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        棒狀鏈霉菌F613-1的誘變及其發(fā)酵工藝優(yōu)化

        2021-01-10 04:07:16劉永青
        中國(guó)釀造 2020年12期
        關(guān)鍵詞:棒狀精氨酸谷氨酸

        劉永青

        (呂梁學(xué)院生命科學(xué)系,山西離石 033000)

        克拉維酸(clavulanic acid,CA)又名棒酸,有微弱的抗菌活性,是一種β內(nèi)酰胺酶抑制劑,C2位上有一個(gè)β羥基乙叉取代基,而C6位沒(méi)有酰氧基。它以氧原子取代了青霉素及頭孢菌素惡唑環(huán)中的硫原子,形成3R、5R立體結(jié)構(gòu)[1],目前主要與各種β內(nèi)酰胺類抗生素聯(lián)合使用以解決細(xì)菌耐藥性問(wèn)題[2]。

        棒狀鏈霉菌是克拉維酸的生產(chǎn)菌株,屬于放線桿菌家族,是一種產(chǎn)β內(nèi)酰胺類抗生素的需氧革蘭氏陽(yáng)性菌。通過(guò)基因工程手段對(duì)菌株理論研究的較多,如LI J等[3-5]通過(guò)解析工業(yè)菌株F613-1基因組信息來(lái)破譯其高產(chǎn)機(jī)理;左志晗等[6]在棒狀鏈霉菌NRRL3585基礎(chǔ)上構(gòu)建了lat基因阻斷的突變菌株;áLVAREZ-áLVAREZ R等[7]通過(guò)構(gòu)建oppA2缺失突變體研究克拉維酸生產(chǎn)通路?;谡T變技術(shù)篩選高產(chǎn)菌株的研究主要集中在通過(guò)紫外、亞硝基胍(nitroso-guanidin,NTG)和甲基磺酸乙酯(ethylmethane,EMS)誘變,內(nèi)酰胺酶、鏈霉素、甘油耐受和舒巴坦鈉篩選培育高產(chǎn)菌株[8-12]。

        作為克拉維酸合成途徑的前體物質(zhì),添加精氨酸理論上可以使克拉維酸合成增加,但目前研究結(jié)果不一致[13-15],可能與菌株、精氨酸濃度有關(guān)。研究表明,添加鳥(niǎo)氨酸、谷氨酸、天冬氨酸、蘇氨酸和賴氨酸都有利于克拉維酸合成[14,16],覃榮活等[17]研究表明,谷氨酸鹽到精氨酸代謝途徑的基因整體表達(dá)上調(diào),有利于克拉維酸合成。谷氨酸是多種氨基酸的代謝前體,在氨基酸代謝中處于核心位置,且成本較低,故本實(shí)驗(yàn)采用谷氨酸作為克拉維酸前體添加劑。

        甘油衍生物3-磷酸甘油是克拉維酸合成的限速因素[18-19],所以工業(yè)生產(chǎn)中常把甘油作為添加前體。本試驗(yàn)以工業(yè)生產(chǎn)菌棒狀鏈霉菌F613-1為出發(fā)菌株,經(jīng)過(guò)紫外和NTG聯(lián)合誘變處理,篩選高產(chǎn)菌株進(jìn)行遺傳標(biāo)記鑒定。以甘油為碳源添加劑,分別考察添加不同氮源前體——精氨酸和谷氨酸時(shí)菌株的培養(yǎng)效果。在對(duì)高產(chǎn)菌株發(fā)酵研究基礎(chǔ)上,利用響應(yīng)面法優(yōu)化菌株發(fā)酵條件,為進(jìn)一步提高克拉維酸生產(chǎn)、降低成本提供理論基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        棒狀鏈霉菌(Streptomyces clavulans)F613-1:由山東省醫(yī)藥生物技術(shù)研究中心贈(zèng)送;聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)相關(guān)酶、引物和脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)試劑盒:北京博凌科為生物科技有限公司;液相試劑均為國(guó)產(chǎn)色譜級(jí),其余試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。

