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        水稻熱激轉(zhuǎn)錄因子研究進展

        2021-11-06 02:59:08劉曉藝羊健劉敬王冰戴良英李魏
        生物技術(shù)通報 2021年9期
        關(guān)鍵詞:水稻植物功能

        劉曉藝 羊健 劉敬 王冰 戴良英 李魏

        (1. 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護學(xué)院,長沙 410128;2. 寧波大學(xué)植物病毒學(xué)研究所,寧波 315211)

        植物在生長發(fā)育過程中會受到很多逆境脅迫的影響,比如生物脅迫(害蟲、病原微生物等)和非生物脅迫(極端溫度、高鹽和干旱等)。在優(yōu)勝劣汰的自然選擇下,植物自身形成了一系列復(fù)雜有序的機制來感知和抵御環(huán)境帶來的不利影響。在植物體內(nèi)具有可以調(diào)控抵御高溫脅迫信號的重要元件,即熱激轉(zhuǎn)錄因子(heat shock transcription factors,HSFs)[1-2]。HSFs對熱激蛋白(heat shock proteins,HSPs)的轉(zhuǎn)錄激活被認為在植物熱應(yīng)激的反應(yīng)中起關(guān)鍵作用[3]。位于脅迫響應(yīng)信號末端的HSFs能夠特異性結(jié)合高度保守的熱激元件(heat shock element,HSE),從而與其他轉(zhuǎn)錄因子聚集共同形成轉(zhuǎn)錄復(fù)合體以調(diào)控HSPs的表達進而調(diào)控植物對高溫脅迫的抗性[4]。此外,已有研究表明,HSFs還參與調(diào)控植物對其他非生物脅迫和生物脅迫的抗性。本文主要對水稻熱激轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)與分類、功能和作用分子機制研究進展進行了綜述。

        1 HSFs的典型結(jié)構(gòu)

        研究發(fā)現(xiàn),植物HSFs雖在序列大小上存在明顯差異,但都具有相似的結(jié)構(gòu)模式,包括保守的DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DNA binding domain,DBD)、寡聚化結(jié)構(gòu)域(oligomerization domain,OD)、核定位信 號(nuclear localization signal,NLS)結(jié) 構(gòu)、核輸出信號(nuclear export signal,NES)結(jié)構(gòu)以及C端激活結(jié)構(gòu)域(C-transcriptional activation domain,CTAD)5個部分[5]。

        1.1 DNA結(jié)合結(jié)構(gòu)域(DBD)

        高度結(jié)構(gòu)化的DBD結(jié)構(gòu)域是HSFs中最保守的區(qū)域,靠近HSFs的N端,約由100個氨基酸組成,含有3個α-螺旋和4個β-折疊形成一個疏水核心[6]。并且DBD的螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋(H2-T-H3)結(jié)構(gòu)具有分解代謝激活蛋白的的特征[7],能夠精準定位并特異性識別同樣高度保守的HSE的保守基序,從而進一步激活靶標基因的轉(zhuǎn)錄及表達[8]。

        1.2 寡聚化結(jié)構(gòu)域(OD)

        HSFs都含有1個OD結(jié)構(gòu),OD的氨基酸序列含有2個疏水七肽重復(fù)區(qū)域A和B(HR-A/B)。每個重復(fù)區(qū)域形成1個以亮氨酸拉鏈為特征的卷曲螺旋結(jié)構(gòu),植物遭受熱激脅迫時,HSFs通過該卷曲螺旋結(jié)構(gòu)形成同源三聚體,促使HSFs與其靶標的HSE結(jié)構(gòu)結(jié)合調(diào)控?zé)峒っ{迫響應(yīng)[9]。其中,OD結(jié)構(gòu)是判定HSFs家族成員分類的重要依據(jù)[10]。根據(jù)序列的相似性和OD的結(jié)構(gòu)特性,可以將植物HSFs劃分為進化保守的A、B、C三大類。植物B類HSFs的HR-A/B結(jié)構(gòu)區(qū)域緊湊,在HR-A與HR-B之間沒有氨基酸殘基插入,而植物A類HSFs和C類HSFs的HR-A和HR-B區(qū)域間分別插入了21個和7個氨基酸而得到了擴展[11]。

