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        弓形蟲病分子生物學(xué)診斷方法的研究進(jìn)展

        2021-02-28 15:15:11劉道華汪天平
        熱帶病與寄生蟲學(xué) 2021年2期
        關(guān)鍵詞:檢測方法

        劉道華,汪天平

        安徽省寄生蟲病防治研究所,安徽 合肥 230601

        弓形蟲病(toxoplasmosis)是由剛地弓形蟲寄生人體導(dǎo)致的人獸共患機(jī)會性寄生蟲病,呈世界性分布。免疫機(jī)能正常者感染弓形蟲常呈自限性,無明顯臨床表現(xiàn),多呈隱性感染狀態(tài)。AIDS患者和腫瘤患者等免疫功能低下者感染弓形蟲常導(dǎo)致嚴(yán)重后果,主要表現(xiàn)為腦炎、視網(wǎng)膜脈絡(luò)膜炎或精神異常等,嚴(yán)重者可引起死亡[1-2]。孕婦感染弓形蟲可通過胎盤垂直傳播,引起不良妊娠結(jié)局,或引起嬰兒先天性弓形蟲病[3-5]。

        目前,弓形蟲病的診斷方法主要分為病原學(xué)方法、免疫學(xué)方法及分子生物學(xué)方法。病原學(xué)檢測包括直接鏡檢、滋養(yǎng)體檢查及動物組織內(nèi)包囊的檢查等。但病原學(xué)檢測所需時間較長,且敏感性和特異性較差。免疫學(xué)方法主要檢測血清或組織液等標(biāo)本中的弓形蟲抗體,適用于流行病學(xué)調(diào)查,但易出現(xiàn)假陽性,只能作為弓形蟲病的輔助診斷。分子生物學(xué)技術(shù)的許多新方法也逐漸應(yīng)用于弓形蟲病的診斷,為弓形蟲病的診斷提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支撐。本文旨在對分子生物學(xué)的新技術(shù)和新方法在弓形蟲病診斷中的應(yīng)用及發(fā)展前景等進(jìn)行綜述。

        1 核酸分子雜交

        核酸分子雜交技術(shù)是依據(jù)核酸分子的變性、復(fù)性,使來源不同的DNA(或RNA)片段,按照堿基互補(bǔ)配對的原則形成雜交雙鏈分子。核酸分子雜交具有特異性高、靈敏性強(qiáng)等優(yōu)點,國內(nèi)外學(xué)者陸續(xù)將其應(yīng)用于弓形蟲病的診斷。

        夏愛娣等[6]采用32P標(biāo)記的弓形蟲DNA探針與無腦兒、腦積水及死胎標(biāo)本的DNA進(jìn)行核酸分子雜交,成功檢測出弓形蟲陽性標(biāo)本。陳海峰等[7]用RH株弓形蟲抗原SAG1基因編碼序列,構(gòu)建pcDNA3-SAG1重組表達(dá)質(zhì)粒,運(yùn)用核酸分子雜交方法可以檢測弓形蟲SAG1的存在。張洪花等[8]應(yīng)用生物素標(biāo)記的核酸探針檢測腦囊蟲病人、癲癇患者及健康人群的弓形蟲感染狀況,發(fā)現(xiàn)核酸分子雜交技術(shù)可應(yīng)用于弓形蟲病的現(xiàn)場調(diào)查。此外,研究者通過PCR擴(kuò)增弓形蟲TGR4核酸片段,用地高辛標(biāo)記探針和待測樣本進(jìn)行核酸雜交,結(jié)果顯示,此探針不僅特異性較好,且具有較好的敏感性[9]。國外相關(guān)研究者采用同位素標(biāo)記探針的酶聯(lián)免疫滲濾試驗檢測弓形蟲的DNA,結(jié)果發(fā)現(xiàn)核酸分子雜交技術(shù)具有較好的敏感性、特異性,還可節(jié)約時間,實現(xiàn)操作的自動化[10]。

        2 聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)

        20世紀(jì)80年代,美國PE公司成功推出了一套快速DNA擴(kuò)增系統(tǒng),使目的DNA片段的拷貝數(shù)擴(kuò)增至百萬倍以上,具有特異、敏感和操作簡便等優(yōu)點[11]。隨著PCR技術(shù)的深入研究和快速發(fā)展,衍生出了巢氏PCR、熒光定量PCR、原位PCR、多重PCR等相關(guān)技術(shù),這些方法均逐漸應(yīng)用于弓形蟲病的診斷。