        固體培養(yǎng)基[17]:0.4%葡萄糖,0.3%胰蛋白胨,1.5%麥芽提取物,2%瓊脂粉,pH調(diào)至7.5;

        種子培養(yǎng)基:2%大豆超細(xì)粉,1.2%玉米淀粉,0.5%酵母膏,0.08%磷酸氫二鉀,1.1%三油酸甘油酯,pH 8.0;

        發(fā)酵培養(yǎng)基:3.0%大豆超細(xì)粉,2%大豆蛋白提取物,3.0%麥芽糊精,1.5%三油酸甘油酯,0.1%氯化鉀,0.25%磷酸氫二鉀,0.1%氯化鎂,0.05%氯化鈣,0.01%三氯化鐵,0.02%氯化鈉,0.05%泡沫劑,pH 7.0。

        所有培養(yǎng)基均在121 ℃條件下滅菌20 min。

        1.2 儀器與設(shè)備

        SC-04離心機(jī):安徽中科中佳科學(xué)儀器有限公司;Agilent 1100高效液相色譜儀(high performance liquid chromatography,HPLC):美國(guó)安捷倫公司;2720 PCR儀:美國(guó)ABI公司;DYY-10C電泳儀:北京六一生物科技有限公司;HZQ-X700C恒溫振蕩培養(yǎng)箱:上海一恒科學(xué)儀器有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1 種子液制備

        固體培養(yǎng):棒狀鏈霉菌F613-1孢子在固體培養(yǎng)基上25 ℃培養(yǎng)10 d[17]。

        種子培養(yǎng):按106個(gè)/mL接種孢子于種子培養(yǎng)基,25 ℃、250 r/min振蕩培養(yǎng)48 h。

        發(fā)酵培養(yǎng):以10%(V/V)的接種量將種子液接入發(fā)酵培養(yǎng)基,25 ℃、300 r/min振蕩培養(yǎng)144 h,250 mL燒瓶裝液量為50 mL。

        1.3.2 誘變篩選方法

        收集棒狀鏈霉菌孢子制備單孢子懸液(孢子濃度約為107~108個(gè)/mL)。距30 W紫外燈30 cm處照射4 min,然后用6 mg/L的NTG處理40 min,將誘變后的孢子懸液涂布于含60 μg/mL鏈霉素[20]的固體培養(yǎng)平板上,25 ℃培養(yǎng)10 d。取各單菌落涂平板,25 ℃培養(yǎng)5 d,測(cè)定克拉維酸含量。取克拉維酸含量最高的菌落繼續(xù)復(fù)合誘變3次,按上述方法篩選突變株。

        1.3.3 遺傳標(biāo)記擴(kuò)增

        將出發(fā)菌株F613-1和突變株在種子培養(yǎng)基中25 ℃培養(yǎng)60 h,3 000×g離心收集細(xì)胞,磷酸鹽緩沖液洗滌。使用DNA試劑盒提取基因組DNA,根據(jù)GenBank序列代碼AY426768(pah1)和X84101.1(Cas2)進(jìn)行PCR引物設(shè)計(jì)以驗(yàn)證遺傳標(biāo)記[21]。pah1上游引物(P1)5'-GCAGCCATATGTCCACCGCCGTCTCCCCGCGCTACGCCCAAC-3',pah1下游引物(P2)5'-GTGGTGCTCGAGCTACCCCCACCGCTGCCCGGCGAAGTCCAC-3';Cas2上游引物(C1)5'-GCGCCATATGGCCTCTCCGATAGTTGACTGCACCC-3',Cas2下游引物(C2)5'-GACTCGAGTCAGCGGCGCGGCGAGAACG-3'。PCR擴(kuò)增程序?yàn)?4 ℃預(yù)變性5 min,然后94 ℃、30 s,65 ℃、1 min,72 ℃、3 min,35個(gè)循環(huán),最后72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物用0.7%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

