enrichment histogram of DEGs between Na2SeO3 induced and control groups

        進(jìn)一步分析表明,639 個DEGs在GO功能分類下共涉及838 個GO term,選擇富集最顯著的30 個GO term,繪制GO富集柱狀圖(圖4),縱坐標(biāo)為富集的GO term,橫坐標(biāo)為該term中差異基因的個數(shù),富集最顯著主要涉及26 個生物過程和4 個細(xì)胞組分,包括細(xì)胞膜(92 個DEGs)和細(xì)胞核組分(71 個DEGs),跨膜轉(zhuǎn)運(77 個DEGs)、DNA修復(fù)(22 個DEGs)、DNA復(fù)制(9 個DEGs)、DNA重組(12 個DEGs)過程,RNA剪切過程(5 個DEGs)、蛋白質(zhì)糖基化(14 個DEGs)、磷脂生物合成(9 個DEGs)、絲氨酸/蘇氨酸激酶調(diào)節(jié)(2 個DEGs)和GSH生物合成過程(2 個DEGs)等。

        2.6 差異表達(dá)基因KEGG代謝通路富集

        圖 5 差異表達(dá)基因的KEGG通路富集Fig. 5 KEGG pathway enrichment of DEGs between Na2SeO3 induced and control groups

        將獲得的Na2SeO3誘導(dǎo)組和對照組間DEGs比對到KEGG數(shù)據(jù)庫,通過超幾何分布樣本抽取方法進(jìn)行DEGs功能的KEGG代謝通路富集,1 254 個顯著DEGs中有649 個基因被KEGG注釋,參與94 條代謝途徑。選擇富集最顯著的50 個KEGG通路(圖5),包括氨基酸的生物合成(40 個DEGs)、碳代謝(39 個DEGs)、糖酵解/糖異生(22 個DEGs)、核酸代謝(嘌呤21 個DEGs、嘧啶14 個DEGs)、甲烷代謝(20 個DEGs)、脂肪酸代謝(11 個DEGs)等代謝通路;酵母細(xì)胞周期(24 個DEGs)、有絲分裂等細(xì)胞過程(18 個DEGs);以及核糖體(27 個DEGs)和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)加工(23 個DEGs)的遺傳信息處理通路。其中,參與核糖體和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)蛋白質(zhì)加工等遺傳信息處理通路調(diào)控的基因為蛋白質(zhì)合成和細(xì)胞有絲分裂做好準(zhǔn)備;調(diào)控有絲分裂和細(xì)胞周期等細(xì)胞過程的調(diào)控基因與Na2SeO3誘導(dǎo)酵母細(xì)胞快速增值,提高發(fā)酵產(chǎn)率密切相關(guān);碳、核酸、脂肪酸代謝過程相關(guān)基因保障細(xì)胞代謝維持穩(wěn)定并為促進(jìn)細(xì)胞生長繁殖提供物質(zhì)和能量;而參與調(diào)控氨基酸的生物合成,尤其是參與GSH合成密切相關(guān)的丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代謝通路,甘氨酸、絲氨酸和蘇氨酸代謝通路,半胱氨酸和蛋氨酸代謝通路,以及GSH代謝通路的酶基因,其轉(zhuǎn)錄水平在Na2SeO3誘導(dǎo)組和對照組酵母之間呈現(xiàn)顯著的差異。