        2.1常規(guī)PCR PCR利用堿基互補(bǔ)配對的原則,經(jīng)高溫變性、低溫復(fù)性、子鏈延伸的不斷循環(huán),在體外快速、選擇性地擴(kuò)增目的基因。 謝德華等[12]以弓形蟲核糖體DNA第一內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS1)序列作為遺傳標(biāo)記,利用上游引物:5'-GATTTGCATTCAAGAAGCGTGATAGTAT-3',下游引物:5'-AGTTTAGGAAGCAATCTGAAAGCACATC-3',構(gòu)建了PCR診斷方法。該方法可檢測出10個弓形蟲速殖子DNA,且與其他8種原蟲和線蟲均無交叉反應(yīng),證實該方法具有較高的靈敏性和特異性。此外,有關(guān)學(xué)者以弓形蟲高度重復(fù)基因序列 529 bp建立了PCR診斷方法,最低可檢測出10個拷貝的弓形蟲DNA片段[13]。

        PCR技術(shù)建立起來后,迅速應(yīng)用到臨床試驗。研究者采用PCR技術(shù)對生殖道、分泌物、孕婦和3個月以下嬰兒全血進(jìn)行弓形蟲感染的檢測,同時采用酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)進(jìn)行了比較分析,證實了PCR技術(shù)檢測弓形蟲感染具有較高的可靠性[14-15]。

        2.2巢式PCR 巢式PCR是對常規(guī)PCR技術(shù)的完善、改進(jìn)及發(fā)展,應(yīng)用兩對引物擴(kuò)增DNA片段。Fuentes等[16]首次采用根據(jù)弓形蟲B1基因建立了巢氏PCR,所用上游引物:5'-GGAACTGCATCCGTTCATGAG-3',下游引物:5'-TCTTTAAAGCGTTCGTGGTC-3',并用該方法檢測尿液中弓形蟲DNA,進(jìn)行嬰兒先天性弓形蟲病的產(chǎn)前診斷。另外,國外有學(xué)者根據(jù)弓形蟲B1基因構(gòu)建了巢式PCR,并證實該方法可確診弓形蟲性視網(wǎng)膜脈絡(luò)膜炎[17]。張瑩光等[18]根據(jù)弓形蟲529 bp重復(fù)序列設(shè)計引物,建立巢式PCR檢測方法,檢測出0.1 pg的弓形蟲DNA,其最低檢測限比常規(guī)PCR提高了100倍,且該方法對蜥蜴利什曼原蟲、隱孢子蟲、細(xì)粒棘球絳蟲基因組擴(kuò)增無條帶,特異性強(qiáng)。程寧等[19]采用巢式PCR對早產(chǎn)兒和正常新生兒進(jìn)行弓形蟲DNA的篩查,結(jié)果發(fā)現(xiàn)早產(chǎn)兒弓形蟲感染率較高,提示弓形蟲感染可能是引起早產(chǎn)的危險因素之一。

        隨著巢式PCR的發(fā)展,又出現(xiàn)了半巢式PCR技術(shù)。半巢式PCR應(yīng)用3條引物而進(jìn)行2次PCR擴(kuò)增,具有操作簡便、特異性強(qiáng)、靈敏性高等優(yōu)點。王素華[20]利用弓形蟲RH株的P30基因設(shè)計了3條特異性引物P1、P2及P3,成功構(gòu)建半巢氏PCR 檢測技術(shù),并證實該方法靈敏性高,可檢測18 fg的弓形蟲DNA??椎孟璧萚21]同樣利用弓形蟲的P30基因為作為研究對象,建立了半巢式PCR檢測體系,證實了最低可檢測18 fg的弓形蟲DNA,極大地提高了檢出率,為弓形蟲早期診斷奠定基礎(chǔ)。

        2.3熒光定量PCR 熒光定量PCR,又稱為實時定量PCR,將探針技術(shù)與PCR技術(shù)有機(jī)結(jié)合,通過測定PCR產(chǎn)物中的DNA含量來定量分析待檢樣本中目的DNA或者mRNA的含量。

        近年來,國內(nèi)外學(xué)者根據(jù)GenBank中弓形蟲529 bp重復(fù)序列、GRA7基因、B1基因及GRA6基因分別設(shè)計熒光定量PCR的引物,成功構(gòu)建了弓形蟲熒光定量PCR檢測方法[22-23]。研究者還利用構(gòu)建的熒光定量PCR方法,對無償獻(xiàn)血者進(jìn)行弓形蟲感染的篩查,對病死豬及組織樣品進(jìn)行弓形蟲感染情況的檢測,并與常規(guī)PCR方法進(jìn)行比較分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)熒光定量PCR法的檢出率顯著高于常規(guī)PCR法[24]。此外,采用特定熒光定量PCR引物對新孢子蟲、牛巴貝斯蟲等寄生蟲DNA的檢測,結(jié)果均為陰性,顯示出較好的特異性[25]。因此,熒光定量PCR比常規(guī)PCR技術(shù)更加快捷、敏感、準(zhǔn)確,適合臨床實驗室及相關(guān)標(biāo)本弓形蟲感染的檢測。