        1.3 核定位信號(NLS)和核輸出信號(NES)結(jié)構(gòu)域

        NLS結(jié)構(gòu)與OD結(jié)構(gòu)的C端相鄰,由一簇富集賴氨酸和精氨酸的堿性氨基酸殘基組成,與HSFs亞細胞定位和進入細胞核有關(guān)。有些HSFs的C末端還具有富含亮氨酸的NES結(jié)構(gòu),與植物細胞內(nèi)的蛋白向核外輸出密切相關(guān)。NLS與NES協(xié)同作用可以控制HSFs在細胞核及細胞質(zhì)中的自由分布[12]。

        1.4 C端激活結(jié)構(gòu)域(CTAD)

        CTAD是HSFs序列上最不保守的區(qū)域,含有由芳香族氨基酸殘基(色氨酸、苯丙氨酸、酪氨酸)、大的疏水性氨基酸殘基(亮氨酸、異亮氨酸、纈氨酸)和酸性氨基酸(谷氨酸、天冬氨酸)組成的短 肽AHA(aromatics,hydrophobic and acidic amino acid residues)基序[11]。AHA基序與一些基本轉(zhuǎn)錄復(fù)合物結(jié)合,是HSFs進行轉(zhuǎn)錄激活時所必需的條件,而只有A類HSFs具有AHA基序。因此,通常認為只有A類HSFs具有轉(zhuǎn)錄激活功能,B、C兩類HSFs則不具有轉(zhuǎn)錄激活功能[13]。

        1.5 水稻體內(nèi)HSFs的分類

        水稻HSFs的組成和功能具有多樣性(表1),這或許是水稻適應(yīng)自然環(huán)境導(dǎo)致的進化結(jié)果。

        表1 水稻HSFs的分類與生物學(xué)功能Table 1 Classification and biological functions of rice HSFs

        2 OsHSFs在水稻抗非生物脅迫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的功能與機制

        水稻在其生命周期中會遇到很多的非生物脅迫,常見的包括極端溫度脅迫、干旱脅迫、高鹽脅迫、氧化脅迫、重金屬脅迫等。大量研究表明,水稻HSFs在調(diào)控植物抗非生物脅迫的功能中發(fā)揮至關(guān)重要的調(diào)控作用。

        2.1 HSFs在水稻抗溫度脅迫中的功能與應(yīng)用

        高溫脅迫是水稻生長發(fā)育過程中常見的環(huán)境脅迫因子,會導(dǎo)致水稻的減產(chǎn)甚至顆粒無收。高溫脅迫一般通過破壞水稻體內(nèi)細胞膜結(jié)構(gòu)、影響酶的活性以及蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)來影響細胞的功能,從而導(dǎo)致水稻體內(nèi)的代謝紊亂甚至是大量累積有害物質(zhì),情況嚴重時甚至?xí)?dǎo)致水稻死亡[11]。為減少高溫脅迫帶來的危害,水稻需要一系列功能基因和蛋白的參與來適應(yīng)環(huán)境,其中就包括HSFs[32]。楊雙蕾[17]通過對水稻OsHsfA2e過表達轉(zhuǎn)基因株系和野生型株系進行熱處理,測量它們的莖葉生理指標發(fā)現(xiàn),過表達株系體內(nèi)的H2O2含量,SOD活性以及POD活性的升高速度比野生型快;而葉綠素的降低速度比野生型的要慢,并且始終維持在一個較高的水平。并且根據(jù)熱處理之后的表型分析發(fā)現(xiàn),野生型株系的萎蔫情況特別嚴重,而過表達株系莖葉的生長情況比野生型株系要健壯且基本不發(fā)生萎蔫,說明OsHsfA2e能夠提高水稻的耐熱性。此外,研究發(fā)現(xiàn)OsHsfA2d能夠編碼2種剪接變體蛋白OsHsfA2dI和OsHsfA2dII,在正常條件下,OsHsfA2dII是顯性但轉(zhuǎn)錄無活性的剪接形式;當(dāng)植物遭受高溫脅迫時,OsHsfA2d剪接成轉(zhuǎn)錄活性形式OsHsfA2dI,進而參與熱應(yīng)激反應(yīng)以提高水稻植株的耐熱性[16]。

