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        廣東省人H7N9病例分布與活禽高危因素相關(guān)性研究

        2021-03-10 08:27:58黃澤穎李海軍
        畜牧與獸醫(yī) 2021年3期
        關(guān)鍵詞:活禽調(diào)運(yùn)珠三角

        黃澤穎,李海軍

        (1. 農(nóng)業(yè)農(nóng)村部食物與營(yíng)養(yǎng)發(fā)展研究所,北京 100081;2. 三亞學(xué)院,海南 三亞 572000)

        SARS、H7N9亞型禽流感,MERS等新型動(dòng)物源性傳染病頻頻發(fā)生,期間針對(duì)高危因素的防控措施值得總結(jié)和反思。H7N9亞型禽流感是近年來(lái)發(fā)生的一次人畜共患病疫情,引發(fā)全球廣泛關(guān)注。廣東省是H7N9亞型禽流感的高發(fā)省份,據(jù)統(tǒng)計(jì),2013年8月至 2018年2月,共發(fā)生病例264起(占全國(guó)18.84%)[1]。由于廣東省是家禽產(chǎn)銷大省,加上居民喜食現(xiàn)宰活禽,疫情具有復(fù)雜性,但H7N9亞型禽流感的高危因素來(lái)自養(yǎng)殖與銷售環(huán)節(jié)的人與活禽接觸[2-5]和活禽市場(chǎng)暴露[6-8]兩個(gè)方面,基于此,省政府根據(jù)省情與國(guó)家政策,采取了多項(xiàng)防控措施,其中有三項(xiàng)主要措施:一是活禽交易限制,2015年2月起實(shí)施《廣東省家禽經(jīng)營(yíng)管理辦法》, 規(guī)定設(shè)立活禽經(jīng)營(yíng)限制區(qū),在限制區(qū)外的活禽市場(chǎng)推行“1110”制度,一日一清洗、一周一消毒、一月一休市、過(guò)夜零庫(kù)存。在2017年2月起該措施更為嚴(yán)格,規(guī)定有條件的地市要擴(kuò)大活禽經(jīng)營(yíng)限制區(qū)域,在嚴(yán)重時(shí)實(shí)行臨時(shí)休市,延長(zhǎng)休市時(shí)間;二是活禽調(diào)運(yùn)限制,2013年6月起實(shí)施活禽跨省“禁運(yùn)令”,暫停從人感染病例省份調(diào)入商品活禽。從2017年2月起加強(qiáng)活禽調(diào)運(yùn)管控,暫停從疫情高風(fēng)險(xiǎn)省份調(diào)入所有活禽;三是對(duì)家禽實(shí)施H7N9免疫,隨著H7N9亞型禽流感轉(zhuǎn)變?yōu)閷?duì)禽高致病性(然而廣東省沒(méi)有發(fā)生任何一例動(dòng)物H7N9疫情),2017年6月起廣東省在全國(guó)率先實(shí)施家禽H7N9全面免疫。目前,學(xué)術(shù)界較多將樣本流感病毒檢出情況作為這些措施實(shí)施效果的評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)[9-11],而缺少將活禽高危因素的病例數(shù)增減情況作為評(píng)價(jià)標(biāo)準(zhǔn)。為了從不同視角評(píng)價(jià)廣東省H7N9亞型禽流感的活禽高危因素防控措施,文章首先采用Moran指數(shù)等方法分析廣東省H7N9病例的空間分布特征,其次,將有過(guò)活禽高危因素的病例劃分為有活禽接觸史病例與活禽市場(chǎng)暴露史病例,采用K-means算法聚類分析這兩種病例的特征,然后分析活禽交易限制、活禽調(diào)運(yùn)限制、活禽H7N9免疫與這兩個(gè)活禽高危因素病例的關(guān)聯(lián)性,進(jìn)而評(píng)價(jià)這三個(gè)措施的實(shí)施效果,希冀為防控措施的延續(xù)與完善,并達(dá)到凈化和消滅H7N9亞型禽流感提供參考價(jià)值。

