孔 瓊,王傳銘,汪斌偉,張曉媛,李 珣,謝 昆,舒 茜,黃鏡梅,袁盛勇
(紅河學(xué)院生物科學(xué)與農(nóng)學(xué)學(xué)院/云南省高校滇南特色生物資源研究與利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南 蒙自 661199)
【研究意義】南瓜實(shí)蠅[Bactroceratau(Walker)]是一種重要的農(nóng)業(yè)檢疫性害蟲(chóng),分布于東南亞和南太平洋地區(qū)[1],而中國(guó)主要分布于東南沿海、華中、華南、西南等地區(qū)。寄主范圍廣,能危害16個(gè)科80多種植物,尤其是果蔬類(lèi)作物,會(huì)造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失。目前該蟲(chóng)仍以化學(xué)防治為主,帶來(lái)一系列不良后果,如環(huán)境污染加重、果蔬農(nóng)藥殘留超標(biāo)和害蟲(chóng)易產(chǎn)生抗藥性等[2-4]。所以,基于嗅覺(jué)靶標(biāo)的防治策略制定具有重要意義,即通過(guò)調(diào)控其覓食、產(chǎn)卵等行為進(jìn)行害蟲(chóng)防治是一個(gè)重要的研究方向,開(kāi)發(fā)綠色、環(huán)保、安全的新型昆蟲(chóng)行為干擾劑,并為南瓜實(shí)蠅的后期相關(guān)研究提供理論基礎(chǔ)?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】昆蟲(chóng)嗅覺(jué)感受器是昆蟲(chóng)感受外界揮發(fā)性化學(xué)物質(zhì)的特異感受系統(tǒng),昆蟲(chóng)通過(guò)該系統(tǒng)感知和識(shí)別氣味分子,并將其轉(zhuǎn)化為電生理信號(hào),從而調(diào)控昆蟲(chóng)對(duì)外界信息化學(xué)物質(zhì)做出反應(yīng),如取食、交配、產(chǎn)卵及躲避敵害等行為[5-6]。而這一序列過(guò)程,需要多種蛋白參與,包括氣味結(jié)合蛋白(odorant binding proteins,OBPs)、化學(xué)感受態(tài)蛋白(chemosensory proteins,CSPs)、氣味受體蛋白(odorant receptors,ORs)、氣味降解酶(odorant degrading esterase,ODEs) 、離子型受體(ionotropic receptors,IRs) 以及感覺(jué)神經(jīng)元膜蛋白 (sensory neuron membrane proteins,SNMPs)等,且每種蛋白都不可替代,發(fā)揮著重要作用[7-8]。其中OBPs是氣味分子和受體間的橋梁,起到識(shí)別并運(yùn)輸氣味分子,激活受體,降解和保護(hù)等主要功能,在昆蟲(chóng)嗅覺(jué)通訊中具有重要作用[7,9]。目前,氣味結(jié)合蛋白(OBPs)在多種昆蟲(chóng)中被鑒定出來(lái),如鱗翅目稻縱卷葉螟(Cnaphalocrocismedinalis)[10]、大蠟螟(Galleriamellonella)[11]、甜菜夜蛾(Spodopteraexigua)[12];直翅目亞洲小車(chē)蝗(Oedaleusasiaticus)[13]、沙漠蝗(Schistocercagregaria)[14];鞘翅目馬鈴薯甲蟲(chóng)(Leptinotarsadecemlineata)[15]、云南切梢小蠹(Tomicusyunnanensis)[16];膜翅目斑痣懸繭蜂(Meteoruspulchricornis)[17];雙翅目柑橘大實(shí)蠅(Bactroceraminax)[18]、斑翅果蠅(Drosophilasuzukii)[19];半翅目麥長(zhǎng)管蚜(Sitobionavenae)[20]等。雖然OBPs是一類(lèi)低分子量的水溶性蛋白,且具有相似的結(jié)構(gòu),但不同種昆蟲(chóng)其OBPs數(shù)量和組織表達(dá)差異較大[21]。