        Mittal等[24]與Chauhan等[18]對水稻植株進行4℃低溫脅迫處理后發(fā)現(xiàn),A類HSFs基因OsHsfA3、OsHsfA4d、OsHsfA7和OsHsfA9,B類HSFs基 因Os-HsfB4b以及C類HSFs基因的表達量都顯著上調(diào)。其中OsHsfC1b受低溫誘導(dǎo)超強表達,作為主要的低溫感受元件存在。這些結(jié)果說明HSFs在水稻抵御低溫脅迫的信號中也發(fā)揮著重要作用。此外,冉靜[27]發(fā)現(xiàn),對水稻OsHsfB2b過表達和RNAi轉(zhuǎn)基因植株幼苗進行5℃低溫脅迫處理2周后,OsHsfB2b-RNAi及非轉(zhuǎn)基因?qū)φ杖克劳觯鳲sHsfB2b過表達植株仍有13%的存活率,表明OsHsfB2b基因的過表達可以提高水稻對低溫脅迫的耐受性。

        2.2 OsHSFs在水稻抗干旱脅迫信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的功能與機制

        在自然條件下,干旱脅迫往往與高溫脅迫同時發(fā)生。干旱脅迫對植物造成的生理影響表現(xiàn)在氣孔關(guān)閉,光合作用和呼吸作用減弱等方面,在分子生物學(xué)水平上則表現(xiàn)為HSPs的積累。并且植物在應(yīng)對干旱脅迫時會產(chǎn)生一種重要的化合物,即肌醇半乳糖苷合成酶(GolS1)。研究發(fā)現(xiàn),植物HSFs可能通過介導(dǎo)目的基因GolS1的表達來參與植物干旱脅迫應(yīng)答機制,此外還能作用于下游干旱相應(yīng)元件結(jié)合因子DREB2A和DREB2C,提高部分干旱脅迫響應(yīng)基因的表達[33]。

        有研究發(fā)現(xiàn),通過觀測OsHsfA7過表達植株和野生型植株斷水處理10 d后復(fù)水10 d的表型,野生型植株進一步枯萎而OsHsfA7過表達植株中的一部分恢復(fù)了正常的生長[22]。OsHsfB2b是水稻B類HSFs的成員,可模擬干旱信號的聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)處理對OsHsfB2b表達有強烈的誘導(dǎo)作用,OsHsfB2b過表達植株的耐旱性顯著降低,而OsHsfB2b-RNAi轉(zhuǎn)基因植株的耐旱性增強。在干旱脅迫下,轉(zhuǎn)基因水稻OsHsfB2b的相對電導(dǎo)率(relative electrical conductivity,REC)和丙二醇(malondialdehyde,MDA)含量增加,脯氨酸含量下降,而OsHsfB2b-RNAi轉(zhuǎn)基因植株的REC和MDA含量降低,脯氨酸含量增加[23]。過表達OsHsfB2b能夠降低水稻種子萌發(fā)期的耐旱性,且OsHsfB2b過表達會降低水稻對干旱脅迫的耐受性,表明OsHsfB2b負調(diào)控水稻的耐旱性[27]。由此可見,OsHSFs通過不同的作用機制參與水稻對干旱脅迫的調(diào)控。

        2.3 OsHSFs在水稻抗其他非生物脅迫中的功能與機制

        鹽堿化的土地會嚴重影響農(nóng)作物的產(chǎn)量,已有研究表明轉(zhuǎn)錄因子能夠增強作物的耐鹽性[34]。據(jù)報道,HSFs同樣可以介導(dǎo)水稻的耐鹽性。水稻體內(nèi) 的OsHsfA2a、OsHsfA2b、OsHsfA2c、OsHsfA2d、OsHsfA2e、OsHsfA4b、OsHsfA5、OsHsfA7、OsHsfA9、OsHsfC1b等基因在高鹽脅迫下都能被誘導(dǎo)表達,從而能提高植物的抗高鹽脅迫能力[15,31]。此外,上文提及的OsHsfB2b-OX轉(zhuǎn)基因水稻種子在高鹽處理下的苗高和萌發(fā)率均低于對照[27];并且OsHsfB2b過表達轉(zhuǎn)基因水稻的耐鹽性顯著降低,而OsHsfB2b-RNAi轉(zhuǎn)基因水稻的耐鹽性增強[23],表明OsHsfB2b蛋白負調(diào)控水稻的耐鹽性。

