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        “蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的原因”模擬實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

        2021-01-19 15:00:09楊仕敏昆明市教育科學(xué)研究院云南昆明650000
        生物學(xué)通報(bào) 2021年7期
        關(guān)鍵詞:肽鏈種顏色魚線

        楊仕敏(昆明市教育科學(xué)研究院 云南昆明 650000)

        “蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的原因”是人教版新版高中生物學(xué)《必修1 分子與細(xì)胞》第2 章第4 節(jié)中的內(nèi)容。蛋白質(zhì)是以氨基酸為基本單位構(gòu)成的生物大分子,在人體中組成蛋白質(zhì)的氨基酸有21種,人體中卻有數(shù)萬(wàn)種不同的蛋白質(zhì),而生物界的蛋白質(zhì)種類多達(dá)1010~1012種[1]。21 種氨基酸是怎樣構(gòu)成種類如此之多的蛋白質(zhì)的?即蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)具有多樣性的原因是什么?因氨基酸形成蛋白質(zhì)的過(guò)程抽象,而高中階段不具備現(xiàn)實(shí)條件觀察和開展相關(guān)實(shí)驗(yàn)。為幫助學(xué)生理解和構(gòu)建該重要概念,筆者嘗試通過(guò)模擬實(shí)驗(yàn)探究此問(wèn)題。

        1 “蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的原因”模擬實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)

        1.1 實(shí)驗(yàn)?zāi)康?通過(guò)學(xué)生親自動(dòng)手模擬氨基酸形成蛋白質(zhì)的過(guò)程,理解蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的原因,進(jìn)而加深對(duì)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能多樣性原因的理解,即“做中學(xué)”。

        1.2 實(shí)驗(yàn)材料 魚線(可用細(xì)鐵絲、膠線等代替)、10 種顏色的穿孔彩色塑料珠。

        1.3 實(shí)驗(yàn)原理 在細(xì)胞內(nèi),組成一種蛋白質(zhì)的氨基酸數(shù)目可能成百上千,氨基酸形成肽鏈時(shí),不同種類氨基酸的排列順序千變?nèi)f化,肽鏈的盤曲、折疊方式及其形成的空間結(jié)構(gòu)千差萬(wàn)別,因此,蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)具有多樣性,這也是細(xì)胞中蛋白質(zhì)種類繁多的原因[1]。不同顏色的塑料珠模擬不同種氨基酸,魚線模擬連接氨基酸的肽鍵。通過(guò)改變塑料珠的數(shù)目、種類和排列順序及用塑料珠和魚線串好的“肽鏈”的盤區(qū)、折疊方式,模擬蛋白質(zhì)多樣性的原因。

        1.4 實(shí)驗(yàn)步驟 1)4 人一組,每組發(fā)放10 種顏色的穿孔彩色塑料珠,每種顏色4 顆,魚線2 段(25~35 cm,據(jù)塑料珠大小決定)。

        2)以4 人為一大組,2 人為一小組制作以下珠串:①2 個(gè)小組分別隨機(jī)取10 顆塑料珠,根據(jù)小組成員意愿隨機(jī)制作2 條塑料珠串;②2 個(gè)小組分別取10 種顏色的塑料珠,一小組每種顏色1 顆,另一小組每種顏色2 顆,分別按小組成員意愿隨機(jī)制作2 條塑料珠串;③2 個(gè)小組分別取10 種顏色,每種顏色2 顆,根據(jù)小組成員意愿隨機(jī)制作2 條塑料珠串;④2 個(gè)小組分別取10 種顏色,每種顏色2 顆,制作以下2 串珠串:①2 個(gè)小組分別先用10種顏色,每種顏色1 顆共同制作2條顏色及排列順序完全相同的珠串;②再將每組剩余的10 顆10種顏色塑料珠按照各小組意愿隨機(jī)制作成2 條珠串。制作完成后,2 個(gè)小組據(jù)各自成員意愿將2條串珠纏繞折疊成不同造型(也可2個(gè)小組分別制作2 串顏色、數(shù)目、排列順序均不同的珠串,再進(jìn)行盤曲折疊)。

        3)各小組以大組為單位按制作順序進(jìn)行以上4 類串珠的組內(nèi)比較。思考以下問(wèn)題:①塑料珠的數(shù)目相同時(shí),2 個(gè)小組制作出的串珠包含的塑料珠顏色及排列順序是否相同?說(shuō)明什么?②塑料珠的顏色相同但數(shù)目不同時(shí),2 個(gè)小組制作的珠串是否相同?說(shuō)明什么?③塑料珠的種類和數(shù)目相同時(shí),珠鏈上各種顏色的塑料珠排列順序是否相同?說(shuō)明什么?④不同珠串盤區(qū)折疊形成的造型是否相同,說(shuō)明什么?(注:不同蛋白質(zhì)由不同種類不同條數(shù)肽鏈盤曲折疊構(gòu)成,具有不同功能)