【本研究切入點(diǎn)】前人關(guān)于實(shí)蠅科害蟲(chóng)桔小實(shí)蠅(B.dorsalis)、柑橘大實(shí)蠅(B.minax)、瓜實(shí)蠅(B.cucurbitae)等的OBPs鑒定、特征、組織表達(dá)及功能研究較多[18,22-23],而南瓜實(shí)蠅(B.tau)的相關(guān)研究尚未見(jiàn)報(bào)道?!緮M解決的關(guān)鍵問(wèn)題】通過(guò)南瓜實(shí)蠅轉(zhuǎn)錄組庫(kù)和NCBI搜尋氣味蛋白基因,對(duì)南瓜實(shí)蠅OBPs基因的cDNA全長(zhǎng)序列進(jìn)行克隆和分析,并采用半定量RT-PCR檢測(cè)不同OBPs基因在其組織中的表達(dá)情況,以期明確南瓜實(shí)蠅OBPs 基因的特性、表達(dá)情況,為南瓜實(shí)蠅的后續(xù)相關(guān)研究和揭示昆蟲(chóng)嗅覺(jué)反應(yīng)機(jī)制提供理論數(shù)據(jù)。
蟲(chóng)源:南瓜實(shí)蠅采用人工飼養(yǎng)3代以上的實(shí)驗(yàn)室種群。成蟲(chóng)于26 ℃,相對(duì)濕度(75±10)%,光周期L∶D=14 h∶10 h下進(jìn)行飼養(yǎng)。
主要試劑:Trizol 購(gòu)自 Invitrogen公司;通用型RNA提取試劑盒(R4130-02)購(gòu)自廣州美基生物科技有限公司);瓊脂糖凝膠回收試劑盒、載體 pMD18-T和TOP10感受態(tài)細(xì)胞購(gòu)自 TaKaRa公司;反轉(zhuǎn)錄試劑盒(HB181210)、Hieff?PCR Master Mix、三氯甲烷、瓊脂糖、無(wú)水乙醇、DL2000 DNA Marker、loading buffer等一些常用試劑購(gòu)自上海翊圣生物科技有限公司。
1.2.1 引物設(shè)計(jì) 根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果注釋篩選獲得6條南瓜實(shí)蠅OBP基因,利用Primer premier 5.0設(shè)計(jì)擴(kuò)增OBPs全長(zhǎng)和RT-PCR的所用引物(表1),引物由上海生工生物科技有限公司合成。
1.2.2 RNA提取及cDNA合成 南瓜實(shí)蠅不同組織的RNA采用通用型RNA試劑盒提取,并采用反轉(zhuǎn)錄試劑盒進(jìn)行cDNA合成,獲得cDNA于-20 ℃保存?zhèn)溆茫蛑苯佑糜诳寺』騌T-PCR。
1.2.3 南瓜實(shí)蠅OBP基因的克隆與鑒定 以cDNA為模板進(jìn)PCR擴(kuò)增,克隆OBPs的全長(zhǎng)。體系為50 μL,組成為模板cDNA 2 μL、PCR Mix 25 μL、上下游引物各2 μL、ddH2O 19 μL,反應(yīng)條件為94 ℃預(yù)變性5 min、94 ℃變性30 s、50~58 ℃退火30 s、72 ℃延伸30 s,35個(gè)循環(huán),72 ℃終延伸10 min,其中退火溫度根據(jù)引物不同進(jìn)行微調(diào)。將鑒定后的擴(kuò)增產(chǎn)物連接至pMD18-T載體,并轉(zhuǎn)化到TOP10感受態(tài)細(xì)胞中,培養(yǎng)后,挑起陽(yáng)性單克隆菌株送至上海生工生物科技有限公司測(cè)序。測(cè)序結(jié)果利用DNASTAR 7.1軟件中的SeqMan工具進(jìn)行拼接分析,獲得完整的基因編碼區(qū)序列。