        氧化脅迫是高溫、高鹽等逆境引起的二級脅迫,引起水稻體內(nèi)ROS的大量積累,對細胞中的蛋白質(zhì)、脂質(zhì)和核酸造成損傷,導(dǎo)致細胞的代謝功能降低甚至細胞死亡[15]。已有報道表明,氧化脅迫會引起水稻體內(nèi)多個OsHSFs轉(zhuǎn)錄表達增強[35]。Mittal等[14]發(fā)現(xiàn)OsHsfA2a、OsHsfB4b和OsHsfC2a是ROS積累和感知途徑中的主要參與者,并且提出在所有OsHSFs中,OsHsfA2a在氧化應(yīng)激的兩個時間點(即1 h和4 h)表達最高,而OsHsfA2f和OsHsfA7可能參與氧化應(yīng)激的后期反應(yīng)。此外,用ABA和H2O2處理水稻后,OsHsfA4a和OsHsfA2基因的表達均上調(diào),分別在4 h處理時間內(nèi)產(chǎn)生2個表達高峰;又通過H2O2清除劑和抑制劑預(yù)處理試驗證明,ABA對水稻HSFs基因的誘導(dǎo)作用是通過ABA誘導(dǎo)產(chǎn)生的H2O2來實現(xiàn)的[19]。由于OsHsfA2在干旱和活性氧脅迫下表達量均升高,說明OsHSFA家族和水稻的抗氧化脅迫行為密切相關(guān)。

        農(nóng)業(yè)土壤的鎘污染已造成一些糧食作物和蔬菜等農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量的下降,影響了農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展[36],因此植物耐鎘性的分子調(diào)控具有重要意義。Shim等[20]對小麥基因進行篩選,發(fā)現(xiàn)熱激轉(zhuǎn)錄因子TaHsfA4a參與調(diào)控植物對鎘的耐受性。水稻體內(nèi)與TaHsfA4a同源性最高的OsHsfA4a蛋白也同樣能夠在酵母系統(tǒng)中提高對鎘的耐受性,但同源性第二高的OsHsfA4d沒有此功能。相應(yīng)地,異源表達TaHsfA4a的水稻植株對鎘的耐受性增強,而OsHsfA4a基因被敲除的水稻植株對鎘的耐受性降低。對利用TaHsfA4a和OsHsfA4d構(gòu)建的嵌合蛋白進行功能結(jié)構(gòu)域分析,結(jié)果表明HsfA4a的DBD對于鎘耐受性起關(guān)鍵作用,而在DBD內(nèi),Ala-31和Leu-42位點對于鎘耐受性是非常重要的[20]。此外,TaHsfA4a介導(dǎo)的鎘抗性需要金屬硫蛋白(metallothionein,MT),在小麥和水稻的根部,鎘脅迫引起HsfA4a和MT基因的轉(zhuǎn)錄水平提高。因此該研究結(jié)果表明,小麥和水稻的HsfA4a通過上調(diào)MT基因表達來提高植物的鎘耐受性。

        3 OsHSFs在水稻抗病信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中的功能與機制

        3.1 OsHSFs在水稻抗稻瘟病中的功能與機制

        稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae)引起的稻瘟病發(fā)病于水稻的各個生育期,是水稻生產(chǎn)上的毀滅性病害,在世界各水稻產(chǎn)區(qū)都有發(fā)生[37]。防治稻瘟病最經(jīng)濟、有效的方法就是培育抗病水稻品種。N-乙酰殼寡糖(GNn)作為病原物相關(guān)分子模式(pathogen-associated molecular pattern,PAMP),在水稻中被模式識別受體CEBiP[38]和OsCERK1[39]感知。一旦與受體結(jié)合,GNn會激發(fā)一系列植物免疫反應(yīng),包括基因表達變化、MAPK級聯(lián)反應(yīng)、ROS積累等[40]。水稻GRAS家族蛋白CIGR2是1個GNn信號應(yīng)答基因,其活性通過OsHsf23直接轉(zhuǎn)錄控制,在病原物感染期間介導(dǎo)過敏性細胞死亡的激活。CIGR2以及OsHsf23的RNAi轉(zhuǎn)基因植株的葉鞘表皮細胞在接種稻瘟菌無毒菌株后表現(xiàn)出高度顆?;?,而這兩種轉(zhuǎn)基因植株的抗性并未發(fā)生改變,這表明CIGR2可能通過激活OsHsf23以抑制稻瘟病菌引起的不親和互作中水稻細胞過度死亡[30]。