        2.4原位PCR 1990年,Hasse等人將PCR技術(shù)和原位雜交技術(shù)結(jié)合在一起,成功建立了原位多聚酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)技術(shù),簡稱原位PCR[26]。原位PCR將原位雜交的定位性與PCR的高度敏感性結(jié)合,極大地提高了原位雜交對低復(fù)制樣品檢測的敏感性,克服了PCR技術(shù)因擴(kuò)增產(chǎn)物無法在細(xì)胞組織中定位而不能與形態(tài)學(xué)特征結(jié)合的不足。

        李爽等[27]以弓形蟲RH株的速殖子感染小鼠,取肝臟制備了石蠟標(biāo)本及冰凍切片標(biāo)本,采用直接原位PCR擴(kuò)增并檢測石蠟標(biāo)本中的弓形蟲DNA,結(jié)果弓形蟲病原體檢出率為100%,顯著優(yōu)于免疫組化法。盧慎[28]應(yīng)用間接原位PCR技術(shù),檢測3所醫(yī)院共86例病理診斷為慢性非特異性淋巴結(jié)炎患者石蠟包埋切片組織中的弓形蟲DNA,結(jié)果發(fā)現(xiàn)47例弓形蟲陽性,占54.65%。此外,他還采用免疫組化、原位雜交及間接原位PCR技術(shù)三種方法,檢測71例診斷為慢性非特異性淋巴結(jié)炎(淋巴結(jié)反應(yīng)性增生)患者組織切片中的弓形蟲,結(jié)果發(fā)現(xiàn),間接原位PCR的檢出率明顯高于免疫組化和原位雜交法[29]。

        2.5多重PCR 多重PCR(MPCR)又稱多重引物PCR或復(fù)合PCR技術(shù),是1988年Chamberlian等首次提出的[30]。多重PCR的主要優(yōu)勢是在同一個反應(yīng)體系中加入兩對或兩對以上引物,分別擴(kuò)增不同的模板,可同時得到不同的目的片段。因此,多重PCR技術(shù)不但保留了常規(guī)PCR方法的特異性及敏感性,而且減少了操作步驟和試劑用量,提高了檢測效率,節(jié)約了檢測成本。

        趙錦等[31]成功構(gòu)建了可同時檢測弓形蟲和乙肝DNA的多重PCR,以乙肝病人血液及弓形蟲RH實驗動物腹水為樣本,通過基因片段篩選,進(jìn)行弓形蟲和乙肝病毒基因片段的擴(kuò)增,證明該方法能夠有效診斷弓形蟲感染,可用于弓形蟲感染的實驗室篩查。彭武麗等[32]以牛新孢子蟲Nc-5基因和弓形蟲GRA6基因作為目的基因,各設(shè)計一對PCR引物,建立了可同時檢測牛新孢子蟲和弓形蟲的雙重PCR方法,并用該方法對臨床樣品進(jìn)行篩檢,證明此方法具有較好的特異性和重復(fù)性。于新友等[33]依據(jù)GenBank中豬弓形蟲和附紅細(xì)胞體核苷酸序列,分別設(shè)計兩對引物,優(yōu)化雙重PCR反應(yīng)條件,成功構(gòu)建了雙重PCR檢測體系,此方法可同時進(jìn)行這兩種病原的檢測。

        3 環(huán)介導(dǎo)等溫擴(kuò)增技術(shù)(LAMP)

        2000年,日本學(xué)者Notomi等人研發(fā)了一種快速、簡單、靈敏、特異且低成本的恒溫核酸擴(kuò)增技術(shù),即LAMP技術(shù)[34]。LAMP技術(shù)具有擴(kuò)增效率高、操作步驟簡單、靈敏性極高、特異度好、結(jié)果判定簡便等諸多優(yōu)點。LAMP技術(shù)一經(jīng)問世,迅速應(yīng)用于寄生蟲病領(lǐng)域,并取得良好效果。

        近年來,研究者根據(jù)弓形蟲SAG1基因、529 bp高度重復(fù)序列,分別設(shè)計兩對特異性引物,不斷優(yōu)化反應(yīng)步驟和實驗條件,成功構(gòu)建了LAMP法。在建立LAMP技術(shù)的基礎(chǔ)上,對人血清和人工接種動物肌肉組織弓形蟲感染情況進(jìn)行檢測,并與常規(guī)PCR法、ELISA法進(jìn)行對比分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)LAMP法的最低檢測限比傳統(tǒng)PCR提高了100倍,且與其他人體常見寄生蟲及原蟲無任何交叉反應(yīng)現(xiàn)象,還可彌補(bǔ)ELISA 法僅檢測弓形蟲抗體而無法確診的不足[35-36]。此外,LAMP法也被應(yīng)用到豬弓形蟲病的診斷。在建立豬弓形蟲病LAMP檢測體系的基礎(chǔ)上,對豬血液樣本進(jìn)行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)LAMP法具有極高的敏感性,且與常見病原體沒有交叉反應(yīng),能夠作為判斷家畜是否感染弓形蟲的分子檢測手段[37-38]。