        1.3.4 不同培養(yǎng)基突變株發(fā)酵研究

        將甘油添加量調(diào)至1.5%,比較分別添加0.15%谷氨酸[22]和0.15%精氨酸對(duì)克拉維酸生產(chǎn)的影響,試驗(yàn)在25 ℃、300 r/min、250 mL燒瓶中進(jìn)行,發(fā)酵時(shí)間為144 h,每隔12 h收集并測(cè)定培養(yǎng)物。

        1.3.5 突變株發(fā)酵條件的優(yōu)化

        以突變株為發(fā)酵菌株,在發(fā)酵培養(yǎng)基基礎(chǔ)上,實(shí)行二段法發(fā)酵。全程300 r/min振蕩培養(yǎng),36 h之前按25 ℃、pH7進(jìn)行,36 h后分別設(shè)置發(fā)酵溫度(25 ℃、28 ℃、30 ℃、32 ℃、35 ℃、37 ℃)、pH值(5.5、6、6.5、7、7.5、8)和發(fā)酵時(shí)間(60 h、72 h、80 h、96 h、108 h、120 h)為單一變量,進(jìn)行發(fā)酵試驗(yàn)。在單因素試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,按照響應(yīng)曲面Box-Behnken法,優(yōu)化克拉維酸發(fā)酵條件。為保證結(jié)果的可信度,每次試驗(yàn)平行3次,符合統(tǒng)計(jì)學(xué)分析的結(jié)果按平均值計(jì)算。

        1.3.6 測(cè)定方法

        克拉維酸檢測(cè):誘變菌固體平板培養(yǎng)采用生物效價(jià)法[23];液體發(fā)酵采用高效液相色譜(HPLC)法[17]。細(xì)胞生物量測(cè)定:樣品3 000×g離心,收集細(xì)胞,雙蒸水洗滌細(xì)胞兩次,65 ℃孵化至恒質(zhì)量。甘油濃度:參照Eliton的方法測(cè)定[24]。谷氨酸、精氨酸濃度:參照2,4-二硝基氟苯(2,4-dinitrofluorobenzene,DNFB)衍生法測(cè)定[25]。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 突變菌株篩選

        經(jīng)過(guò)紫外和NTG復(fù)合處理3次,篩選到1株效價(jià)最高的突變菌株。25 ℃、300 r/min振蕩培養(yǎng)96 h,可達(dá)4.19 g/L,比出發(fā)菌株提高19.9%。將該菌株平板傳代3次,遺傳穩(wěn)定性良好。

        2.2 遺傳標(biāo)記鑒定

        以菌株F613-1為對(duì)照,對(duì)突變株的2個(gè)克拉維酸相關(guān)基因進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以驗(yàn)證突變株是否為棒狀鏈霉菌的衍生菌株,棒狀鏈霉菌F613-1和突變株的PCR擴(kuò)增圖譜見(jiàn)圖1。

        由圖1可知,第2和第4泳道為菌株F613和突變株的pah1基因擴(kuò)增產(chǎn)物,長(zhǎng)度均在1 056 bp左右;第3和第5泳道為菌株F613和突變株的cas2基因擴(kuò)增產(chǎn)物,長(zhǎng)度均在978 bp左右。棒狀鏈霉菌F613-1和突變株的PCR擴(kuò)增圖譜相同,說(shuō)明該突變株為棒狀鏈霉菌變種。

        2.3 突變株克拉維酸生產(chǎn)研究

        精氨酸和3-磷酸甘油是克拉維酸合成的直接前體物質(zhì),由于成本限制,發(fā)酵時(shí)谷氨酸替代精氨酸添加已成為克拉維酸生產(chǎn)的趨勢(shì)。因此在添加1.5%甘油基礎(chǔ)上,考察谷氨酸和精氨酸對(duì)突變株克拉維酸生成的影響,結(jié)果見(jiàn)圖2。