        3.2 OsHSFs在水稻抗白葉枯病中的功能與機制

        由 黃 單 胞 菌(Xanthomonas oryzae pv. oryzae,Xoo)引起的白葉枯病是導(dǎo)致水稻減產(chǎn)的重要細菌性病害。白葉枯病是Xoo通過水孔或傷口進入水稻葉片,入侵維管組織而引起的[41]。水稻抗病品種‘SH5’和感病品種‘8411’接種Xoo 6 h后,OsHsfA2s、OsHsfB2s 和OsHsfC2b等11個HSFs成 員在抗、感品種‘SH5’和‘8411’中的表達水平存在顯著差異[42]。而有研究分析了7個OsHSFs基因(OsHsfA2a、OsHsfA2c、OsHsfA2d、OsHsfB2a、OsHsfB2b、OsHsfB2c1和OsHsfB2c2)在水稻葉片接種Xoo小種P6后的表達情況,發(fā)現(xiàn)僅OsHsfB2c2參與了水稻對白葉枯病的抗性[29]。由此可見,HSFs成員在水稻對白葉枯病的防御過程中發(fā)揮重要作用。此外,有報道表明OsHsfB4d通過與OsHsp18.0-CI的啟動子結(jié)合進而調(diào)控對白葉枯病的抗性[28]。

        3.3 OsHSFs在水稻抗細菌性條斑病中的功能與機制

        由另一黃單胞菌(Xanthomonas oryzae pv.oryzicola,Xoc)引起的細菌性條斑病是影響全球水稻生產(chǎn)的重要病害之一[43]。Xoc通過傷口或氣孔入侵水稻,定殖于水稻葉片的薄壁組織細胞間并擴展形成條狀病斑,隨著病斑的不斷擴大,會導(dǎo)致水稻葉片的枯死。在水稻上接種Xoc菌株RS105后發(fā)現(xiàn)可以上調(diào)熱激轉(zhuǎn)錄因子OsHsp18.0-CI的表達[44]。過表達OsHsp18.0-CI的轉(zhuǎn)基因水稻明顯增強對Xoc菌株RS105的抗性,而OsHsp18.0-CI表達受抑制的水稻株系對RS105菌株的抗性則相應(yīng)降低。進一步研究發(fā)現(xiàn),通過RNA-seq,與野生型水稻相比,基礎(chǔ)防御相關(guān)基因的表達在OsHsp18.0-CI過表達水稻植株中明顯增強。接種RS105菌株后,這些抗病基因的表達在OsHsp18.0-CI過表達水稻植株中相較于野生型對照植株更強烈地激活[45]。由此發(fā)現(xiàn)OsHsp18.0-CI正調(diào)節(jié)水稻對細菌性條斑病的抗性。除此之外,用Xoc菌株RS105在中華11(野生型,ZH11)和過表達OsHsp18.0-CI的水稻中接種后OsHsfB4d均上調(diào)。并且過表達OsHsfB4d的水稻植株對RS105抗性增強,OsHsp18.0-CI和致病相關(guān)基因表達增加。此外OsHsfB4d直接與OsHsp18.0-CI啟動子中攜帶唯一HSE的DNA片段結(jié)合[28],這表明OsHsfB4d參與了水稻對細菌性條斑病的防御過程。