        1 材料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源

        使用的數(shù)據(jù):一是來(lái)自廣東省衛(wèi)健委的疫情信息(廣東省衛(wèi)生健康委員會(huì),2018),梳理了廣東省2013年8月至2018年2月的264個(gè)H7N9亞型禽流感患者的確診時(shí)間、發(fā)生城市與區(qū)縣、性別、年齡、基礎(chǔ)病史、身份(活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者、養(yǎng)禽人員等)、是否接觸活禽、是否有活禽市場(chǎng)暴露;二是來(lái)自廣東省人民政府(http://www.gd.gov.cn)的政策文件和官方報(bào)道信息,如《廣東省家禽經(jīng)營(yíng)管理辦法》等,梳理了活禽交易限制(2015年2月前未啟動(dòng)、2015年2月到2017年1月啟動(dòng)、2017年2月起強(qiáng)化)、活禽調(diào)運(yùn)限制(2013年6月啟動(dòng)、2017年2月起強(qiáng)化)、對(duì)家禽實(shí)施H7N9免疫(2017年6月前未啟動(dòng)、2017年6月起啟動(dòng))3個(gè)防控措施的情況。

        1.2 研究方法

        采用ArcGIS 10.7 軟件開展空間自相關(guān)、空間熱點(diǎn)與趨勢(shì)面分析,并運(yùn)用R統(tǒng)計(jì)軟件,采用K-means算法和Apriori算法開展研究。

        1.2.1 Moran指數(shù)空間自相關(guān)、空間熱點(diǎn)與趨勢(shì)面分析

        空間自相關(guān)分析的基本測(cè)度是Moran指數(shù),該指數(shù)是標(biāo)準(zhǔn)化的空間自協(xié)方差,反映空間鄰接或鄰近的區(qū)域單元屬性值的相似程度[12]。熱點(diǎn)分析主要采用核密度估計(jì)法,該方法是估計(jì)點(diǎn)的空間集聚性密度函數(shù),旨在每一個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)處設(shè)置核函數(shù),表示數(shù)據(jù)在這一點(diǎn)鄰域內(nèi)的分布,z≥1.96 說(shuō)明該區(qū)域存在顯著的高值聚類,即“熱點(diǎn)區(qū)域”,z≤-1.96 則說(shuō)明該區(qū)域存在顯著低值聚類[13]。趨勢(shì)面分析是通過(guò)計(jì)算一個(gè)數(shù)學(xué)曲面來(lái)擬合數(shù)據(jù)中的區(qū)域性分布及變化趨勢(shì)的一種數(shù)學(xué)方法,用來(lái)展示地理要素在地域空間上的變化趨勢(shì)[14]。首先采用Moran指數(shù),以廣東省縣區(qū)行政規(guī)劃為單位(包括中山市、東莞市的鄉(xiāng)鎮(zhèn)),以2013—2018年H7N9亞型禽流感病例的經(jīng)緯度坐標(biāo)為變量開展空間自相關(guān)分析,分析病例分布是否存在空間異質(zhì)性;其次,采用熱點(diǎn)分析,通過(guò)計(jì)算各個(gè)縣區(qū)的z(GiZScore)統(tǒng)計(jì)值來(lái)識(shí)別存在空間異質(zhì)性的具體區(qū)域;最后,通過(guò)趨勢(shì)面分析展示病例的經(jīng)緯度分布特征。

        1.2.2 K-means算法的聚類分析

        K-means算法是一種最廣泛使用的聚類算法,以距離作為數(shù)據(jù)對(duì)象間相似性度量的標(biāo)準(zhǔn)劃分類簇[15]。文章從總病例數(shù)(實(shí)際值)、性別(男=1、女=0)、年齡(實(shí)際值)、基礎(chǔ)病史(有基礎(chǔ)病史=1、無(wú)基礎(chǔ)病史=0)、是否活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者(是=1,否=0)、是否養(yǎng)禽人員(是=1,否=0)、活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者與養(yǎng)禽人員以外的其他人員(是=1,否=0)、居住城市(珠三角城市=1,非珠三角城市=0)5個(gè)維度分別對(duì)接觸活禽史病例、活禽市場(chǎng)暴露史病例進(jìn)行聚類分析,最佳聚類組數(shù)采用肘部法則(Elbow Method)的方法選定,并采用方差分析法比較各組類的特征差異,評(píng)價(jià)聚類區(qū)分效果。