        由圖2可知,谷氨酸替代精氨酸對(duì)突變株克拉維酸生產(chǎn)影響不大;添加谷氨酸可提高突變株克拉維酸產(chǎn)量,同時(shí)克拉維酸累積至最大值所需時(shí)間提前至72 h。谷氨酸在72 h消耗殆盡,72 h以后突變株克拉維酸產(chǎn)量降低可能與之有關(guān)。36~72 h之間添加甘油和谷氨酸突變株無(wú)論生物量還是克拉維酸產(chǎn)量都較對(duì)照有較大提高,可能與突變株攝取營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)能力提高且發(fā)酵液中谷氨酸相對(duì)充足有關(guān),后續(xù)實(shí)驗(yàn)將谷氨酸添加量控制在0.15%。

        為了將甘油和谷氨酸最大限度應(yīng)用于克拉維酸合成,發(fā)酵初始添加0.1%谷氨酸和0.5%甘油,發(fā)酵36 h添加0.05%谷氨酸和1%甘油,突變株實(shí)行二段法發(fā)酵,36 h之前以菌種生長(zhǎng)為主,36 h后以產(chǎn)克拉維酸為主,通過(guò)響應(yīng)面試驗(yàn)優(yōu)化發(fā)酵條件。

        2.4 突變株發(fā)酵條件的優(yōu)化

        2.4.1 發(fā)酵溫度對(duì)克拉維酸產(chǎn)量的影響

        圖3 發(fā)酵溫度對(duì)克拉維酸產(chǎn)量的影響Fig.3 Effect of fermentation temperature on clavulanic acid yield

        由圖3可知,隨著發(fā)酵溫度在25~37 ℃范圍內(nèi)的升高,克拉維酸產(chǎn)量呈先升高后降低的趨勢(shì),當(dāng)發(fā)酵溫度28~32℃范圍內(nèi)克拉維酸產(chǎn)量較高,可能是菌體合成克拉維酸相關(guān)酶在該溫度內(nèi)活性較高;發(fā)酵溫度為30 ℃時(shí),克拉維酸產(chǎn)量達(dá)到最高,為4.10 g/L;當(dāng)發(fā)酵溫度高于32 ℃,克拉維酸產(chǎn)量持續(xù)降低,可能是克拉維酸合成受到抑制且降解增強(qiáng)的結(jié)果。故選擇發(fā)酵溫度28~32 ℃進(jìn)行后續(xù)研究。

        2.4.2 pH對(duì)克拉維酸產(chǎn)量的影響

        圖4 pH值對(duì)克拉維酸產(chǎn)量的影響Fig.4 Effect of pH value on clavulanic acid yield

        由圖4可知,隨著pH升高,克拉維酸產(chǎn)量呈先升高后降低的趨勢(shì),當(dāng)pH 6.5~7.5范圍內(nèi)克拉維酸產(chǎn)量較高,可能是克拉維酸合成增加且降解被抑制的結(jié)果;pH為7時(shí)克拉維酸產(chǎn)量達(dá)到最大值,為3.41 g/L;當(dāng)pH>7.5之后,克拉維酸產(chǎn)量持續(xù)降低,可能高pH時(shí)克拉維酸降解速率增大所致。故選擇pH 6.5~7.5進(jìn)行后續(xù)研究。

        2.4.3 發(fā)酵時(shí)間對(duì)克拉維酸產(chǎn)量的影響

        圖5 發(fā)酵時(shí)間對(duì)克拉維酸產(chǎn)量的影響Fig.5 Effect of fermentation time on clavulanic acid yield

        由圖5可知,隨著發(fā)酵時(shí)間在60~120 h范圍內(nèi)延長(zhǎng),克拉維酸產(chǎn)量呈先升高后降低的趨勢(shì),在發(fā)酵時(shí)間72~96 h范圍內(nèi)克拉維酸產(chǎn)量較高,可能是發(fā)酵液營(yíng)養(yǎng)相對(duì)充足且代謝副產(chǎn)物較少的結(jié)果;發(fā)酵時(shí)間為72 h時(shí)克拉維酸產(chǎn)量達(dá)到最大值,為4.72 g/L;當(dāng)發(fā)酵時(shí)間>72 h之后,克拉維酸產(chǎn)量持續(xù)降低,可能與發(fā)酵液中代謝副產(chǎn)物增多有關(guān)。故選擇72~96 h進(jìn)行后續(xù)研究。