        4 基因芯片技術(shù)

        基因芯片技術(shù)又稱DNA芯片技術(shù),是將大量的探針分子固定于支持物后與待檢樣本雜交,依據(jù)檢測探針上的雜交信號而獲取待檢樣本的相關(guān)信息。基因芯片具有高通量、微型化、多樣化和自動化等諸多優(yōu)勢。近年來,基因芯片技術(shù)飛速發(fā)展,并逐漸應(yīng)用于醫(yī)學(xué)研究領(lǐng)域,在疾病的診斷、藥物靶點的篩選和致病基因的測序等方面得到了廣泛應(yīng)用,發(fā)展前景十分廣闊[39-42]。

        易廣才[43]依據(jù)Genbank 中弓形蟲(TOX)、風(fēng)疹病毒(RV)、巨細(xì)胞病毒(HCMV169)、單純皰疹病毒(HSV-Ⅰ、HSV-Ⅱ)基因序列分別設(shè)計16只寡核苷酸探針,成功構(gòu)建基因芯片技術(shù),證明該基因芯片可同時檢測5種致病微生物,并與熒光定量PCR法進(jìn)行比較,結(jié)果基本一致。此外,研究者根據(jù)弓形蟲基因和常見人獸共患病原基因作為目的基因,設(shè)計合成特異性引物及適宜探針,成功構(gòu)建了液相基因芯片檢測方法,并通過實驗證實,該方法檢測弓形蟲感染具有較好的敏感性和特異性[44-45]。

        5 基因測序技術(shù)

        基因測序技術(shù)是鑒定目的基因最準(zhǔn)確的方法,最早建立的DNA測序方法有兩種,即Sanger雙脫氧末端終止法和化學(xué)降解法[46]。人類基因組計劃的實施推動了基因測序技術(shù)的發(fā)展,在第一代基因測序技術(shù)的基礎(chǔ)上,已經(jīng)發(fā)展到第二代測序技術(shù)、第三代單分子測序技術(shù)和單細(xì)胞測序技術(shù)。

        郭玲玲等[47]提取弓形蟲RH株速殖子總RNA,根據(jù)棒狀體蛋白18基因(TgROP18)的開放閱讀框設(shè)計引物,采用逆轉(zhuǎn)錄PCR擴(kuò)增ROP18基因,并對其產(chǎn)物進(jìn)行測序,經(jīng)生物信息學(xué)分析表明,TgROP18蛋白具有良好的免疫原性,為弓形蟲疫苗的研究提供基礎(chǔ)資料。劉楠等[48]提取弓形蟲總RNA,根據(jù)TgROP16基因的開放閱讀框架設(shè)計引物,采用逆轉(zhuǎn)錄PCR(RT-PCR)擴(kuò)增ROP16基因,經(jīng)基因測序及生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),TgROP16蛋白具有良好的抗原性及免疫原性,有望作為弓形蟲疫苗候選分子。章瑩等[49]成功提取了弓形蟲RH株的cDNA和基因組DNA,經(jīng)酶切反應(yīng)、PCR擴(kuò)增及基因序列測定,發(fā)現(xiàn)了在原核表達(dá)系統(tǒng)中高效表達(dá)的重組蛋白,該重組蛋白具有較好的生物學(xué)活性,可能成為弓形蟲特異性藥物靶標(biāo)之一。

        6 結(jié) 語

        綜上所述,核酸分子雜交技術(shù)具有特異性強(qiáng)、靈敏度高的優(yōu)點,且可對DNA或RNA進(jìn)行定性、定量檢測。PCR技術(shù)及衍生的諸多新分子生物學(xué)技術(shù),不僅提高了弓形蟲病檢測的敏感性和特異性,而且為弓形蟲病的實驗室診斷和流行病學(xué)篩查提供了強(qiáng)有力的技術(shù)支持。LAMP法在檢測弓形蟲感染方面具有快速簡便、敏感性高、設(shè)備要求低等優(yōu)點,應(yīng)用前景良好?;蛐酒夹g(shù)和基因測序技術(shù)逐漸應(yīng)用于弓形蟲病的診斷、藥物靶點的篩選等方面,其發(fā)展前景令人期待。隨著分子生物學(xué)檢測技術(shù)的飛速發(fā)展和不斷完善,其作為一種可彌補(bǔ)病原學(xué)、免疫學(xué)檢測不足的新方法,必將給弓形蟲病的診斷提供更強(qiáng)有力的技術(shù)支撐。

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