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        河南地方綿羊品種LHR基因的多態(tài)性分析

        2021-03-15 13:25:32邵俊紅付俊偉董智豪白俊艷陳夢柯付學(xué)言韓志洪崔晗晗

        邵俊紅,付俊偉,董智豪,白俊艷*,陳夢柯,付學(xué)言,冀 祥,韓志洪,崔晗晗,彭 彬

        (1.河南省汝州市動(dòng)物衛(wèi)生監(jiān)督所,河南 汝州 467500;2.河南科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院,河南 洛陽 471023)

        促黃體素受體 (LHR)是屬于G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)超家族中的糖蛋白亞家族成員,其氨基酸序列和結(jié)構(gòu)有高度同源性,具有7個(gè)跨膜區(qū)、4個(gè)胞質(zhì)區(qū)以及由3個(gè)環(huán)狀區(qū)和N端組成的細(xì)胞外區(qū),細(xì)胞外區(qū)中大約有14個(gè)不完全重復(fù)的富含亮氨酸的序列。其不但有與跨膜區(qū)發(fā)生反應(yīng)后介導(dǎo)信號(hào)傳導(dǎo)的特性,而且還具有結(jié)合黃體生成素 (LH)的作用。葛立軍等[1](2007)在多種動(dòng)物包括靈長類動(dòng)物、豬、牛、火雞以及人的子宮內(nèi)都發(fā)現(xiàn)有促黃體素(LH)或人絨毛膜促性腺激素(HCG)及其mRNA的結(jié)合位點(diǎn)。狄冉等[2](2009)檢測了促黃體素受體(LHR)基因外顯子11在性早熟、高繁殖力山羊品種(濟(jì)寧青山羊)和性晚熟、低繁殖力品種(波爾山羊、安哥拉山羊和內(nèi)蒙古絨山羊)中的單核苷酸多態(tài)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn),僅引物P3和P6的擴(kuò)增片段具有多態(tài)性。申穎等[3](2009)在探究LHR基因在濟(jì)寧青山羊發(fā)情周期的不同階段于子宮中的表達(dá)差異時(shí),發(fā)現(xiàn)LHR mRNA在整個(gè)發(fā)情周期的子宮中都有表達(dá),但各時(shí)期表達(dá)量不同。王利紅等[4](2011)在探究綿羊促黃體素受體基因(LHR)外顯子11多態(tài)性與繁殖性能的相關(guān)性的過程中,發(fā)現(xiàn)設(shè)計(jì)的引物中只有兩個(gè)引物的擴(kuò)增片段具有多態(tài)性。本研究將PCR-SSCP技術(shù)與測序相結(jié)合,對小尾寒羊、大尾寒羊和豫西脂尾羊的LHR基因進(jìn)行種群內(nèi)和種群間的多態(tài)性分析,為綿羊品種的改良和保護(hù)提供科學(xué)依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        分別采集來自濮陽的小尾寒羊、來自平頂山的大尾寒羊和來自偃師烏龍村的豫西脂尾羊的血樣,各48只,采用頸部靜脈采血方法,經(jīng)抗凝處理后在冰壺中低溫保存運(yùn)回實(shí)驗(yàn)室,血樣于-20℃條件下保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2 試驗(yàn)方法

        引物由北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司合成。 具體為:F:5'-TCGTTTCCTCATGTGCAATCT-3';R:5'-GGTATGCCATCTTTCTAGTGTGAT-3',擴(kuò)增產(chǎn)物片段大小為200 bp。PCR反應(yīng)體系的總體積為15 μL,其中 1 uL 的 DNA,上、下游引物各為 1 μL,去離子水 4.5 μL, 以及 7.5 μL 的 2×Taq PCR Green Mix。PCR 擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)變性 4 min,35×(94 ℃變性 40 s,58 ℃退火 1 min,72 ℃延伸 80 s),72 ℃繼續(xù)延伸5 min,最后于4℃條件下保存。PCR產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖電泳,在紫外投射儀中進(jìn)行觀察,確定為陽性后在12%非變性聚丙烯酰胺凝膠上進(jìn)行電泳。利用Excel軟件統(tǒng)計(jì)基因型頻率、基因頻率以及多態(tài)信息含量等相關(guān)指標(biāo)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 綿羊LHR基因的瓊脂糖電泳結(jié)果