        2.4.4 突變株發(fā)酵條件優(yōu)化的響應(yīng)面試驗(yàn)

        根據(jù)單因素試驗(yàn)結(jié)果,選擇克拉維酸產(chǎn)量(Y)為響應(yīng)值,發(fā)酵溫度(A)、pH值(B)及發(fā)酵時(shí)間(C)為考察因素進(jìn)行3因素3水平的響應(yīng)面試驗(yàn)。響應(yīng)面試驗(yàn)結(jié)果見(jiàn)表1,回歸模型顯著性檢驗(yàn)見(jiàn)表2。

        利用Design Expert 8.0.6軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行多元回歸擬合,得到二次多項(xiàng)回歸方程:Y=5.26+0.10A+0.39B-0.28C+0.025AB+0.065AC+0.11BC-0.21A2-0.77B2-0.10C2

        根據(jù)表2可知,整體數(shù)學(xué)模型P<0.000 1,失擬項(xiàng)P>0.05,表明該方程對(duì)試驗(yàn)擬合性好,可以用該模型來(lái)分析和預(yù)測(cè)克拉維酸發(fā)酵工藝。方差分析結(jié)果顯示模型中A、B、C、BC、A2、B2、C2差異顯著,表明各因素對(duì)克拉維酸產(chǎn)量的影響不是簡(jiǎn)單的線性關(guān)系。根據(jù)回歸分析結(jié)果做圖得響應(yīng)曲面圖6。

        表1 突變株發(fā)酵條件優(yōu)化響應(yīng)面試驗(yàn)設(shè)計(jì)與結(jié)果Table 1 Design and results of response surface methodology for fermentation conditions optimization of the mutant strain

        表2 回歸模型方差分析Table 2 Variance analysis of the regression model

        圖6 發(fā)酵溫度、pH值、發(fā)酵時(shí)間交互作用對(duì)克拉維酸產(chǎn)量影響的響應(yīng)曲面及等高線Fig.6 Response surface plots and contour lines of effects of interaction between fermentation temperature,pH and fermentation time on clavulanic acid yield

        由圖6可知,克拉維酸產(chǎn)量隨pH值的增加變化幅度較大,發(fā)酵時(shí)間次之,發(fā)酵溫度影響較小,且pH值與發(fā)酵時(shí)間交互作用顯著。綜合上述分析結(jié)果,軟件Design-Export8.0.6確定的最佳提取工藝條件為發(fā)酵溫度28.94 ℃,pH值7.02,發(fā)酵時(shí)間73.32 h,克拉維酸產(chǎn)量理論值達(dá)到5.46 g/L。實(shí)際操作過(guò)程中將發(fā)酵條件修正為發(fā)酵溫度29℃,pH值7,發(fā)酵時(shí)間73 h,平行3次試驗(yàn),克拉維酸產(chǎn)量實(shí)際值為5.44 g/L,絕對(duì)誤差為0.36%,說(shuō)明試驗(yàn)結(jié)果與理論預(yù)測(cè)契合度良好。

        3 結(jié)論

        本試驗(yàn)在工業(yè)菌株棒狀鏈霉菌F613-1基礎(chǔ)上獲得一株高產(chǎn)菌,克拉維酸產(chǎn)量較出發(fā)菌株提高19.9%;添加1.5%甘油和0.15%谷氨酸可大縮短低突變株發(fā)酵時(shí)間;突變株前36 h時(shí)25 ℃培養(yǎng),后37 h時(shí)29 ℃培養(yǎng),發(fā)酵pH值為7,克拉維酸產(chǎn)量達(dá)5.44 g/L,較出發(fā)菌株F613-1提高了55.8%。為下一步優(yōu)化發(fā)酵罐生產(chǎn)提供理論基礎(chǔ)。

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