        1.2.3 Apriori算法的關(guān)聯(lián)分析

        Apriori算法是常用的用于挖掘出數(shù)據(jù)關(guān)聯(lián)規(guī)則的算法,用來(lái)找出數(shù)據(jù)值中頻繁出現(xiàn)的數(shù)據(jù)集合[16]。首先描述性統(tǒng)計(jì)2種活禽高危因素的病例數(shù)與3個(gè)防控措施的比例關(guān)系,然后采用支持度、置信度和重要性衡量Apriori算法的3個(gè)防控措施分別與活禽高危因素的病例數(shù)的關(guān)聯(lián)規(guī)則強(qiáng)度,支持度揭示了防控措施與活禽高危因素病例數(shù)同時(shí)出現(xiàn)的概率,如果概率小則說(shuō)明關(guān)系較小,反之較大;置信度揭示了防控措施出現(xiàn)時(shí),活禽高危因素病例數(shù)是否也會(huì)出現(xiàn)或有多大概率出現(xiàn)。置信度越大,說(shuō)明防控措施的出現(xiàn)與活禽高危因素病例數(shù)是否出現(xiàn)關(guān)系較大;重要性大于1表示一旦出現(xiàn)防控措施則再出現(xiàn)活禽高危因素病例的概率會(huì)增加,小于1表示一旦出現(xiàn)防控措施則再出現(xiàn)活禽高危因素病例的概率會(huì)降低。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 疫情分布概況

        圖1是2013—2017年廣東省人H7N9亞型禽流感病例分布(由于2018年廣東省僅發(fā)生1例病例,分布不明顯,圖略),264個(gè)病例分布在19個(gè)地級(jí)市(除茂名市、湛江市外)的72個(gè)縣區(qū)(包括中山市和東莞市的鄉(xiāng)鎮(zhèn))。發(fā)病數(shù)前三的是深圳市(50例)、廣州市(39例)、佛山市(22例),共占全省病例總數(shù)的58.16%。從圖1可觀察到,廣東省H7N9亞型禽流感病例2013年首先發(fā)生在珠三角地區(qū)的惠州市、東莞市、深圳市以及粵西地區(qū)的陽(yáng)江市,在2014—2015年迅速擴(kuò)散到粵東與粵北地區(qū),整個(gè)珠三角地區(qū)疫情加重,2016年之后疫情趨勢(shì)放緩,但進(jìn)一步擴(kuò)散至粵東與粵北地區(qū)。

        2.2 疫情的空間分布特點(diǎn)

        2013和2018年病例數(shù)少,故不做分析,廣東省2014—2017 年H7N9 禽流感病例分布的Moran指數(shù)分別為0.032(z=0.973,P=0.165)、-0.035(z=-0.181,P=0.428)、-0.099(z=-0.384,P=0.351)、0.106(z=1.601,P=0.055),可見(jiàn),僅有2017年發(fā)生的病例具有顯著的空間相關(guān)性,其他年份的病例分布不存在顯著的時(shí)空聚集性。病例分布的熱點(diǎn)分析結(jié)果見(jiàn)圖2, H7N9 禽流感的熱點(diǎn)區(qū)域(z≥1.96)主要是珠三角地區(qū)(病例數(shù)占全省總數(shù)的72.35%)。

        圖1 2013—2017年廣東省亞型H7N9禽流感病例分布情況

        趨勢(shì)面分析結(jié)果(見(jiàn)圖3)顯示,在XZ 平面上病例分布呈現(xiàn)中間低兩邊高的趨勢(shì),即在東西走向上,病例分布呈現(xiàn)“少—多—少”的趨勢(shì),即珠三角病例較多,東西兩翼病例較少;在YZ 平面上可見(jiàn)病例數(shù)隨緯度增加而減少,即在南北走向上,珠三角地區(qū)比粵北地區(qū)病例數(shù)更多。