1.2.4 南瓜實(shí)蠅OBPs序列分析及系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建 利用在線程序ExPASy ProtParam獲得OBPs編碼氨基酸的數(shù)量、分子量、等電點(diǎn)等信息;再通過(guò)在線程序Open Reading Frame Finder預(yù)測(cè)OBPs序列的開(kāi)放閱讀框;用Vector NTI計(jì)算序列間的相似度;同時(shí)用SignalP 4.1在線軟件進(jìn)行信號(hào)肽預(yù)測(cè);采用TMHMM工具分析蛋白質(zhì)跨膜區(qū);運(yùn)用NCBI中的BLAST工具進(jìn)行序列相似性搜索;采用MEGA 6.0軟件的neighbor-joining(NJ)法(Bootsrap1000次)進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化分析。
表1 南瓜實(shí)蠅OBPs 基因鑒定和組織表達(dá)分布所用引物
以南瓜實(shí)蠅雌、雄蟲(chóng)不同組織的cDNA為模板,β-actin為內(nèi)參照基因,用表1中的半定量特異性引物進(jìn)行擴(kuò)增。反應(yīng)體系(體積50 μL)為模板cDNA 2 μL、PCR Mix 25 μL、上下游引物各2 μL、ddH2O 19 μL;反應(yīng)程序?yàn)?4 ℃ 預(yù)變性5 min、94 ℃變性30 s、50~57 ℃退火30 s、72 ℃延伸30 s,35個(gè)循環(huán),72 ℃終延伸10 min。產(chǎn)物于1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)目標(biāo)條帶。
用設(shè)計(jì)的6對(duì)特異性全長(zhǎng)引物對(duì)南瓜實(shí)蠅OBP基因編碼區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,獲得大小為500~990 bp,與預(yù)測(cè)相符(圖1),可用于后續(xù)試驗(yàn)。
根據(jù)6對(duì)引物的特異性擴(kuò)增和測(cè)序拼接后的序列,并利用 OBPs 保守半胱氨酸(Cys,cysteine)位點(diǎn)的特征序列鑒定南瓜實(shí)蠅OBPs,再利用 PSI-Blast 和關(guān)鍵詞搜索進(jìn)行比對(duì)鑒定,共獲得6個(gè)OBPs,見(jiàn)表2。6個(gè)OBPs基因序列長(zhǎng)度在498~955 bp,編碼的氨基酸數(shù)量為128~314 aa,等電點(diǎn)于4.69~8.16,分子量大小為14.67~36.24 kDa,且每個(gè)OBP序列的N端均有具有16~26 aa組成的信號(hào)肽序列。其中OBP1編碼314個(gè)氨基酸為超長(zhǎng)鏈,相比其他的OBPs要長(zhǎng)149~223 aa,而OBP2、OBP9、OBP11和OBP14為長(zhǎng)鏈,編碼的氨基酸分別為165、154、148和148個(gè),OBP8則為中鏈,編碼128 aa。
同時(shí)根據(jù)OBPs保守Cys殘基數(shù)目和多序列比對(duì)發(fā)現(xiàn)南瓜實(shí)蠅OBPs具有典型的保守結(jié)構(gòu)域,其中OBP1、OBP2、OBP9、OBP11和OBP14等5個(gè)屬于Classica型,均含有6個(gè)保守半胱氨酸位點(diǎn);而OBP8的第2、5個(gè)保守半胱氨酸位點(diǎn)被其他氨基酸代替,在分類(lèi)上屬于Minus型(圖2)。
通過(guò)南瓜實(shí)蠅6個(gè)OBPs序列間的相似度對(duì)比發(fā)現(xiàn),不同序列間的相似性較低為30%~51%(表3)。其中OBP8和OBP9的氨基酸序列相似性最高達(dá)51%;OBP11和OBP14次之,為49%;OBP2和OBP9、OBP8和OBP11較低為40%;OBP1和OBP11的相似性最低為30%,表明6個(gè)南瓜實(shí)蠅OBPs在一定程度上具有同源性,也存在著較強(qiáng)的分化差異。
表2 南瓜實(shí)蠅OBPs基因序列分析
表3 南瓜實(shí)蠅6個(gè)OBP氨基酸序列的相似性