        如圖1所示,通過梯度PCR得知,58℃是該引物的最適退火溫度。對該退火溫度下的PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)特異性擴(kuò)增良好,無拖尾,與預(yù)期片段大小200 bp相符,可進(jìn)行SSCP分析。

        圖1 綿羊 LHR基因的瓊脂糖檢測結(jié)果

        2.2 綿羊LHR基因的聚丙烯酰胺凝膠電泳結(jié)果

        對小尾寒羊、大尾寒羊、豫西脂尾羊促黃體素受體(LHR)外顯子11的PCR產(chǎn)物進(jìn)行電泳,結(jié)果見圖2??梢园l(fā)現(xiàn),在小尾寒羊中檢測到AB、BB兩種基因型,在豫西脂尾羊中檢測到AA、AB、BB三種基因型,在大尾寒羊中檢測到AB、BB兩種基因型。

        圖2 綿羊LHR基因的聚丙烯酰胺凝膠電泳圖

        2.3 綿羊LHR基因的群體遺傳學(xué)分析

        從表1可以看出,促黃體素受體(LHR)外顯子11在小尾寒羊、大尾寒羊和豫西脂尾羊中存在三種基因型,記為AA、BB和AB。其中小尾寒羊AA的基因型頻率為0.045,AB的基因型頻率為0.295,BB的基因型頻率為0.659。豫西脂尾羊AA基因型頻率為0.174,AB的基因型頻率為0.261,BB的基因型頻率為0.565。大尾寒羊AB基因頻率為0.098,BB基因頻率為0.902。促黃體素受體(LHR)外顯子11在小尾寒羊中的遺傳雜合度(He)為0.312,有效等位基因數(shù)(Ne)為 1.452,多態(tài)信息含量(PIC)為 0.263。在豫西脂尾羊中的遺傳雜合度 (He)為0.423,有效等位基因數(shù)(Ne)為 1.734,多態(tài)信息含量(PIC)為 0.256。在大尾寒羊中的遺傳雜合度 (He)為0.093,有效等位基因數(shù)(Ne)為 1.108,多態(tài)信息含量(PIC)為 0.089。

        表1 綿羊LHR基因的群體多態(tài)性分析

        2.4 綿羊LHR外顯子11的測序分析

        選擇LHR外顯子11的AA、AB、BB這三種基因型的PCR產(chǎn)物直接測序,測序比對結(jié)果見圖3。發(fā)現(xiàn)不同基因型之間有5個(gè)位點(diǎn)發(fā)生突變,LHR在37位發(fā)生G、A的突變;在49位發(fā)生T、C的突變;在93位發(fā)生T、C突變;在139位發(fā)生T、G突變;在184位發(fā)生A、G突變。

        圖3 綿羊LHR基因的不同基因型測序結(jié)果

        3 討論

        LHR基因是動(dòng)物體內(nèi)較為重要的調(diào)節(jié)因子之一,國內(nèi)外許多學(xué)者都對其進(jìn)行了研究。本研究采用PCR-SSCP技術(shù)分析了小尾寒羊、豫西脂尾羊和大尾寒羊LHR基因外顯子11的多態(tài)性,SSCP結(jié)果同樣檢測到了AA、AB、BB這三種基因型。此外,寸靜宇[5](2019)在探究綿羊LHR基因的多態(tài)性時(shí)發(fā)現(xiàn),其所探究的LHR基因7個(gè)SNPs在大多數(shù)綿羊品種中均表現(xiàn)為中度多態(tài) (0.25<PIC<0.5),且試驗(yàn)中該基因的所有位點(diǎn)在各個(gè)綿羊品種中均處于Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)(P>0.05)。 吳翠玲等[6](2019)在研究新吉細(xì)毛羊中5個(gè)生殖激素受體基因的多態(tài)性時(shí)發(fā)現(xiàn),LHR基因存在 T1262G、A1991G、C2012T、A2032T 和 T2041A的突變,但這些突變對其產(chǎn)仔數(shù)并無顯著影響 (P>0.05)。關(guān)于其他物種,王愛華等[7](2003)發(fā)現(xiàn),豬 LHR基因外顯子11序列發(fā)生了一個(gè)堿基突變,但并沒有造成該段蛋白序列的改變,為沉默突變。以上研究都對LHR基因的SNP位點(diǎn)進(jìn)行了部分探索,雖與本試驗(yàn)研究目的不一致,但均表明LHR基因具有較高的堿基突變概率。

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