        2.3 K-means算法的聚類分析

        通過(guò)肘部法則(見(jiàn)圖4和圖5),選定活禽接觸史病例、活禽市場(chǎng)暴露史病例的最佳聚類組數(shù)是3和4。

        圖2 2013—2018年廣東省H7N9亞型禽流感病例分布熱點(diǎn)

        注:z、x、y構(gòu)成了二元一次方程,其中,x,y作為自變量,分別代表經(jīng)度、緯度

        圖4 活禽接觸史病例的最佳聚類組數(shù)

        圖5 活禽市場(chǎng)暴露史病例的最佳聚類組數(shù)

        根據(jù)方差分析結(jié)果(見(jiàn)表1),年齡、基礎(chǔ)病史、居住城市、是否活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者、其他人員的特征差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),區(qū)分效果較好,因此,3個(gè)類別的活禽接觸史病例特征分別是:58.27歲、有基礎(chǔ)病史、82%來(lái)自珠三角城市、64%是活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者、9%為其他人員;58.88歲、有基礎(chǔ)病史、82%來(lái)自珠三角城市、82%是活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者、18%為其他人員;46.45歲、無(wú)基礎(chǔ)病史、66%來(lái)自珠三角城市、活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者。由此可見(jiàn),活禽接觸史病例的共性特征是以中年、有基礎(chǔ)病史、來(lái)自珠三角城市以及在市場(chǎng)從事活禽銷售為主。

        表1 活禽接觸史病例的聚類結(jié)果

        根據(jù)方差分析結(jié)果(見(jiàn)表2),性別、年齡、基礎(chǔ)病史的特征差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),區(qū)分效果較好,因此,4個(gè)類別的活禽市場(chǎng)暴露史病例特征分別是:男性、71.61歲、84%有基礎(chǔ)病史;女性、68.24歲、73%有基礎(chǔ)病史;61%是男性、35歲、4%有基礎(chǔ)病史;男性、70.91歲、96%有基礎(chǔ)病史。這表明,活禽市場(chǎng)暴露史病例的共性特征是中年、男性、無(wú)基礎(chǔ)病史為主。

        表2 活禽市場(chǎng)暴露史病例的聚類結(jié)果

        2.4 Apriori算法的關(guān)聯(lián)分析

        總體上,活禽高危因素的病例數(shù)隨著三大措施的啟動(dòng)或強(qiáng)化而減少(見(jiàn)表3),但是,三大措施產(chǎn)生的效果不同,對(duì)家禽實(shí)施H7N9免疫措施對(duì)減少兩種活禽高危因素的病例數(shù)效果最佳,將有接觸活禽史的病例數(shù)和有活禽市場(chǎng)暴露史的病例數(shù)減少了28.68%、69.43%;其次是活禽交易限制措施,隨著措施的啟動(dòng)再到強(qiáng)化,兩種活禽高危因素的病例數(shù)逐漸減少。然而,活禽調(diào)運(yùn)限制措施從啟動(dòng)到強(qiáng)化,對(duì)有活禽市場(chǎng)暴露史病例數(shù)減少有很大效果,但反而增加了有接觸活禽史的病例數(shù),這可能是因?yàn)?,加?qiáng)活禽調(diào)運(yùn)管制主要是限制活禽從省外調(diào)入廣東,但廣東省作為活禽養(yǎng)殖大省,由于環(huán)境規(guī)制,活禽只能從省內(nèi)的主產(chǎn)區(qū)(非珠三角地區(qū))向主銷區(qū)(珠三角地區(qū))的活禽交易市場(chǎng)調(diào)運(yùn),從上述聚類分析可知,活禽接觸史病例以珠三角和在市場(chǎng)上從事活禽銷售的患者為主,所以活禽市場(chǎng)經(jīng)營(yíng)者可能接觸了主產(chǎn)區(qū)的染疫活禽而感染病毒。