為了明確南瓜實(shí)蠅OBP與其他近緣種的進(jìn)化關(guān)系,以南瓜實(shí)蠅OBPs氨基酸序列進(jìn)行BLAST比對(duì),并選取比對(duì)結(jié)果相似性大于70%且與南瓜實(shí)蠅OBPs相近的12種雙翅目實(shí)蠅科昆蟲(chóng)共48個(gè)OBPs進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建(圖3)。由圖3可知,6個(gè)南瓜實(shí)蠅OBP分布在其他實(shí)蠅科昆蟲(chóng)的OBPs分枝上,沒(méi)有特化形成單一分枝。其中OBP1、OBP2、OBP14聚于同一大進(jìn)化分枝,又分別聚于不同的小進(jìn)化枝(OBP1、OBP2聚于同一進(jìn)化枝,OBP14單獨(dú)為另一枝),3個(gè)均為Classic型;OBP11單獨(dú)分布在另一進(jìn)化枝上,屬于Classic 型;而OBP8、OBP9聚類(lèi)在同一大類(lèi)的進(jìn)化分枝上,但是又分別聚于不同小進(jìn)化枝上,且OBP9是Classic型,而OBP8是Minus型,結(jié)果表明它們之間具有一定的同源性,但又存在分化。與其他雙翅目昆蟲(chóng)比對(duì)發(fā)現(xiàn),6個(gè)南瓜實(shí)蠅OBPs與瓜實(shí)蠅(Zeugodacuscucurbitae)的OBPs親緣關(guān)系較近,柑橘大實(shí)蠅(B.minax)次之;雖然不同OBPs之間分化程度明顯,但相同OBPs亞家族仍然聚類(lèi)到同一進(jìn)化枝,表明其在進(jìn)化過(guò)程中仍具有同源性。
采用半定量PCR對(duì)6個(gè)OBPs基因在南瓜實(shí)蠅的不同性別、成蟲(chóng)不同組織中的表達(dá)情況進(jìn)行檢測(cè),從圖4可看出,除OBP14在雄蟲(chóng)腹部組織不表達(dá),且在雌蟲(chóng)頭、足和腹部表達(dá)較少外,其余5個(gè)OBPs在雌、雄蟲(chóng)的不同組織中均有分布和表達(dá)。其中OBP1在雌雄蟲(chóng)的不同組織中均有表達(dá)和分布且表達(dá)量相對(duì)一致,OBP2在雄蟲(chóng)的觸角、頭、足和腹部組織中表達(dá)量相對(duì)較高且一致,而OBP8則在雌蟲(chóng)的觸角、頭、足和腹部組織中高度表達(dá)且量相對(duì)一致。因此OBP1、OBP2、OBP8、OBP9、OBP11 5個(gè)OBPs在雌、雄蟲(chóng)的觸角、頭、足和腹部等組織中廣泛分布,而OBP11、OBP14均在雌、雄蟲(chóng)觸角中高度表達(dá)。
前人研究發(fā)現(xiàn)昆蟲(chóng)OBPs是一類(lèi)水溶性的小分子蛋白,不同昆蟲(chóng)其體內(nèi)鑒定出的數(shù)目多少不等且差異較大,不同屬或種間其氨基酸序列差異較大,并且同一物種下不同OBP間的氨基酸同源性也較低[21,24-25]。如鞘翅目馬鈴薯甲蟲(chóng)(Leptinotarsadecemlineata)鑒定出26個(gè)OBP,編碼氨基酸長(zhǎng)度為67~255 aa,各序列間高度分化,氨基酸序列相似性為3.20%~41.91%[15];雙翅目中的桔小實(shí)蠅(B.dorsalis)鑒定出49個(gè)OBP[26];棗實(shí)蠅(Carpomyavesuviana)克隆出7個(gè)OBP,其開(kāi)發(fā)閱讀框長(zhǎng)為372~510 bp,編碼氨基酸長(zhǎng)度為124~170 aa[27];福建漳州的南亞實(shí)蠅(B.tau,南瓜實(shí)蠅)克隆鑒定出26個(gè)OBP[28],且與瓜實(shí)蠅(B.cucuribitae)OBPs高度相似;而云南紅河州的南瓜實(shí)蠅(B.tau)僅克隆鑒定出6個(gè)OBP,其編碼的氨基酸長(zhǎng)度為128~314 aa,各序列間高度特化,氨基酸序列相似性?xún)H為3.20%~41.91%,并且不同OBP間其相似性較低為30%~51%,可能與采集地地理環(huán)境不同或者未完全鑒定出OBP有關(guān),推測(cè)南瓜實(shí)蠅體內(nèi)不同OBPs可能具有不同的生理功能。
