楊富裕
(中國農(nóng)業(yè)大學(xué)草業(yè)科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,北京 100193)
青貯發(fā)酵主要原理是在厭氧條件下,飼草表面自然附生的微生物(主要為乳酸菌)利用新鮮飼草中可溶性碳水化合物發(fā)酵產(chǎn)生乳酸等有機(jī)酸,形成酸性環(huán)境,進(jìn)而抑制腐敗微生物生長。深入探究青貯發(fā)酵過程中微生物菌群結(jié)構(gòu)和演替規(guī)律,對(duì)闡明青貯發(fā)酵機(jī)理以及調(diào)控青貯發(fā)酵品質(zhì)奠定重要理論基礎(chǔ)。
芬蘭科學(xué)家Artturi Virtanen首次發(fā)現(xiàn)在厭氧條件下,降低pH值可抑制飼草表面有害微生物生長,進(jìn)而達(dá)到使新鮮飼草長期保存的目的。該研究成果在1945年獲得諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng),并開啟了飼草青貯微生物研究的大門。為了進(jìn)一步探究青貯微生物菌群結(jié)構(gòu),后期研究者根據(jù)微生物生長營養(yǎng)需求和環(huán)境條件,利用經(jīng)典微生物培養(yǎng)技術(shù),闡明了青貯飼料乳酸菌對(duì)優(yōu)良青貯發(fā)酵的關(guān)鍵作用,以及梭菌和真菌是青貯發(fā)霉變質(zhì)的主要貢獻(xiàn)者。
然而,青貯環(huán)境中微生物具有多樣性高的特點(diǎn),而大部分微生物使用傳統(tǒng)的方法仍然是“不可培養(yǎng)的”,并且能被培養(yǎng)的小部分微生物不能夠代表微生態(tài)的多樣性。80年代,隨著分子生物學(xué)技術(shù)的快速發(fā)展,非培養(yǎng)技術(shù)手段如變形梯度凝膠電泳(DGGE)、限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)和實(shí)時(shí)熒光定量PCR(qPCR)明顯提升了我們對(duì)青貯發(fā)酵過程中細(xì)菌和真菌等微生物多樣性的認(rèn)識(shí),并且引導(dǎo)產(chǎn)生許多有趣的假設(shè)以及發(fā)現(xiàn)新的微生物物種。進(jìn)入2000年后,高通量基因測序技術(shù)平臺(tái)(Ilumina、Roche 454、Ion Torrent、PacBio) 讓宏基因組測序成為可能,它不僅可以提供青貯生態(tài)系統(tǒng)中物種水平的特定信息,還可以評(píng)估微生物群落與代謝途徑之間的相互關(guān)系。近年來,這種新方法已經(jīng)徹底改變青貯飼料中微生物群落的研究。
雖然目前關(guān)于青貯微生物多樣性研究有了很大的飛躍,但是多聚焦在乳酸菌群上,對(duì)其它微生物菌群結(jié)構(gòu)、功能尤其是菌群之間的相互作用研究較少。運(yùn)用分子技術(shù)評(píng)價(jià)微生物菌群,會(huì)檢測到?jīng)]有活性的微生物DNA,進(jìn)而影響到對(duì)青貯發(fā)酵品質(zhì)起關(guān)鍵作用微生物的判斷。此外,聯(lián)合使用微生物組和代謝組學(xué)技術(shù),對(duì)探究青貯飼料微生物群落和代謝途徑的動(dòng)態(tài)變化規(guī)律也做出重要貢獻(xiàn)。因此,未來如何進(jìn)一步提高測序技術(shù)的精度廣度以及如何能通過代謝組學(xué)進(jìn)一步從細(xì)胞代謝水平全面揭示青貯發(fā)酵產(chǎn)物中代謝物組分的種類和數(shù)量,確定其生物標(biāo)志物和特異性代謝譜,將為青貯飼料的科學(xué)評(píng)定和深度利用提供更為全面的理論參考依據(jù)。
在此背景下,為了梳理和總結(jié)青貯微生物研究最新現(xiàn)狀,《生物技術(shù)通報(bào)》邀請(qǐng)了國內(nèi)相關(guān)專業(yè)研究人員,就青貯微生物主題撰寫了11篇論文,形成了本專題。內(nèi)容包括青貯微生物多樣性[1-7]、代謝組分[8]以及青貯微生物功能基因鑒定與功能解析[9-11]等方面,詳細(xì)介紹了青貯微生物技術(shù)領(lǐng)域的最新研究成果,為推動(dòng)我國青貯微生物在產(chǎn)業(yè)和科研方面的快速發(fā)展提供重要參考信息。
值此主題專題出版之際,謹(jǐn)向所有提供稿件的同行及審稿專家致謝;向《生物技術(shù)通報(bào)》編輯部致謝,感謝他們?yōu)槲覈噘A微生物研究的成果展示和交流做出的重要貢獻(xiàn)。