        表3 活禽高危因素的病例數(shù)與3個(gè)防控措施的比例關(guān)系%

        表4中規(guī)則編號(hào)1~6、7~10、11~14分別表示活禽交易限制措施、活禽調(diào)運(yùn)限制措施、活禽H7N9免疫措施對(duì)接觸活禽史病例數(shù)的影響。為突出強(qiáng)關(guān)聯(lián)性,本研究以最小支持度為0.3、最小置信度為0.7、最小重要性為1.0作為強(qiáng)關(guān)聯(lián)規(guī)則的篩選標(biāo)準(zhǔn),選擇規(guī)則編碼2、7、12進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),未啟動(dòng)活禽交易限制措施增加活禽市場(chǎng)暴露史病例的概率是70.9%,啟動(dòng)活禽調(diào)運(yùn)限制措施減少接觸活禽史病例數(shù)的概率是70.60%,未啟動(dòng)活禽H7N9免疫措施增加活禽市場(chǎng)暴露史病例數(shù)的概率是71.70%,由此可見(jiàn),三項(xiàng)措施啟動(dòng)前后與活禽高危因素病例數(shù)的相關(guān)性高,未啟動(dòng)活禽交易限制措施和活禽H7N9免疫措施,容易將潛在的或染疫的活禽帶進(jìn)市場(chǎng)污染環(huán)境,而從上述聚類分析可知,活禽市場(chǎng)暴露史患者主要是中年、男性,無(wú)顯著的活禽從業(yè)身份,因此,他們到農(nóng)貿(mào)市場(chǎng)買菜但不接觸活禽、經(jīng)過(guò)或住在活禽市場(chǎng)周邊都比較容易感染病毒。而啟動(dòng)活禽調(diào)運(yùn)限制措施,有助于減少活禽接觸史病例,這與上述強(qiáng)化活禽調(diào)運(yùn)限制反而增加活禽接觸史病例數(shù)的區(qū)別在于,廣東省的首例疫情發(fā)生于2013年8月,而啟動(dòng)活禽調(diào)運(yùn)限制是2013年6月,該措施有效地禁止江浙一帶發(fā)生疫情省份的商品活禽進(jìn)入省內(nèi),避免了人與活禽接觸感染病毒。

        表4 三個(gè)防控措施與活禽高危因素病例數(shù)的關(guān)聯(lián)規(guī)則

        3 討論

        在分析廣東省H7N9亞型禽流感病例特征的基礎(chǔ)上,數(shù)據(jù)挖掘有助于發(fā)現(xiàn)活禽高危因素病例數(shù)和防控措施可能存在的關(guān)聯(lián)或聯(lián)系,使分析結(jié)果更具科學(xué)性,豐富了活禽高危因素防控研究。廣東省人H7N9亞型禽流感防控得當(dāng),從2018年至今,省內(nèi)幾乎沒(méi)有發(fā)生人H7N9病例,這與廣東省清楚認(rèn)識(shí)活禽高危因素,啟動(dòng)或強(qiáng)化活禽交易限制措施、活禽調(diào)運(yùn)限制措施、活禽H7N9免疫措施分不開。然而,這兩年全國(guó)范圍內(nèi)的H7N9疫情呈散發(fā)狀態(tài),仍未被消滅和凈化,存在潛在威脅,例如,2019年4月內(nèi)蒙古發(fā)生1起人H7N9病例。因此,在未來(lái)一段時(shí)間內(nèi),我國(guó)的H7N9疫情仍將繼續(xù)存在,防控的弦時(shí)刻都要緊繃,尤其是江蘇、浙江、廣東等高風(fēng)險(xiǎn)地區(qū)。根據(jù)2019年7~8月本課題組在珠三角開展的家禽產(chǎn)業(yè)鏈H7N9疫情傳播途徑溯源調(diào)查發(fā)現(xiàn),由于廣東省一年多來(lái)未發(fā)生1例病例,一些喜食現(xiàn)宰活禽的廣東人強(qiáng)烈呼吁縮小甚至取消活禽經(jīng)營(yíng)限制區(qū),給活禽交易限制措施的繼續(xù)施行添加了不小壓力。可觀的是,活禽調(diào)運(yùn)限制措施、活禽H7N9免疫措施的預(yù)防作用得到政府部門和活禽產(chǎn)銷商的認(rèn)可,繼續(xù)實(shí)施的壓力不大。因此,在H7N9亞型禽流感徹底根除之前,建議廣東省在全省范圍內(nèi),尤其是珠三角地區(qū)繼續(xù)實(shí)施活禽交易限制與活禽H7N9免疫措施,加強(qiáng)活禽交易限制預(yù)防H7N9疫情的宣傳引導(dǎo)。在周邊省份出現(xiàn)疫情風(fēng)險(xiǎn)的時(shí)候,果斷采取活禽調(diào)運(yùn)限制措施,如果疫情加劇,則強(qiáng)化活禽交易限制和活禽調(diào)運(yùn)管控。