根據(jù)OBPs中半胱氨酸殘基位置和數(shù)目的不同,可將昆蟲(chóng)OBPs分為5類(lèi):①Classical,含有6個(gè)保守的半胱氨酸位點(diǎn);②Minus,常含有4或5個(gè)半胱氨酸位點(diǎn),其數(shù)目比Classical型少1~2個(gè);③Plus,保守半胱氨酸數(shù)量大于6個(gè),在第6個(gè)半胱氨酸后至少有2個(gè)額外的半胱氨酸和1個(gè)脯氨酸;④Atypical,含有多于6個(gè)半胱氨酸位點(diǎn),但N端區(qū)域較為典型,C端區(qū)域較長(zhǎng)且特征不明顯;⑤Dimer,含有2個(gè)典型的半胱氨酸基序聚合在一起形成[25,29-31]。通過(guò)試驗(yàn)鑒定出的6個(gè)南瓜實(shí)蠅OBPs,有5個(gè)是Classical型,分別為OBP1、OBP2、OBP9、OBP11和OBP14,均含有6個(gè)保守半胱氨酸位點(diǎn);1個(gè)(OBP8)是Minus型,該基因的第2個(gè)、第5個(gè)保守半胱氨酸位點(diǎn)被其他氨基酸代替。南亞實(shí)蠅(B.tau,南瓜實(shí)蠅)鑒定出的26個(gè)OBPs中Classical型有21個(gè),Dimer型1個(gè),Minus型和Plus型各2個(gè)[28];桔小實(shí)蠅(B.dorsalis)注釋獲得49個(gè)OBPs,其中33個(gè)屬于Classical型,4個(gè)屬于Plus,10個(gè)屬于Minus,僅有2個(gè)屬于Atypical型[26];棗實(shí)蠅(Carpomyavesuviana)轉(zhuǎn)錄組獲得7個(gè)OBPs,其中5個(gè)是Classical型,其余2個(gè)是Minus型[27]。因此不同科屬或同屬不同種的昆蟲(chóng)體內(nèi)的OBPs數(shù)目、類(lèi)型和比例差異較大。OBPs可在昆蟲(chóng)的不同組織中表達(dá),如頭、胸、腹、翅、下顎須、喙、口器、性腺、精囊、氣門(mén)等[21],同時(shí)在昆蟲(chóng)的唾液中也有表達(dá)[31]。但同種昆蟲(chóng)OBP在不同性別的成蟲(chóng)組織中表達(dá)量差異較大[9,21],本文研究也有類(lèi)似的結(jié)果,即南瓜實(shí)蠅(B.tau)的5個(gè)OBP1、OBP2、OBP8、OBP9、OBP11在雌、雄蟲(chóng)的觸角、頭、足和腹部等組織中廣泛分布,而OBP14在雌蟲(chóng)的腹部不表達(dá),因此腹部可能不是南瓜實(shí)蠅氣味結(jié)合蛋白作用的重要部位。
通過(guò)鑒定獲得6個(gè)南瓜實(shí)蠅OBP及其相關(guān)的生物信息學(xué)數(shù)據(jù),但這些基因在蟲(chóng)體內(nèi)的作用,還需進(jìn)一步進(jìn)行表達(dá)和純化,并采用熒光競(jìng)爭(zhēng)結(jié)合、免疫組學(xué)、亞細(xì)胞定位及RNA沉默[32]等試驗(yàn)對(duì)OBP的具體功能深入研究,才能為開(kāi)發(fā)南瓜實(shí)蠅綠色、有效引誘劑提供科學(xué)依據(jù),同時(shí)為后期研究南瓜實(shí)蠅的嗅覺(jué)功能提供理論基礎(chǔ)。
克隆并鑒定出的6個(gè)南瓜實(shí)蠅OBPs基因,長(zhǎng)度介于498~955 bp,編碼128~314 aa,其中OBP1、OBP2、OBP9、OBP11和OBP14屬于Classic型,而OBP8屬于Minus型,且6個(gè)OBPs分化明顯,相似度為30%~51%;6個(gè)OBPs在雌、雄蟲(chóng)不同組織中均有表達(dá),而OBP14在雄蟲(chóng)腹部不表達(dá),OBP15在雌蟲(chóng)腹部不表達(dá)。數(shù)據(jù)的獲得將為進(jìn)一步研究南瓜實(shí)蠅嗅覺(jué)識(shí)別分子機(jī)制和引誘機(jī)制奠定基礎(chǔ)。