        3.4 OsHSFs在水稻葉片假病斑中的功能與機制

        植物類突變體是指在沒有明顯機械損傷、病原物侵染或者逆境脅迫的情況下,植物組織在葉片、葉鞘等部位自發(fā)形成類似病原物侵染和壞死斑的一類突變體[46]。許多水稻斑點葉突變體是了解水稻抗稻瘟病、抗白葉枯病和細胞程序性死亡機制的理想來源[47]。水稻類病變突變發(fā)生的原因比較復(fù)雜,除了受內(nèi)部基因的調(diào)控之外,光照、溫度和濕度等環(huán)境因素也會導(dǎo)致一些類病變突變體壞死斑的形成[21]。通過測序分析和互補實驗發(fā)現(xiàn),斑點葉基因spl7編碼OsHsfA4d[48]。在高溫及光照條件下,突變體spl7從分蘗到抽穗,整個葉片表面均分布著相對較小的紅棕色小點[21,48],而當(dāng)降低溫度,或遮去光照中的紫外線,葉片斑點癥狀均會減輕。但是,無論是高溫或紫外線處理,突變體spl7在幼苗和嫩葉中沒有發(fā)現(xiàn)任何損傷[48],這表明OsHsfA4d負調(diào)控光溫下水稻的細胞死亡,在抑制水稻葉片假斑病中起到作用。

        4 OsHSFs在水稻體內(nèi)的其他功能

        除了參與水稻對各種脅迫的應(yīng)答之外,OsHSFs還參與了調(diào)控水稻的生長發(fā)育過程。例如通過比較OsHsfA7過表達植株和野生型植株的根系不同,發(fā)現(xiàn)OsHsfA7過表達水稻的側(cè)根和根毛在苗期短于野生型對照植株,但是OsHsfA7過表達水稻的主根比野生型對照植株更長,說明OsHsfA7在水稻根的生長過程中起重要作用[22]。通過對OsHsf18轉(zhuǎn)基因水稻植株進行農(nóng)藝性狀調(diào)查之后發(fā)現(xiàn),OsHsf18過表達植株與野生型對照植株相比,植株變矮,分蘗數(shù)減少,結(jié)實率降低,千粒重下降[45]。OsHsf18-RNAi轉(zhuǎn)基因植株與野生型植株相比,雖然在株高和分蘗數(shù)上無明顯差異,但是結(jié)實率低,千粒重下降[25-26]。說明OsHSF18參與調(diào)控水稻的農(nóng)藝性狀,其轉(zhuǎn)錄水平過高或過低對植株的生長發(fā)育都有一定的影響。

        5 小結(jié)與展望

        自從植物HSFs被發(fā)現(xiàn)能調(diào)控植物應(yīng)對高溫脅迫開始,人們對其結(jié)構(gòu)和功能機制有了更深入的研究,并且發(fā)現(xiàn)HSFs還參與調(diào)控植物對其他非生物脅迫和生物脅迫的抗性。該文綜述了HSFs的典型結(jié)構(gòu),以及水稻HSFs的相關(guān)研究進展,發(fā)現(xiàn)HSFs參與水稻對溫度、鹽堿度、濕度、病害等多種非生物和生物逆境的響應(yīng)。但縱觀近年的研究進展,發(fā)現(xiàn)對水稻HSFs的研究主要以高溫脅迫為主,且多為對單一脅迫的影響,而對其在病蟲害生物脅迫方面的功能研究甚少。

        由于對HSFs的功能研究目前還不夠全面,可以從以下幾方面展開進一步研究:(1)運用基因敲除、基因突變、超表達和RNAi等技術(shù)對HSFs在水稻病蟲害生物脅迫響應(yīng)中的作用機理展開深入研究。(2)運用CHIP-Seq技術(shù)鑒定HSFs蛋白在全基因組上的結(jié)合位點,通過挑選不同通路中的差異性表達基因進行更深入的研究,了解其與HSFs的分子互作機理。(3)應(yīng)用基因工程和分子育種技術(shù),將能提高響應(yīng)逆境脅迫的HSFs應(yīng)用到水稻育種中,提高水稻的產(chǎn)量、對病原物的抗性和對非生物脅迫的耐受性。進一步闡明HSFs在不同類型的非生物脅迫與生物脅迫中的功能和信號途徑,有利于解析和完善植物抗病抗逆分子機制,并對水稻乃至其他作物抗病、抗逆育種中充分利用HSFs提高植物對逆境脅迫的耐受能力具有重要意義。

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        植物罷工啦?
        植物也瘋狂
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