        然而,本文在分析的過(guò)程中仍存在不足之處:首先,采用Moran指數(shù)開展病例分布特征分析時(shí)未將兩類活禽高危因素人群的病例分布特征進(jìn)行時(shí)空分布展示,在一定程度上與下文的聚類分析和關(guān)聯(lián)分析脫節(jié);其次,聚類分析與關(guān)聯(lián)分析之前尚未將活禽高危因素防控措施實(shí)施與兩類活禽高危因素人群病例減少的傳導(dǎo)機(jī)制進(jìn)一步闡釋,使得研究中心不夠凸顯;未找到合理的方法剝離三項(xiàng)防控措施交錯(cuò)產(chǎn)生的效果,例如,2017年6月廣東省啟動(dòng)活禽H7N9免疫措施時(shí),但活禽交易限制強(qiáng)化措施、活禽調(diào)運(yùn)防控強(qiáng)化措施同時(shí)也在實(shí)施,最終將疫情控制下來(lái),這可能離不開所有措施共同發(fā)揮的作用。因此,這些將是下一階段要努力的研究方向。

        4 結(jié)論

        基于廣東省2013年8月到2018年2月的H7N9亞型禽流感病例和活禽交易限制、活禽調(diào)運(yùn)限制、活禽H7N9免疫三大防控措施的啟動(dòng)、強(qiáng)化情況,通過(guò)Moran指數(shù)空間自相關(guān)分析、空間熱點(diǎn)分析、趨勢(shì)面分析、K-means算法聚類分析和Apriori算法關(guān)聯(lián)規(guī)則分析可知,廣東省H7N9禽流感疫情起源于珠三角地區(qū),并向周邊逐步擴(kuò)散,但珠三角地區(qū)是熱點(diǎn)區(qū)域,其他地區(qū)發(fā)生的病例相對(duì)較少,僅2017年的病例分布存在顯著的時(shí)空聚焦性?;钋萁佑|史病例可分為3個(gè)類別,患者以中年、有基礎(chǔ)病史、來(lái)自珠三角城市以及從事活禽銷售為主,而活禽市場(chǎng)暴露史病例可分為4個(gè)類別,患者以男性、中年、無(wú)基礎(chǔ)病史為主?;钋莞呶R蛩氐牟±龜?shù)與3個(gè)防控措施的比例關(guān)系中,對(duì)家禽實(shí)施活禽H7N9免疫措施對(duì)減少兩種活禽高危因素的病例數(shù)效果最佳,其次是活禽交易限制措施。在強(qiáng)關(guān)聯(lián)規(guī)則下,未啟動(dòng)活禽交易限制措施增加活禽市場(chǎng)暴露史病例的概率是70.90%,未啟動(dòng)活禽H7N9免疫增加活禽市場(chǎng)暴露史病例的概率是71.70%,而啟動(dòng)活禽調(diào)運(yùn)限制減少接觸活禽史病例數(shù)的概率為70.60%。研究表明,廣東省在H7N9亞型禽流感疫情期間實(shí)施的三大措施對(duì)減少因接觸活禽與活禽市場(chǎng)暴露的H7N9病例的作用是顯著的。

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