        2.7 GSH代謝相關(guān)的差異表達(dá)基因

        GSH合成和代謝是由一些列酶催化介導(dǎo)的生化反應(yīng)網(wǎng)絡(luò),通過對比分析差異表達(dá)基因GO富集和KEGG富集的結(jié)果,篩選2 組結(jié)果中高富集通路中共有的,并且參與調(diào)控GSH合成代謝的顯著差異表達(dá)的酶基因,分析結(jié)果如表3所示。在Na2SeO3誘導(dǎo)發(fā)酵的多形漢遜酵母中,絲氨酸丙酮酸轉(zhuǎn)氨酶(serine-pyruvate transaminase,SGX1)、丙氨酸乙醛酸轉(zhuǎn)氨酶(alanineglyoxylate aminotransferase,MET6)、GSH合成酶(glutathione synthase,GSH-II)、磷酸葡萄糖酸脫氫酶(6-phosphogluconate dehydrogenase,GND1)、5-氧丙烷酶(5-oxoprolinase,OXP1)和γ-谷氨酰轉(zhuǎn)肽酶(gamma-glutamyl-transpeptidase,ECM38)表達(dá)上調(diào)。Sahu等[23]研究表明SGX1和MET6可以通過順序的轉(zhuǎn)氨基作用,將羥基丙酮酸轉(zhuǎn)化為絲氨酸,再轉(zhuǎn)化為甘氨酸;甘氨酸經(jīng)過GSH-II催化與谷氨酰半胱氨酸合成GSH[24];GND1通過促進(jìn)NADPH脫氫為NADP+,維持GSH的還原態(tài)[25];OXP1和ECM38促進(jìn)GSH-5異脯氨酸-谷氨酸的循環(huán)代謝[26];因此這些基因在Na2SeO3作用下轉(zhuǎn)錄水平增高,可以有效促進(jìn)酵母細(xì)胞合成大量GSH,并保持GSH的還原態(tài)。

        表 3 GSH代謝相關(guān)的差異表達(dá)基因Table 3 DEGs related to glutathione metabolism

        另一方面,在Na2SeO3誘導(dǎo)發(fā)酵的多形漢遜酵母中,谷氨酸合酶、谷氨酰胺合成酶(glutamine synthetase,GLN1)和GSH-S-轉(zhuǎn)移酶(glutathioneS-transferase,GSTs)表達(dá)下調(diào),通過減少谷氨酸進(jìn)入谷氨酸-谷氨酰循環(huán)比例[26],抑制胞內(nèi)GSH酶解為谷氨酸、甘氨酸和乙酰CoA[27],促進(jìn)GSH在細(xì)胞內(nèi)積累。

        此外,低能離子注入的重組酵母[28]、柱狀黏滑菇菌[29](Hebeloma cylindrosporum)、酒酒球菌[9](Oenococcus oeni)等其他微生物中參與調(diào)控GSH合成的關(guān)鍵酶,如γ-谷氨酰基轉(zhuǎn)移酶、GSH還原酶、GSH水解酶,其基因轉(zhuǎn)錄在本研究中表達(dá)無顯著差異,這可能與誘導(dǎo)方式或菌種基因型不同有關(guān),其具體原因還有待進(jìn)一步研究探索。

        3 結(jié) 論

        本研究考察高密度、變溫培養(yǎng)條件下,添加Na2SeO3誘導(dǎo)多形漢遜酵母合成GSH的發(fā)酵過程,發(fā)現(xiàn)60 μmol/L Na2SeO3可以誘導(dǎo)多形漢遜酵母合成GSH總產(chǎn)量提高,達(dá)到(530.22±9.6)mg/L。采用Illumina HiSeq測序平臺對Na2SeO3誘導(dǎo)組與對照組多形漢遜酵母轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行對比分析,按照差異基因表達(dá)變化2 倍以上且FDR≤0.01的原則,兩組間共篩選出1 254 個DEGs,其中630 個基因上調(diào),624 個基因下調(diào)。通過差異基因GO富集分析結(jié)果可以明確Na2SeO3可以誘導(dǎo)酵母中參與跨膜轉(zhuǎn)運、細(xì)胞壁生成等細(xì)胞過程的功能基因,以及調(diào)控蛋白糖基化、基因甲基化、絲氨酸/蘇氨酸和GSH合成的酶基因的轉(zhuǎn)錄水平發(fā)生顯著變化。最后通過差異基因KEGG富集分析確定差異表達(dá)基因在酵母細(xì)胞周期、碳代謝、氧化磷酸化、氨基酸的生物合成,尤其是谷氨酸、甘氨酸、半胱氨酸及GSH代謝通路中顯著富集。本研究部分解析了Na2SeO3誘導(dǎo)多形漢遜酵母菌高產(chǎn)GSH的生理機(jī)制,同時也為進(jìn)一步提高酵母GSH產(chǎn)量及其分子育種提供參考數(shù)據(jù)。

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