        4)各大組派代表匯報(bào)各自情況,任課教師根據(jù)匯報(bào)情況,引導(dǎo)學(xué)生歸納蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)具有多樣性的原因。在引導(dǎo)學(xué)生回答上面第④個(gè)問(wèn)題時(shí),教師應(yīng)告知學(xué)生:一種有生物活性的天然蛋白質(zhì)的空間結(jié)構(gòu)與折疊方式不能隨心所欲地變化(手工折疊珠串只是模擬肽鏈之間盤曲折疊過(guò)程),而是被其一級(jí)結(jié)構(gòu)(氨基酸排列順序)所限制,具有相同一級(jí)結(jié)構(gòu)的天然蛋白質(zhì),折疊后形成的空間結(jié)構(gòu)通常也是一樣的。而不同蛋白質(zhì)由不同種類不同條數(shù)肽鏈盤曲折疊構(gòu)成,因而具有多樣性。

        1.5 注意事項(xiàng)

        1)各小組制作珠串時(shí),請(qǐng)據(jù)各小組成員內(nèi)部意見串連,不要照抄他組,以免影響對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果的判斷;

        2)魚線細(xì)但韌性較好,使用過(guò)程中注意安全;

        3)為防止出現(xiàn)誤吞塑料珠等安全問(wèn)題,實(shí)驗(yàn)后需請(qǐng)學(xué)生將實(shí)驗(yàn)材料(塑料珠、魚線)歸還給教師。

        2 可行性分析

        1)實(shí)驗(yàn)材料易獲得。彩色塑料珠和魚線均可在網(wǎng)上購(gòu)買,價(jià)格便宜。筆者用18.8 元買了8 mm約250 g 珠子,大概有13 種顏色,每種顏色25~30顆,賣家會(huì)送魚線,教師可提前網(wǎng)購(gòu)獲得。

        2)操作簡(jiǎn)便,所需實(shí)驗(yàn)時(shí)間短。該實(shí)驗(yàn)因操作簡(jiǎn)單易行,每個(gè)學(xué)生都會(huì)做,技術(shù)要求不高,無(wú)論是用在課上還是課后讓學(xué)生完成都是可行的。

        3)具有科學(xué)性。本次實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)了4 組實(shí)驗(yàn),通過(guò)大組內(nèi)比較塑料珠在數(shù)目、顏色、顏色和排列順序分別相同的情況下,得到的珠串各不相同,模擬構(gòu)成蛋白質(zhì)的氨基酸種類、數(shù)目、排列順序不同,蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)也隨之不同;而通過(guò)比較2條肽鏈(即使其中1 條相同)因折疊方式不同得到不同造型,模擬不同肽鏈間盤曲折疊方式不同,形成的空間結(jié)構(gòu)不同,最終導(dǎo)致蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)不同。這種模擬具有一定的科學(xué)性,可讓學(xué)生直觀感悟蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性的原因,進(jìn)而理解功能多樣性,初步構(gòu)建結(jié)構(gòu)與功能觀,訓(xùn)練科學(xué)思維。在培養(yǎng)學(xué)生核心素養(yǎng)的同時(shí),也可鍛煉其動(dòng)手動(dòng)腦、小組合作、表達(dá)交流等能力。

        3 討論

        筆者通過(guò)實(shí)踐,以上過(guò)程是完全可行的,且有助于學(xué)生理解和構(gòu)建“蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)具有多樣性的原因”重要概念。以上模擬實(shí)驗(yàn)所用彩色塑料珠大小、顏色、數(shù)目及每大組學(xué)生人數(shù),教師可按個(gè)人需求更改。若無(wú)魚線,可用細(xì)鐵絲、膠線甚至毛線均可代替,使用過(guò)程中注意安全。在模擬“不同肽鏈間盤曲折疊方式不同”實(shí)驗(yàn)中,若時(shí)間允許,2 個(gè)小組比較完成后,可各大組之間合作進(jìn)一步體驗(yàn)不同種類、不同條數(shù)肽鏈盤曲折疊構(gòu)成不同蛋白質(zhì),以達(dá)到建模到固模的效果;為節(jié)約時(shí)間且該模擬實(shí)驗(yàn)簡(jiǎn)單,小組匯報(bào)環(huán)節(jié)可不覆蓋全班所有組,教師根據(jù)實(shí)際情況暫停匯報(bào)即可。

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